$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Bu protokol, titiz doku hazırlığı, hassas antikor inkübasyonu ve güvenilir otomatik hücre sayımı sağlayarak fare retinalarının tam montajlı immün boyama metodolojisini detaylandırır. Prosedür, retinal ganglion hücrelerinin (RGC'ler) sağlam bir şekilde etiketlenmesini ve nicelleştirilmesini kolaylaştırarak, çeşitli deneysel bağlamlarda hücresel popülasyonların doğru bir şekilde değerlendirilmesini sağlar. Yöntem, vahşi tip ve glokom modellenmiş farelerde RGC'leri saymak için kullanıldı ve tutarlı sonuçlar verdi. Temsili bir sonuç, 2 aylıkken normal bir yetişkin faredeki RGC sayısının yaklaşık 45.000 olduğunu göstermektedir (Şekil 6).
AI yazılımının normal ve hastalık modellerinde BRN3a etiketli RGC'leri doğru bir şekilde ölçüp ölçemeyeceğini değerlendirmek için, glokom7'nin N-metil-D-aspartat (NMDA) ile indüklenen bir fare modeli oluşturduk. Bu modelden elde edilen tam montajlı retina, anti-BRN3A ile immün olarak boyandı ve RGC'ler otomatik sayma yazılımı kullanılarak ölçüldü. Sonuç, nispeten yüksek bir arka plan lekelenmesine işaret etti (Şekil 7). Bununla birlikte, yazılım neredeyse tüm RGC'leri doğru bir şekilde tanımlayabildi. Normal bir fare retinasındaki yaklaşık 45.000-50.000 RGC'ye kıyasla, bu retinada toplam 15.231 RGC tanımlandı ve bu da ciddi dejenerasyona işaret etti. Bu nedenle, AI yazılımı, daha az optimal boyama kalitesine sahip retinalardaki RGC'leri saymak için de etkili bir şekilde kullanılabilir.

Şekil 1: RGC hazırlığı için şematik diyagram. (A) Göz küresi çıkarılır ve 1x PBS'ye yerleştirilir. (B) Göz küresi, 3 saat boyunca buz üzerinde% 4 PFA'da sabitlenir. (C) Korneanın çıkarılması. (D) Lensin çıkarılması. (E) Vizör lastiği makas kullanılarak 4 flebe bölünür. (F) Sklera soyulur ve kalıntılar yumuşak bir fırça ile retina yüzeyinden nazikçe çıkarılır. (G) Retina, anti-BRN3A ile immün olarak etiketlenmiştir. (H) Floresan sinyaller konfokal mikroskop kullanılarak görüntülenir. (I) RGC'lerin otomatik sayımı. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 2: Tam montajlı fare retinasının izolasyonu. (A) Fare, servikal çıkık ile ötenazi yapılır. (B) Fare düz bir yüzeye yerleştirilmiştir. (C) Göz küresi makasla dikkatlice çıkarılır. (D) Göz küresi nazikçe 1x PBS'ye yerleştirilir. (E) Göz küresi, korneanın kenarına forseps ile sabitlenir. (F) Korneanın kenarında bir iğne ile küçük bir kesi yapılır. (G) Kornea çıkarıldıktan sonra çanak şeklindeki yapı çıkarılır. (H) Lens forseps ile dikkatlice çıkarılır. (I) Retinanın zarar görmesini önlemek için korneanın kenarı boyunca sklera üzerindeki optik sinire doğru küçük bir kesi yapılır. (J) Sklera, forseps ile kesi boyunca yırtılır. (K) Retina düzleştirilir ve bir boya fırçası ile temizlenir. (L) Retina düzleştirilir ve buz gibi soğuk metanol ile hızla sabitlenir. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 3: Tam montajlı fare retinasının immün boyama. (A) 1x PBS ile yıkandıktan sonra, retina bir bloke edici tampon ile bloke edilir. (B) Retina, gece boyunca 4 ° C'de bir primer antikor ile inkübe edilir. (C) Retina 1x PBS ile üç kez yıkanır. (D) Retina, oda sıcaklığında 2 saat boyunca ikincil bir antikor ile inkübe edilir. (E) Retina, RGC'ler yukarı bakacak şekilde bir cam slayt üzerine monte edilmiştir. (F) Görüntüler bir lazer konfokal mikroskop kullanılarak elde edilir. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 4: Otomatik sayma yazılımının kurulumu. (A) Adım 1, dosya yolunun "yolov5_cpu" dizinine güncellenmesini içerir. (B) Grafik arayüz başlatılır. (C) Model dosyasının C sürücüsünün kök dizinindeki varlığının doğrulanması. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 5: Otomatik RGC sayma yazılımının çalışması. (A) Sayma yazılımı açılır. (B) Görüntüyü içe aktarmak için RESMİ AÇ düğmesine tıklanır. (C) Otomatik sayımı başlatmak için RUN düğmesine tıklanır. (D) Sayılan hücreler kırmızı kare bir kutu ile işaretlenir ve hücre numarası sağ üst köşede görüntülenir. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 6: Fare RGC'lerinin otomatik sayımı. Üst panel (solda), anti-BRN3A ile immün olarak boyanmış düz montajlı retinanın temsili sonuçlarını gösterir; üst panel (sağda), daha önce geliştirilmiş yazılımla RGC'lerin otomatik sayımını gösterir. Ölçek çubuğu: 100 μm. Üst panellerdeki iç kısımlar sırasıyla büyütülür ve alt panelde gösterilir. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 7: NMDA ile indüklenen bir glokom fare modelinde RGC sayımı. Sol panel: AI yazılımı tarafından tanınan RGC'leri gösteren tam montajlı retinaya genel bakış. Sağ panel: Retinanın kısmi bir alanının büyütülmüş görünümü. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.