Araştırma makalesi

Rabdomiyosarkomda Tiazolon Türevlerinin Terapötik Potansiyelini Araştırmak için Ağ Farmakolojisi ve İn Vitro Hücre Deneysel Çalışması

DOI:

10.3791/69464

⸱

14 Kasım 2025

 ,  ,  ,  , 
1Research Institute for Doping Control, Shanghai University of Sport, 2Drug and Food Anti-doping Laboratory, China Anti-Doping Agency

Bu makalede

Özet

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Tiazolon türevlerinin rabdomiyosarkoma karşı terapötik potansiyelini ağ farmakolojisi ve hesaplamalı kimyaya dayalı olarak sistematik olarak araştıran, in vitro hücre deneyleri yoluyla doğrulama ve değerlendirme yapılan bir çalışma sunuyoruz.

Özet

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Rabdomiyosarkom (RD), rabdomiyoblastlardan köken alan, çocuk ve ergenlerin sağlığı için ciddi bir tehdit oluşturan kötü huylu bir tümördür. Tiazolon türevlerinin çeşitli biyolojik aktivitelerdeki potansiyeline dayanan bu çalışma, ağ farmakolojisi ve in vitro hücre deneylerini birleştirerek RD tedavisinde tiazolon türevlerinin mekanizmalarını sistematik olarak araştırmayı amaçlamaktadır. Ağ farmakolojisi aracılığıyla, tiazolonun potansiyel hedeflerini tahmin etmek için yüksek verimli veriler entegre edildi. Ek olarak, bileşiğin ve hedef protein molekülünün bağlanma enerjisini hesaplamak için AutoDock Vina yazılımı kullanıldı ve RD ile ilgili sinyal yolunu ortaya çıkardı. Son olarak, in vitro hücre deneyleri, bileşiklerin tümör baskılayıcı etkisini daha da doğruladı. RD tedavisinde tiazolon türevlerinin hedeflerini analiz etmek için ağ farmakolojisi kullanıldı ve son olarak birleştirilerek ve tekilleştirilerek 172 hedef gen elde edildi. Düşük bağlanma enerjisine sahip beş protein hedefi, bileşik ile hedef protein molekülü, PIK3CD, AKT1, GSK3B, HSP90AB1 ve ITGB1 arasında kenetlenerek tarandı. İn vitro hücre kültürü deneylerinin sonuçları, spesifik bir tiazolon türevinin RD hücre dizileri üzerinde önemli bir inhibitör etkiye sahip olduğunu ve RD tedavisi için yeni hedeflerin ve etkili bileşiklerin keşfi için bilimsel bir temel sağladığını göstermiştir. Bu çalışma, ağ farmakolojisi ve in vitro deneylerin bir kombinasyonu yoluyla RD tedavisinde tiazolon türevlerinin mekanizmalarını ortaya koymuş ve gelecekteki ilaç geliştirme ve tedavi stratejileri için yeni bir bakış açısı sağlamıştır.

Giriş

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Rabdomiyosarkom (RD), pediatrik sağlık için önemli bir tehdit oluşturan, sınırlı tedavi seçeneklerine sahip, oldukça agresif bir pediatrik yumuşak doku sarkomudur. Epidemiyolojik çalışmalar, RD'nin nispeten düşük insidans oranları sergilemesine rağmen, yüksek malignitesi ve kötü prognozunun önemli klinik zorluklar ortaya çıkardığını göstermektedir. RD dört farklı histolojik alt tipe ayrılır: embriyonal, alveolar, iğsi hücre/sklerozan ve pleomorfik, embriyonal rabdomiyosarkom (ERMS) en yaygın formdur 1,2,3. Yeni tanı almış düşük riskli ERMS hastaları için mevcut tedavi stratejileri öncelikle vinkristin, daktinomisin ve siklofosfamid dahil olmak üzere kemoterapötik ajanlarla kombine lokalize tümörlerin cerrahi rezeksiyonunu içerir. Yüksek riskli hastalar tipik olarak ifosfamid ve etoposid 4,5 içeren yoğunlaştırılmış çok ajanlı kemoterapi rejimleri alırlar. Cerrahi, kemoterapi ve radyoterapiyi birleştiren multimodal yaklaşım, lokal tümör kontrolünün sağlanmasında ve mikrometastazların5 ortadan kaldırılmasında etkinlik göstermiş olsa da, önemli zorluklar devam etmektedir. Nörotoksisite ve geri dönüşümsüz böbrek ve mesane hasarı6 dahil olmak üzere mevcut kemoterapötik ajanların önemli toksisite profilleri, pediatrik ve ergen hastalar için özel riskler oluşturmaktadır. Ayrıca, RD'nin doğal heterojenliği ve nüks eğilimi, daha etkili ve hedefe yönelik terapötik ajanların geliştirilmesine yönelik kritik ihtiyacın altını çizmektedir7.

Bu bağlamda, buradaki araştırma, farklı farmakolojik özelliklere sahip bir tiazolon türevleri sınıfına odaklanmaktadır. Tiazolon türevleri, önemli anti-inflamatuar, antioksidan ve apoptoz düzenleyici aktivitelersergiler 8, bu da geniş biyolojik aktivite ve ilaç geliştirme için umut verici bir potansiyel gösterir 9,10. Elgubbi ve ark. tiazolon türevlerinin, agresif tümörlerde aşırı eksprese edilen hipoksi ile indüklenebilir bir enzim olan insan karbonik anhidraz IX (CA IX) gibi anahtar hedeflere güçlü bağlanma afinitelerini ortaya çıkardı ve antiproliferatif etkileri için bir mekanizma önerdi11. Hesaplamalı çalışma, tiazolon türevleri ile kanserle ilişkili proteinler arasındaki moleküler etkileşimleri aydınlatmaktadır. 2024 yılında El-Helw ve ark. benzokinolin bazlı tiazolon türevlerinin kanser hücre hatlarına karşı güçlü aktivite sergilediğini, tiazoletion ve tiyazol analoglarının en yüksek etkinliği gösterdiğini bildirmiştir12. Mekanik çalışmalar10,13, bu bileşiklerin tümör hücresi canlılığını ikili yollarla bozduğunu öne sürmektedir: (1) antioksidan yol modülasyonu yoluyla oksidatif stresin indüklenmesi ve (2) proliferasyonun doğrudan inhibisyonu. Bu bulgular, anti-inflamatuar ve antimikrobiyal özellikler de dahil olmak üzere tiazolonların geniş farmakolojik profilini vurguladı. Özellikle, pioglitazon14 ve troglitazon15 gibi bileşikler öncelikle tip 2 diyabettedavisinde kullanılır 16, 4-tiazolon türevleri ise lösemi hücrelerine karşı anti-proliferatif etkiler sergiler17 (Şekil 1). Bu bileşikler yalnızca klinik çalışmalarda önemli terapötik umut vaat etmekle kalmaz, aynı zamanda tümör hücresi proliferasyonunun inhibisyonu, apoptozun indüklenmesi ve hücre döngüsünün düzenlenmesi dahil olmak üzere çoklu hücre sinyal yollarını spesifik olarak hedefler. Tiazolon türevlerinin antikanser mekanizmaları, PI3K/Akt ve NF-κB yolları gibi kritik yolları modüle ederek tümör hücresi büyümesini ve hayatta kalmasını etkili bir şekilde engelleyen çeşitli sinyal yollarını içerir. Ayrıca, tiazolon türevleri, anjiyogenezin inhibisyonu ve immün yanıtların modülasyonu dahil olmak üzere tümör mikroçevresi üzerinde düzenleyici etkiler de sergilemiştir18. Tiazolon türevlerinin çok yönlü mekanik etkileri, onları yeni kanser terapötiklerinin geliştirilmesi için ideal adaylar olarak konumlandırmaktadır.

Önceki araştırmalarda, bakır katalizli distal asimetrik propargilasyon reaksiyonu yoluyla bitişik kiral merkezlere sahip tiazolon türevlerini verimli bir şekilde oluşturduk. Substrat olarak propargil esterler ve tiazolonlar kullanılarak, reaksiyon, fenil ikameli bir piridin bis(oksazolin) ligandı varlığında CuI tarafından katalize edildi. Reaksiyon koşullarını optimize ederek, bu tiazolon türevlerinin19 sentezinde yüksek verim elde ettik. Bir sistem biyolojisi yaklaşımı olarak ağ farmakolojisi, ilaçlar, hedefler ve hastalık yolları arasındaki karmaşık etkileşimleri ortaya çıkararak kanser gibi karmaşık hastalıklara yönelik tedavilerin anlaşılmasında ve geliştirilmesinde devrim yaratır20. Bu çalışmanın ön amacı, RD tedavisinde yeni tiazolon türevlerinin potansiyel terapötik değerini ortaya koymaktır. Entegre ağ farmakolojisi ve hücresel deneyler yoluyla, PIK3CD ve AKT1 dahil olmak üzere beş temel hedefi koordineli olarak düzenleyerek çok hedefli terapötik etkiler gösterebilen ve böylece PI3K-Akt gibi temel sinyal yollarını etkileyebilen üstün aktiviteye sahip bileşikler tanımlanacaktır. Bileşik ve hedef proteinler arasındaki bağlanma özelliklerini göstermek için moleküler yerleştirme ve moleküler dinamik simülasyonları kullanılacaktır. Ayrıca, sonraki yapısal optimizasyon için bir referans sağlayan bir ön yapı-faaliyet ilişkisi modeli oluşturulacaktır. Bu çalışma sadece rabdomiyosarkomun ilaç gelişimi için yeni aday moleküller sunmakla kalmaz, aynı zamanda ilaçların çok hedefli terapötik mekanizmalarını araştırmada multidisipliner stratejilerin olumlu rolünü de vurgular.

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Protokol

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Tüm ağ farmakolojisi prosedürleri, Ağ Farmakolojisi Değerlendirme Yöntemleri Kılavuzu'na uygun olarak gerçekleştirildi21. Bu çalışmada benimsenen kapsamlı ağ farmakolojisi iş akışı, Şekil 2'de şematik olarak gösterilmektedir.

Tiazolon türevlerinin sentezi
Bu çalışmadaki tiazolon türevleri, önceki çalışmamızda19, bakır katalizli bir uzaktan asimetrik propargilasyon reaksiyonu yoluyla sentezlenmiştir. Reaksiyon, 48 saat boyunca -10 ° C'de bir DIPEA bazı ve metanol çözücü sisteminde bir katalizör olarak CuI ve stereokontrol çekirdeği olarak bir kiral Pybox ligandı (L1) kullandı ve propargil esterler ve tiazolonlar arasında yüksek enantioselektif eşleşme sağladı. Hedef ürün %89'a varan verim, 97.8:2.2 enantiyomerik oran (er) ve 17.8:1 diastereomerik oran (dr) ile elde edildi. Bu bileşik serisinin sentez yöntemleri hakkında ayrıntılı bilgi için lütfen önceki çalışmalara19 bakın. Bu yöntem, aril (orto-, meta-, para-sübstitüentler), alifatik zincirler ve kaynaşmış halkalı propargil esterlerin yanı sıra çeşitli ikame edilmiş tiazolonları barındıran geniş substrat uygulanabilirliği gösterdi ve verimleri %51 ila %98 arasında değişti. Bu strateji, çok kiral merkezli tiazolon çerçevelerini ilk kez tek adımlı bir süreçte verimli bir şekilde oluşturarak, tıbbi kimyada önemli potansiyel uygulamalara sahip kiral ilaç moleküllerinin sentezi için oldukça seçici ve basit bir yaklaşım sağlar.

Ağ farmakolojik tahmini
Tiazolon türevinin hedef tahmini: Tiazolon türevlerinin yapısal temsilleri KingDraw yazılımı kullanılarak oluşturuldu ve ilgili yapısal dosyalar daha sonra Open Babel yazılımı aracılığıyla SMILES ID'ye dönüştürüldü. RD'ye karşı potansiyel terapötik hedefleri tahmin etmek için üç farklı hedef tahmin veritabanını kullanan kapsamlı bir hesaplama yaklaşımı kullandık: SwissTargetPrediction (http://swisstargetprediction.ch/), TargetNet (http://targetnet.scbdd.com) ve SuperPred (https://prediction.charite.de). TargetNet analizi için, Olasılığı > 0 olan genleri seçerek sıkı bir filtreleme kriteri uyguladık. SuperPred veritabanında, yalnızca Model doğruluğunu %90 ve Olasılığı %60>> sergileyen genleri koruyarak daha sıkı seçim parametreleri uyguladık ve yüksek güvenilirlikli hedef tahminleri sağladık.

RD hedeflerinin tahmini: GeneCards veri tabanına (https://www.genecards.org/) ve OMIM veri tabanına (https://omim.org/) dayanarak, Rabdomiyosarkom için bir araştırma yaptık. GeneCards veri tabanından elde edilen veriler için, rabdomiyosarkom ile ilişkili genleri elde etmek için sonuçları 20'den büyük bir puanla filtreledik.

Protein-protein etkileşimi (PPI) ağlarının oluşturulması ve analizi: Tiazolon türevlerinin potansiyel hedefleri ve RD ile ilişkili genler kesişti. İnsan embriyonal rabdomiyosarkomunun tiazolon türevleri ile tedavisi için potansiyel hedefler, yüksek güvenilirlikli hedef ÜFE (protein-protein etkileşimi) ilişki analizi için STRING veri tabanına (https://www.string-db.org/) yüklendi. ÜFE ağı Cytoscape yazılımında (http://www.cytoscape.org/) oluşturuldu ve çekirdek hedefler derece değerlerine göre tarandı.

Bileşik-hastalık-hedef yolu ağ yapısı: İlaç-hedef-yol ağı, RD için bileşik tedavi için olası anahtar hedefleri ve yolları belirlemek için bileşiklerin ve hastalıkların hedeflerini ve bu hedeflerde yer alan yolları açıkça görebilir. İlk olarak, elektronik tabloda ağ tablosunu ve öznitelik tablosunu oluşturun. Ağ tablosunun içeriği temel olarak bileşik ile çekirdek hedef arasındaki yazışmaları, çekirdek hedef ile ilgili yol arasındaki yazışmaları ve RD ile ana yol arasındaki yazışmaları içerir. Öznitelik tablosunun içeriği esas olarak ağ tablosundaki tüm bilgileri sınıflandırmak ve adlandırmaktır. Bundan sonra, Cytoscape yazılımını açın, ağ listesini yükleme konumuna yükleyin, başlangıç noktasını, bitiş noktasını ayarlayın, öznitelik tablosunu yükleyin ve son olarak görüntü şeklini değiştirin.

Entegre fonksiyonel açıklama ve ağ farmakolojisi analizi - Yapı Gen Ontolojisi (GO) Zenginleştirme, Kyoto Genler ve Genomlar Ansiklopedisi (KEGG): Çekirdek hedeflerin GO ve KEGG zenginleştirme analizi DAVID veri tabanı (https://david.ncifcrf.gov/) tarafından gerçekleştirildi. P değerinin küçükten büyüğe sırasına göre, GO'da biyolojik süreç (BP), hücresel bileşen (CC) ve moleküler fonksiyon (MF) açısından ilk 10 madde analiz için seçilmiş ve KEGG'de ilk 20 madde analiz edilerek çevrimiçi mikro-biyoenformasyon platformu temel alınarak çekirdek hedeflerin GO ve KEGG kabarcık haritaları oluşturulmuştur.

Moleküler yerleştirme: Çekirdek hedef proteinler PDB veri tabanından (https://www.rcsb.org/) seçildi ve çekirdek hedeflerin yapısal dosyaları indirildi. Başlangıçta, proteinler PyMol yazılımı kullanılarak dehidre edildi, ardından ligandlar ve reseptörler ayrıldı. Daha sonra, proteinler ADFRSuite yazılımı kullanılarak hidrojene edildi ve AutoDock moleküler yerleştirme yazılımı için ızgara kutusu parametreleri elde edildi. Tiazolidinon türevlerinin ve çekirdek hedef proteinlerin pdbqt dosyaları AutoDock Vina yazılımı kullanılarak hazırlandı. Daha sonra tiazolon türevlerinin ve çekirdek hedef proteinlerin moleküler yerleştirme simülasyonları gerçekleştirildi. Son olarak, moleküler yerleştirme modelleri PyMol yazılımı kullanılarak görselleştirildi.

Moleküler dinamik simülasyonu: PDB dosyası, amber99sb-ildn kuvvet alanı ve TIP3P su modeli kullanılarak GROMACS uyumlu GRO formatına dönüştürüldü:
gmx pdb2gmx -f Pro.pdb -o Pro_temp_H.gro -ff amber99sb-ildn -su ucu3p -ignh
Proteinden 1.2 nm uzaklıkta bir kübik periyodik sınır kutusu eklendi:
gmx editconf -f Pro_temp_H.gro -o Pro_temp_H_box.gro -c -d 1.2 -bt kübik
Kutu TIP3P su molekülleri ile dolduruldu:
gmx solvat -cp Pro_temp_H_box.gro -o Pro_temp_H_box_water.gro -p topol.top
Sistem, Na iyonları eklenerek nötralize edildi:
gmx grompp -f iyonlar.mdp -c Pro_temp_H_box_water.gro -p topol.top -iyonlar.tpr
gmx genion -s iyonlar.tpr -o Pro_temp_H_box_water_ion.gro -p topol.top -nötr
Enerji minimizasyonu gerçekleştirildi:
gmx grompp -f minim.mdp -c Pro_temp_H_box_water_ion.gro -p topol.top -o em.tpr
gmx mdrun -v -deffnm em
NVT dengelemesi gerçekleştirildi:
gmx grompp -f nvt.mdp -c em.gro -r em.gro -p topol.top -o nvt.tpr
gmx mdrun -deffnm nvt -v
NPT dengelemesi gerçekleştirildi:
gmx grompp -f npt.mdp -c nvt.gro -r nvt.gro -t nvt.cpt -p topol.top -o npt.tpr
gmx mdrun -deffnm npt -v
Üretim moleküler dinamik simülasyonu başlatıldı:
gmx grompp -f md.mdp -c npt.gro -t npt.cpt -p topol.top -o md_0_1.tpr
gmx mdrun -deffnm md_0_1 -v

Simülasyonların tamamlanmasının ardından, elde edilen yörüngeler Görsel Moleküler Dinamik (VMD) ve PyMOL kullanılarak analiz edildi ve proteinler ile küçük moleküllü ligandlar arasındaki bağlanma serbest enerji analizi g_mmpbsa programı kullanılarak gerçekleştirildi.

RD hücre canlılığı üzerindeki ilaç etkilerinin değerlendirilmesi
RD hücreleri (Embriyonal Rabdomiyosarkom Hücresi; STR Doğrulanmış) logaritmik büyüme fazında, 1 x105 hücre/mL konsantrasyonda bir hücre süspansiyonu oluşturmak için tripsinize edildi. Bu süspansiyon daha sonra 1 x 104 hücre/kuyu (kuyu başına 100 μL) yoğunlukta 96 oyuklu bir plakaya ekildi ve hücre yapışmasına izin vermek için %5CO2 ile 37 °C'de inkübe edildi. Yapışmayı takiben, ortam% 100 FBS içeren 1 μL serumsuz ortam ile değiştirildi ve hücreler 12 saat aç bırakıldı. Daha sonra ortam, test bileşiğinin değişen konsantrasyonlarını içeren ilgili ortamın 100 μL'si ile değiştirildi. Kontrol kuyucukları, solvent içeren ortam veya normal ortam ile muamele edildi ve yalnızca hücresiz karşılık gelen ortamı içeren boş kuyucuklar dahil edildi. Plakalar 37 °C'de %5 CO ile inkübeedildi.2 24 saat (süre, bu bileşik sınıfının RD hücreleri üzerindeki maksimum inhibitör etkisini gözlemlemek için optimal olacak şekilde ön deneylerle belirlendi. Yani, hücre yoğunluğunun OD değerinin yaklaşık 1.0'a ulaşması için gereken süre.). Daha sonra, her bir oyuğa 10 μL CCK-8 çözeltisi eklendi ve plakalar 1-4 saat daha inkübe edildi. Son olarak, 450 nm'deki absorbans bir mikroplaka okuyucu kullanılarak ölçüldü. Çözücü ile muamele edilmiş hücreler kontrol grubu olarak görev yaptı ve boş kuyucuklar temel düzeltme için kullanıldı. Hücre canlılığı, absorbans okumalarına göre hesaplandı.

Hayatta kalma oranı% = [(kontrol grubu-boş)-(deney grubu-boş)]/(kontrol grubu-boş) x %100

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Sonuçlar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bu çalışmada, 13 tiazolon türevi (a-m bileşikleri; Şekil 3, Şekil 4) daha önce sentezlenmişti19 kanser hücrelerine karşı inhibitör aktivitelerinin değerlendirilmesi için seçildi (Şekil 5). Bu bileşikler arasında, 100 μM'deki bileşik m, RD hücrelerine (Embriyonal Rabdomiyosarkom Hücresi) (STR Doğrulanmış)22'ye karşı en yüksek inhibisyon oranını göstermiştir. Değişen konsantrasyonları (5...

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Tartışma

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Ağ farmakolojisi, karmaşık geleneksel Çin tıbbı bileşenleri içindeki potansiyel aktif molekülleri tahmin etmek ve taramak ve bitkisel formülasyonlardaki çok bileşenli, çok hedefli ve çok eylemlerin sinerjik mekanizmalarını aydınlatmak için yaygın olarak kullanılır. Bu çalışmada, yeni sentezlenen tiazolon türevimizin RD'ye karşı potansiyel mekanizmasını bir bileşik-hedef-yol-hastalık ağı oluşturarak sistematik olarak araştırmak için bir ağ farmakolojisi yaklaşımı uyguladık. Bu çalışmada, ...

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Açıklamalar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Yazarlar herhangi bir çıkar çatışması beyan etmemektedir.

Teşekkürler

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bu yayında bildirilen Araştırma, Şangay Spor Üniversitesi'nin (2025STD004) bir araştırma projesi tarafından desteklenmiştir.

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi
AdŞirketKatalog numarasıYorumlar
CCK-8 Analiz KitiBeyotime Biotechnology Co., Ltd.C0038Suda çözünebilen tetrazolyum tuzunun renkli bir ürün oluşturmak için indirgenmesine dayalı hücre canlılığı ve çoğalma ölçümü için kullanılan bir kit.
Temiz SıraSuzhou Antai Airtech Co., LtdSW-CJ-1FDHücre kültürleri ve diğer hassas malzemelerin işlenmesi için steril bir ortam sağlayan laminar hava akışı çalışma istasyonu.
CO2 Kuluçka MakinesiHeal ForceHF90Hücre kültürü için sıcaklık, nem ve CO2 kontrollü bir ortam kullanılır; böylece optimal büyüme koşulları sağlanır.
DMEM Yüksek GlikozcytivaSH30022.01Yüksek glukoz konsantrasyonuna (4,5 g/L) sahip bir hücre kültür ortamıdır; hızlı büyüyen memeli hücreleri dahil olmak üzere çeşitli hücre tipleri için uygundur.
FBSYEASEN40130ES76Hücre kültüründe yaygın bir takviye olup, hücre çoğalması için temel büyüme faktörleri, hormonlar ve besinler sağlar.
Ters MikroskopOLYMPUSIX51Aşamanın altında objektif lens bulunan ve hücre kültürlerinin aşağıdan şişe veya plakalarda gözlemlenmesine olanak tanıyan bir mikroskop.
Microplate ReaderDiatekDR-200B'lerMikroplaka örneklerindeki biyolojik, kimyasal veya fiziksel olayları emilik, floresans veya lülüsans ölçülerek tespit etmek için kullanılan bir cihazdır.
PBSJinuo Biyomedikal Teknoloji A., Ltd.GNM20012Tampon çözeltisi, biyolojik araştırmalarda hücreleri yıkamak, çözeltileri seyreltmek ve pH stabilitesini korumak için yaygın olarak kullanılır.
RD (Embriyonal Rabdomiosarkom Hücresi) (STR Doğrulanmış)Şanghay FuHeng Biyoteknoloji Şirketi, Ltd.FH0712Hücre hattı kısa tandem tekrar (STR) analiziyle doğrulanmış, iyi tanımlanmış genetik arka plana ve net hücre kimliğine sahiptir; böylece deneysel verilerin güvenilirliği ve tekrarlanabilirliği sağlanır.
RMPI Orta Modifiye (1640)cytivaSH30809.01İnsan lökosit hücreleri için geliştirilen yaygın olarak kullanılan bir hücre kültürü ortamı, şimdi çeşitli memeli hücre tipleri için uygulanmaktadır.
Tripsin-EDTAJinuo Biyomedikal Teknoloji A., Ltd.GNM25200Yapışkan hücreleri kültür yüzeylerinden ayırmak için hücre dışı proteinleri sindirmek ve kalsiyum iyonlarını şelatlamak için kullanılan bir çözelti.

Kaynaklar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Chen, C., Dorado Garcia, H., Scheer, M., Henssen, A. G. Current and future treatment strategies for rhabdomyosarcoma. Front Oncol. 9, 1458(2019).
  2. Skapek, S. X., et al. Rhabdomyosarcoma. Nat Rev Dis Primers. 5 (1), 1(2019).
  3. Leiner, J., Le Loarer, F. The current landscape of rhabdomyosarcomas: An update. Virchows Archiv. 476 (1), 97-108 (2020).
  4. Hawkins, D. S., et al. Addition of vincristine and irinotecan to vincristine, dactinomycin, and cyclophosphamide does not improve outcome for intermediate-risk rhabdomyosarcoma: A report from the children's oncology group. J Clin Oncol. 36 (27), 2770-2777 (2018).
  5. Weigel, B. J., et al. Intensive multiagent therapy, including dose-compressed cycles of ifosfamide/etoposide and vincristine/doxorubicin/cyclophosphamide, irinotecan, and radiation, in patients with high-risk rhabdomyosarcoma: A report from the children's oncology group. J Clin Oncol. 34 (2), 117-122 (2016).
  6. Chisholm, J., et al. Frontline and relapsed rhabdomyosarcoma (far-rms) clinical trial: A report from the european paediatric soft tissue sarcoma study group (epssg). Cancers. 16 (5), 998(2024).
  7. Robinson, G. W., et al. Irreversible growth plate fusions in children with medulloblastoma treated with a targeted hedgehog pathway inhibitor. Oncotarget. 8 (41), 69295-69302 (2017).
  8. Finiuk, N., et al. 4-thiazolidinone derivative les-3833 effectively inhibits viability of human melanoma cells through activating apoptotic mechanisms. Croat Med J. 58 (2), 129-139 (2017).
  9. Petrou, A., Fesatidou, M., Geronikaki, A. Thiazole ring-a biologically active scaffold. Molecules. 26 (11), 3166(2021).
  10. Gupta, S., Jha, S., Rani, S., Arora, P., Kumar, S. Medicinal perspective of 2,4-thiazolidinediones derivatives: An insight into recent advancements. ChemistryOpen. 13 (11), e202400147(2024).
  11. Elgubbi, A. S., El-Helw, E. aE., Alzahrani, A. Y. A., Ramadan, S. K. Synthesis, computational chemical study, antiproliferative activity screening, and molecular docking of some thiophene-based oxadiazole, triazole, and thiazolidinone derivatives. RSC Adv. 14 (9), 5926-5940 (2024).
  12. El-Helw, E. aE., Asran, M., Azab, M. E., Helal, M. H., Ramadan, S. K. Synthesis, cytotoxic, and antioxidant activity of some benzoquinoline-based heterocycles. Polycyc Aromatic Comp. 44 (9), 5938-5950 (2024).
  13. Chawla, P. A., Wahan, S. K., Negi, M., Faruk, A., Chawla, V. Synthetic strategies and medicinal perspectives of 4-thiazolidinones: Recent developments and structure-activity relationship studies. J Heterocyc Chem. 60 (8), 1248-1286 (2023).
  14. Alam, F., et al. Efficacy and safety of pioglitazone monotherapy in type 2 diabetes mellitus: A systematic review and meta-analysis of randomised controlled trials. Sci Rep. 9 (1), 5389(2019).
  15. Moon, J. H., Hong, J. M., Park, S. Y. The antidiabetic drug troglitazone protects against prp (106-126)-induced neurotoxicity via the pparγ-autophagy pathway in neuronal cells. Mol Med Rep. 23 (6), 430(2021).
  16. Datar, P. A., Aher, S. B. Design and synthesis of novel thiazolidine-2, 4-diones as hypoglycemic agents. J Saudi Chem Soc. 20, S196-S201 (2016).
  17. Tiber, P. M., et al. Evaluation of hydrazide-hydrazone and 4-thiazolidinone derivatives of etodolac as potential anticancer agents in leukemia cells. Lett Drug Design Disc. 21 (12), 2396-2406 (2024).
  18. Tilekar, K., Shelke, O., Upadhyay, N., Lavecchia, A., Ramaa, C. S. Current status and future prospects of molecular hybrids with thiazolidinedione (tzd) scaffold in anticancer drug discovery. J Mol Str. 1250, 131767(2022).
  19. Wang, Z. -H., Wang, J. -R., Wei, Y. -Y., Liu, B., Lin, T. -Y. Copper-catalyzed remote asymmetric yne-allylic substitution: Construction of thiazolone derivatives with adjacent chiral centers. Org Chem Front. 11 (21), 6083-6088 (2024).
  20. Wang, X., Wang, Z. Y., Zheng, J. H., Li, S. Tcm network pharmacology: A new trend towards combining computational, experimental and clinical approaches. Chin J Nat Med. 19 (1), 1-11 (2021).
  21. Li, S. Network pharmacology evaluation method guidance - draft. World J Trad Chinese Med. 7 (1), 146-154 (2021).
  22. Hinson, A. R. P., et al. Human rhabdomyosarcoma cell lines for rhabdomyosarcoma research: Utility and pitfalls. Front Oncol. 3, 183(2013).
  23. Zhang, Q., et al. Clinical and genetic analysis of immunodeficiency-related diseases associated with pik3cd mutations. Pediat Investigat. 2 (4), 257(2019).
  24. Bae, S., et al. Akt is negatively regulated by the Mulan E3 ligase. Cell Res. 22 (5), 873-885 (2012).
  25. Padi, S. K., et al. Phosphorylation of depdc5, a component of the gator1 complex, releases inhibition of mtorc1 and promotes tumor growth. Proc Natl Acad Sci. 116 (41), 20505-20510 (2019).
  26. Duda, P., et al. Targeting gsk3 and associated signaling pathways involved in cancer. Cells. 9 (5), 1110(2020).
  27. Manduca, J. D., Thériault, R. K., Perreault, M. L. Glycogen synthase kinase-3: The missing link to aberrant circuit function in disorders of cognitive dysfunction. Pharmacol Res. , 157(2020).
  28. Lai, S., Wang, P., Gong, J., Zhang, S. New insights into the role of gsk-3β in the brain: From neurodegenerative disease to tumorigenesis. PeerJ. 11, e16635(2023).
  29. Haase, M., Fitze, G. Hsp90ab1: Helping the good and the bad. Gene. 575 (2), 171-186 (2016).
  30. Su, C., et al. Integrinβ-1 in disorders and cancers: Molecular mechanisms and therapeutic targets. Cell Comm Signal. 22 (1), 71(2024).
  31. Sun, L., Guo, S., Xie, Y., Yao, Y. The characteristics and the multiple functions of integrin β1 in human cancers. J Translat Med. 21 (1), 787(2023).
  32. Prota, A. E., et al. A new tubulin-binding site and pharmacophore for microtubule-destabilizing anticancer drugs. Proc Natl Acad Sci. 111 (38), 13817-13821 (2014).

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Yeniden basım ve izinler

Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste

İzin iste

Etiketler

Network PharmacologyThiazolone DerivativesRhabdomyosarcoma TreatmentIn Vitro ExperimentsTumor SuppressionProtein DockingTarget PredictionCell CultureSignaling PathwaysDrug Development

İlgili makaleler