JoVE Encyclopedia of Experiments
Biyolojik Teknikler
0 görüntüleme • 4:43 dk • July 8th, 2025
Enflamasyon bölgeleri, monositler, makrofajlar ve lökositler dahil olmak üzere çeşitli bağışıklık hücreleri içerir.
Tek hücreli batı lekeleme ile heterojen bir hücre popülasyonunu tanımlamak için, bloklar halinde desenlenmiş fotoaktive edilebilir bir poliakrilamid jelden oluşan, önceden hidratlanmış bir kurutma çipi alın. Her blokta çok sayıda mikro kuyu vardır. Birkaç bloğa desenleme, birden çok hücreyi paralel olarak yakalar.
Heterojen bir hücre popülasyonu içeren bir süspansiyon ekleyin. Kuyunun boyutları, tek hücrelerin yerleşmesine izin verir. Çipi uygun bir tamponla doldurulmuş bir elektroforez odasına daldırın. Tampondaki deterjan molekülleri hücre zarını bozarak hücresel içeriği serbest bırakır.
Bir elektrik alanı uygulayın. Serbest bırakılan proteinler jel boyunca göç eder ve farklı büyüklükte bantlara ayrılır. Spesifik olarak bağlı olmayan molekülleri çıkarmak için çipi bir yıkama tamponu ile yıkayın ve istenen işaretleyici proteinler de dahil olmak üzere yalnızca hücresel proteinleri bırakın.
Jeli UV ışığına maruz bırakın, yüzeyini aktive edin ve proteinleri hareketsiz hale getirin.
Her hücre tipine özgü işaretleyici proteinlere spesifik olarak bağlanan ve protein-birincil antikor kompleksleri oluşturan bir birincil antikor kokteyli ekleyin. İlgili birincil antikorlarını bağlayan ve karşılık gelen hücreye özgü işaretleyici proteini etiketleyen floresan etiketli ikincil antikorların bir karışımını dağıtın.
Çipi bir tarayıcıya yerleştirin. Numune hücresi süspansiyonunun tek bir hücresine özgü karşılık gelen protein markörünün ekspresyon seviyesi ile orantılı olan floresan yoğunluğunu ölçün.
Tek hücreli bir Western blot analizi için, 10 santimetrelik bir Petri kabının dibindeki rehidre edilmiş tek hücreli Western blot çipine 1 mililitre seyreltilmiş tek hücreli süspansiyon ekleyin. Beş ila on beş dakika sonra, çipi parlak alan mikroskobu altında inceleyin. Mikro kuyuların yaklaşık% 15 ila% 20'si tek bir hücre tarafından işgal edilmeli ve kuyuların% 2'sinden daha azı iki veya daha fazla hücre içermelidir.
Çip uygun şekilde yüklenmişse, çanağı 45 derece eğin ve yakalanmamış hücreleri çıkarmak için çipi süspansiyon tamponu ile üç kez yıkayın. Son yıkamadan sonra, çipi tek hücreli bir Western aletinin jel tarafı yukarı bakacak şekilde elektroforez hücresine dikkatlice yükleyin ve tüm tek hücreli Western blot çipini lizis/çalışan tampon ile kaplayın. Hücre lizizini başlatın ve cihazı uygun deney parametrelerine göre çalıştırın.
Çalışmanın sonunda, çipi oda sıcaklığında her yıkama için taze yıkama tamponu ile 10 dakikalık iki yıkama ile durulayın. İkinci yıkamadan sonra, ilgilenilen birincil antikor çözeltisinden 80 mikrolitreyi antikor problama odasına ekleyin ve antikor çözeltisinin çip boyunca fitil olması için çipi jel tarafı aşağı gelecek şekilde indirin.
Oda sıcaklığında iki saat sonra, çipi üç kez yıkama tamponunda ve bir kez bir çalkalayıcı üzerinde suda yıkayın. Çipi, ışıktan korunarak oda sıcaklığında bir saat boyunca uygun bir ikincil antikor ile inkübe edin. İnkübasyonun sonunda, talaşı yıkama tamponu ile üç kez yıkayın ve kalan yıkama tamponunu çıkarmak için talaşı bir kayar döndürücü üzerinde döndürün.
Tek hücreli Western blot çipini soymak için, 50 mililitrelik bir tüp rafını, su rafın sadece 1 santimetre üzerinde olacak şekilde 60 derecelik bir su banyosuna yerleştirin. Bir davlumbazda, bir teneke kutuya 40 mililitre sıyırma tamponu ve 320 mikrolitre beta-merkaptoetanol ekleyin. Çipi, kutunun içindeki 10 santimetrelik bir Petri kabına yerleştirin ve kutuyu parafilm ile kapatın.
Ardından, teneke kutuyu su banyosundaki tüp rafının içine yerleştirin. 90 dakika sonra, çipi dikkatlice yeni bir Petri kabına aktarın ve çalkalayıcı üzerinde 15 dakikalık bir yıkama için Petri kabına 15 mililitre taze yıkama tamponu eklemeden önce çipi bir kez yıkama tamponu ile kısa bir süre yıkayın.
Bu makale, tek hücreli western blotting yöntemi kullanılarak heterojen hücre popülasyonlarının belirlenmesine yönelik bir yöntemi detaylandırmaktadır. Teknik, analiz için bireysel hücreleri yakalamak amacıyla mikro kuyucuklar şeklinde bloklar halinde desenlenmiş, fotoaktivasyonla etkinleştirilebilir bir poliakrilamid jel kullanımı içermektedir.
Tek hücreli western blotting, immünomodülatör terapiler için hedef doğrulamanın risklerini azaltmada kritik bir faktör olan bağışıklık hücresi popülasyonlarındaki protein ekspresyon heterojenliğinin, biyofarma Ar-Ge ekipleri tarafından çözümlenmesine olanak tanır. Markör ekspresyonunu tek hücre çözünürlüğünde nicelleştiren bu yöntem, aday belirleme sürecinde öngörülebilir güvenilirliği destekler ve inflamasyonun preklinik modellerindeki mekanistik belirsizlikleri azaltır. Bu yetenek, karar aşamaları için tekrarlanabilir ve kantitatif veriler sağlayarak, keşif aşamasından preklinik aşamalara kadar translasyonel sürekliliği artırır.
Bu yöntem, Erken Keşif'ten Öncü Bileşik Belirleme ve Preklinik çalışmalara kadar uzanan keşif sürekliliğine uygun olup, kaynakta belirtildiği üzere hipotez testlerini, analiz hazırlıklarını ve kantitatif analizleri desteklemektedir.
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
Son güncelleme: 29 Ağustos 2026