Burada, büyük boyutlu bitkilerin genetik dönüşümünün in vivo çalışmaları için lokalize vakum infiltrasyonu için ilk protokolü sunuyoruz. Bu metodolojiyi kullanarak, ilk kez kakaonun planta geçici dönüşümünde Agrobacterium aracılı hale getirdik.
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.
Yöntem makalesi
Burada, büyük boyutlu bitkilerin genetik dönüşümünün in vivo çalışmaları için lokalize vakum infiltrasyonu için ilk protokolü sunuyoruz. Bu metodolojiyi kullanarak, ilk kez kakaonun planta geçici dönüşümünde Agrobacterium aracılı hale getirdik.
Planta transformasyonunda geçici, bitki genetik transformasyonu için hızlı ve uygun maliyetli bir alternatiftir. Planta dönüşümü için çoğu protokol, Agrobacterium aracılı dönüşümün kullanımına dayanır. Bununla birlikte, şu anda kullanımda olan protokoller, büyük boyutlu bitkilerin vakum işlemine tabi tutulmasının fiziksel ve ekonomik kısıtlamaları nedeniyle küçük boyutlu tesisler için standartlaştırılmıştır. Bu çalışma, büyük boyutlu bitkiler için özelleştirilmiş lokalize vakum tabanlı agroinfiltrasyon için etkili bir protokol sunmaktadır. Önerilen yöntemin etkinliğini değerlendirmek için, genetik dönüşüme karşı inatçı tropikal bir bitki türü olan kakao bitkilerinde kullanımını test ettik. Protokolümüz, kakao yapraklarının lokalize bir hava kısmına tekrarlarla 0.07 MPa'ya kadar vakum uygulanmasına izin vererek, Agrobacterium'un bağlı yaprakların hücreler arası boşluklarına sızmasını mümkün kıldı. Sonuç olarak, RUBY raportör sistemi için eksprese edilen ekli kakao yapraklarının planta dönüşümünde Agrobacterium aracılı geçici elde ettik. Bu aynı zamanda kakaonun planta geçici dönüşümünde aracılık edilen ilk Agrobacterium'dur. Bu protokol, vakum bazlı agroinfiltrasyon yönteminin benzer boyut kısıtlamalarına sahip diğer bitki türlerine uygulanmasına izin verecek ve inatçı odunsu, büyük boyutlu türlerde genlerin bitki karakterizasyonu için kapıyı açacaktır.
Bitki genetik dönüşüm yöntemleri, genlerin biyolojik işlevlerini test etmek için gereklidir ve genom sonrası dönemde tahmin edilen çok sayıda karakterize edilmemiş gen göz önüne alındığında günümüzde özellikle yararlıdır1. Bu yöntemler, tamamen dönüştürülmüş çizgiler elde etmek veya genleri geçici olarak ifade etmek için kullanılabilir. Kararlı dönüşüm, konakçının aldığı yabancı DNA, konakçı genomuna tamamen ve geri döndürülemez bir şekilde entegre olduğunda ve genetik modifikasyonlar sonraki nesillere aktarıldığında meydana gelir. Geçici transformasyon olarak bilinen geçici ekspresyon, Agrobacterium tarafından hücreye aktarılan, konakçı genomuna entegre edilmemiş T-DNA'nın çoklu kopyalarından oluşur ve enfeksiyondan 2-4 gün sonra zirve yapar2.
Geçici ekspresyon tahlillerinin genellikle genlerin fonksiyonel karakterizasyonu için yeterli olduğunu ve kararlı dönüşüme göre çeşitli avantajlar sunabileceğini belirtmekte fayda var. Örneğin, geçici dönüşüm, doku kültürüne dayalı rejenerasyon prosedürleri gerektirmez. Diğer bir avantaj, Arabidopsis thaliana3 ve Nicotiana benthamiana4 gibi model bitki türleri için iyi standartlaştırılmış birkaç başarılı protokol örneği olan genlerin planta fonksiyonel analizi ile uyumlu olmasıdır, ancak model olmayan türlerdehala sınırlıdır 5.
Geçici tahlillerin geliştirilmesi, verimli gen transfer yöntemlerinin mevcudiyetine dayanır. Bunun için en popüler yaklaşımlar, Agrobacterium'un DNA'yı bitki hücrelerine aktarma konusundaki benzersiz yeteneğinden yararlanan Agrobacterium infiltrasyonuna dayanmaktadır6. Bu analizler için bir başka yararlı araç, tümü dönüşüm olaylarını izlemek için kullanılan yeşil floresan proteinleri (GFP), β-glukuronidaz (GUS), lusiferaz veya RBY gibi raportör genlerin kullanılmasıdır. Bu raportör sistemler arasında, RUBY şu anda görselleştirilmesi en kolay olanıdır ve üç enzimatik adım reaksiyonu yoluyla tirozinin betalainlere dönüştürülmesine dayanır. Diğer raporlayıcı sistemlerin aksine, ortaya çıkan betalainler, karmaşık ekipmana veya ek reaktanlara ihtiyaç duymadan dönüştürülmüş bitki dokusu üzerinde parlak renkli pigmentler olarak kolayca gözlemlenebilir7.
Bir Agrobacterium süspansiyonunu yaprak mezofilinin hücreler arası boşluğuna sızarken, başarılı agroenfeksiyon için en kritik adım, yapraklarınepidermal kütikülünün dayattığı fiziksel engelin üstesinden gelmektir 8. Bazı bitkiler için, iğnesiz bir şırınga (şırınga Agroinfiltrasyonu) ile oluşturulan bir basınç gradyanı, verimli bir agroinfiltrasyon için yeterli olsa da, Nicotiana benthamiana9'da olduğu gibi, diğer bitki türleri, vakum pompaları yardımıyla oluşturulan gibi daha büyük bir basınç gradyanı gerektirebilir10. Vakum destekli işlemlerde, agroinfiltrasyon iki adımda gerçekleşir. İlkinde vakum, bitki materyalini düşük basınca maruz bırakmaya hizmet eder ve gazların mezofil hava boşluklarından stomalar ve yaralar yoluyla salınmasını zorlar. Daha sonra, bir yeniden basınçlandırma aşaması sırasında, Agrobacterium süspansiyonu stomalar yoluyla hücreler arası boşluklara sızar veyaralar 11.
Şırınga sızması ile karşılaştırıldığında, vakum sızması, daha yüksek kullanım sıklığı, tekrarlanabilirlik ve sızma işleminin her aşamasında basıncı ve süreyi kontrol etme yeteneği sağlar10. Ispanak (Spinacia oleracea)12, şakayık (çok yıllık odunsu bir bitki) (Paeonia ostii)13 ve Börülce (Vigna unguiculata)14 gibi farklı bitki türlerinin yapraklarında, vakumlu agroinfiltrasyon protokolleri, şırınga infiltrasyonundan daha derin bir infiltrasyon oranı elde etti. Benzer şekilde, domateste (Lycopersicon esculentum)15 ve gerbera'da (Gerbera hybrida)16, vakumlu agroinfiltrasyon, şırınga infiltrasyonundan daha güçlü ve daha homojen gen susturma üretti. Vakum infiltrasyonunun ek bir avantajı, son zamanlarda üç narenciye çeşidinde (Fortunella obovata, Citrus limon ve C. grandis) gözlenen şırınga infiltrasyonuna kıyasla genotipe daha düşük bağımlılıktır17. Bununla birlikte, desikatörlere sığamayacak kadar büyük bitkilere vakumlu agroinfiltrasyon uygulamaya çalışırken, tipik olarak tropikal odunsu bitkilerde olduğu gibi, vakum odalarının boyutu bir sınırlama olabilir.
Aşağıda, vakum odalarının uzamsal sınırlamasının üstesinden gelen ve kakao yapraklarının planta geçici dönüşümü için faydasını test eden bir protokolü açıklıyoruz. Kakao için ek ekipman gerektirmeyen ve hatta tüm bitkinin sızması için kullanılan aynı laboratuvar kurutucularının kullanımına izin veren, ancak bitkinin bir kısmının vakum odası içinde erişmesine izin veren basit bir uyarlama ile ilk lokalize vakum infiltrasyon yöntemini sunuyoruz. Önerilen lokalize vakum sızma yönteminin kullanışlılığını test etmek için, kakaoyu dönüştürülmesi zor olan büyük yapraklı tropikal bir bitki türünün vekili olarak seçtik. Bu lokalize infiltrasyon yöntemini kullanarak, yakın zamanda avokadoda Agrobacterium aracılı vakum infiltrasyonu ile daha önce ayrılmış yapraklar18 için optimize edilmiş koşullarla planta geçici ekspresyonunda ilk kez rapor ettik ve burada kakaoda planta geçici ekspresyonunda ilkini rapor ediyoruz.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
1. Agrobacterium tumefaciens kültürü
2. Bitki seçimi
3. Vakum odası kurulumu
4. Vakum sızması
5. Sızan yaprakların inkübasyonu

Şekil 1: Kakao yapraklarının gelişim aşamaları. (A-E) Gelişim aşamaları25. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 2: Vakum odası konfigürasyonu ve bileşenleri. Vakum odası, bir vakum göstergesine bağlı bir desikatördür. Conta / O-ring, dalın yerleştirileceği bir açıklığa sahip olacak şekilde kesilir. (A) Vakum göstergesi, (B) Kapak, (C) Conta / O-ring, (D) Basınç valfi, (E) Desikatör, (F) Hortum. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 3: Planta vakumlu agroinfiltrasyon sisteminde. Sızma işlemi sırasında vakum kayıplarını önlemek için, dalın kurutucuya ve contaya/O-ringe silikon baskı malzemesi ile sabitlenmesi çok önemlidir. (A) Kakao bitkisi, (B) Vakum odası, (C) Silikon baskı malzemesi, (D) Agrobacterium süspansiyonuna batırılmış yapraklar, (E) Vakum pompası. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu protokol, büyük boyutlu odunsu bitkiler için etkili bir agroinfiltrasyon yöntemi sunar. Bu protokolle, -0,07 MPa'lık bir vakum basıncı elde edebildik, bu da kakao yapraklarının etkili, lokalize infiltrasyonu ile sonuçlandı. Şekil 4'te, sızma sistemi kurulum sürecini ve Şekil 5'te son yapılandırmayı gözlemliyoruz.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu çalışmada, örnek olarak kakao bitkilerini kullanarak, odunsu bitkilerin planta geçici dönüşümü için verimli, düşük maliyetli bir agroinfiltrasyon protokolü sunduk. Yaprakların kütikülünün bitki dokularının dönüşümü için temsil ettiği iyi bilinen kısıtlama göz önüne alındığında, genellikle bu prosedüre karşı inatçı olan odunsu bitkilerde vakumla agroinfiltrasyonu kolaylaştırmak için bir strateji geliştirmeye odaklandık.
Vakum odası içinde elde edilen vakum basıncı, protokolün ana zo...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarların beyan edebilecekleri herhangi bir çıkar çatışması yoktur.
Lic'e teşekkür ederiz. Jesús Fuentes González ve Néstor Iván Robles Olivares'e video görüntülerinin çekilmesindeki yardımları için. CIATEJ'den (Theobroma kakao bitkileri) Dr. Antonia Gutierrez Mora'nın cömert armağanlarını kabul ediyoruz. Ayrıca tesis desteği için CIATEJ ve Laboratorio Nacional PlanTECC, México'ya teşekkür ederiz. H.E.H.D. (CVU: 1135375), Consejo Nacional de Humanidades, Ciencia y Tecnología, México (CONAHCYT) tarafından finanse edilen yüksek lisans çalışmaları yürütmüştür. R.U.L., Consejo Estatal de Ciencia y Tecnología de Jalisco (COECYTJAL) ve Secretaría de Innovación Ciencia y Tecnología (SICYT), Jalisco, México (Hibe 7270-2018) tarafından desteklenmektedir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| 35S:RUBY plazmid | Addgene | 160908 | http://n2t.net/addgene:160908 ; RRID:Addgene_160908 |
| 1 mm elektroporasyon küveti | Thermo Fisher Scientific | FB101 | Balıkçı Markası Elektroporasyon Küvetleri Plus |
| Kurutucu | Bel-Art SP SCIENCEWARWE | F42400-2121 | |
| Dondurarak kurutucu | LABCONCO | 700402040 | |
| K2HPO4 | Sigma Aldrich | P8281-500G | YM ortamı için 0,38 g/L ekleyin |
| LBA4404 ElectroCompetent Agrobacterium | Intact Genomics USA | 1285-12 | https://intactgenomics.com/product/lba4404-electrocompetent-agrobacterium/ |
| Mannitol | Sigma Aldrich | 63560-250G-F | YM ortamı için 10 g/L MES ekleyin |
| Sigma Aldrich | PHG0003 | (LB, YM ve yeniden süspansiyon ortamı için) 1,95 g/L (10mM) MgCl | |
| 2 | Sigma Aldrich | M8266 | süspansiyon ortamı için 0,952 g/L (10 mM) ekleyin |
| MgSO4 ve orta nokta; 7H20 | Sigma Aldrich | 63138-1KG | YM ortamı için 0.204 g/L |
| MicroPulser Elektroporasyon Aparatı | Biorad | 165-2100 | |
| NaCl | Karal | 60552 | LB ortamı için 5 g/L ekleyin; YM ortamı için 0,1 g/L NanoDrop |
| Bir Mikro Hacimli UV-Vis Spektrofotometresi | Thermo Fisher Scientific ekleyin. | 13-400-518 | |
| President Silikon Baskı malzemesi | COLTENE | 60019938 | |
| Rifampicin | Altın-Bio | R-120-1 | (100 mg / mL) |
| Silikon Baskı malzemesi tabancası | Andent | TBT06 | |
| Spektinomisin | Altın-Bio | S-140-SL10 | (100 mg / mL) |
| Streptomisin | Gold-Bio | S-150-SL10 | (100 mg / mL) |
| Sigma Aldrich | 95039-1KG-F'den | tripton enzimatik sindirim | LB ortamı için 10 g / L |
| Maya ekleyin MCD | LAB | 9031'i | : LB ortamı için 5 g / L ekleyin; YM ortamı için 0,4 g/L ekleyin |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.