Name: Hücre içi Komşu maruz kalan hücreler, apoptotik hücre ölümü ile etkileşim yoluyla canlı hücreler İndüklenen sinyal olaylarının tanımlanması (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-12-27T13:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 18 s
Description: Öğrenin, BUNPT hücreleri kullanarak apoptotik hücrelerle fiziksel etkileşim sonrası canlı yanıt veren hücrelerde sinyal olaylarını nasıl tanımlayacağınızı. Bu yöntem hücre biyolojisi ve patoloji alanlarında ölü hücrelerin canlı komşuları üzerindeki etkisini incelemek için kullanılır.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu çalışma, kısmen veya tamamen, Dr. José A. Arruda ve Chicago'daki Illinois Üniversitesi Nefroloji Bölümü'nden (J. S. L.'ye) ve McGill Üniversitesi Tıp Bölümü ve McGill Üniversitesi Sağlık Merkezi Araştırma Enstitüsü'nden (J. R.'ye) sağlanan fonlarla desteklenmiştir.

1. hazırlıklar Not: Bu protokol, iki ya da daha fazla hücre hattında ya da birincil hücre kültürleri içinde, bağımsız bir şekilde, belirli koşullar altında hazırlanır. Bu preparatlar, apoptotik hücrelerin (Protokol 1), nekrotik hücre (Protokol 2) ve sağlıklı bir cevap veren hücreler (Protokol 3) içerir. bağımsız olarak hazırlanması sonra apoptotik ya da nekrotik hücre cevap hücrelere ilave edilir ve sonuçta elde edilen sinyal transdüksiyon (Protokoller 4, 5, ve 6) kontrol edilmektedir. <ol><li> Kültür ortamı ve reaktifler hazırlayın <ol><li> , 110 1x Dulbecco Modifiye Eagle Ortamı (DMEM) 4.5 g / L glikoz, 584 mg / L ʟ-glutamin (permisif koşullar altında büyüyen hücreleri zaman, kullanıcı için bölüm 1.2), 500 ml kültür ortamı bir hazırlama şu birleştirerek mg / L sodyum piruvat, 100 birim / ml penisilin-streptomisin,% 10 (h / h) cenin sığır serumu (FBS) ve 10 birim / interferon-γ (IFN-y) çözeltisi. </li><li> kullanım wh için kültür ortamı B 500 mL (hazırlayınnon-permisif koşullar altında serum açlıktan hücreleri tr, önceki serum açlık non-permisif koşullar altında (hücreleri büyümek için kültür ortamı A.) bir tarifi FBS ve IFN-y atlayarak bölüm 1.2) bakın,% 10 v ekleyin kültür ortamı B. / h FBS </li><li> Ölü hücrelerin tespit için% 4 paraformaldehid hazır gelen 1x Dulbecco fosfat tamponlu tuzlu su (DPBS) içinde,% 0.4 (h / h) paraformaldehit, pH 7.2 hazırlanır. Not: Paraformaldehyde toksik ve uygun uyarı kullanımı konusunda dikkatli olunmalıdır. </li></ol></li><li> Kültür BU.MPT hücreleri <ol><li> Sıvı nitrojenden BU.MPT hücrelerin bir şişe çözülme. Not: BU.MPT büyük fare kontrolü altında SV40 büyük tümör antijeni (TAg) &#39;in bir sıcaklığa duyarlı (ts) mutasyon (tsA58) taşıyan bir transgenik fare türetilmiş bir fare böbreği proksimal tübül epitel hücre (PTEC) çizgi doku uygunluk kompleksi (MHC) H-2K b class I 25,26 promotör. </li><li> Steril polystyr plaka hücreleriene vakum gaz plazma tedavi doku kültürü yemekleri (~ 5 x 10 6 hücre 100 mm çaplı tabak başına). </li><li> Nemlendirilmiş bir% 5 (h / h) CO2 atmosfer izin veren koşullar altında hücrelerin büyütün. Not: 33, kültür olarak tanımlanır izin veren koşullar, - IFN-y varlığında, 37 ° C, tsA58 mutasyonlu TAg transgenin stabil ifadesini sağlar. hoşgörülü koşullar süresiz pasajlanır edilebilir altında tek bir geçit ya da iki daha fazla hayatta olmayan fare böbrek PTEC primer kültürlerinde, aksine, BU.MPT kültüre. <ol><li> Bir deneyde kullanmadan önce çözdürme sonrası Passage hücreleri en az üç kez. <ol><li> Geçiş hücreleri için, 5 dakika için 37 ° C &#39;de (h / h) CO2 atmosferi nemlendirilmiş% 5, 100 mm tabak başına% 0.05 tripsin 1 ml ve inkübe edilir. 10 ml orta A. aspire müstakil hücreler ekleyerek tripsin nötralize ve 1 bölmek: Yeni 100 mm steril polistiren vakum gaz plazma tedavi Tiss içine 5: 1 3ue kültür yemekleri. Her 100 mm tabak için 10 mL toplam hacim getirmek için ortam bir ekleyin. </li></ol></li></ol></li><li> Hücrelerin yanıt deney kullanım için hazırlık olarak, non-permisif koşullar altında nemlendirilmiş bir% 5 birbirine karışacak şekilde hücrelerin (h / h) CO2 atmosferi büyür (yani, IFN-y ve yokluğunda 39 ° C &#39;de [ortam B,% 10 v ihtiva eden / hac FBS]). Not: non-permisif koşullar altında, tsA58 mutasyonlu TAg transgenin ekspresyonu&gt;% 95 oranında inhibe edilir ve BU.MPT hücreleri, fare böbreği PTEC primer kültürlerinde gibi davranırlar. </li></ol></li></ol> Apopitotik BU.MPT Hücreler 2. Hazırlık (Protokol 1) Not: Bu protokol, apoptoz indüksiyonu yöntemi olarak apoptotik hücrelerin kaynağı ve staurosporin olarak BU.MPT hücreleri için özeldir. Seçenek olarak ise, bir başka hücre hattı veya birincil hücre kültürü, standart Protoco neden olduğu apoptozi ile apoptotik hücre kaynağı olarak kullanılabilmektedirapoptoz indüksiyonu, belirli bir hücre tipi ve yönteme mi. <ol><li> 100 mm çapında, steril polistiren vakum gaz plazma muamele edilmiş doku kültürü çanakları üzerine geçtikten sonra, BU.MPT Hücreler, nemli% 5 bir toplak izin veren koşullar altında (h / h) CO2 atmosferi büyümeye (yani kültür ortamı A 37 ° C&#39;de bölüm 1.2.3&#39;de tarif edildiği gibi, 100 mm tabak için 10 mL). </li><li> yapışık hücre tek tabaka durulama için 10 mL kullanılarak kültür ortamı B ile üç kez yıkayın. </li><li> 37 ° C &#39;de (h / h) CO, nemlendirilmiş% 5, 3 saat boyunca 1 ug / ml, 2 atmosfer staurosporin, seçici olmayan bir protein kinaz inhibitörü ihtiva eden kültür ortamı B hücreleri inkübe edilerek apoptosis. </li><li> tek tabaka müstakil &quot;yüzen&quot; apoptotik hücreler içeren staurosporin içeren orta aspire. Santrifüj 500 xg&#39;de 10 dakika boyunca, bu ortam, süpernatantı atmak pelet kültür ortamı B ile üç kez yıkanır, veBir sonraki adımda, 2,5 toplanan hücrelere geri pelet ekleyin. </li><li> 5 mM (etilendiamintetraasetik asit) 1 x Ca EDTA ilave edilerek adım 2.3 ve 2.4 arasında kalan yapışkan hücreleri ayırmak 2 + - ve Mg, 5 dakika süreyle etiketlenir 1 mL, 2 + içermeyen DPBS. müstakil apoptotik hücreler içeren EDTA içeren ortam aspire ve steril bir 15 ml santrifüj tüpüne polistiren adım 2.4 &quot;yüzen&quot; apoptotik hücreler müstakil hücreleri havuz. </li><li> Ve Mg + 2 yıkama başına içermeyen DPBS - 10 ml 1x Ca + 2 10 500 xg&#39;de dk ve tabanda için apoptotik hücreleri santrifüj yoluyla üç kez yıkayın. </li><li> Son yıkamadan sonra, cevap veren hücreler uyarmak için kullanımdan önce mL başına yaklaşık 5 x 10 6 hücre taze kültür ortamı B apoptotik hücrelerin süspansiyonu. Seçenek olarak ise, 30 dakika boyunca 1 x DPBS% 0.4 (h / h) paraformaldehid yıkandı apoptotik hücrelerin tespit ve kültür ile üç kez yıkamakKültür ortamı B içinde askıya alınmadan önce ortam B, </li><li> Uygun olarak, apoptotik hücrelerin ayrı hazırlanmasını kullanarak sitometrisi (ya da bu amaç için bazı hücreler ayırarak), daha önce tarif edildiği gibi 6,9,10,15, akış apoptosis teyit etmektedir. Not: erken apoptotik hücre sağlam hücre zarları, ve propidyum iyodür (PI) gibi görünür artı ve anneksin V-pozitif hücreler (canlı hücrelere göre) hücre boyutuna azalmıştır. Mesai apoptotik hücre dışı sağlam hücre zarları, ve PI-pozitif ve anneksin V-pozitif hücreler, hücre boyutu azalmıştır olarak görünür. Geçerli protokolünü kullanarak tipik hazırlıkları ~ 85% erken apoptotik ve ~% 15 geç apoptotik hücreler içerir. </li><li> ya doğrudan ya da% 0.4 1x DPBS (h / h) paraformaldehid ile, 30 dakika boyunca apoptotik hücrelerin tespit sonra 1: 1 arasında bir apoptotik-to-yanıtlayıcı hücre oranında, cevap veren hücreler (Protokol 3) BU.MPT apoptotik hücrelerin ekleme . Not: Apoptotik hücre tespit önceki yanıt uyarılmasına gerekirgözlenen sinyal olayları çözülebilir bir arabulucu (Tablo 1) salınmasına bağlı olmadıkça değil, sonuçları etkileyebilir. </li></ol> Nekrotik BU.MPT Hücreler 3. Hazırlama (Protokol 2) Not: Bu protokol, nekroz indüksiyon yöntemi olarak nekrotik hücre kaynağı, ve ısıtma gibi BU.MPT hücreleri için özeldir. Seçenek olarak ise, bir başka hücre hattı veya birincil hücre kültürü, nekroz indüksiyonunun bu özel hücre tipine ve yönteme standart protokollerle neden olduğu nekrozu ile nekrotik hücre kaynağı olarak kullanılabilir. <ol><li> 100 mm çapında, steril polistiren vakum gaz plazma muamele edilmiş doku kültürü çanakları üzerine geçtikten sonra, BU.MPT Hücreler, nemli% 5 bir toplak izin veren koşullar altında (h / h) CO2 atmosferi büyümeye (yani kültür ortamı A 37 ° C&#39;de bölüm 1.2.3&#39;de tarif edildiği gibi kap başına 10 mL). </li><li> , Yapışık hücre tek tabaka kültür ortamı B ile üç kez yıkayın kullanarakdurulama için 10 mL. </li><li> Ve Mg + 2, 5 dakika süreyle etiketlenir 1 mL içermeyen DPBS - 1x Ca + 2 5 mM EDTA ilave edilerek hücreler ayırın. Ayrılan hücreler içeren EDTA içeren ortam aspire ve steril bir 15 ml santrifüj tüpüne polistiren hücre süspansiyonu ekleyin. </li><li> Ve Mg + 2, yıkama başına içermeyen DPBS - Ca + 2 10 mL, 10 500 x g&#39;de dakika ve yeniden süspansiyon için hücreler santrifüj ile üç kez yıkayın. </li><li> Son yıkamadan sonra, mL başına yaklaşık 5 x 10 6 hücre taze kültür ortamı B hücreleri askıya. </li><li> yavaşça hücre süspansiyonu her 10 dakika süre ile girdap, bir su banyosu içinde 45 dakika boyunca 70 ° C &#39;hücreleri ısıtılarak nekroza neden. </li><li> 37 ° C&#39;de (h / h) CO2 atmosferi nemlendirilmiş% 5, 2 saat boyunca inkübe hücreleri. Yavaşça hücre süspansiyonu, her 15 dakikada bir vorteks. </li><li> Uygun olarak, KD ayrı bir hazırlık kullanarak flow sitometri ile nekroz indüksiyon onaylamakcrotic hücreleri (veya bu amaçla bazı hücrelerin ayırarak), daha önce 6,9,10,15 nitelendirdi. Nekrotik hücreler, hücre zarlar açılmış ve (canlı hücrelere göre) hücre boyut artışı PI-pozitif hücreler olarak görünür: edin. Geçerli protokolünü kullanarak tipik hazırlıkları ≥% 95 nekrotik hücreler içerir. Seçenek olarak ise, nekroz ve membran bütünlüğü kaybı indüksiyonu Tripan mavi boyanması yolu ile teyit edilebilir. </li></ol> BU.MPT tepki veren hücre 4. hazırlanması (Protokol 3) Not: Bu protokol, cevap veren hücreler kaynağı olarak BU.MPT hücreleri için özeldir. Seçenek olarak ise, bir başka hücre hattı veya birincil hücre kültürü, cevap veren hücreler olarak da kullanılabilir. Deneysel kullanmadan önce, sessizlik laboratuvar içinde standardize protokoller tarafından bir gecede uyarılan edilebilir. <ol><li> bu elde edene kadar ~ çanak başına 10 mL kültür ortamı A izin veren koşullar altında steril 100 mm doku kültürü çanakları içinde BU.MPT hücreleri büyümek% 85 izdiham. </li><li> Aspire kültür ortamı A ve durulama başına 10 mL hücreleri kültür ortamı B ile üç kez yıkayın. Nemli bir% 5 18 ila 24 saat boyunca bir gece boyunca non-permisif koşullar altında (h / h) CO2 atmosferi hücreler serum açlıktan (örneğin çanak başına 10 mL 39 ° C kültürü ortamı b) Bölüm 1.2&#39;de tarif edildiği gibi, 0,4, sırayla sessizliğini ikna etmek. Seçenek olarak ise, FBS&#39;siz gece boyunca kültür ortamı B serum açlık hücreler bir gün önce 39 ° C &#39;de kültür ortamı B ve% 10 (h / h) FBS hücreleri büyür. </li><li> Her bir deney koşulu için konfluent BU.MPT hücreleri ayrı bir doku kültürü çanağı etiketleyin. </li><li> Resim hücreler, apoptotik hücrelerin ya da nekrotik hücrelerden 30 dakika boyunca kendi maruz kaldıktan sonra, 15 dakika boyunca, ya araç ya da epidermal büyüme faktörü (EGF) ile uygun bir BU.MPT yanıt uyarılmasını, aşağıdaki altı koşulları içerir. Not: ölü hücrelerin maruz uyarmak veya bir GI aktivite seviyesini önleyen, yaven molekülünü sinyalizasyon. Uyarım en düşük taban üzerinde tespit edilir (örneğin, EGF yokluğu), inhibisyon en yüksek başlangıçtan itibaren tespit edilir ise (örneğin, EGF varlığı). Ölü hücreleri ile uyarma etkisi a priori bilinmeyen olduğu için, ve yokluğunda, EGF varlığında hem de tüm çalışmalar yapılması önerilmektedir. </li></ol> Apoptotik ve nekrotik hücreler (Protokolün 4) ile Cevapçi hücrelerinin 5. Stimülasyon <ol><li> durgun önceden etiketlenmiş yemekler aspire kültür ortamı B (serum hasret) BU.MPT yanıtlayıcı hücreleri (Protokolü 3). Not: non-permisif koşullar altında gecede kültür, BU.MPT hücreleri, fare böbrek PTEC primer kültürlerinde gibi davranması gerektiğini sonra. </li><li> 100 mm tabak başına, aşağıdakilerden biri 2 mL ekleyin: kültür ortamı B (hücre yok); Kültür ortamı B mL başına yaklaşık 5 x 10 6 hücre (Protokol 1) en apoptotik hücre süspansiyonu; ml i başına ya da nekrotik hücre süspansiyonu ~ 5 x 10 6 hücren kültür ortamı B (Protokol 2). <ol><li> eşit 100 mm tabak üzerinde ölü hücrelerden 2 ml süspansiyon dağıtmak ve onları minimuma yerleşmek için zaman tutun. Bunu başarmak için, cevaplayıcı hücre yemekleri tüm yüzey üzerinde geniş bir uç pipet ile damla ölü hücre süspansiyonu damla dağıtın. yerleşme zamanı en aza indirilmesi ve ölü hücrelerin topaklanma kaçınarak arasında bir uzlaşma olarak 2 mL hacmi kullanın. Not: ölü hücre süspansiyonunun kullanımı bir uyarıcı daha ayrıntılı (Tablo 2 ve Tartışma) aşağıda açıklanan özel durumlar, bir dizi gerektirir gibi. </li><li> ~ 10 x 10 6 hücre içeren bir birleşik 100 mm tabak e mL başına yaklaşık 5 x 10 6 hücre ölü hücrelerin 2 mL eklenerek 1: ~ 1 bir ölü için yanıtlayıcı hücre oranı elde edin. Seçenek olarak ise, gözlenen herhangi bir sinyal olayını doza bağlılığı tespit etmek için, kült ilerleyici seyreltme ile sürekli cevap veren hücreler ölü oranı değişebilirProtokoller 1 ve 2&#39;de hazırlanan ölü hücre süspansiyonları ure ortam B. </li></ol></li><li> Yavaşça, nemlendirilmiş% 5 (h / h) CO2 atmosferinde 37 ° C&#39;de inkübe yemekler girdap. </li><li> 30 dakika sonra, kültür çanağı ön etiketleme, uygun, araç veya 50 nM EGF ile ya cevap veren hücreler uyarır. </li><li> Nemlendirilmiş bir% 5 (h / h) CO2 atmosferinde 37 ° C&#39;de 15 dakika boyunca inkübe edin. </li><li> , Buz gibi soğuk 1x DPBS 5 ml ekleyerek çanak dönen ve yıkama sıvısı aspire ölü hücreleri yıkayacak. üç kez tekrarlayın. </li><li> Hemen daha sonraki işlemler için buz üzerinde cevaplayıcı hücre yemekleri yerleştirin. </li><li> Hücre lizatları hazırlanması <ol><li> Aşağıdakileri içeren hücre liziz tamponu: 1 × Tris tuz (TBS), 10 mM sodyum pirofosfat,% 0.5 w / v deoksikolat / h SDS,% 10 gliserol, ve 25 mM sodyum fluorür% 0.1 tamponlu. <ol><li> , Lizis hücre ind verilen kesin sırayla aşağıdaki eklemek hemen öncegili konsantrasyonları: Mini EDTA&#39;sız proteaz inhibitör kokteyli (1 tablet 10 liziz tamponunda mL başına),% 10 (h / h) Triton X-100, 1 mM ditiotreitol (DTT), 1mM fenilmetansülfonil florit (PMSF), ve 10 mM sodyum ortovanadat. </li></ol></li><li> Adım 5.7 buz üzerinde taze uyarılmış cevap veren hücreler 100 mm tabak başına buz gibi soğuk hücre lizis tamponu 700 mcL ekleyin. Bir hücre kazıyıcı ile hücreler Pençe ve 1.5 mL mikrotüpler pre-soğuk lizat aktarın. 15 dakika boyunca buz üzerinde tüpler koruyun. </li><li> 20 Hz, süresi bir saniyeden daha kısa her biri 10 darbeleri ile buz üzerinde sonikasyon lizatları. Bu örnekleri aşırı ısınmasına gibi, gaz / sıvı arayüzünde köpük oluşturma kaçının. Tamamen üzerinde sonikatör açmadan önce lizatları içeren mikrotüpler içine sonikatör probu batırmak ve lizatları probu çıkarmadan önce sonikatör kapatın. </li><li> 4 ° C&#39;de 10 dakika boyunca 20,000 x g&#39;de santrifüj, taze, önceden soğutulmuş mikrotüpler içine süpernatantlar aktarınVe mağaza -70 ° C&#39;de ºC. </li><li> Daha önce tarif edildiği gibi 6,9,10,15, lizatlarının yüzen üzerinde jel elektroforezi ve immunoblotting gerçekleştirin. </li></ol></li></ol> 6. Yarı geçirgen polikarbonat membran kullanılarak Hedefler ve Müdahale arasında doğrudan fiziksel temas önleme (Protokol 5) <ol><li> bir istisna dışında, Protokole 3&#39;e göre BU.MPT yanıtlayıcı hücrelerin hazırlayın; steril polistiren doku kültürü içindeki hücreler büyümeye 12 oyuklu küme işlemden geçirildi. </li><li> Seçilen kuyularda, ölü ve cevap veren hücreler arasındaki fiziksel etkileşimi önlemek için 0.4 mikron polikarbonat membran içeren bir geçirgen destek sistemi yerleştirin. Aynı deneyde, bir membran olmayan kontrol kuyuları içerir. </li><li> Serum hasret BU.MPT cevap veren hücreler deneysel kuyulardan aspire kültür ortamı B. </li><li> şu değişiklikler ya apoptotik ya da nekrotik hücre ile tepki veren hücre uyarılması için Protokol 4 uygulayın: <ol><li> Oyuk başına 12-oyuklu küme aşağıdakilerden biri 0.1 mL ekleyin: kültür ortamı B (hücre yok); Kültür ortamı B mL başına yaklaşık 5 x 10 6 hücre (Protokol 1) en apoptotik hücre süspansiyonu; ya da nekrotik hücre süspansiyonu kültür ortamı B mL başına yaklaşık 5 x 10 6 hücre (Protokol 2), en. Not: 12 oyuklu küme konfluent de içerdiğinden ± 0.5 x 10 6 hücre, ~ ölü hücrelerin 0.1 mL ilave ML başına 5 x 10 6 hücre bir ölü için yanıtlayıcı hücre oranı ~ verir 1: 1. </li><li> geçirgen destek sistemi içeren kuyulara, geçirgen destek sistemi içinde 0.4 mikron polikarbonat membran üstüne ölü hücreleri eklemek, böylece ölü ve cevap veren hücreler arasında doğrudan bir fiziksel etkileşim vardır. </li></ol></li></ol> Sitokalasin D Fagositoz 7. Önleme (Protokol 6) <ol><li> Protokol 3&#39;e göre BU.MPT cevap veren hücreler hazırlayın. </li><li> dimetilpropil olarak iskelet inhibitörü cytochalasin D hazırlayınil sülfoksit 4 mg / mL (1.000 x) (DMSO). BU.MPT tepki veren hücre için önceden işaretlenmiş bulaşık ilave ya da aracın 10 uL (DMSO) veya sitokalasin D 10 uL kültür ortamı B 10 mL 4 ug / mL&#39;lik bir nihai konsantrasyona ulaşmak için Not: BU.MPT hücre ve makrofaj hücre hattı ile sitokalasin D, fagositoz Bu konsantrasyonda ≥90% 9,10 ile inhibe edilmiştir. </li><li> Nemlendirilmiş bir% 5 (h / h) CO2 atmosferinde 37 ° C &#39;de 2 saat süre ile inkübe edilir. </li><li> apoptotik ya da nekrotik hücreler ile cevap veren hücreler uyarılması için Protokol 4 izleyin. </li><li> Daha önce tarif edildiği gibi, 9,10, uygun olarak, (bu amaç için ayrılmıştır veya hücre) ve ölü cevap veren hücreler, ayrı bir preparasyonu kullanılarak akış sitometrisi ile ölü hücrelerin fagositozu inhibisyonunu teyit etmektedir. </li></ol>

<ol><li>Galluzzi, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Essential+versus+accessory+aspects+of+cell+death%3A+recommendations+of+the+NCCD+2015%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Death+Differ%22%5BJournal%5D)">Essential versus accessory aspects of cell death: recommendations of the NCCD 2015.</a> Cell Death Differ. 22, 58-73 (2015).</li>
<li>Wallach, D., Kang, T. -B., Kovalenko, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Concepts+of+tissue+injury+and+cell+death+in+inflammation%3A+a+historical+perspective%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Rev.+Immunol%22%5BJournal%5D)">Concepts of tissue injury and cell death in inflammation: a historical perspective.</a> Nature Rev. Immunol. 14, 51-59 (2014).</li>
<li>Hochreiter-Hufford, A., Ravichandran, K. S. Clearing the dead: Apoptotic cell sensing, recognition, engulfment, and digestion. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aHochreiter-Hufford%2C+A+%22Cold+Spring+Harb.+Perspect.+Biol%22">Cold Spring Harb. Perspect. Biol</a>. 5, a008748(2013).</li>
<li>Reddy, S. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phagocytosis+of+apoptotic+cells+by+macrophages+induces+novel+signaling+events+leading+to+cytokine-independent+survival+and+inhibition+of+proliferation%3A+activation+of+Akt+and+inhibition+of+extracellular+signal-regulated+kinases+1+and+2%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Immunol%22%5BJournal%5D)">Phagocytosis of apoptotic cells by macrophages induces novel signaling events leading to cytokine-independent survival and inhibition of proliferation: activation of Akt and inhibition of extracellular signal-regulated kinases 1 and 2.</a> J. Immunol. 169, 702-713 (2002).</li>
<li>Cvetanovic, M., Ucker, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Innate+immune+discrimination+of+apoptotic+cells%3A+repression+of+proinflammatory+macrophage+transcription+is+coupled+directly+to+specific+recognition%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Immunol%22%5BJournal%5D)">Innate immune discrimination of apoptotic cells: repression of proinflammatory macrophage transcription is coupled directly to specific recognition.</a> J. Immunol. 172, 880-889 (2004).</li>
<li>Patel, V. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Apoptotic+cells%2C+at+all+stages+of+the+death+process%2C+trigger+characteristic+signaling+events+that+are+divergent+from+and+dominant+over+those+triggered+by+necrotic+cells%3A+implications+for+the+delayed+clearance+model+of+autoimmunity%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Biol.+Chem%22%5BJournal%5D)">Apoptotic cells, at all stages of the death process, trigger characteristic signaling events that are divergent from and dominant over those triggered by necrotic cells: implications for the delayed clearance model of autoimmunity.</a> J. Biol. Chem. 281, 4663-4670 (2006).</li>
<li>Cvetanovic, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Specific+recognition+of+apoptotic+cells+reveals+a+ubiquitous+and+unconventional+innate+immunity%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Biol.+Chem%22%5BJournal%5D)">Specific recognition of apoptotic cells reveals a ubiquitous and unconventional innate immunity.</a> J. Biol. Chem. 281, 20055-20067 (2006).</li>
<li>Birge, R. B., Ucker, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Innate+apoptotic+immunity%3A+the+calming+touch+of+death%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Death+Differ%22%5BJournal%5D)">Innate apoptotic immunity: the calming touch of death.</a> Cell Death Differ. 15, 1096-1102 (2008).</li>
<li>Patel, V. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recognition+of+apoptotic+cells+by+epithelial+cells%3A+conserved+versus+tissue-specific+signaling+responses%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Biol.+Chem%22%5BJournal%5D)">Recognition of apoptotic cells by epithelial cells: conserved versus tissue-specific signaling responses.</a> J. Biol. Chem. 285, 1829-1840 (2010).</li>
<li>Patel, V. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recognition-dependent+signaling+events+in+response+to+apoptotic+targets+inhibit+epithelial+cell+viability+by+multiple+mechanisms%3A+implications+for+non-immune+tissue+homeostasis%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Biol.+Chem%22%5BJournal%5D)">Recognition-dependent signaling events in response to apoptotic targets inhibit epithelial cell viability by multiple mechanisms: implications for non-immune tissue homeostasis.</a> J. Biol. Chem. 287, 13761-13777 (2012).</li>
<li>Voll, R. E., Herrmann, M., Roth, E. A., Stach, C., Kalden, J. R., Girkontaite, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Immunosuppressive+effects+of+apoptotic+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Immunosuppressive effects of apoptotic cells.</a> Nature. 390, 350-351 (1997).</li>
<li>Fadok, V. A., Bratton, D. L., Konowal, A., Freed, P. W., Westcott, J. Y., Henson, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Macrophages+that+have+ingested+apoptotic+cells+in+vitro+inhibit+proinflammatory+cytokine+production+through+autocrine%2F+paracrine+mechanisms+involving+TGF-%CE%B2%2C+PGE2%2C+and+PAF%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Clin.+Investig%22%5BJournal%5D)">Macrophages that have ingested apoptotic cells in vitro inhibit proinflammatory cytokine production through autocrine/ paracrine mechanisms involving TGF-β, PGE2, and PAF.</a> J. Clin. Investig. 101, 890-898 (1998).</li>
<li>Lucas, M., Stuart, L. M., Savill, J., Lacy-Hulbert, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Apoptotic+cells+and+innate+immune+stimuli+combine+to+regulate+macrophage+cytokine+secretion%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Immunol%22%5BJournal%5D)">Apoptotic cells and innate immune stimuli combine to regulate macrophage cytokine secretion.</a> J. Immunol. 171, 2610-2615 (2003).</li>
<li>Ariel, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Apoptotic+neutrophils+and+T+cells+sequester+chemokines+during+immune+response+resolution+through+modulation+of+CCR5+expression%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Immunol%22%5BJournal%5D)">Apoptotic neutrophils and T cells sequester chemokines during immune response resolution through modulation of CCR5 expression.</a> Nature Immunol. 7 (11), 1209-1216 (2006).</li>
<li>Schwab, J. M., Chiang, N., Arita, M., Serhan, C. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Resolvin+E1+and+protectin+D1+activate+inflammation-resolution+programmes%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Resolvin E1 and protectin D1 activate inflammation-resolution programmes.</a> Nature. 447, 869-874 (2007).</li>
<li>Rothlin, C. V., Ghosh, S., Zuniga, E. I., Oldstone, M. B. A., Lemke, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((TAM+receptors+are+pleiotropic+inhibitors+of+the+innate+immune+response%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">TAM receptors are pleiotropic inhibitors of the innate immune response.</a> Cell. 131, 1124-1136 (2007).</li>
<li>Li, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Apoptotic+cells+can+activate+the+%22phoenix+rising%22+pathway+to+promote+wound+healing+and+tissue+regeneration%5BTitle%5D)+AND+%22Sci.+Signal%22%5BJournal%5D)">Apoptotic cells can activate the "phoenix rising" pathway to promote wound healing and tissue regeneration.</a> Sci. Signal. 3, ra13(2010).</li>
<li>Peter, C., Wesselborg, S., Hermann, M., Lauber, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dangerous+attraction%3A+phagocyte+recruitment+and+danger+signals+of+apoptotic+and+necrotic+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Apoptosis%22%5BJournal%5D)">Dangerous attraction: phagocyte recruitment and danger signals of apoptotic and necrotic cells.</a> Apoptosis. 15 (2010), 1007-1028 (2010).</li>
<li>Patel, V. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Apoptotic+cells+activate+AMPK+and+inhibit+epithelial+cell+growth+without+change+in+intracellular+energy+stores%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Biol.+Chem%22%5BJournal%5D)">Apoptotic cells activate AMPK and inhibit epithelial cell growth without change in intracellular energy stores.</a> J. Biol. Chem. 290, 22352-22369 (2015).</li>
<li>Hess, K. L., Tudor, K. -S. R. S., Johnson, J. D., Osati-Ashtiani, F., Askew, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cook-Mills+J.M.+Human+and+murine+high+endothelial+venule+cells+phagocytose+apoptotic+leukocytes%5BTitle%5D)+AND+%22Exp.+Cell+Res%22%5BJournal%5D)">Cook-Mills J.M. Human and murine high endothelial venule cells phagocytose apoptotic leukocytes.</a> Exp. Cell Res. 236, 404-411 (1997).</li>
<li>Zernecke, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Delivery+of+microRNA-126+by+apoptotic+bodies+induces+CXCL12-dependent+vascular+protection%5BTitle%5D)+AND+%22Sci.+Signal%22%5BJournal%5D)">Delivery of microRNA-126 by apoptotic bodies induces CXCL12-dependent vascular protection.</a> Sci. Signal. 2, ra51(2009).</li>
<li>Esmann, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phagocytosis+of+apoptotic+cells+by+neutrophil+granulocytes%3A+diminished+proinflammatory+neutrophil+functions+in+the+presence+of+apoptotic+cells%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Immunol%22%5BJournal%5D)">Phagocytosis of apoptotic cells by neutrophil granulocytes: diminished proinflammatory neutrophil functions in the presence of apoptotic cells.</a> J. Immunol. 184, 391-400 (2010).</li>
<li>Obeid, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Calreticulin+exposure+dictates+the+immunogenicity+of+cancer+cell+death%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Med%22%5BJournal%5D)">Calreticulin exposure dictates the immunogenicity of cancer cell death.</a> Nature Med. 13, 54-61 (2007).</li>
<li>Peter, C., Wesselborg, S., Hermann, M., Lauber, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dangerous+attraction%3A+phagocyte+recruitment+and+danger+signals+of+apoptotic+and+necrotic+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Apoptosis%22%5BJournal%5D)">Dangerous attraction: phagocyte recruitment and danger signals of apoptotic and necrotic cells.</a> Apoptosis. 15, 1007-1028 (2010).</li>
<li>Sinha, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lithium+activates+the+Wnt+and+phosphatidylinositol+3-kinase+Akt+signaling+pathways+to+promote+cell+survival+in+the+absence+of+soluble+survival+factors%5BTitle%5D)+AND+%22Am.+J.+Physiol.+Renal+Physiol%22%5BJournal%5D)">Lithium activates the Wnt and phosphatidylinositol 3-kinase Akt signaling pathways to promote cell survival in the absence of soluble survival factors.</a> Am. J. Physiol. Renal Physiol. 288, F703-F713 (2005).</li>
<li>Jat, P. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Direct+derivation+of+conditionally+immortal+cell+lines+from+an+H-2Kb-tsA58+transgenic+mouse%5BTitle%5D)+AND+%22Proc.+Natl.+Acad.+Sci.+U.S.A%22%5BJournal%5D)">Direct derivation of conditionally immortal cell lines from an H-2Kb-tsA58 transgenic mouse.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88, 5096-5100 (1991).</li>
<li>Wakasugi, K., Schimmel, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Two+distinct+cytokines+released+from+a+human+aminoacyl-tRNA-synthetase%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Two distinct cytokines released from a human aminoacyl-tRNA-synthetase.</a> Science. 284, 147-151 (1999).</li>
</ol>

Yazarlar, rekabet eden hiçbir finansal çıkarları olmadığını beyan ederler.

Burada apoptoz veya hücre ölümünün diğer formları uygulanan hücrelere maruz kalma sonra yaşayabilir hücrelerin indüklenen hücre içi sinyal olayları için bir protokol sağlar. protokol apoptotik hücrelere maruz canlı cevap veren hücreler içinde hücre içi sinyal yollarını modüle hangi birden fazla mekanizmalar vurgulamaktadır. Bu mekanizmalar, şunları içerir: bir etkileşim (ölü hücre ya da atkı aralığı veziküller ve microvesicles ilgili moleküller veya yüzey belirleyicilerini köprü ile, genellikle apoptotik organları olara...

Apoptozis veya regüle hücre ölümü 1, dokuların bakımı ve geliştirilmesi için önemli bir şekilde katkıda bulunur. En basit inceledi, apoptoz izinleri, yaş hasarlı veya aşırı hücre çevredeki dokulara 2,3 zarar vermeden bertaraf edilmesi için. doku homeostazında için apoptoz katkısı, önemli ölçüde daha dinamik ve çeşitlidir. Apoptoz ile ölmemiştir hücreler birden fazla yeni aktiviteler elde hem salgılanan hem hücre-bağlantılı bitişik canlı hücreler 4-10 çalışmasına etki sağlayacak. Inflamasyonu 11-16 bastırmak için apoptotik hücrelerin yeteneği odaklanmış önceki çalışmalar, ancak apoptotik hücreler de, hayatta kalma 4,9,10, çoğalması 4,9,10, farklılaşma 17 gibi hayati faaliyetler de dahil olmak üzere hücresel fonksiyonları, geniş bir modüle göç 18 ve büyüme 19. Ayrıca, bu etkiler makrofaj gibi -profesyonel fagositlerin sınırlı değildirs, ancak epitelyal ve endotelyal hücreleri 7,9,10,18-21 gibi geleneksel fagositik olmayan hücreler de dahil olmak üzere, hemen hemen tüm hücre tipleri ve soy, kadar uzanır. apoptotik hücrelere maruz kaldıktan sonra, bitişik canlı hücre spesifik yanıt uygulanabilir, hücrelerin ve apoptotik hücrelerin kendileri, hem ilgili çok sayıda faktöre bağlıdır. Apoptotik hücrelere maruz kalmanın sıçangil makrofaj ve böbrek proksimal tübüler epitelyel hücrelerin (PTECs) proliferasyonunu inhibe olmasına rağmen, örneğin, bu iki hücre tipi apoptotik hücrelerin 4,6,9,10 onların yaşam yanıt olarak büyük ölçüde farklılık gösterir. Apoptotik hücreler, makrofajlar yaşamasını uzattığı ancak PTECs 4,6,9,10 apoptotik ölümüne neden olur. Özellikle, apoptotik hücrelere yanıt aynı soydan gelen hücrelerin yanıt kökeni 10 (meme epitel karşı, örneğin böbrek PTECs nedeniyle yanıt hücrenin organa bağlı arasında bile farklılık gösterebilirhücreleri) ya da aktivasyon durumu 22 (örneğin, nötrofiller). Bunun aksine, apoptotik hücrelerin apoptotik doğasına bağlı olarak aynı hücre içinde farklı tepkiler 10,23 veya apoptoz 10,14 aşamasına uyaran tetikleyebilir. Apoptotik hücre yanıtı diverseness ve karmaşıklığı göz önüne alındığında, büyük bir dikkatle herhangi bir sonuç sorumlu sinyal olaylarını ve yolların kesme alınmalıdır. İlk olarak, canlı ve apoptotik hücreleri arasındaki doğrudan fiziksel etkileşim gerektiren yanıtları apoptotik hücrenin 3,6-10 tarafından yayımlanan veya oluşturulan çözünür arabulucular tarafından ortaya çıkarılan olanlardan ayırt edilmelidir. Fiziksel etkileşim gerekli ise, o zaman, bir başka farklılaşma yapılmalıdır. Sinyal olayları apoptotik hücre bağlanan özel bir reseptör bağımsız sonra yutulma bağımsız veya fagositik alımına apoptotik hücre, reseptör aracılı tanıma bağlıdır<html> 3-7,9,10,19. İkinci durumda, tepki apoptotik hücrelere özgü değildir ve herhangi bir fagositik malzeme 4,6 ile tetiklenebilir. Bu ayrımlar önemi tekrar makrofajlar ve böbrek PTECs tepkileri zıt tarafından takdir edilebilir. Her iki hücre türü için, apoptotik hücrelerine maruz ön-sağkalım kinaz Akt&#39;nin aktivitesini değiştirir. Modülasyon, bir 0.4 um polikarbonat membran ile yanıt ayrılması ve apoptotik hücre yana yanıt 4,9,10,19 ortadan kaldırır, fiziksel etkileşime bağlıdır. Makrofajlar tepki fagositozu 4,9,10,19 tarafından tahrik edilmektedir, oysa Ancak PTECs tepkisi, reseptör aracılı fagositoz bağımsızdır. Bu sonuç, lateks boncuklar, nötr fagositik uyarana, maruz kalınması hiçbir PTECs içinde Akt aktivitesi üzerine etkisi, ancak taklit makrofajlar 4,9 apoptotik hücrelerin etkisi vardır gerçeği ile takviye edilmiştir. &quot;Daha az araştırılmıştır&gt; de, nekroz ya da kaza sonucu hücre ölümü 1 ile boyama hücreleri apoptotik hücre gibi, nekrotik hücre çeşitli mekanizmalar, özellikle sızıntı yoluyla etki gösterirler. 3-10,19 Yakınlarda canlı hücrelerin fonksiyonunu modüle onların yırtılmış hücre zarından 3,5,6,9,24 aracılığıyla hücre içi içeriğinin. PTECs ve makrofajlar dahil olmak üzere birçok hücreler, hücreler nekroz 5,9 ile ölen için farklı olmayan rakip reseptörlerini sahiptirler. bu reseptörlerin Nişan olan sinyal olaylarını neden olur apoptotik hücreler, fosforilasyon 9,10,19 azaltılması ise genellikle apoptotik hücrelerin 4-10,19 reseptörlerinin katılım neden kişilerce karşısında yer alır. Örneğin, PTECs olarak, nekrotik hücre, Akt fosforilasyonunun artar. Burada, komşu apoptotik PTECs reseptör aracılı tanınması yoluyla uygulanabilir böbrek PTECs indüklenen hücre içi sinyal olaylarını belirlemek için bir protokol açıklar <sup&gt; 9,10,19. Protokol BU.MPT hücreleri 9,10,19,25,26 olarak bilinen bir şartlı immortalize PTEC hücre hattı için özel olsa kolayca kaynaklı olmayan epitel ve / veya daha başka organlara türetilmiş olan hücre hatlarına uyarlanmıştır böbrek. Önemlisi, bir hücre uyarıcı olarak apoptotik hücrelerin kullanımı çözünür ligandlar ile mevcut olmayan bazı doğal deneysel zorluklar teşkil etmektedir. Bunların en önemlisi, apoptotik hücrelerin bir süspansiyon olarak yerine bir çözelti olarak ilave edilebilir olmasıdır. Bu zorluklar, hem de bunları en aza indirmek veya aşmak için stratejiler, protokolde içinde tartışılır. Neredeyse protokolün açıklanan tekniklerin tüm basit ve hücre kültürüne standarttır. Bu protokolün avantajı apoptotik hücreler yanıt hücrelerin içinde sinyal iletimini modüle hangi birden mekanizmaları dikkatini yatıyor. Bu mekanizmalar yüzey belirleyicileri yoluyla bağlanması veya yeniden spesifik reseptörlere molekülleri köprü dahilsponding hücre, çözünür mediatörlerin salınımı ve / veya fagositik makine nişan. Nekrotik hücrelerinin sonuçları hücre ölümü modunda olup ölü hücreler için genel yanıtı özgü olduğundan emin olmak için tüm deneylere dahil edilmiştir. Bu protokol önerildiği gibi dikkatli bir yaklaşım, ölen hücrelerin sağlığı ve hastalıkları hem de, onların canlı komşuları üzerinde uygulamayın sürekli genişleyen etki anlayışımıza çok önemlidir.

<table><tbody><tr><td><güçlü > Hücre kültürü materyalleri< / güçlü ></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>DMEM, [4.5 g / L] glikoz ile 1x, &# 671;-glutamin ve sodyum-piruvat</td><td>Mediatech (Manassas, VA)</td> <td>10-013-CV</td><td></td></tr><tr><td>HyClone Fetal Klon II, fetal sığır serumu</td><td>GE Healthcare (Logan, UT)</td><td>SH30066.03</td><td>kültür ortamına %10 (h/h)&nbsp; ekleyin</td></tr><tr><td>A Penisilin-Streptomisin-Glutamin, 100x</td><td>Yaşam Teknolojileri (Grand Island, NY)</td><td>10378-016</td><td>kültür ortamı A ve B&gamma;-Interferon'a 100 birim / mL ekleyin</td></tr><tr><td>, fare rekombinant, Escherichia coli</td><td>Calbiochem, Millipore (Billerica, MA)</td><td>407303</td><td>kültür ortamına 10 birim / mL ekleyin Falcon</td></tr><tr><td>polistiren doku kültürü ile muamele edilmiş yemekler, pirojenik olmayan</td><td>Corning (Durham, NC)</td><td>353003</td><td>steril, 100 mm çaplı</td></tr><tr><td>Falcon polistiren santrifüj tüpleri, konik tabanlı</td><td>Corning (Durham, NC)</td><td>352095</td><td>steril, 15 mL</td></tr><tr><td>Tripsin-EDTA, %0,05, Gibco</td><td>Fisher (Waltham, MA)</td><td>25300062</td><td>steril, 100 mL</td></tr><tr><td><güçlü>İsim<</td><td>strong>Company</td><td>Catalog</td><td>Comments</td></tr><tr><td><güçlü>Kimyasallar ve inhibitörler</güçlü></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Staurosporin, Streptomyces sp.</td><td>Sigma (St. Louis, MO)</td><td>S4400</td><td>[1 & mu; apoptozu indüklemek için 3 saat boyunca g / mL</td></tr><tr><td>Epidermal büyüme faktörü (EGF), [1 mg / mL]</td> <td>Millipore (Billerica, MA)</td> <td>EA140</td>, <td>yanıt veren hücreleri uyarmak için 50 nM'de kullanın</td></tr><tr><td>UltraPure, 0.5 M EDTA, pH 8.0</td><td>Yaşam Teknolojileri (Grand Island, NY)</td><td>15575-038</td>, <td>yapışık hücreleri ayırmak için 5 mM kullanır</td></tr><tr><td>Tripan mavisi çözeltisi, %0.4</td> MP Ölü <td>hücrelerin boyanması</td><td></td><td></td></tr> <tr><td>için biyomedikal (Santa Ana, CA)91691049Paraformaldehit Çözeltisi, DPBS</td><td>Affymetrix'te %4 (Santa Clara, CA)</td> <td>19943</td>, <td>hücre fiksasyonu için 1x DPBS'de% 0.4 (h / v) kullanın</td></tr><tr><td>Dulbecco'nun fosfat tamponlu salin (DPBS), 1x, Gibco</td><td>Life Technologies (Grand Island, NY</td> <td>14040133</td>), <td>stok çözeltisi</td></tr><tr><td>Dulbecco'nun fosfat tamponlu tuzlu su (DPBS), Ca 2 + - ve Mg2 + içermez, 1x, Gibco</td><td>Life Technologies (Grand Island, NY)</td><td>14190367</td><td>stok çözeltisi</td></tr><tr><td>Cytochalasin D, dimetil sülfoksit (DMSO) içinde 4 mM, Zygosporium mansonii</td><td>Sigma (St. Louis, MO)</td><td>C8273'ten</td><td>[4 & mu; g/mL] fagositozu inhibe etmek için</td></tr><tr><td>Dimetil sülfoksit (DMSO)</td><td>Sigma (St. Louis, MO)</td><td>Sitokalasin için</td> <td>D2650</td> çözücü D</tr><tr><td colspan="4">[başlık]</td></tr><tr><td><güçlü>Hücre lizis tamponu bileşenleri</güçlü></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Tris tamponlu salin (TBS), 10x, pH 7.4</td><td>BioRad (Herkül, CA)</td><td>1706435</td><td>hücre lizis tamponu için</td></tr><tr><td>Sodyum pirofosfat</td><td>Sigma-Aldrich (St. Louis, MO)</td><td>221368</td><td>hücre lizis tamponu için 10 mM</td></tr><tr><td>Sodyum deoksikolat</td><td>Sigma-Aldrich (St. Louis, MO)</td><td>D6750</td><td>hücre lizis tamponu için% 0.5 w / v</td></tr><tr><td>Sodyum dodesil sülfat (SDS)</td> <td>Sigma-Aldrich (St. Louis, MO)</td> <td>L3771 & nbsp;</td><td>Hücre lizis tamponu için% 0.1 w / v</td></tr><tr><td>Gliserol</td><td>Sigma-Aldrich (St. Louis, MO)</td><td>G5516</td><td>hücre lizis tamponu için% 10</td></tr><tr><td>Sodyum florür</td><td>Sigma-Aldrich (St. Louis, MO)</td><td>450022</td><td>hücre lizis tamponu için 25 mM</td></tr><tr><td>Komple mini EDTA içermeyen proteaz inhibitörü kokteyl tableti</td><td>Roche Diagnostics (Indianapolis, IN)</td><td>4693159001</td><td>hücre lizis tamponu için, 10 mL tampon başına 1 tablet</td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>Sigma-Aldrich (St. Louis, MO)</td><td>T8787</td><td>hücre lizis tamponu için %10</td></tr><tr><td>Dithiothreitol (DTT)</td><td>MP Biyomedikaller (Santa Ana, CA)</td><td>11DTT00005</td><td>Hücre lizis tamponu için 1 mM</td></tr><tr><td>Fenilmetansülfonil florür (PMSF)</td><td>MP Biyomedikal (Santa Ana, CA)</td><td>4800263</td><td>Hücre lizis tamponu için 1 mM</td></tr><tr><td>Sodyum ortovandat</td><td>MP Biyomedikal (Santa Ana, CA)</td><td>2159664</td><td>Hücre lizis tamponu</td></tr> <tr><td>için 10 mMName</td><td>Company</td><td>Catalog<</td><td>strong>Comments</td></tr><tr><td>Equipment</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Sorvall T6000B santrifüj</td><td>Du Pont (Wilmington, DE)</td><td>T6000B</td><td></td></tr><tr><td>Fisher Tissuemat, su banyosu</td><td>Fisher (Waltham, MA)</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Sonic Dismembrator (sonikator), model 100</td><td>Fisher (Waltham, MA)</td><td></td><td></td></tr> <tr><td>< güçlü > Çeşitli< / güçlü ></td><td></td><td></td><td></td></tr> <tr><td>Hücre sayma odası, Neubauer</td><td>Hawksley (Lancing, Sussex, İngiltere)</td> <td>AC2000</td><td></td></tr><tr><td>Annexin V-FITC Apoptoz Tespit Kiti II</td><td>Millipore (Billerica, MA)</td> <td>Apoptoz aşamasını belirlemek için PI ve Annexin V boyama için</td> <td>CBA059</td></tr><tr><td>Eppendorf mikrotrifüj tüpleri, 1.5 mL</td><td>Sigma-Aldrich (St. Louis, MO)</td><td>T9661</td><td></td></tr><tr><td>Transwell geçirgen destek, 0.4 & mu; m polikarbonat membran</td><td>Corning (Corning, NY)</td><td>3413</td><td>steril, polistiren, doku kültürü tedavi edilmiş</td></tr><tr><td><güçlü>Ad<</td><td>strong>Company</td><td>Catalog</td><td>Comments</td></tr><tr><td>Antikorlar</güçlü></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Fosfo-glikojen sentaz kinaz-3&alfa;/&beta; (GSK-3&alfa;/&beta;) (Ser21/9), poliklonal antikor</td><td>Hücre Sinyalizasyon Teknolojisi</td><td>9331</td><td>tavşan poliklonal antikoru</td></tr><tr><td>Gliseraldehit-3-fosfat dehidrojenaz (GAPDH) monoklonal antokor ( (14C10) )</td><td>Hücre Sinyalizasyon Teknolojisi</td><td>2118</td><td>tavşan monoklonal antikoru</td></tr></tbody></table>

hücre içi komşu maruz kalan hücreler, apoptotik hücre ölümü ile etkileşim yoluyla canlı hücreler İndüklenen sinyal olaylarının tanımlanması

Identification of Intracellular Signaling Events Induced in Viable Cells by Interaction with Neighboring Cells Undergoing Apoptotic Cell Death

apoptoz ile ölen hücreler, aynı zamanda komşu canlı hücrelerin fonksiyonunu etkileyen sağlayacak birçok yeni faaliyetler kazanmak gibi düzenlenmiş hücre ölümü anılacaktır. Böyle hayatta kalma, proliferasyon, büyüme ve farklılaşma gibi hayati faaliyetler, apoptotik hücreler tarafından modüle birçok hücresel fonksiyonları arasında yer almaktadır. apoptotik hücrelere tanıyıp tepki yeteneği bağımsız olarak soy veya bağlantı organının, tüm hücrelerin evrensel özellik olarak görünmektedir. Ancak, çeşitlilik ve büyük bir dikkatle herhangi bir sonuç için sorumlu sinyal olaylarını ve yollar diseksiyon alınması apoptotik hücreler görev tepki karmaşıklığı. Özelde, bir apoptotik hücreler de dahil olmak üzere, uygun bir cevap hücreleri içinde hücre içi sinyal yollarını etkileyebilir olan çoklu mekanizmalar arasında ayrım yapılmalıdır: reseptör aracılı apoptotik hücre tanınması, apoptotik hücre tarafından çözülebilen aracıların salınmasını ve / veya etkileşim phagocytic makine. Burada, apoptotik hücrelere maruz kaldıkları aşağıdaki canlı yanıt veren hücrelerde uyarılan hücre içi sinyal olayları tanımlamak için bir protokol sağlar. protokolün önemli bir avantajı apoptotik hücrelerin yanıt hücreleri içinde sinyal olaylarını modüle hangi mekanizmanın diseksiyonu için ödediği dikkat yatıyor. Protokol bir şartlı immortalize fare böbreği proksimal tübüler hücre hattı (BU.MPT hücreleri) için spesifik iken, kolayca kaynaklı olmayan epitel ve / veya böbrek dışında organ türetilmiş olan hücre hatlarına uyarlanmıştır. Bir uyarıcı olarak ölü hücrelerin kullanımı hücre içi sinyal olayları algılama engelleyebilir birçok benzersiz faktörler tanıtır. Bu sorunlar, hem de bunları en aza indirmek veya aşmak için stratejiler, protokolde içinde tartışılır. Bu protokolün uygulanması sağlığında ve Disea hem de ölü veya ölmekte hücreler canlı komşuları üzerinde uygulamayın geniş etki genişleyen bilgi yardımcı olmalıdırse.

Şekil 1'de, zamanlama ve kritik apoptotik hücre hazırlanmasında yer alan adımları (Protokol 1) ve nekrotik hücre (Protokol 2) ve apoptotik ve nekrotik hücre süspansiyonları cevap hücrelerinin uyarılmasını (Protokol 4) tasvir eden bir şemadır sağlar. Şekil 2'de, serin-treonin kinaz glikojen sentaz kinaz-3 (GSK-3), GSK-3α ve GSK-3β, iki izoform fosforilasyonu üzerindeki apoptotik hücrelerin etki...

Burada, bitişik ölü veya ölmekte olan hücrelerle fiziksel etkileşim yoluyla canlı hücrelerde indüklenen hücre içi sinyal olaylarının belirlenmesi için bir protokol sunuyoruz. Protokol, fagositik alımlarının veya çözünür aracıların salınmasının aksine, ölü hücrelerin reseptör aracılı tanınmasıyla indüklenen sinyal olaylarına odaklanır.

Hücre içi Komşu maruz kalan hücreler, apoptotik hücre ölümü ile etkileşim yoluyla canlı hücreler İndüklenen sinyal olaylarının tanımlanması

Cells dying by apoptosis, also referred to as regulated cell death, acquire multiple new activities that enable them to influence the function of adjacent ...

Bu prosedürün genel amacı, yakındaki ölü hücrelerle fiziksel etkileşimlerini takiben sinyal olaylarının neden olduğu ve canlı yanıt veren hücreleri tanımlamaktır. Bu yöntem, hücre biyolojisi, patoloji ve fizyoloji alanlarında, ölü veya ölmekte olan hücrelerin canlı komşuları üzerindeki etkisi gibi temel soruların yanıtlanmasına yardımcı olabilir. Bu tekniğin temel avantajları, basit ve ucuz olması ve apoptoz geçiren komşu hücrelerle etkileşimlerini takiben canlı hücrelerde indüklenen biyolojik etkileri incelemek için uygulanabilmesidir.Tekniği gösteren, laboratuvarımda bir teknisyen olan Lanfei Feng olacak. BUNPT hücrelerini 100 milimetre vakumlu gaz plazma ile muamele edilmiş doku kültürü kaplarına geçirdikten sonra bu işleme başlamak için, bunları A kültür ortamında birleşene kadar büyütün ve 37 santigrat derecede nemlendirilmiş %5 karbondioksit atmosferinde büyütün. Bundan sonra, yapışan hücre tek tabakasını kültür ortamı B ile üç kez durulayın.Ardından, hücreleri, seçici olmayan bir protein kinaz inhibitörü olan staurosporin içeren kültür ortamı B'de 37 santigrat derecede 3 saat inkübe ederek apoptozu indükleyin.3 saat sonra, tek tabakadan ayrılmış yüzen apoptotik hücreleri içeren ortamı toplayın. Daha sonra, bu ortamı 500 kez G'de on dakika boyunca santrifüjleyin. Daha sonra, süpernatanı atın, peleti yapışkan hücrelere geri eklemeden önce kültür ortamı B ile üç kez yıkayın. Bu yıkama adımını takiben, 1X kalsiyum ve magnezyum içermeyen DPBS'ye 5 milimolar EDTA ekleyerek kalan yapışık hücreleri ayırın.Ayrılmış apoptotik hücreleri içeren ortamı toplayın ve yüzen apoptotik hücrelerle birlikte ayrılmış hücreleri steril bir 15 mililitre polistiren santrifüj tüpüne koyun. Daha sonra apoptotik hücreleri 500 x G'de on dakika santrifüjleme ile üç kez yıkayın, ardından yıkama başına on mililitre 1X kalsiyum ve magnezyum içermeyen DPBS'de yeniden süspansiyon yapın. Son yıkamadan sonra, apoptotik hücreleri, yanıt veren hücreleri uyarmak için kullanmadan önce, mililitre başına 5x10 ^ 6 hücrede taze kültür ortamı B'de askıya alın.Alternatif olarak, yıkanmış apoptotik hücreleri 30 dakika boyunca 1X DPBS'de 0.4 paraformaldehit içinde sabitleyin, daha sonra kültür ortamı B ile üç kez yıkayın ve yanıt veren hücreleri uyarmak için kullanmadan önce mililitre başına 5x10 ^ 6 hücrede askıya alın. BUNPT hücrelerini 100 milimetre çapında steril polistiren vakumlu gaz plazma ile muamele edilmiş doku kültürü kaplarına geçirdikten sonra, izin verilen koşullar altında birleşecek ve nemlendirilmiş% 5 karbondioksit atmosferine kadar büyütün. Daha sonra yapışkan hücre tek tabakasını, durulama başına 10 mL kültür ortamı B ile üç kez durulayın.Daha sonra, 1X kalsiyum ve magnezyum içermeyen DPBS'ye 5 mM EDTA ekleyerek hücreleri ayırın. Ayrılan hücreleri EDTA içeren ortamdan toplayın ve hücre süspansiyonunu steril bir 15 mL polistiren santrifüj tüpüne ekleyin. Daha sonra, hücreleri 500 kez G'de on dakika santrifüjleme ve yıkama başına 10 mL kalsiyum ve magnezyum içermeyen DPBS'de yeniden süspansiyon yoluyla üç kez yıkayın.Son yıkamadan sonra, hücreleri mililitre başına 5x10 ^ 6 hücrede taze kültür ortamı B'de askıya alın. Bunu takiben, hücreleri bir su banyosunda 45 dakika boyunca 70 santigrat dereceye ısıtarak nekrozu indükleyin ve bu hücre süspansiyonunu her on dakikada bir hafifçe girdaplayın. Nekrozun indüksiyonundan sonra, hücreleri 37 santigrat derecede nemlendirilmiş% 5 karbondioksit atmosferinde iki saat inkübe edin ve hücre süspansiyonunu her 15 dakikada bir hafifçe girdap haline getirin.Bu prosedürde, BUNPT hücrelerini, yaklaşık% 85 birleşme elde edene kadar, izin verilen koşullar altında steril 100 milimetre doku kültürü kaplarında büyütün. Daha sonra, kültür ortamı A'yı aspire edin ve hücreleri durulama başına 10 mL kültür ortamı B ile üç kez durulayın. Daha sonra serum, sessizliği indüklemek için hücreleri, izin verilmeyen koşullar altında nemlendirilmiş% 5 karbondioksit atmosferinde 18 ila 24 saat boyunca kültür ortamı B'de aç bırakın.Bir sonraki prosedür için altı deneysel koşul için birleşik BUNPT hücrelerinin ayrı bir doku kültürü kabını etiketleyin. Şimdi, hareketsiz BUNPT yanıtlayıcı hücrelerinin önceden etiketlenmiş tabaklarından kültür ortamı B'yi aspire edin. 100 milimetrelik tabakları farklı koşullarda hazırlamak için, hücresiz kültür ortamı B'den iki mL, kültür ortamı B'de mililitre başına 5X10^6 hücrede apoptotik hücre süspansiyonu veya kültür ortamında mL başına 5X10^6 hücrede nekrotik hücre süspansiyonu ekleyin. 10X10 ^ 6 hücre içeren birleşik 100 milimetre çanak.Bulaşıkları yavaşça döndürün. Daha sonra nemlendirilmiş% 5 karbondioksit atmosferinde 37 santigrat derecede inkübe edin. 30 dakika sonra, kültür kabının ön etiketlemesine göre, yanıt hücrelerini araç veya 15 nMOL EGF ile uyarın.Hücreleri nemlendirilmiş% 5 karbondioksit atmosferinde 37 santigrat derecede 15 dakika inkübe edin. Daha sonra, beş milimetre buz gibi soğuk DPBS ekleyerek ölü hücreleri yıkayın. Çanağı döndürün ve yıkama sıvısını aspire edin.Yıkamayı üç kez tekrarlayın. Ardından, daha sonraki işlemler için yanıtlayıcı hücre kaplarını hemen buzun üzerine yerleştirin. Bu şekil, hareketsiz BUNPT yanıtlayıcılarının 30 dakika boyunca apoptotik hücrelere maruz kalmasının GSK3 alfa beta'nın bazal fosforilasyonunu güçlü bir şekilde inhibe ettiğini göstermektedir.BUNPT yanıtlayıcıları ve apoptotik hücreler arasındaki fiziksel etkileşimi önlemek için, BUNPT yanıtlayıcıları geçirgen bir destek sistemi içinde büyütüldü ve apoptotik hedeflerden 0.4 mikron polikarbonat membran ile ayrıldı. BUNPT yanıtlayıcıları ve apoptotik hücreler arasındaki fiziksel etkileşimin önlenmesi, apoptotik hedeflerin GSK3 alfa beta'nın fosforilasyonunu inhibe etme yeteneğini ortadan kaldırdı. Fagositozun rolünü değerlendirmek için, ölü hücrelerin fagositik alımını önlemek için hücre iskeleti inhibitörü Cytochalasin D kullanıldı.Apoptotik hücrelere yanıt olarak GSK3 alfa beta'nın fosforilasyonunun inhibisyonu, fagositoz yokluğunda meydana geldi. Bir kez ustalaştıktan sonra, bu teknik, jel elektroforezi ve immünoblotlama için gereken süre hariç, uygun şekilde yapılırsa 4-6 saat içinde yapılabilir. Bu prosedürü denerken, bir uyaran olarak çözünür bir ligandın aksine hücresel bir süspansiyonun kullanılmasının birkaç doğal ve büyük ölçüde kaçınılmaz deneysel engel oluşturduğunu hatırlamak önemlidir.Aynı prosedürü kullanarak, yakındaki ölü hücrelerle etkileşimlerini takiben canlı yanıt veren hücrelerde indüklenen sinyal olaylarının işlevsel sonuçlarını belirlemek için hayatta kalma veya proliferasyon veya hücre büyümesi gibi diğer hücre işlevleri incelenebilir. Bu videoyu izledikten sonra, yakındaki ölü hücrelerle fiziksel etkileşimlerini takiben canlı yanıt veren hücrelerde indüklenen belirli sinyal olaylarının nasıl tanımlanacağını iyi anlamış olmalısınız.

identification-intracellular-signaling-events-induced-viable-cells

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Source: Berens, C. et al. Applying an Inducible Expression System to Study Interference of Bacterial Virulence Factors with Intracellular Signaling. J. Vis. Exp. (2015)This video demonstrates the use of immunoblotting to assess apoptosis inhibition by the bacterial effector protein CaeB in human cells. It outlines the steps for detecting apoptotic markers following doxycycline-induced expression of pro-apoptotic proteins in host cells expressing the effector.

Immunoblot Analysis of Apoptosis Inhibition in Host Cells Expressing an Antiapoptotic Bacterial Protein

Anastaz terimi, ölmekte olan hücrelerin geç bir aşamada hücre intihar sürecini tersine çevirdiği, kendilerini onardığı ve nihayetinde hayatta kaldığı fenomeni ifade eder. Burada, anastaz geçiren hücreleri tespit etmek ve izlemek için protokoller gösteriyoruz.

Takip inişi, Apoptosisi tersine Cep Survival Fenomeni için Stratejiler

Burada açıklanan yöntem, bir anti-apoptotik bakteriyel efektör proteinin aktivitesini incelemek için tanımlanmış adımlarda apoptotik sinyal kaskadını indüklemek için kullanılır. Bu yöntem aynı zamanda pro-apoptotik veya toksik proteinlerin indüklenebilir ekspresyonu için veya diğer sinyal yollarıyla etkileşimi incelemek için de kullanılabilir.

Bir uyarılabilir İfade Sistemi uygulamak Hücre içi Sinyali ile Bakteriyel Virulans Faktörler Girişim Eğitim için

Anastasis teknik olarak hücre ölüm süreci tersine çevirdin mi hücreler morfolojik normal sağlıklı hücrelerden ayırt edilemez olabilir çünkü vivo içinde tespit etmek zordur. Burada tarif biz tespit ve yeni geliştirilen vivo içinde CaspaseTracker Biyoalgılayıcı sistemimizi kullanarak canlı hayvanlarda anastasis geçmesi hücreleri izleme için kullanılan protokol.

Anastasis Vivo içinde CaspaseTracker Biyoalgılayıcı tarafından tespit

Efferocytosis, apoptotik hücreler, fagositik kaldırılması homeostazı korumak için gerekli ve reseptörleri ve tanıma, engulfment ve apoptotik hücreler içselleştirilmesi için izin sinyal yollar tarafından yönetilir. Burada, biz efferocytosis miktar ve efferocytic sinyal yolları etkinlik için bir floresans mikroskobu Protokolü mevcut.

Efferocytosis tek hücreli floresans mikroskobu tarafından miktar

Akış Sitometresi veya diferansiyel Santrifüjü kullanarak bir iş akışı tespit etmek, ölçmek ve apoptotik vücutlarından apoptotik örneği yüksek saflıkta yalıtmak için geliştirilmiştir.

Algılama ve yalıtım için yüksek saflıkta apoptotik organlarının

Biz burada pre-harekete geçirmek CD8 sitotoksisite araştırmak için bir protokol tarif+ T hücreleri kanser hücrelerine karşı apoptotik kanser hücreleri aracılığıyla gerçek zamanlı mikroskobu tespit ederek. Bu protokol mekanizmaları myeloid hücre kaynaklı T hücre bastırma arkasında araştırmak ve T hücreleri ile abluka bağışıklık baskılayıcı myeloid hücre yenileyici amaçlı bileşikler değerlendirmek.

Gerçek zamanlı hafiye-in Vitro tümör hücre Apoptosis içinde CD8 tarafından indüklenen+ T hücreleri Myeloid hücrelerin tümör infiltre bağışıklık baskılayıcı işlevlerini çalışmaya

Burada, apoptotik tirositler ve periton makrofajlar hazırlamak ve effersitoz verimliliğini ve apoptotik tirositlerin özel inhibitörü-aracılı engellemesini analiz etmek için bir protokol sunuyoruz. Bu protokol yapay boncuk ve bakteri dahil olmak üzere diğer parçacıklar hücre aracılı boşluk geniş bir uygulama vardır.

Makrofajlar tarafından apoptotik thymocyte engulfment deneysel Analizi

Apoptoz, erken ve geç apoptotik biyobelirteçlerin akış sitometrik analizi ile karakterize edilebilir. Serviks kanseri hücre hattı SiHa, bir tezgah üstü akış sitometresi kullanılarak Actinomycin D ile tedaviden sonra apoptoz biyobelirteçleri için analiz edildi.

Aktinomisin D ile Tedavi Edilen SiHa Serviks Kanseri Hücrelerinde Apoptotik Biyobelirteçlerin Akış Sitometrik Analizi

OCT4 bir retrovirüs-aracılı ektopik ifadesi ile insan kaynaklı hücreler pluripotent kök (iPSCs) üretmek için bir yöntem olup, SOX2, KLF4 ve MYC tarif edilmektedir. GFP dayanarak insan iPSC koloniler tespit etmek pratik bir yolu da tartışılmaktadır.

GFP Retroviral Vector kullanarak İsteyerek Pluripotent Kök Hücrelerinin (iPSCs) içine İnsan somatik hücreleri yeniden programlama

Öğrenin, BUNPT hücreleri kullanarak apoptotik hücrelerle fiziksel etkileşim sonrası canlı yanıt veren hücrelerde sinyal olaylarını nasıl tanımlayacağınızı. Bu yöntem hücre biyolojisi ve patoloji alanlarında ölü hücrelerin canlı komşuları üzerindeki etkisini incelemek için kullanılır.

Hücre içi Komşu maruz kalan hücreler, apoptotik hücre ölümü ile etkileşim yoluyla canlı hücreler İndüklenen sinyal olaylarının tanımlanması (Video) | JoVE Journal

Hücre içi Komşu maruz kalan hücreler, apoptotik hücre ölümü ile etkileşim yoluyla canlı hücreler İndüklenen sinyal olaylarının tanımlanması

Daha fazla video keşfet