Name: Nematod Popülasyona Dayalı Kemoterapi Tercihi Testinin Otomatik Analizi (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-07-13T14:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 44 s
Description: Keşfedin Caenorhabditis elegans popülasyon davranış analizi için çok kameralı video kayıt sistemi ve otomatik analiz yöntemini. Bu teknik genetik mutantların nörobiyoloji araştırmalarında hızlı ve standart davranış değerlendirmesi sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Bazı suşlar NIH Araştırma Altyapı Programları Ofisi (P40 OD010440) tarafından finanse edilen Caenorhabditis Genetics Centre (CGC) tarafından sağlanmıştır. Bu çalışma, PWS&#39;nin araştırmacı olduğu Howard Hughes Tıp Enstitüsü tarafından desteklenmektedir.

<ol><li>White, J. G., Southgate, E., Thomson, J. N., Brenner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+structure+of+the+nervous+system+of+the+nematode+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Philos+Trans+R+Soc+Lond+B+Biol+Sci%22%5BJournal%5D)">The structure of the nervous system of the nematode Caenorhabditis elegans.</a> Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 314, 1-340 (1986).</li>
<li>Bargmann, C. I., Horvitz, H. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chemosensory+neurons+with+overlapping+functions+direct+chemotaxis+to+multiple+chemicals+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Neuron%22%5BJournal%5D)">Chemosensory neurons with overlapping functions direct chemotaxis to multiple chemicals in C. elegans.</a> Neuron. 7 (5), 729-742 (1991).</li>
<li>Bargmann, C. I., Hartwieg, E., Horvitz, H. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Odorant-selective+genes+and+neurons+mediate+olfaction+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Odorant-selective genes and neurons mediate olfaction in C. elegans.</a> Cell. 74 (3), 515-527 (1993).</li>
<li>Hilliard, M. A., Bargmann, C. I., Bazzicalupo, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((C.+elegans+responds+to+chemical+repellents+by+integrating+sensory+inputs+from+the+head+and+the+tail%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">C. elegans responds to chemical repellents by integrating sensory inputs from the head and the tail.</a> Curr Biol. 12 (9), 730-734 (2002).</li>
<li>Hilliard, M. A., Bergamasco, C., Arbucci, S., Plasterk, R. H., Bazzicalupo, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Worms+taste+bitter%3A+ASH+neurons%2C+QUI-1%2C+GPA-3+and+ODR-3+mediate+quinine+avoidance+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">Worms taste bitter: ASH neurons, QUI-1, GPA-3 and ODR-3 mediate quinine avoidance in Caenorhabditis elegans.</a> EMBO J. 23 (5), 1101-1111 (2004).</li>
<li>Zariwala, H. A., Miller, A. C., Faumont, S., Lockery, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Step+response+analysis+of+thermotaxis+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22J+Neurosci%22%5BJournal%5D)">Step response analysis of thermotaxis in Caenorhabditis elegans.</a> J Neurosci. 23 (10), 4369-4377 (2003).</li>
<li>Ward, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chemotaxis+by+the+nematode+Caenorhabditis+elegans%3A+identification+of+attractants+and+analysis+of+the+response+by+use+of+mutants%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Chemotaxis by the nematode Caenorhabditis elegans: identification of attractants and analysis of the response by use of mutants.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 70 (3), 817-821 (1973).</li>
<li>Wicks, S. R., de Vries, C. J., van Luenen, H. G., Plasterk, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CHE-3%2C+a+cytosolic+dynein+heavy+chain%2C+is+required+for+sensory+cilia+structure+and+function+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">CHE-3, a cytosolic dynein heavy chain, is required for sensory cilia structure and function in Caenorhabditis elegans.</a> Dev Biol. 221 (2), 295-307 (2000).</li>
<li>Jansen, G., Weinkove, D., Plasterk, R. H. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+G-protein+subunit+gpc-1+of+the+nematode+C.+elegans+is+involved+in+taste+adaptation%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">The G-protein subunit gpc-1 of the nematode C. elegans is involved in taste adaptation.</a> EMBO J. 21 (5), 986-994 (2002).</li>
<li>Srinivasan, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+blend+of+small+molecules+regulates+both+mating+and+development+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">A blend of small molecules regulates both mating and development in Caenorhabditis elegans.</a> Nature. 454 (7208), 1115-1118 (2008).</li>
<li>Choe, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ascaroside+signaling+is+widely+conserved+among+nematodes%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Ascaroside signaling is widely conserved among nematodes.</a> Curr Biol. 22 (9), 772-780 (2012).</li>
<li>Ezcurra, M., Tanizawa, Y., Swoboda, P., Schafer, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Food+sensitizes+C.+elegans+avoidance+behaviours+through+acute+dopamine+signalling%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">Food sensitizes C. elegans avoidance behaviours through acute dopamine signalling.</a> EMBO J. 30 (6), 1110-1122 (2011).</li>
<li>Ward, A., Liu, J., Feng, Z., Xu, X. Z. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Light-sensitive+neurons+and+channels+mediate+phototaxis+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Neurosci%22%5BJournal%5D)">Light-sensitive neurons and channels mediate phototaxis in C. elegans.</a> Nat Neurosci. 11 (8), 916-922 (2008).</li>
<li>Kunitomo, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Concentration+memory-dependent+synaptic+plasticity+of+a+taste+circuit+regulates+salt+concentration+chemotaxis+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Concentration memory-dependent synaptic plasticity of a taste circuit regulates salt concentration chemotaxis in Caenorhabditis elegans.</a> Nat Commun. 4, 2210(2013).</li>
<li>Snow, J. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Two+anterograde+intraflagellar+transport+motors+cooperate+to+build+sensory+cilia+on+C.+elegans+neurons%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Two anterograde intraflagellar transport motors cooperate to build sensory cilia on C. elegans neurons.</a> Nat Cell Biol. 6 (11), 1109-1113 (2004).</li>
<li>Tobin, D. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Combinatorial+expression+of+TRPV+channel+proteins+defines+their+sensory+functions+and+subcellular+localization+in+C.+elegans+neurons%5BTitle%5D)+AND+%22Neuron%22%5BJournal%5D)">Combinatorial expression of TRPV channel proteins defines their sensory functions and subcellular localization in C. elegans neurons.</a> Neuron. 35 (2), 307-318 (2002).</li>
<li>Waggoner, L. E., Zhou, G. T., Schafer, R. W., Schafer, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Control+of+alternative+behavioral+states+by+serotonin+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Neuron%22%5BJournal%5D)">Control of alternative behavioral states by serotonin in Caenorhabditis elegans.</a> Neuron. 21 (1), 203-214 (1998).</li>
<li>Sawin, E. R. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Genetic+and+cellular+analysis+of+modulated+behaviors+in+Caenorhabditis+elegans%22">Genetic and cellular analysis of modulated behaviors in Caenorhabditis elegans</a>. , M.I.T. Cambridge, MA. (1996).</li>
<li>Ramot, D., Johnson, B. E., Berry, T. L., Carnell, L., Goodman, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+parallel+worm+tracker%3A+A+platform+for+measuring+average+speed+and+drug-induced+paralysis+in+nematodes%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">The parallel worm tracker: A platform for measuring average speed and drug-induced paralysis in nematodes.</a> PLoS One. 3 (5), e2208(2008).</li>
<li>Swierczek, N. A., Giles, A. C., Rankin, C. H., Kerr, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+behavioral+analysis+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">High-throughput behavioral analysis in C. elegans.</a> Nat Methods. 8 (7), 592-598 (2011).</li>
</ol>

Yazarların açıklayacak bir şeyi yok.

Protokolde kritik bir adım, tahlil plakalarının farklı deneysel günler boyunca tutarlı bir kuruma seviyesine sahip olmasını sağlamaktır. Farklı kuruluk seviyeleri, çözeltinin agara farklı difüzyon hızlarına ve dolayısıyla davranışsal sonuçlarda değişikliğe neden olacaktır. Böylece, deney plakaları daima deneyler öncesinde öğleden sonra taze yapılmalıdır. Her tahlil için test edilen solucanlar sayısı, tedaviler arasında karşılaştırma kolaylığı için düzenlenmelidir. Referans olarak, bir vahşi tipi sonsuz 4-10 yumurta / gr ortalama h&gt; deney başına 360 solucanlar üzerinde sonsuz senkronizasyon protokol 17 takip olup olmadığını belirlemektedir. Bazı mutant suşlar yumurta atma yeteneğine sahipse, hedef yavru sayısına ulaşmak için daha yumuşak tavuk yumurtacı solucanları seçin. Protokolün bir diğer önemli adımı, yıkama işlemi ve solucan yerleşimi sırasında solucanları hafifçe tutmaktır. Solucanlar mekanik uyaranlara duyarlıdır ve bu tür stres tepkileri ortaya çıkar<html> S tersinme ve yumurta bırakma inhibisyonu 18 . Ayrıca, video analizine başlamadan önce ROI&#39;yi doğru bir şekilde tanımlamak ve belirli aydınlatma koşulları için optimum eşik sabitini belirlemek için özen gösterilmelidir. Ayrıca, son denemenin çalıştırılmasından bu yana geçen uzun bir süre geçtikten sonra kalibrasyon ve eşik değerleme işlemlerinin tekrarlanması önerilir. Bu yöntemin bir kısıtlaması, küçük solucan popülasyonlarını denemek için uygun değildir. Bununla birlikte, gıda varlığının duyusal davranış üzerindeki etkisini belirlemek için uygun kontroller yapılırsa, solucanların uzaysal keşif yerlerini kısıtlamak için, tutma tahlilinde olduğu gibi gıda kullanımı da mümkündür. Buna ek olarak, bu metot, kullanılan yakın kontrol ve deneysel solüsyon damlaları yakınlığı ve küçük miktarları nedeniyle uyaran gradyan navigasyonunu incelemek için tasarlanmamıştır. E_content &quot;&gt; İleride çok solucanlı izleme ve tek solucan özütleme sağlayan programlama yazılımı bu sisteme entegre edilebilir 19 , 20. Tek solucan davranışının ters hızlar ve vücut virajlarının genliği gibi ince davranış parametrelerinin kaydedilmesi, Popülasyona dayalı bir tahlil bağlamında bireysel bir solucanın kemosensör davranışının daha ayrıntılı bir resmi. Tahlil, uygun ölçme büyüklüğüne sahip şırınga iğnelerini kullanarak ROI boyunca delikleri delme yoluyla alışkanlığı incelemek ve delikleri agar enfüzyonu ile doldurmak için modifiye edilebilir Deneysel bileşik veya kontrol tamponu ile karıştırma Bu, alışkanlık çalışmaları sırasında gerekli olduğu gibi daha uzun bir kayıt süresi süresi boyunca bileşiğin daha tutarlı bir yüzey konsantrasyonunu sağlayacaktır.Bu yöntemin bir başka potansiyel uygulaması, farklı nematod türleri arasında karşılaştırmalı davranış çalışmaları yapmaktır. Buna ek olarak, davranış odasıMultimodal uyarılara davranışsal tepkiler üzerinde çalışmak için birden fazla yönde değiştirilebilir. Optogenetik uygulamalar için, yüksek yoğunluklu LED dizileri, tahlilde ilgi çekici nöronları seçici olarak etkinleştirmek için kamera yuvasının yanında takılabilir. Sıcaklığın duyusal davranışlar üzerindeki etkilerini incelemek için, ısıtma elemanları, soğutma sistemleri ve sıcaklık sensörleri de kuruluma eklenebilir. Ayrıca, odorensor ve chemosensory modaliteleri arasındaki etkileşimleri araştırmak için oda içine koku iletme sistemleri kurulabilir.

Hayvancılık hayvanları, çoklu duyu yöntemlerinden gelen girdileri entegre etmeli ve çevreye başarıyla gitmek için uygun davranış stratejilerini seçmelidir. Hareketli seçimi yönlendirmek için harici duyusal girdilerin sinirsel bilgiye nasıl ulaştığını ve aktarıldığını anlamak, nörobiyoloji alanında merkezi bir hedeftir. Genetik olarak eğitilebilen nematod C. elegans , duyusal biyoloji ve multimodal entegrasyonun altında yatan sinirsel mekanizmaları incelemek için çekici bir model organizmasıdır. C. elegans&#39;ın sadece 302 nöronu olmasına rağmen, çözünebilir bileşikler, uçucu koku maddeleri ve ortam sıcaklığı 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 dahil çok çeşitli çevresel uyarıları tespit edebilir ve ayrım yapabilir.Nematod C. elegans , besin kaynaklarını lokalize etmek ve potansiyel tehditlere karşı kendisini uyarmak için kimyasal duyu aygıtına dayanır. Bu nedenle, vahşi tip ve mutant C. elegans&#39;ın kimyasal uyaranlara verdiği yanıtları taramak için tasarlanmış davranış testleri, C. elegans&#39;ın dikkat çekici duyusal yeteneklerinin altında yatan genetik, hücresel ve sinirsel mekanizmaların ayrılmasında hayati bir rol oynamaktadır. Çözünür bileşiklere verilen cevabı test etmek için, düşme testi, kemotaksis tahlili ve tutma tayini olmak üzere üç tip tahlil tarif edilmiştir. Düşme testinde, bileşimin küçük bir damlası, hareket eden bir solucanın kuyruğuna yerleştirilir ve ön solunum cihazına sıvı ulaştığında solucan ileri geri veya ters hareket etme kararı verilir 4 . Düşme testi, çok az deneysel hazırlık gerektirir ve solucanların örnek boyutu küçük olduğunda (lazerle çalışan solucanlar gibi) kullanışlıdır. Bununla birlikte, yalnızca bir solucan gibiBir seferde denenebilir ve deneyci testin süresi boyunca mevcut olmalı, damla testi zaman alıcı olabilir. Düşme testi ayrıca, bir numunedeki her solucan arasındaki damla aktarımındaki varyasyonlara karşı savunmasızdır ve bu da tahlilin genel sonuçlarını etkileyebilir. Düşme testinin bir diğer kısıtlaması, bileşiğin solucan ileri hareketinden çekici veya nötr bir etki arasında ayrım yapmanın mümkün olmadığı için yalnızca solucanın aversive bileşiklere verdiği tepkiyi tahlil etmek için kullanılabilmesidir. Çözünür bileşikler için kemotaks analizi genellikle bir agar plakasının dört kadrana bölünmesini içerir, deneysel solüsyon iki karşıt bölmenin agarına karıştırılır ve kontrol solüsyonu diğer iki kadran 8 , 9&#39;a karıştırılır . Deneyin başlangıcında solucanlar içeren bir damla tampon plakanın ortasına yerleştirilir ve solucan sayısı<html> Her kadran farklı zaman noktalarında puanlanır. Kemotaksis tahlili, her deneyde çok sayıda solucan test edildiği için düşme testine kıyasla daha fazla istatistiksel güç sağlar. Bununla birlikte, bu yöntemin bir kısıtlaması, kemotaksis tahlil plakalarının hazırlanmasının deneysel bileşiğin büyük miktarlarını gerektirmesidir. Ascaroside sinyal molekülleri 10&#39;da olduğu gibi ilgilenilen bileşimi elde etmek için sınırlı miktarda karmaşık bir saflaştırma işlemi gerekiyorsa, bu, büyük ölçekli davranış ekranları yürütmeyi zorlaştıracaktır. Ek olarak, solucanların deneme boyunca manuel olarak sayılması hatalara açıktır ve sayma işlemi sırasında plakaların bozulması sonuçları etkileyebilir. Sözü geçen iki yöntemin aksine, tutma deneyi, puanlama işlemi sırasında hatayı en aza indiren ve deneme sırasında deneycinin girişimini azaltan makine görme özelliğini kullanır<html> &gt; 11. Solucan davranışının video kayıtlarının bilgisayar ortamında analizi potansiyel olarak, puanlama sadece birkaç ayrı zaman noktasında gerçekleştirildiğinde kaçılacak daha belirsiz davranışsal dinamikleri ortaya çıkarabilir. Tutulum testinde, küçük yuvarlak bakteriyel yemeğin karşı taraflarına iki çözelti lekesi eklendikten sonra, yem yamasının ortasında az sayıda solucan yerleştirildi. Solucanlar &#39;davranışları daha sonra video kaydedilir, analiz edilir ve bir tercih endeksi değeri her solüsyon bölgesindeki toplam solucan piksel sayısına göre hesaplanır. Çekici bir yeme örneğinin bulunması, her tahlilde daha küçük popülasyon solucanları kullanılmasına rağmen, gıda, daha önce çözünebilir iticilere karşı kaçınma davranışlarını hassaslaştırdığı gösterilmiştir 12 . Ayrıca, solucanlar kısa dalga boyundaki ışığa karşı fotofobik bir tepki gösterir ve davranış kaydı ayarında beyaz ışık yayan mikroskop ışık kaynaklarının kullanımı davranışları etkileyebilirS = &quot;xref&quot;&gt; 13. Bu makalede ele alınan yöntemin amacı, C. elegans&#39;ın çözünür bileşikler için popülasyona dayalı bir tahlil tercihini kaydetmek ve analiz etmektir. Bu amaca yönelik olarak, mevcut yöntem, daha önce tartışılan yöntemlerin her üçünün yönlerini de bütünleştirir ve geliştirir. Büyük solucan popülasyonlarının test edilmesini sağlar ve her deneyde sadece az miktarda deneysel çözelti kullanılmasını gerektirir. Buna ek olarak, analiz, kısa dalga boylu ışığın davranış üzerindeki etkilerini en aza indirgemek için kızılötesi LED arka aydınlatması ile birlikte özel olarak hazırlanmış kapalı bir davranış odasında yürütülür. Her hazne aynı zamanda, tezgah alanından ödün vermeden deneysel verimi artıran çoklu mikroskop kameralarıyla donatılabilir. Son olarak, video analiz yazılımı, zamanla popülasyon davranış dinamikleri görselleştirmek için her video için tercih endeksi değerinin yanı sıra eşlik eden bir solucan doluluk arsa çıktısını verir. Oda konfigürasyonu ve birSsay protokolü, odorantların veya sıcaklığın kemosensör davranışlara etkisi gibi multimodal davranış tepkilerinin incelenmesi için daha da modifiye edilebilir. Bu makale, davranış odasının yapısını ve tahlil protokolünü anlatmaktadır. Aynı zamanda, bilinen suda çözülebilir itici yabani tip solucanlar ve kimyasal duyu kusurlu mutantlar, bakır iyonları 4 tepkisinin değerlendirilmesinden bu yöntemin kullanımını göstermektedir. Son olarak, verilen yazılımı kullanarak video analiz süreci detaylandırılmıştır.

<table><tbody><tr><td>Alüminyum T-oluklu çerçeveleme ekstrüzyonları</td><td>McMaster-Carr</td><td>47065T101</td><td>Tek profil, 1" boyut, katı</td></tr><tr><td>Braketler</td><td>McMaster-Carr</td><td>47065T236</td><td>1" yüksek tek profilli ekstrüzyonlar için 1" uzun</td></tr><tr><td>Kompakt uç beslemeli bağlantı elemanları</td><td>McMaster-Carr</td><td>47065T139</td><td>1" (tekli), 4'lü paket</td></tr><tr><td>Bükümlü masif panel tutucular</td><td>McMaster-Carr</td><td>47065T251</td><td>1" yüksek ekstrüzyon için</td></tr><tr><td>Plastik uç kapakları</td><td>McMaster-Carr</td><td>47065T91</td><td>1" yüksek ekstrüzyon için</td></tr><tr><td>Optik olarak şeffaf dökme akrilik levha</td><td>McMaster-Carr</td><td>8560K211</td><td>3/16" kalınlık, 12" x 12"</td></tr> <tr><td>Vinil kaplı polyester kumaş</td><td>McMaster-Carr</td><td>88505K57</td><td>0.027" kalınlık, 61" genişlik, siyah</td></tr><tr><td>Pirinç rondelalar</td><td>McMaster-Carr</td><td>9604K22</td><td>Ticaret boyutu 0, 0.545 "dış çap</td></tr><tr><td>Çelik rondelalar</td><td>McMaster-Carr</td><td>90107A029</td><td>1/4" vida boyutu</td></tr><tr><td>Yuvarlak başlı vidalar</td><td>McMaster-Carr</td><td>90272A546</td><td>1/4" - 20 diş boyutu, 1 - 1/2" uzunluk</td></tr><tr><td>Standart çalıştırma arka ışığı</td><td>Akıllı Görüş Işıkları</td><td>Yerel satıcıya danışın</td><td>8" x 8", kızılötesi 850 nm</td></tr><tr><td>IVP-C1 Değişken Kontrol Potu</td><td>Akıllı Görüş Işıkları</td><td>Yerel satıcıya</td><td></td>bakın</tr><tr><td>T1 Güç Kaynağı</td><td>Akıllı Görüş Işıkları</td><td>Yerel satıcıya</td><td></td>bakın</tr><tr><td>Dino lite Pro AM4113T</td><td>Dino-Lite Dijital Mikroskop</td><td>Yerel satıcıya</td><td></td>bakın</tr><tr><td>MS09B mikroskop standı</td><td>Dino-Lite Dijital Mikroskop</td><td>Yerel satıcıya bakın</td><td></td></tr></tbody></table>

nematod popülasyona dayalı kemoterapi tercihi testinin otomatik analizi

Automated Analysis of a Nematode Population-based Chemosensory Preference Assay

Nematod, Caenorhabditis elegans&#39;ın sadece 302 nöron kompakt sinir sistemi, çeşitli davranış repertuarının altında yatıyor. Bu davranışların altında yatan sinirsel devrelerin ayrılmasını kolaylaştırmak için sağlam ve tekrarlanabilir davranışsal testlerin geliştirilmesi gereklidir. Önceki C. elegans davranış araştırmaları, C. elegans&#39;ın çözünebilir bileşiklere verdiği tepkiyi araştırmak için bir &quot;düşme testi&quot;, &quot;kemotaksis testi&quot; ve &quot;tutma testi&quot; varyasyonlarını kullandı. Bu makalede açıklanan yöntem, yukarıda belirtilen üç tahlilin tamamlayıcı güçlerini birleştirmeyi amaçlamaktadır. Kısaca, her tahlil plakasının ortasındaki küçük bir daire, kontrol ve deneysel solüsyonlar dönüşümlü olarak yerleştirilen dört kadrana bölünür. Solucanlar ilâve edildikten sonra, tahlil plâkaları, mikroskop kameralarının solucanların muamele görmüş bölgelerle olan karşılaşmalarını kaydeden bir davranış odasına yüklenir. Otomatik video analizi daha sonraNd her video için bir tercih indeksi (PI) değeri oluşturulur. Bu yöntemin video edinimi ve otomatik analiz özellikleri deneycinin katılımını ve ilişkili hataları en aza indirir. Ayrıca, test başına dakikalık deney bileşiği miktarı kullanılır ve davranış odasının çok kamera kurulumu deneysel çıktı miktarını artırır. Bu yöntem, genetik mutantların ve yeni kimyasal bileşiklerin davranışsal ekranlarının yürütülmesi için özellikle yararlıdır. Bununla birlikte, bu yöntem, kontrol ve deneysel çözelti bölgelerinin yakınlığına bağlı olarak uyaran gradyan navigasyonunun incelenmesi için uygun değildir. Sadece küçük bir solucan popülasyonu mevcut olduğunda da kullanılmamalıdır. Mevcut formdaki çözünebilir bileşiklere verilen cevapların sadece test edilmesi için uygun olmakla birlikte, bu yöntem çok modlu duyusal etkileşimi ve optogenetik çalışmaları kolaylaştıracak şekilde kolayca modifiye edilebilir. Bu yöntem, diğer nematod türlerinin kemo-duyarlı tepkilerini denemek için de uyarlanabilir. </p&gt;

Şekil 3A , farklı genotip ve tedavi çiftleri için elde edilen tercih indeksi değerlerini göstermektedir. Bir tercih endeksi değeri 1, deneysel ROI&#39;ye yerleştirilen çözüme güçlü bir cazibe gösterdiğini gösterirken -1 tercih endeksi değeri, güçlü itme gösterir. M13 tampon solüsyonu hem kontrol hem de deneysel ROI&#39;lara yerleştirildiğinde, ROI&#39;ye yönelik herhangi bir mekansal önyargı olmadığını gösteren 0.02 bir tercih indeksi elde edildi. N2 solucanlan güçlü bakır iyonları güçlü itici (Ek Film 1) 4 olduğu, önceki bulguları doğrulamaktadır -0.67 bir tercih endeksi elde bakır iyonu kaçınılmalıdır. Osm-3 mutantları, duyu kılıcının distal bölümlerinin düzgün oluşumundan yoksundur, bakır iyonlarının kaçınılması önemli ölçüde azalmıştır (PI = -0.19) 15 . Ocr-2 mutantları, bunlar<html> Ayrıca önemli ölçüde kaçınma azalma sergileyen ve bakır iyonları (PI = 0.19), hatta bazı hafif gözde (Ek Film 2) 16, bakır önlenmesi dahil birçok ASH aracılı nosiseptif yanıtlarda Güneylilerin. Şekil 3B , her videodaki deneysel ROI&#39;lere kıyasla kontrollerde solucan yoğunluğunu gösteren, solucan doluluk alanlarını temsil eden örnekleri göstermektedir. Çizim alanının rengi ne kadar koyu renkte olursa, ROI&#39;daki solucan piksel sayısı o kadar yüksek olur. M13 tampon kontrolü ile tedavi edilen N2 solucanları için doluluk arsası, her iki ROI&#39;deki solucan sayısının test boyunca benzer kaldığını göstermektedir. Bununla birlikte, bakır iyonlarıyla muamele edilen N2 solucanları için doluluk alanı, solucanlar tahlil boyunca deneysel ROI&#39;yı kuvvetli ve sürekli olarak önlediğini göstermektedir. Gimg &quot;src =&quot; / files / ftp_upload / 55963 / 55963fig1.jpg &quot;/&gt; Şekil 1: Davranış Odası Tasarımının Fotoğraf ve Şematik Temsilciliği. ( A ) Davranış odası tertibatının ön görünümü (sol) ve hazne çerçevesinin ilgili şematik gösterimi (sağ). Opak olmayan polyester plakalar alt yüzü dışındaki tüm yüzleri kapsar ve kızılötesi arka aydınlatma panelinden ışık akışı sağlar. Rakamlar 1, 2 ve 3, (B) &#39;de ekstrüzyon katmanlarına karşılık gelir. ( B ) Davranış odası çerçevesi içeren ekstrüzyon katmanlarının üstten görünüş şeması. Buna, üst katman (1), orta kamera montaj montaj katmanı (2) ve alt katman katmanı (3) dahildir. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55963/55963fig1large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen tıklayınız.</a> <img alt="şekil 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55963/55963fig2.jpg"/&gt; Şekil 2: Çözüm Yerleştirme ve Plaka Hizalama Şablonları. ( A ) Çözüm yerleştirme şablonunun dört kadran ve sayı hizalama işaretleri vardır. Deney çözümü sağ üst ve alt sol kadranlara yerleştirilirken kontrol solüsyonu sol üst ve sağ alt kadranlara yerleştirilir. ( B ) Levha hizalama şablonu, video kaydı ve analizi sırasında solucanların görüş alanındaki oklüzyonunu en aza indirgemek için yalnızca sayı hizalama işaretlerine sahiptir. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55963/55963fig2large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen tıklayınız.</a> <img alt="Şekil 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55963/55963fig3.jpg" /> Şekil 3: Bu Testi Kullanarak Toplanan Verilerin Örnekleri. ( A ) Vahşi tip N2 ve mutant C. elegans için Tercih İndeksi (PI) değerleri </e<html> M13 tamponu ve 10 mM CuCl2 yanıt olarak, m&gt;. N2 solucanlar, M13 kontrol solüsyonu her iki ROI&#39;ye yerleştirildiğinde kontrol ve deneysel ROI&#39;ler arasında hiçbir tercih göstermedi; ancak bakır iyonları yerleştirildiğinde deneysel ROI&#39;dan şiddetle kaçınıldı (sırasıyla PI = 0.02 ve -0.67). Osm-3 (p802) mutantları ve ocr-2 (ak47) mutantları, N2&#39;ye kıyasla bakır iyonlarından kaçınılması önemli ölçüde azalmıştır (sırasıyla PI = -0.1 ve 0.2). Her bir genotip-muamele eşleşmesi için N = 6 tahlil, tahlf başına 360 kurt solüsyon, hata çubukları ± 1 SEM, *** p &lt;0.001, tek yönlü ANOVA, ardından post-hoc Tukey Dürüstçe Anlamlı Fark (HSD) testi. ( B ) ROI&#39;lerde (üstte) M13 tamponu ve kontrol ROI&#39;de M13 tamponu ve deneysel ROI&#39;da (alttaki) bakır iyonları ile N2 solucanları bulunan N2 solucanları için temsilci solucan doluluk arsaları. Her doluluk arsındaki renk ölçeği solucan piksel sayısını temsil eder.Pload / 55963 / 55963fig3large.jpg &quot;target =&quot; _ blank &quot;&gt; Bu figürden daha büyük sürümünü görmek için lütfen tıklayınız. Tamamlayıcı Film 1: N2 solucanlarının 10 mM Bakır Klorid&#39;e Davranışsal Yanıtları. Solucanlar M13 tamponu (üst sol ve sağ alt) ile kontrol kadranlara çekilir ancak M13 tamponunda çözünmüş bakır iyonlarını (sağ üst ve alt sol) güçlü bir şekilde önlerler. Video saniyede 1 kare kaydedildi ve 15 kat arttı. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55963/Supplementary_Video_1.mp4">Bu dosyayı indirmek için lütfen tıklayınız.</a> Ek Film 2: ocr-2 (ak47) Solucanlarının 10 mM Bakır Klorid&#39;e Davranışsal Davranışı . Solucanlar, hem M13 tamponlu (üst sol ve sağ alt) kontrol kadranı hem de çeyrekte kabaca eşit derecede dolaşıyorlar(Sağ üst ve alt solda) çözünmüş bakır iyonlarını içeren bir sodyum klorid çözeltisi. Mutantlar, kayıt başlangıcında bakır iyonları içeren kadranlar için hafif bir tercih sergilemektedir. Video saniyede 1 kare kaydedildi ve 15 kat arttı. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55963/Supplementary_video_2.mp4">Bu dosyayı indirmek için lütfen tıklayınız.</a> Ek Dosya: Çözüm Yerleştirme ve Plaka Hizalama Şablonları. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55963/JoVE_template.pptx">Bu dosyayı indirmek için lütfen tıklayınız.</a>

Nematodun, Caenorhabditis elegans&#39;ın , nüfusa dayalı bir deneyde çözünür bileşikler için tercihinin otomatik analizini sağlayan bir davranış kayıt kurulumu ve protokolü sunuyoruz. Bu makale bir davranış odasının inşasını, davranışsal analiz protokolünü ve video analiz yazılımının kullanımını anlatıyor.

Nematod Popülasyona Dayalı Kemoterapi Tercihi Testinin Otomatik Analizi

The nematode, Caenorhabditis elegans' compact nervous system of only 302 neurons underlies a diverse repertoire of behaviors. To facilitate the dissection ...

Bu davranış kayıt düzeneğinin ve protokolünün genel amacı, çok kameralı bir video görüntüleme sistemi ve ardından otomatik video analizi kullanarak, C. elegans'ın çözünür bileşiklere karşı popülasyon tabanlı kemosensör tercihlerini nicelleştirmektir. Bu yöntem, genetik mutantların daha hızlı ve daha standardize edilmiş davranışsal analizlerine olanak sağlayarak C. elegans nörobiyolojisi araştırmalarını kolaylaştırabilir. Bu tekniğin temel avantajı, nematod popülasyonunun çözünür uyaranlara verdiği yanıtın zamansal dinamiği izlenirken, aynı koşullar altında birden fazla tekrarın eş zamanlı olarak analiz edilebilmesidir.Davranış odası düzeneğini Christopher Cronin, bu laboratuvardan bir uzman bilim insanı olan personeliyle gösterecek. Başlamak için; kumaş örtüleri, kamera montaj çubuklarını, köşe braketlerini, ekstrüzyon çubuklarını ve kamera montaj düzeneğini beraberindeki metin protokolünde açıklandığı şekilde hazırlayın. Merkez çubuğuna takılı uç çubuklarından başlayarak, kamera standını ve kılıfları kamera montaj düzeneğine takın.Ardından, davranış odası çerçevesini monte edin. Dört adet bir foot uzunluğundaki alüminyum ekstrüzyon çubuğun kare bir polyester levhaya tutturulmasıyla başlayın. Bir çubuğu, kumaş levhanın iki T-somununa, çubuğu kumaş genişliği boyunca merkezleyerek kaydırın.Kumaş levhayı her bir çubuğa sabitlemek için bağlantı elemanlarını sıkın. Kare polyester levhayı, üzerine takılı dört alüminyum çubuk gelecek şekilde çalışma yüzeyine yayın. Ardından, sekiz adet köşe braketini dört alüminyum çubuğun üst yüzeylerine, her çubuğun her bir ucuna bir tane gelecek şekilde geçirin.Köşe braketlerini, braketin dikey ayakları çubukların uçlarıyla aynı hizaya gelecek şekilde çubukların üzerine yerleştirin ve vidaları T-somunlara sıkarak sabitleyin. Her köşeye, ekstrüzyon profilini iki köşe braketi ayağındaki T-somunların üzerine geçirerek bir fit uzunluğunda bir alüminyum ekstrüzyon profilini dikey olarak yerleştirin. Ardından, bağlantı elemanlarını sıkarak dikey çubuğu yatay çubuklara sabitleyin ve böylece birbirine komşu iki yatay çubuğu birleştirin.H şeklindeki kamera montaj düzeneğinin gevşek T-somunlarını çerçeve dikmelerinin içine doğru kaydırın. H düzeneğinin, çerçevenin her köşesindeki köşe braketlerinin üzerine oturana kadar tamamen aşağı inmesine izin verin. Dört köşe braketi vidasını sıkarak kamera montaj düzeneğini sabitleyin.Ardından, haznenin alt katmanını monte etmek için kalan dört adet bir fit uzunluğundaki alüminyum ekstrüzyon çubuklarını kullanın. Köşe braketlerini, braket ayakları çubuğun ucuyla aynı hizada olacak şekilde yerleştirin ve sabitlemek için vidaları sıkın. Daha sonra, gevşek T-somunlar dikme kanallarındayken çubukları çerçeve dikmeleri arasına aşağı doğru kaydırın.Çubukları, köşe braketlerinin üst kenarları dikmelerin açık ucundan bir inç aşağıda kalacak şekilde konumlandırın ve köşe braketi vidalarını sıkarak sabitleyin. Ardından, dört adet dikdörtgen polyester levhanın T-somunlarını, oda yanlarını kapatmak için dik ekstrüzyon çubuklarının kanallarına doğru kaydırın ve sabitlemek için bağlantı elemanlarını sıkın. Odanın içine erişmek için bir tarafı kapı olarak belirleyin ve odanın alt katmanındaki iki vidayı ve T-somunu çıkarın.Tamamlanan çerçevenin ayakları olarak hizmet etmesi için her köşenin üst ucuna plastik bir kap yerleştirin. Çerçeveyi düz konuma getirin ve çerçeve boşluk katmanının içine her slayt için iki adet panel tutucu yerleştirip sabitlemek için döndürün. Ardından, analiz plakaları için bir platform sağlamak amacıyla panel tutucuların üzerine 12 by 12 inç boyutunda şeffaf bir akrilik parça yerleştirin.Son olarak, kamerayı ve sahne şablonunu ekteki metin protokolünde açıklandığı şekilde konumlandırın. Deneyden bir gün önce, 28 adet boş 35 milimetrelik plakayı düz bir yüzeye beşli veya daha küçük gruplar halinde dizin. Her bir analiz plakasını beş mililitre nematod büyüme ortamı agarı ile doldurun ve analiz plakalarını kapakları açık şekilde, oda sıcaklığında gece boyunca dik konumda kurumaya bırakın.Deney gününde, arka ışığı açın, bilgisayarı başlatın ve mikroskop kamerasının video kayıt yazılımını çalıştırın. Mikroskop kamerasını bilgisayara bağlayın ve kameranın canlı görüntüsünü izlemek için yazılım penceresinin üst kısmındaki numaralandırılmış kamera küçük resmine tıklayın. Video kayıt ayarlarını düzenlemek için kamera görüntüsünün sol üst köşesindeki video formatı menüsünü aşağı çekin ve MJPG 1280x1024 seçeneğini belirleyin.Ardından, video formatı menüsünün yanındaki klasör menüsünü aşağı çekin ve video dosyalarını kaydetmek için bir klasör seçin. Kamera görüntüsünün sağ üst köşesindeki otomatik pozlama simgesine tıklayarak otomatik pozlamayı kapatın. Daha sonra, yerleşik mikroskop kamerası LED'lerini kapatmak için otomatik pozlama simgesinin hemen sağındaki LED simgesine tıklayın.Yandaki ayarlar simgesine tıklayın ve siyah-beyaz (monokrom) seçeneğini seçin. Kontrastı maksimize edin ve parlaklığı ayarlayın. Bir solüsyon yerleştirme şablonunu, sahne plakası hizalama şablonunun üzerine hizalayın ve kamera beslemesinin sol tarafındaki timelapse video kayıt simgesine tıklayın.Saniyede bir kare hızında beş saniyelik bir kalibrasyon videosu kaydetmek için süreye beş saniye ve aralığa bir saniye girin. Senkronize solucanların bulunduğu bir plakaya 1,2 mL nematod büyüme ortamı tamponu eklemek için beş mililitrelik bir cam pipet kullanın ve solucanları tamponun içine geçirmek için plağı nazikçe çalkalayın. Plakadaki tamponu pipetle çekin ve tampon içindeki solucanları temiz bir mikro santrifüj tüpüne aktarın.Solucanların dibe çökmesi için tüpleri bir ila iki dakika bekletin. Ardından, tüplerin altındaki kümelenmiş solucan peletini bozmadan, plastik bir pipet ucu kullanarak tüplerdeki yıkama tamponunun mümkün olduğunca fazlasını uzaklaştırın. Tüpü bir mililitre temiz nematod büyüme ortamı tamponu ile yeniden doldurun ve yıkama işlemini iki kez daha tekrarlayın.Ardından, bir çözelti yerleştirme şablonunu bir diseksiyon mikroskobunun tablasının üzerine bantla sabitleyin. Daha sonra, bir plaka hizalama şablonunun her iki yanına çift taraflı bant şeritleri yerleştirin. Analiz plağının çevresini plaka hizalama şablonundaki daire ile hizalayın ve şablon plağın altına yapışana kadar üzerine bastırın.Ardından, analiz plakası şablonu işaretlerini, diseksiyon mikroskobu üzerindeki çözelti yerleştirme şablonu işaretleriyle hizalayın. Sonra, bir P2 pipet kullanarak birinci ve dördüncü kadranların her birine bir mikrolitre M13 tamponu yerleştirin. İkinci ve üçüncü kadranların her birine bir mikrolitre 10 millimolar CuCl2 çözeltisi yerleştirmek için yeni bir uç kullanın.Çözelti damlacıkları agar tarafından tamamen emildikten sonra, yıkanmış solucanları assay plakalarına aktarmak için cam bir pasteur pipeti kullanın. Solucanlardan bir damla, dairesel işlem görmüş bölgelerin üst ve alt alanlarına yerleştirin. Dokuyu dört kez katlayın ve assay plakalarındaki fazla yıkama tamponunu emmek için küt kenarı kullanın.Şablon köşelerindeki numaraları hizalayarak analiz plakalarını davranış odasındaki mikroskop kameralarının altına hemen yerleştirin. Solucanların analiz plakalarına alışması için iki ila üç dakika bekleyin. Ardından, kamera beslemesinin sol tarafındaki zaman atlamalı (timelapse) video kayıt simgesine tıklayın ve saniyede bir kare olacak şekilde 10 dakikalık bir video kaydetmek için süreye 10 dakika, aralığa ise bir saniye girin.Son olarak, video kaydını başlatmak için start'a tıklayın. Her bir video karesi için, tercih indeksi fonksiyonu her bir ilgi alanındaki solucan piksellerinin sayısını sayar ve ilgi alanındaki toplam piksel sayısı içinde tek bir pikselin yüzdesini hesaplar. Farklı genotip ve işlem eşleşmeleri için elde edilen tercih indeksi değerleri burada gösterilmiştir.Pozitif bir tercih indeksi değeri işleme karşı bir çekimi, negatif bir tercih indeksi değeri ise itilme olduğunu gösterir. Hem kontrol hem de deney bölgelerine M13 tampon çözeltisi yerleştirildiğinde 0,02'lik bir tercih indeksi elde edilmiş olup bu durum, herhangi bir mekansal yanlılığın olmadığını kanıtlamaktadır. Bu grafik ayrıca, N2 solucanlarının bakır iyonlarından güçlü bir şekilde kaçındığını ve bunun sonucunda 0,67'lik bir tercih indeksi oluştuğunu göstermektedir.Ek olarak, duyusal silya oluşumunda kusurlu olan osm-3 ve ASH aracılı nosiseptif yanıtlarda kusurlu olan ocr-2 mutantlarının, bakır iyonlarına karşı azalmış kaçınma ve hatta bazı hafif çekim tepkileri gösterdiği görülmüştür. Bu protokol uygulanırken, hızlı ancak aynı zamanda sarsıntısız ve tutarlı çalışmak önemlidir. Kayıt düzeneği ve analiz protokolü, farklı C Elegans duyusal varyeteleri arasındaki etkileşimlerden kaynaklanan popülasyon tabanlı davranışsal yanıtları karakterize etmek için kolayca uyarlanabilir.

automated-analysis-nematode-population-based-chemosensory-preference

Research

JoVE Journal

Behavior

Davranış

Bu video, nematod C. elegans'ta kemotaksisi tanıtıyor ve bakır sülfata karşı kemotaktik kaçınmayı test eden örnek bir protokolü gösteriyor.

C. elegans Kemotaksis Testi: Solucanlarda Kemosensasyonu Test Etmek İçin Bir Yöntem

Araştırmacılar, solucanların algıladığı ve tepki verdiği bir elektrik alanı uygulayarak C. elegans'ta isteğe bağlı hareketi tetikleyebilir. Bu videoda elektrotaktik davranış tanıtılır ve mikroakışkan bir cihazda yapılan örnek bir protokol gösterilir.

Elektrotaksi Deneyi: C. elegans'ta Hareketi Gözlemlemek İçin Bir Yöntem

Bu videoda, bir transgenik solucan modelinde kemokaçınma davranışını incelemek için bir ozmotik kaçınma testi açıklanmaktadır. Kaçınma davranışı, yüksek ozmotik bir bariyer ve kemoatraktan varlığında bir plakada test edilir. Fonksiyonel nöron kaybı olan solucanlar kemoatraktan tarafından çekilir, yüksek ozmotik bariyeri geçer ve anestezik çözelti nedeniyle tuzak bölgesinde felç olur.

Ozmotik Kaçınma Testi Kullanarak Transgenik Solucanlarda Kemokaçınma Davranışını İnceleyin

Niceliksel kemotaktik tepkiyi değerlendirmek için bir...

C. elegans Kemotaksis Deneyi

Davranışsal tahliller, nöronal işlevi anlamak için güçlü araçlar sağlar. Burada, model nematod Pristionchus pacificus ve akrabalarında bulunan yırtıcı beslenme davranışını ölçmek için çeşitli protokoller sunuyoruz. Ek olarak, ağız yapıları ve dişler dahil olmak üzere yırtıcı beslenme adaptasyonlarını analiz etmek için yöntemler sunuyoruz.

içinde Yırtıcı Beslenme Davranışları tahlil<em&gt; Pristionchus</em&gt; Ve Diğer Nematodlar

Burada, organizmanın iyi beslenmiş bir beslenme durumundan aç kalmış beslenme durumuna geçmesiyle bakırdan kaçınma davranışındaki ve ortak bir besin kaynağını bulma yeteneğini değerlendirmek için tasarlanmış Caenorhabditis elegans spesifik bir analiz sunuyoruz.

bir<emCaenorhabditis elegans</emBeslenme Durumuna Dayalı Bakır Kaçınma Deneyi

Biz yüksek üretilen iş Caenorhabditis elegansbüyük popülasyonlarda fenotipik karakterizasyonu sağlayan geniş görüş alanı nematodunun izleme platformu (WF-NTP) kullanarak iletişim kurallarını açıklar. Bu protokoller mutant suşları veya yüksek ölçeklenebilir bir moda farmakolojik tedaviye yanıt ince davranış değişiklikleri tanımlamak için kullanılabilir.

Otomatik davranış analizi büyük C. elegans nüfus kullanarak bir geniş alan bakış açısı izleme platformu

Nicel bir yöntem tanımlamak ve fenotipik Caenorhabditis elegansprofil oluşturma otomatik olarak analiz ederek kimyasal maddeler akut toksisite tahmin etmek için geliştirilmiştir. Bu iletişim kuralı, bir 384-şey tabak içinde solucanlar kimyasallar ile tedavi, video esir alma ve toksikolojik ilgili fenotipleri ölçmek açıklar.

Bir yüksek-den geçerek tahlil tarafından otomatik fenotipik profil oluşturma Caenorhabditis elegans ve kimyasal toksisitesi tahmin için

Burada, model organizma C. elegans'ta klasik koşullandırma gerçekleştirerek ilişkisel öğrenmeyi test etmek için bir protokol sunuyoruz. Paradigma, ortamdaki tuz konsantrasyonunu, kemotaksislerini tuza doğru veya tuzdan uzaklaştıran gıdanın varlığı veya yokluğu ile eşleştirmeye dayanır.

Nematod Caenorhabditis elegans'ın Kemotaksisinde İlişkisel Öğrenmenin Ölçülmesi

Bu protokol, C. elegans'taki uçucu seks feromonuna verilen yanıtların çıkarılması ve ölçülmesi için yöntemler oluşturur ve kimyasal iletişim ve navigasyon yörüngesini incelemek için araçlar sağlar.

Caenorhabditis elegans'ta Uçucu Seks Feromon Ekstraksiyonu ve Kemocazibe Testi

Keşfedin Caenorhabditis elegans popülasyon davranış analizi için çok kameralı video kayıt sistemi ve otomatik analiz yöntemini. Bu teknik genetik mutantların nörobiyoloji araştırmalarında hızlı ve standart davranış değerlendirmesi sağlar.

Nematod Popülasyona Dayalı Kemoterapi Tercihi Testinin Otomatik Analizi

Daha fazla video keşfet