$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Kemoterapötik ajanlar, kanser hücrelerinde tek ve çift sarmallı DNA kırılmalarına neden olarak DNA hasarına ve hücre ölümüne neden olur.
DNA hasarını ölçmek için, kemoterapi ile tedavi edilen kanser hücrelerini erimiş, düşük erime noktalı agaroz ile karıştırın. Bu karışımı agaroz önceden kaplanmış cam slaytlara pipetleyin. Erimiş agarozun katılaşmasına izin verin, hücreleri gözenekli jel matrisinin içine gömün.
Yüksek konsantrasyonlarda deterjan ve tuz içeren bir lizis tamponu ile muamele edin. Deterjanlar hücresel ve nükleer zarları çözündürür. Ayrıca, yüksek tuz, histon proteinlerini DNA'dan sıyırır ve süper sarmal DNA'yı nükleer matrise bağlı bırakır.
Alkali elektroforez tamponunda inkübe edin. Alkali ortam, DNA süper bobinlerinin gevşemesine neden olarak tek sarmallı, çift sarmallı DNA kırılmalarını açığa çıkarır.
Slaytları elektroforez tamponu içeren jel tepsiye yerleştirin. Elektroforezi başlatın.
Negatif yüklü olan DNA, pozitif anoda doğru çekilir. Hasarlı DNA parçaları çekirdekten dışarı çıkar ve gözenekli jel matrisinden geçer, daha uzun uzunluktaki parçalar daha kısa parçalardan daha yavaş hareket eder. Aksine, hasar görmemiş DNA, çekirdeğin içinde kalarak kolayca göç etmez.
Elektroforez sonrası, hücreleri floresan nükleik asit boya çözeltisi ile boyayın. Boya molekülleri DNA'ya bağlanır.
Floresan mikroskobu altında, hasarlı DNA içeren tek hücreler floresan kuyruklu yıldız yapısı sergiler. Kuyruklu yıldızın 'başı' hasar görmemiş DNA'yı temsil ederken, 'kuyruk' hasarlı DNA parçalarından oluşur.
Kuyruklu yıldız 'kuyruğunun' uzunluğu ve yoğunluğu, kemoterapi ile tedavi edilen bireysel kanser hücrelerindeki DNA hasarının derecesini gösterir.
Hücre süspansiyonunu 1:10 hacim oranında %1 erimiş düşük erime noktalı agaroz ile birleştirin. Yukarı ve aşağı pipetleyerek nazikçe karıştırın ve hemen 30 mikrolitreyi bir slayta pipetleyin. İnce bir tabaka oluşumunu sağlamak için agaroz hücre karışımını yaymak için pipet ucunun yan tarafını kullanın. Slaytları karanlıkta 10 dakika boyunca 4 santigrat derecede düz bir şekilde yerleştirin. Slaytları karanlıkta bir saatten gece boyunca 4 santigrat derece lizis çözeltisine daldırın.
Alkali kuyruklu yıldız tahlili için, slaytları lizis çözeltisinden nazikçe çıkarın, fazla sıvıyı boşaltın ve DNA'nın gevşemesine izin vermek için slaytları karanlıkta 4 santigrat derecede bir saat boyunca AES'e yavaşça daldırın.
Elektroforez slayt tepsisine önceden soğutulmuş AES ekleyin. Slaytların üzerinde 0,5 santimetreyi aşmayın. Slaytları içine yerleştirin ve bir kapakla örtün. Güç kaynağı voltajını santimetre başına 1 volta ayarlayın ve 30 dakika boyunca 4 santigrat derecede çalıştırın. Elektroforez tamamlandığında, slaytlardaki fazla AES'yi boşaltın.
Slaytları iki kez, oda sıcaklığında damıtılmış suya, her seferinde beş dakika boyunca yavaşça daldırın. Bundan sonra, slaytları oda sıcaklığında beş dakika boyunca% 70 etanole yavaşça batırın.
Slaytları karanlıkta 37 santigrat derecede 10 ila 15 dakika kurutarak boyama işlemine başlayın. Daha sonra, her bir slaydın kurutulmuş agarozunun üzerine 50 ila 100 mikrolitre yeşil floresan nükleik asit boyama solüsyonu yerleştirin ve karanlıkta oda sıcaklığında 15 dakika boyayın. Slaytları damıtılmış suda kısa bir süre durulayın ve karanlıkta 37 santigrat derecede tamamen kurulayın.