Yetişkin kök hücreler, belirli bir organda farklılaşmış hücre tiplerinin yenilenmesinden sorumludur ve ağırlıklı olarak uykuda, bölünmeyen bir durumda bulunur 1,2. Örneğin, kanı koruyan hematopoetik kök hücreler (HSC'ler) büyük ölçüde hareketsiz kalır ve olgun kan bileşenleri oluşturmak için kendini yenilemek veya farklılaşmak için hücre döngüsüne sadece küçük bir kısım girer3. Benzer şekilde, kanserlerde, kanser kök hücreleri (CSC'ler) adı verilen nadir bir hücre alt popülasyonu, kendini yenileme yeteneğine sahiptir ve malignitenin uzun süreli bakımından sorumludur4. Kanser kök hücreleri in vivo olarak anti-proliferatif kanser tedavilerinden5 kaçmalarını,bağışıklık sistemi tarafından temizlenmeden kaçınmalarını, oksidatif stresi azaltmalarını ve DNA onarım yollarınıgeliştirmelerini 7 sağlayabilen bir sessizlik veya yavaş büyüme durumunda bulunur. Tedaviden sonra geride kalan az sayıda CSC bile tümörü potansiyel olarak yeniden doldurabilir ve bu da hastanın nüksetmesine neden olabilir8. Buna göre, hücresel sessizliği anlamak, CSC'lerin potansiyel güvenlik açıklarının belirlenmesi ve bunları hedeflemek için yeni yolların geliştirilmesi için büyük umut vaat etmektedir.
Karboksifloresein süksinimidil ester (CFSE) boyası ve türevleri gibi hücre proliferasyon boyaları, hücre bölünmelerinin9 sıklığını izlemek için yaygın olarak kullanılır. Boya, hücre zarı boyunca nüfuz eder ve hücrenin içine girdikten sonra, hücre içi esterazlar tarafından bir floresan ürüne aktivasyona uğrar. Elde edilen floresan bileşik, süksinimidil kısmı ile hücre içi proteinlerin10 amin fonksiyonel grupları arasında oluşan kovalent amid bağları yoluyla hücre içinde tutulur. Her hücresel bölünme ile, floresan bileşik, elde edilen iki hücre arasında eşit olarak bölünür ve iki kat sinyal seyrelmesine neden olur. Bu boya, akış sitometrisi analizi11 yoluyla 10'a kadar hücre bölünmesinin tespit edilmesini sağlar.
Bu yaklaşım daha önce, boya11,12'nin yüksek tutulumuna sahip yavaş döngülü hücre popülasyonlarını tanımlayarak CSC popülasyonlarını in vitro olarak zenginleştirmek için kullanılmıştır. T-ALL'de CFSE, farelerde hasta kaynaklı ksenogreftlerde in vivo tümör büyümesini izlemek için kullanılmıştır. Hücre etiketleme ve üç haftalık nakilden sonra, akış sitometri analizi, CFSE floresansını hala koruyan nadir bir hücre popülasyonu gösterdi. Bu popülasyon, hasta13'te saplılık, tedavi direnci ve nüksetmeye neden olan hücrelere yüksek benzerlik ile ilişkilendirildi. Buna göre, bu boya, T-ALL'deki lösemi kök hücre (LSC) fenotiplerinin incelenmesi için yararlı bir araç sağlar.
Çalışmanın amacı, bir zebra balığı T-ALL modeli kullanarak in vivo olarak sessizliği incelemek için hücre proliferasyon boyasının uygulamasını genişletmektir. Özellikle, rag2:Myc güdümlü zebra balığı T-ALL model14 , fare modellerine ve insan hastalıklarına15 kıyasla LSC'lerin yüksek sıklığı nedeniyle kendini yenileme çalışmaları için mükemmel bir yer sağlar. Ek olarak, zebra balığının kullanımı, fare muadillerine kıyasla çok daha düşük bir bakım ve bakım maliyetiyle yapılabilen büyük ölçekli nakil çalışmalarına izin verir16. Zebra balığı ayrıca canlı görüntüleme uygulamaları için mükemmeldir, çünkü floresanla etiketlenmiş tümör hücreleri, tümör gelişim hızını tahmin etmek için basit bir floresan mikroskobu kullanılarak kolayca görüntülenebilir16.
Bu protokolde, zebra balığı T-ALL hücrelerinin hücre proliferasyon boyası ile boyanması ve ardından sinjeneik CG1 zebra balığında lekeli hücrelerin in vivo çoğaltılması için iş akışını açıklıyoruz. Lösemi gelişimi üzerine, boyayı tutan hücrelerin sınıflandırılmasını ve LSC kendini yenileme oranlarını ölçmek için müteakip bir sınırlayıcı seyreltme transplantasyon deneyi için kullanımlarını açıklıyoruz. Bu protokol, hareketsiz LSC'lerin hedeflenmesi için potansiyel bileşiklerin in vivo ilaç taraması dahil olmak üzere ek uygulamalar için genişletilebilir. Ek olarak, toplanan hücreler, transkriptomik profilleme, proteomik ve metabolomik gibi farklı aşağı akış analizleri için kullanılabilir ve T-ALL'deki hareketsiz LSC'lerin davranışına ilişkin benzersiz bilgiler sunar.