$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Poli-histidin etiketine kaynaşmış rekombinant proteini - bir terminalde bir dizi histidin kalıntısı - bir bakteri hücre lizatından saflaştırmak için, önce kromatografik çalışma sırasında kolon tıkanmasını önlemek için hücre lizatını seyreltin.
Bir kenetleme maddesi olan nitrilotriasetik asit kullanılarak bir agaroz boncuk matrisi üzerine hareketsiz hale getirilmiş iki değerlikli nikel katyonları içeren bir afinite kolonunu birleştirin. Nitrilotriasetik asit, nikel katyonlarını dört koordinat kovalent bölge aracılığıyla bağlarken, metal iyonu üzerindeki iki bölge, ilgilenilen proteindeki poli-histidin etiketleri ile etkileşimler için mevcut kalır.
Etkili metal-protein etkileşimleri için koşulları optimize etmek üzere kolonu uygun tamponla dengeleyin. Hücre lizatını kolona yükleyin.
Erişilebilir terminal histidin kalıntıları taşıyan rekombinant proteinler, metal iyonunun histidinin yan zinciri olan imidazole olan yüksek afinitesi nedeniyle nikel katyonları ile koordinasyon bağları oluşturur ve matrise bağlanır. Rekombinant proteindeki yüksek ardışık histidin sayısı, matrise olan bağlılığını güçlendirir.
Buna karşılık, histidin kalıntıları olmayan proteinler kolona yapışmaz ve akışta elüte olmaz. Kolonu düşük konsantrasyonlu imidazol tamponu ile yıkayın.
İmidazol, polipeptit zincirlerindeki histidin kalıntıları yoluyla matrise spesifik olmayan bir şekilde yapışmış olabilecek, onları yer değiştiren ve elüsyonu kolaylaştıran zayıf bağlı protein kirleticileri ile rekabet eder. Güçlü bir şekilde bağlanmış histidin etiketli rekombinant proteinleri nikel iyon şelatından ayırmak için sütunu yüksek konsantrasyonlu imidazol tamponu ile yıkayın ve bunları akışta serbest bırakın.
Daha fazla analiz için saflaştırılmış rekombinant protein fraksiyonunu toplayın.
Bu protokole, metin protokolünde tarif edildiği gibi histidin etiketli bir proteinin indüklenebilir aşırı ekspresyonu ile başlayın. Proteini saflaştırmak için yerçekimi sütununda 1 mililitre Nikel-Nitriloasetik Asit reçinesi hazırlayın. Kullanmadan bir gün önce, sütunu gece boyunca 4 santigrat derecede 2 mililitre dengeleme tamponu ile dengeleyin.
Ertesi gün, arıtılmış lizatı yüklemeden önce sütunu 4 santigrat dereceden oda sıcaklığına getirin ve yaklaşık iki ila üç saat bekletin. Ardından, peleti lizis tamponunda yeniden askıya alın.
Hücreleri buz üzerinde 10 kez 10 saniyelik aralıklarla sonikasyon yapın, darbeler arasında 30 saniye duraklayın. Bir mikrosantrifüj kullanarak 4 santigrat derecede 30 dakika boyunca 3080 x g'da santrifüjleme ile lizatı netleştirin.
Arıtılmış lizatı eşit hacimlerde lizis tamponu ile hazırlayın, ardından önceden hazırlanmış arıtılmış lizatı kolona uygulayın ve akışı toplayın. Arıtılmış lizat akışını kolona yeniden uygulayın ve ikincil akışı toplayın.
Ardından, sütunu 5 mililitre yıkama tamponu #1 ile yıkayın ve akışı toplayın. Sütunu 5 mililitre yıkama tamponu #2 ile tekrar yıkayın ve akışı toplayın. Şimdi 2 mililitre elüsyon tamponu uygulayın. Akışı, her biri 1 mililitrelik iki fraksiyon halinde toplayın.