JoVE Encyclopedia of Experiments
Kanser Araştırmaları
0 görüntüleme • 3:34 dk • April 30th, 2023
- Bir mikroRNA veya miRNA, küçük, kodlamayan bir RNA'dır. mRNA transfeksiyonunu veya bir hücreye girişini takiben, bir miRNA protein kompleksi oluşturur. Kompleks, spesifik mRNA'yı hedefler ve ona bağlanır ve ekspresyonunu negatif olarak düzenleyerek hücre döngüsü ilerlemesini durdurur.
Analize başlamak için, miRNA ile transfekte edilmiş akciğer kanseri hücrelerinin hasat edilmiş bir kültürüne uygun bir dehidrasyon fiksatifi ekleyin. Fiksatif hücreleri korur ve ayrıca hücre zarına nüfuz eder. Hücreleri propidyum iyodür, bir floresan nükleik asit boyası ve ribonükleaz enzimi karışımına tabi tutun.
Boya hücrelere girer ve hem DNA'yı hem de RNA'yı boyar. Enzimler, optimal DNA miktar tayinine izin vererek RNA'yı spesifik olarak bozar. Tek tek hücrelerin floresan yoğunluğuna bağlı olarak farklı hücre döngüsü fazlarında durdurulan hücrelerin oranını belirlemek için bir akış sitometresi kullanın.
Dinlenme ve büyüme aşamalarındaki hücreler daha düşük DNA içeriğine ve dolayısıyla daha düşük floresan yoğunluğuna sahiptir. Boşluk 2 fazındaki hücreler, iki kat daha fazla DNA miktarına sahip hücreler, iki kat daha fazla floresan yoğunluğu üretir. DNA sentez fazındaki hücreler, diğer iki popülasyon arasında bir floresan değeri indükler. Aşağıdaki protokol, PI boyama ve akış sitometrisi kullanarak DNA içeriğini ölçerek miRNA ile tedavi edilen akciğer kanseri hücrelerinin hücre döngüsü regülasyonunu analiz edecektir.
- Hücreleri bu videonun önceki bölümünde anlatıldığı gibi transfekte edin. Her numuneden hücreleri ayrı 15 mililitrelik steril tüplerde tripsinizasyon ile hasat edin. Daha sonra, hücreleri 5 dakika boyunca 751 g'da santrifüjleme ile 1X PBS ile iki kez yıkayın ve ardından süpernatanı çıkarın. Pipetleme yoluyla 200 mikrolitre buz gibi soğuk 1X PBS ekleyerek peleti yeniden askıya alın ve kırın.
Hücreleri sabitlemek için tüpü hafifçe girdaplarken tüpe damla damla 2 mililitre %70 buz gibi etanol ekleyin. Tüpleri oda sıcaklığında 30 dakika inkübe edin ve 1 saat boyunca 4 santigrat dereceye koyun. Tüpleri 4 santigrat dereceden çıkarın ve santrifüjleyin.
2 mL buz gibi soğuk PBS ve girdap ekleyin ve ardından süpernatanı santrifüjleme ile çıkarın. Her numuneye mililitre başına sırasıyla 50 ve 200 mikrogram konsantrasyonlarda propidyum iyodür ve ribonükleaz A içeren 500 mikrolitre 1X PBS ekleyin ve oda sıcaklığında 30 dakika inkübe edin. Numuneleri ışıktan koruyarak uygun tüplere aktarın ve akış sitometresinde çalıştırın.
Bu çalışma, akciğer kanseri hücrelerinin hücre döngüsünün düzenlenmesinde mikroRNA'nın (miRNA) rolünü araştırmaktadır. Araştırma, akış sitometrisi ve propidyum iyodür boyama yöntemlerini kullanarak, miRNA ile işlem görmüş hücrelerde DNA içeriğini nicelleştirmeyi ve hücre döngüsü evrelerini analiz etmeyi amaçlamaktadır.
miRNA transfekte edilmiş akciğer kanseri hücrelerinin kantitatif hücre döngüsü analizi, onkoloji ilaç keşfiyle ilgili hücre döngüsü düzenleme mekanizmalarının hassas bir şekilde sorgulanmasına olanak tanır. Akış sitometrisi tabanlı DNA içeriği ölçümü, erken aşamadaki terapötik programlarda hedef doğrulama ve mekanistik risk azaltma için uygulanabilir veriler sağlar. Bu yaklaşım, onkoloji Ar-Ge hattındaki kritik karar noktalarında öngörüsel güvenilirliği destekler.
Akış sitometrisi tabanlı bu hücre döngüsü analizi, onkoloji araştırmalarında hem hedef doğrulamayı hem de öncü bileşik tanımlamasını destekleyerek, keşiften preklinik aşamaya kadar olan sürece entegre olmaktadır.
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
Son güncelleme: 22 Ağustos 2026