JoVE Encyclopedia of Experiments
İmmünoloji
0 görüntüleme • 4:38 dk • July 8th, 2025
Polisakkarit reçine parçacıklarının inert bir matrisi ile paketlenmiş bir boyut dışlama kromatografi sütunu alın. Gözenekli parçacıkların tanımlanmış bir gözenek boyutu vardır.
Optimum saflaştırma için kolonu bir dengeleme tamponu ile yıkayın.
Patojenik bir bakteri olan Mycobacterium tuberculosis kültüründen işlenmiş konsantre bir kültür süzüntüsü ekleyin. Süzüntü, hücre dışı veziküller veya EV'ler ve bakteriler tarafından salgılanan diğer çözünür proteinleri içerir.
EV'ler heterojen boyutlu, küçük, küresel yapılardır. Bir lipit çift tabakası içine alınmış makromoleküller ve virülans faktörleri içerirler.
Numune matrise yerçekimi altında girer. Numunenin sütun boyunca hareket etmesine izin vermek için tamponu ekleyin.
EV'ler, küçük gözenek boyutu nedeniyle reçineye giremez ve bunun yerine parçacıklar arası boşlukta hareket eder, daha kısa bir yol kat eder ve önce dışarı çıkar.
Daha küçük bir boyuta sahip olan proteinler gözeneklere girer, reçine boyunca daha uzun bir yol kat eder ve sonunda elüte olur.
Aşağı akış analizi için EV'leri içeren fraksiyonları toplayın.
Boyut dışlama kromatografisinin veya SEC kolonunun oda sıcaklığına dengelenmesine izin verin. Kule ünitesinin arkasındaki güç anahtarını kullanarak AFC'yi açın ve yük hücresi ayarlarını yapmak için gerekirse ana menü dokunmatik ekranında SETUP düğmesine basın. KURULUM ekranından, CAROUSEL'i ve ardından CALIBRATE'i seçerek karuseli hizalayın. Karuseli, 13 küçük delik AFC kulesine bakacak şekilde yerleştirin ve sıvı nozulu doğrudan yıkama konumunun üzerinde olacak şekilde eksi veya artı düğmelerine basarak karuseli ayarlayın.
Dengelenmiş SEC sütunundan kapakları çıkarın ve SEC sütununu uygun sütun montajına kaydırın. AFC kulesine dikkatlice monte edin. Kolon üzerindeki radyo frekansı tanımlama etiketinin AFC'ye baktığından emin olun ve kolon ile vana arasındaki bağlantının sağlam olduğunu kontrol edin. Atık çıkış borusunu bir toplama kabına yerleştirin. KURULUM ekranından Toplama Planı'nı seçin ve eksi veya artı düğmelerine basarak sayımı 13 ve boyutu 0,5 mililitre olarak ayarlayın.
Arabellek hacmi ayarını varsayılan değer olan 2,7 mililitre olarak bırakın ve ardından Toplama Zamanlaması penceresini kapatın. Ana ekrandan Koleksiyonu Başlat'ı seçin ve Evet'i seçerek toplama parametrelerini onaylayın. 13 etiketli 1.7 mililitrelik mikrosantrifüj tüpünü kapakları açık ve atlıkarınca merkezine bakacak şekilde yükleyin. Tamam'ı seçerek AFC'yi ilerletin. Ardından, sütun rezervuarını monte edin ve Tamam'a basarak tekrar ilerleyin.
Evet tuşuna basarak sütunu boşaltma seçeneğini belirleyin ve herhangi bir depolama arabelleğini kaldırmak için 0,2 mikrometre filtreli PBS'lik bir sütun hacmi ekleyin. Yıkama tamamlandıktan sonra, OK düğmesine basarak AFC'yi ilerletin. Dönen kapağı AFC'nin üzerine yerleştirin ve OK (Tamam) düğmesine basın. Kolondaki fazla tamponu çıkarmak için bir pipet kullanın. 3 miligram 100R numuneyi 1x PBS ile 500 mikrolitreye getirin ve numuneyi sütunun üstüne ekleyin.
0,2 mikrometre filtreli PBS'nin bir sütun hacmini hazırlayın. AFC'yi ilerletin ve numunenin fritin içine akmasına izin verin. Numune sütuna tam olarak girdikten sonra, daha önce hazırlanan PBS'yi rezervuara ekleyin. Önce boş hacmi ve ardından belirtilen kesirleri toplarken AFC'nin çalışmasını izleyin. Çalışma tamamlandıktan ve atlıkarınca atık konumuna döndükten sonra, kapağı ve fraksiyon tüplerini atlıkarıncadan çıkarın.
Bu makale, boyut dışlama kromatografisi (SEC) kullanarak Mycobacterium tuberculosis'ten hücre dışı veziküllerin (EV'ler) saflaştırılması sürecini detaylandırmaktadır. Metot, EV'lerin çözünür proteinlerden boyutlarına göre ayrılmasını vurgulayarak sonraki analizleri kolaylaştırmaktadır.
Boyut dışlama kromatografisi (SEC) kullanılarak Mycobacterium tuberculosis hücre dışı veziküllerinin (EV'ler) saflaştırılması, enfeksiyon hastalıkları araştırmalarının erken evrelerinde yüksek saflıkta vezikül preparatlarına duyulan kritik bir ihtiyacı karşılamaktadır. Bu teknik, EV'lerin sonraki moleküler karakterizasyon işlemleri için güvenilir bir şekilde izole edilmesini sağlayarak, patojen-konak etkileşim süreçlerindeki mekanistik çalışmaları ve hedef doğrulamalarını destekler. SEC tabanlı EV saflaştırması, fonksiyonel analizler için standardize edilmiş ve tekrarlanabilir girdiler sağlayarak translasyonel araştırmalardaki öngörü güvenilirliğini artırır.
SEC tabanlı EV saflaştırma, erken keşif ve preklinik araştırma arayüzünde yer alarak hedef doğrulama, mekanistik çalışmalar ve analiz geliştirme için kritik girdiler sağlar.
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
İlgili videolar
0 Görüntüler
Son güncelleme: 29 Ağustos 2026