Hücre heterojenliğini belirlemek için tek hücreli western blotlama

0 görüntüleme4:43 dk • July 8th, 2025

Enflamasyon bölgeleri, monositler, makrofajlar ve lökositler dahil olmak üzere çeşitli bağışıklık hücreleri içerir.

Tek hücreli batı lekeleme ile heterojen bir hücre popülasyonunu tanımlamak için, bloklar halinde desenlenmiş fotoaktive edilebilir bir poliakrilamid jelden oluşan, önceden hidratlanmış bir kurutma çipi alın. Her blokta çok sayıda mikro kuyu vardır. Birkaç bloğa desenleme, birden çok hücreyi paralel olarak yakalar.

Heterojen bir hücre popülasyonu içeren bir süspansiyon ekleyin. Kuyunun boyutları, tek hücrelerin yerleşmesine izin verir. Çipi uygun bir tamponla doldurulmuş bir elektroforez odasına daldırın. Tampondaki deterjan molekülleri hücre zarını bozarak hücresel içeriği serbest bırakır.

Bir elektrik alanı uygulayın. Serbest bırakılan proteinler jel boyunca göç eder ve farklı büyüklükte bantlara ayrılır. Spesifik olarak bağlı olmayan molekülleri çıkarmak için çipi bir yıkama tamponu ile yıkayın ve istenen işaretleyici proteinler de dahil olmak üzere yalnızca hücresel proteinleri bırakın.

Jeli UV ışığına maruz bırakın, yüzeyini aktive edin ve proteinleri hareketsiz hale getirin.

Her hücre tipine özgü işaretleyici proteinlere spesifik olarak bağlanan ve protein-birincil antikor kompleksleri oluşturan bir birincil antikor kokteyli ekleyin. İlgili birincil antikorlarını bağlayan ve karşılık gelen hücreye özgü işaretleyici proteini etiketleyen floresan etiketli ikincil antikorların bir karışımını dağıtın.

Çipi bir tarayıcıya yerleştirin. Numune hücresi süspansiyonunun tek bir hücresine özgü karşılık gelen protein markörünün ekspresyon seviyesi ile orantılı olan floresan yoğunluğunu ölçün.

Tek hücreli bir Western blot analizi için, 10 santimetrelik bir Petri kabının dibindeki rehidre edilmiş tek hücreli Western blot çipine 1 mililitre seyreltilmiş tek hücreli süspansiyon ekleyin. Beş ila on beş dakika sonra, çipi parlak alan mikroskobu altında inceleyin. Mikro kuyuların yaklaşık% 15 ila% 20'si tek bir hücre tarafından işgal edilmeli ve kuyuların% 2'sinden daha azı iki veya daha fazla hücre içermelidir.

Çip uygun şekilde yüklenmişse, çanağı 45 derece eğin ve yakalanmamış hücreleri çıkarmak için çipi süspansiyon tamponu ile üç kez yıkayın. Son yıkamadan sonra, çipi tek hücreli bir Western aletinin jel tarafı yukarı bakacak şekilde elektroforez hücresine dikkatlice yükleyin ve tüm tek hücreli Western blot çipini lizis/çalışan tampon ile kaplayın. Hücre lizizini başlatın ve cihazı uygun deney parametrelerine göre çalıştırın.

Çalışmanın sonunda, çipi oda sıcaklığında her yıkama için taze yıkama tamponu ile 10 dakikalık iki yıkama ile durulayın. İkinci yıkamadan sonra, ilgilenilen birincil antikor çözeltisinden 80 mikrolitreyi antikor problama odasına ekleyin ve antikor çözeltisinin çip boyunca fitil olması için çipi jel tarafı aşağı gelecek şekilde indirin.

Oda sıcaklığında iki saat sonra, çipi üç kez yıkama tamponunda ve bir kez bir çalkalayıcı üzerinde suda yıkayın. Çipi, ışıktan korunarak oda sıcaklığında bir saat boyunca uygun bir ikincil antikor ile inkübe edin. İnkübasyonun sonunda, talaşı yıkama tamponu ile üç kez yıkayın ve kalan yıkama tamponunu çıkarmak için talaşı bir kayar döndürücü üzerinde döndürün.

Tek hücreli Western blot çipini soymak için, 50 mililitrelik bir tüp rafını, su rafın sadece 1 santimetre üzerinde olacak şekilde 60 derecelik bir su banyosuna yerleştirin. Bir davlumbazda, bir teneke kutuya 40 mililitre sıyırma tamponu ve 320 mikrolitre beta-merkaptoetanol ekleyin. Çipi, kutunun içindeki 10 santimetrelik bir Petri kabına yerleştirin ve kutuyu parafilm ile kapatın.

Ardından, teneke kutuyu su banyosundaki tüp rafının içine yerleştirin. 90 dakika sonra, çipi dikkatlice yeni bir Petri kabına aktarın ve çalkalayıcı üzerinde 15 dakikalık bir yıkama için Petri kabına 15 mililitre taze yıkama tamponu eklemeden önce çipi bir kez yıkama tamponu ile kısa bir süre yıkayın.

07:42

Bir

İlgili videolar

0 Görüntüler

11:53

Kararlı İzotop Etiketleme için indirgeyici dimetilasyonu kullanma Sayısal Proteomiks

İlgili videolar

0 Görüntüler

11:38

Nicel Glycomics ve Proteomik Kombine Arıtma Stratejisi

İlgili videolar

0 Görüntüler

06:02

Protein Ekspresyon Seviyelerini Tahmin Etmek için Kantitatif Western Blotting

İlgili videolar

0 Görüntüler

09:03

Kantitatif RT-PCR ile Bireysel İnsan Embriyonik Kök Hücreleri profilleme

İlgili videolar

0 Görüntüler

10:12

Hedef hücre ön zenginleştirme ve tüm genom amplifikasyon tek hücre aşağı akım karakterizasyonu için

İlgili videolar

0 Görüntüler

08:45

Bir Western Protokolü hematopoetik kök hücre küçük sayılar için kurutma

İlgili videolar

0 Görüntüler

09:34

Bir moleküler karakterize etmek için Kombinatorik tek hücreli yaklaşım ve insan kök ve yaratıcı nüfus Immunophenotypic heterojen

İlgili videolar

0 Görüntüler

09:58

Hücre hatları nicel Immunoblotting ayirt rutin doku örneklerinde biyomarker protein miktarının için doğrulamak için standart olarak

İlgili videolar

0 Görüntüler

08:29

Proteom çapında Quantification maddelerinin homojenliği tek molekül düzeyinde etiketlenmesi

İlgili videolar

0 Görüntüler

Son güncelleme: 29 Ağustos 2026