Name: Micropost Diziler Kolay ve Doğru Mekanik-profil (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2015-11-17T15:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 25 s
Description: Öğrenin, mikro gönderi dizileri ve MechProfiler yazılımı kullanarak tek hücrelerden mekanobiyolojik özellikleri nasıl çıkaracağınızı. Bu yöntem, standart ışık mikroskobisiyle kanser hücrelerinin metastaz davranışlarını yüksek verimlilikte araştırmanıza olanak tanır.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu çalışma, Teknoloji ve Yenilik Komitesi (CTI) İsviçre hibesi 14796-PFLS-LSCTI tarafından desteklenmiştir. MicroPost dizileri, MicroDuits GmbH tarafından cömertçe sağlandı.

Micropost Dizileri 1. Kültürleme Hücreler Not: Tüm adımlar sterilite sağlamak için bir biyogüvenlik kabini içinde yapılmalıdır. Burada verilen miktarlar T25 hücre kültürü şişeleri içindir. Hücre kültürü ortamı tarifi ve hücre tohum yoğunluğu, kemik kanseri hücre çizgileri HuO9 ve M132 için optimize edilmiştir. <ol><li> Bir micropost dizisi üzerine tohumlama için hücre kültürü hazırlayın. <ol><li> Standart ışık mikroskobu kültür şişesi koyarak hücre kültürü kalitesini kontrol edin. Hücreler kaplıdır ne kadar kültür şişesi alt tahminine göre tipik bir büyüme ve morfoloji göstermektedir emin olun. % 70 -80% A kapsama sağlıklı bir büyüme oranını yansıtır. Onlar ölü hücreleri ve / veya büyümüş kültürünü temsil olarak hücrelerin yüzen miktarına dikkat edin. </li><li> 4 mi 1x Fosfat ile orta ve yıkama kaldırarak Hücreleri tripsinize edin salin (PBS) tampon tamponlu. Hücre kadar oda sıcaklığında 0,8 ml 1 x tripsin / etilendiamintetraasetik asit (EDTA) ilave edin ve inkübeyaklaşık 2-4 dakika sürer s sökülmüş. Mikroskop ile süreci kontrol ve bazen yerinden oynatmamaya desteklemek için hafifçe şişeyi hafifçe vurun. </li><li> 5 ml hücre kültür ortamı (Dulbecco tadil edilmiş Eagle ortamı (DMEM)% 10 cenin sığır serumu (FBS ile / F12),% 1 penisilin / streptavidin (Pen / Strep)), reaksiyonu durdurmak için hala oturup bakiye hücrelerini yıkamak için ekleme balona en altta. Daha sonra homojen bir karışım elde etmek için yukarı ve aşağı birkaç kez bu süspansiyonu pipetle. Etkili bir yerinden oynatmamaya kazanmak için balonun orijinal büyüme alanı boyunca tüm çözümler pipetle emin olun. </li><li> 15 ml&#39;lik bir tüpe, hücre süspansiyonu aktarın ve 3 dakika boyunca 0,5 x g&#39;de bir masa üstü santrifüj kullanılarak da santrifüj. </li><li> Süpernatantı ve yukarı pipetleme ve 5 kat aşağı 5 ml ortamda hücre pelet yeniden askıya. Bunu yaparken kabarcıklarının oluşumunu önlemek için emin olun. </li><li> Bir hücre sayımı odacığı ve bir ışık mikroskobik kullanılarak hücre yoğunluğu belirlemekpe. Hücre agrega için hücre sayım odasında hücre süspansiyonu kontrol ve sonraki deney için tek tek hücrelere sahip sağlamak. Pipet hücreleri onları ayırmak için agrega oluşturmak üzere tekrar ve birkaç kez aşağı eğilimi varsa. </li><li> 25.000 hücre / ml hücre solüsyonu elde etmek için yeterli bir ortam maddesi ile bir hücre süspansiyonu ile seyreltilir. Kapalı tüpü birkaç kez ters yüz edilerek iyice karıştırın. </li></ol></li><li> Hücre tohumlama için micropost dizisi hazırlayın. Kritik Not: Bu potansiyel microposts zarar verebilecek doğrudan gibi istenmeyen kabarcıklar tanıtıldı, özellikle micropost dizisi üzerine pipetle etmeyin. Ayrıca, micropost dizisi asla kılcal kuvvetler microposts çöken yol olarak oluşan kurur emin olun. <ol><li> Bir çift cımbız kullanarak bir 12 oyuklu plaka iyi yüzü yukarı bakacak şekilde ve 1 ml etanol (% 99) eklenmesi ile ıslatın micropost dizisi ile cam substratın yerleştirin. 20-30 saniye boyunca oda sıcaklığında inkübe edin. </li><li> Etanol seyreltinde tarafında yaklaşık 1 ml steril deiyonize su (DI su) ilave edilmesi ve bir transfer pipeti veya aspirasyon cihazı kullanılarak yaklaşık olarak 1 ml aspire aşamalı olarak gerçekleştirilebilir. Bu adımı en az 3 kez tekrarlayın. </li><li> Ekleme ve yaklaşık olarak 1 ml aspire aynı şekilde PBS-tamponu ile DI-su değiştirin. Bu adımı 3 kez tekrarlayın. </li><li> Ekleme ve yaklaşık ortam 1 ml aspire ortam ile PBS-tampon değiştirin. Bu adımı 3 kez tekrarlayın. </li></ol></li><li> Hazırlanan her micropost dizinin üstünde pipetle 1 ml hücre solüsyonu (25.000 hücre). Çok-yuvalı plaka yakın ve bir kuluçka transfer (CO 2 5%, 37 ° C). Hücreler yapışır ve 6 -7 saat microposts üstünde büyümek edelim. </li><li> Bir ışık, bir mikroskop kullanarak bazen yapışma sürecini inceleyin. Hücrelerin en Birden microposts yayılmış görünür olduğunu kontrol edin. </li></ol> 2. Tespit ve Boyama Hücreleri Not: Tüm adımları veBurada verilen miktarlar 12-çukurlu bir plaka tek bir oyuk içindir. Bu microposts çökmesi ile sonuçlanır herhangi bir sıvı, bir aspirasyon sonra kuyuların Bir kurumasını önlemek için bir seferde on iki kuyu dörtten fazla işleme sokulması tavsiye edilmektedir. <ol><li> Kuyudan aspire orta ve yıkama hücreler 1 ml PBS tamponu ile 2x. Inkübasyon sırasında micropost dizisi üzerinde biriken hücre debrisini uzaklaştırmak için ve ölü hücreleri ayırmak için PBS ile yıkama sırasında hafif bir kuvvet uygulamak için emin olun. </li><li> 5 dakika boyunca 0.5 ml% 3.7 tamponlu formaldehit solüsyonu ile hücrelerin sabitleyin. </li><li> 1 ml steril DI su ile micropost dizi 2x yıkayarak formaldehit çözüm değiştirin. </li><li> Yaklaşık 90 sn için (% 50 su,% 40 etanol ve% 10 asetik asit içinde% 0.05 Coomassie Brilliant Blue) boya ile hücrelerin Leke. 1 ml steril DI su ile 2x kapalı aşırı boyama çözüm yıkayın. Dizi micropost 1 ml distile su ekleyin. </li><li> Bir ışık mikroskobu kullanılarak boyama sonucu kontrol edin. Tekrarlama tHücre gövdesi görüntülenmiştir çok sönük ise o adımı boyanarak. </li><li> 4 ° C &#39;de bir buzdolabında üzerine boyanan hücreler ile mağazası micropost dizileri. Her zaman su altında tutmak için emin olun. </li></ol> 3. Hücre Görüntüleme Not: Adım 4 sadece sonsuzluk düzeltilmiş optik olmadan mikroskoplar için de geçerlidir. <ol><li> Yüksek çözünürlüklü görüntüleme için ince bir cam alt kısma sahip bir Petri kabı, 2 ml DI-su ilave edilir. </li><li> Microposts yukarı bakacak şekilde görüntüleme çanak içine bir cımbız kullanarak micropost dizi aktarın. </li><li> Işık mikroskobu bir hareketli sahnede görüntüleme Petri kabı yerleştirin. </li><li> Ölçekte sayı cam alt tabaka, silikon elastomer ve üstünde sıvı kırılma indeksleri uyumsuzluğu telafi etmek için optik yol boyunca tüm malzemelerin toplam kalınlığı temsil dek görüntüleme için kullanılan lensin tazminat halkasını çevirin. Bu microposts parlak bir görünüm gitmelidirçekirdekler. </li><li> Aşağı% 50 aydınlatma tarafında iris kapatın ve sıradan bir parlak alan modu sağlayan optik yol herhangi bir faz kontrast halkaları çıkartın. </li><li> Microposts gözlem tarlada yatay bir çizgi oluşturacak micropost dizi aynı hizaya getirin. Bir başlangıç ​​noktası (örneğin, sol üst) tanımlar ve sayısız görüntüleri çekerken micropost dizisi tarayarak sahne üzerinde Petri kabı adım adım hareket ettirin. </li><li> 20X veya 40X objektif kullanarak kamera için en yüksek çözünürlük ayarı ile tüm görüntüleri çekin. Görüntünün merkezinde tek bir hücreyi hedefliyoruz. </li><li> Micropost ipuçları odak kadar madde boyunca z ekseni boyunca hareket ettirin. Mikroskop ince ayar odak tekerleğini kullanın ve yaklaşık 2-3 um için micropost alt odaklanarak doğru çevirin. </li><li> (Bir seferde görüntüleme parametreleri tek doğru süpürme tek dizi bölümünün test görüntülerinin serisini alarak standart bir görüntüleme prosedürü oluşturulması, örneğin, maruz kalma süresi,iris ayarı, lamba ayarları vb.) MechProfiler görüntüleri analiz ve hızlı ve güvenilir bir analiz için uygun bir parametre setini belirler. </li></ol> Açık Kaynak Yazılım &quot;MechProfiler&quot; 4. Görüntü Analizi Not: Tüm yazılım fonksiyonları sol fare düğmesini kullanarak bir işaretleme cihazı ile aktif hale getirilebilir. Ancak, eğitimli operatör verimli iki elle görüntü işleme etkinleştirmek için klavyenin sol yarısında olacak şekilde tasarlanmıştır belgelenmiş kısayol tuşlarını kullanabilirsiniz olacaktır. <ol><li> Görüntü analiz yazılımı MechProfiler başlatın ve &quot;Aç&quot; tıklayarak analiz edilmesi gerekir görüntülerin bir dizi açın. </li><li> Yazılım geliştiricisi tarafından verilen &quot;Ayarlar&quot; bölümüne tüm parametreleri yerleştirin. Özel yazılım el kitabında ayrıntılı olarak tarif edilen prosedürlere göre (örneğin, kontur eşiği ve minimal mesafe) yapılandırılmalıdır parametreleri belirleyin. </li><li> Görüntüyü analizs birer-one &quot;Kırp&quot; seçeneğini kullanarak, ilgi alanına bunları kırparak (tıklayın ve fare düğmesi ile sürükleyin basılı). Çizilmiş dikdörtgenin içine çift tıklayınız Bu eylemi tamamlamak için. </li><li> &quot;Hücre hatlarını çizin&quot; ve hücre bağlı olduğu tüm microposts dahil çizim için çapraz saç imleci kullanın tıklayarak her görünür hücre anahat tek-tek işaretleniyor. </li><li> &quot;Sil Mesajlar&quot; linkine tıklayarak istenmeyen microposts atın ve çizim çapraz saç imleci kullanın. Görüntü bölümü dışında bir hücreye ait veya başka herhangi bir nedenle değil, ilgi hücre tarafından deflected tüm microposts sarmalar. </li><li> Yazılım alt yordamı fare tıklaması ile &quot;Sentroidler Find&quot; başlayın. Hemen yanında kendi merkezinde kırmızı bir çarpı görünür tüm microposts kayıtlı kadar &quot;Sentroidler Bul&quot; düğmesi, ayarı filtreyi ayarlayın. Filtre ayarı çok ise çok yüksek mu eğer düşük microposts, göz ardı edilecektirltiple pozisyonları tek bir micropost için işaretlenir. Bir analiz oturumu sırasında sürekli ayar filtreyi tutun. </li><li> Birden veya cevapsız micropost pozisyonları ile centroids manuel düzenleme fonksiyonu &quot;Manuel Düzenle&quot; kullanın. Tıklatarak ve karşıdan karşıya sürükleyerek söz konusu micropost seçmek için fare çapraz saç kullanın. Dikdörtgenin içine çift tıklayın ve otomatik olarak kapanır büyütülmüş görüntü bölümünde, eksik kırmızı işaret yerleştirmek. Çizilmiş hücre anahat dışında ise böyle bir micropost atın devam etmeden önce (adım 4.5). </li><li> Bir fare tıklaması ile &quot;Izgara üret&quot; fonksiyonunu aktive ederek ideal bir micropost ızgara bulun. Pozisyon çizilmiş hücre anahat içinde mavi bir halka ile gösterilen gerçek micropost kafası, tekabül emin olun. </li><li> Bir fare tıklaması ile gelen &quot;Manuel Edit&quot; fonksiyonunu kullanarak gerekli hücre alanı içinde herhangi bir yanlış ızgara makinesi düzeltin. Qu micropost seçmek için çapraz saç kullanıntıklatarak ve karşıdan karşıya sürükleyerek Sorusuna. Görünen dikdörtgenin içine çift tıklayın ve otomatik olarak kapanır büyütülmüş görüntü bölümünde, eksik mavi işaret yerleştirmek. </li><li> Bir micropost görüntü bölümü içindeki pozisyon ve oluşturulan ideal bir ızgara arasındaki fark esas alınarak hesaplanan sapma değerleri bir histogram almak için fare tıklaması ile renkli &quot;Hesapla sehim&quot; kullanın. </li><li> &quot;Kaydet&quot; konulu bir fare tıklaması ile değerlerin tablolar dahil olmak üzere komple bir analiz kaydedin. </li><li> &quot;Görünüm Reset&quot; ve uygun doğru klavye curser tuşu kullanılarak yapılabilir &quot;Next Image&quot;, başka bir görüntü bölümü veya klik analiz tıklayarak ya görüntü analizi devam edin. </li></ol> 5. Veri Analizi - Mechanoprofiling <ol><li> Analiz görüntüleri ile klasörden bir ofis elektronik tablo programı ile dosya &quot;results.xls&quot; açın. Bu al veri içeriyoranaliz hücrenin bütün micropost sapması ve bu tür çalışmaların (yani, alt tabaka deformasyon enerjisi) gibi standart önlemler dahil olmak üzere türev l hesaplanan değerler. </li></ol>

<ol><li>Sharma, R. I., Snedeker, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biochemical+and+biomechanical+gradients+for+directed+bone+marrow+stromal+cell+differentiation+toward+tendon+and+bone%5BTitle%5D)+AND+%22Biomaterials%22%5BJournal%5D)">Biochemical and biomechanical gradients for directed bone marrow stromal cell differentiation toward tendon and bone.</a> Biomaterials. 31 (30), 7695-7704 (2010).</li>
<li>Suresh, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biomechanics+and+biophysics+of+cancer+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Acta+Biomater%22%5BJournal%5D)">Biomechanics and biophysics of cancer cells.</a> Acta Biomater. 3 (4), 413-438 (2007).</li>
<li>Bartalena, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+novel+method+for+assessing+adherent+single-cell+stiffness+in+tension%3A+design+and+testing+of+a+substrate-based+live+cell+functional+imaging+device%5BTitle%5D)+AND+%22Biomed+Microdevices%22%5BJournal%5D)">A novel method for assessing adherent single-cell stiffness in tension: design and testing of a substrate-based live cell functional imaging device.</a> Biomed Microdevices. 13 (2), 291-301 (2011).</li>
<li>Tan, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cells+lying+on+a+bed+of+microneedles%3A+An+approach+to+isolate+mechanical+force%5BTitle%5D)+AND+%22PNAS%22%5BJournal%5D)">Cells lying on a bed of microneedles: An approach to isolate mechanical force.</a> PNAS. 100 (4), 1484-1489 (2003).</li>
<li>Akiyama, Y., Hoshino, T., Iwabuchi, K., Morishima, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Room+Temperature+Operable+Autonomously+Moving+Bio-Microrobot+Powered+by+Insect+Dorsal+Vessel+Tissue%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+ONE%22%5BJournal%5D)">Room Temperature Operable Autonomously Moving Bio-Microrobot Powered by Insect Dorsal Vessel Tissue.</a> PloS ONE. 7 (7), (2012).</li>
<li>Biais, N., Ladoux, B., Higashi, D., So, M., Sheetz, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cooperative+retraction+of+bundled+type+IV+pili+enables+nanonewton+force+generation%5BTitle%5D)+AND+%22Plos+Biology%22%5BJournal%5D)">Cooperative retraction of bundled type IV pili enables nanonewton force generation.</a> Plos Biology. 6 (4), 907-913 (2008).</li>
<li>Wuang, S. C., Ladoux, B., Lim, C. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Probing+the+Chemo-Mechanical+Effects+of+an+Anti-Cancer+Drug+Emodin+on+Breast+Cancer+Cells%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Mol+Bioeng%22%5BJournal%5D)">Probing the Chemo-Mechanical Effects of an Anti-Cancer Drug Emodin on Breast Cancer Cells.</a> Cell Mol Bioeng. 4 (3), 466-475 (2011).</li>
<li>Schoen, I., Hu, W., Klotzsch, E., Vogel, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Probing+Cellular+Traction+Forces+by+Micropillar+Arrays%3A+Contribution+of+Substrate+Warping+to+Pillar+Deflection%5BTitle%5D)+AND+%22Nano+Lett%22%5BJournal%5D)">Probing Cellular Traction Forces by Micropillar Arrays: Contribution of Substrate Warping to Pillar Deflection.</a> Nano Lett. 10 (5), 1823-1830 (2010).</li>
<li>Lemmon, C. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Shear+Force+at+the+Cell-Matrix+Interface%3A+Enhanced+Analysis+for+Microfabricated+Post+Array+Detectors%5BTitle%5D)+AND+%22Mech+Chem+Biosyst%22%5BJournal%5D)">Shear Force at the Cell-Matrix Interface: Enhanced Analysis for Microfabricated Post Array Detectors.</a> Mech Chem Biosyst. 2 (1), 1-16 (2005).</li>
<li>Lam, R. H. W., Weng, S. N., Lu, W., Fu, J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Live-cell+subcellular+measurement+of+cell+stiffness+using+a+microengineered+stretchable+micropost+array+membrane%5BTitle%5D)+AND+%22Integr+Biol-UK%22%5BJournal%5D)">Live-cell subcellular measurement of cell stiffness using a microengineered stretchable micropost array membrane.</a> Integr Biol-UK. 4 (10), 1289-1298 (2012).</li>
<li>Roure, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Force+mapping+in+epithelial+cell+migration%5BTitle%5D)+AND+%22PNAS%22%5BJournal%5D)">Force mapping in epithelial cell migration.</a> PNAS. 102 (39), 14122-14122 (2005).</li>
<li>Papenburg, B. J., Rodrigues, E. D., Wessling, M., Stamatialis, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Insights+into+the+role+of+material+surface+topography+and+wettability+on+cell-material+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Soft+Matter%22%5BJournal%5D)">Insights into the role of material surface topography and wettability on cell-material interactions.</a> Soft Matter. 6 (18), 4377-4388 (2010).</li>
<li>Badique, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Directing+nuclear+deformation+on+micropillared+surfaces+by+substrate+geometry+and+cytoskeleton+organization%5BTitle%5D)+AND+%22Biomaterials%22%5BJournal%5D)">Directing nuclear deformation on micropillared surfaces by substrate geometry and cytoskeleton organization.</a> Biomaterials. 34 (12), 2991-3001 (2013).</li>
<li>Sniadecki, N. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Magnetic+microposts+as+an+approach+to+apply+forces+to+living+cells%5BTitle%5D)+AND+%22PNAS%22%5BJournal%5D)">Magnetic microposts as an approach to apply forces to living cells.</a> PNAS. 104 (37), 14553-14558 (2007).</li>
<li>Weng, R. H. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+silicone-based+stretchable+micropost+array+membrane+for+monitoring+live-cell+subcellular+cytoskeletal+response%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Chip%22%5BJournal%5D)">A silicone-based stretchable micropost array membrane for monitoring live-cell subcellular cytoskeletal response.</a> Lab Chip. 12, 731-740 (2012).</li>
<li>Desai, R. A., Yang, M. T., Sniadecki, N. J., Legant, W. R., Chen, C. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microfabricated+Post-Array-Detectors+%28mPADs%29%3A+an+Approach+to+Isolate+Mechanical+Forces%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Microfabricated Post-Array-Detectors (mPADs): an Approach to Isolate Mechanical Forces.</a> J Vis Exp. (8), e311(2007).</li>
<li>Yang, M. T., Fu, J. P., Wang, Y. K., Desai, R. A., Chen, C. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assaying+stem+cell+mechanobiology+on+microfabricated+elastomeric+substrates+with+geometrically+modulated+rigidity%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Assaying stem cell mechanobiology on microfabricated elastomeric substrates with geometrically modulated rigidity.</a> Nat Protoc. 6 (2), 187-213 (2011).</li>
<li>Sniadecki, N. J., Han, S. J., Ting, L. H., Feghhi, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Micropatterning+in+Cell+Biology%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+in+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Micropatterning in Cell Biology.</a> Methods in Cell Biol. 121, 61-73 (2014).</li>
</ol>

Baş yazar (NG), bu çalışmada kullanılan mikro direk dizilerinin ticari tedarikçisi olan MicroDuits GmbH'nin kurucu ortağıdır. Başka hiçbir yazarın bu çalışmayla herhangi bir potansiyel çıkar çatışması yoktur.

Bu çalışma esas olarak giriş teknik ve pratik engellerin düşürerek çekiş kuvvet mikroskobu alanını ilerletmek istiyor. Bu engeller iki taraftan geliyor. Öncelikle çoğaltılabilir imalatları ve deneysel bir micropost dizisi komisyon için aşılması gereken çok sayıda önemsiz olmayan teknik zorluklar bulunmaktadır. Tipik bir deney yüzlerce veya hücrelerin hatta binlerce analizini gerektirebilir akılda tutarak - İkincisi, benzer olmayan önemsiz tek hücre güçlerinin güvenilir bir yarı otomatik analizi için ihtiyaçtır. Yukarıda...

Mekanik-duyarlı hücre bazlı deneyler mekaniği hücre biyolojisi oynayabileceği role yansıtan geniş bir uygulama yelpazesi ile, yapışık hücrelerin araştırmak için izin verir. Bu uygulamalar genellikle hücre içi süreçleri ya da tam hücreli davranışını sürücü altında yatan mekanizmalar odaklanın. Bir yandan, bu tür ekstra hücresel matris bileşiminin ya da matris sertlik gibi dış çevre faktörleri önemli ölçüde bir hücrenin mekanik ve biyolojik tepkiyi etkiler. 1, aynı farmasötik olarak aktif bileşiklerin çoğu sınıflarının kullanımından sonra gözlenebilir, etkileri olan vardır genellikle hücre kültür modelleri kullanılarak karakterize edilmiştir. 2 tür iskeleti yapısı ve fonksiyonu değişiklikler ile ilişkili hücre fenotipi işaretli değişiklikleri uyarabilir spontan veya deneysel genetik mutasyonların neden olduğu gibi diğer taraftan genotipik özellikleri üzerinde. 3 Bu örnekler vardır Birçok olası birkaçkonular hangi hücrelerin mekanik fenotiplendirilmesi ilgili olduğunu ve tüm bu yararlı micropost dizileri ile incelenmiştir. Bu yazının yazıldığı, yaklaşık 200 makaleler hücre micropost etkileşimini anlatan yayınlanmıştır. Bu eserler micropost saptırma ilkeleri teorik yönlerini yanı sıra kendi imalatı pratik talimatlar tartışmak. Hücreler ve esnek micropost dizilerin etkileşimini anlatan ilk makale, sürekli yumuşak yüzeylerde Tan ve ark nanonewton ölçekli hücre kasılma, tahmin etmek için kullanılır, klasik çekme kuvvet mikroskobu (TFM) aksine 2003. 4&#39;te Tan ve arkadaşları tarafından yayımlandı. silikon elastomerden yapılmış çok yakın aralıklı dikey kirişler kullanılarak bir yöntem açıklamıştır. Bu tekniğin başlıca avantajları, iki ana özelliklerinden ortaya çıkmaktadır. Tutarken İlk hücre görünür substrat sertliği değiştirmek için yalnızca tek bir micropost boyutlarını değiştirmek gerekiyorAksi takdirde sürekli ve böylece yüzey topoloji ve kimya farklılıkları kaçınarak substrat bileşimi. İkinci microposts discretely bireysel odak yapışıklıklar sırasına kuvvet ve mekansal kararları ile analiz edilebilir ve standart TFM tarafından benzer analizler doğasında olan analitik zorlukları azaltabilir bireysel yaylar gibi hareket ederler. Bugün micropost dizileri için uygulama aralığı büyük ölçüde birkaç tek hücreler için kuvvetlerin sadece haritalama aşıyor. Örneğin, Akiyama bir böcek kas gücünü bağımsız mikro robot geliştirmek amacıyla, bir micropost dizisi için bir harekete geçirici olarak güve tırtıl bir izole dorsal damar dokusu kullanımını bildirir. 5 Bununla birlikte, microposts en yayınlanmış başvurular enfeksiyon ya da kanser gibi tıbbi durumların çalışmalara yoğunlaşmıştır. Örneğin, micropost diziler Neisseria gonorrh ve paketlenmiş tip IV pili kuvvet nesil incelemek için kullanılmıştır. Sinyal kaskadları enfeksiyon artırılması ile ilişkili 6 Diğerleri hücre iskeleti hedefleyen ilaç bileşikleri ile tedavi meme kanseri hücrelerini incelemek için microposts kullandık OEA kolonileri. 7 Bir micropost sapması genellikle hücrenin varsayarak bir uç yük ile bir konsol için klasik ışın teorisi kullanılarak tarif edilir ancak micropost çok uç takılır. Bir saptırma ö neden İşte uygulanan kuvvet F micropost yönettiği &quot;bükülme sertliği&quot; k bağlıdır ve hesaplanır: <img alt="Denklem 1" src="/files/ftp_upload/53350/53350eq1.jpg" /> (1) E, I, L ve varlık Young modülü, sırasıyla atalet ve kiriş uzunluğunun alan anı ile. Alt tabaka eğilmesi ac alınmadığı Ancak, bu denklemden sonuçlar sadece ışın kesme beri iş ve hem de eğilme kuvvetlerin genel yaklaşım vermeksaymak. Microposts tipik polidimetilsiloksan (PDMS) gibi yumuşak malzemelerden yapılmış olması dikkate alındığında bu faktörlerin dahil edilmesi gereken silikon kauçuk tabanlı. . Schoen ve arkadaşları micropost (L / D) ve karşılık gelen polimerin Poisson Oranı v oranına göre bir düzeltme faktörü olduğunu göstermiştir 8 O ile verilir.: <img alt="Denklem 2" src="/files/ftp_upload/53350/53350eq2.jpg" /> (2) T eğim (v) aynı maddede bulunabilir gibi uydurma parametre a = 1.3 içeren bir devirme katsayısı olma ile: <img alt="Denklem 3" src="/files/ftp_upload/53350/53350eq3.jpg" /> (3) Bu bir micropost en düzeltilmiş sertlik k corr saf eğilme sertliği k = k viraj ürün ve düzeltme faktörü corr demektirtarafından verilen: <img alt="Denklem 4" src="/files/ftp_upload/53350/53350eq4.jpg" /> (4) Bu nedenle, hücre kuvvet hesaplamaları şimdi okuma denklem (1) daha rafine varyasyon kullanılarak yapılmalıdır: <img alt="Denklem 5" src="/files/ftp_upload/53350/53350eq5.jpg" /> (5) Düzeltme etkisi kısa sürede micropost boyutları için tipik değerler kullanılır gibi daha belirgin hale gelir. Örneğin, dairesel bir kesite ve PDMS bazlı silikon lastikten yapılmış 5 um&#39;lik bir çapa sahip bir 15-mikronluk bir uzun micropost 0.77 bir düzeltme faktörü yol açar ve bu nedenle, düzeltilmemiş hesaplama% 23 tarafından uygulanan kuvvetleri hücre olduğundan fazla olacaktır. Bu daha şiddetli küçük boy oranları ile microposts için olur. Geleneksel olarak, micropost görüntü analizi de idealize kiriş eğilme kuramına dayalı olmuştur. 2005 yılında MICR kullanımına öncülük grupOPOST diziler micropost analizi için uygun bir görüntü analiz yazılımı yayınlanan 9 yazılımı yazılım lisans gerektirir ve kullanıcı her pozisyon için üç görüntüleri almak zorundadır.; iletim modu ve lekeli hücre floresan modunda başka biri micropost üst ve alt uçakları birer. Her biri için üst ve alt pozisyonları karşılaştırarak sonra yazılım bir kuvvet vektör alanı belirler ve yazı başına kuvvet gibi ilgili parametreleri hesaplar micropost. Diğer yazılım paketleri var ve bunların analizleri prensipleri kısaca bunları açıklamak gelen maddelerde belirtilen, ancak bu analitik yazılım paketleri genellikle kamuya açık değildir. 10,11 Eşleme hücre kuvvetleri için tasarlanmış micropost dizileri tüm komşu microposts arasında eşit mesafeli boşlukların avantajına sahip olan ikinci bir ortogonal micropost düzeni veya altıgen biri olmak ya da sınıflandırılabilir. Tipik microposts habir dairesel geçiş kısmına ziyaretinde ve boyutları oval ya da kare kesitli microposts de rapor edilmiştir, ancak uzunluğu 50 um ila 1,0 um çapında 10 um ve 2. 4 arasında değişir. 12,13 Micropost malzemesi olarak PDMS bazlı silikon karışımlarının kullanılması karışımı içine nano-tanecikleri ilave sağlar. Kobalt nano çubuklar ekleyerek Örneğin micropost bir manyetik aktivasyon sağlayan ve böylece potansiyel deneysel tasarımlar özgürlük başka derecesini verir. 14 Çoğu grup kapak cam gibi veya Petri kabı içinde düz sert yüzeylerde kendi micropost dizileri üretmek. Bununla birlikte, Mann ve arkadaşları son bir gerilebilir zar üzerinde oluşturulmuş bir dizi micropost bildirmiştir. 15, hücre kontraktilite açısından canlı hücre sub-hücresel dinamik yanıtları okurken bu yapışık hücreler hücre germe güçlerine uygulanmasını da mümkün kılar. Yaygın olarak kullanılan ve çoğu estabSU8 fotorezist ile bir silikon gofret üstüne mikro üretmek için kullanılan temiz oda, kısa, standart işlemlerde SNIADECKI ve ark. 16-18 arasında derinlemesine protokoller de tarif edildiği gibi micropost dizileri yapmak için yayımlanır işlemi, yumuşak litografi dayanmaktadır. Bu silikon kauçuk kalıplara aktarılması yapılar üzerinde döküm edildiği bir kopyalama işlemi ile takip edilir. İkinci bir aşamada, bu kalıplar, seçilen bir alt-tabaka üzerine bir silikon kauçuğun kullanımım başlangıç ​​mikro çoğaltmak için kullanılır. Ancak microposts için bir üretim sürecini kuran kendi uygulamasıyla ilgili yayınlar, büyük ve artan sayıda rağmen mikro mühendislik uzmanları için bile zaman önemli miktarda alır; kabul edilebilir bir kalite düzeyini elde etmek için belirli laboratuar ortamında ve micropost düzeni optimizasyon ve adaptasyon gerektiren birçok işlem basamakları vardır. Ticari micropost dizileri hazır t artık mevcutsürekli yüksek kalite ile o-kullanım (&quot;off-the-raf&quot;) biçimi. Bu nedenle onlar bünyesinde üretimi için gerekli olan karmaşık ve uzun üretim sürecinin bir alternatiftir. Bu yazıda, bir ticari olarak temin edilebilir micropost dizisi, tek bir aydınlık alan mikroskopi görüntü kullanılarak selüler kuvvetleri haritasını hazırlamak için kullanıldı. Daha da önemlisi, bu makalede açıklanan ve bu yazının tamamlayıcı malzeme olarak yüklenebilir MechProfiler adında bir tam fonksiyonlu açık kaynak yazılımlar, belgelemektedir. Yazılımın bir aktif tutulan versiyonu da http://www.orthobiomech.ethz.ch adresinde bulunabilir. Bir &quot;off-the-raf&quot; tahlil ve uyumlu bir açık kaynak analiz yazılımı kombinasyonu belirgin doğru TFM deneyler gerçekleştirmek için giriş engel düşürür. Temiz oda tesisleri veya yazılım geliştirme uzmanlığı ya erişimi olmayan araştırmacılar başarıyla hücresel güçleri analiz edebilirsiniz. Bu mechanos odaklanmak için bir kullanıcı sağlayanensitivity tahlil çıktı ziyade teknoloji kendisi ve daha geniş bir topluluk için kullanılabilir çekiş gücü ölçümleri yapar. Ayrıca, bu micropost diziler tam otomatik tarama doğru yolunu açmak için önemli bir adımdır. MechProfiler analiz yazılımı dosya biçimi tiff, png, bmp ve jpg görüntüleri işler. Görüntüler floresan, faz kontrast ya da parlak alan ışık mikroskobu kullanılarak alınabilir. Başına bir program (mevcut: Şekil 12) ücretsiz Matlab Derleyici Runtime ile birlikte çalışır ve temel algoritmaları yaklaşık 1 dakika içinde tek veya birden fazla hücreleri ile görüntüleri işlemek için kullanıcı sağlayan aerodinamik görüntü işleme, izin verir. Ayrıca, bu hücreler ya yaşayan olabilir ya da &quot;sabit&quot;. MechProfiler yazılım ölçüde kaliteli ticari micropost diziler tekrarlanabilirlik dayanarak veri analizi verimini artırmak mümkün, daha spesifik olarak, varsayılan &amp; #8220 non-deflected &quot;dizisindeki her yazının konumunu ideal ızgara karşı kabul edilebilir (bu çalışmada kullanılan dizilerde ızgara imalat sapmalar az 100 nm idi). Kısacası birinde, ilgilenilen bölgeye onları ekinler, analiz için görüntü dosyaları bir seçim açar hücreler tarafından kapsanan mesajları tanımlar veya atılması gereken sonrası pozisyonları belirler deplasmanlar / İdeal ızgara karşı güçlerini hesaplar ve nihayet Standart ofis-tabloya dahil, ihracat için bir olasılık tüm hücre özel verileri kaydeder.

<table><tbody><tr><td>T25 hücre kültürü şişeleri</td><td>Nunc</td><td>156367</td><td></td></tr><tr><td>1x PBS-tampon</td><td>Sigma</td><td>D8537</td><td></td></tr><tr><td>%0.5 Tripsin-EDTA</td><td>Yaşam Teknolojileri</td><td>15400054</td><td></td></tr><tr><td>Orta DMEM/F12</td><td>Sigma</td><td>D8437</td><td></td></tr><tr><td>FBS Güney Amerika</td><td>Yaşam Teknolojileri</td><td>10270106</td><td></td></tr><tr><td>Penisilin-Streptomisin 100x</td><td>Sigma</td><td>P4333</td><td></td></tr><tr><td>15 ml santrifüj şişeleri</td><td>Sarstedt</td><td>62.554.502&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>Kollajen I / Fibronektin</td><td>MicroDuits</td><td>MPA-col1 / FN</td> Micropost boyutları ile önceden kaplanmış <td>Micropost dizisi: & Oslash; = 6.4 & # 160; &mikro; m, l=18.2 &mikro; m; ızgara=13 ve mikro; m, k<alt>corr</alt>=2.87&#160; nN/&mikro; m</td></tr><tr><td>Etanol abs pa</td><td>Merck</td><td>100.983</td><td></td></tr><tr><td>12 oyuklu plaka</td><td>Nunc</td><td>150628</td><td></td></tr><tr><td>Formalin çözeltisi, nötr tamponlu %10</td> <td>Sigma</td><td>HT5011</td><td></td></tr><tr><td>Parlak Mavi G-250</td><td>Sigma</td><td>27815</td><td>Coomassie mavisi</td></tr><tr><td>Metanol ACS pa</td><td>Merck</td><td>1.06009</td><td></td></tr><tr><td>Asetik asit</td><td>Sigma</td><td>695092</td><td></td></tr><tr><td>Cam alt çanak</td><td>WillCo Wells BV</td><td>GWSb-3522</td><td>35 mm çap, açıklık 22&nbsp; mm</td></tr><tr><td>T-100 Eclipse</td><td>Nikon</td><td>yok</td><td>Ters mikroskop</td></tr><tr><td>D3-L3</td><td>Nikon</td><td>yok</td><td>Kamera kontrol cihazı</td></tr><tr><td>DS Fi2</td><td>Nikon</td><td></td><td>Fotoğraf makinesi</td></tr></tbody></table>

micropost diziler kolay ve doğru mekanik-profil

Easy and Accurate Mechano-profiling on Micropost Arrays

Entegre esnek mikropostlara sahip hücre kültürü substratları, kullanıcının hücreler ve yakın çevresi arasındaki mekanik etkileşimleri incelemesini sağlar. Özellikle, hücre-substrat etkileşimleri ana ilgi alanıdır. Günümüzde mikropost dizileri, son on yılda yayınlanmış geniş bir uygulama yelpazesine sahip, iyi karakterize edilmiş ve yerleşik bir yöntemdir. Bununla birlikte, mikropost üretiminin uzun ve zorlu süreci ve mikropostlarla etkileşime giren hücrelerin görüntülerini analiz etmek için kolayca ulaşılabilir yazılımların olmaması nedeniyle biyologlar arasında tekniği uyarlamak için bir çekince var gibi görünüyor. 
Mikro direklerden kuvvet okuması şaşırtıcı derecede kolaydır. Bir mikro direk, hücresi ideal olarak ucuna bağlı olan bir yay gibi davranır. Boyuta bağlı olarak, bir hücre hücre iskeletinden bir veya birden fazla odak yapışma noktasından mikrodireğe kuvvet uygular, böylece mikrodireği saptırır. Sapma miktarı, yön ve büyüklük olarak uygulanan kuvvetle doğrudan ilişkilidir. Bir hücre tarafından kapsanan mikro direklerin sayısı ve post sapma modelleri karakteristiktir ve post başına kuvvet gibi değerlerin ve hücre fenotiplerinin "mekanik profillenmesine" izin veren biyolojik olarak ilgili birçok parametrenin belirlenmesine izin verir.
Mekano-profil oluşturma için uygun bir yöntem burada açıklanmıştır: kullanıma hazır, ticari olarak temin edilebilen ilk nesil mikro direkleri, artık tüm araştırmacıların erişebileceği, şirket içinde geliştirilmiş bir yazılım paketiyle birleştirmek. Tipik uygulamanın bir gösterimi olarak, kemik kanseri hücrelerinin tek görüntüleri, metastaz hücre hattı modellerinin mekano-profillemesi için parlak alan mikroskobunda çekildi. Ticari çekiş kuvveti sensörleri ve analiz için açık kaynaklı yazılımın bu kombinasyonu, mikropost dizi tekniğinin ilk kez uzman olmayan kullanıcılar tarafından yapılan rutin laboratuvar çalışmalarına hızlı bir şekilde uygulanmasına olanak tanır. Ayrıca, sağlam ve kolaylaştırılmış bir analiz süreci, bir kullanıcının çok sayıda mikro post görüntüsünü zaman açısından verimli bir şekilde analiz etmesini sağlar.

Açıklanan tekniğin ana avantajı rutin laboratuvar çalışmaları içine hızlı ve etkin entegrasyonu için sadeliği ve potansiyeli yatıyor. Açık kaynak yazılım ile eşleştirilmiş yüksek kalitede ticari sensör dizileri kombinasyonu olur, aksi takdirde görüntü analizi ve yazılım geliştirme bilgisine temiz oda tesislerine ve derinlemesine erişimi gerektirir mekano-hassasiyeti hakkında bilgi vermektedir. 1 sunulan yöntemin iş akışını gösterir Şekil. Bu micropost dizisi üzerine hücreleri hazırlanma...

Açıklanan, yapışık hücreler ve mikroyapılı substratlar arasındaki mekanik etkileşimleri ölçmek için kullanılan protokollerdir. Bu etkileşimler, göç, proliferasyon, farklılaşma ve apoptoz dahil olmak üzere temel hücre davranışlarıyla yakından bağlantılıdır. Protokoller, her bir mikro direk için ilgili kuvvetlerin belirlenmesini sağlayan MechProfiler adlı açık kaynaklı bir görüntü analiz yazılımı sunar.

Micropost Diziler Kolay ve Doğru Mekanik-profil

Cell culture substrates with integrated flexible microposts enable a user to study the mechanical interactions between cells and their immediate ...

Bu tekniğin genel amacı, standart ışık mikroskopisi kullanarak karakteristik hücre-substrat etkileşimlerinden kaynaklanan kuvvetleri görselleştirerek, izole tekil hücrelerden mekanobiyolojik açıdan ilgili özellikler toplamaktır. Sunulan yöntem, mekanobiyoloji için bir platform teknolojisidir. Kanser hücre metastazında hücre kasılmasının rolü gibi, kanser araştırmalarındaki temel soruların incelenmesine yardımcı olabilir.Tekniğin başlıca avantajları, çok az kullanıcı eğitimiyle nörobiyolojik bilgileri güçlü bir şekilde çıkarmasıdır. Standart ışık mikroskobu ile uyumludur ve yüksek verimliliğe yöneliktir. Üçüncü olarak, bu yöntem insan kemik kanseri hücrelerinin mekanobiyolojik özelliklerine dair içgörü sağlar.Düz kas hücreleri veya kardiyomiyositler gibi oto hücre tiplerine de uygulanabilir. Öncelikle cam altlığı, mikro sütun dizisi yukarı bakacak şekilde 12 kuyucuklu bir plakanın kuyucuğuna yerleştirerek başlayın; altlığın kaplanması için kuyucuğa dolaylı olarak 1 ml %99 etanol ekleyin. Herhangi bir sıvı aktarım adımı sırasında kabarcık oluşmadığından ve mikro sütun dizisinin her zaman ince bir sıvı tabakasıyla kaplı olduğundan emin olun.Ardından, kuyucuğun kenarına 1 mL steril deiyonize su eklemeden önce diziyi oda sıcaklığında 20 ila 30 saniye inkübe edin. Su, etanol aspiratı ile karıştığında, kuyucuktan yaklaşık 1 mL etanol çözeltisi aspire edin ve ek olarak 1 mL deiyonize su ekleyin. Numuneyi ıslatmak için bu işlemi en az üç kez tekrarlayın.Ardından, her seferinde yaklaşık bir mililitre ekleyip aspire ederek ve bu işlemi üç kez tekrarlayarak kuyucuktaki deiyonize suyu aynı yöntemle PBS ile değiştirin. Daha sonra, aynı işlemi PBS'yi besiyeri ile değiştirmek için uygulayın. Dizi yaklaşık bir mililitre besiyeri ile kaplandığında, hazırlanan mikro post dizisinin bulunduğu kuyucuğa, bir mililitre besiyeri içerisinde 25.000 hedef hücre pipetleyin.Ardından çok kuyucuklu plakayı kapatın ve 37 °C ve %5 karbon dioksit içeren bir inkübatöre aktarın. Hücrelerin mikro sütunların üzerinde yapışması ve büyümesi için altı ila yedi saat bekleyin ve yapışma sürecini gözlemleyin. Ara ara bir ışık mikroskobu kullanarak, kuyucuktaki besiyerini aspire edin ve ardından hücreleri 1 mL PBS ile iki kez yıkayın.İnkübasyon sırasında mikro post dizisinde biriken hücre kalıntılarını temizlemek ve ölü hücreleri ayırmak için PBS ile yıkama yaparken nazik kuvvet uyguladığınızdan emin olun. Ardından, hücreleri sabitlemek için beş dakika boyunca 0,5 mililitre %3,7 tamponlu formaldehit çözeltisi ekleyin. Daha sonra formaldehit çözeltisini uzaklaştırın ve mikro post dizisini bir mililitre steril deiyonize su kullanarak iki kez yıkayın.Her bir yıkama için, tespit edilmiş hücreleri %50 su, %40 etanol ve %10 asetik asit içeren %0,05 kumasi brilliant blue boyası ile yaklaşık 90 saniye boyunca örtün, ardından fazla boyama çözeltisini bir mililitre steril deiyonize su ile iki kez durulayarak uzaklaştırın. Daha sonra mikro post dizisine bir mililitre deiyonize su ekleyin ve boyama sonucunu bir ışık mikroskobu altında kontrol edin. İnce cam tabanlı bir Petri kabına bir cımbız yardımıyla iki mililitre deiyonize su ekleyerek başlayın; mikro post dizisini 12 kuyucuklu plakadan, bir mikro post yukarı bakacak şekilde görüntüleme kabına aktarın.Ardından, görüntüleme Petri kabını bir ışık mikroskobunun hareketli tablasına yerleştirin. Mikroskop optikleri sonsuz düzeltmeli değilse, görüntüleme için kullanılan lensin kompanzasyon halkasını, ölçek üzerindeki sayı optik yol boyunca bulunan tüm malzemelerin toplam kalınlığını temsil edene kadar çevirin. Daha sonra, standart parlak alan modunu etkinleştirmek için optik yoldaki tüm yüzey kontrast halkalarını çıkarın ve aydınlatma tarafındaki irisi %50'ye kadar düşürün. Petri kabını, dizinin mikro sütunları gözlem alanı boyunca yatay veya dikey bir hat oluşturacak şekilde hizalayın.Sol üstte bir başlangıç noktası belirleyin ve Petri kabını sahne üzerinde kademeli olarak hareket ettirin. 20x veya 40x objektif ile çok sayıda yüksek çözünürlüklü görüntü alarak mikro post dizisini tarayın. Her yeni konumda, her görüntünün merkezinde tek bir hücre olacak şekilde hedefleme yapın.Mikroskobun ince ayar tekerleğini kullanarak, uç netleşene kadar Z ekseni boyunca mikro post tabanından uç kısmına doğru tarama yapın. Ardından, odak düzlemini mikro post tabanına doğru iki ila üç mikron indirin.Yazılım mec, profiler'ı başlatın ve "open" (aç) seçeneğine tıklayıp görüntüleri seçerek analiz edilmesi gereken bir dizi görüntüyü yükleyin. Ardından, ayarlar bölümüne gidin ve yazılım kılavuzunda belirtilen parametreleri girin. Daha sonra görüntüleri tek tek analiz edin.Önce kırpma düğmesini seçin ve ardından ilgi alanının etrafında dikdörtgen bir çerçeve oluşturmak için tıklayıp sürükleyin. İşlemi tamamlamak için çizilen dikdörtgenin içine çift tıklayın. Ardından, hücre çerçevesini çiz seçeneğini belirleyin ve görüntüdeki görünür hücre tarafından kaplanan tüm mikro direklerin etrafına bir çerçeve çizmek için artı şeklinde imleci kullanın.Gönderileri silmek için tıklayarak istenmeyen tüm mikro sütunları ayıklayın ve çizim için artı şeklinde imleci kullanın. Ardından, görüntünün dışında kalan veya ilgilenilen hücre dışındaki herhangi bir nedenle saptırılmış olan tüm mikro sütunları çevreleyin. Sonra, yazılım alt programını başlatmak için Find OID'lere tıklayın.Tüm mikro direkler kaydedilene kadar, "find OIDs" butonunun hemen yanındaki filtre ayarını düzenleyin; kaydedilen direkler merkezlerinde kırmızı bir çarpı işareti ile görünür hale gelir. Birden fazla veya kaçırılmış mikro direk konumu varsa, "manual edit"e tıklayarak manuel düzenleme işlevini kullanın ve ilgili mikro direği seçmek için fare imlecini kullanın. Dikdörtgenin içine çift tıklayın ve otomatik olarak kapanan genişletilmiş görüntü bölümüne tek bir kırmızı işaretleyici yerleştirin.Fare tıklamasıyla ızgara oluşturma işlevini etkinleştirerek ideal mikro direk ızgarasını bulun. Konumun, çizilmiş hücre ana hat çizgisi içinde mavi bir halka ile gösterilen gerçek mikro direk başlığıyla eşleştiğinden emin olun. Ardından, hücre alanı içinde gerektiğinde yanlış yerleştirilmiş ızgara işaretleyicilerini düzeltin.Fare tıklamasıyla ilgili manuel düzenleme fonksiyonunu kullanarak, artı şeklinde imleci mikro gönderi sorusunu seçmek için tıklayıp sürükleyerek belirleyin. Ortaya çıkan dikdörtgenin içine çift tıklayın ve düzeltilmiş mavi işareti, otomatik olarak kapanan genişletilmiş görüntü bölümüne yerleştirin. Ardından, görüntü bölümündeki bir mikro gönderi konumu ile oluşturulan ideal ızgara arasındaki farka dayanarak hesaplanan sapma değerlerinin histogramını elde etmek için sapmaları hesapla seçeneğine tıklayın.Son olarak, değer tabloları da dahil olmak üzere analizin tamamını kaydedin. Görüntü analizine, başka bir görüntü bölümünü analiz etmek için görünümü sıfırla (reset view) seçeneğine tıklayarak veya bir sonraki görüntüyü göster (next image show) seçeneğine tıklayarak devam edin. Burada, aynı üretim serisinden alınan lamlar üzerine ekilmiş, düşük metastatik potansiyele sahip Q oh nine hücreleri ve yüksek metastatik M 132 hücrelerinden oluşan iki kemik kanseri hücre hattının profilinin çıkarılmasına dair bir örnek gösterilmiştir.Kuvvet değerleri kategorize edildiğinde, sonuçlar Q oh nine hücrelerinin tutunma noktalarında yüksek metastatik hücrelere kıyasla daha fazla kuvvet uygulama eğiliminde olduğunu göstermektedir. Hücre alanı açısından bakıldığında, huo nine hücreleri için hücre başına ortalama kuvvetin M 132'ye kıyasla daha yüksek olduğu görülmektedir. Ayrıca, hücreler yayıldıkça mikro post başına ortalama kuvvet, post başına ortalama kuvvet daha stabil bir değere ulaşana kadar artış göstermektedir.Morfolojik farklılıkların yanı sıra, varyanslar ilgi çekici sonuçlarla nicelleştirilebilir. Örneğin, daha az mikro direğe yerleşme eğiliminde olan yüksek derecede metastatik M 132 hücrelerinin aksine, HU oh nine hücreleri mikro direk kapsamı açısından daha heterojen bir profil sergilemektedir. Kısacası, parental hücre hattı HU oh nine için Meno profili, bu hücrelerin tipik olarak daha fazla alanı kapladıklarını ve mikro direklere biraz daha fazla kuvvet uyguladıklarını ortaya koymaktadır.Metastatik hücre hattı M 132 ve agresif hücre tipi ise karakteristik olarak daha az mikro direğe tutunur ve mikro direk başına daha az kuvvet uygular. Bu prosedür gerçekleştirilirken, pipetleme işleminin çok dikkatli yapılması ve asla doğrudan mikro direk dizisinin üzerine ekleme yapılmaması önemlidir. Mikro direklerin çökmesine neden oldukları için hava kabarcığı oluşumundan kaçınılmalıdır.Bu videoyu izledikten sonra, mesh profile yazılımımızla birlikte mikro post dizileri kullanarak izole tek hücrelerden nasıl biyolojik bilgi çıkarılacağı konusunda iyi bir anlayışa sahip olmalısınız. Sonuçlarınızın keyfini çıkarın.

easy-and-accurate-mechano-profiling-on-micropost-arrays

Research

JoVE Journal

Bioengineering

Biyomühendislik

Bu video, hücresel kontraktilite modülasyon değerlendirmek için microfabricated sonrası dizi dedektörleri (mPADs) imal ve nasıl kullanılacağını göstermektedir.

Microfabricated Post-Dizi-Dedektörleri (mPADs): Mekanik Kuvvetleri yalıtın bir Yaklaşım

Thermo Scientific Matrix çok kanallı pipet ile el gibi bir robot kullanarak qPCR için 96-iyi dizileri Biz ön microRNA kurulum ve analiz gösterecektir.

Kantitatif Gerçek-zamanlı PCR (qPCR) Diziler kullanarak Pre-mikro RNA&#39;lar ve microRNA, Profilleme

Bir çip üzerinde fotopolimerizasyon tekniği kullanılarak bir polimer mikro oluşumu açıklaması. Atomik kuvvet mikroskobu, temas açısı ölçümleri, X-ışını fotoelektron spektroskopisi ve uçuş ikincil iyon kütle spektrometresi ve hücre bağlanma testinin zaman kullanarak yüksek aktarım yüzey karakterizasyonu da açıklanmıştır.

Biyomalzemelerin Yüksek Verimli Discovery için Polimer Mikroarray&#39;ler

Bu makale ayrıntıları Multiplex microneedle tabanlı sensör yapımı. Aygıt bir hızlı ve seçici bir şekilde birden fazla analitlerin in situ numune alma ve elektrokimyasal analizi için geliştirilmektedir. Biz klinik tıp tasavvur ve biyomedikal araştırmalar, bu microneedle tabanlı sensörler için kullanır.

Multiplexed Transdermal Elektrokimyasal Algılama Hollow microneedle tabanlı Sensör

Hücresel fonksiyonları üzerinde mikro moleküler bileşim etkileri ilgili bilgi sağlamak için bir kombinatoryal fonksiyonel tarama yöntemi tarif edilmektedir. Yöntemi hücre yapışması ve fonksiyonel analiz destekleyen tanımlı Kombinatoryal mikroçevrelerde diziler oluşturmak için varolan mikroarray tabanlı teknolojileri yararlanır.

Fabrikasyon ve mikroçevresindeki microarrays Kullanımı (MEArrays)

Bu video, histon peptitleri üzerindeki translasyon sonrası modifikasyonları (PTM'ler) tanıyan antikorların özgüllüğünü profillemek için peptit mikrodizi teknolojisini uygulayan bir tekniği göstermektedir. Bilinen PTM kombinasyonlarına sahip hareketsizleştirilmiş florofor konjuge histon peptitleri içeren bir mikrodizi slaytı, hedef PTM'ye özgü antikorlarla muamele edilir. Bu işlem, antikorun hedef için özgüllüğünü ve hedef olmayan PTM'lerle potansiyel çapraz reaktivitesini tanımlamaya yardımcı...

Antikorların Özgüllük Profili için Bir Peptit Mikroarray Teknolojisi

Bu el yazması karmaşık yüksek maliyetli İmkanları için gerek kalmadan içbükey microwells imalatı, sağlam bir yöntem sunar. Manyetik kuvvet, çelik boncuk ve bir delik aracılığıyla dizi kullanarak, birkaç yüz microwells 3 cm x 3 cm polydimethylsiloxane (PDMS) substrat kuruldu.

Eşleştirilmiş boncuk ve mıknatıs dizi Microwells değişken içbükey geometrileri ile kalıplama için

Burada için geniş alan tarama prob nanolithography sonda diziler yinelemeli hizalama gibi hücre yüzeyine etkileşim çalışmaları için taş desen kullanımı tarafından etkinleştirilmiş bir iletişim kuralı mevcut.

Otomatik hizalama ve substrat imalat hücre kültür araştırmaları için uygulama tarafından kolaylaştırdı geniş alan tarama prob Nanolithography

Bu makalede, bir Multiplexed yapay hücresel MicroEnvironment (MACME) dizi taklit eden vivo içinde hücresel microenvironments fiziksel ve kimyasal yüksek üretilen iş manipülasyonu ipuçları ve için hazırlamak için ayrıntılı metodolojisi insan pluripotent kök hücreler (hPSCs) için en iyi hücresel ortam tek hücreli profil oluşturma ile tanımlayın.

Çoğaltılmış yapay hücresel MicroEnvironment dizi imalatı

Burada sunulan, mekano-düğüm-gözenek algılama (mekano-NPS) adı verilen elektronik tabanlı bir mikroakışkan platform kullanarak tek hücreleri mekanik olarak fenotiplemek için bir yöntemdir. Bu platform, hücrelerin hem elastik hem de viskoz biyofiziksel özelliklerini ölçerken 1-10 hücre / s'nin ılımlı verimini korur.

Mekano-Düğüm-Gözenek Algılama: Çok Parametreli Tek Hücreli Viskoelastik Ölçümler için Hızlı, Etiketsiz Bir Platform

Nano ölçekli çözünürlüğe sahip büyük ölçekli numune incelemesi, özellikle nanofabrikasyon yarı iletken gofretler için geniş bir uygulama alanına sahiptir. Atomik kuvvet mikroskopları bu amaç için harika bir araç olabilir, ancak görüntüleme hızları ile sınırlıdır. Bu çalışma, yüksek verimli ve büyük ölçekli denetimler sağlamak için AFM'lerde paralel aktif konsol dizilerini kullanır.

Yüksek Verimli Büyük Ölçekli Numune Denetimi için Quattro-Paralel Konsol Dizileri ile Aktif Prob Atomik Kuvvet Mikroskobu

Öğrenin, mikro gönderi dizileri ve MechProfiler yazılımı kullanarak tek hücrelerden mekanobiyolojik özellikleri nasıl çıkaracağınızı. Bu yöntem, standart ışık mikroskobisiyle kanser hücrelerinin metastaz davranışlarını yüksek verimlilikte araştırmanıza olanak tanır.

Micropost Diziler Kolay ve Doğru Mekanik-profil

Daha fazla video keşfet