Name: Deniz suyu Örnekleme ve Tahsilat (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2009-06-17T19:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 23 s
Description: Keşfedin deniz suyu örnekleme yöntemlerini biyokütle konsantrasyonu ve nükleik asit saflaştırması için. Bu prosedür, deniz ekosistemlerini inceleyen araştırmacılar için güvenilir veri sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Yenilik, British Columbia Bilgi Kalkınma Fonu ve Ulusal Bilimler ve Mühendislik Araştırma Konseyi (NSERC) Kanada Kanada Vakfı Biz, kıyı ve açık okyanus sularında düşük oksijen bölgelerde devam eden çalışmalar destek için teşekkür etmek istiyorum. Buna ek olarak, DAW NSERC, Killam ve TULA vakıf Mikrobiyal Çeşitlilik ve Evrim finanse Merkezi burs tarafından desteklenmiştir.

Bölüm 1: Su Toplama <ol><li> Derinlikleri her döküm atanır. </li><li> Derinlikleri numune alınacak ve mevcut döküm için tahsil edilecek toplam hacmi belirlenir. </li><li> Go-Flo ve Niskin şişe açıktır ve vanalar ve uçlar kapalı olduğunu sağlanır. </li><li> CTD hattı alt yüklenir ve suya daha düşüktür. </li><li> Döküm örneklenmiş derin derinlik için bir şişe ilk CTD sonra çizgi üzerine yüklenir; satır dirsek içine doğru takılı olduğunu sağlanır ve vidaları sıkılır. </li><li> Bir haberci indirilmesinden önce (en derin hariç) her bir şişe bağlı. </li><li> Hattı ilk derinliği ve gelecek arasındaki mesafe düşürdü; başka bir şişe daha sonra yüklenir. 20L filtrasyon için toplanan derinlikleri için, toplam 2 12L şişelerin dışında .75 m hakkında art arda yüklü olduğu unutulmamalıdır. </li><li> Tüm şişeler on line sonra, çizgi istenilen derinliğe kadar indirilir ve 2 dakika geçmesine izin verir. </li><li> Bir haberci indirdik ve tüm şişe yakın sağlamak geçmek için birkaç dakika izin verilir. </li><li> Doğrultusunda reeled ve rafları üzerine gelip şişe boşaltılır. </li><li> DNA ve RNA için 20L örnekleri gerektiren derinlikler için, iki Niskin şişe toplanır. Bir şişe, damacana diğer boşaltılması ise, kimyasal parametreler (aşağıya bakın) örnek kullanılır. RNA ikinci Niskin hemen toplanır. ~ 20L son hacim vermek için damacana ilk kalanı da içine boşaltılır. Düşük çözünürlüklü örnekleri için sadece su 1L steril Nalgene şişe filtrasyon için bir kenara koyun. </li></ol> Bölüm 2: Gaz örnek toplama <ol><li> Eğer oksijen örnekleri ihtiyaç vardır, onlar ilk toplanır. </li><li> Bir parça ince boru Niskin bağlı / Go-Flo tertibatı ve hortumun diğer ucunu cam serum şişeleri içine yerleştirilir. </li><li> Serum şişe 3 kez numune su ile durulanır ve hiçbir hava kabarcığı mevcut olduğunu tıklım dolu. </li><li> 50μl civa klorür (HgCl 2) örnek içine hava kabarcıkları tanıtmak olmayan bir şekilde serum şişesine eklenir. </li><li> Şişe, bir lastik tıpa ve alüminyum bir kap ile oturtulmuş ile kapatılan ve daha sonra bir soğutucu buz saklanır. </li></ol> Bölüm 3: Besin örnek toplama <ol><li> 60 cc şırınga numune su ile durulanır, in-line (0.2 mikron) eklenir ve biraz su acrodisc ile itilir. </li><li> Polietilen şişe (durulama sırasında şişe sallamak) ~ 10 ml filtrelenmiş su ile 3 kez yıkanır. </li><li> Filtreli örnek su hakkında, şişe eklenir ¾ dolu. </li><li> Numune soğutucu buz üzerinde saklanır. </li></ol> Bölüm 4: Amonyak örnek toplama <ol><li> Örnek tüpleri, numune su ile durulanır. </li><li> Örnek tüpleri, numune su ile tamamen doldurulur. </li><li> Numune su 5ml, 10ml pipetlemeyin kullanarak dışarı alınır; tüp içindeki suyun geri kalanı atılır ve pipetlemeyin uç örnek tüpe 5ml değiştirilir. </li><li> Tüm derinliklerinden örnekleri sonra amonyum çalışan reaktif 7.5ml her tüpe eklenir. </li></ol> Bölüm 5: hücre sayımı için örnek toplama <ol><li> 5.4 ml% 37 formaldehit içeren bir ön etiketli 50 ml Falcon tüp final konsantrasyon% 4 üst doludur. Bakım dökmemeye alınır. </li></ol> Bölüm 6: hidrojen sülfit ölçümler için örnek toplama <ol><li> % 20 çinko asetat (Zn (O 2 CCH 3) 2) içeren bir ön etiketli 50 ml Falcon tüp üst doludur. Bakım dökmemeye alınır. </li></ol> Bölüm 7: biyokütle konsantrasyonu Küçük hacimli toplama <ol><li> 1 litrelik şişelerde üst doldurulur. </li></ol> Bölüm 8: biyokütle konsantrasyonu Büyük hacimli toplama <ol><li> 20 litrelik bidonlarda doldurulur. </li></ol> Bölüm 9: Temsilcilik Sonuçlar Nihai sonucu yaklaşık 12 çözünmüş oksijen örnekleri, 32-48 gaz numunesi, 16 besin örnekleri, 32 amonyum örnekleri, 16 hidrojen sülfür örnekleri, hücre sayımı için 16 örnek, 6 20-litrelik bidonlarda, 16 adet 1 litrelik şişe deniz suyu numune sonuçları 4 Sterivex 0.22μm filtreleri içeren mikrobiyal biyokütle daha sonra RNA ile korunmuştur.

<ol><li>Cline, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spectrophotometric+determination+of+hydrogen+sulfide+in+natural+waters%5BTitle%5D)+AND+%22Limnology+%26+Oceanography%22%5BJournal%5D)">Spectrophotometric determination of hydrogen sulfide in natural waters.</a> Limnology & Oceanography. 14, 454-458 (1969).</li>
<li>Holmes, R. M., Aminot, A., Kerouel, R., Hooker, B. A., Peterson, B. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+and+precise+method+for+measuring+ammonium+in+marine+and+freshwater+ecosystems%5BTitle%5D)+AND+%22Canadian+Journal+of+fisheries+and+Aquatic+Science%22%5BJournal%5D)">A simple and precise method for measuring ammonium in marine and freshwater ecosystems.</a> Canadian Journal of fisheries and Aquatic Science. 56, 1801-1808 (1999).</li>
</ol>

Yazarların beyan edilecek bir çıkar çatışması yoktur.

Genel olarak, bu tip örnekleme için gerekli hazırlık ve planlama büyük bir anlaşma, bu nedenle gezisi sonrasında her şeyin temizlenmesi için sipariş ve bir gün şeyler almak için bütçe 2 gün önce. Genel olarak, tuzlu su veya saha ekipmanları taşımak için kullanılan alüminyum Zarges kutuya peristaltik pompa ile temas etmesine izin vermeyin. Saygılı davranın ve ekipman gelmek için uzun bir zaman için iyi bir performans sergileyecektir.

<table><tbody><tr><td>20L Karboylar</td><td></td><td>Fisher Scientific</td><td>02-960-15</td><td></td></tr><tr><td>3/8&quot; Tygon</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-36</td><td></td></tr><tr><td>Sterivex filtreler</td><td></td><td>Fisher Scientific</td><td>SVG010RS</td><td></td></tr><tr><td>Ön Filtre Muhafaza Ünitesi</td><td></td><td>AMD</td><td>501200</td><td></td></tr><tr><td>Luer Bağlantı Parçası</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>31507-27</td><td></td></tr><tr><td>1/4&quot; Tygon hortum</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-24</td><td></td></tr><tr><td>1/4&quot; Tygon hortum</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-24</td><td></td></tr><tr><td>1/4&quot; Tygon hortum</td><td></td><td>Cole-Parmer</td><td>06429-24</td><td></td></tr><tr><td>50ml Plastik tüpler</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Cam Serum Şişeleri</td><td></td><td></td><td></td><td>Cam Numune Toplama</td></tr><tr><td>Cam serum şişeleri için septalar ve alüminyum kapaklar</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>El Tipi Kapatıcı (Crimper)</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>20-200ul Pipet ve Uçlar</td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Cam Tüpler</td><td></td><td></td><td></td><td>Amonyum Numune Toplama</td></tr><tr><td>30ml Plastik Şişeler</td><td></td><td></td><td></td><td>Besin Toplama</td></tr><tr><td>Acrodisc Filtreler</td><td></td><td>EMD Millipore</td><td></td><td></td></tr><tr><td>5 ml Tüpler</td><td></td><td></td><td></td><td>Nitrit Numune Toplama</td></tr><tr><td>%37 Formaldehit</td><td>Reaktif</td><td></td><td></td><td>Hücre sayım numuneleri için</td></tr><tr><td>%20 Çinko Asetat</td><td>Reaktif</td><td></td><td></td><td>Sülfür numuneleri için</td></tr><tr><td>Cıva(II) Klorür</td><td>Reaktif</td><td></td><td></td><td>Gaz numuneleri için</td></tr><tr><td>milliQ su</td><td>Reaktif</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Amonyum Çalışma Reaktifi</td><td>Reaktif</td><td></td><td></td><td>Borat tamponu, sodyum sülfit, ortofaladiyaldehit</td></tr><tr><td>Sülfanilamid</td><td>Reaktif</td><td></td><td></td><td>450ml su ve 50ml HCl içine 5g</td></tr><tr><td>N-(1-naftil)-etilendiamin dihidroklorür çözeltisi</td><td>Reaktif</td><td></td><td></td><td>500ml su içine 0.5g</td></tr></tbody></table>

deniz suyu Örnekleme ve tahsilat

Seawater Sampling and Collection

Bu video belgeleri kıyı deniz suyu örneklerinin toplanması ve biyokütle konsantrasyonu, nükleik asit saflaştırma, hücrenin bolluk, besin ve iz gaz analizleri de dahil olmak üzere çeşitli alt uygulamalar için işleme yöntemleri. Saanich&#39;dan Giriş HMS John Strickland işletim güverte bugünkü gösteri örnekleri için toplanmıştır. Niskin ile birlikte kullanılır ya da çok amaçlı vinç ve kablo sistemi ile derrick A-çerçevesi, Go-Flo su örnekleme şişeleri. , İletkenlik, Sıcaklık, ve Derinlik (BDH) sensörleri, aynı zamanda temel su kütlesi örnek kullanılır. Outgassing en aza indirmek için, iz gaz örnekleri toplanır. Sonra, besinler, su kimyası ve hücre sayıları belirlenir. Son olarak, sular biyokütle filtrasyon için toplanır. Tek bir döküm için set-up ve tahsilat süresi en fazla 215 metre derinlikte ~ 1.5 saat. Bu nedenle, toplam 6 saat, genellikle burada açıklanan koleksiyon serisi tamamlamak için gerekli.

Bu video belgeleri kıyı deniz suyu örneklerinin toplanması ve biyokütle konsantrasyonu, nükleik asit saflaştırma, hücrenin bolluk, besin ve iz gaz analizleri de dahil olmak üzere çeşitli alt uygulamalar için işleme yöntemleri.

Deniz suyu Örnekleme ve Tahsilat

Bu video, kıyı deniz suyu örneklerinin toplanması ve biyokütle dahil olmak üzere çeşitli alt uygulamalar için işlenmesine yönelik yöntemleri belgelemektedir...

Merhaba, ben University of British Columbia Mikrobiyoloji ve İmmünoloji Bölümü'ndeki Stephen Hallam Laboratuvarı'ndan Elena Kova. Bugün size fiziksel, kimyasal ve biyolojik analizler için deniz suyu toplama prosedürünü göstereceğiz. Laboratuvarımızda deniz sularının okyanografik parametrelerini incelemek için bu prosedürü kullanıyoruz.Öyleyse başlayalım. İlk olarak, her bir atıştaki atış sayısı ve derinlikler atanır, ardından örnekleme yapılacak derinlikler ve mevcut atış için toplanacak toplam hacim belirlenir. Go-flow ve kin su örnekleme cihazlarının açık konumda olduğundan ve tüm vanaların ve muslukların kapalı olduğundan emin olun.CTD'yi hattın tabanına takın ve profildeki en derin noktaya ulaşmak için suya indirin. CTD'nin hemen arkasına hatta bir örnekleme cihazı yerleştirin. Hattın cihaz braketine düzgünce oturduğundan ve vidaların sıkı olduğundan emin olun.Cihazı suya indirmeden önce, en derin örnekleme derinliği hariç her bir cihaza ağırlıklı bir haberci (messenger) takın. Hattı ve ilk belirtilen derinlik ile bir sonraki derinlik arasındaki mesafeyi indirin, ardından başka bir örnekleme cihazı kurun. Büyük hacimli su örneklerinin toplandığı derinlik aralıkları için, toplam

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Su sütunu çapı 0.22μm ve 2.7μm arasında değişen mikrobiyal biyokütle Bu video belgeleri büyük hacimli filtrasyon (≥ 20 L).

Büyük Hacimli Kıyı Deniz suyu Örnekleri (20L +) Filtrasyon

Bu video belgeleri küçük hacimli (~ 1 L) su sütunu mikrobiyal biyokütle filtrasyon.

Kıyı Deniz suyu Örnekleri Küçük Hacim (1-3L) Filtrasyon

Kaynak: Villela, H. D. M . ve diğerleri. Metaorganizma Araştırması ve Koruma için Biyoremediasyon ve Probiyotik Geliştirme için Mikrobiyal Suşların Araştırılması. J. Vis. Exp. (2019)Bu video, petrol bazlı ortamda deniz suyu örneklerinin zenginleştirilmesiyle petrol bozucu deniz bakterilerinin seçici izolasyonunu gösteriyor; bu da ham petrol biyoremediasyonu ve çevresel temizlikte potansiyel uygulamalara sahip saf suşların geri kazanılmasını sağlıyor.

Deniz Suyu Örneklerinden Petrol Bozucu Deniz Bakterilerinin Seçici Zenginleştirmesi ve İzolasyonu

Burada, uzak deniz ortamlarında organik ve inorganik besin mevcudiyetini ve mikrobiyal ve viral toplulukların bolluğunu ve yapısını değerlendirmek için kapsamlı bir protokol sunuyoruz.

Su Kimya ve Deniz Mikrobiyoloji A Field Guide - Okyanusu&#39;nda gaybı Oyuncular çözülüyor

Sucul ortamlarda eser metal çalışmaları için su örneklerinin uygun şekilde toplanması ve işlenmesi için "temiz tekniklerin" kullanılmasına özel dikkat gösterilmesi gerekmektedir. Ayrıntılı eser metal çalışmaları için güvenilir çevresel izleme verileri ve yüksek hassasiyete sahip sonuçlar elde etmek amacıyla numune alma, işleme ve analitik prosedürler için bir protokol sunulmaktadır.

Temiz Örnekleme ve Eser Metal Çalışmaları Nehri ve haliç Waters Analizi

Burada, tortu-su gazı ölçümü ve çözünen madde değişimi için küçük çekirdek inkübasyonları sunuyoruz. Bunlar, sucul ekosistemlerdeki biyolojik ve biyojeokimyasal süreçleri etkilemede tortunun rolünü değerlendiren tortu-su değişiminin güvenilir ölçümlerini sağlayacaktır.

O Bentik Değişim<sub&gt; 2</sub&gt; K<sub&gt; 2</subKüçük Çekirdek KUluçkalar Kullanma&gt; ve Çözünmüş Besinler

Plankton ve askıya alınan parçacıklar okyanusta biyojeokimyasal döngüleri içinde önemli bir rol oynamaktadır. Burada, deniz suyu büyük miktarlarda işleme yeteneği ile parçacıklar ve plankton denizde irili ufaklı derlemesinin bir ultra temiz, düşük stres yöntemi sağlamak.

Şeker boyutu deniz Plankton ve askıya alınan parçacıkları toplamak için Ultra temiz bir çok katmanlı aparat

Çoğu microplastic araştırma bugüne deniz sistemleri asma katı düzeyleri nispeten düşük olduğu ortaya çıktı. Odak şimdi yüksek tortu yükler ve yüzen enkaz özelliği olabilir tatlı su sistemleri için kayıyor. Bu iletişim kuralı toplama ve asma katı yük içeren su ortamları microplastic örnekleri analiz giderir.

Örnekleme, sıralama ve Microplastics su ortamlarında yüksek askıya alınan tortu yükler ve büyük yüzen enkaz ile karakterize

Burada, faal feribotlardan ve diğer ticari gemilerden deniz suyu örneklerinin toplanması ve filtrelenmesi yoluyla deniz eDNA'sını almak için yeni bir protokol sunuyoruz.

Yüzer Laboratuvar: Çevresel DNA Analizi için İşletme Feribotlarından Deniz Suyu Örneklerinin Toplanması ve Filtrelenmesi için Standart Operasyonel Prosedür

Burada, siyanofajları (ve konakçılarını) izole etmek için deniz ve tatlı su ekosistemlerinin öfotik bölgelerinden örnekleme yöntemlerini ve tek genotipleri zenginleştiren ve virüs-konak etkileşim dinamiklerini karakterize eden örnekleme sonrası süreçleri açıklıyoruz.

Fotosentetik Mikropların ve Virüslerinin Çevresel Örneklemesi: Tarladan Laboratuvara

Bu protokol, balina gözlem gemilerinden deniz balığı çevresel DNA (eDNA) örnekleri toplamak için standartlaştırılmış bir iş akışını tanımlar. Araştırmacılar ve eğitimli vatandaş bilim insanları için fizibilite önceliklidirken, çevresel koşullar, filtrasyon süresi, bulanıklık ve gemi üzerindeki lojistik uygulamanın pratik sınırlarını belirler.

Balina İzleme Gemileri için Çevresel DNA Örnekleme Örneği

Keşfedin deniz suyu örnekleme yöntemlerini biyokütle konsantrasyonu ve nükleik asit saflaştırması için. Bu prosedür, deniz ekosistemlerini inceleyen araştırmacılar için güvenilir veri sağlar.

Deniz suyu Örnekleme ve Tahsilat

Daha fazla video keşfet