Name: Medial Temporal Lob Yapıların El segmentasyonu için Kapsamlı Protokolü (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2014-07-02T13:00:00.000+00:00
Duration: 12 min 30 s
Description: Öğrenin, medial temporal lob yapılarını yüksek çözünürlüklü manyetik rezonans görüntüleri üzerinde manuel olarak izleme yöntemini. Bu protokol, amigdala ve hipokampusun hassas hacimsel değerlendirmelerini sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu araştırma, FD'ye verilen fonlarla desteklendi. MM, Ulusal Bilim Vakfı 0903622 numaralı hibe kapsamında IGERT Bursu ile desteklendi. Yazarlar, veri toplama ve hazırlıkta Dolcos Lab üyelerine teşekkür etmek ister.

1.. Amygdala <ol><li> AMY Anterior Dilimleri <ol><li> Frontal ve temporal lob arasındaki beyaz madde bağlantısı sürekli ve 30 görünür olduğu limen insula başlangıçta göründüğü AMY ilk dilim tanımlayın. Koronal görünümünde, AMY inferolateralinden sınır olarak açısal paket kullanın. </li><li> AMY görünümü için bir dönüm noktası olarak optik kiazma bulun. Çevredeki unkusun onun erken dilimler halinde AMY ayırt etmek için eksenel ve sagital görünümleri kullanın. Entorhinal alanı 32 hariç tutmak için eksensel görünümünde AMY etrafında beyaz madde yolu takip edin. </li><li> Posterior hareket eden, ön ek yeri AMY tipik şekli görülebilir her iki hemisferde 28, boyunca sürekli olduğu, birinci dilim tanımlar. Süperomedial sınırına semianular sulcu fundusundan hayali bir çizgi olarak entorinal sulkusu kullanarak AMY saat yönünün tersine Tracegeri entorinal sulkus inferomedyal sınır olarak AMY, lateral sınırı olarak zamansal kök, ve alt ucuna beyaz madde boyunca s izleme 31 tamamlamak için. </li></ol></li><li> AMY posterior Dilimleri <ol><li> AMY HC ve her ikisi de aynı dilim (ler) de görebilir, bu seviyede unutmayın. </li><li> Hala koronal görünümünde, unsinat girusun, tümsek ve yanal (ventrikül mevcut değilse veya Alveus) yapısı lateral ventrikül 36 temporal boynuzun medial uzantısı üstündür AMY son dilim tespit HC başının. Doğru ve tutarlı takibi için sagital ve aksiyel görüşlerini edin. </li><li> Insulanın alt dairesel sulkusun fundustan de globus pallidus ve putamenin gri madde ayıran AMY 31, üstün sınır olarak optik yollarına hayali bir çizgi çizin. </li><li> Birlikte Tracesemilunar süperomedial sınır olarak girus ve unsinat girus 32 hariç. Lateral ventrikül alt boynuz ve yanal tarif için zamansal kök kullanın. </li></ol></li><li> Anterior-posterior yönde AMY ardışık Dilimleri <ol><li> Sistematik Yukarıdaki ilgili yönergeleri kullanarak AMY dilim-dilim iz. AMY en azından ön kısmı, ön-en dilim için aynı sınırları kullanır; tersine, AMY arka kısmında, posterior en dilim için aynı sınırları kullanın. </li><li> Tanımlamak ve daha fazla AMY sınırları rafine yardımcı eksenel ve sagital görüşlerini istihdam devam ediyor. </li></ol></li></ol> 2. Hippocampus <ol><li> HC yerelleştirme <ol><li> Lateral ventrikül temporal boynuz AMY inferolateralinden sınırında göründüğünde HC izleme başlayın. Lateral ventrikül temporal boynuz önceki dilimleri üzerinde zaten varsa, o inci dikkatHC e başlaması daha sonra yan ventrikül büyütme ve süperolaterale germe zamansal boynuz ile belirtilir. </li><li> Lateral ventrikül 31 trigonuna inferomedyal, son görünümü ile HC izleme End. Her zaman HC ve sınırlarını yerelleştirilmesine yardımcı olmak için alternatif görüşlere kullanmaktadır. </li></ol></li><li> HC Sınır Tanımlar <ol><li> Temporal boynuz karşı yanal HC tasvir. Lateral ventrikül temporal boynuz yeterli hissedilir olmadığı durumlarda, segmentasyon voksellerin bir satır dışlamak bunu belirtmek için. </li><li> Inferiorda, PHG&#39;nin gelen HC ayırmak için ventrikül boşluğuna açısal demeti (veya onun hayali uzantısı) kullanın. Üstün sınır olarak fimbrial birlikte alveus kullanın. Boyunca aynı tanımlara kullanarak HC izleyin. </li><li> Ayrıca, mediale PHG&#39;nin beyaz cevher paket, superiorda hizalanana sınırları şekilde segmentasyon içine subikulum dahilunkusun eğri ve HC 37 öncelikle ile yatay olarak uzanır. Kalkarin sulcus müdahale edene kadar posteriora aydınger, bu tanımları korumak. </li></ol></li><li> HC kaydederek Bölümleri <ol><li> Baş, gövde ve kuyruk: HC üç segmente ayrılabilir unutmayın. </li><li> HC kuyruk görünümünü belirtmek için tipik olarak forniksin CRU görünümü ile denk boyutunda HC vücuda HC kafa geçişi ve hızlı artan ve genişleme, işaretlemek için uncal tepe görünümünü kullanın 23,30,38. </li></ol></li><li> Aşağıdaki yapıları izlerken özellikle dikkat edin. <ol><li> Segmentasyon posterior unkusun içerir. </li><li> Bu düşük çözünürlüklü görüntülerde mümkün olmayabilir rağmen, koronal dilimleri üzerinde segmentasyon Alveus yukarıdaki koroid pleksus Gözardı. </li><li> C kuyruk dahil önlemek için iki alternatif görünümü bakınızaudate ve HC kuyruğun üstün yönü de pulvinar. </li><li> Başlangıçta Fasciola cinerea ve daha fazlasına göre hipokampal kuyruk ayrılır forniksin arasında krusun seviyesinde onun ortaya çıkması belirterek fasiküler girusun oluşumunu önlemek posteriora Kalkarin sulcus 32 üstün gri madde haline gelir. </li></ol></li></ol><img alt="Şekil 2," fo:content-width="4in" src="/files/ftp_upload/50991/50991fig2highres.jpg" width="400" /> Şekil 2. Beyinde gerçek konumunu gösteren, mevcut protokolü kullanılarak takip MTL, ve büyük yapılar arasında göreli konumlarının temsili bir sagital dilim, yani, AMY (kırmızı), HC (mavi), PRC (sarı), ERC (pembe) ve ÖYK (yeşil). 3.. Parahipokampal Gyrus <ol><li> PHG&#39;nin kaydederek Bölümleri <ol><li> Not PHG&#39;nin caanterior PHG (yani, ÇHC ve ERC) ve posterior PHG&#39;nin (yani, ÖYK): n iki ana bölüme ayrılabilir. </li><li> Anterior segment olduğunu unutmayın, ÇHC ERC daha önce görünür ve tüm kurs boyunca yanal bunu yanları. </li><li> ERC kaybolduktan sonra, ÇHC PHG&#39;nin yerini bir araya toplayan ve 3 mm için devam ettiğini unutmayın. </li><li> Bu segment ötesinde, birinci basamak sonuna kadar 30 PHG&#39;nin genişliği boyunca alır posterior PHG, iz. </li></ol></li><li> PHG&#39;nin ön Dilimleri <ol><li> CS 25,39 görünümü ile ÇHC ilk dilim tanımlayın. Schwalbe iki giruslar varsa ERC başlamasından önce, CS yanal bankanın medial kenarından yanal Schwalbe en girusun fundus ya da medial birinin bu için PRC iz ya da orta noktası Bu girus 25,39 yokluğunda temporopolar dorsal yüzeyi. </li><li> ERC 5 mm bir iz başlayınnterior 40,41 insula Limen için. </li><li> Üstün sonunda 40 olarak medial temporopolar sulkusun fundus ve AMY görüntülendikten sonra yarım halka sulkusun fundus veya yarım halka sulkus ise açısal paket hayali uzantısı ventrikül boşluğu karşılayan noktasını kullanarak ERC izleme devam 25 farksız. Doğrudan ventriküler kavite veya Pial yüzeyini karşılamak için inferiorda uzanır unutmayın. </li><li> ÇHC ve ERC arasındaki sınır dilim dilim değişebilir. <ol><li> CS (≥ 1.5 cm) derinlikte olduğu zaman, yanal banka 25 orta noktasına, bu sulkusa medial bankanın medial kenarından PRC iz. </li><li> Normal bir CS (1-1.5 cm derinliğinde) ile durumda, sulkusa 25&#39;in yanal bankanın medial ucuna teminat sulkus medial bankanın orta noktasından alanı olarak PRC iz. </li><li> With a &lt;em&gt; sığ CS (&lt;1 cm), fusiform girus 25 taç orta bu sulkusun fundustan PRC iz. </li></ol></li><li> CS fundusdan çıkan küçük girus ile, genellikle uncal tepe seviyesinde, kesildiğinde, yanal sulkus 25&#39;in dibine PRC iz. Eklemek veya ROI için hedefe göre beyaz madde içermemektedir. </li><li> Uncal apeks veya 42 intralimbicus girusun sonuna kadar 1.5 mm posterior kadar ERC Trace. </li><li> Mediale onun ikincisi için tanımları uncal apeks 4,5 mm posterior kadar geçerli olmaya devam fesih, ya da 42 intralimbicus girusun bitiminden sonra ERC yer işgal ÇHC izleme uzatın. PRC daha sonra birinci basamak 25,30 ile ikame edilir. </li></ol></li><li> PHG&#39;nin posterior Dilimleri <ol><li> 4 mm posterior t kadar, ÇHC sonuna dilim arka üzerinde TSH&#39;nin iz başlayınO HC kuyruk 32 sonuna. Literatürden alternatif tanımlar tartışma kısmında tarif edilmiştir. Yine, içeren veya amacına bağlı olarak beyaz madde içermemektedir. </li><li> ERC kaybolduktan sonra ÇHC arka kısmında açıklandığı aynı yöntemi kullanarak birinci basamak sağlık tasvir. Göründüğü kez de üstün sınır olarak singulumun beyaz madde kullanın. Sulkus 30 alt kenarına superomedial TSH&#39;nin kısıtlar Kalkarin sulkus, görünümü kadar bu şekilde izleme devam edin. </li><li> Mini-sulcus, Kalkarin sulkusun çıkmasından önce görünür segmentasyon içinde dahil, fakat Kalkarin sulkustan farklılaşan dikkatli olmalıdır. </li></ol></li></ol>

Yazarların beyan edecek çıkar çatışmaları yoktur.

Geleneksel olarak, manuel segmentasyon birçok araştırmacı tarafından altın standart olarak kabul edilmiştir. Bununla birlikte, tek tek yapıların kesin bir tarif MTL yapıların son derece değişken morfolojisi ile komplike ve çevresindeki sinir dokusu ve nöral olmayan alanlara karşı bu yapıların genellikle zayıf bir MRI kontrast tarafından edilmiştir. Tarihsel olarak, bazı MTL yapılar için literatürde çakışan açıklamalar olmuştur. 40,41 kesintiye gibi PRC segmentlere, bazı durumlarda, örneğin, kollateral sulkus ...

A correction was made to <a href="/video/50991">A Comprehensive Protocol for Manual Segmentation of the Medial Temporal Lobe Structures</a>. Table 1 and its legend were updated. References 10 and 14 were also updated.
The references were updated from:
<ol start="10">
<li>Wager, T. D. &amp; Smith, E. E. Neuroimaging studies of working memory: a meta-analysis. Cognitive, Affective &amp; Behavioral Neuroscience. 3(4), 255-274 (2003).</li>
</ol>
<ol start="14">
<li>Scheltens, Ph, et al. Atrophyofmedialtemporallobeson MRIin 'probable' Alzheimer's disease and normal ageing: diagnostic value and neuropsychological correlates. Journal of Neurology, Neurosurgery, and Psychiatry. 55(10), 967-972, (1992).</li>
</ol>
to:
<ol start="10">
<li>Wager, T. D., Phan, K. L., Liberzon, I., &amp; Taylor, S. F. Valence, gender, and lateralization of functional brain anatomy in emotion: a meta-analysis of findings from neuroimaging. Neuroimage. 19 (3), 513-31, doi:10.1016/S1053-8119(03)00078-8 (2003).</li>
</ol>
<ol start="14">
<li>de Leon, M. J. et al. Imaging and CSF studies in the preclinical diagnosis of Alzheimer's disease. Annals of the New York Academy of Sciences. 1097, 114-145, doi:10.1196/annals.1379.012 (2007).</li>
</ol>
Table 1 had its legend updated from:
Table 1. Representative volumetric results of the bilateral AMY and the HC of a single subject, from manual tracing using the present protocol and automatic segmentation. Automatic segmentation has underestimated the volume of each of the four structures compared. Corrected volume was calculated as the ratio between Voxel volume and Intracranial volume (ICV). For this subject, ICV = 1446616.73 mm3.
to:
Table 1. Representative volumetric results of the bilateral AMY and the HC of a single subject, from manual tracing using the present protocol and automatic segmentation. Automatic segmentation has misestimated the volume of each of the four structures compared. Corrected volume was calculated as the ratio between Voxel volume and ICV. For this subject, ICV = 1599482.11 mm3. <a href="http://www.jove.com/files/ftp_upload/50991/50991table1.jpg" target="_blank">Please click here to view a larger version of this figure.</a>

A correction was made to <a href="/video/50991">A Comprehensive Protocol for Manual Segmentation of the Medial Temporal Lobe Structures</a>. Table 1 and its legend were updated. References 10 and 14 were also updated.

Erratum: A Comprehensive Protocol for Manual Segmentation of the Medial Temporal Lobe Structures

Medial temporal lob (MTL), duyusal bilginin 1 entegrasyonu en üst düzeyde bir varsayımsal alanı, hedeflenen analizler sık sık konu olmuştur. Örneğin, hipokampus ve ilişkili parahipokampal alanlarda yaygın olarak hafıza araştırma 2-5 incelenmiştir. Ayrıca, amigdala rolü sık sık duygu işleme ve duygu-biliş etkileşimleri 6-11 inceleyen araştırmalarda vurgulanmıştır. Son zamanlarda, çeşitli MTL bölgelerde de 12 özellikleri, kişilik bireysel varyasyon bu ve diğer beyin bölgelerinin yapısı ve fonksiyonu bağlantılar kişilik nörobilim, ortaya çıkan alanında dikkat aldık. MTL yapıların anatomi ve fonksiyonunu değerlendirmek spesifik yapısal ve işlevsel anomaliler MTL farklı yapılarında oluşabilir dejeneratif hastalıkların teşhisi kolaylaştırmak önemli olabilir. Örneğin, Alzheimer hastalığında (AD), önemli birentorinal korteks ve hipokampus kupa 13,14 görülebilir ve hipokampus atrofi MS 15 hafif bilişsel bozukluk geçişi tahmin edebilirsiniz. Otomatik segmentasyon algoritmaları son zamanlarda kortikal ve subkortikal yapıları segmentlere için popüler olmuştur, ancak herhangi bir araç gibi, bu programlar kaçınılmaz olarak bazı durumlarda hatalarla karşılaşabilirsiniz. Bu gibi durumlarda, bir araştırmacı bilgisi ve MTL yapıların anatomik sınırları tanımak için kurallar her ikisi ile donatılmış olmalıdır. Kaybolmamış Literatürde eğilimi hipokampus 16-19 odaklanma eğilimi birçok protokol ile, bireysel MTL altbölgeler 16-21 hedef olmuştur. MTL izleme için kullanılabilir yayınlanan kılavuzların çoğunun aksine, mevcut protokolü bütün MTL altbölgeler net lokalizasyonu için izin kurallar kapsamlı bir kümesi sağlar. Aşağıdaki MTL yapılar izleme için kurallar açıklanmaktadır: amigdala (AMY), hipokamp (HC), peririnal korteks (PRC), entorinal korteks (ERC) ve parahipokampal korteks (TSH). AMY ve HC ilk takip edilir, ve sonra parahipokampal girus (PHG) yapılar tarafından takip edilmektedir. Genel bir terim HC uygun HC kapsar HC oluşumu, subikulum ve uncus 22-24 arka bölümüne değinmek için kullanılmaktadır unutmayın. Ayrıca, PHG iki parça, ön kısmın ve arka kısmın ayrılabilir unutmayın. PHG&#39;nin ön kısmı içinde, bundan başka, sırasıyla olan kortikal alanlar PRC ve ERC tekabül eden lateral ve medial anterior PHG, ayrılabilir. Birinci basamak, PHG&#39;nin posterior bölümünün kortikal alan, uygun parahipokampal korteks karşılık gelir. Basit nedenlerden dolayı, biz posterior PHG&#39;nin başvurmak için PRC ve ERC lateral ve medial anterior PHG&#39;nin başvurmak için terimlerini kullanarak, ve birinci basamak olacaktır. BÖLÜMLEREher yapı için ntation bir anterior-posterior/rostro-caudal sonra koronal düzlemde dilim-dilim gerçekleştirilen fiili izleme tarafından takip edilir ilgili diğer yerler ile birlikte anterior ve posterior sınırları kaba lokalizasyonu, ile başlar yönü. Tüm durumlarda, sagital ve aksiyel kesitler yakından anatomik sınırları ve yerlerinden yerelleştirme yardımcı izlenir. Bu tür izleme kılavuzlar için olan ihtiyaç da otomatik ve manuel bölümleme protokollerin çıkışı arasındaki olası farklar gösteren Şekillerde gösterilmiştir. Mevcut görsel bir biçimde MTL yapıların her açıklayan bir protokol avantajı sınır tanımları etkileyebilir anatomi (örneğin, kollateral sulkus [CS] derinlik) değişimleri, çevredeki anatomi (bağlamında tarif edilebilir olmasıdır, örneğin , ÇHC ve ERC medial ve lateral sınırları CS 25 derinliğine bağlı olarak yer değişir </skadar&gt;). Bu, yalnızca tek ya da ayrı ayrı yapılar izleri, ve bildiğimiz kadarıyla, böyle bir görsel kapsamlı kılavuz yok deneyimsiz bir izleyici veya deneyimli bir izleyici için açık ya da anlaşılır olmayabilir. Mevcut protokol önceki bir soruşturma yapısal manyetik rezonans (MR) görüntüleme son gelişmelere izin yüksek çözünürlüklü beyin görüntüleri uyarlanmış, duygu 26 hafıza artırıcı etkisine MTL altbölgeler ayırıcı katkıları belirlenmesinde MTL izleme için kullanılan kurallar açık bir sunumudur . Izleme 3T MR tarayıcı kullanarak, (24 yaş, kadın) sağlıklı gönüllüden alınan taramalar üzerinde gösterilmiştir. AC-PC için satın alma açısı paralel anatomik görüntüler 3D MPRAGE (Voxel büyüklüğü = 1 x 0.5 x 0.5 mm; TE = 2.26 msn;; FOV = 256 x 256 mm TR = 1.800 milisaniye) olarak elde edildi. Görüntü verisi gibi eğik yönlendirilmesi gibi farklı bir satın alma açısı ile satın alınması durumunda, veri belgeli olmalıdırAC-PC&#39;ye paralel veya dik yönelime ridded, anatomik dönüm açıklamaları uygun tercüme böyle. Görüntüler daha sonra manuel izleme segmentasyon yazılım içine 27 Nifti biçimine ve giriş tercüme edilmiştir. Mevcut protokolde kullanılan tarama verileri Kurumsal Değerlendirme Kurulu tarafından onaylanan çalışmanın bir parçası ve yazılı rızası alınmak koşuluyla gönüllü olarak toplandı. Bu yapıların 18-22,28-31 yanı sıra anatomik analizler ve atlasların 23,32,33 gelen çeşitli ayrı izleme protokolleri bilgi çizerek, mevcut protokol literatürle tutarsızlıkları ele kurallar kapsamlı bir set sunuyor. Ekteki görsel malzeme ile tamamlanan bu çalışma MTL yapıların daha net anlaşılmasını sağlamak, ve MTL izleme birincil yöntem olarak ya da bir supplementa olarak da, manuel segmentasyon benimseyerek gelecekteki araştırmaların ilgi uyandırmak bekleniyorotomatik segmentasyon için ry yöntemi. MTL anatomisini anlamak için bir, doğru, sezgisel ve kullanışlı rehber sunarak, bu protokol araştırmacılar sadece bazı MTL yapılar özel analizler için hedeflenen bile, onların komşu yapılara göre tüm MTL alt bölgesinin konumunu belirlemenize yardımcı olacaktır. Bu yerelleştirme doğruluğunu artırmak değil, aynı zamanda izleyicileri MTL oldukça muhtemeldir morfolojik varyasyon, durumlarında bilinçli kararlar vermenize yardımcı olacaktır. Bu kurallar sağlıklı grupta hacim analiz ve beyin anormallik algılama, hem de fonksiyonel, anatomik için lokalize prosedürler ve analizler tractographic, aşağıdakileri içeren MTL yapısal ve / veya fonksiyonel MRI tahlillerini içeren aratmak için uygulanabilir. Mevcut protokolü de büyük anatomik oluşumlar nispeten korunmuş ise, hasta (atrofi örneğin, hastalar) için MTL yapıların segmentasyonu bilgilendirmek için kullanılabilir. Klinik konuyu Takips &#39;veri atrofi ve / veya anatomik değişikliklerin şiddetine bağlı olarak, ek zaman ve çaba alabilir. Bu yatırım getirisi tanımlarken girus ve korteks arasındaki ayrımı dikkate almak önemlidir. Korteks madde sadece gri ifade ederken anatomik, burada girus, beyaz madde ve gri madde hem de ifade eder. ROI kullanım amacına bağlı olarak, bölütlemelerle beyaz madde içeren ya da dışarıda olabilir. Biz, her seferinde bir sekans dahilinde gerçekleştirilebilir için izleme, alt yapı ile alt yapı, bir yarı küre önerilir. Bazı yazılım paketleri 34 sonraki dilimleri, sürecini hızlandırır bir özellik üzerine yapıştırılan bir dilim üzerinde belirtilen sınırların izleme için izin verir. Bu gerektiği gibi (anatomik işaretlerini tespit örneğin,) iki taraf arasında tutarlılık kontrol etmek için, karşı yarımkürede başvurmak her zaman tavsiye edilir. Iki yarımkürede içinde aynı yapıların alternatif, paralel izlemeler de gerçekleştirilebilir. Ne olursa olsun işlemi tamamlandıktan sonra aydınger, sıralı veya paralel olup olmadığı, izleyiciler sonu sonucu çift kontrol edin ve gerektiği gibi ayarlamalar yapmak, her iki yarımkürede ve çoklu uçak görüşlerini referans olmalıdır. İzleyicinin deneyim ve görüntüleme verileri çözünürlüğüne bağlı olarak, sağlıklı konu veri MTL manuel segmentasyon içinde, 3-4 saat için, bir acemi tracer&#39;ın durumunda, 8-10 saat veya daha fazla sürebilir deneyimli biri vaka. <img alt="Şekil 1" fo:content-width="4in" src="/files/ftp_upload/50991/50991fig1highres.jpg" width="400" /> Mevcut protokolünü kullanarak takip MTL Şekil 1.. 3D bakış. Burada gösterilen Yapıları AMY (kırmızı), HC (mavi), PRC (sarı), ERC (pembe) ve ÖYK (Yeşil) .

<table><tbody><tr><td>ITK-SNAP</td><td>Pennsylvania Üniversitesi ve Utah Üniversitesi'nde ITK-SNAP Ekibi</td><td>ITK-SNAP v2.2</td><td></td></tr><tr><td>FSL</td><td>Beynin Fonksiyonel Manyetik Rezonans Görüntüleme (FMRIB) Analiz Grubu</td><td>FSL v4.1</td><td></td></tr><tr><td>Siemens Magnetom Trio 3T MR Tarayıcı</td><td>Siemens</td><td>Magnetom Trio 3T</td><td></td></tr></tbody></table>

medial temporal lob yapıların el segmentasyonu için kapsamlı protokolü

A Comprehensive Protocol for Manual Segmentation of the Medial Temporal Lobe Structures

Amigdala, hipokampus ve ilişkili parahipokampal bölgeleri (entorinal peririnal, ve uygun parahipokampal): Mevcut kağıt medial temporal lob (MTL) oluşan beyin bölgelerinin dizi manuel izleme için kapsamlı bir protokol tanımlamaktadır. Mevcut diğer birçok izleme protokollerinden farklı olarak, genellikle belli MTL alanlarda (örneğin, amigdala ve / veya hipokampus) odaklanarak, mevcut izleme kurallar tarafından benimsenen bütünleştirici bakış açısı, tüm MTL altbölgeler net lokalizasyonu için izin verir. Kaybolmamış izleme protokoller ayrı ayrı çeşitli MTL yapıları, histolojik raporları ve beyin atlas hedefleyen ve açıklayıcı görsel materyallerin tamamlayıcı ile dahil çeşitli kaynaklardan gelen bilgileri entegre ederek, mevcut protokol anlamak için, doğru, sezgisel ve kullanışlı bir kılavuz sağlar MTL anatomi. Bu tür izleme kurallar için ihtiyaçAyrıca otomatik ve manuel segmentasyon protokolleri arasındaki olası farklılıklar gösteren tarafından vurgulanmıştır. Bu bilgi yapısal MRG soruşturmaları sadece araştırma içeren doğru uygulanabilir ama aynı zamanda hem sağlıklı ve klinik gruplarda anatomik tanımlanan ROI&#39;ler yapısal-işlevsel kolokalizasyon ve fMRI sinyal çıkarma, olabilir.

Manuel ve Otomatik segmentasyonu arasındaki olası farklar İllüstrasyon AMY, HC, PRC, ERC ve birinci basamak sağlık için el bölümleme bir 3 boyutlu modeli, Şekil 1 &#39;de gösterilmiştir ve bu bölümleme bir sagital kesit, Şekil 2&#39; de gösterilmiştir. Manuel ve otomatik arasında mümkün olan en uç farklılıklar gösteren amacıyla traseleri, hatalı otomatik segmentasyon ile temsili bir konu gelen AMY dilimleri (aşağıya bakınız Şekil 3)<...

Mevcut çalışma, medial temporal lob (MTL) yapılarını manuel olarak izlemek için kapsamlı bir rehber seti sunmaktadır. Bu protokol, MTL'nin yapısal ve/veya birleşik yapısal-fonksiyonel manyetik rezonans görüntüleme (MRG) incelemelerini içeren araştırmalarda, hem sağlıklı hem de klinik gruplarda uygulanabilir.

Medial Temporal Lob Yapıların El segmentasyonu için Kapsamlı Protokolü

The present paper describes a comprehensive protocol for manual tracing of the set of brain regions comprising the medial temporal lobe (MTL): amygdala, ...

Bu prosedürün genel amacı, insan medial temporal lob yapılarının yüksek çözünürlüklü manyetik rezonans görüntülerinde manuel olarak nasıl izlenebileceğini göstermektir. Bu, önce beyindeki amigdalanın tanımlanması ve ön kenarlardan arka kenarlara sistematik şekilde izlenmesiyle sağlanır. İkinci adım, hipokampusun boyuna uzunluğunu ve genel sınırlarını bulmak ve ardından ön arka yönde dilim dilim izlemektir.Sonra, parahippokampal girusun ön yapılarını, yani interal ve perineal korteksleri paralel olarak izleyerek karşılıklı sınırlardaki varyasyonları daha iyi uyum sağlayabilir. Son adım, para hipokampal girusun arka segmentini, yani para hipokampal korteksin kendisini aynı ön arka şekilde izlemektir. Sonuç olarak, bu manuel izleme prosedürü tüm medial temporal lob yapılarının 3D render ve hacimsel istatistiklerini elde etmek için kullanılabilir.Bu izleme protokolünün mevcut protokollere ve otomatik segmentasyon algoritmalarına göre temel avantajı, medial temporal lobun komşu yapılara göre tüm bölgelerini tanımlamasıdır. Bu, lokalizasyon doğruluğunu ve manuel izlemeyi artırabilir, ayrıca gerekirse otomatik segmentasyonun beynin önemli değişkenliğe sahip bir bölgesini değerlendirmeye ve düzeltmesine yardımcı olabilir. Mevcut protokol sadece medial temporal lobda anatomik araştırmalar için değil, aynı zamanda diğer görüntüleme yöntemlerinden veri analizine de uygulanabilir.Örneğin, fonksiyonel manyetik rezonans görüntüleme ile ilgilenilen fonksiyonel bölgeleri yüksek doğrulukla tespit eder. Bu protokol, hem ileri hem de acemi araştırmacıların insan beynindeki bu bölgeleri doğru şekilde tanımlamalarına yardımcı olabilecek intertemporal lob bölgelerinin benzersiz örneklerini sunar. İlk gösteri amigdalanın izini kapsıyor.Öncelikle beyindeki yapıyı yerelleştirerek başlayın. Lyman insula'sının göründüğü amigdalanın ilk kesimini belirleyin. İşte frontal ve temporal loblar arasındaki beyaz madde bağlantısının sürekli olduğu yerdir.Optik kiazma başka önemli bir simgedir. Daha sonra açılı demeti amigdalanın inferolateral sınırı olarak kullanarak amigdalanın son dilimi koronal görünümde tanımlanır. Yapının lateral ventrikülün temporal boynuzunun medial uzantısı ve hippokampus başının çıkıntısı olan uncinate girusun lateral olduğu bir seviyeye bakın.Şimdi amigdalayı izlemek için, amigdalanın tipik şekliyle göründüğü her iki yarımküre boyunca ön komissürün sürekli olduğu ilk dilimi belirleyin, amigdalayı süper medial sınır olarak interal sulkus kullanarak, yarı yıllık sulkusun fundusundan beyaz madde boyunca amigdalanın alt ucuna kadar inframedial sınır olarak izleyin, Temporal sap lateral sınır olarak ve arka dilimlerde izlemeyi tamamlamak için süperolateral eğriliği takip ederek, insula'nın alt dairesel sulkusun fundus seviyesinden yarı yıllık girus boyunca optik trakta ve amigdalanın üst sınırına kadar hayali bir çizgi çizer. Uncinate gyrus'u mutlaka hariç tutun. Lateral ventrikülün alius ve temporal boynuzunu, inferolateral delineation için ise temporal sapı lateral sınır için kullanın.İzlemeyi tamamlamak için eğriliği süper yanlara takip edin. Amigdalanın erken dilimlerindeki çevre alanlardan, onus'tan ve enteral korteksden ayırt etmeye özel dikkat edin; rehber olarak sagital ve eksenel görünümler kullanılarak, ardından amigdalayı önden arkaya doğru sistematik olarak dilim-dilim izleme yapın. Bu yönergeler kullanılarak, medial temporal lobda lokalize edilecek bir sonraki yapı, hipokampusun hipokampusu takip etmeye başlamasıdır; lateral ventrikülün temporal boynuzu amigdalanın inferolateral sınırı boyunca belirdiğinde ve hipokampusun son görünümüyle izlenmesi ve son görünümüyle hipokampusun izlenmesi olur; lateral ventrikülün trigonuna karşı inframedial, hipokampus ve sınırlarını lokalize etmek için her zaman alternatif görüş yönelimlerini kullanır.Hipokampusun sınırlarını tanımlamak için alius ve FIA'yı üstün yönde ayırmakla başlayın. Lateral taraftaki temporal boynuz, alt kenarı tanımlamak için köşesel demetin boyunca aşağıya doğru izler. Hipokampusu aynı tanımlarla izlemeye devam edin.Ayrıca, ulu'yu segmentasyona dahil edin ki hemen para hipokampal girusun beyaz madde demetiyle sınır komşusunda olsun. Üstten yükün eğriliğiyle hizalanır ve ağırlıklı olarak hipokampustan yatay olarak uzanır. Aşağıdaki üç yapıyı takip ederken özel dikkat gösterir.İlk olarak, segmentasyona arka yükü dahil edin. İkinci olarak, segmentasyondan aliusun üzerindeki koroid pleksusu çıkardığınızdan emin olun; ancak bu düşük çözünürlüklü görüntülerde mümkün olmayabilir. Ve üçüncü olarak, kaudat çekirdeğinin kuyruğunun dahil edilmesini önlemek için iki alternatif görüşe başvurun.İzlenmesi gereken bir sonraki alan para hipokampal girustur. Lateral taraftaki perineal korteksi kapsayan bir terim. Medial taraftaki trinal korteks ve ön dilimlerdeki para hipokampal korteks, perineal korteksin ilk dilimini tanımlar; kollateral sulkusun ortaya çıkışı önce, perineal korteks, kollateral sulkusun lateral bankasının medial kenarından albe girusunun lateral fundusuna veya medial korteks ile izler.Eğer iki giri varsa veya dorsal temporal kutup yüzeyinin orta noktası varsa. Bu girus yoksa, interal korteksi Lyman insula'nın yaklaşık beş milimetre önünde izlemeye başlar; medial temporal polar sulkusun fundusunu üst uç olarak ve peel yüzeyini inframedial sınır olarak kullanır. Amigdala ortaya çıktıktan sonra, yarım halka sulkusun fundusu üst sınır olur, yani açısal demetin hayali uzantısının ventriküler boşluğuyla buluşduğu nokta olur.Yarı halka sulkus ayırt edilemezse, perineal ile trinal korteks arasındaki sınır dilimden dilime değişebilir. Kollateral sulkus derin olduğunda, yani 1,5 santimetre kadar veya daha büyük olduğunda, perineal korteksi bu sulkusun medial bankasının medial kenarından lateral bankasının orta noktasına kadar takip edin. Derinliği bir ila 1,5 santimetre arasında değişen düzenli bir kollateral sulkusun olduğu durumlarda, perineal korteksi kollateral sulkusun medial bankasının ortasından sulkusun lateral bankasının medial ucuna kadar olan alan olarak izleyin.Bir santimetreden küçük sığ bir kollateral sulkus durumunda, perineal korteksi bu sulkusun fundusundan fusiform girusun taçının orta noktasına kadar takip edin. Kollateral sulkus, genellikle amca apeks seviyesinde, fundusundan çıkan küçük bir girus ile kesildiğinde, perineal korteksi lateral sulkusun fundusuna kadar takip edilir. Enteral korteksi oncle apex'in yaklaşık 1,5 milimetre gerisine kadar takip edin.Perineal korteksin izini, sonlandıktan sonra enteral korteksin yerini dolduracak şekilde medial olarak uzatın; burada merdiven tanımları üç milimetre uzunlukta uygulanmaya devam eder. Bunun ötesinde, perineal korteks para hipokampal korteks ile değiştirilir. Dilimdeki para hipokampal korteksi perineal korteksin hemen arkasından ve hippokampal kuyruğun sonuna kadar yaklaşık dört milimetre geride takip edilmesine doğru başlangıç yapılır.Parahippokampal korteksi, perineal korteksin arka kısmı için tarif edilen şekilde izleyin; kalsin sulkus ortaya çıkana kadar ve onu sulkusun alt kenarına sınırlandırın. Bu seviyede mini bir sulkus belirirse, onu segmentasyona dahil edin. MTL yapılarının izlenmesinin bir sonucu burada 3D render ve sağ taraftaki beyin içindeki temsil dilimlerinin konumunu gösteren 2D görüntülerde gösterilmiştir.Bu amigdalanın koronal görüntüleri, manuel izleme ile otomatik segmentasyon sonuçları arasındaki olası farkların aşırı bir örneğini göstermektedir. Sağ yan panelde görüldüğü gibi, yaygın bir otomatik segmentasyon yazılımı, uzman bir insan gözü için amigdalanın bir parçası olarak tanımlanabilecek dokunun yarısından fazlasını ihmal ederken, sol amigdalanın sadece küçük bir bölümünü tanımlamıştır. Benzer bir eksiklik var, ancak sağ amigdala'da da daha az bir derecede görüldü.Burada, tek bir denekten elde elde edilen iki taraflı amigdala ve su aygırı kampusunun manuel izleme ile elde edilen temsili hacimsel sonuçları gösterilmiştir. Mevcut protokol ve otomatik segmentasyon kullanılarak, otomatik segmentasyonun karşılaştırılan dört yapının her birinin hacmini yanlış tahmin ettiği gözlemlenebilir. Bu prosedürü takip ettiğinizde, bu prosedür denerken medial temporal lob yapılarının iki yaş grubu veya sağlıklı ile klinik gruplar arasında hacimsel farklılıklar gösterip göstermediği gibi soruları yanıtlamak için hacim istatistikleri toplanabilir.İzleme sırasında doğruluk ve verimlilik sağlamak için, koronal, eksenel ve sagital olmak üzere üç görsel düzlemin her birine atıfta bulunmak önemlidir. Bu videoyu izledikten sonra, MIT temporal lob bölgelerinin anatomik sınırlarını bilmeye dayanarak otomatik segmentasyonlarını doğru şekilde nasıl tespit edeceğinizi ve manuel olarak nasıl ayarlayacağınızı iyi anlamalısınız.

a-comprehensive-protocol-for-manual-segmentation-medial-temporal-lobe

Research

JoVE Journal

Neuroscience

Sinirbilim

Lezyon Explorer (LE), Alzheimer hastalığı ve normal yaşlı yapısal MRG bölgesel beyin dokusu ve subkortikal hiperintens lezyon Volumetrics elde etmek için geliştirilmiş bir yarı-otomatik, görüntü işleme boru hattı. Doğruluk ve güvenilirlik yüksek düzeyde sağlamak için, aşağıdaki LE kılavuzu prosedürleri için bir video-güdümlü, standart bir protokoldür.

Lezyon Explorer: Doğru ve Güvenilir MR türetilmiş Alzheimer Hastalığı Volumetrics ve Normal Yaşlı Bir Video-güdümlü, Standart Protokol

Bu makalenin amacı, MRI kullanarak hipokampus ve hipokampal alt alanları incelemektir. El yazması, hipokampusu ve beş hipokampal alt yapıyı segmentlere ayırmak için bir protokolü tanımlar: cornu ammonis (CA) 1, CA2/CA3, CA4/dentate gyrus, strata radiatum/lacunosum/moleculare ve subiculum.

Yüksek çözünürlük İn Vivo 3T Manyetik Rezonans Görüntüleme kullanma İnsan hipokampal alanlar için Manuel Segmentasyon Protokolü

Bu iletişim kuralı gri madde birim miktar için kullanılan gri cevherde bölgeleri betimlemek için yapısal T1 ağırlıklı MRG taramaları için yedi farklı otomatik bölümleme araçları başvuru süreci açıklar.

Kortikal gri cevherde T1 ağırlıklı MRG görüntülerden otomatik bölümleme

Açık yazılım kullanarak görüntü bölümlemesi ve otomatik bir modelleme paketi kullanarak daha fazla grup-bilge şekil analizi de dahil olmak üzere beyin yapıları üzerinde şekil analizi için yarı otomatik bir protokol sıyoruz. Burada, beyin MR görüntülerinden hipokampal segmentasyon ile 3D şekil analizi protokolünün her adımını gösteriyoruz.

Beyin Yapılarının Üç Boyutlu Şekil Modellemesi ve Analizi

Koroid pleksusun beyindeki önemli rolüne rağmen, güvenilir otomatik segmentasyon araçlarının olmaması nedeniyle bu yapının nörogörüntüleme çalışmaları azdır. Mevcut protokol, gelecekteki nörogörüntüleme çalışmalarını bilgilendirebilecek koroid pleksusun altın standart manuel segmentasyonunu sağlamayı amaçlamaktadır.

Beyin MRG Kullanılarak İnsan Koroid Pleksusunun Manuel Segmentasyonu

Burada, tıbbi olarak dirençli temporal lob epilepsisi olan hastaların tedavisinde kullanılan anteromesiyal temporal lobektomi prosedürüne genel bir bakış sunuyoruz. Özellikle, prosedürün endikasyonlarını ve sonuçlarını özetlemenin yanı sıra, ameliyat yönteminin ve ilgili cerrahi tekniğin ayrıntılarını burada açıklıyoruz.

Tıbbi Olarak İnatçı Temporal Lob Epilepsisinde Anteromesial Temporal Lobektomi: Operatif Bir Çalışma

Bu makalede, biz Neuronetics NeuroStar TMS cihaz kullanarak FDA onaylı depresyon tedavi protokolü ile ilgili metodoloji ve düşünceler inceleyin.

NeuroStar TMS Aygıt: FDA yürütülmesi Depresyon Tedavisinde Protokolü Onaylandı

Biz yaşam antennal lobda koku uyarılmış kalsiyum yanıtları ölçmek ve analiz etmek için kurulmuş bir tekniği...

Koku-uyarılmış Cevaplarının Kalsiyum Görüntüleme Drosophila Antennal Lob

Biz medial entorinal korteks (MEC) dorsal-ventral eksen korumak beyin dilimleri ile hazırlanması ve elektrofizyolojik kayıt için prosedürler açıklanmaktadır. Konumu nöral kodlama MEC içinde dorsal-ventral organizasyonu aşağıdaki Çünkü, bu işlemler navigasyon ve bellek için önemli hücresel mekanizmaların incelenmesi kolaylaştırmak.

Kemirgen Medial entorinal Korteksin dorsal-ventral Örgütü Soruşturma parasagital Dilimleri hazırlanması

Biz beyin omurilik sıvısı (BOS) toplamak ve embriyonik zebrafish beynin ventriküler sistemde BOS yoksun bir sistem oluşturmak için bir yöntem mevcut. Bu embriyonik beyin gelişimi sırasında BOS kompozisyonu ve onun ihtiyacının daha fazla inceleme için izin verir.

Zebra balığı Embriyonik Beyin Ventrikül Manuel Drenaj

Öğrenin, medial temporal lob yapılarını yüksek çözünürlüklü manyetik rezonans görüntüleri üzerinde manuel olarak izleme yöntemini. Bu protokol, amigdala ve hipokampusun hassas hacimsel değerlendirmelerini sağlar.

Medial Temporal Lob Yapıların El segmentasyonu için Kapsamlı Protokolü

Daha fazla video keşfet