Domates Analyzer: İki boyutlu Objects Doğru ve detaylı Morfolojik ve Kolorimetrik Veri Toplama Faydalı Yazılım Uygulaması

Domates analizörünü kullanmak için. Domates meyveleri sayısallaştırılmış görüntüler toplamak için hazırlanır ve kesilir. Meyve, kesik tarafları aşağı bakacak şekilde tarayıcıya yerleştirilir ve bir JPEG görüntüsü elde etmek için taranır.

Daha sonra, görüntüler domates analizörü yazılımında görüntülenir ve analiz edilir. Tüm meyve şekli ölçümleri, yazılım tarafından tanınan meyve sınırlarına göre hesaplanırken, renk testi modülü, sınırların içindeki renk parametrelerini ölçmek için tasarlanmıştır. Son olarak, veriler bir kerede 100'den fazla görüntü içeren toplu modda veya tek tek görüntüler olarak bir Excel dosyasına aktarılır.

Merhaba, ben Estevan Dena ve Ohio Eyalet Üniversitesi Bahçe Bitkileri ve Mahsul Bilimi Bölümü'ndeyim. Ben Matthew Robbins, Ohio Eyalet Üniversitesi Bahçe Bitkileri ve Mahsul Bilimi Bölümü'ndeki Francis Laboratuvarı'ndayım. Ben Gu Rodriguez'den Adım Bugün size domates analizörü kullanarak domates meyvesinin şekil, boyut ve renk verilerini toplamak ve analiz etmek için bir prosedür göstereceğiz.

Domates meyvesinin morfolojisini ve rengini incelemek için bu prosedürü kullanıyoruz, Öyleyse başlayalım. Domates analizörü, kısaltılmış TA , iki boyutlu şekille ilgili 37 özelliği ölçen ve ayrıca RGB ve L yıldızı, A yıldızı, B yıldızı, evrensel levha renk uzayı renk alanında renk verilerini yarı otomatik ve tekrarlanabilir bir şekilde yakalayabilen bir yazılım programıdır. Burada TA, domates meyvesinin taranmış görüntüleri ile kullanılır.

Bu işleme başlamak için meyvenin temiz ve kuru olduğundan emin olun. Meyve etli ise fazla olgunlaşmadığından emin olun çünkü yumuşama meyveyi keserken şekil deformasyonuna neden olabilir. Bir meyvenin ne kadar düz veya uzun olduğunu ölçmek için ve enlem kesiti kategorisi altındakiler dışındaki tüm özellikler için, peri sazanının kalınlığını ölçmek ve enlem kesiti kategorisi altındaki tüm özellikler için meyveyi merkezden uzunlamasına kesmek için tırtıklı bir bıçak veya yeni bir tıraş bıçağı kullanın, Bazılarının yanı sıra temel ölçüm ve morf altında meyveyi enine kesin.

Renk analizi, uzunlamasına veya enine kesilmiş meyvelerin yanı sıra belirli özellikleri vurgulamak için tasarlanmış diğer bölümlere de uygulanabilir. Son olarak meyvenin iç kısmını kağıt mendil veya kağıt havlu ile kurulayarak kurulayın. Meyve çok sulu ise, kesilmiş meyve artık görüntü toplamaya hazırdır.

Yüksek verimli analiz için, bir seferde yalnızca bir bitki veya genotipten elde edilen meyveyi taramak ve aynı taramada uzunlamasına veya enine kesilmiş, ancak her ikisinin bir karışımı olmayan meyveleri taramak önemlidir. Kesilmiş meyveyi, kesik tarafı aşağı bakacak şekilde dikkatli ve hassas bir şekilde tarayıcıya yerleştirerek başlayın. Meyveleri tarayıcıya birbirine yakın ama dokunmayacak şekilde yerleştirin.

Nesneler, aralarında minimum büyük boşluk olacak şekilde ne kadar iyi hizalanırsa, Adobe Photoshop gibi görüntüleme yazılımlarıyla o kadar az manuel ayarlama gerekir. Meyveyi ta'da analiz etmeden önce, meyve özelliklerinin doğru ölçümü için önemli olan doğru tarama çözünürlüğünün seçildiğini doğrulamak için kullanılan meyvenin üzerine bir cetvel yerleştirin. Dosyanın doğru adlandırıldığını doğrulamak için meyvenin altına bir etiket yerleştirin.

TA yazılımı, boyutu doğru bir şekilde ölçmek için görüntü çözünürlüğünü kullandığından, tarama çözünürlüğünün uygun şekilde seçilmesi, bir ila sekiz santimetre arasındaki nesneler için kural olarak önemlidir. Sekiz santimetreden büyük nesneler için 300 DPI'da tarayın. 100 DPI'da tarayın ve tohumlar gibi çok küçük nesneler için 750 DPI veya daha yüksek tarayın.

Meyve boyutunun farklı bitkiler arasında çok değişken olmadığı toplu analiz için, aynı deney için toplanacak tüm görüntüler için bir tarayıcı çözünürlüğü ayarı seçin. Ayrıca çıktı görüntü boyutunu tarayıcı yazılımında bulunan en yüksek renk sayısına ayarlayın. Tarayıcı ekranının üstüne veya üzerine bir karton kutu yerleştirerek nesneler için koyu bir arka plan oluşturun.

Siyah veya çok koyu bir arka plan, analizi engelleyen gölgeleri önler. Beyaz bir arka plan, koyu bir arka plan kullanımı için optimize edildiğinden TA'nın çökmesine neden olur. Işık yansıması ve arka plan da yazılım taraması tarafından tanınabilir.

İlk taramadan sonra meyve, büyük boş alanlardan kaçınmak için kaydetmeden önce görüntüyü kırptı. Görüntü bu aşamada kırpılmazsa, ta ile analiz edilmeden önce Adobe Photoshop gibi görüntüleme yazılımları kullanılarak kırpılmalıdır. Taranan görüntüyü, RGB değerlerinin L yıldızı, A yıldızı ve B yıldızı parametrelerine çevrilmesini içeren renk analizi için bir JPEG dosyası olarak kaydedin ve tarayıcıyı önceden hazırlanmış bir renk denetleyicisi kullanarak kalibre edin.

Burada, ilgilenilen görüntülerdeki renk aralığını temsil eden özel bir renk denetleyicisi kullanılır. Standart bir renk daması da kullanılabilir. Meyvelerin taranması sırasında renk denetleyicisini tarayın.

Renk denetleyicisi taramasını, meyve görüntüleri tarayıcısıyla aynı klasöre kaydedin. Kalibrasyon gereklidir, çünkü tarayıcılar yakalama ve yorumlama şekillerine göre farklılık gösterebilir. RGB Renk kalibrasyonu, evrensel renk alanına dönüştürmenin görüntü analizine devam etmesini sağlar.

Tomato analyzer sürüm 2.200, Windows işletim sistemi sürüm 2000 veya daha yüksek bir sürüm gerektirir ve web sitemizden indirilebilir. Orijinal görüntülerin, TA uygulaması tarafından üretilen ayarlanmış görüntülerle aynı klasöre kaydedildiğinden emin olmak için bir kullanım kılavuzu ve renk testi kılavuzu da aynı web sitesinde mevcuttur. Özgün görüntülerin bulunduğu klasörü Belgelerim klasörüne veya uzak bir sunucuya değil, sabit sürücüye yerleştirin.

TA programını başlatın. İlk olarak, tarayıcı DPI'sını seçerek ayarlar menüsü altında DPI ve ölçü birimlerini ayarlayın. Boyut ölçümlerinin doğru olması için DPI ayarının görüntü dosyalarıyla aynı olması gerekir.

Diyalog kutusunda kullanılan birimler, veri çıkışı için birimleri belirler. Aynı iletişim kutusunda, nesneler nispeten karanlık olduğunda gerekirse parlaklığı ayarlayın. Ardından, kaydedilen ölçümü seçerek ayarlar menüsünden ölçülecek özellikleri seçin.

Öznitelikler, temel ölçümden morfo metriklerine kadar 10 kategoride gruplandırılmıştır. Gruba veya özelliğe tıklayarak tek tek özellikleri veya tüm ölçüm grubunu seçebilir veya seçimi kaldırılabilir. Bir ölçüm grubunun tüm özellikleri, artı işaretine tıklanarak gösterilebilir.

Seçilen özellikler, ekranın sağ alt köşesindeki pencerede kategoriye göre görüntülenir. Giriş çözünürlüğünü ve çıkış birimlerini ayarladıktan ve analiz edilecek öznitelikleri seçtikten sonra, görüntüyü aç düğmesine tıklayın ve görüntü dosyasını seçin. Açılır diyalog kutusundan, seçilen görüntü sol pencerede görüntülenecektir.

Açık görüntüyü analiz etmek için analiz et düğmesine tıklayın. Bittiğinde, her meyvenin çevresi sarı çizgi ile vurgulanır ve veriler sağ alttaki veri penceresinde görüntülenir. Renk verilerinin bu pencerede gösterilmediğini unutmayın.

Yazılım, cetvel veya etiket gibi çok büyük veya küçük nesnelerin seçimini otomatik olarak kaldırır. Seçimi kaldırılan nesneler mavi bir çizgiyle vurgulanır. Birimlerin ve çözünürlüğün doğru seçildiğinden emin olmak için cetveli kullanın.

Yükseklik ve genişlik ölçümleri ile karşılaştırılarak, ek meyvelerin seçimi sadece resimlerine sağ tıklanarak kaldırılabilir. Sarı renkle özetlenen öğeler veri penceresinde görüntülenir ve mavi renkle özetlenen dışa aktarılan öğeler analizlere dahil edilmez. Tek tek nesneler, fare ile üzerlerine sol tıklanarak sağ üst pencerede görüntülenebilir.

Sağ alttaki veri penceresindeki veriler, görüntüdeki belirli bir nesneye karşılık gelir ve görüntüdeki nesnelerle aynı sırada görüntülenir. İlk satır, görüntünün sol üst köşesinde nesnenin değerlerini ve son veri satırında görüntünün sağ alt köşesinde nesnenin değerlerini görüntüler. Bir meyveye tıklamanın yanı sıra, ilgili veri satırını vurgulamak için, ilgili meyveyi sağdaki üst pencerede görüntülemek için bir satıra tıklayabilirsiniz.

Sağ alt penceredeki özellik sekmesine tıklayarak, her bir meyve için özelliğin nasıl ölçüldüğünü görmek mümkündür. Örneğin, distal uç açısına tıklandığında, yazılım tarafından ölçülecek olan sol penceredeki meyvenin üzerindeki açılar gösterilecektir. Bu özellik, manuel ayarlama gerektiren nesneleri tanımlarken çok kullanışlıdır.

Daha doğru ölçümler için, revize edilmiş düğmeye tıklamak, uygulamada yapılabilecek manuel ayarlamaları gösterir. Aşağıda en sık kullanılan manuel ayarlamalardan bazıları verilmiştir. İlk olarak, manuel ayarlama gerektiriyorsa sol pencere görüntüsündeki bir nesneye sol tıklayın.

Sınırın ayarlanması gerekiyorsa, önce sınırı seçerek bu özelliği ayarlayın. Gözden geçirilmiş düğmenin açılır menüsünden, yanlış sınırın başlangıç noktasına ve bitiş noktasına sol tıklayarak değiştirilecek sınır konumunu seçin. Sonuç olarak, sınırlandırılmış sınır kaldırılacaktır.

Yeni bir sınır eklemek için, başlangıç noktasından bitiş noktasına doğru sol tıklayın, istenen konturu takip etmek için tıklamaya devam edin. Yeni sınırı onaylamak için enter tuşuna basın. Aksi takdirde, bu işlemi iptal etmek için escape tuşuna basın.

Döndürme gerektiren nesnelerin sınırdan sonra ayarlanması gerekecektir, ancak kalan manuel ayarlamalardan önce sol penceredeki uygun meyveye tıklayın. Revize edilmiş düğmenin yanındaki oka tıklayın ve açılır listeden döndür'ü seçin, erişim sağ üst pencerede görüntülenecektir. Eksenin sonundaki yeşil kareyi sürükleyin ve meyve buna göre dönecektir.

Bu ayarlamayı tamamlamak için enter tuşuna basın. Diğer manuel ayarlamalar da mevcuttur. Talimatlar ekteki yazılı protokolde bulunur.

Açılar ve blokajlık gibi bazı özellikler için, ölçümün yapılması gereken ayarları seçin. Açılar meyvenin uçlarından çeşitli pozisyonlarda hesaplanabilir. Bu ayarlar, ayarlar menüsü altında seçilebilir.

Tıkanıklık, meyvenin distal veya proksimal ucuna en yakın yüksekliğin kullanıcı tarafından seçilen bir oranındaki genişliğin orta genişliğe oranı olarak hesaplanır. Renk testi için tarayıcının kalibre edilmesi gerekir. İlk olarak, taranan renk denetleyicisi görüntüsünü açın ve meyve için gösterilenle aynı şekilde analiz edin.

L yıldızı, A yıldızı B yıldızı değerlerini toplamak için, TA'nın her yamayı sarı sınırla işaretlenmiş analiz edilecek bir nesne olarak tanıdığından emin olun. Standart bir renk denetleyicisi kullanılıyorsa, yazılım daha koyu alanları tanıyamayabilir. Bu renkler kalibrasyona dahil edilmeyecektir.

Swath tanıma, ayarlar menüsünden tarayıcı DPI altındaki parlaklık değiştirilerek iyileştirilebilir. Ardından ayarlar menüsü altında kalibrasyon için renk testini seçin. İletişim kutusu göründüğünde varsayılan ayarlar kullanılmalıdır.

Düzeltme değerlerinin sol kutulardaki eğim için bir, sağ kutulardaki y kesişim noktası için sıfır olarak ayarlandığından emin olun. Minimum mavi değeri sıfıra ayarlanmalıdır ve birinci ve ikinci parametreler göz ardı edilebilir. Şimdi renk testi diyalog kutusundaki analiz düğmesine tıklayın.

Çıktıyı bir Excel belgesine kaydetmek için yeni bir pencere açılır. Veri dosyasının adını ve dizinini belirtin. Çıktı veri dosyası, RGB değerlerini, yıldız ASTAR B değerlerini ve HU ve chroma hesaplamalarını içerecektir.

Her renk yaması için, her renk yaması için L yıldızı ASTAR B değerlerini, renk dama üreticisinden veya beraberindeki yazılı protokolde bulunan L yıldızı, A yıldızı ve B yıldızı renklendirici değerleriyle karşılaştırın. Regresyon denklemini belirleyin ve her parametre için eğimi ve y kesişimini kaydedin. Renk testi iletişim kutusuna, eğimin tersini ve y kesişim noktası değerinin işaretinin tersini girin.

L yıldızı, A yıldızı ve B yıldızı için bu değerler düzeltme değerleri olarak kullanılacaktır. Renk testi ayarları için. Bu iletişim kutusunda, domates meyvesi için minimum mavi değerini 30 olarak ayarlayın.

Meyveler üç santimetreden küçükse, minimum mavi değeri 20'ye ayarlayın. TA doğru sınırları bulmakta sorun yaşıyorsa veya domates meyvesi dışındaki nesneleri analiz ediyorsa bu değerin ayarlanması gerekebilir. Renk testi ayrıca kullanıcının belirtilen aralıklara düşen piksellerin yüzdesini bildiren iki parametre tanımlamasına da olanak tanır.

Domates analizi için birkaç değer, birinci parametre için alt ve üst değerleri sırasıyla 70 ve 100 olarak ayarlar, bu da istenmeyen sarı ve yeşile karşılık gelir. Sarı et rengi. İkinci parametre için alt ve üst değerleri sırasıyla sıfır ve 50 olarak ayarlayın.

Bunlar istenen kırmızı renge karşılık gelir. Bu değerler için ayarları kaydedin. Bu değerler daha sonra program kapatılana kadar analiz edilen tüm görüntülere uygulanır.

Taranan görüntüler için, yalnızca kalibrasyondan sonra doğal ışıkta elde edilen görüntüler için uygulanan Aydınlat D 65 10 derece seçeneğini değil, C'yi iki derece Aydınlat seçeneğini seçin. Bir görüntünün manuel olarak ayarlanmasından ve ekteki yazılı protokolde ayrıntılı olarak açıklanan TA ile görüntü analizinden sonra meyve görüntülerini renk açısından analiz edin. Meyveyi kaydet düğmesine tıklayın.

Manuel ayarlamalar ve seçimi kaldırılan nesneler de dahil olmak üzere tüm mevcut bilgiler, orijinal görüntüyle aynı ada sahip yeni bir dosyaya kaydedilir. Ancak TMT uzantısıyla, herhangi bir ayarlama yapmadan orijinal görüntü dosyasına geri dönmek için ilişkili TMT dosyasını silmeniz yeterlidir. Alternatif olarak, analiz et'i seçin ve orijinal görüntüyü yeniden analiz edin.

Ancak, taranan görüntüyle aynı ada sahip herhangi bir TMT dosyasının, değişiklikleri kaydetmek için üzerine yazılmadığı sürece orijinal görüntüyle ilişkili kaldığını unutmayın. Verileri dışa aktar Dışa aktar düğmesini seçerek, veriler bir Excel dosyasına aktarılır. Her meyve için öznitelik değerleri, ortalama ve standart sapma görüntülenir.

Toplu analiz işlevi, iki veya daha fazla görüntüden öznitelik değerlerinin dışa aktarılmasına izin verir. Resmi aç düğmesine tıklayarak toplu analizi başlatın. Toplu analiz edilecek görüntü dosyalarını seçin.

Ek dosyalar seçilirken shift veya kontrol tuşu kullanılarak birden fazla dosya seçilir. Dosyalar seçildikten sonra, açık tuşa tıklayın, ardından yalnızca toplu analiz çıktı ortalamasının türünü seçebilirsiniz. Görüntü başına ortalama ve standart sapma veya bireysel ölçümler.

Oluşturulacak Excel dosyası için bir ad seçin ve kaydet tuşuna tıklayın. Yazılım otomatik olarak dosyaları açar ve toplu analize başlar. Görüntü dosyaları daha önce ta tarafından analiz edilmiş ve kaydedilmişse, kaydedilen TMT dosyaları toplu analiz için açılacaktır.

Dosyalar daha önce analiz edilmemişse, yazılım manuel ayarlamalar ve DES seçimleri olmadan görüntülerin analizini gerçekleştirir, TA 600 DPI'da en az 100 görüntünün toplu analizini gerçekleştirebilir. Toplu analiz, renk testi için de kullanılabilir, bilgisayarın donanımına bağlı olarak 100'e kadar meyve görüntüsü toplu olarak analiz edilebilir. Ayarlar menüsü altındaki renk testi seçeneğini açın.

Toplu analizi kontrol edin ve analiz et'e tıklayın. Analiz edilecek görüntüleri seçmek için yeni bir pencere açılır. Bir sonraki pencerede, veri dosyasının adını ve dizinini belirtin.

Kaydet'e tıklayın ve renk testinin toplu analizi başlar. İşte domatesteki varyasyonu temsil eden iki görüntünün şekil ve renk sonuçları. Her iki görüntünün çıktı dosyaları sağdadır ve her meyve için çeşitli şekil ve renk özelliklerinin değerlerini gösterir.

Toplu analiz sonuçları, 10 domates çeşidi için ortalama öznitelik şekil değerlerini ve standart sapmayı gösteren bu çıktı dosyasında görüntülenir. Toplu analizin renk analizi çıktısı, diğer parametrelerin yanı sıra her meyve için ortalama renk değerlerini içerir. Domates analizöründe bulunan en sık kullanılan özellikleri kullanarak domates meyve görüntülerini nasıl toplayacağınızı ve bunları nasıl analiz edeceğinizi az önce gösterdik.

Bu yazılım domates meyvesini analiz etmek için geliştirilmiş olsa da, yapraklar ve tohumlar ile domates ve diğer bitki türleri dahil olmak üzere diğer bitki organlarını analiz etmek için de kullanılabilir. İşte bu kadar. Yıkadığınız için teşekkürler ve deneyinizde iyi şanslar.