$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Mezenkimal kök hücreler (MSC'ler), hücre bazlı tedaviler için uygun, ölçeklenebilir bir hücre kaynağı olarak kabul edilebilir ve rejeneratif tıpta altın standart bir sistem olarak kabul edilebilir. Bu hücreler, vücutta farklı doku kökenlerine sahip çeşitli kaynaklardan izole edilebilir1. Kaynak dokularına bağlı olarak, her MSC tipi belirsiz bir in vitro davranış sergiler2. Bu, morfolojik ve fonksiyonel özelliklerinde iyi gözlenir3. Çok sayıda çalışma, yetişkin doku farklılaşması, genomik durum ve MSC'lerin metabolik ve hücresel mimarisi dahil olmak üzere boyutlarda klonal varyasyon göstermiştir 2,4.
Hücrelerin immünofenotiplemesi, kök hücrelerin tanımlanması için akış sitometrisinin yaygın bir uygulaması olmuştur ve bu, 2006 yılında Uluslararası Hücre ve Gen Terapisi Derneği (ISCT) tarafından hücreleri MSC'ler olarak tanımlamak için minimal kriterlerin bir listesini reçete etmek için kullanılmıştır. Plastik yapışma ve in vitro olarak üç soya (osteojenik, kondrojenik ve adipojenik) farklılaşma yeteneği ile birlikte, hücre popülasyonunun %≥95'inin CD105, CD73, CD90 eksprese etmesi gerektiğini ve bu hücrelerin akış sitometrisi ile ölçüldüğü gibi CD34, CD45, CD11b, CD14 ve HLA-DR ekspresyonundan (%≤2 pozitif) yoksun olması gerektiğini belirtmiştir5. MSC'ler, ISCT'nin minimal kriterleri altında bir dizi biyobelirteç tarafından tanımlanmış olsa da, bağışıklık özellikleri bu biyobelirteçlerle kıyaslanamamıştır ve çapraz çalışma karşılaştırmalarını ve klonal varyasyonları ölçmeyi kolaylaştırmak için bu kriterlerin ötesinde daha fazlasına ihtiyaç vardır2.
ISCT tarafından belirlenen yönergelere rağmen, MSC'ler üzerine yapılan kapsamlı araştırmalar, bu popülasyonda, esas olarak MSC donörleri6, doku kaynakları7, klonal popülasyon8 içindeki bireysel hücreler ve kültür koşulları 2,9 arasında ortaya çıkan heterojenliğin her yerde bulunan doğası nedeniyle ortaya çıkabilecek çok sayıda faktöre bağlı olarak ortaya çıkabilecek heterojenliğin var olduğunu göstermiştir. 10. Kaliteyi ve hücre kaderini sağlamak için bu birincil hücrelerin çeşitli doku kaynaklarından karakterizasyonu ve saflaştırılması, üretimlerinde kilit adımlardır. Popülasyon arasında sergilenen varyasyonları anlama ihtiyacı, onu ayrı ayrı bölünebilen ve toplanabilen alt popülasyonlara çözmek için etkili bir yöntem gerektirir11. Tek hücre düzeyinde analizler, hücre-hücre varyasyonunun zorluklarının üstesinden gelmeye yardımcı olur, heterojen bir popülasyondan kaynaklanan biyolojik gürültüyü azaltır ve nadir hücreleri araştırma ve karakterize etme yeteneği sunar12.
Amaca ve seçilen parametrelere bağlı olarak, seçilen popülasyonları sıralamak ve zenginleştirmek için çeşitli yöntemler kullanılabilir. Hücre sıralama teknikleri, hem toplu sıralama hem de tek hücreli sıralama yöntemlerini içerebilir. Toplu sıralama, Manyetik ile aktive edilen hücre sıralaması (MACS)13, fraksiyonlama 14 ve elütriasyon15 yoluyla hedef popülasyonları zenginleştirebilirken, tek hücreli sıralama, floresanla aktive edilen hücre sıralaması (FACS)11 yoluyla daha homojen popülasyonları zenginleştirebilir. Bu yöntemlerin her birinin kendi avantaj ve dezavantajları ile karşılaştırmalı bir analizi Tablo 1'de vurgulanmıştır.
Tablo 1: Farklı tekniklerin karşılaştırmalı analizleri: MACS, Fraksiyonlama, Elütriasyon ve FACS, prensiplerindeki farklılıkları ve belirli bir tekniği diğerine göre seçmenin avantaj ve dezavantajlarını vurgulamaktadır. Kısaltmalar: MACS = Manyetik ile aktive edilen hücre sıralaması; FACS = Floresanla aktive edilen hücre sıralaması. Bu Tabloyu indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Tekniğin ortaya çıkışından bu yana, tek hücreli akış sitometrisi, heterojen bir örnekte17 belirli bir hücre popülasyonunun sayımında16, tespitinde ve karakterizasyonunda önemli bir rol oynamıştır. Hewitt ve ark. 2006 yılında, farklılaşmış insan embriyonik kök hücrelerinin (hESC'ler) homojen havuzlarının izolasyonunu geliştirmek için otomatik hücre sıralama metodolojisinin temelini attı18. Tek hücreli ayıklama, genetik olarak değiştirilmiş klonların izolasyonunu kolaylaştırarak GFP ile dönüştürülmüş hESC'lerin popülasyonunu zenginleştirdi ve bu da klinik araştırmalarda yeni bir boyut açtı. Sıralama verimliliğini artırmak için genellikle iki yaklaşım benimsenmiştir; Ya sıralanmış popülasyonların toplama ortamı, sıralanmış hücrelerin19 canlılığını ve çoğalmasını sürdürmek için değiştirilir ya da hücre sıralama algoritması/yazılımı uygun şekilde değiştirilir12.
Teknolojinin ilerlemesiyle, ticari akış sitometreleri ve hücre ayıklayıcıları, kırılgan ve nadir hücre popülasyonlarını, özellikle de farklı kökenlerden kök hücreleri aseptik olarak ayırırken karşılaşılan zorlukların üstesinden gelmeye yardımcı olmuştur. Kök hücre biyologlarının en büyük zorluklarından biri, gen düzenleme çalışmalarında gerekli olan transfeksiyon protokollerini takiben insan pluripotent kök hücrelerinin klonal izolasyonu olmuştur19. Bu, tek hücrelerin, takviyeler ve ticari küçük moleküllü ROCK inhibitörleri ile birlikte Fare Embriyonik Fibroblastları (MEF'ler) ile kaplanmış 96 oyuklu plakalara ayrılmasıyla ele alındı. Bununla birlikte, hücre izolasyon stratejileri, sıralanan tek tek hücrelerin immünofenotipini tanımlayan sıralama algoritmasının bir özelliği olan indeks sıralaması kullanılarak büyük ölçüde rafine edilebilir12. Tek hücreli ayıklamadaki bu rafine modalite, özellikle nadir hematopoietik kök hücre popülasyonları ile ilgili olarak, yalnızca kök hücreler için sıralama verimliliğini arttırmaya yardımcı olmakla kalmadı, aynı zamanda tek hücreli klonları aşağı akış fonksiyonel tahlillerine verimli bir şekilde bağladı20.
Bu makale, fonksiyonel farklılaşma kapasitelerini incelemek için alt popülasyonların zenginleştirilmesi için insan pul pul dökülmüş yaprak döken dişlerden (SHED'ler) immünofenotipli kök hücrelerin tek hücreli olarak sınıflandırılmasına odaklanmaktadır. İki MSC-pozitif belirteç, CD90 ve CD73 ve negatif hematopoietik belirteç CD45'in bir kombinasyonu kullanılarak, MSC'ler immünofenotiplendirildi ve loş ve boş ekspresyoncular tanımlandı. İmmünfenotiplerine göre alt popülasyonlar saf MSC'ler, tek pozitif ve çift negatif popülasyonlar olarak tanımlandı. Belirteçlerin diferansiyel ekspresyonunun in vitro kültür koşullarının bir eseri olup olmadığını veya fonksiyonel özellikler üzerinde herhangi bir etkisi olup olmadığını belirlemek için daha ileri fonksiyonel çalışmalar için saf ve zenginleştirilmiş alt popülasyonlar elde etmek için tek hücreli sıralama modu kullanılarak sıralandılar. "Pozitif MSC belirteçlerinin" homojen ekspresörleri olmayan hücreler, fonksiyonel özelliklerini incelemek için sıralandı.