Bu protokoldeki kritik adımlardan biri, YHT'nin aktif bileşenlerini tanımlamak ve bunların DKD ile ilgili hedeflerle etkileşimlerini tahmin etmek için ağ farmakolojisinin kullanılmasıdır. Bu adım, YHT'den etkilenen moleküler yolları ve potansiyel biyolojik ağları haritalamak için veritabanları (örneğin, TCMSP, DrugBank ve GeneCards) gibi biyoinformatik araçları kullanarak büyük ölçekli biyolojik verilerin analiz edilmesini içerir. Bu tahmini, YHT'nin bu yollar üzerindeki varsayımsal etkilerinin test edildiği DKD'nin hayvan modelleri aracılığıyla deneysel doğrulama izledi. Hesaplamalı tahminlerin verilerle entegrasyonu, bulgularımızın güvenilirliğini artırdığı ve teorik tahminler ile pratik sonuçlar arasındaki boşluğu doldurduğu için yaklaşımımızın çok önemli bir yönüdür. Ek olarak, hayvan modellerinin kullanılması, YHT'nin terapötik etkilerini doğrulamada bir başka kritik adımdır. Hayvanlarda DKB, insan hastalığının ilerlemesini yakından taklit eder ve YHT'nin hem glomerüler hasar hem de renal fibroz üzerindeki etkisinin etkili bir şekilde değerlendirilmesine olanak tanır. Histopatolojik değerlendirmelerin yanı sıra Scr, BUN ve proteinüri gibi böbrek fonksiyon belirteçlerinin titiz bir şekilde izlenmesi, YHT'nin terapötik etkinliğini değerlendirmek için esastır.
Protokolümüz güçlü hesaplama ve deneysel yöntemleri birleştirse de, çeşitli sınırlamalar vardır. İlk olarak, ağ farmakolojisi yaklaşımı büyük ölçüde kamuya açık veri tabanlarındaki mevcut verilere dayanır ve YHT veya DKD ile ilgili yolların belirli bileşenleriyle ilgili önyargılar veya eksik bilgiler olabilir. Bu sorunu azaltmak için birden çok veritabanına çapraz referans vermiş olsak da, bazı ilgili etkileşimler yine de göz ardı edilebilir. İkincisi, bu çalışma sadece deney hayvanı düzeyinde podosit hasarını azaltmada YHT'nin mekanizmasını araştırdı ve deneysel sonuçları doğrulamak için hücresel deneylere ve klinik büyük örneklem çalışmalarına ihtiyaç var. Son olarak, ağ farmakolojisi, DKH'nin YHT ile tedavisinin alkolik karaciğer hastalığı, lipid metabolizması ve ateroskleroz ve adipositlerde lipolizin düzenlenmesi ile de ilişkili olduğunu göstermiştir. Bu çalışma sadece PI3K/AKT/NF-κB sinyal yolunun YHT tarafından modülasyonunun DKD'nin ilerlemesini geciktirip geciktiremeyeceğini doğruladı; Sonuçların daha fazla araştırılması gerekiyor.
PI3K/AKT/NF-κB sinyal yolu, hücre büyümesi, proliferasyon, sağkalım ve inflamatuar yanıtlar gibi çeşitli biyolojik süreçlerin düzenlenmesinde rol oynayan önemli bir hücre içi sinyal yoludur22. Yapılan çalışmalar pedikülosit hasarının ilerlemesinde önemli rol oynadığını göstermiştir23,24. NF-κB, PI3K/Akt yolunun önemli bir aşağı akış bileşenidir ve çeşitli hücre içi sinyallerin iletimine ve çoklu genlerin ekspresyonuna katılır. PI3K / AKT sinyal yolunun inhibisyonu, NF-κB inhibitör proteini IκB'nin bozulmasına yol açar, bu da NF-κB'nin fosforilasyonuna ve çekirdeğe girmesine ve çeşitli kemokinlerin ve enflamatuar faktörlerin üretilmesine yol açar, bu da podosit hasarına ve renal interstisyel fibroziseyol açar 25. Bazı çalışmalar, PI3K / AKT / NF-κB sinyal yolunun aktivasyonunun inhibisyonunun, inflamatuar yanıtları ve renal fibrozu etkili bir şekilde baskılayabildiğini ve böylece DKD26'nın ilerlemesini geciktirdiğini göstermiştir.
Çalışmalar, lipid metabolizması bozukluklarının DKH'nin başlangıcında ve ilerlemesinde önemli bir rol oynadığını göstermiştir27,28. DKD hastaları sıklıkla yüksek LDL, TG seviyeleri ve yağ asidi birikimi dahil olmak üzere anormal lipid metabolizması gösterir. Bu anormallikler glomerüloskleroz ve tubulointerstisyel fibrozis gibi patolojik değişikliklerle yakından ilişkilidir29,30. Araştırmalar, lipid metabolizması bozukluklarının çoklu sinyal yolları yoluyla DKD ilerlemesini destekleyebileceğini göstermektedir31,32. İlk olarak, mTOR sinyal yolu, lipid metabolizmasının düzenlenmesinde anahtar bir yoldur; Aşırı aktivasyonu podosit hasarına ve proteinüriye yol açar33,34. Yüksek yağlı bir ortam, PI3K/AKT/mTOR ekseni yoluyla lipid birikimini teşvik edebilir, podosit apoptozunu indükleyebilir ve nihayetinde böbrek fonksiyonlarındaki bozulmayı şiddetlendirebilir 35,36,37. İkincisi, hücresel enerji metabolizmasının kritik bir düzenleyicisi olan AMP ile aktive olan protein kinaz (AMPK), yağ asidi oksidasyonunu teşvik ederek, lipid sentezini inhibe ederek ve lipotoksisiteyi azaltarak böbreği metabolik bozukluklardan korur 38,39,40. AMPK inaktivasyonu, DKD progresyonunda önemli bir mekanizma olarak kabul edilir. Metformin gibi AMPK aktivatörleri, önemli renoprotektif etkiler göstermiştir ve DKD41 için umut verici bir terapötik hedefi temsil etmektedir.
Son olarak, çalışmalar peroksizom proliferatörle aktive olan reseptörlerin α/γ (PPARα/γ) lipid metabolizmasının düzenlenmesinde önemli bir rol oynadığını ve DKD42,43'ü göstermiştir. PPARα aktivasyonu, yağ asidi oksidasyonunu teşvik eder ve böbrekte lipit birikimini azaltırken, PPARγ insülin duyarlılığını artırır ve anti-inflamatuar etkiler gösterir44,45. Fibratlar gibi PPAR agonistleri, DKD hastalarında proteinüriyi azaltmada potansiyel klinik faydalar göstermiştir46. Sonuç olarak, lipid metabolizması bozuklukları DKH'nın patolojik progresyonunu çoklu sinyal yolakları ile etkilemektedir. Bu yolaklar arasındaki etkileşimler karmaşık bir patolojik ağ oluşturur. Lipid metabolizmasının hedeflenmesi DKD için yeni terapötik stratejiler sağlayabilir.
Sisteine özgü proteazların bir ailesi olan kaspaz (CASP) ailesi, hücrelerde yaygın olarak bulunan ve esas olarak apoptoz ve inflamatuar yanıtların düzenlenmesinde rol oynayan bir proteaz grubudur47,48. CASP ailesinin üyeleri yapısal benzerlikleri paylaşır ve genellikle bir dizi reaksiyon yoluyla aktive edilen ve böylece apoptoz, piroptoz ve diğer programlanmış hücre ölümü süreçlerini tetikleyen zimojenler olarak bulunur49. Bunlar arasında, tipik olarak bir zimojen olarak bulunan korunmuş bir yapıya sahip kaspaz (CASP) ailesinin bir üyesi olan CASP3, apoptozun yürütme aşamasında, spesifik hücresel proteinlerin bölünmesini katalize eden ve böylece normal hücre büyümesinin düzenlenmesinde ve iç homeostazın sürdürülmesinde kritik bir rol oynayan anahtar bir proteazdır50,51. Kaspaz-8, apoptotik kaskadların başlatıcısı olarak işlev görür ve hücresel büyümenin düzenlenmesinde önemli bir faktör olan NPK'nın aktivasyonu yoluyla inflamatuar yanıtların modülasyonuna katılır. Kaspaz-8, apoptotik kaskadının bir başlatıcısı olarak işlev görür ve ayrıca NLRP1 ve NLRP3 gibi enflamatuar vezikülleri aktive ederek inflamatuar yanıtın düzenlenmesine katılır, böylece hücresel piroptozu52 tetikler. CASP sinyal yolunun saplı hücrelerde apoptoz ve piroptoza aracılık etmedeki önemli rolüne dayanarak, gelecekte YHT, CASP3/8, saplı hücreler ve DKD arasındaki ilişkiye ilişkin daha derinlemesine araştırmalar yapılması gerekmektedir.
Düzenleyici netlik ve öngörülebilirlik için tipik olarak iyi tanımlanmış tek hedefli mekanizmaları vurgulayan geleneksel ilaç keşif yaklaşımlarıyla karşılaştırıldığında, ağ farmakolojisine dayalı stratejimiz, YHT gibi TCM formülasyonlarında bulunan çok hedefli etkileşimlerin sistematik bir şekilde araştırılmasına olanak tanır. Bu karmaşıklık, TCM'nin bütünsel doğasını ve potansiyel terapötik genişliğini yansıtırken, aynı zamanda dikkatli bir doğrulama ve yorumlama gerektiren istenmeyen hedef dışı etkilerin zorluğunun da altını çizmektedir. YHT'nin eyleminin çok hedefli ve çok doğasını göz önünde bulundurarak, DKH'nin tedavisinde terapötik etkilerinin daha bütünsel bir şekilde anlaşılmasını sağlıyoruz. Ayrıca, ağ farmakolojisi, çok bileşenli tedavilerin güvenliğini ve etkinliğini sağlamak için çok önemli olan potansiyel ilaç etkileşimlerinin ve yan etkilerin tahmin edilmesine izin verir. Mevcut DKD tedavileri, altta yatan hastalık mekanizmalarını ele almaktan ziyade büyük ölçüde semptomları yönetmeye veya ilerlemeyi yavaşlatmaya odaklanmaktadır. Modern biyoinformatik araçlarını deneysel doğrulama ile entegre eden bu çalışma, özellikle DKD gibi kronik hastalıklarda TCM'nin etkinliğini arttırmada sistem biyolojisinin önemini vurgulamaktadır.
İleriye dönük olarak, bu teknik, özellikle DKD gibi karmaşık hastalıkların tedavisinde, TCM araştırmalarında ağ farmakolojisinin kapsamını genişletmek için önemli bir umut vaat etmektedir. Yaklaşımımız, böbrek hastalıkları, kardiyovasküler hastalıklar ve metabolik bozuklukların tedavisinde terapötik potansiyelleri için diğer TCM formüllerini veya bireysel bitkileri keşfetmek için uygulanabilir. Ayrıca, bu metodoloji, DKD tedavisinde mevcut ilaçlar için yeni kullanımları belirleyerek ilacın yeniden kullanımını araştırmak için genişletilebilir. Yaklaşımımızın bir başka potansiyel uygulaması da kişiselleştirilmiş tıpta yatmaktadır. Hastaya özgü verileri birleştirerek, ağ farmakolojisi, TCM tedavi stratejilerini bireysel moleküler profillere dayalı olarak uyarlamak, tedavi etkinliğini artırmak ve yan etkileri en aza indirmek için kullanılabilir.