Name: Birden çok nükleik asit kapiller bir dizi görsel algılama (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-11-15T14:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 56 s
Description: Öğrenin, çoklu nükleik asit tespiti için hazır kullanımlı bir kaset nasıl üretilir. Kapiller dizilerle genetiği değiştirilmiş organizmaların görsel analizini kolaylaştıran bu yöntem, biyoteknoloji araştırmalarında hızlı ve verimli tarama imkanı sunar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu çalışmada kısmen Ulusal doğal Bilim Vakfı, Çin hibe (31370813, 3147670, 31670831 ve 31600672,), ulusal transjenik bitki özel Fonu (2016ZX08012-003, 2016ZX08012-005), Program tarafından yeni yüzyıl mükemmel yeteneklerini için finanse edildi Üniversitesi, ulusal anahtar araştırma ve geliştirme projesi (2016YFA0500601) Çin ve Çin doktora sonrası Bilim Vakfı (2016M 591667).

Not: Bu protokol istenen mikro kanallar ve yükleme adaptörü için şekil taşıyan paslanmaz çelik kalıp önceden yaptığınızı varsayar (3D dosyaları ek dosyalar 1 sağlanan ve 2. ). Bu iletişim kuralı da bitki DNA izolasyon zaten yapılmıştır varsayar.
 1. kılcal dizi tabanlı kullanıma hazır kaset imalatı <ol><li>paslanmaz çelik kalıp temizlik.
	<ol><li>Potansiyel kirletici kaldırmak için paslanmaz çelik kalıp deterjan, etanol, deiyonize su ile yıkama. Kalıp tarafından azot kuru.</li>
	</ol></li> <li>Kılcal temiz <ol><li>aşınma emniyet gözlük, laboratuvar düzgün ve kimyasal koruyucu eldivenler.</li>
		<li>Yer kılcal içine bir ölçek. Organik madde kaldırmak 5 min için 30 mL aseton ile kılcal temiz ve kılcal deiyonize su ile yıkama. 
		Dikkat: Başa bir duman başlıklı aseton.</li>
		<li>H 2 O 2 10 mL kabı dökün ve 4 H 2 O 2 ile içine yavaş böylece aşırı ısınmayı önlemek için sallayarak H 2 30 mL ekleyin. (Piranha çözüm) tamamen kılcal en az 30 dakika süreyle kapsadığından emin olun 
		Dikkat: piranha çözüm taşıma sırasında dikkatli olun (H 2 SO 4/h 2 O 2 = 3: 1, v/v) . Piranha çözüm dökülen, çok miktarda su ile hızlı bir şekilde çözüm silsin ve yüzey kağıt havlu ile silin. 
		Not: Kılcal temizlik, lamba reaksiyon da başarıya ulaşmak için önemli noktalar biridir. Bu baloncuklar içinde kılcal damarlar kaldırmak için temizleme işlemi sırasında asit silindir sallamak gereklidir ve temiz zaman da gerektiğinde uzatılabilir.</li>
		<li>Su büyük miktarda piranha Çözümle silsin. Kılcal etanol ve 5 min için deiyonize su ile yıkayın. Kılcal bir kurutma fırında kuru.</li>
	</ol></li> <li>Polydimethylsiloxane (PDMS) dökün <ol><li>ağırlık PDMS temel ve kür reaktifler oranı 1:1 bir 50 mL tüp ile dışarı. Genellikle, elastomer Ajan kür elastomer 5 g için temel 5 g karıştırın.</li>
		<li>İyice için yaklaşık 5 dakika cam çubuk ile karışımı ilave edin. Bir vakum Sırça fanus de-gaz için 30 dk için PDMS ile tüp yerleştirin.</li>
		<li>PDMS yavaş yavaş paslanmaz çelik kalıp silindir içine dökün. Kurutma fırın 60 ° c de 3 h için tedavi PDMS izin Not: Hava kabarcıkları PDMS dökme önlemek dikkatli olun. Dökme PDMS sonra 5 dk'ya doğal baloncuklar PDMS dışarı için stand izin.</li>
	</ol></li> <li>PDMS kalıptan çıkarmak <ol><li>PDMS kür sonra kalıp kalıp silindir dışarı çekerek çıkarın. Kalıp bir neşter ile kenar kesim tarafından silindir PDMS kaldırmak.</li>
		Üç kez etanol ve deiyonize su ile yıkama PDMS <li>. Kuru PDMS azot ile destek.</li>
	</ol></li> <li>Hidrofobik olmak PDMS destek alt yüzeyinin tedavi. PDMS destek bir süper hidrofobik emmek kat 1 s. kuru için bu oda sıcaklığında 10 dk için.</li>
	<li><ol><li>Kılcal PDMS destek içine eklemek temizlenmiş 4 mm kılcal PDMS destek deliklere yerleştirin ve 0,5 mm kapiller PDMS destek üst yüzeyi dışında bırakın. Kılcal uçları aynı düzeyde olduğundan emin olun.</li>
	</ol></li> <li>Kılcal dış yüzeyi ve hidrofobik olmak PDMS desteğinin üst yüzeyi tedavisi.
	<ol><li>Ekleyin 15 µL süper hidrofobik kat PDMS üst yüzeyinin destek. Unutmayın kaplama (PDMS destek üst yüzeyi ve kılcal maruz parçası dış yüzeyleri de dahil olmak üzere) üst yüzeyi kapiller Kuvvetleri tarafından her yerinde hemen yayılır.</li>
		<li>Hava kuru süper hidrofobik değiştirilmiş kapiller dizi.</li>
	</ol></li> <li>Astar kapiller diziye tamir <ol><li>astar çözüm hazırlamak. Ağırlık 0.65 g kitosan dışarı (moleküler formülü: (C 6 H 11 NO 4) n) ve pH 4.5-5.5 ile Asetik asit % 1.3 kitosan konsantrasyon ulaşmak için ayarlayarak 50 mL deiyonize su geçiyoruz. Astar bileşenleri karıştırmak Tablo 1 göre hazırlayın. Bkz. Astar için ek tablo 1</li> <li>astar önceden tasarlanmış bir sıraya göre kılcal dizinin bir karşılık gelen kılcal doldurmak için bir dizi karışımı ekleyin 1.6 µL. 
		Not: Negatif denetimler olarak kalan iki boş kılcal kuruldu.</li>
		<li>Standart düz dipli 96-şey plaka şeffaf bir kuyu dizide çapa ve en az 2 h. için 60 ° C'de dizi kuru</li>
	</ol></li></ol> <table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"> <tbody><tr><td>lamba astar sabitleme mix bileşenler (başlangıç konsantrasyonu)</td> <td>birim (μL) </td></tr> <tr><td>GKD 2 O</td> <td>17,0</td></tr> <tr><td>Chitosan (% 1.3)</td> <td>1.0</td></tr> <tr><td>FIP/BIP astar (20 mikron)</td> <td>2.0/2.0</td></tr> <tr><td>LoopF/LoopB astar (20 mikron)</td> &lt; td &gt; 1.0/1.0</tr> <tr><td>F3/B3 astar (20 mikron)</td> <td>0.5/0,5</td></tr> <tr><td>Toplam hacim</td> <td>25.0</td></tr></tbody></table> Tablo 1: lamba bileşenleri reaktifler sabitleme astar. Mix sabitleme lamba astar bileşenleri tablonun sol sütununda listelenir ve her bileşen hacmi sağ sütunda listelenir.
<ol start="9"> <li>araya kaset aşağıdaki gibi. Bir yükleme adaptörü bağlantılı dizi koydu. Adaptör çanak sadece tüm on kılcal damarlar (bkz: şekil 1) maruz kalan bölümlerini kapsar emin olun.</li>
</ol> <img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56597/56597fig1.jpg"> Resim 1: kaset imalat ve montaj. (bir) paslanmaz kalıp ve PDMS destekler. Kalıp 3 bölümden oluşur: silindir, Barajı kurulu ve ayağı plaka. (b) PDMS şematik destek imalat ve montaj kapiller kaset. Tüm süreç 5 adım içerir: 1. dökme, PDMS 2. kalıp kaldırma, 3. kılcal ekleme ve yüzey kaplama, 4. Astar sabitleme ve 5. Kaset demirleme. 1. PDMS kalıp silindir içine dökün; 2. kalıp PDMS kaldırmak için itme Barajı kurulu dışarı destek; 3. kat PDMS aşağı yüzeyine desteklemek ve kılcal PDMS yerleştirin destek, son olarak PDMS destek üst yüzey kat ve kılcal maruz. Kalın mavi çizgi süper hidrofobik kat gösterir; 4. Astar bireysel kılcal ayarla yük; 5. tek bir 96-şey plaka kapiller dizide çapa ve adaptör üzerine yükleme bir örnek yükleyin. Ayrıntıları protokol adımları 1.1-1.9 anlatmıştık. <a href="//ecsource.jove.com/files/ftp_upload/56597/56597fig1large.jpg" target="_blank"> Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
 2. lamba performans reaksiyon kapiller dizideki <ol><li>hazırla tepki mix <ol><li>başı olarak T mümkün 2 lamba tepki karışımı hazırlayın.</li>
		Calcein ekledikten sonra <li>Ekle reaktifler karışıma seçtiğiniz sıraya göre Tablo 2 ve girdap tepki karışımı olduğu gibi 5 s. Yavaşça inçDikey 20 kere sonra Bst polimeraz tüp eklenir.</li>
	</ol></li></ol> <table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"> <tbody><tr><td>lamba bileşenleri (ilk konsantrasyon)</td> <td>birim (μL)</td></tr> <tr><td>GKD 2 O</td> <td>11,6</td></tr> <tr><td>MgSO 4 (100 mM)</td> <td>2.0</td></tr> <tr><td>dNTPs (25 mM)</td> <td>1.4 &lt; /t d &gt;</td></tr> <tr><td>Betaine (5 M)</td> <td>4.0</td></tr> <tr><td>tampon (10 x)</td> <td>2.5</td></tr> <tr><td>Calcein (1,25 mM)</td> <td>0.5</td></tr> <tr><td>MnCl 2 (25 mM)</td> <td>0.5</td></tr> <tr><td>Bst &lt; /Em &gt; polimeraz (8 U/μL)</td> <td>1.5</td></tr> <tr><td>DNA bitki (10 ng/μL)</td> <td>1.0</td></tr> <tr><td>Toplam hacim</td> <td>25.0</td></tr></tbody></table> Tablo 2: Tepki sistemi kapiller dizi lamba. Kılcal dizi lamba bileşenlerinin tepki sisteminin bileşenleri sol sütununda listelenir ve her bileşen hacmi sağ sütunda listelenir.
<ol start="2"> <li>reaktifleri yük ve kaset mühür <ol><li>pipet 20 µL lamba tepki karışımı ile standart 100 µL ipucu. İpucu kilitlemek için yükleme adaptör girişi yerleştirin. Yavaşça tepki karışımı adaptör çanak içine enjekte; reaksiyon karışımı hızlı bir şekilde çanak doldurmak ve kılcal kapiller Kuvvetleri aracılığıyla otomatik olarak yüklemek.</li>
		<li>Kilitli ucu adaptörü çıkarın ve iyi tarafından bir PCR uyumlu şeffaf mühürleme film mühür. 
		Not: yalnızca kılcal reaksiyon karışımı hidrofilik tabak içinde dokunmadan dolu olabilir. Bu yüzden tüm kılcal üst kısmı aynı yüksekliği (bkz: Şekil 2) olduğundan emin olun.</li>
	</ol></li></ol> <img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56597/56597fig2.jpg"> Şekil 2: örnek yükleme yükleme adaptörü kullanarak diyagram. Resim mavi çözüm örnek olarak istihdam yükleme işlemi gösterir. İpucu giriş yerleştirin ve örnek adaptör yavaş yavaş enjekte ve adaptörü ile kilitli ipucu kaldır. <a href="//ecsource.jove.com/files/ftp_upload/56597/56597fig2large.jpg" target="_blank"> Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
<ol start="3"> <li>Incubate bir kuluçka 63 ° c için 1 h. kapiller dizide</li></ol>
 3. sonuçları okuma ve veri analizi <ol><li>elde Floresans emisyon görüntülerini.
	<ol><li>Görünür ışığın filtre uygulamak için bir küçük el UV LED el feneri üst yüzeyinde bir UV filtre düzeltmek.</li>
		<li>UV el feneri ile floresan yayılmasını sağlamak için Disosiye calcein heyecanlandırıyor. Esir alma imge kapiller dizi tepesinden bir dijital fotoğraf makinesi ya da bir akıllı telefon.</li>
		<li>Bir resim çekerken kamerayı kılcal yüksek kaliteli olsun, görüntülerini temizlemek mümkün olduğu kadar alan üzerinde yakınlaştırılmış sağlamak.</li>
	</ol></li> <li>Sonuçları analiz <ol><li>tarafından görüntü analiz yazılımı açın ve sonra seçin " görüntü &gt; kalıp &gt; gri tonlama &gt; Evet " ve " görüntü &gt; kalıp &gt; 16 bit &gt; Evet ". Seçin " dosyayı &gt; olarak kaydedin &gt; biçimi &gt; TIFF " görüntünün 16 bit TIFF biçimine dönüştürmek için.</li>
		<li>Mikroarray analiz yazılımı floresan yoğunluğu <ol><li>Aç değerini çıkarın. 16-bit TIFF biçimi görüntü yazılımı arayüzü içine sürükleyin ve dalga boyu seçin " 532 nm " ve bir rengi " yeşil " resmi görüntülemek için.</li>
			<li>Kılcal Floresans sinyalini bulmak için Oluştur yeni bir blok. Seçin " araçlar &gt; yeni blok " ve olarak satır ve sütun numarasını girin " 1; 1 " ve " 2; 5 " içinde ' blok ' ve ' özellikleri ' ayrı ayrı arabirimleri.</li>
			<li>Sağ tıklatın ve seçin " özellikleri " model ve kapiller Floresans alanına sığacak şekilde çapı ve konumunu ayarlayın. Seçin " analiz " floresan yoğunluğu değeri ayıklamak için.</li>
			<li>Select " dosya &gt; ayarları farklı kaydet " blok belgeleri kaydedin ve seçmek için " dosya &gt; olarak sağlamaları " floresan yoğunluğu sağlamaları için. LAMBA başarıyla kılcal damarlar içinde gerçekleştirilen tanımlamak için SNR hesaplamak. 
			Not: Sinyalleri kapiller noktalar ve sinyal-gürültü oranı (SNRs) gri değerler ön sinyal ön plan sinyalleri iki negatif ortalama ortalama değerlerine hedeflerinden ortalama değerlerden oranları olarak tanımlanan kayıt tarafından elde edildi denetimleri. Olumlu sinyaller belirlemek için kesim SNR kuruldu &gt; 2.</li>
		</ol>
		</li>
	</ol>
	</li>
</ol>

<ol><li>Urdea, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Requirements+for+high+impact+diagnostics+in+the+developing+world%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Requirements for high impact diagnostics in the developing world.</a> Nature. 444, Suppl 1. 73-79 (2006).</li>
<li>Yager, P., Domingo, G. J., Gerdes, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Point-of-care+diagnostics+for+global+health%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Biomed+Eng%22%5BJournal%5D)">Point-of-care diagnostics for global health.</a> Annu Rev Biomed Eng. 10, 107-144 (2008).</li>
<li>Opota, O., Jaton, K., Greub, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microbial+diagnosis+of+bloodstream+infection%3A+towards+molecular+diagnosis+directly+from+blood%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Microbiol+Infec%22%5BJournal%5D)">Microbial diagnosis of bloodstream infection: towards molecular diagnosis directly from blood.</a> Clin Microbiol Infec. 21 (4), 323-331 (2015).</li>
<li>Guo, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MPIC%3A+A+High-Throughput+Analytical+Method+for+Multiple+DNA+Targets%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">MPIC: A High-Throughput Analytical Method for Multiple DNA Targets.</a> Anal Chem. 83 (5), 1579-1586 (2011).</li>
<li>Shao, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MACRO%3A+a+combined+microchip-PCR+and+microarray+system+for+high-throughput+monitoring+of+genetically+modified+organisms%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">MACRO: a combined microchip-PCR and microarray system for high-throughput monitoring of genetically modified organisms.</a> Anal Chem. 86 (2), 1269-1276 (2014).</li>
<li>Kamle, S., Ali, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genetically+modified+crops%3A+detection+strategies+and+biosafety+issues%5BTitle%5D)+AND+%22Gene%22%5BJournal%5D)">Genetically modified crops: detection strategies and biosafety issues.</a> Gene. 522 (2), 123-132 (2013).</li>
<li>Galvin, S., Dolan, A., Cahill, O., Daniels, S., Humphreys, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microbial+monitoring+of+the+hospital+environment%3A+why+and+how%3F%5BTitle%5D)+AND+%22J+Hosp+Infect%22%5BJournal%5D)">Microbial monitoring of the hospital environment: why and how?</a> J Hosp Infect. 82 (3), 143-151 (2012).</li>
<li>Sciancalepore, A. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microdroplet-based+multiplex+PCR+on+chip+to+detect+foodborne+bacteria+producing+biogenic+amines%5BTitle%5D)+AND+%22Food+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Microdroplet-based multiplex PCR on chip to detect foodborne bacteria producing biogenic amines.</a> Food Microbiol. 35 (1), 10-14 (2013).</li>
<li>Saxena, G., Bharagava, R. N., Kaithwas, G., Raj, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microbial+indicators%2C+pathogens+and+methods+for+their+monitoring+in+water+environment%5BTitle%5D)+AND+%22J+Water+Health%22%5BJournal%5D)">Microbial indicators, pathogens and methods for their monitoring in water environment.</a> J Water Health. 13 (2), 319-339 (2015).</li>
<li>Hopwood, A. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrated+Microfluidic+System+for+Rapid+Forensic+DNA+Analysis%3A+Sample+Collection+to+DNA+Profile%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Integrated Microfluidic System for Rapid Forensic DNA Analysis: Sample Collection to DNA Profile.</a> Anal Chem. 82 (16), 6991-6999 (2010).</li>
<li>Estes, M. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimization+of+multiplexed+PCR+on+an+integrated+microfluidic+forensic+platform+for+rapid+DNA+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Analyst%22%5BJournal%5D)">Optimization of multiplexed PCR on an integrated microfluidic forensic platform for rapid DNA analysis.</a> Analyst. 137 (23), 5510-5519 (2012).</li>
<li>Niemz, A., Ferguson, T. M., Boyle, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Point-of-care+nucleic+acid+testing+for+infectious+diseases%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Point-of-care nucleic acid testing for infectious diseases.</a> Trends Biotechnol. 29 (5), 240-250 (2011).</li>
<li>Peeling, R. W., Mabey, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Point-of-care+tests+for+diagnosing+infections+in+the+developing+world%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Microbiol+Infec%22%5BJournal%5D)">Point-of-care tests for diagnosing infections in the developing world.</a> Clin Microbiol Infec. 16 (8), 1062-1069 (2010).</li>
<li>Perkins, M. D., Kessel, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((What+Ebola+tells+us+about+outbreak+diagnostic+readiness%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">What Ebola tells us about outbreak diagnostic readiness.</a> Nat Biotechnol. 33 (5), 464-469 (2015).</li>
<li>Li, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+universal+multiplex+PCR+strategy+for+100-plex+amplification+using+a+hydrophobically+patterned+microarray%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Chip%22%5BJournal%5D)">A universal multiplex PCR strategy for 100-plex amplification using a hydrophobically patterned microarray.</a> Lab Chip. 11 (21), 3609-3618 (2011).</li>
<li>Notomi, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Loop-mediated+isothermal+amplification+of+DNA%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Loop-mediated isothermal amplification of DNA.</a> Nucleic Acids Res. 28 (12), (2000).</li>
<li>Mori, Y., Nagamine, K., Tomita, N., Notomi, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detection+of+loop-mediated+isothermal+amplification+reaction+by+turbidity+derived+from+magnesium+pyrophosphate+formation%5BTitle%5D)+AND+%22Biochem+Biophys+Res+Commun%22%5BJournal%5D)">Detection of loop-mediated isothermal amplification reaction by turbidity derived from magnesium pyrophosphate formation.</a> Biochem Biophys Res Commun. 289 (1), 150-154 (2001).</li>
<li>Tomita, N., Mori, Y., Kanda, H., Notomi, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Loop-mediated+isothermal+amplification+%28LAMP%29+of+gene+sequences+and+simple+visual+detection+of+products%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) of gene sequences and simple visual detection of products.</a> Nat Protoc. 3 (5), 877-882 (2008).</li>
<li>Iwamoto, T., Sonobe, T., Hayashi, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Loop-mediated+isothermal+amplification+for+direct+detection+of+Mycobacterium+tuberculosis+complex%2C+M-avium%2C+and+M-intracellulare+in+sputum+samples%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Loop-mediated isothermal amplification for direct detection of Mycobacterium tuberculosis complex, M-avium, and M-intracellulare in sputum samples.</a> J Clin Microbiol. 41 (6), 2616-2622 (2003).</li>
<li>Goto, M., Honda, E., Ogura, A., Nomoto, A., Hanaki, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Colorimetric+detection+of+loop-mediated+isothermal+amplification+reaction+by+using+hydroxy+naphthol+blue%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechniques%22%5BJournal%5D)">Colorimetric detection of loop-mediated isothermal amplification reaction by using hydroxy naphthol blue.</a> Biotechniques. 46 (3), 167-172 (2009).</li>
<li>Iseki, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+a+multiplex+loop-mediated+isothermal+amplification+%28mLAMP%29+method+for+the+simultaneous+detection+of+bovine+Babesia+parasites%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microbiol+Methods%22%5BJournal%5D)">Development of a multiplex loop-mediated isothermal amplification (mLAMP) method for the simultaneous detection of bovine Babesia parasites.</a> J Microbiol Methods. 71 (3), 281-287 (2007).</li>
<li>Liang, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiplex+loop-mediated+isothermal+amplification+detection+by+sequence-based+barcodes+coupled+with+nicking+endonuclease-mediated+pyrosequencing%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Multiplex loop-mediated isothermal amplification detection by sequence-based barcodes coupled with nicking endonuclease-mediated pyrosequencing.</a> Anal Chem. 84 (8), 3758-3763 (2012).</li>
<li>Shao, Y., Zhu, S., Jin, C., Chen, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+multiplex+loop-mediated+isothermal+amplification-RFLP+%28mLAMP-RFLP%29+to+detect+Salmonella+spp.+and+Shigella+spp.+in+milk%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Food+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Development of multiplex loop-mediated isothermal amplification-RFLP (mLAMP-RFLP) to detect Salmonella spp. and Shigella spp. in milk.</a> Int J Food Microbiol. 148 (2), 75-79 (2011).</li>
<li>Fang, X., Chen, H., Yu, S., Jiang, X., Kong, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Predicting+viruses+accurately+by+a+multiplex+microfluidic+loop-mediated+isothermal+amplification+chip%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Predicting viruses accurately by a multiplex microfluidic loop-mediated isothermal amplification chip.</a> Anal Chem. 83 (3), 690-695 (2011).</li>
<li>Stedtfeld, R. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gene-Z%3A+a+device+for+point+of+care+genetic+testing+using+a+smartphone%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Chip%22%5BJournal%5D)">Gene-Z: a device for point of care genetic testing using a smartphone.</a> Lab Chip. 12 (8), 1454-1462 (2012).</li>
<li>Liu, D., Liang, G., Zhang, Q., Chen, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detection+of+Mycobacterium+tuberculosis+using+a+capillary-array+microsystem+with+integrated+DNA+extraction%2C+loop-mediated+isothermal+amplification%2C+and+fluorescence+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Detection of Mycobacterium tuberculosis using a capillary-array microsystem with integrated DNA extraction, loop-mediated isothermal amplification, and fluorescence detection.</a> Anal Chem. 85 (9), 4698-4704 (2013).</li>
<li>Zhang, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Point-of-Care+Multiplexed+Assays+of+Nucleic+Acids+Using+Microcapillary-based+Loop-Mediated+Isothermal+Amplification%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Point-of-Care Multiplexed Assays of Nucleic Acids Using Microcapillary-based Loop-Mediated Isothermal Amplification.</a> Anal Chem. 86 (14), 7057-7062 (2014).</li>
<li>Shao, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visual+detection+of+multiple+genetically+modified+organisms+in+a+capillary+array%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Chip%22%5BJournal%5D)">Visual detection of multiple genetically modified organisms in a capillary array.</a> Lab Chip. 17 (3), 521-529 (2017).</li>
<li>Lizardi, P. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mutation+detection+and+single-moledule+counting+using+isothermal+rolling-circle+amplification%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genet%22%5BJournal%5D)">Mutation detection and single-moledule counting using isothermal rolling-circle amplification.</a> Nat Genet. , (1998).</li>
<li>Piepenburg, O., Williams, C. H., Stemple, D. L., Armes, N. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+detection+using+recombination+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22Plos+Biol%22%5BJournal%5D)">DNA detection using recombination proteins.</a> Plos Biol. 4 (7), 1115-1121 (2006).</li>
<li>Opota, O., Jaton, K., Greub, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microbial+diagnosis+of+bloodstream+infection%3A+towards+molecular+diagnosis+directly+from+blood%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Microbiol+Infect%22%5BJournal%5D)">Microbial diagnosis of bloodstream infection: towards molecular diagnosis directly from blood.</a> Clin Microbiol Infect. 21 (4), 323-331 (2015).</li>
</ol>

Yazarlar ifşa gerek yok.

Burada, sakin platformu gösterdi hangi lamba teknolojisi ile kılcal bir dizi birleştiren, aynı anda birden çok gen GDO ile ilgili hedef tek bir son derece etkili ve kolay test çalışmasına tespiti sağlar.
Multiplex lamba reaksiyonlar kasete başarıyla uygulamak için üç kritik noktaları fark gerekir. İlk olarak, kılcal üst tarafında ve kapiller dizi hidrofilik ve hidrofobik desen için aynı yükseklikte ulaşmak reaktifler tüm kılcal aynı anda yüklemek için kritik. İlk hepsi emin olmak için PDMS des...

Aynı anda birden fazla nükleik asitler tespiti için düşük maliyetli, hızlı ve kullanımı kolay sistemleri Klinik teşhis1,2,3, GDO algılama4gibi alanlarda geniş bir alanda acilen ihtiyaç vardır, 5,6,7,8,9, analiziniz10,11ve özellikle nokta-in-bakım testleri (POCTs), nerede izleme mikrobiyal kaynaklar genellikle sınırlı12,13,14vardır.
Polimeraz zincir tepkimesi (PCR), gerçek zamanlı PCR ve çoklu PCR, türev yöntemleri de dahil olmak üzere bu alanlardaki algılama için en yaygın olarak uygulanan bir tekniktir. Ancak, bu yöntemler genellikle sadece bir hedef bir test15 dakika içinde algılamak ve elektrik ve sofistike profesyonel ekipman gerektirir.
Nükleik asitler algılamak için başka bir gelecek vaat eden ilk tarif eden 200016izotermal amplifikasyon (lamba), döngü-aracılı teknolojisidir. LAMBA yüksek verim DNA algılama yöntemi vardır. Teorik olarak, tek bir sabit sıcaklık, (Yani, 60-65 ° C arasında) gerçekleştirilen bir saat içerisinde amplicons 109 kopya 1 kopya yükseltmek. Başarılı amplifikasyon çözünmez yan ürünü pirofosfat büyük miktarda üretmek ve bulanıklık17doğrudan çıplak gözle tarafından gözlenen, bir değişiklik neden. Renk değişikliği, metal iyonları veya floresan boyalar Calcein18, nükleik asit boya19ve hidroksil naftol mavi20gibi eklenmesi tarafından da görülebilir. Yüksek hassasiyet avantajları ve işlem kolaylığı nedeniyle, lamba nükleik asit algılama içinde yaygın olarak uygulanmaktadır.
Şu anda, başlıca iki stratejiler multiplex lamba deneyleri için vardır. Biri birden çok lamba alarak birden fazla lamba deneyleri gerçekleştirmeye astar ayarlar içinde bir tüp21,22,23. Ancak, çokluğu ve amplifikasyon verimliliği iç parazit ve farklı astar kümeleri arasında rekabet tarafından sınırlı. Ayrıca, farklı lamba ürünleri aynı tepki olarak tanımlamak zor olabilir. Başka bir strateji üzerinde fiziksel yalıtım dayanmaktadır. Farklı astar kümeleri bireysel küçültülmüş bölmeleri izole ve birden çok lamba reaksiyonlar sonra aynı anda gerçekleştirilen24,25. Genellikle mikrosıvısal çip üzerinde temel alır, bu yaklaşımların yüksek üretilen iş lamba reaksiyonlar için olası bir çözüm sunar. Ancak, cips üretimi ve multiplex öncesi kaplama astar kümeleri karmaşıktır maliyetleri artırmak ve tekrarlanabilirlik azaltmak.
Son zamanlarda, bazı çalışmalar mikrosıvısal çip karmaşık imalatı bypass ve düşük maliyetli algılama26,27elde ettik kılcal performanslı lamba tepkileri anlatmıştık. Örnekleri ve reaksiyon Kimyasalları (farklı astar kümeleri dahil olmak üzere) olmalı ayrı ayrı hazırlanan ve farklı teslim çünkü ancak, yüksek üretilen iş analizi açısından, bu kılcal PCR şerit tüpler, minyatür sürümleri için benzer reaksiyon biriminde bulunan kılcal damarlar. Paralel ve çok katmanlı analiz elde etmek için örnekleri ya da reaktifler paralel yükleme için ek donanımları, örneğin bir çok kanallı şırınga pompa, gereklidir.
Nükleik asitler multiplex algılanması için geçerli yöntemleri ile ilişkili sınırlamalarını aşmak için kılcal bir dizi görsel lamba teknoloji birleştiren bir minyatür platformu geliştirdi. Bu platform çoklu hedef, kompakt, düşük maliyetli ve kolay28çalışmasına boyutu. Burada, kapiller dizi imal ve lamba reaksiyonlar dizideki gerçekleştirmek nasıl ayrıntıları açıklamak. Burada açıklanan protokol genetiği değiştirilmiş organizma (GDO) algılama bir model olarak kullanarak standart. Önemlisi, bu iletişim kuralı diğer nükleik asit hedefler yüksek üretilen iş tespiti de kullanılabilir.

<table><tbody><tr><td>UltraEverDry (süper hidrofobik kaplama)</td> <td>UltraTech</td><td>4001</td><td>tedarikçi: Exiron kimya (ÇİN) CO., LTD.</td></tr><tr><td>PDMS</td><td>Dow Corning</td><td>8332557</td><td></td></tr><tr><td>Bst polimeraz</td><td>New England BioLabs</td><td>M0275L</td><td></td></tr><tr><td>betain</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>B0300-1VL</td><td></td></tr><tr><td>kalsein</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C0875-5G</td><td></td></tr><tr><td>MnCl2</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>MKBP0495V</td><td></td></tr><tr><td>MgSO4</td><td>New England BioLabs</td><td>B1003S</td><td></td></tr><tr><td>dNTP'ler</td><td>Şanghay Sangon</td><td>B804BA0022</td><td></td></tr><tr><td>kitosan</td><td>Şanghay Sangon</td><td>LJ0805S309J</td><td></td></tr><tr><td>Photoshop 7.0 yazılımı</td><td>Adobe Systems Inc., CA, ABD</td><td></td><td>Görüntü analizi</td></tr><tr><td>GenePix Pro 6.1</td><td>Molecular Devices, CA, ABD</td><td></td><td>mikroarray analiz yazılımı</td></tr><tr><td>AutoCAD</td><td>Adobe Systems Inc.</td><td></td><td>3D inşaat yazılımı</td></tr><tr><td>UV filtresi (ZWB2)</td><td>YXSensing</td><td></td><td>tedarikçisi: taobao</td></tr></tbody></table>

birden çok nükleik asit kapiller bir dizi görsel algılama

Visual Detection of Multiple Nucleic Acids in a Capillary Array

Çoklu hedef, kısa süre ve kaynak uygun yöntemlerden birden çok nükleik asitler tek bir test kolay tespiti için acilen ihtiyaç vardır hastalık tanı, mikrobiyal izleme, genetiği değiştirilmiş organizma (GDO) algılama, ve adli analiz. Sakin (Capillary Array tabanlı Loop-aracılı izotermal amplifikasyon Multiplex nükleik asitler görsel algılanması için) olarak adlandırılan platformu daha önce anlatmıştık. Burada, geliştirilmiş imalat ve bu platform için performans işlemleri açıklanmaktadır. Burada, Nükleik asitlerin multiplex görsel algılama için kılcal dizi tarafından monte küçük, kullanıma hazır bir kaset geçerli. Kılcal damar kılcal damarlar içinde izotermal amplifikasyon (lamba) döngü-aracılı astar setleri sabitleme önce bir hidrofobik ve hidrofilik kalıp içine önceden tedavi dizidir. Sonra derleme yükleme bağdaştırıcısının lamba tepki karışımı yüklü ve tek bir pipetting adım kapiller zorla nedeniyle her kılcal damar içine izole. LAMBA reaksiyonlar kılcal paralel gerçekleştirilir. Sonuçları görsel olarak el UV el feneri ile aydınlatma tarafından okunur. Bu platformu kullanarak, sık sık yüksek özgüllük ve duyarlılık ile öğeleri ve GDO örnekleri genlerinde görünmüyor 8 izleme göstermektedir. Özetle, burada açıklanan platformu birden çok nükleik asitler algılama kolaylaştırmak için tasarlanmıştır. Biz alanlarında yüksek üretilen iş nükleik asit analizi gerekli olduğu yerde geçerli olacağına inanıyoruz.

Bu yöntemde, Çapraz bulaşma farklı kılcal damarlar arasında örnek yükleme sırasında önlemek önemlidir. Bu amaçla, hangi bireysel kılcal astar korumak kitosan tanıtıldı. O ya da değil amele olup olmadığını sınamak için "T" ve "U", deseni ile kılcal kaset set ADH1 (Mısır endojen referans gen) astar gösterildiği gibi önceden tamir ettik şekil 3a. Beklendiği gibi yalnızca bulunan kılcal astar gösteren olumlu sinyaller (<strong ...

Bu iletişim kuralı birden fazla Nükleik asitlerin kullanımı kolay bir tek, testinde görsel algılama için uygulanan küçük, kullanıma hazır bir kaset imalatı açıklar. Bu yaklaşım, kılcal bir dizi GDO hedefleri çok katmanlı ve yüksek verimli tespiti için kullanıldı.

Birden çok nükleik asit kapiller bir dizi görsel algılama

Multi-target, short time, and resource-affordable methodologies for the detection of multiple nucleic acids in a single, easy to operate test are urgently ...

Bu prosedürün genel amacı, kullanımı kolay tek bir testte birden fazla nükleik asidin görsel tespiti için uygulanabilen küçük, kullanıma hazır bir kaset üretmektir. Bu yöntem, genetiği değiştirilmiş organizmalar veya GDO tespiti gibi multipleks nükleik asit algılama alanındaki temel soruların yanıtlanmasına yardımcı olabilir. Kılcal damarları temizlemek için laboratuvar üniforması, koruyucu gözlük ve kimyasal koruyucu eldiven giyin.Kılcal damarları bir behere yerleştirin. Organik maddeyi uzaklaştırmak için kılcal damarları 30 mililitre asetonla beş dakika boyunca temizleyin. Ardından, kılcal damarları deiyonize suyla yıkayın.Daha sonra, behere yaklaşık on mililitre hidrojen peroksit dökerek piranha çözeltisini hazırlayın. Ardından, aşırı ısınmayı önlemek için hidrojen peroksitin içine yavaş çalkalayarak 30 mililitre sülfürik asit ekleyin. Solüsyonun kılcal damarları en az 30 dakika boyunca tamamen kapladığından emin olun.Ardından, piranha çözeltisini bol miktarda su ile yıkayın. Kılcal damarları etanol ve deiyonize su ile her biri beş dakika yıkayın. Kılcal damarları bir kurutma fırınında kurutun.Ardından, PDMS tabanını ve dişli reaktiflerini 50 mililitrelik bir tüpte bire bir oranında tartın. Tipik olarak, beş gram elastomer bazını beş gram elastomer kürleme maddesi ile karıştırın. Karışımı bir cam çubukla yaklaşık beş dakika iyice karıştırın.Gazdan arındırmak için beheri PDMS ile otuz dakika boyunca vakumlu bir çan kavanozuna yerleştirin. Ardından, PDMS'yi yavaşça paslanmaz çelik kalıbın silindirine dökün. PDMS'nin 60 santigrat derecede bir kurutma fırınında üç saat kürlenmesine izin verin.PDMS sertleştikten sonra kalıbı silindirik ile dışarı çekerek kalıbı çıkarın. Kalıbın kenarını bir neşter ile keserek PDMS'yi silindirden çıkarın. PDMS'yi etanol ve deiyonize su ile üç kez yıkayın.Ardından, PDMS desteğini nitrojen ile kurulayın. PDMS desteğini bir saniye boyunca süper hidrofobik bir kaplamaya batırarak PDMS desteğinin alt yüzeyini hidrofobik hale getirin. Daha sonra oda sıcaklığında on dakika kurutun.Ardından, temizlenmiş dört milimetrelik kılcal damarları PDMS desteğinin deliklerine yerleştirin ve kılcal damarların sıfır noktası beş milimetreyi PDMS desteğinin üst yüzeyinin dışında bırakın. Kılcal damarların uçlarının aynı seviyede olduğundan emin olun. Kılcal damarların dış yüzeyini ve PDMS desteğinin üst yüzeyini hidrofobik hale getirmek için, PDMS desteğinin yüzeyinin üzerine 15 mikrolitre süper hidrofobik kaplama ekleyin.Süper hidrofobik modifiye edilmiş kılcal damar dizisini havayla kurutun. Daha sonra, önceden tasarlanmış bir sıraya göre kılcal dizinin karşılık gelen bir kılcal damarını doldurmak için bir set astarın astar sabitleme karışımından bir nokta altı mikrolitre ekleyin. Diziyi standart düz tabanlı 96 oyuklu bir plakanın şeffaf bir kuyusuna sabitleyin ve diziyi en az iki saat boyunca 60 santigrat derecede kurutun.Kaseti monte etmek için, bağlantılı dizinin üstüne bir yükleme adaptörü yerleştirin. Adaptörün çanağının on kılcal damarın tümünün açıkta kalan kısımlarını kapladığından emin olun. LAMP reaksiyon karışımını hazırlamak için, metin protokolüne göre karışıma reaktifler ekleyin ve kalsin ekledikten sonra reaksiyon karışımını beş saniye boyunca girdaplayın.Bst polimeraz eklendikten sonra tüpü yirmi kez yavaşça ters çevirin. Çevrede bulunan eser DNA, LAMP karışımını vermeden önce litre başına bir mol hidroklorik asit ile daha önce temizlenerek elimine edilebilir. Standart 100 mikrolitrelik bir uç ile 20 mikrolitre LAMP reaksiyon karışımını aspire edin.Kilitlemek için ucu yükleme adaptörünün girişine sokun. Reaksiyon karışımını yavaşça adaptör kabına enjekte edin. Reaksiyon karışımı tabağı hızlı bir şekilde dolduracak ve daha sonra kılcal damarları kılcal kuvvet yoluyla otomatik olarak yükleyecektir.Adaptörü kilit ucuyla çıkarın ve kuyuyu PCR uyumlu şeffaf bir sızdırmazlık filmi ile kapatın. Ardından, kılcal diziyi bir saat boyunca 63 santigrat derecede bir inkübatörde inkübe edin. Floresan emisyonunun görüntülerini elde etmek için, ayrışmış kalsini floresan yaymak üzere uyarmak için bir UV el feneri kullanın.Bir dijital kamera veya akıllı telefon ile kılcal dizinin tepesinden görüntüler yakalayın. Bir görüntü çekerken, yüksek kaliteli ve net görüntüler elde etmek için kameranın kılcal damarların bulunduğu alana mümkün olduğunca yakınlaştırıldığından emin olun. Ardından, görüntüyü görüntü analiz yazılımı ile açın.Ve sonra görüntü, kalıp, gri tonlamalı, evet ve görüntü, kalıp, 16 bit, evet seçin. Görüntüyü 16 bit TIFF formatına dönüştürmek için dosya, farklı kaydet, format, TIFF'i seçin. Floresan yoğunluğunun değerini çıkarmak için mikrodizi analiz yazılımını açın.16 bit TIFF formatındaki görüntüyü yazılımın arayüzüne sürükleyin ve ardından görüntüyü görüntülemek için 532 nanometre dalga boyunu ve yeşil rengi seçin. Ardından, kılcal damarlardan gelen floresan sinyalini bulmak için yeni bir blok oluşturun. Araçları, yeni blokları seçin ve ardından sütun ve satır sayısını bloklara ve özellikler arayüzlerine ayrı ayrı bire bir ve ikiye beş olarak yerleştirin.Sağ tıklayın ve özellik modelini seçin. Ardından, kılcal damarların floresan alanına uyacak şekilde konumu ve çapı ayarlayın. Floresan yoğunluğunun değerini çıkarmak için analiz et'i seçin.Son olarak, bloğun belgelerini kaydetmek için dosyayı seçin, ayarları farklı kaydedin. Ardından, floresan yoğunluğu sonuçlarını kaydetmek için sonuçları seçin, dosyalayın, kaydedin. Burada kılcal dizinin düzeni gösterilmektedir.Bir ila sekiz arasında kılcal damarlar, LAMP astar setleri ile önceden eklenmiştir. Dokuzuncu ve onuncu kılcal damarlar ikiyi temsil eder, astar kontrolü yoktur. Burada, genetiği değiştirilmiş mısır MON863'ün tespiti için floresan fotoğraf gösterilmektedir, burada yeşil renk pozitif LAMP amplifikasyonunu temsil eder.Başarılı amplifikasyon, sadece beklenen kılcal damarlarda bir, altı, yedi ve sekizde, boş kılcal damarlar arasında kontaminasyon olmadan sunulur. Bu floresan fotoğraf, GDO karışımının tespiti içindir. Yeşil renk, pozitif LAMP amplifikasyonunu sundu.Başarılı amplifikasyon sadece beklenen kılcal damarlarda bir, dört, beş, altı, yedi ve sekizde boş kılcal damarlar arasında kontaminasyon olmadan sunulmuştur. Burada gösterilen floresan fotoğraf, genetiği değiştirilmemiş mısırın tespiti içindir ve yeşil renk pozitif LAMP amplifikasyonunu sunar. Başarılı amplifikasyon sadece beklenen kılcal sekizde ve boş kılcal damarlar arasında kontaminasyon olmadan ortaya çıktı.Bir kez ustalaştıktan sonra, bu algılama prosedürü düzgün bir şekilde gerçekleştirilirse bir nokta beş saat içinde yapılabilir. Bu videoyu izledikten sonra, çoklu nükleik asit tespiti yapmak için kılcal damar bazlı kasetin nasıl üretileceğini iyi anlamış olmalısınız.

visual-detection-of-multiple-nucleic-acids-in-a-capillary-array

Research

JoVE Journal

Bioengineering

Biyomühendislik

ampliPHOX kolorimetrik algılama teknolojisi mikroarray'ler için floresan tespiti için ucuz bir alternatif olarak sunulmaktadır. AmpliPHOX fotopolimerizasyon dayanarak, sadece birkaç dakika içinde çıplak gözle görülebilen katı polimer lekeler oluşturur. Sonuçlar basit ama güçlü bir yazılım paketi ile görüntülü ve sonra otomatik olarak yorumlanır.

Grip için DNA Mikroarray ampliPHOX Kolorimetrik Algılama

Bu videoda, otomatik kılcal elektroforez kullanarak hücresiz DNA veya cfDNA fragmanlarının boyut dağılımını analiz ediyoruz. Bu teknik, apoptoz sırasında kanser hücreleri tarafından salınan DNA parçalarının profili hakkında bilgi edinmeye yardımcı olur.

cfDNA'nın Otomatik Kapiler Elektroforez Tabanlı Parça Boyutu Dağılımı Analizi: Biyosıvılardan İzole Edilen DNA Parçalarının Boyut Dağılımını İncelemek İçin DNA Mikroçip Tabanlı Bir Yöntem

Bu videoda, boyutlarına göre çeşitli örneklerden elde edilen floresan etiketli PCR amplikonları analiz etmek için kılcal elektroforez tekniği açıklanmaktadır. Her parçadaki etiketli floresan boya yardımıyla parçaların baz çifti uzunluklarını belirleyen bir göç modeli oluşturur.

Kılcal Elektroforez: Floresan Etiketli Polimeraz Zincir Reaksiyonu Amplikonlarını Analiz Etmek İçin Bir Teknik

Bu video, fare serumunda dolaşımdaki anti-glikan antikorlarını analiz etmek için basılı glikan dizisi teknolojisini göstermektedir. Serumdaki antikorlar, çip üzerindeki spesifik glikanlarla etkileşime girer ve bu, immün boyama ve ardından floresan taraması ile doğrulanır.

Basılı Glikan Dizisi ile Dolaşımdaki Anti-Glikan Antikorlarının Saptanması

Biz DNA hibridizasyon tespiti için mikroakışkan tabanlı elektrokimyasal Bioçip sunuyoruz. SsDNA probu fonksiyonlandırmalar ardından, özgüllük, duyarlılık ve algılama limiti tamamlayıcı ve non-ssDNA hedefleri ile incelenmiştir. Sonuçlar 3.8 nM'lik bir algılama sınırı ile, elektro-kimyasal sistemine DNA hibridizasyonu olaylarının etkisini göstermektedir.

Etiket-serbest DNA Hibridizasyon Analiz için mikroakışkan tabanlı Elektrokimyasal Biochip

Bu protokol hücre sinyal çalışmalar ve biyolojik belirteç tespiti potansiyel uygulamalar ile büyük ölçekli imalat, mültipleksli iki boyutlu DNA veya antikor dizisi, özetlemektedir.

Yüksek yoğunluklu Barkod Antikor Mikroarray Akışı-desen Rehberli Fabrikasyon

Bu eser bir pnömatik damlacık manipülasyon platformunda çoklu nükleotid polimorfizmi tespit etmek için basit ve görsel bir yöntem sunar. Damlacık manipülasyon ve çoklu nükleotid polimorfizmlerinin tespiti de dahil olmak üzere önerilen yöntem, tüm deney ile, ileri araçların yardımı olmadan, 23 ° C civarındaki gerçekleştirilebilir.

Bir Pnömatik Damlacık Manipülasyon Platformu Multi-nükleotid Polimorfizmlerinin Görsel Kolorimetrik Tespiti

Bu makalede, yerinde üretilen nükleik asit mikrodizilerinin sentezi ve uygulamalarındaki yeni gelişmeleri sunmakta ve tartışıyoruz. Özellikle, DNA sentezi protokollerinin RNA'ya nasıl genişletilebileceğini ve mikrodizilerin geri alınabilir nükleik asit kitaplıkları oluşturmak için nasıl kullanılabileceğini gösteriyoruz.

Yüksek Yoğunluklu DNA ve RNA mikrodizileri - Fotolitografik Sentez, Hibridizasyon ve Büyük Nükleik Asit Kütüphanelerinin Hazırlanması

Burada floresan görüntüleme yaklaşımı için bir protokol, D NA, RNA ve protein'in (MICDDRP) multiplex immunofloresan cell bazlı detectionu, viral protein ve farklı tip ve karaya oturmuş nükleik asitlerin eşzamanlı floresan tek hücreli görselleştirmesini yapabilen bir yöntemdir. Bu yaklaşım çok çeşitli sistemlere uygulanabilir.

Viral Nükleik Asitleri ve Proteinleri Görselleştirmek ve HIV, HTLV, HBV, HCV, Zika Virüsü ve İnfluenza Enfeksiyonunu İzlemek için Tek Hücreli Çoklanmış Floresan Görüntüleme

DNAzyme tabanlı nanomakineler, nükleik asitlerin son derece seçici ve hassas tespiti için kullanılabilir. Bu makale, özgür yazılım kullanılarak 10-23 çekirdekli DNAzyme tabanlı nanomakinelerin tasarımı için ayrıntılı bir protokolü ve örnek olarak bir Epstein-Barr virüs parçasının tespitinde uygulanmasını açıklamaktadır.

DNAzyme 10-23 - Nükleik Asit Tanıma için Tabanlı Nanomakineler

Öğrenin, çoklu nükleik asit tespiti için hazır kullanımlı bir kaset nasıl üretilir. Kapiller dizilerle genetiği değiştirilmiş organizmaların görsel analizini kolaylaştıran bu yöntem, biyoteknoloji araştırmalarında hızlı ve verimli tarama imkanı sunar.

Birden çok nükleik asit kapiller bir dizi görsel algılama

Daha fazla video keşfet