N 6-metiladenosin (m⁶A), ökaryot haberci RNA'da (mRNA) en yaygın iç modifikasyondur ve transkripsiyon sonrası düzenlemede önemli rol oynar; RNA stabilitesi, splicing, bozunma, translasyon veihracat 1,2,3 dahildir. M⁶A modifikasyonunun düzensizliği, tümör başlatılması, ilerlemesi vemetastaz 4,5 dahil olmak üzere çeşitli fizyolojik ve patolojik süreçlerde rol oynamıştır. Osteosarkomda, hem hücre hatlarında hem de dokularda yüksek m⁶A seviyeleri gözlemlenmiştir; bu da hastalık biyolojisinde anormal RNA metilasyonununrolünü göstermektedir 6,7. Bu nedenle, küresel m⁶A bolluğunun sistematik olarak değerlendirilmesi, osteosarkomla ilişkili transkriptler ve düzenleyici yollardaki değişikliklerle birlikte, osteosarkomda RNA metilasyonunun biyolojik mekanizmalarını ve klinik etkilerini netleştirmek için gereklidir.
m⁶Amodifikasyonları 8,9'u incelemek için çeşitli analitik yöntemler mevcuttur. Sıvı kromatografi-kütle spektrometrisi/kütle spektrometrisi (LC-MS/MS)10 ve enzim bağlantılı immünosorbent test (ELISA) tabanlıtestler 11 küresel m⁶A seviyelerini ölçmek için kullanılır. İlki yüksek hassasiyet sunar ancak özel ekipman ve uzmanlık gerektirirken, ikincisi görecelim 6A seviyeleri sağlar ve dot blot testinden daha yüksek maliyete katkıda bulunur. MeRIP-qPCR, belirli transkriptlerin hedefli değerlendirilmesini sağlar, ancak immünopresipitasyon etkinliğinden güçlü şekildeetkilenir. MeRIP-seq13, m⁶A-seq14 ve m⁶A-SAC-seq15, m⁶A metilasyon noktalarını tam olarak haritalayabilen dizileme tabanlı yaklaşımlardır; ancak pahalıdırlar ve kapsamlı biyoinformatik analiz gerektirirler.
m⁶A nokta leke testi, RNA'da küresel m⁶A modifikasyon seviyelerini belirlemek için basit, hızlı ve maliyet etkin bir yöntem sunar. Yarı nicel bir immünoanaliz olarak, temel avantajı, özel ekipman veya karmaşık biyoinformatik analiz gerektirmeden m⁶A bolluğunun genel bir görünümünü üretmektir. Bu da m⁶A nokta leke testini rutin tarama, ön fonksiyonel doğrulama ve klinik araştırmalar için değerli bir araç olmanın yanı sıra gelişmiş dizileme ve kütle spektrometrisi tabanlı yaklaşımlara pratik bir tamamlayıcı yapar. Mevcut protokol, tekrarlanabilir algılama ve geniş uygulama sağlayacak ayrıntılı adım adım iş akışı sunmaktadır.