Name: Virionlar antijenik Spectra ve ekstrasellüler veziküllerin Analiz Virometry Akış (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-01-25T15:00:00.000+00:00
Duration: 6 min 28 s
Description: Öğrenin, manyetik nanopartiküller kullanarak tek virion ve ekstraselüler vezikül yüzey antijenlerini konvansiyonel akış sitometrisiyle analiz etme yöntemini. Bu teknik, bireysel parçacık heterojenliğini ortaya çıkararak HIV-1 ve Dengue virüsü fenotiplerini incelemenizi sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

AA, SZ, WF, J-C'nin bu çalışması. G ve LM, NICHD Intramural Programı tarafından desteklenmiştir. MV'nin çalışması, Rusya Federasyonu Hükümeti hibesi #14.B25.31.0016 tarafından desteklenmiştir.

Manyetik Nanopartiküller 1. Birleştirme (MNPS) <ol><li> Ticari bağlantı prosedürü ve antikorlar (Abs) ile çift MNPS için reaktif (tipik olarak 1 mg) kullanın. Karboksilik asit, reaktif gruplar ile demir oksit nanopartiküllerinin kullanılır. <ol><li> antikorlar bir hacimde daha yüksek 0.5 ml ise, bir 100K konsantratörü kullanarak konsantre. 3-5 dakika boyunca 2.000 xg&#39;de Spin. </li></ol></li><li> İşlem sonunda, ani soğutma tamponu, 10 ul ilave edildikten sonra, 12 mm x 75 mm tüp MNPS transferi ve 3 ml yıkama / saklama tamponu ilave edin. Manyetik separatörün merkezi delik tüp yerleştirilir ve 4 ° C&#39;de bir gece bekletin. </li><li> MNPS tüm tüpün yanına toplanan ve daha sonra dikkatlice sıvı dışarı pipetlemeyin emin olun. Taze yıkama / depolama tamponu 3 ml ekleyin ve arka mıknatıs yerleştirmek. </li><li> Birkaç saat sonra, MNPS tüpün yanına toplanır kontrol ve sıvıyı pipetleyin. yıkama / depolama tamponu 2 ml kullanınMNPS tekrar süspansiyon ve 4 ° C&#39;de depolayın. </li><li> (Bölüm 2&#39;de tarif edildiği gibi yakalama için bir fare monoklonal antikor kullanılması durumunda, örneğin, keçi anti-fare) ABS ilgili bir floresan Fab antikoru fragmanı ile etiketleme ile MNPS bağlanır olduğunu ve bir akış sitometresi üzerinde çalışır. </li></ol> MNPS için Coupled 2. Etiketleme Antikorlar <ol><li> 1.5 ml mikrosantrifüj tüpü içinde Yakalanan Ab&#39;nin izotip spesifik MNPS bölgesinin (koşul başına) 60 ul (3.9 x 10 ila 12 parçacıklar) ve (200 ug / ml, ticari çözelti) 5 ul etiketli Fab fragmanları, birleştirin. </li><li> Sürekli karıştırma ile, 30 dakika boyunca oda sıcaklığında (RT) enkübe edilir. </li><li> 5 dakika boyunca 1500 x g&#39;de bir mikrosantrfuj fosfat tamponlu tuz (PBS) ve bir dönüş 300 ul bir 100 K konsantratör Ön ıslatma sergilemez. </li><li> 100K sütun üzerinde etiketli kompleksleri arındırın. 200 ul PBS ile yıkayın, 5 dakika boyunca 1500 x g&#39;de bir mikrosantrfuj adım 2.2 karışımı spin ve kurtarmakİlk hacmi. </li></ol> Etiketli Ab-MNP Kompleksleri 3. İlgi parçacıklar (Virüsler veya AGH) Yakalama <ol><li> HIV (60 ul) veya EV hazırlanması (100 ul) ile önceden etiketlenmiş MNPS 60 ul (3.9 x 10 ila 12 parçacıklar) inkübe edin. <ol><li> çeşitli yöntemler kullanarak EV hazırlıklarını hazırlayın. Burada, sakaroz geçişlerini üzerinde AGH arındırmak exosome yağış reaktifler kullanılarak trombosit fakir plazmadan bunları toplamak veya plazma doğrudan izole 8. NOT: Optimal oranları her bir deney için tespit edilmesi gerekmektedir ve hazırlık virüs / EV konsantrasyonuna bağlıdır. MNP-Ab kısmı ~ fazla 10 6 virüs / EV fraksiyonunun konsantrasyonu karşılaştırılmalıdır. </li></ol></li><li> virüs, nazik karıştırma ile, 37 ° C&#39;de 40 dakika veya EVS, 4 ° C &#39;de 1 saat inkübe edin. </li><li> Fc yavaşça girdap bağlanmasını bloke oda sıcaklığında 3-5 dakika inkübe% 2.5 fare IgG / insan IgG ekleyin. </li><li>Her algılama Abs üreticisi tavsiye veya titre konsantrasyonları ekleyin ve oda sıcaklığında ek 20 dakika kuluçkaya yatmaktadır. </li></ol> Sınırsız Antikorlar gelen MNP-yakalanan viryonlar (veya AGH) Manyetik sütunlar kullanma 4. Ayırma <ol><li> bir ayırıcı mıknatıs yerleştirerek kullanım için manyetik ayırma kolonu hazırlayın. </li><li> Yıkama tamponu (2 mM etilendiamintetraasetik asit (EDTA),% 0.5 sığır serum albümini, PBS içinde (BSA)) 500 ul ile kolon ön ıslatma sergilemez. yıkama tamponu sütuna akmasına izin verin. </li><li> sütuna MNP-virüs / MNP-EV kompleksleri ekleyin ve tüm sıvı akmasına izin verin. Bütün hacmi geçmesine izin kolona yıkama tamponu 500 ul ekle. </li><li> Yıkama tamponu 2 kez daha tekrarlayın yıkama. </li><li> muhafaza MNP-virüs / MNP-EV komplekslerinin toplanması için x 75 mm tüp 12 mm mıknatıs ve yerden sütun çıkarın. Sütun 3 dakika mıknatıs kapalı tüp içinde bekletin. PBS 200 ul ekleyin ve izinBoncuklar PBS başka bir 200 ul ekleyin, yerçekimi tarafından aşağı akış ve elüsyon sonra 200 ul% 4 paraformaldehid ile düzeltmek. NOT: Paraformaldehyde bir şüpheli kanserojen ve havalandırılmış kaputu ele alınmalı ve eldiven giyilmelidir. </li><li> Tek virionlar ölçmek için / AGH Yüksek Verimli Sampler (HTS) ya da hemen öncesinde edinimi sayım boncuk sitometri iyi karıştırılmış akışını eklemek üzerinde hacimsel ayarları kullanın. </li></ol> MNPS yakalanan Virüsler 5. Analiz / a Akış Sitometre ile AGH <ol><li> 30 dakika boyunca flowsitometri Isınma. </li><li> Run kalite kontrol boncuk. </li><li> MNPS veya etiketli virüs / AGH birinin floresan Set eşik. arka plan &quot;gürültü&quot; azaltmak için eşik PBS süzülmüş 0.22 mikron kullanın. Olayları süzülmüş PBS hayır verir nerede düzeyinde PMT gerilimi ayarlayarak eşiğini ayarlamak, ya da çok az. </li><li> Düşük Run örnekler. (Arkasında seri olarak yerleştirilen kılıf sıvısı için ek 0.04 mikron inline filtresi kullanınStandart 0.2 mikron kılıf filtresi daha fazla) yanlış olayları ortadan kaldırmak için. </li></ol> Yakalama Etkinliğinin Değerlendirilmesi 6. <ol><li> 3.1, 3.2 anlatıldığı gibi floresan etiketli AGH veya MNP-Abs ile HIV yakalayın. (AGH bir zar boya ile veya kargo yoluyla ya da etiketli olabilir 15; HIV geni ile kodlanmış boya 16 ile, ya etiketlenmiş ya da bir zar boya 12, 17) sahip olabilir. </li><li> (4.1-4.2) &#39;de tarif edildiği gibi manyetik ayırma kolonu hazırlayın. </li><li> sütuna MNP-virüs / MNP-EV kompleksleri ekleyin ve tüm sıvı (fraksiyon akmaya) akmasına izin verin. tüp içinde fraksiyon akışı toplamak. </li><li> (4.4-4.5) &#39;de tarif edildiği gibi kolon üzerinde tutulan fraksiyon ile devam edin. </li><li> sonraki ayırma (4,1-4,5) ile 6.3 fraksiyon üzerinden akış tekrarlayın yakalama prosedürü. </li><li> İlk ca korudu kesirler analizBu sitometresinde onları çalıştırarak pture ve ikinci yakalama AGH veya HIV floresan etiketi üzerinde tetikleme ayarlanır. etkinliğini değerlendirmek için, her iki fraksiyonda olayların sayısını karşılaştırın. </li></ol> Belirli görevler için Protokol 7. Adaptasyon Not: yukarıda tarif edildiği gibi bir protokol DENV analizi için, HIV ve EVs analizi uygulanabilir olsa da, aşağıdaki modifikasyonlar dahil edilmelidir: <ol><li> Oda sıcaklığında 30 dakika süre ile karanlıkta 1 uM DII sahip virionlar inkübe edin. İnkübasyondan sonra herhangi bir fren ile, 4 ° C&#39;de 1.5 saat boyunca 240,000 x g hızında yoğunluk gradyan ortam içinde santrifüjleme (% 10,% 20,% 25 ve% 35) ile boyanan virüs temizler. % 20 ve% 25 yoğunluk gradyanı orta tabakaları 14 arasında fraksiyonu toplayın. </li><li> DII oda sıcaklığında 20 dakika süre ile% 2.5 fare IgG mevcudiyetinde tespit Ab&#39;nin İmalatçı tarafından tavsiye edilen veya titre konsantrasyonlarda DENV 1 x 10 7 (60 ul) etiketli inkübe edin. </li><li> inkubasyonyumuşak bir karıştırma ile, 37 ° C&#39;de 40 dakika boyunca önceden etiketlenmiş, 60 ul (3.9 x 10 ila 12 parçacıklar) MNP yakalama antikor kompleksleri ile karışım yedi. </li><li> Yukarıda açıklanan ve akış sitometresinde analiz gibi manyetik sütun üzerinde bağlanmamış Abs ayrı bileşke kompleksleri. </li></ol>

<ol><li>Tremblay, M. J., Fortin, J. F., Cantin, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+acquisition+of+host-encoded+proteins+by+nascent+HIV-1%5BTitle%5D)+AND+%22Immunol+Today%22%5BJournal%5D)">The acquisition of host-encoded proteins by nascent HIV-1.</a> Immunol Today. 19 (8), 346-351 (1998).</li>
<li>Santos, S., Obukhov, Y., Nekhai, S., Bukrinsky, M., Iordanskiy, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Virus-producing+cells+determine+the+host+protein+profiles+of+HIV-1+virion+cores%5BTitle%5D)+AND+%22Retrovirology%22%5BJournal%5D)">Virus-producing cells determine the host protein profiles of HIV-1 virion cores.</a> Retrovirology. 9, 65(2012).</li>
<li>Wolf, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+nature+and+significance+of+platelet+products+in+human+plasma%5BTitle%5D)+AND+%22Br+J+Haematol%22%5BJournal%5D)">The nature and significance of platelet products in human plasma.</a> Br J Haematol. 13 (3), 269-288 (1967).</li>
<li>Piccin, A., Murphy, W. G., Smith, O. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Circulating+microparticles%3A+pathophysiology+and+clinical+implications%5BTitle%5D)+AND+%22Blood+Rev%22%5BJournal%5D)">Circulating microparticles: pathophysiology and clinical implications.</a> Blood Rev. 21 (3), 157-171 (2007).</li>
<li>Bernal-Mizrachi, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+levels+of+circulating+endothelial+microparticles+in+patients+with+acute+coronary+syndromes%5BTitle%5D)+AND+%22Am+Heart+J%22%5BJournal%5D)">High levels of circulating endothelial microparticles in patients with acute coronary syndromes.</a> Am Heart J. 145 (6), 962-970 (2003).</li>
<li>Rozmyslowicz, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Platelet-+and+megakaryocyte-derived+microparticles+transfer+CXCR4+receptor+to+CXCR4-null+cells+and+make+them+susceptible+to+infection+by+X4-HIV%5BTitle%5D)+AND+%22Aids%22%5BJournal%5D)">Platelet- and megakaryocyte-derived microparticles transfer CXCR4 receptor to CXCR4-null cells and make them susceptible to infection by X4-HIV.</a> Aids. 17 (1), 33-42 (2003).</li>
<li>Bhattarai, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((GB+virus+C+particles+inhibit+T+cell+activation+via+envelope+E2+protein-mediated+inhibition+of+TCR+signaling%5BTitle%5D)+AND+%22J+Immunol%22%5BJournal%5D)">GB virus C particles inhibit T cell activation via envelope E2 protein-mediated inhibition of TCR signaling.</a> J Immunol. 190 (12), 6351-6359 (2013).</li>
<li>Arakelyan, A., Ivanova, O., Vasilieva, E., Grivel, J. C., Margolis, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antigenic+composition+of+single+nano-sized+extracellular+blood+vesicles%5BTitle%5D)+AND+%22Nanomedicine%22%5BJournal%5D)">Antigenic composition of single nano-sized extracellular blood vesicles.</a> Nanomedicine. 11 (3), 489-498 (2015).</li>
<li>Arakelyan, A., Fitzgerald, W., Margolis, L., Grivel, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanoparticle-based+flow+virometry+for+the+analysis+of+individual+virions%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Invest%22%5BJournal%5D)">Nanoparticle-based flow virometry for the analysis of individual virions.</a> J Clin Invest. 123 (9), 3716-3727 (2013).</li>
<li>Yang, H., Liang, W., He, N., Deng, Y., Li, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chemiluminescent+labels+released+from+long+spacer+arm-functionalized+magnetic+particles%3A+a+novel+strategy+for+ultrasensitive+and+highly+selective+detection+of+pathogen+infections%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Appl+Mater+Interfaces%22%5BJournal%5D)">Chemiluminescent labels released from long spacer arm-functionalized magnetic particles: a novel strategy for ultrasensitive and highly selective detection of pathogen infections.</a> ACS Appl Mater Interfaces. 7 (1), 774-781 (2015).</li>
<li>Tang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Highly+sensitive+and+rapid+detection+of+Pseudomonas+aeruginosa+based+on+magnetic+enrichment+and+magnetic+separation%5BTitle%5D)+AND+%22Theranostics%22%5BJournal%5D)">Highly sensitive and rapid detection of Pseudomonas aeruginosa based on magnetic enrichment and magnetic separation.</a> Theranostics. 3 (2), 85-92 (2013).</li>
<li>Borlido, L., Azevedo, A. M., Roque, A. C., Aires-Barros, M. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Magnetic+separations+in+biotechnology%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnol+Adv%22%5BJournal%5D)">Magnetic separations in biotechnology.</a> Biotechnol Adv. 31 (8), 1374-1385 (2013).</li>
<li>Xi, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Selection+of+HBsAg-Specific+DNA+Aptamers+Based+on+Carboxylated+Magnetic+Nanoparticles+and+Their+Application+in+the+Rapid+and+Simple+Detection+of+Hepatitis+B+Virus+Infection%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Appl+Mater+Interfaces%22%5BJournal%5D)">Selection of HBsAg-Specific DNA Aptamers Based on Carboxylated Magnetic Nanoparticles and Their Application in the Rapid and Simple Detection of Hepatitis B Virus Infection.</a> ACS Appl Mater Interfaces. 7 (21), 11215-11223 (2015).</li>
<li>Zicari, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+the+maturation+of+individual+Dengue+virions+with+flow+virometry%5BTitle%5D)+AND+%22Virology%22%5BJournal%5D)">Evaluation of the maturation of individual Dengue virions with flow virometry.</a> Virology. 488, 20-27 (2016).</li>
<li>Lai, C. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualization+and+tracking+of+tumour+extracellular+vesicle+delivery+and+RNA+translation+using+multiplexed+reporters%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Visualization and tracking of tumour extracellular vesicle delivery and RNA translation using multiplexed reporters.</a> Nat Commun. 6, 7029(2015).</li>
<li>McDonald, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualization+of+the+intracellular+behavior+of+HIV+in+living+cells%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Visualization of the intracellular behavior of HIV in living cells.</a> J Cell Biol. 159 (3), 441-452 (2002).</li>
<li>Morcock, D. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Elimination+of+retroviral+infectivity+by+N-ethylmaleimide+with+preservation+of+functional+envelope+glycoproteins%5BTitle%5D)+AND+%22J+Virol%22%5BJournal%5D)">Elimination of retroviral infectivity by N-ethylmaleimide with preservation of functional envelope glycoproteins.</a> J Virol. 79 (3), 1533-1542 (2005).</li>
<li>Shapiro, H. M. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aShapiro%2C+HM+%22Practical+Flow+Cytometry%22">Practical Flow Cytometry</a>. , John Wiley & Sons, Inc. 101-223 (2005).</li>
</ol>

Yazarlar herhangi bir çıkar çatışması beyan etmemektedir.

Geleneksel akış sitometrelerinde bireysel düzeyde 18 fiziksel ve kimyasal özelliklerine göre hücrelerin analiz etmek için önemli bir araçtır kalır. akış temel ilkeleri sitometri gelişimi beri değişmiş değil: Lazer ışınına geçer ve ışık dağıtır hücre hücre bağlı floresan antikorlar tarafından yayılan floresan spektrumları kayıt tetikleyen bir olay oluşturur. Onlar en 18 ışık toplamak yok akış sitometresi hangi büyük açılar altında daha fazla ışık dağılım olarak 300 nm altında daha küçük parçacıkların bir Sitometre yan dağılım ile tespit edilemez. Burada anlatılan teknik, tanımlama ve floresan tetikleme geleneksel akış sitometrelerinde sayısız bireysel virüs ya da AGH birden antijenlerin analizi sağlar. protokolü içinde kritik adımlar MNPS antikorların bağlantı vardır. Bizim deneyler performan- edildiMed bir reaktif grup karboksilik asit ile 15 mil demir oksit nano-tanecikleri kullanılarak, daha önce tarif edildiği gibi 9. Üreticiye göre, her bir 15 mil MNP 20 antikorlarının fazla bağlanırlar; Biz yaklaşık 15 nm MNP başına 10 antikorları bağlarlar. Bu tahmin önce ve birleştirme sonrası antikor miktarı ve nanoparçacık karakterizasyonu ve boyutlandırma cihazlarla ölçülerek boncuk / mL sayısına dayanır. Prensip olarak, birleştirme partiküllerinin agregasyonunu neden olabilir ve istenmeyen olabilir. Bu toplama bizim protokol ile olmuyor kontrol etmek için, biz nanoparçacık karakterizasyonu ve boyutlandırma enstrümantasyon ile bu doğrulandı. Bu cihaz kaplama ve antikor katmanları ziyade sadece 15 nm çekirdek içeren parçacıklar için hidrodinamik çap ölçer. Biz birleştiğinde boncuk çoğunluğu tek bir zirvede yer aldığını (73 ± 7.3 nm altındaki tüm olayların% 90 ile 64.7 ± 4.2 nm zirveye demek) bulundu. Ab-MNP co karıştırmaSağ orantılı virionlar ya AGH mplexes MNPS EVs / virionlar daha yüksek birkaç emir konsantrasyonunda yani çok önemlidir. Bu tek EVs / virionlar analiz olduğundan emin olmak için önemlidir. Düşük debide sitometresinde çalıştırarak olayların tesadüfler kaçının. floresan üzerinde edinimi tetikleyebilir ve yakalanan kişilerin konsantrasyonunu ölçmek için hacimsel denetimlerini kullanmak için emin olun. Bununla birlikte, çapraz bağlama MNPS veya aynı nanopartikül iki veya daha fazla virion arasında bağlanarak EVs veya virionlar burada toplayabilir. Bunu kontrol etmek için, Şekil 4&#39;te tarif edildiği gibi toplama için bir test gerçekleştirilmelidir. Hatta tek tek yakalanan virionlar veya AGH aynı anda akış sitometresinin lazer ışınını girebilir. Bu iki farklı antijen için yanlış pozitif yaratacak. Bunu önlemek için, tarif edildiği gibi akış sitometrisi ayarlanmalıdır ve preparasyonlar seyreltilmelidir. Bir aynı kullanarak tesadüf oluyor olmadığını kontrol edebilirsinizBir önceki nokta açıklandığı gibi strateji. Ayrıca, rastlantı olmaması hazırlama seri dilüsyonları analiz etmek ve floresan lekeli antijenin ortalama florasan yoğunluğu tüm seyreltileri (Şekil 5) sabit kalırken olay sayısı dilüsyonu ile doğrusal olarak azalmaktadır ispatlanması belirlenebilir. Başka bir sorun çok az virüs / AGH yakalanabilir olmasıdır. Bunun nedeni virüsler / spesifik MNPS tarafından yakalanır hangi aracılığıyla antijenleri taşıyan AGH gerçek kıtlığı olabilir. Alternatif olarak, yakalama etkinliği çeşitli nedenlerden dolayı düşüktür (örneğin, MNPS, bu protokol için geliştirilen virionlar / AGH ile MNPS oranları sapma, vb antikorların verimsiz bağlantı). İkinci olasılığını önlemek için, yakalama etkinliği özellikle değerlendirilmelidir. Tipik haliyle, verimlilik, Şekil 6&#39;daki gibi yaklaşık% 90 olmalıdır. Farklı antikorlar nedeniyle engelleyebilirbirbirleriyle veya MNPS bağlı antikorlar ile sterik engelleme. Bunun üzerine serbest dalgalı Abs Daha sonraki ayrılığı Ab-MNP kompleksleri ilk floresan algılama Abs ile boyanmış olmalıdır Bölüm 7. Kısaca, virionlar veya AGH açıklanan ve daha sonra yakalanan bir ters yakalama protokolü (test edilmelidir olmadı kontrol etmek için manyetik sütunlar. Akış virometry virionlar ya EVs antijenik bileşimi analizi, mevcut yöntemlere göre önemli avantajlara sahiptir. Rutin biyokimyasal yöntemler hazırlıklarında belirli proteinlerin genel varlığına rapor, ancak virionlar veya EVs heterojenliği hiçbir bilgi sağlar. Bu büyük ticari olarak temin edilebilen parçacıkları üzerinde virionlar ya EVs Immunocapture içerir. Bu parçacıklar çapı birkaç mikron arasında tipik olarak ve her biri virionlar ya EVs yüzlerce ya da binlerce yakalayabilir. Bu nedenle, herhangi bir sonraki analiz ortalamalara virionlar / AGH özellikleribir parçacık tarafından yakalanan. Bunun aksine, akış virometry olayların en az% 90 tek bir virion, ya da tek bir EV temsil çapında ve tarif edilen protokol ile 10-15 nm MNPS kullanır. Ana sınırlama hazırlık virionlar veya EVs tüm nüfus analiz olmayabilir, ama sadece o yakalanır söyledi. Bu nedenle, virionlar ya EVs yakalanır, üzerinden antijen seçimi kritik hale gelir. Ayrıca farklı antijenlerin sayısı (çeşitli antijenlere karşı floresan antikorlar sayısı) sitometrisi farklı akış virionlar ya EVs küçük bir yüzey ile sınırlandırılmıştır. Son olarak, farklı antikorlar sterik nedeniyle küçük (hücrelere kıyasla) yüzeye tekrar birbirleri ile etkileşime girebilir. Mevcut protokolü de yakalanabilir nedeniyle, özel antikorlar mevcut olduğu sürece, herhangi bir virüs ya da herhangi bir kökenli EV analizi için adapte edilebilir. Bireysel virionlar izin üzerindeki antijenlere Analizis araştırmacılar, viral popülasyonların farklı fraksiyonları patogenezi ele. Ayrıca, plazma bireysel EVs tanımlanması mümkün özellikle hücrelere EVs izini ve normal veya patolojik bu hücrelerin koşulları ve içinde bulundukları organ hakkında rapor yapabilir.

çok hücreli organizmalarda hücreler, belirli bir hücre için özel olarak mevcut ya da en azından hücre özel gruplarına ait olabilir birçok bireysel özelliklere sahiptir. onların çeşitli morfoloji ile kanıtlandığı gibi, hatta kültürlü klonlanmış hücreler bireysel özellikleri göstermektedir. Ayrıca, bir hücrenin bireysellik o salgılar ürünlerde yansımaktadır. viral enfeksiyon durumunda, viral partiküller onları üreten hücrelerden proteinlerin taşıyabilir. Örneğin, HIV için birçok konakçı hücre proteinleri viral zarf gömülür ve farklı hücreler tarafından üretilen virüs, bu karakteristik proteinleri, 1, 2 ya da &quot;hücre imza&quot; taşıyabilir. Hatta enfeksiyon olmadan, hücreler çevredeki medya, küçük hücre dışı veziküller (AGH) içine bırakın. Bu veziküller ve birçok durumda da yapının Biogenesis, virüsler, özellikle retrovirüsler bu benzerler. Son yıllarda netleştiBaşlangıçta &quot;trombosit toz&quot; 3 olarak kabul edildi AGH, hücre-hücre iletişim önemli bir fizyolojik sistem oluşturduğunun. Birlikte arası iletişim, yani hücre-hücre temas etkileşimlere ve serbest çözünür moleküllerin iki diğer sistemlerle EVS normal fizyoloji koordine etmek ve çeşitli patolojilerin viral enfeksiyonlar 6, 7 de dahil olmak üzere 4, 5 değiştirilir. serbest viral partiküller ve hücre dışı kesecikler hem oldukça çeşitli olmasına rağmen, onların bireysel özellikleri kaybolur hangi toplu analizi ile ağırlıklı olarak karakterize edilir. Farklı yüzey antijenleri göre hücreler fenotip akış sitometrisi benzer bir yöntem olup, ayrı ayrı, viral ve viral-benzeri partiküller karakterize etmek için gereklidir. Ne yazık ki, AGH veya küçük virionlar standart akış CYTO kullanılarak analiz edilemezmetry yöntemler onlar en sitometrelerinde tetiklenmesi için dayandığı ışık saçılım sinyali üretmek için çok küçük olduğu için. Bu sınırlamayı aşmak için, tetikleme floresans uygulanabilir. AGH veya virionlar floresan antikor ile boyandı eğer Ancak, çünkü onların benzer floresan ve karşılaştırılabilir boyutlarda serbest antikorlar ve onların agrega ayırt etmek zordur. Son zamanlarda, düzenli akış sitometre 8, 9 kullanarak bireysel küçük parçacıkların üzerindeki antijenlere karakterizasyonu sağlayan bir nanoteknoloji tabanlı yüksek verimlilik yöntem geliştirdi. Muhtelif uygulamalar 10, 11, 12, 13, diğer gruplar tarafından tarif edilmiş gibi, ilgi konusu Immunocapture partiküllerine MNPS kullanır; Ancak, bizim yeni teknik bireysel speci yakalanması için izin verirfic hedefleri serbest dalgalı antikorlar müdahalesi olmaksızın, ışık saçılması yerine tetikleme floresan kullanılarak flow sitometri ile bu yakalanan parçacıkların feno izledi. Bu yöntem geniş bir uygulama alanı vardır ve in vivo olarak hücreler tarafından üretilen herhangi bir vira- ve viral olmayan küçük bir parçacık antijenik bileşimi karakterize etmek için kullanılabilir ve in vitro olarak bir yüzey antijenine karşı spesifik floresan antikorlar durumu Resim. Biz zaten birkaç biyolojik sorunları incelemek için bu tekniği uyguladık. Özellikle, bireysel HIV-1 parçacıkların 9 konak hücre belirteçleri dağılımını değerlendirdi, biz onların yüzey proteinleri 14 analizine dayanan bireysel Dang virüsleri (DENV) olgunlaşmasını okudu ve sağlıklı gönüllüler ve hastalar kan dolaşımına salınır AGH araştırıldı akut koroner sendrom (AKS). benzer prensiplere göre, ancakYeni yöntemin uygulanması aşağıda açıklanmaktadır özel protokoller geliştirilmesini gerektirmiştir.

<table><tbody><tr><td><güçlü > Malzemeler< / güçlü ></td><td></td><td></td><td></td></tr> <tr><td>Karboksil Manyetik Demir Oksit Nanopartiküller Konjugasyon Kitleri</td><td>Ocean Nanotech</td><td>ICK-15-005</td><td></td></tr><tr><td>Ultracel-100 membranlı Amicon Ultra-4 Santrifüj Filtre Ünitesi</td><td>Millipore</td><td>UFC810024</td><td></td></tr><tr><td>5 ml Yuvarlak Alt PP Test Tüpü, Kapaksız</td><td>Falcon</td><td>352002</td><td></td></tr><tr><td>DEPC ile tedavi edilmiştir su</td><td>Kalitesi Biyolojik&nbsp;</td><td>351-068-131</td><td></td></tr><tr><td>SuperMAG-01 manyetik ayırıcı ve nbsp;</td><td>Ocean Nanotech</td><td>SuperMAG-01</td><td></td></tr><tr><td>Zenon R-Phycoerythrin Fare IgG1&nbsp; Etiketleme</td><td>Kiti Thermo Fisher Scientific</td><td>Z25055</td><td></td></tr><tr><td>Omega Membranlı Nanosep Santrifüj Cihazları 100k</td><td>Pall Corp</td><td>OD100C34</td><td></td></tr><tr><td>EDTA 0.5 M</td><td>Corning Cellgro</td><td>46-034-CI</td><td></td></tr><tr><td>Sığır Serumu Albümin çözeltisi</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A9576-50ML</td><td></td></tr><tr><td>PBS</td><td>Gibco</td><td>10010-23</td><td></td></tr><tr><td>Paraformaldehit, EM Sınıfı, Saflaştırılmış</td><td>EMS</td><td>15710</td><td></td></tr><tr><td>123 adet eBeads&nbsp;</td><td>eBioscience</td><td>01-1234-42</td><td></td></tr><tr><td>CytoCount boncukları</td><td>Dako</td><td>S2366</td><td></td></tr><tr><td>AccuCheck sayım boncukları</td><td>Invitrogen</td><td>PCB100</td><td></td></tr><tr><td>Sitometre Kurulumu ve İzleme Boncuk Kiti (CST)</td><td>BD Bioscience</td><td>642412</td><td></td></tr><tr><td>Vybrant DiI Hücre Etiketleme Çözümü</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>V22885</td><td></td></tr><tr><td>Name<</td><td>strong>Company</strong<></td><td>strong>Katalog Numarası</td><td>Yorumlar</td></tr><tr><td>Equipment</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>&mikro; MACS sütunu&nbsp;</td><td>Miltenyi Biotec</td><td>130-042-701</td><td></td></tr><tr><td>OctoMACS Ayırıcı mıknatıs</td><td>Miltenyi Biotec</td><td>130-042-108</td><td></td></tr><tr><td>Nanodrop</td><td>ThermoFisher</td><td>yok NanoSight</td><td></td></tr><tr><td>NS300</td><td>Malvern</td><td>yok</td><td></td></tr><tr><td>BD LSRII akış sitometresi</td><td>BD Bioscience</td><td>yok</td><td></td></tr><tr><td><güçlü>Adı</td><td>Company</td><td>Katalog Numarası</td><td>Comments</td></tr><tr><td>Software</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Flowjo yazılımı</td><td>Flowjo</td><td></td><td></td></tr><tr><td>BD FACSDiva yazılımı</td><td>BD</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

virionlar antijenik spectra ve ekstrasellüler veziküllerin analiz virometry akış

Flow Virometry to Analyze Antigenic Spectra of Virions and Extracellular Vesicles

Hücreler, çevredeki ortama küçük hücre dışı veziküller (EV'ler) salar. Virüs enfeksiyonu üzerine hücreler ayrıca bazı EV'lerle aynı boyutta olan viryonları serbest bırakır. Hem virionlar hem de EV'ler, onları üreten hücrelerin proteinlerini taşır ve antijenik olarak heterojendir. Çeşitliliklerine rağmen, hem virüsler hem de EV'ler ağırlıklı olarak toplu analizlerle karakterize edildi. Burada, düzenli akış sitometreleri kullanarak tek tek küçük parçacıklar üzerindeki antijenlerin karakterizasyonuna izin veren orijinal bir nanoteknoloji tabanlı yüksek verimli yöntemi açıklıyoruz. Virüsler veya hücre dışı veziküller, yüzey antijenlerinden birini tanıyan antikorlara bağlı 15 nm manyetik nanopartiküller (MNP'ler) ile immüno-yakalandı. Yakalanan virionlar veya veziküller, diğer yüzey antijenlerine karşı floresan antikorlarla inkübe edildi. Elde edilen kompleksler, bağlanmamış antikorlardan manyetik kolonlar üzerinde ayrıldı ve floresan üzerinde tetiklenen geleneksel akış sitometreleri ile analiz edildi. Bu yöntemin geniş uygulamaları vardır ve in vivo ve in vitro hücreler tarafından üretilen herhangi bir viral ve viral olmayan küçük partikülün antijenik bileşimini karakterize etmek için kullanılabilir. Burada, konak hücre belirteçlerinin bireysel HIV-1 partikülleri üzerindeki dağılımını değerlendirmek, bireysel Dang virionlarının (DENV) olgunlaşmasını incelemek ve kan dolaşımına salınan hücre dışı vezikülleri araştırmak için bu yöntemin kullanımına ilişkin örnekler sunuyoruz.

HIV-1 viryonlarıyla hücresel antijenlere seçici yakalama &quot;Akış virometry&quot; ile bireysel viral parçacıkların hücresel antijenleri görselleştirmek için artık mümkün. Bir örnek olarak, HIV-1, LFA-1, HLA-DR tarafından taşınan iki hücre antijenleri üzerinde odaklanmıştır. Daha önce, bu iki antijen toplu 1 &#39;de analiz, HIV-1 preparasyonlarda tespit edilmiştir. Bu MNPS Env HIV proteini, VRC01 karşı antikorların birisi ile bağlanmış ve (periferal kan tek-çekirdekli hücreleri (PBMC), üretilen HTV-1 LAI.04 veya HIV-1 SF162), bu MNPS HİV-1 virionlar ile çekilen hazırlanabilir. Buna ek olarak, 2G12, başka bir anti-Env antikoru ile bu virionlar ile boyanmıştır. Akış virometry LFA-1 ve HLA-DR varlığı ile ilgili HIV-1 virionlar yüksek heterojen göstermiştir. Ortalama 16.7 ±% 2.0 üzerinde (n = 6) ve 8.6 ± 0.3% (n = 3), LFA-1, HLA-DR taşınan HIV-1 LAI.04 virionlar,sırasıyla. 4.8 ± 0.6% (n = 3) Tüm virionların iki antijen için pozitifti. Diğer HIV-1 suşu, HIV-1 SF162, bu antijenler 20.0 ±% 4.4 mevcut (n = 6) ve 10.8 ± 1.3% (n = 6) sırası ile virionlar, ve, her iki antijen de 6.5 ± tarafından taşınır, oysa % 0.4 (Şekil 1). Hücresel protein dağılımı virüsü çoğaltılmış hücrelerine bağımlıdır. Enfekte PBMC tarafından üretilen gelen antijenik farklı virionlar üretilen Jurkat hücreleri, HIV-enfekte edilmiştir. Jurkat hücreleri tarafından üretilen HTV-1 LAI 0.4 virionları 1.6 ± 1.4% gerçekleştirilmiştir (n = 3) ve 1.6 ± 0.7% (n = 4), LFA-1, HLA-DR, sırasıyla. Jurkat hücrelerinde üretilen HTV-1 SF162 virionlar, bu parametreler (N = 4) 7.2 ± 2.5% (n = 3) ve 5.6 ± 2.7% idi. Bu nedenle, (en azından HLA-DR ve LFA-1) antijenik makyaj, HIV-1 LAI.04 iki farklı hücre tarafından üretilen farklı olduğutürleri (p &lt;0.02). Dang virüsü değerlendirilmesi uygulanan virometry Akış DENV matürasyon viryonları üzerindeki prM proteinin ifadesi ile ilişkilidir. Biz olgun virüsleri oluşturan BHK-1 üretilen DENV ne fraksiyonu ve LoVo hücreleri değerlendirmek için akış virometry uyguladı. Viryonlar bir lipidik boya DII ile boyandı. Bireysel yakalanan virionlar Analizi 48.2 ± 5.3% üzerinde PRM ortaya (n = 8) DENVs evi. Bunun aksine, 84.5 ± 3.4% (n = 4) DENV bölgesinin prM taşınan LoVo hücreleri gösterdi. Virionlar geri kalanı, sırasıyla 51.8 ± 5.3% (n = 8) ve 15.5 ± 3.4% (n = 4) idi prM negatif (Şekil 2). Bu nedenle, akış virometry olgunlaşmamış (veya kısmen olgun) DENV vırıonlardan tam olarak olgun tek tek DENV ayırt etmek için kullanılabilir. Ekstrasellüler veziküller sağlıklı kan dolaşımına salınırAkut koroner sendrom ile gönüllüler ve hastalar (AKS) ACS ve sağlıklı hastalarda farklı EV alt kümelerini araştırmak amacıyla, floresan CD31, CD41a, CD63 ya da karşı antikorlarla MNPS birleştirilmiş platelet zayıf plazma (PPP) gelen EVS ele. CD31-MNPS tarafından yakalanan EVs CD41a-MNPS tarafından yakalanan EVs CD31 ve CD63 için boyandı, CD41a ve CD63 için boyandı ve CD63-MNPS tarafından yakalanan EVs CD31 ve CD41a (Şekil 3) için boyandı. AKS hastalarında tespit antikorların bir ya da iki pozitif CD31-MNPS tarafından ve esir AGH miktarı 3359 [2328 idi; 5.472] EVs / 1.272 [714 ile karşılaştırıldığında ul; 2.157] EVs / sağlıklı gönüllülerde (p = 0.001) | il. Sağlıklı gönüllülerde ile karşılaştırıldığında AKS hastalarında CD63 tarafından yakalanan AGH tutarı 3541 [1318 idi; 5173] AGH / ul vs. 806 [488; 2112] AGH / ul (p = 0.007). 4752 [3238 vardı; sağlıklı gönüllülerin plazmasında bu sayı önemli ölçüde daha düşük iken 7,173] EVs /, CD41a-MNPS tarafından yakalanan ACS hastaların plazmasındaki 2.623 [1.927 ul; 4188] AGH / ul (p = 0,015). Genel olarak, elde ettiğimiz sonuçlar EV miktarları çoğunlukla AKS hastalarında artarken, artış büyüklüğü EVs farklı alt popülasyonlarda farklı olduğunu göstermektedir. <img alt="Şekil 1" src="/files/ftp_upload/55020/55020fig1.jpg" /> Şekil 1: Farklı hücre tipleri de replike HIV-1 virionlar hücresel antijenlere seçici olarak dahil edilmez. PBMC&#39;ler veya Jurkat hücreleri tarafından yayımlanan, HIV (HIV-1 veya HIV-LAI.04 1 SF162) viryonlar VRC01-MNPS çekilir ve ikinci anti-gp120 antikor 2G12 ve HLA-DR ve LFA-1&#39;e karşı özel antikorlar ile boyandı. boyama yöntemi, HLA-DR (beyaz çubuklar) ve LFA-1 (siyah BA akış analizi tabi tutulmuşturrs). Üç ila altı deneyler 9 ± SEM. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55020/55020fig1large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> <img alt="şekil 2" src="/files/ftp_upload/55020/55020fig2.jpg" /> Şekil 2: DENV virionlar Olgunlaşma durumu. Üretilen DENV BHK-21 hücreleri (A, B) ya da LoVo hücrelerinin (C, D) &#39;de 2H2 antikorları (A, C) ya da prM proteini için boyanmış, yoğunluk gradyanlı bir ortam içinde Ultrasantrifüje edildikten sonra, lipidik boya DII ile etiketlenmiş edildi ve izotip kontrol IgG2a (B, D). Etiketli virionlar sonra 3H5-1-MNPS çekilir ve analizi 14 akış tabi tutuldu. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55020/55020fig2large.jpg" target="_blank">Bu daha büyük bir versiyonunu görmek için buraya tıklayınız</a>rakam. <img alt="Şekil 3," src="/files/ftp_upload/55020/55020fig3.jpg" /> Şekil 3: AKS hastalar ve sağlıklı kontrollerden AGH analizi. Plazma EVs CD31-MNPS, CD63-MNPS ya CD41a-MNPS çekilir ve CD31 ve CD41a karşı CD41a ve CD63 karşı sırasıyla CD31 ve CD63, karşı antikorlar ile boyandı. Algılama antikorların en azından biri ile boyanmış Yakalanan EVs, görsel ve akış analizi numaralanmıştır. Veriler ortanca ve çeyrekler arası aralık (IQR) ile nokta arsa olarak sundu. Yeşil sembolleri: Sağlıklı gönüllüler (kontrol), kahverengi sembolleri: AKS hastalar. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55020/55020fig3large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> <img alt="Şekil 4," src="/files/ftp_upload/55020/55020fig4.jpg" /> Şekil 4: erlendirmesiBireysel virionlar temsil akış olaylarının fraksiyonu üzerine. (A) HIV-1. Virionlar Süspansiyon iki bölüme ayrılır ve her iki mi (sol panel) ve DIO (orta panel) ile boyandı. Karıştırma işleminden sonra, iki farklı şekilde boyanmış virüsleri içerdi Süspansiyon, VRC01-MNPS çekilir ve virometry (sağ panel) akış tabi tutuldu. Agrega (çift renkli olaylar) toplam olayların% 10&#39;dan az oluşturmuştur. (B - D) DENV. 1: 2: DII lekeli viryonlann Süspansiyon seri 1 iki defa seyreltilmiştir 256 ve bir akış sitometresinde (B) üzerinde HTS ile elde. DII DENVs 2H2 antikorları (C) veya DII DENVs ile etiketlenmiş 3H5-1-MNPS (D) ele geçirildi. 1: 2: Hazırlık C ve D daha sonra seri olarak 1 ile iki kat seyreltilmiştir ve 256 HTS 14 ile elde. Virionlar orada her durumda bu yana bir araya görünmemektedirseyreltme faktörü ve olayların sayısı arasında doğrusal bir ilişki olduğunu. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55020/55020fig4large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> <img alt="Şekil 5," src="/files/ftp_upload/55020/55020fig5.jpg" /> Şekil 5: akış sitometresi ile tek parçacıkların tespiti. 1: 2: DII lekeli DENV süspansiyonu seri 1 iki defa seyreltilmiştir 2.048 ve bir akış sitometresi üzerinde bir HTS kullanılarak elde. Seyreltme faktörü bir fonksiyonu olarak tespit edilen virüs (A) sayısı. (B) ortalama florasan yoğunluğu (MFI) DII DENV 14 etiketli. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55020/55020fig5large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> <img alt = &quot;Şekil 6&quot; src = &quot;/ files / ftp_upload / 55020 / 55020fig6.jpg&quot; /&gt; Şekil 6: virionlar ve spesifik antikorlara bağlanmış MNPS çekilen hücre dışı veziküllerin fraksiyonunun değerlendirilmesi. Işaretli HIV-1 virionlar ya EVs MNPS spesifik antikorlara bağlı olan ve virometry akış işlemine tabi ile yakalandı. Manyetik sütun üzerinde ayrılmasından sonra, akış oranı (korunmaz) fraksiyonlar ilk aşamada cevapsız virionlar veya ilgi duyulan EVS varlığı için analiz edildi. (A) işaretli HIV-1 BaL viryonlar 2G12-MNPS (sol panel) ele geçirildi. Akış fraksiyonu yeniden yakalanıp virometry (sağ panel) akış tabi tutuldu. İlk çevrimde ilgi virionlar yaklaşık% 95 ele geçirildi. (B) olarak tanımlanan EVs, anti-CD81 MNPS çekilir ve manyetik sütun (sol panel) üzerinde izole edilmiştir. Flow-through fraksiyonu yeniden yakalanır ve (sağ panel) analiz edildi. İlk olarakilgi veziküllerin döngüsü yaklaşık% 99 8 ele geçirildi. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55020/55020fig6large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a>

Virüsler veya hücre dışı veziküller, yüzey antijenlerini tanıyan antikorlara bağlı 15 nm manyetik nanopartiküller ile immüno-yakalandı. Yakalanan virionlar veya veziküller, diğer yüzey antijenlerine karşı floresan antikorlarla etiketlendi. Elde edilen kompleksler yüksek manyetik alanda ayrıldı ve floresan üzerinde tetiklenen geleneksel akış sitometreleri ile analiz edildi.

Virionlar antijenik Spectra ve ekstrasellüler veziküllerin Analiz Virometry Akış

Cells release small extracellular vesicles (EVs) into the surrounding media. Upon virus infection cells also release virions that have the same size of ...

Bu prosedürün genel amacı, geleneksel bir akış sitometresi ile tek virionların veya tek hücre dışı veziküllerin yüzeyindeki çoklu antijenleri tanımlamak için manyetik parçacıklar veya MNP'ler kullanmaktır. Bu yöntem, insan hastalıklarında, özellikle viral enfeksiyonlarda, veziküllerin ve virüslerin fenotipi ve işlevi arasındaki ilişkinin doğası gereği bize yardımcı olabilir. Bu tekniğin temel avantajı, bu parçacıkların bireysel özelliklerinin kaybolduğu toplu analiz yerine tek virionların veya tek hücre dışı veziküllerin analizine izin vermesidir.Bu yöntem, viral partiküllerin uygun testi hakkında bilgi sağlayabilir, ancak uygun antikorların mevcut olması koşuluyla diğer sistemlere de uygulanabilir. Genel olarak, bu yönteme yeni olan kişiler mücadele edecektir, çünkü akış sitometresinin uygun şekilde kurulması da dahil olmak üzere analizden önce tüm adımların doğrulanması ve kontrol edilmesi gerekir. Koşul başına 60 mikrolitre MNP'yi ve 1.5 mililitrelik bir mikrosantrifüj tüpünde ilgilenilen yakalama antikorunun izotipine özgü beş mikrolitre etiketli FAB fragmanını birleştirerek başlayın.Çözeltiyi sürekli karıştırarak oda sıcaklığında 30 dakika inkübe edin. Daha sonra 100K'lık bir yoğunlaştırıcıyı 300 mikrolitre PBS ile önceden ıslatın ve yoğunlaştırıcıyı mikrosantrifüjde döndürün. Santrifüjlemenin sonunda, etiketli kompleksleri 100K'lık bir kolon üzerinde saflaştırın ve ardından peleti 200 mikrolitre taze PBS'de yeniden askıya alan başka bir mikrosantrifüjleme yapın.İlgilenilen parçacıkları yakalamak için, MNP etiketli antikoru, uygun inkübasyon süresi ve sıcaklığı için ilgilenilen parçacık ile inkübe edin. Daha sonra, herhangi bir spesifik olmayan FC bağlanmasını uygun IGG antikoru türleri ile bloke edin, hafifçe girdap yapın ve parçacık çözeltisini oda sıcaklığında üç ila beş dakika inkübe edin. Daha sonra, oda sıcaklığında 20 dakikalık ek bir inkübasyon için her bir tespit antikorunun üretici tarafından önerilen konsantrasyonunu partiküllere veya izotip kontrol antikorlarını izotip kontrol numunesine ekleyin.MNP ile yakalanan partikülleri bağlanmamış antikordan ayırmak için, önce bir ayırıcı mıknatısa manyetik bir ayırma sütunu yerleştirin ve sütunu 500 mikrolitre yıkama tamponu ile önceden ıslatın. Yıkama tamponunun kolondan akmasına izin verin, ardından MNP partikül komplekslerini kolona ekleyin ve akışı bir atık kabında toplayın. Karmaşık çözeltinin tamamı kolondan geçtiğinde, kolonu 500 mikrolitre yıkama tamponu ile üç kez yıkayın.Ardından sütunu 12 x 75 milimetrelik bir tüpe aktarın. Üç dakika sonra, boncukların yerçekimi ile elüsyonuna izin veren 200 mikrolitre PBS ekleyin. PBS'nin tamamı kolondan geçtiğinde, tüpe 200 mikrolitre taze PBS ekleyin ve parçacıkları 200 mikrolitre% 4 paraformaldehit ile sabitleyin.Daha sonra, 0.22 mikron filtrelenmiş PBS'yi bir akış sitometresine yükleyin ve filtrelenmiş PBS sıfır ila çok az olay gösterene kadar sitometre üzerindeki PMT voltajını ayarlayın. Ardından, herhangi bir yanlış olayı daha da ortadan kaldırmak için standart 0,2 mikron kılıf filtresinin arkasına seri olarak yerleştirilmiş kılıf sıvısı için 0,04 mikronluk sıralı filtre ile düşük akış kullanarak MNP yakalanan parçacıkları çalıştırın. Flow virometrisi ile artık tek tek viral partiküller üzerinde hücresel antijenleri görselleştirmek mümkündür.Örneğin, bu deneyde, virüsü kopyalayan hücrelere bağlı olan viral partikül yakalama ile LFA-1 ve HLA-DR'nin varlığı için yüksek bir HIV-1 viriyonlarının heterojenliği gözlenmiştir. Dang virüsü olgunlaşması, az önce gösterildiği gibi akış virometrisi kullanılarak ayırt edilebilen virionlar üzerindeki öncü membran proteinlerinin ekspresyonu ile ilişkilidir. Bu temsili deneyde, akut koroner sendromlu hastalarda farklı hücre dışı virüs alt kümelerini araştırmak için çeşitli floresan MNP bağlantılı antikorlar kullanılarak trombositten fakir plazmadan hücre dışı veziküller yakalandı.Flow virometry analizi, akut koroner sendromlu hastalarda genel hücre dışı vezikül sayılarının sağlıklı donör kontrollerine kıyasla çoğunlukla artmasına rağmen, artışın büyüklüğünün farklı hücre dışı vezikül alt popülasyonları arasında değiştiğini belirledi. Bir kez ustalaştıktan sonra, bu teknik düzgün bir şekilde yapılırsa iki saat içinde tamamlanabilir. Bu prosedürü denerken, analize başlamadan önce akış sitometrenizi doğru şekilde kurmayı unutmamak önemlidir.Bu tekniğin geliştirilmesi, viroloji ve hücre dışı biyoloji alanındaki araştırmacıların, bu parçacıkların in vitro sistemde ve insan ve hayvan örneklerinde normal ve patolojik süreçlerdeki rollerini araştırmaları için bir yol açmıştır. Bu prosedürü takiben, PCR veya kütle spektrometresi gibi diğer yöntemler, özel olarak yakalanan EV'lerin veya virüslerin hangi proteinleri veya RNA veya DNA moleküllerini taşıdığı gibi ek soruları yanıtlamak için gerçekleştirilebilir. Umarım bu videoyu izledikten sonra, tek tek virionların veya tek tek hücre dışı veziküllerin antijenik bileşimini nasıl analiz edeceğinizi iyi anlamışsınızdır.

flow-virometry-to-analyze-antigenic-spectra-virions-extracellular

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

İmmünoloji ve Enfeksiyon

Tek Parçacık Düzeyinde Viral Fusion Kinetik Ölçüm yöntemi

Tek Virüs Genomik (SVG) tek Virons en genom izole etmek ve yükseltmek için bir yöntemdir. Karışık malzeme grubuyla viral süspansiyonları böylece virion yakalama ve alt işleme sırasında genom kesme azaltarak, agaroz içeren ayrık kuyu ile bir mikroskop lamı üzerine akım sitometri kullanılarak sıralanır. Tüm genom amplifikasyonu sekanslama için uygun olan genomik malzeme ile sonuçlanan birden fazla yer değiştirme amplifikasyonu (MDA) kullanılarak elde edilir.

&#39;Tek Virüs Genomik&#39; kullanarak Tek viryonlar İzolasyonu ve Genom Analizi

Bu video, floresan işaretli yakalama antikoru-manyetik nanopartikül konjugatları kullanılarak hücre dışı veziküllerin immüno-yakalanmasını göstermektedir. İşlem, karmaşık oluşum, floresan etiketli tespit antikorları ile boyama, manyetik ayırma ve antijenik karakterizasyon için akış sitometrik analizini içerir.

Antijenik Karakterizasyon için Hücre Dışı Veziküllerin İmmünoyakalama ve Akış Sitometrisi

Virionların yüzeye bağlanması, Süper çözünürlüklü floresan görüntüleme veya atomik kuvvet mikroskopisi (AFM) ile tek virion görüntüleme için bir gerekliliktir. Burada, VIRIONların AFM ve süper çözünürlüklü floresan görüntülemede kullanıma uygun cam yüzeylere kontrollü yapışıklık için örnek bir hazırlama yöntemi gösteriyoruz.

Tek Virion Atomik Kuvvet Mikroskopisi ve Süper Çözünürlüklü Floresan Görüntüleme için Numune Hazırlama

Bu yazının nano ölçekli yapının kesin modellerini üretmek için süper çözünürlüklü mikroskopi görüntülere tek parçacık analizi uygulamak için Fiji tabanlı açık kaynak yazılım paketi VirusMapper kullanır.

VirusMapper Süper çözünürlüklü Mikroskopi Açık kaynak Tek parçacık Analizi

Bu protokol için hızlı izole edilmesi insan tam kan üzerinden ekstraselüler veziküller ve belirli işaretleri karakterizasyonu için tam iş akışı floresans tabanlı nanopartikül izleme analizi ile açıklanmaktadır. Sunulan sonuçlar tekrarlanabilirlik yüksek düzeyde göstermek ve hücre kültür supernatants için ayarlanabilir.

İnsan kanı nanopartikül izleme analizi ile tek hücre dışı veziküller floresans tabanlı hızlı karakterizasyonu

Bu makale, hücre dışı vezikül alt kümelerinin karakterizasyonu için artan verime sahip yeni nesil multiparametrik analitik platformlar önermektedir. Yöntem, bir mikroarray biyoçipinde sıkışmış veziküler hedefleri nitelemek için Raman spektroskopisi ile birleştiğinde, atomik kuvvet mikroskobu ile metrolojik ve morfomekanik analizlerle çoklanmış biyosensing yöntemlerinin bir kombinasyonuna dayanmaktadır.

Hücre Dışı Vezikül Alt Kümelerinin Analizi için Çok Katlı Yüzey Plazmon Rezonans Görüntüleme Çipi Üzerinde Multimodal Analitik Platform

Burada, anjiyotensin dönüştürücü enzim-2'ye bağlı manyetik mikroküreler tarafından yakalanan sağlam şiddetli akut solunum sendromu koronavirüs 2 (SARS-CoV-2) viral partikülleri üzerinde iki benzersiz spike protein epitopunu aynı anda tespit etmek için çift raportörlü bir akış sitometrik sistemi kullanan yeni geliştirilmiş bir multipleks floresan immünolojik testi açıklıyoruz.

Viral Partiküller Üzerindeki Yüzey Protein Epitoplarının Multipleks Çift Raportör Stratejisi ile Profillenmesi

Bu video protokolü, virolojik örneklerin taramalı transmisyon elektron mikroskobu tomografisinin nasıl gerçekleştirileceğini göstermektedir. Optimum sonuçlar için numuneler, yüksek basınçlı dondurma ve ardından dondurma ikamesi ile hazırlanır.

Virolojide Taramalı Transmisyon Elektron Mikroskobu Tomografisi: Yüksek Basınçlı Dondurulmuş, Dondurularak İkame Edilmiş Örneklerin 3 Boyutlu Görüntülenmesi

İnsan dışkı örneklerinden yüksek kaliteli viral boyutlu fraksiyon metagenomları (viromlar) üretmek için esnek bir protokol sunuyoruz. Başlangıçta toprak viromikleri için geliştirilen bu protokol, burada dışkı örneklerine başarıyla uygulanarak insan bağırsak virosferinin sağlam bir şekilde karakterizasyonu sağlanmıştır.

İnsan Dışkısı Örnekleri için DNA Viral Boyut Fraksiyonu Metagenomikleri

Öğrenin, manyetik nanopartiküller kullanarak tek virion ve ekstraselüler vezikül yüzey antijenlerini konvansiyonel akış sitometrisiyle analiz etme yöntemini. Bu teknik, bireysel parçacık heterojenliğini ortaya çıkararak HIV-1 ve Dengue virüsü fenotiplerini incelemenizi sağlar.

Virionlar antijenik Spectra ve ekstrasellüler veziküllerin Analiz Virometry Akış

Daha fazla video keşfet