Name: Denatüre Gradient Jel Elektroforezi (DGGE) (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2007-02-25T00:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 52 s
Description: Öğrenin, mikrobiyal biyofilm topluluklarındaki bakteri profillemesi için DDGE yöntemini kullanarak 16S rRNA dizilerindeki değişiklikleri analiz etmeyi. Bu teknik ekolojik dinamikleri anlamaya yardımcı olur.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Yazarların beyan edilecek herhangi bir çıkar çatışması yoktur.

denatüre gradient jel elektroforezi (dgge)

Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE)

Denatüre Gradient Jel Elektroforezi (DGGE)

Merhaba. Benim adım Celeste Peterson; Harvard Üniversitesi'nde mikrobiyal biyofilm toplulukları üzerine çalışan bir araştırmacıyım. Bakteriyel toplulukların 16S rRNA dizilerini ve bu dizilerin zamanla ve mekanda nasıl değiştiğini inceleyerek profilini çıkarıyorum. Bunu gerçekleştirmek için de DGGE yöntemini kullanıyorum.Bu, kuyumun normal bir akrili değildir; çalıştırılırken 60 derecede tutulması ve tamponun sürekli pompalanması gerekir. Bu nedenle, tamponu 60 dereceye ulaşana kadar yaklaşık bir saat boyunca ısıtacağız ve ardından deneyi başlatabiliriz. Şimdi, bu plakayı safsızlıkları gidermek için seyreltilmiş uc çözeltisiyle yıkayacağım ve ardından ışıklandıracağım.Buna benzer herhangi bir durum düzensizliklere yol açabilir. Tüm suyun silinmesi önemlidir. Bu nedenle jeli hazırlarken, çipi jelin dış kısmına yerleştireceğim.Böylece jel bu iki cam parçasının arasında kalacak ve çip dış kısımda yer alarak aradaki jeli etkilemeyecektir. Şimdi jeli bu kıskaçlar içine yerleştireceğim, ardından onları birbirine bastırıp sağa doğru çevirerek sıkıştıracağım. Her jelde olduğu gibi, alt kısmın düz olduğundan emin olmak önemlidir.Sızıntıyı önlemek için şimdi jeli ters çeviriyoruz ve contayla

denaturing-gradient-gel-electrophoresis-dgge

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Denatüre üre poliakrilamid jel elektroforezi ayrı tek iplikli DNA veya RNA 500 nükleotidlerin bir sınıra kadar kullanılır. Üre, ısı denatüre örnekleri ve yapılandırılmamış tek iplikçikler ile birlikte moleküler ağırlığına göre jel matriks içinde göç ederler.

Denatüre Üre Poliakrilamid Jel Elektroforez (Üre SAYFA)

Agaroz jel elektroforez ile DNA parçalarının ayrılması için temel bir protokol tarif edilmektedir.

DNA kırıntıları Ayrılma Agaroz Jel Elektroforezi

Bu video, amiloid liflerinin iki boyutlu yarı denatüre edici deterjan agaroz jel elektroforezi bazlı ayrımını göstermektedir. Teknik, polimorfik amiloid agregatlarını heterojen boyutlarına göre ayırır.

İki Boyutlu Yarı Denatüre Edici Agaroz Jel Elektroforezi: Polimorfik Amiloid Liflerini Boyut Heterojenliğine Göre Ayırmak İçin Bir Teknik

Bu videoda, insan fonksiyonel olmayan hipofiz adenomunun (NFPA) tümör dokularından elde edilen karmaşık bir protein karışımından tek tek proteinleri ayıran iki boyutlu bir jel elektroforezi yöntemi gösteriyoruz. Proteinler, birinci boyutta elektrik yüklerine göre ayrılır ve ikinci boyutta moleküler ağırlıklara göre daha da ayrılır.

İki Boyutlu Poliakrilamid Jel Elektroforezi: Yük ve Moleküler Ağırlığa Dayalı Kompleks Protein Karışımındaki Proteinlerin Analizi İçin Bir Ayırma Tekniği

RNA düzenleme olaylarının genomik ölçekte hızlı tespiti ve güvenilir bir şekilde ölçülmesi zorlu olmaya devam etmektedir ve şu anda doğrudan RNA dizileme yöntemlerine dayanmaktadır. Burada açıklanan protokol, RNA düzenlemesini tespit etmek için basit, hızlı ve taşınabilir bir yöntem olarak mikrosıcaklık gradyan jel elektroforezi (μTGGE) kullanır.

RNA Düzenlemenin Hızlı Tespiti için Dizilemesiz Bir Yaklaşım

Bu video in vitro anjiyogenez tayininde bir protokol anjiyogenez özetlediği çeşitli aşamaları olduğunu göstermektedir. Zaman atlamalı çimlenme görüntüleri, lümen oluşumu, dallanma ve anastomoz - anjiyogenez temel özellikleri gösterilmektedir.

Anjiyogenez Çalışmaları için optimize edilmiş Fibrin Jel Boncuk Testi

Biz, iyi tanımlanmış mikroçevresinin mekansal ve zamansal degradeleri üretebilir degrade üreten mikroakışkan cihaz mikroimalat için bir protokol tanımlamaktadır. Bu yaklaşımda, degrade üreten mikroakışkan cihaz yönlendirilmiş hücre göçü, embriyogenez, yara iyileşmesi, ve kanser metastazı çalışma için kullanılabilir.

Hücre Biyolojisi Degrade üreten mikroakışkan Aygıt

SDD-YAŞ hücrelerde polimerler gibi amiloid algılama ve karakterizasyonu için yararlı bir tekniktir. Burada, bu tekniğin büyük ölçekli uygulamalarda mükellef kılar bir uyum göstermektedir.

Yarı denatüre Deterjan-Agaroz Jel Elektroforez Amiloid Toplama taraması

Biz sezyum klorür yoğunluk gradiyenti santrifüj arıtma için 0.22 mikron Sterivex filtreler, konsantre planktonik biyokütle yüksek molekül ağırlıklı genomik DNA çıkarılması için bir metodu tanımlar.

0.22 mcM Sterivex Filtreler ve Sezyum Klorür Yoğunluk Gradient Santrifüj DNA Ekstraksiyon

Bu video, mavi yerli poliakrilamid jel elektroforezi (BN-PAGE) multiprotein kompleksler (MPCs) karakterizasyonu açıklar. Birinci boyut, diyaliz hücresel lizatları bireysel MPCs tanımlamak için BN-PAGE ile ayrılır. Ikinci bir boyut SDS-PAGE, faiz MPCs daha immün bileşenleri analiz alt gruba ayrılır.

Hücresel lizatları Multiprotein Kompleksleri Analizi Mavi Native Poliakrilamid Jel Elektroforez (BN-PAGE)

Öğrenin, mikrobiyal biyofilm topluluklarındaki bakteri profillemesi için DDGE yöntemini kullanarak 16S rRNA dizilerindeki değişiklikleri analiz etmeyi. Bu teknik ekolojik dinamikleri anlamaya yardımcı olur.

Denatüre Gradient Jel Elektroforezi (DGGE)

Daha fazla video keşfet