$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Bitki stomalarının uygun şekilde modellenmesi ve farklılaşması, fotosentez ve terleme olmak üzere iki temel biyolojik süreçteki işlevleri için kritik öneme sahiptir ve EPF peptid sinyal yolları tarafından uygulanır. Arabidopsis'te, salgılanan üç sistein bakımından zengin peptit, EPF1, EPF2 ve STOMAGEN / EPFL9, stoma gelişiminin farklı yönlerini kontrol eder ve ERECTA-ailesi reseptör kinazları (ER, ERL1 ve ERL2), SERK'ler ve TMM 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10 dahil olmak üzere hücre yüzeyi reseptör bileşenleri tarafından algılanır. . Bu tanıma daha sonra MAPK'ya bağımlı bir süreç11 ile stoma farklılaşmasını teşvik eden transkripsiyon faktörlerinin aşağı regülasyonuna yol açar. Bu çekirdek stoma genlerinin keşfi öncelikle epidermal defekt sergileyen mutantların fenotipik taraması ile sağlanır. Bu yazıda, stoma paternini ve farklılaşmasını kontrol eden potansiyel genleri tanımlamak ve karakterize etmek için gerekli olan stomaların ve diğer epidermal hücrelerin görselleştirilmesi için nispeten basit ve etkili fenotipleme yöntemleri sunulmaktadır.
Bitki epidermisinin detaylarının gözlemlenmesi tipik olarak, toluidin mavisi O (TBO) veya safranin12,13,14 gibi bir boya ile lekelenmiş veya lekelenmemiş epidermal kabuklar kullanılarak elde edilmiştir. Bununla birlikte, bu yöntemlerin temel zorluğu, yaprakları yırtmadan yaprak epidermisini soymak ve yaprağın farklı bölgelerinden alınan görüntülerden kaçınırken desen verilerini dikkatlice gözlemlemek ve analiz etmek için özel eğitim gerektirmesidir. Doku örneklerini kloral hidrat bazlı temizleme çözeltileri gibi reaktiflerle temizlemeye yönelik kimyasal işlemler, çeşitli biyolojik materyaller için de yaygın olarak kullanılmaktadır 8,15; Bu tedaviler, yüksek kaliteli görüntüler sağlayarak çok sayıda fenotipik bilgi üretir, ancak aynı zamanda tehlikeli kimyasalların (örneğin, formaldehit, kloral hidrat) kullanılmasını gerektirir. Bu yazıda ilk olarak, kantitatif analiz için yeterli görüntü üreten, ancak numune hazırlama için tehlikeli kimyasalların ve epidermal yaprak kabuklarının kullanılmasını gerektirmeyen nispeten kolay ve kullanışlı bir fenotipleme yöntemi sunulmaktadır. TBO boyalı kotiledon epidermisi stoma gelişiminin incelenmesi için de idealdir, çünkü trikomların eksikliği ve kotiledonlardaki daha küçük gelişimsel gradyan, epidermal fenotiplerin basit ve izlenebilir bir şekilde yorumlanmasına izin verir.
Stomatal EPF peptitleri, nispeten büyük olgun boyutlara ve korunmuş sistein kalıntıları arasındaki intramoleküler disülfit bağlarına sahip bitkiye özgü, sistein bakımından zengin peptitler grubuna aittir. Doğru konformasyonel katlama, biyolojik işlevleri için kritik öneme sahiptir, ancak kimyasal sentez veya heterolog bir rekombinasyon sistemi tarafından üretilen sistein bakımından zengin peptitler inaktif olabilir ve hem uygun şekilde katlanmış hem de katlanmamış peptitlerin bir karışımıdır 3,7,16. Bu nedenle, stoma gelişiminin kontrolünde rol oynayan biyoaktif peptitlerin taranması çok zorlu bir görev olmuştur. Bu makale ayrıca biyoaktif stoma peptitlerinin daha iyi tanımlanması ve karakterizasyonu için bir biyotahlil açıklamaktadır. Bu yöntemde, Arabidopsis fideleri 6-7 gün boyunca potansiyel peptitleri olan ve olmayan ortamlar içeren çok kuyucuklu bir plakada yetiştirilir. Daha sonra, kotiledon epidermisi konfokal mikroskop kullanılarak görselleştirilir. Genel olarak, stoma gelişiminde potansiyel peptitlerin biyolojik aktivitesini açıkça görselleştirmek için, daha fazla epidermal hücre üreten epf2 mutantı ve azalmış epidermalhücre yoğunluğu 2,4,5 veren STOMAGEN-ami hattı gibi az ya da çok stoma soy hücreleri üreten genotipler, biyotahliller için vahşi tip Arabidopsis kontrolüne (Col-0) ek olarak kullanılır.
Genel olarak, burada sunulan iki protokol, çeşitli epidermal fenotiplerin hızlı ve verimli bir şekilde değerlendirilmesi ve stoma paterninin ve gelişiminin kontrolünde rol oynayan küçük peptitlerin ve hormonların taranması için kullanılabilir.