Organoidler, türetildikleri organların mimarisine ve işlevselliğine benzeyen minyatür üç boyutlu (3D) hücresel yapılardır 1,2. Laboratuvarda yetiştirilen bu modeller, kök hücrelerin veya dokuya özgü hücrelerin, bu hücrelerin kendi kendini organize etmesine ve çeşitli hücre tiplerine farklılaşmasına izin veren kontrollü bir ortamda yetiştirilmesiyle oluşturulur 1,2,3. Organoidlerin en önemli avantajlarından biri, insan biyolojisini geleneksel iki boyutlu (2D) hücre kültürlerindendaha yakından özetleme yetenekleridir 1,2,3. Özellikle, insan organoidlerinin orijin dokularının genetik çeşitliliğini koruduğu gösterilmiştir 3,4,5. Organoidler, kontrollü bir laboratuvar ortamında insan organı gelişimini incelemek, hastalıkları modellemek ve potansiyel terapötikleri test etmek için eşsiz bir fırsat sunar. Ayrıca, organoidler bireysel hasta örneklerinden elde edilebilir, bu da kişiselleştirilmiş tıp yaklaşımlarına ve bireyselleştirilmiş tedavilerin potansiyel olarak geliştirilmesine olanak tanır 3,6,7.
Araştırmacılar, mide biyolojisi ve patolojisinin çeşitli yönlerini araştırmak için insan mide organoidlerini kullandılar. Öne çıkan örnekler arasında mide kanseri kemoterapi yanıtlarınıtahmin etmek için hasta kaynaklı organoidlerin (PDO'lar) kullanımı 8,9,10 ve Helicobacter pylori enfeksiyonunaepitelyal yanıtı modellemek 11,12,13 yer alır. İnsan mide organoidleri, boyun hücreleri, çukur hücreleri ve diğer destekleyici hücreler dahil olmak üzere midede bulunan çeşitli hücre tiplerinden oluşur11,14. Gastrik organoidler, indüklenmiş pluripotent kök hücrelerden (iPSC'ler) veya biyopsiler yoluyla elde edilen mide dokusundan veya gastrik rezeksiyon örneklerinden doğrudan izole edilen kök hücrelerdenüretilebilir 11,14. Mide kök hücrelerinin mide dokusundan izolasyonu yaygın olarak mide bezlerinin izole edilmesi ve kültürlenmesi veya tek hücreleri serbest bırakmak için doku örneklerinin enzimatik olarak sindirilmesiyle yapılır 9,13,15. Önemli olarak, bu tekniklerden herhangi biri kullanılarak üretilen mide organoidleri içindeki hücrelerin farklılaşmasının benzer olduğu gösterilmiştir13. Burada açıklanan protokol, tek hücreli bir özete odaklanır.
Organoidler, geleneksel hücre kültürü ile tüm organlar arasındaki boşluğu dolduran bilimsel bir yeniliği temsil eder. Alandaki araştırmalar ilerlemeye devam ettikçe, organoidler çok çeşitli uygulamalar için daha etkili tedavilerin ve terapilerin geliştirilmesine katkıda bulunmaya hazırdır. Gastrik PDO'ların artan kullanımı göz önüne alındığında, bunların üretilmesi için standart bir yaklaşıma zamanında ihtiyaç vardır. Burada, üst endoskopi sırasında elde edilen iyi huylu gastrik biyopsi dokusundan izole edilen tek hücrelerden insan gastrik PDO'larının üretilmesi için protokol açıklanmaktadır. Önemli ve benzersiz bir şekilde, gastrik PDO'ları güvenilir bir şekilde oluşturmak ve sonraki karakterizasyona izin vermek için tohumlama için standartlaştırılmış sayıda tek hücre belirlenir. Bu teknik kullanılarak, mide gövdesi veya mide antrumunun biyopsilerinden üretilen organoidlerin oluşumu ve büyümesinde güvenilir farklılıklar gösterilmiştir.