Pankreas kanserinin kötü prognozu, aralarında geç teşhise yol açan kolayca tespit edilebilir biyobelirteçlerin olmaması gibi çeşitli nedenlerle ilişkilidir. Bir diğer önemli neden, dokuyu çevreleyen kalın stromadır ve bu da kan akışının azalmasına neden olur. Büyük miktarlarda hücre dışı matriks (ECM), hücre-hücre etkileşimi, endotel hücreleri, çeşitli bağışıklık hücreleri, perisitler, proliferatif miyofibroblast ve fibroblast popülasyonunun birikmesi ve neoplastik olmayan hücrelerin varlığı (birlikte desmoplastik reaksiyonu oluşturur)1, PDAC'ın kemoterapisinden ve radyoterapötik direncinden sorumlu olan kalın stroma'yı oluşturur2. Kanser ve stromal hücreler karmaşık, dinamik ve çift yönlü bir etkileşime sahiptir. Bazı elementler hastalığın ilerlemesini azaltsa veya hızlandırsa da, çoğu süreç tümörüngelişimi sırasında uyarlanabilir 1. Bu, büyüme faktörleri, proanjiyojenik faktörler, proteazlar ve adezyon molekülleri açısından zengin bir ortam sağlar. Bu faktörler anjiyogenez, hücre proliferasyonu, metastaz ve invazyonu teşvik eder 3,4. Birlikte, tümör için bağışıklık ve ilaç ayrıcalıklı sığınaktırlar ve bu da ilaç direncine neden olur.
Desmoplazi, bağışıklık hücreleri ve pankreatik yıldız hücreleri (PSC) ile birlikte çeşitli ECM proteinlerinden oluşan karmaşık bir karışımdır. Bunlar birlikte, hücrelerin büyümesi için bir iskele oluşturma eğilimindedir. PSC'ler, stromal bölmenin5 en büyük bileşenlerinden biridir. Matriks metaloproteazlar (MMP), matriks metaloproteazların doku inhibitörleri (TIMP) ve kanserle ilişkili fibroblastlar (CAF)6 gibi enzimler üretme yetenekleri, desmoplastik reaksiyonun gelişiminde kritik bir rol oynayabileceklerini ima eder. ECM, kanserle ilişkili fibroblastlar (CAF) ve vaskülatür, PDAC'ın temel yönleridir. CAF'ler arasında, miyofibroblast ve inflamatuar CAF'lerin, pro-tümör özelliklerinden sorumlu aktif karışmada rol oynadığı tahmin edilmektedir7. Tümör üzerindeki fibroblastik oluşumlar ne kadar geniş olursa, prognoz o kadar kötü olur 8,9,10.
Yerleşik hücre hatları aracılığıyla tek katmanlı hücre kültürü, ilaç toksisitesini analiz etmek için yararlı bir araç olmaya devam etmektedir ve kavram kanıtı ve keşif çalışmaları için iyi bir başlangıç noktasıdır. Bununla birlikte, yerleşik hücre kültürü hatları, germ hattı DNA'sından ve klinik ilişkilendirilebilirlikten yoksundur11. Düz yüzeylerde büyüdükleri için, tümörün bir parçası oldukları, anormal şekilde bölündükleri ve farklılaşmış fenotiplerini kaybettikleri zamana kıyasla farklı in vitro seçim kriterlerine tabi tutulurlar12. Genel olarak, tek hücreli kültürler tümör heterojenliğini sınırlar ve bu nedenle klinik önemini kaybeder. Tümörün mikro çevresinin karmaşıklığını doğru bir şekilde temsil edemezler (örneğin, ECM). 3D kültür, karmaşık tümör mikro ortamını daha yakından kopyalayabilir.
3D kültür, 1970'lerde sağlıklı hücreler ve neoplastik muadilleri için tanıtıldı13. Spheroidler14 aracılığıyla malign dokuların morfolojisini ve mimarisini incelemek için çeşitli teknikler kullanılmıştır. Stromal hücrelerle ko-kültürler TME sinyallerini modelleyebilir. Hücreler yıldız hücreleri15 ile birlikte kültürlendiğinde EMT belirteçlerinde bir yukarı regülasyon görülmüştür. PDAC sferoidleri ve bunların stroma ile etkileşimleri, ECM bileşenleri ile birlikte kültürlenerek modellenebilir. Spesifik olarak PSC'lerle birlikte kültürlemenin klinik olarak anlamlı ilaç sitotoksisite verileri ürettiği bildirilmiştir 16,17,18. PSC'ler ayrıca apoptozdan kaçarak ve çeşitli parakrin faktörler19 yoluyla kanser hücrelerinin proliferasyonunu uyararak ve EMT geçişini indükleyerek ilaç direncine yardımcı olur. Bu nedenle, PSC'leri bir ilacın veya ilaç dağıtım sisteminin başarısını değerlendirmek için kullanılan kriterlere erken bir aşamadan itibaren dahil etmek kritik hale gelir. PSC'nin, tek başına pankreas kanseri hücrelerine kıyasla, proliferasyonu artırma ve kombinasyon halinde daha hızlı büyümeyi destekleme yeteneği, immün sistemi baskılanmış farelerde20 iki hücre hattının deri altı yan enjeksiyonları değerlendirildiğinde in vivo olarak da görülmüştür.
Bir hücre tipinin ECM bileşenleri ile etkileşime girme yeteneği, birlikte kültürlenmiş sferoidler yetiştirilirken de dikkate alınması gereken kritik öneme sahiptir. BxPC-3 ve PANC-1'in kollajene bağlanmada eşit afiniteye sahip olduğu bildirilmiştir. BxPC-3'ün 21,22,23,24,25 daha iyi bağlandığına dair raporlar olmasına rağmen, iki hücre hattı da laminine eşdeğer olarak bağlanır. Migrasyon açısından, Stahle ve ark.26, PANC-1 hücreleri için BxPC-3'e kıyasla 5 kat daha hızlı bir motilite göstermiştir. PANC-1 hücrelerinin ayrıca esas olarak tek hücreler olarak göç ettiği, BxPC-3 hücrelerinin ise sıkıca paketlenmiş bir tabaka olarak göç ettiği bildirilmiştir. Hücrelerin seçimi aynı zamanda tümörün boyutunu da etkiler25. BxPC-3 tümörlerinin PANC-1'den elde edilenleregöre 27,28 daha büyük olduğu gösterilirken, bir çalışmada bunun tersi29 olgu gösterilmiştir. Boyut ve hareketlilikteki farklılıklarına rağmen, her iki hücrenin de farelerde tümör oluşturmak için uzun gecikme sürelerine ihtiyaç duyduğu bildirilmiştir. Bu süre özellikle BxPC-3 için 4 hafta ile 4 ay25 arasında değişen uzun olabilir. Bununla birlikte, BxPC-328 veya BxPC-3 kanser kök hücrelerinin30'un daha hızlı görünür tümörler oluşturduğu literatür de vardır, bu da tümör büyüme sürelerinde görülen varyasyonlar olabileceğini ima eder. Bu nedenle, burada belirtilen süreler, tümör büyüme oranları için yalnızca bir başlangıç kılavuzu olarak hizmet etmelidir.
BxPC-3 hücreleri, yüzeyde gevşek hücreler ve yoğun çekirdekler ile sferoidler oluştururken, PANC-1 hücrelerinin hem gözenekli ancak sağlam sferoidler31 hem de kompakt sferoidler oluşturduğu bildirilmiştir. PANC-1 hücrelerinin ayrıca daha az farklılaşmış ve daha agresif olduğu bildirilmiştir32. PANC-1 hücrelerinin daha yüksek motilitesi, kompakt sferoidler oluşturma yeteneği ve ECM bileşenleri ile etkileşime girme yeteneği ile birlikte agresif doğayı32 ön planda tutarak, sferoid çalışmaları için PANC-1 hücreleri seçildi.
Son birkaç yılda, sferoid kültür, iki boyutlu (2D) kültürlere kıyasla klinik alaka düzeyinde bir avantaj göstermede çok başarılı olmuştur. Alaka düzeyi, bu tekniğin hayvan çalışmalarının yerine kullanılması ve tümörlerin biyolojisinin daha iyi anlaşılması için kullanılmıştır. Spheroidlerin klinik önemi, özellikle PSC'lerle birlikte kültürlendiğinde, sertlik33, TGF-βekspresyonu 34,35,36,37,38, E-kaderin, F-aktin 18,34,36,37, α-SMA 34,35,37 gibi sferoidin çeşitli fonksiyonlarını incelemek için kullanımlarını sağlamıştır.38, laktat dehidrojenaz (LDHA)32, HIF-1α35,39, ilaç direnci 16,37,40, hücre göçü41, hücre istilası37, fibroz35, radyasyon direnci42, fenotipik değişiklikler18, heterojenlik36, hücresel etkileşim seviyeleri39 ve ECM bileşenlerini gösterir37,38,39. Açıklanan verileri elde etmek için kullanılan protokollerin çoğu, küresel ve ECM büyümesini desteklemeye yardımcı olmak için Matrigel'e, asılı bırakma yöntemine, baskılı kalıplara veya diğer iskelelere dayanır. Çalışmalar ayrıca genellikle insan olmayan fibroblastik hücrelerin veya hastalardan yeni izole edilmiş yıldız hücrelerinin kullanımını da içerir. Yıldız hücrelerinin kullanılması, tümörlerin in vivo koşullara benzemesi için kritik öneme sahipken, taze ekstraksiyonlarla ilişkili hastalar arası değişkenlik bu çalışmaların tekrarlanmasını zorlaştırır.
Bu protokol, geliştirilmesi kolay, tekrarlanabilir, klinik olarak anlamlı ve iskele içermeyen bir model göstermeyi amaçlamaktadır, böylece yalnızca ECM'yi doğal olarak oluşturmak için ortak kültürlerin yeteneklerine güvenir. Bunu yapmak için, insan pankreas yıldız hücreleri (HPaSteC) ile birlikte PANC-1 hücrelerinin (tek hücreler olarak göç etme eğilimleri nedeniyle) bir karışımını içeren basit bir ko-kültür yöntemi, kök hücreler gibi davranma yetenekleri nedeniyle seçildi ve ilaca yüksek dirençli olmaları. Durymanov ve ark.38tarafından yapılan çalışmaları temel alarak, aşağıda ayrıntıları verilen protokol, hücre oranları ve ortam değişiklikleri arasındaki süreler gibi parametrelerin daha da optimize edilmesinden sonra oluşturulmuştur. Bu protokol sonucunda ortaya çıkan sferoidler, yeni ilaç adayı değerlendirmesi için model bir sistem olarak kullanılabilir40.
Ek olarak, küresel kültüre aşina olmayan kullanıcılar için, MISpheroID bilgi tabanının gelişimini tartışan Peirsman ve ark.43çalışması yardımcı olabilir. Laboratuvar protokolleri arasındaki heterojenlikle başa çıkmaya yardımcı olabilecek bazı minimum bilgi yönergeleri oluşturur. Bazı sınırlamalara rağmen, çalışma, kültür ortamının seçiminin, hücre hatlarının, küresel oluşum yönteminin ve nihai küresel boyutun, sferoidlerin fenotipik özelliklerinin belirlenmesinde kritik olduğunu göstermiştir.