Collection-image

TOPICAL COLLECTIONS

Kromatin Yapısını ve Genom Regülasyonundaki Rolünü Çalışmaya Yönelik Yaklaşımlar
Submit Abstract

Guest Editor

Dongyan Tan

Dongyan Tan

Stony Brook University, Department of Pharmacological Sciences

Dr. Dongyan Tan, New York'taki Stony Brook Üniversitesi Farmakolojik Bilimler Bölümü'nde yardımcı doçenttir. Lisans derecesini Çin'deki Sun Yat-Sen Üniversitesi Yaşam Bilimleri bölümünden, doktora derecesini ise 2009 yılında Albert Einstein Tıp Okulu Biyofizik ve Fizyoloji bölümünden almıştır. Daha sonra, Yapısal Biyoloji ve elektron mikroskobu (EM) alanındaki doktora sonrası eğitimleri için Harvard Tıp Okulu'na geçmiştir. 2016 yılında Dr. Tan, Stony Brook Üniversitesi'nde bağımsız akademik kariyerine başlamıştır. Dr. Tan; biyokimya, biyofizik ve hücre biyolojisi alanlarında geniş bir birikime sahiptir. Ayrıca, karmaşık biyolojik sorunları çözmek için farklı disiplinlerden bilim insanlarıyla başarılı iş birlikleri yürüttüğü kanıtlanmış bir geçmişe sahiptir. Kromatin biyolojisi ve genom düzenlemesine olan ilgisi, Harvard Tıp Okulu'ndaki çalışmaları sırasında başlamıştır. Laboratuvarı, normal gelişim sırasında ve hastalıklarda gen düzenlemesinde önemli işlevleri olan makromolekülleri incelemek için kryo-EM ile çeşitli biyokimyasal ve biyofiziksel yaklaşımlar kullanmaktadır. Laboratuvarındaki mevcut projeler, histon varyantlarının ve kromatinle ilişkili proteinlerin kromatinin yapısını ve dinamiğini nasıl modüle ettiğini ve bu süreçlerin transkripsiyonu ve DNA hasar onarımlarını nasıl etkilediğini anlamaya odaklanmaktadır. 

Collection Overview

Doğru gen ekspresyonu, normal hücresel fonksiyonun ve organizma gelişiminin sağlanması için kritik öneme sahiptir. Ökaryotlarda genom, genom fonksiyonunu şekillendiren güçlü bir platform görevi gören dinamik bir DNA-protein kompleksi olan kromatin şeklinde organize edilmiştir. Kromatinin nasıl organize edildiğini anlamak, fizyolojide genom regülasyonunu ve bu regülasyondaki bozulmaların hastalıklara nasıl yol açtığını anlamak için gereklidir.

Bu koleksiyon, kromatin yapısını ve fonksiyonlarını hem çekirdek içinde hem de in vitro izole durumda incelemek için kullanılan mevcut yöntemlere odaklanmaktadır. Bunlar arasında, genom mimarisini hem organizma düzeyinde hem de tek hücre çözünürlüğünde haritalamak için kullanılan kantitatif yöntemler (3C tabanlı yöntemler), kromatin yapısının genom fonksiyonuyla nasıl iç içe geçtiğine dair önemli bilgiler sağlayan bir dizi teknik yer almaktadır. Ayrıca, kromatin yapı-dinamiği anlayışımıza geniş ölçüde katkıda bulunan bir teknik olan analitik ultrasantrifüjleme de yer almaktadır. Son olarak koleksiyon, kromatinin farklı ölçeklerde doğrudan görselleştirilmesine olanak tanıyan görüntüleme tekniklerini içermektedir. Özellikle, süper çözünürlüklü görüntüleme, hücrelerdeki kromatin hakkında in situ nanometre ölçeğinde yapı bilgisi sağlamıştır. Kriyojenik elektron mikroskobisine dayalı teknikler, nanometre ölçeğinden atomik çözünürlüğe yakın seviyelere kadar yapısal bilgiler üreterek, kromatin organizasyonunu incelemek için önemli araçlar olarak ortaya çıkmıştır.

Özetle, bu koleksiyon yalnızca bu yöntemlerin ayrıntılı protokollerini sunmakla kalmaz, aynı zamanda hızla gelişen kromatin biyolojisi alanındaki güncel metodolojik ilerlemeleri tanıtmak için bir platform görevi görür.