Yüksek çözünürlük İn Vivo 3T Manyetik Rezonans Görüntüleme kullanma İnsan hipokampal alanlar için Manuel Segmentasyon Protokolü

Bu protokolün genel amacı, insan hipokampusunu manyetik rezonans görüntülerindeki alt alanlarla bölümlere ayırmak için güvenilir, anatomik olarak doğru bir yöntem sağlamaktır. Burada, hipokampal alt alanlar beş etikete ayrılır: CA bir, CA iki, ca üç, CA dört, dentat girus, S-R-S-L-S-M ve icm. Bu yöntem, hipokampal alt alan yapısının sağlıklı ve hastalık durumlarında nasıl değiştiği gibi nörogörüntüleme alanındaki temel soruların yanıtlanmasına yardımcı olabilir.

Bu tekniğin ana avantajı, üç T tarayıcıda toplanan yüksek çözünürlüklü görüntülere göre uyarlanması ve hipokampusun tüm ön arka uzunluğu için alt alan tanımlarını içermesidir. Aşağıdaki komut sahnesini burada terminale girerek başlayın. Yazılım arayüzünü T bir ağırlıklı görüntüde açmak için koronal görünümü büyütün ve hipokampusu yakınlaştırın, gezinme penceresinde segmentlemeyi seçin ve ardından XY yarıçapını seçin.

XY fırça boyutunu 0,1 olarak ayarlayın. Ön benek dilimi olan a dilimi için hipokampusun en ön koronal dilimine kaydırın. Hipokampal gri cevherin en dış kenarını, çevredeki temporal lob beyaz cevheri ile buluştuğu yere çizin ve üst sınıra yardımcı olması için alvesin yüksek yoğunluklu beyaz cevherini kullanın.

Kenarlığın içindeki etiketi doldurmak için gezinme penceresinin segmentasyon menüsündeki etiket doldurma tuşunu kullanın. B dilimi için hipokampal kafa kazandı. Temporal lobun beyaz maddesini ve alves'i kılavuz olarak kullanarak hipokampal başın sınırlarını çizmeye devam edin.

C dilimi için bir sonraki adımda, hipokampal kafa iki, dations ile. Alius'un beyaz maddesini kullanarak hipokampusun boyutlarını çizin. Ardından, lateral hipokampusun ön kenarından yatay bir çizgi çizmek için eksenel görünümü kullanın ve bu çizginin altındaki herhangi bir şeyi hipokampusun bir parçası olarak belirleyin.

Şimdi D dilimi için, hipokampal kafa, üç, temporal lobun beyaz maddesinde hipokampusun alt sınırını ve lateral ventrikülün alt boynuzundaki lateral kenarı çizin. Alius fibr'in beyaz maddesinde üst kenarlığı ve ortam sarnıcının hipointens bölgesinde medial kenarı çizin. Dilim E için inferior, lateral, superior ve medial sınırları çizin.

Daha önce olduğu gibi, hipokampusun hafifçe inceldiği ve interal korteksin gri maddesine uzandığı medial sınırın alt kısmını çizerek infer medial sınırı tanımlayın. Bu dilimlerde, hipokampal segmentasyonlardaki onusu dahil edin. Daha sonra hipokampal gövdeyi daha önce F.As dilim üzerinde belirleyin, vetigial hipokampal sulkusun düşük yoğunluklu serebral omurilik sıvısını segmentasyona dahil etmeyin.

Şimdi G dilimi segmenti için, hipokampal kuyruk kuyruğu segmentlere ayırmaya başlar. Forniksin seyri ilk kez göründüğünde. Daha ön dilimler için veziküler girusun şeklini hipokampal kuyruğa ekstrapolasyon yaparak veziküler girusu hariç tutun.

Veziküler girus artık ayırt edilemediğinde, tüm görünür gri maddelere hipokampal kuyruk olarak muamele edin. Daha sonra H dilimi için, hipokampal kuyruk iki segment, arka hipokampal kuyruğun düşük yoğunluklu gri maddesi, çevreleyen yüksek yoğunluklu beyaz maddeden. Son olarak, veya dilim gözü, en arkadaki dilim segmenti, temporal lobun çevresindeki beyaz maddeden hipokampal gri cevherin kalan küçük alanı.

T iki ağırlıklı bir görüntüde hipokampusun en ön koronal dilimine kaydırarak başlayın. Boya etiketini ayarla'yı seçerek ve terminalde bir ile 255 arasında bir sayı girerek boya fırçasının rengini değiştirin. En öndeki dilim olan A dilimi için, görünür hipokampal gri cevheri en uzun görünür ekseni boyunca iki eşit bölüme ayıran bir çizgi çizin.

Bu iki bölümden üstün olanı ca bir, alt bölümü ise B dilimi için sulu, hipokampal baş olarak etiketlemek için iki farklı renk kullanın. Hipokampal oluşumun ortasındaki düşük yoğunluklu alanı etiketleyin. SR SLSM olarak, inferior hipokampustaki kıvrımda bir sınır olan inferolateral ksumayı tanımlayın.

Hipokampal kafa olan C dilimi için üst medial uçta ca bir sulu sınırını çizmek için hipokampusun en uzun eksenini takip etmeye devam edin. Baştan çıkarıcı iki tane. Ca bir etiketin eğrisini takip eden koyu S-R-S-L-S-M bandını, SRSLM'nin içindeki herhangi bir yüksek yoğunluklu gri maddeyi CA dört dg olarak etiketleyin.

Ardından, kıvrım ve alt hipokampusu kullanarak sicm ca bir kenarlığı tanımlayın. CA bir ve ca iki arasındaki sınırı, CA üç arasındaki sınırı, SRSM'nin en üst kenarından süperolateral yönde uzanan 45 derecelik bir açı çizgisi olarak tanımlayın. Ca iki CA üçünü medial olarak üst kenar boyunca dations arasındaki oluğa kadar uzatın ve üst kenarın geri kalanını D dilimi için ca bir, hipokampal baş üç olarak etiketleyin.

S-R-S-L-S-M CA dört, DG ve ICM'yi tam olarak açıklandığı gibi etiketleyin. C dilimi için, CA iki, CA üç'ü medial olarak üst kenarın yarısına kadar uzatın ve üst kenarın diğer yarısını CA bir olarak etiketleyin. Süper medial hipokampal kafayı dikey olarak ikiye bölün.

Medial yarıyı S-R-S-L-S-M olarak etiketleyin. Sonra yatay olarak, yanal yarıyı ikiye bölün. Yine, alt kısmı CA iki, CA üç olarak etiketleyin ve üst kısmı E dilimi için CA dört DG, Angus ile hipokampal baş dört olarak etiketleyin.

Saeculum ca bir kenarlığı, CA dört dg'nin en medial kenarından alt yönde uzanan dikey bir çizgi olarak tanımlayın. CA bir, CA iki, CA üç s, RSL, SM ve ca dört DG kenarlıklarını tanımlamaya devam edin. Daha önce olduğu gibi, hipokampal kafa hipokampal gövdeye geçerken hipokampusun onus etiketinde, merkezdeki düşük yoğunluklu bölgeyi SRSL sm olarak etiketleyin.

E diliminde devam ederek, S-R-S-L-S-M bölümünün üst kenarına UCAS etiketinin inferolateral süper medial ekseni boyunca bir çizgi çizin. Bu çizginin üzerindeki tüm gri maddeler CA iki, CA üç olarak, bu çizginin altındaki etiketlenmemiş gri maddeleri CA dört D olarak etiketleyin veya hipokampal gövde olan F dilimini işaretleyin. Sulu S-R-S-L-S-M ca dört, DG ca iki, CA üç için kenarlıkları, hipokampal kuyruk olan G dilimindeki E dilimi için belirtildiği gibi uygulamaya devam edin.

ICM ca bir sınır, H dilimi için CA dört DG'nin medial kenarından infra medial yönde uzanan 45 derecelik bir açı çizgisi haline gelir. Veziküler girus artık hipokampal oluşumdan ayırt edilemediğinde, ortada kalan gri maddeyi CA dört dg olarak etiketleyin. Son olarak, dilim gözü için, en arkadaki dilim tüm yapıyı CA olarak bırakır.

Hipokampal oluşumda karanlık S-R-S-L-S-M artık görünmediğinde, bu protokol insan hipokampusunu segmentlere ayırmak için manyetik rezonans görüntüleme kullanır. Burada, tüm hipokampus, T bir ağırlıklı görüntüler kullanılarak dokuz koronal dilime bölünmüştür. Beş, hipokampal alt alanlar daha sonra burada T iki ağırlıklı görüntüler kullanılarak bölümlere ayrılır, CA bir, CA iki, CA üç, CA dört, denat girus, S-R-S-L-S-M ve ICM bu hipokampal kafa dilimi içinde görülebilir.

Bir kez ustalaştıktan sonra, bu teknik uygun şekilde uygulanırsa her konu için 40 saat içinde tamamlanabilir. Görüntülerdeki yoğunluk modellerini mümkün olduğunca takip etmeyi unutmamak ve bu prosedürü takiben konular arasındaki sınırlar konusunda tutarlı olmak önemlidir. Sağlıklı yaşlanma geçiren veya Alzheimer hastalığından muzdarip olanlar gibi savunmasız popülasyonlarda hipokampusun hacmi ve şekli hakkındaki soruları yanıtlamak için başka otomatik segmentasyon teknikleri de uygulanabilir.

Bu videoyu izledikten sonra, bu protokolü güvenilir bir şekilde tekrarlayabilmeli ve deneklerinizin ayrıntılı hipokampal alt alan anatomisi hakkında fikir edinebilmelisiniz.