Name: Geliştirilmiş Örnekleme Tekniği ve Histolojik Karakterizasyon ile Prostat Tümörü Biyobankacılık Güvenilirliğinin Artırılması (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2023-11-17T14:30:00.000+00:00
Duration: 7 min 34 s
Description: Keşfedin, prostat kanseri dokularının geliştirilmiş örnekleme ve histolojik karakterizasyon yöntemleriyle nasıl toplandığını. İntratümöral heterojenite ve moleküler analiz zorluklarını aşarak kişiselleştirilmiş tıp stratejilerine katkı sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

AL, bir "Margarita Salas" doktora sonrası sözleşmesini (21-076 numaralı) ve MAM-T'yi bir 'Maria Zambrano' araştırma sözleşmesini (numara MAZ/2021/03 UP2021-021) kabul eder. Her iki sözleşme de Avrupa Birliği-Yeni nesil AB tarafından finanse edilmiştir.

Bu yöntem, farklı klinik hizmetleri (Üroloji, Patoloji ve La Fe Hastanesi Biyobankası) içeren ortak çabalarla geliştirilmiştir. Çalışma, insan refahı için kurumsal, ulusal ve uluslararası yönergelere uygun olarak yürütüldü ve Instituto de Investigación Sanitaria Hastanesi Universitario y Politécnico La Fe'deki (Valensiya, İspanya) Biyomedikal Araştırma Etik Kurulu'ndan onay aldı. Tüm numuneler La Fe Hastanesi Biyobankasında (PT13/0010/0026) saklandı. Genel prosedür Şekil 1'de detaylandırılmıştır.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/65635/65635fig01.jpg"> Şekil 1: Genel prosedür şeması. Protokol bölümünde açıklanan adım adım prosedürün şematik gösterimi. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/65635/65635fig01large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
1. Tümör hedefleme
<ol><li>Ameliyattan önce, tümörün yerini belirlemek ve prostat bezi içindeki konumunu haritalamak için multiparametrik veya biparametrik Manyetik Rezonans Görüntüleme (mpMRI veya bpMRI)17,18 kullanın. MRG'den elde edilen bilgileri, transrektal ultrason veya rektal muayeneden elde edilen bulgularla birleştirin, eğer ikincisi uyumsuz sonuçlar verirse.</li>
	<li>Tümör lokalizasyonunu geliştirmek için, ameliyat öncesi ultrason kılavuzluğunda ve MRG kılavuzluğunda transrektal prostat biyopsilerinin sonuçlarını gözden geçirin. NOT: Prostat kanseri tanı prosedüründe, biyopsiler transrektal erişim yoluyla doğrudan prostattan alınır. Bu biyopsiler, prostattan sistematik örnekleme (bezin etrafına dağılmış silindirleri içeren) ve doğrudan MRG'deki şüpheli bulguları hedef alan silindirleri içerir. Bu örneklerin alınmasını hedeflemek için, MRG bulguları ile bilişsel bir şekilde ("bilişsel füzyon") veya varsa "gerçek MRI-ultrason füzyon yazılımı" ile birleştirilen transrektal ultrason kullanılır.</li>
</ol>2. Radikal prostatektomi ve prostat toplanması
<ol><li>Huynh ve ark.19 tarafından özetlenen adımları izleyerek transperitoneal bir yaklaşımla standart robotik yardımlı radikal prostatektomi gerçekleştirin.<ol><li>Abdominal erişim, insüflasyon ve kamera portu yerleşimi ile başlayın (bkz. Malzeme Tablosu). Kalan beş bağlantı noktasını doğrudan görüş alanına yerleştirin. Pnömoperitoneumu 12 mm'ye ayarlayın.</li>
		<li>Peritonu keserek mesaneyi serbest bırakın ve perirektal boşluğu inceleyin.</li>
		<li>Her iki taraftaki pelvik fasyayı açın.</li>
		<li>Prostat ve mesanenin ön ve yan yönlerinin tam bir diseksiyonunu gerçekleştirin.</li>
		<li>Mesane boynunun açılmasını gerçekleştirin, prostat ve mesanenin arka yönlerine erişim sağlamak için proksimal üretrayı tanımlayın ve bölümlere ayırın.</li>
		<li>Seminal vezikülleri ve rektum boşluğunu inceleyin19.</li>
		<li>Nörovasküler demetleri koruyarak prostatın lateral yönlerini inceleyin.</li>
		<li>Retropubik boşluktaki damarların hemostazını sağlayın.</li>
		<li>Apeksi diseksiyon ve distal üretrayı kesit edin.</li>
		<li>Vezikoüretral anastomozu tamamlayın.</li>
		<li>Prostatı çıkarın ve kesiğin kapatılmasını gerçekleştirin19.</li>
	</ol></li>
	<li>Taze prostatı kuru bir kapta toplayın. Numune numunesinin sabitlenmemesi veya parafine gömülmemesi çok önemlidir.</li>
	<li>Tüm prostatı içeren taze cerrahi numuneyi, numune işleme için Biobank'a taşıyın.</li>
</ol>3. Prostat işleme ve örnek toplama
<ol><li>Preoperatif mpMRG, preoperatif biyopsi sonuçları ve direkt prostatektomi spesimenti palpasyonundan alınan tümör konum bilgilerine dayalı olarak örnekleme için hedeflenen prostat bölgelerini seçin. Bu bilgileri hasta tanımlama verilerini, son olarak örneklenen prostat bölgelerini ve toplanan örnek sayısını içeren bir forma kaydedin. NOT: MRG bulguları, ameliyat öncesi biyopsi sonuçları ve direkt prostatektomi spesim palpasyonu uyumlu olduğunda, tüm örnekleri o veya bu yerlere (4 ila 6 silindir arasında) hedefleyin. Herhangi bir uyumsuzluk varsa, silindir sayısını artırın ve bu yöntemlerden herhangi birinden etkilendiğinden şüphelenilen tüm bölgeleri ayrı ayrı hedefleyin.</li>
	<li>Seçilen alanlardan silindirik numuneler almak için tek kullanımlık bir otomatik iğne (cerrah) kullanın (adım 1.1). Ardından, silindirin dış bölgesini tanımlayın (patolog), silindiri doku forseps ile sıkıştırın, bir slayta yerleştirin ve dış bölgeyi doku mürekkebi ile işaretleyin. Bu işlemi tüm silindirler alınmış olarak tekrarlayın.</li>
	<li>Toplanan silindirleri, kriyostat gömme ortamı ile doldurulmuş bir numune tutucu diske (Malzeme Tablosuna bakınız) yatay olarak yerleştirin ve bunları kesmek için mikrotom soğutma plakasına aktarın.</li>
	<li>Plakaya yerleştirildikten sonra, numune tutucu diski numune alma diskine takın ve aşağıdaki adımları izleyerek tekerleğin dikkatli hareketleriyle kesin:<ol><li>Bir mikrotom-kriyostat üzerine donmuş kesitlerden önce doku örneğini gömmek için en uygun kesme sıcaklığı bileşiğini (OCT bileşiği, Malzeme Tablosuna bakınız) kullanın.</li>
		<li>Daha sonra, numuneyi -25 °C'de bir kriyostat-mikrotom kullanarak kesin. İnce silindir şeklindeki doku bölümlerini (10 μm) işlenmiş mikroskop slaytlarına toplayın. Biobank'ta saklanmak üzere yeterli miktarda sağlam tümör dokusu sağlamak için yalnızca birkaç mikron doku topladığınızdan emin olun.</li>
		<li>Slayt başına iki veya üç ince bölüm toplayın ve son renklendirmeyi kontrol etmek için bunları manuel olarak boyayın. Teknisyenin gözü optimum boyama sağlar ve gerekli herhangi bir yeniden boyama yapılabilir. Bu adımları takip et<ol><li></li><li><li></li><li></li><li></li></ol></li></ol></li></ol><ol><li><li></li></ol><ol><li><li><li> </li><li> </li></ol>

Prostatektomi Spesimeni Haritalama ve Diseksiyon Protokolü

<ol><li>Rawla, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Epidemiology+of+prostate+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22World+Journal+of+Oncology%22%5BJournal%5D)">Epidemiology of prostate cancer.</a> World Journal of Oncology. 10 (2), 63-89 (2019).</li>
<li>Epstein, J. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+2019+Genitourinary+Pathology+Society+%28GUPS%29+white+paper+on+contemporary+grading+of+prostate+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Archives+of+Pathology+%26+Laboratory+Medicine%22%5BJournal%5D)">The 2019 Genitourinary Pathology Society (GUPS) white paper on contemporary grading of prostate cancer.</a> Archives of Pathology & Laboratory Medicine. 145 (4), 461-493 (2021).</li>
<li>Zhang, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Intratumor+heterogeneity+and+clonal+evolution+revealed+in+castration-resistant+prostate+cancer+by+longitudinal+genomic+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Translational+Oncology%22%5BJournal%5D)">Intratumor heterogeneity and clonal evolution revealed in castration-resistant prostate cancer by longitudinal genomic analysis.</a> Translational Oncology. 16, 101311(2022).</li>
<li>Haffner, M. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genomic+and+phenotypic+heterogeneity+in+prostate+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Reviews+Urology%22%5BJournal%5D)">Genomic and phenotypic heterogeneity in prostate cancer.</a> Nature Reviews Urology. 18 (2), 79-92 (2021).</li>
<li>Woodcock, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Prostate+cancer+evolution+from+multilineage+primary+to+single+lineage+metastases+with+implications+for+liquid+biopsy%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Communications%22%5BJournal%5D)">Prostate cancer evolution from multilineage primary to single lineage metastases with implications for liquid biopsy.</a> Nature Communications. 11 (1), 5070(2020).</li>
<li>Heo, Y. J., Hwa, C., Lee, G. H., Park, J. M., An, J. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrative+multi-omics+approaches+in+cancer+research%3A+from+biological+networks+to+clinical+subtypes%5BTitle%5D)+AND+%22Molecules+and+Cells%22%5BJournal%5D)">Integrative multi-omics approaches in cancer research: from biological networks to clinical subtypes.</a> Molecules and Cells. 44 (7), 433-443 (2021).</li>
<li>Menyhárt, O., Győrffy, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multi-omics+approaches+in+cancer+research+with+applications+in+tumor+subtyping%2C+prognosis%2C+and+diagnosis%5BTitle%5D)+AND+%22Computational+and+Structural+Biotechnology+Journal%22%5BJournal%5D)">Multi-omics approaches in cancer research with applications in tumor subtyping, prognosis, and diagnosis.</a> Computational and Structural Biotechnology Journal. 19, 949-960 (2021).</li>
<li>Annaratone, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Basic+principles+of+biobanking%3A+from+biological+samples+to+precision+medicine+for+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Virchows+Archiv%22%5BJournal%5D)">Basic principles of biobanking: from biological samples to precision medicine for patients.</a> Virchows Archiv. 479 (2), 233-246 (2021).</li>
<li>King, C. R., Long, J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Prostate+biopsy+grading+errors%3A+A+sampling+problem%5BTitle%5D)+AND+%22International+Journal+of+Cancer%22%5BJournal%5D)">Prostate biopsy grading errors: A sampling problem.</a> International Journal of Cancer. 90 (6), 326-330 (2000).</li>
<li>Jayadevan, R., Zhou, S., Priester, A. M., Delfin, M., Marks, L. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+MRI-ultrasound+fusion+to+achieve+targeted+prostate+biopsy%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Use of MRI-ultrasound fusion to achieve targeted prostate biopsy.</a> Journal of Visualized Experiments. 146, e59231(2019).</li>
<li>Heavey, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+magnetic+resonance+imaging+and+biopsy+data+to+guide+sampling+procedures+for+prostate+cancer+biobanking%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Use of magnetic resonance imaging and biopsy data to guide sampling procedures for prostate cancer biobanking.</a> Journal of Visualized Experiments. 152, 60216(2019).</li>
<li>Panach Navarrete, J. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aPanach+Navarrete%2C+J+%22Estudio+metabol%C3%B3mico+en+tejido+prost%C3%A1tico+y+orina+para+el+diagn%C3%B3stico+y+pron%C3%B3stico+del+c%C3%A1ncer+de+pr%C3%B3stata%22">Estudio metabolómico en tejido prostático y orina para el diagnóstico y pronóstico del cáncer de próstata</a>. , https://roderic.uv.es/handle/10550/81853 (2022).</li>
<li>Bertilsson, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+new+method+to+provide+a+fresh+frozen+prostate+slice+suitable+for+gene+expression+study+and+MR+spectroscopy%5BTitle%5D)+AND+%22The+Prostate%22%5BJournal%5D)">A new method to provide a fresh frozen prostate slice suitable for gene expression study and MR spectroscopy.</a> The Prostate. 71 (5), 461-469 (2011).</li>
<li>Show SOP - Biospecimen Research Database. , https://brd.nci.nih.gov/brd/sop/show/522 (2022).</li>
<li>Dagher, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quality+matters%3A+International+standards+for+biobanking%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Proliferation%22%5BJournal%5D)">Quality matters: International standards for biobanking.</a> Cell Proliferation. 55 (8), e13282(2022).</li>
<li>Yüzbaşıoğlu, A., Özgüç, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biobanking%3A+sample+acquisition+and+quality+assurance+for+%26%2334%3Bomics%26%2334%3B+research%5BTitle%5D)+AND+%22New+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Biobanking: sample acquisition and quality assurance for &#34;omics&#34; research.</a> New Biotechnology. 30 (3), 339-342 (2013).</li>
<li>Carpagnano, F. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiparametric+MRI%3A+local+staging+of+prostate+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Radiology+Reports%22%5BJournal%5D)">Multiparametric MRI: local staging of prostate cancer.</a> Current Radiology Reports. 8 (12), 27(2020).</li>
<li>Christophe, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Prostate+cancer+local+staging+using+biparametric+MRI%3A+assessment+and+comparison+with+multiparametric+MRI%5BTitle%5D)+AND+%22European+Journal+of+Radiology%22%5BJournal%5D)">Prostate cancer local staging using biparametric MRI: assessment and comparison with multiparametric MRI.</a> European Journal of Radiology. 132, 109350(2020).</li>
<li>Huynh, L. M., Ahlering, T. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Robot-assisted+radical+prostatectomy%3A+a+step-by-step+guide%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Endourology%22%5BJournal%5D)">Robot-assisted radical prostatectomy: a step-by-step guide.</a> Journal of Endourology. 32 (S1), S28-S32 (2018).</li>
<li>van Leenders, G. J. L. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+2019+International+Society+of+Urological+Pathology+%28ISUP%29+consensus+conference+on+grading+of+prostatic+carcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22The+American+Journal+of+Surgical+Pathology%22%5BJournal%5D)">The 2019 International Society of Urological Pathology (ISUP) consensus conference on grading of prostatic carcinoma.</a> The American Journal of Surgical Pathology. 44 (8), e87-e99 (2020).</li>
<li>Liu, A., Collins, C. C., Diemer, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biobanking+metastases+and+biopsy+specimens+for+personalized+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Biorepository+Science+for+Applied+Medicine%22%5BJournal%5D)">Biobanking metastases and biopsy specimens for personalized medicine.</a> Journal of Biorepository Science for Applied Medicine. 3, 57-67 (2015).</li>
<li>Ellervik, C., Vaught, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Preanalytical+variables+affecting+the+integrity+of+human+biospecimens+in+biobanking%5BTitle%5D)+AND+%22Clinical+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Preanalytical variables affecting the integrity of human biospecimens in biobanking.</a> Clinical Chemistry. 61 (7), 914-934 (2015).</li>
<li>Arellano, H. L., Castillo, C. O., Metrebián, B. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diagnostic+agreement+of+the+Gleason+score+in+needle+biopsy+and+radical+prostatectomy+and+its+clinical+consequences%5BTitle%5D)+AND+%22Rev+M%C3%A9d+Chile%22%5BJournal%5D)">Diagnostic agreement of the Gleason score in needle biopsy and radical prostatectomy and its clinical consequences.</a> Rev Méd Chile. 132 (8), 971-978 (2004).</li>
<li>Torres Caparó, D. A. Concordancia en los valores de gleason en biopsia prostática transrectal y en prostatectomia radical en pacientes con cáncer de próstata del Hospital Cirujano Mayor Santiago Távara entre enero 2010 - junio del 2018. , Universidad Ricardo Palma. https://repositorio.urp.edu.pe/handle/20.500.14138/1886 (2019).</li>
<li>Chavolla-Canal, A. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Concordancia+del+puntaje+de+Gleason+en+biopsia+transrectal+de+pr%C3%B3stata+vs+prostatectom%C3%ADa+radical%5BTitle%5D)+AND+%22Revista+Mexicana+de+Urolog%C3%ADa%22%5BJournal%5D)">Concordancia del puntaje de Gleason en biopsia transrectal de próstata vs prostatectomía radical.</a> Revista Mexicana de Urología. 81 (2), 1-10 (2021).</li>
<li>Fan, X. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Impact+of+cold+ischemic+time+and+freeze-thaw+cycles+on+RNA%2C+DNA+and+protein+quality+in+colorectal+cancer+tissues+biobanking%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Cancer%22%5BJournal%5D)">Impact of cold ischemic time and freeze-thaw cycles on RNA, DNA and protein quality in colorectal cancer tissues biobanking.</a> Journal of Cancer. 10 (20), 4978-4988 (2019).</li>
<li>Vaswani, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+liquid+chromatography%2Ftandem+mass+spectrometry+lipidomics+analysis+of+macaque+heart+tissue+flash-frozen+or+embedded+in+optimal+cutting+temperature+polymer+%28OCT%29%3A+Practical+considerations%5BTitle%5D)+AND+%22Rapid+communications+in+Mass+Spectrometry%3A+RCM%22%5BJournal%5D)">Comparative liquid chromatography/tandem mass spectrometry lipidomics analysis of macaque heart tissue flash-frozen or embedded in optimal cutting temperature polymer (OCT): Practical considerations.</a> Rapid communications in Mass Spectrometry: RCM. 35 (18), e9155(2021).</li>
<li>Zhang, W., Sakashita, S., Taylor, P., Tsao, M. S., Moran, M. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comprehensive+proteome+analysis+of+fresh+frozen+and+optimal+cutting+temperature+%28OCT%29+embedded+primary+non-small+cell+lung+carcinoma+by+LC-MS%2FMS%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+%28San+Diego%2C+Calif%29%22%5BJournal%5D)">Comprehensive proteome analysis of fresh frozen and optimal cutting temperature (OCT) embedded primary non-small cell lung carcinoma by LC-MS/MS.</a> Methods (San Diego, Calif). 81, 50-55 (2015).</li>
<li>Boyd, A. E., Allegood, J., Lima, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Preparation+of+human+tissues+embedded+in+optimal+cutting+temperature+compound+for+mass+spectrometry+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments%22%5BJournal%5D)">Preparation of human tissues embedded in optimal cutting temperature compound for mass spectrometry analysis.</a> Journal of Visualized Experiments. 170, e62552(2021).</li>
</ol>

Yazarlar herhangi bir çıkar çatışması beyan etmezler.

Herhangi bir araştırma çalışmasında, sistematik önyargıları azaltmak ve güvenilir sonuçlar elde etmek için kaliteli örnekler elde etmek temel bir gerekliliktir22. Bu nedenle, numunelerin işlendiği ve saklandığı sıcaklık, numune alımından depolamaya kadar geçen süre, sterilize edilmiş malzemelerin kullanımı veya koruyucu veya diğer katkı maddelerinin eklenmesinin numuneler üzerinde yaratabileceği etkiler gibi preanalitik değişkenlerin kontrolü, biyolojik numuneleri içeren herhangi bir protokolde di...

Prostat kanseri (PK) erkeklerdeen sık görülen 2. kanserdir ve dünya çapında 5. önde gelen ölüm nedenidir1. Hasta tedavisi ve prognozu, yüksek Gleason dereceleri ve metastatik tümörlere (%31) kıyasla lokalize ve düşük dereceli tümörlerin (Gleason derece 6) (%99) daha yüksek 5 yıllık sağkalım oranları ile kanıtlandığı gibi, tümörün evrelemesine ve derecelendirilmesine (Gleason skoru) bağlıdır2.
PK lokal nüks ve tedavi başarısızlığı, bu tümör tip3'ün karakteristik yüksek genetik intratümör heterojenliği ile ilişkilendirilmiştir. Ek olarak, PK, bağımsız olarak ortaya çıkabilen veya ortak bir tümör hücresi atasından türetilebilen, farklı morfolojik, histolojik ve moleküler özellikler4 sergileyen birkaç tümör odağına sahip multifokal bir hastalık olarak kabul edilir5. Önceki çalışmalar, tümör evriminin, metastazı teşvik edebilen veya hücre soyunu prostat ile sınırlayabilen spesifik genetik sürücülere dayalı olarak hastalar arasında farklılık gösterdiğini göstermiştir5. Bu nedenle, farklı tümör odaklarının moleküler karakterizasyonu sadece daha doğru bir tanı ve prognoz sağlamak için değil, aynı zamanda hasta için etkili ve kişiselleştirilmiş tedaviyi uyarlamak için de çok önemlidir.
Bu bağlamda, biyomedikal araştırmalar ve bütünleştirici multi-omik yaklaşımlar, kanserleri farklı alt tiplere ayırmak, tanısal ve prognostik biyobelirteçleri tanımlamak ve tedavi yanıtı ile ilgili belirteçleri keşfetmek için benzeri görülmemiş fırsatlar sunmaktadır. Ayrıca, bu yaklaşımlar bu hastalığın biyolojisinin daha iyi anlaşılmasına katkıda bulunur 6,7. Biyolojik örnekler, ister dokular ister biyosıvılar olsun, kanser patofizyolojisinin altında yatan biyolojik özellikleri ortaya çıkarmak ve böylece genetik ve fenotipik heterojenite ile ilgili mevcut sınırlamaları ele almak için çeşitli multi-omik platformlar (genomik, transkriptomik, proteomik, metabolomik vb.) kullanılarak analiz edilebilir6. Bununla birlikte, omik çalışmalardan elde edilen verilerin kalitesinin, tümörlerden toplanan örneklerin kalitesine, bunların doğru karakterizasyonuna ve müteakip işleme ve depolamaya bağlı olduğunu göz önünde bulundurmak önemlidir8.
Bu bağlamda, araştırma için taze PC dokusu elde etmek, başarılı tümör örneklemesinin zorluğu nedeniyle metodolojik bir zorluk teşkil etmektedir9. Önceki yöntemler radikal prostatektomiyi takiben rastgele örneklemeyi içeriyordu ve kötü sonuçlar veriyordu10. Bununla birlikte, daha yeni yaklaşımlar, hem manyetik rezonans görüntüleme (MRG) hem de biyopsi verilerine dayanan hedefli protokolleri içerir ve bu da tümör örneği toplamada etkinliğin artmasına neden olur11.
Öte yandan, örneklerin saklanmadan önce önemli doku değişikliği olmadan histopatolojik karakterizasyonu da ilginç bir zorluk teşkil etmektedir. Sonuç olarak, birçok durumda, numunelerin histopatolojik tayini, analizlerinden sonra gerçekleştirilir (örneğin, HR 1H NMR metabolomik analizi)12. Bu uygulama, gereksiz masraflara, zaman tüketimine ve sonunda analizden çıkarılan önemli sayıda numunenin kaybına neden olur (örneğin, histopatolojik analizin ardından tümör numunesi olmadığı ortaya çıkan numuneler). Diğer durumlarda, numunelerin histopatolojik karakterizasyonu analizlerinden önce gerçekleştirilir. Aslında, önceki bazı çalışmalar, genomik ve metabolomik için radikal prostatektomi örneklerinden temsili yüksek kaliteli araştırma örnekleri sağlamak için yöntemleri standartlaştırmaya çalışmıştır13,14. Bununla birlikte, dokuyu bozan histolojik olarak doğrulanmış bölümlerden (%88) gerçekleştirildiğinde, doğrulanmamış bölümlerden (%45) yapıldığında örnekleme verimliliği önemli ölçüde daha yüksektir1.
Burada, bu sınırlamaların üstesinden gelmek için, Biyobanka'da depolanmadan önce taze ve iyi karakterize edilmiş PC örnekleri elde etmeyi amaçlayan yeni bir metodoloji sunulmaktadır. Bu yöntem, farklı klinik hizmetler (Üroloji, Patoloji ve La Fe Hastanesi Biyobankası) arasındaki ortak çabalarla geliştirilmiştir. Biyobankaların biyolojik numunelerin toplanması, işlenmesi, korunması ve saklanmasında önemli bir rol oynadığını ve aynı zamanda numunelerin ve verilerin yüksek kalitesinin yanı sıra etik ve yasal gerekliliklere uyumu sağladığını vurgulamak önemlidir 8,15,16.

<table><tbody><tr><td>Cadiere forseps</td><td>Sezgisel</td><td>PN1052082-US 10/2021</td><td>Parça numarası: 471049. 18 kullanır.</td></tr><tr><td>Konvansiyonel kaydıraklar</td><td>Knittel Glass</td><td>2021</td><td>Topraklı/ Buzlu uç</td></tr><tr><td>Kriyostat mikrotomu</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>---</td><td>Criostato CryoStar NX50</td></tr><tr><td>Cryotubes</td><td>Greiner Bio-One GmbH</td><td>Referans: 122280.</td><td>CRYO S. PP, vidalı kapaklı, steril.</td></tr><tr><td>Da Vinci cerrahi sistemi</td><td>Sezgisel</td><td>PN1052082-US 10/2021</td><td>XI modeli</td></tr><tr><td>Diseksiyon aletleri</td><td>Bayer</td><td>---</td><td>İki cımbız ve bir cerrahi bıçak&nbsp;</td></tr><tr><td>DPX Eukitt&nbsp;</td><td>Medizin- und Labortechnik GmbH</td><td>6.00.01.0001.06.01.01</td><td></td></tr><tr><td>Eosin</td><td>Agilent</td><td>157252</td><td></td></tr><tr><td>Fenestre bipolar forseps</td><td>Sezgisel</td><td>PN1052082-US 10/2021</td><td>Parça numarası: 471205. 14 hayat.</td></tr><tr><td>Bipolar Sezgisel</td><td></td><td>PN1052082-US 10/2021</td><td>Parça numarası: 471405. 12 kullanır.</td></tr><tr><td>Dondurucular</td><td>Thermo Scientific</td><td></td><td>MODEL 907. -80 &gtm; C</td></tr><tr><td>Hematoksilen</td><td>Agilent</td><td>157251</td><td></td></tr><tr><td>İnmunohistokimya Slaytları</td><td>Agilent-Dako</td><td>K802021-2</td><td></td></tr><tr><td>Büyük iğne sürücüsü</td><td>Sezgisel</td><td>PN1052082-US 10/2021</td><td>Parça numarası: 471006. 15 kullanır.</td></tr><tr><td>Maryland bipolar forseps</td><td>Sezgisel</td><td>PN1052082-US 10/2021</td><td>Parça numarası: 471172. 14 kullanır.</td></tr><tr><td>Mikroskop</td><td>Olympus</td><td>---</td><td>Olympus cx40</td></tr><tr><td>Mikrotom bıçakları</td><td>PFM Medical</td><td>a35</td><td></td></tr><tr><td>Monopolar kavisli makas</td><td>Sezgisel</td><td>PN1052082-US 10/2021</td><td>Parça numarası: 470179. 10 kullanır.</td></tr><tr><td>OCT bileşiği</td><td>NEG-50</td><td>LOT.117340</td><td></td></tr><tr><td>PlusSpeed S Eğimli uçlu Tek Kullanımlık Biyopsi Cihazı</td><td>Peter Pflugbeil GmbH&nbsp;</td><td>PSS-1825-S</td><td></td></tr><tr><td>ProGasp forseps</td><td>Sezgisel</td><td>PN1052082-US 10/2021</td><td>Parça numarası: 471093. 18 kullanır.</td></tr><tr><td>Numune tutucu Disk</td><td>Davidson Cryo Chuck. BradleyÜrünler</td><td></td><td>30 mm&nbsp;</td></tr><tr><td>Mendil mürekkebi</td><td>Pelikan</td><td>2021</td><td>Mürekkep 4001 parlak siyah (301168)</td></tr><tr><td>Xylol</td><td>Quimipur</td><td>Ref. 169</td><td></td></tr></tbody></table>

geliştirilmiş Örnekleme tekniği ve histolojik karakterizasyon ile prostat tümörü biyobankacılık güvenilirliğinin artırılması

Enhancing Prostate Tumor Biobanking Reliability with Improved Sampling Technique and Histological Characterization

Taze ve iyi karakterize edilmiş tümör dokusu örneklerinin alınması, yüksek kaliteli "omik" çalışmaların yürütülmesi için kritik öneme sahiptir. Bununla birlikte, bu organın benzersiz doğası ve bu tümörle ilişkili yüksek heterojenlik nedeniyle prostat kanseri (PC) bağlamında özellikle zor olabilir. Öte yandan, önemli doku değişikliklerine neden olmadan numuneleri depolanmadan önce histopatolojik olarak karakterize etmek de ilgi çekici bir zorluktur. Bu bağlamda, rezeke edilen prostat dokusunun anatomopatolojik kriterlere dayalı olarak elde edilmesi, haritalanması, karakterizasyonu ve mikro-diseke edilmesi için yeni bir yöntem sunuyoruz.
Daha önce yayınlanmış protokollerden farklı olarak, bu yöntem prostat örneğinin yapısından ödün vermeden histopatolojik analizi için gereken süreyi azaltır ve bu da cerrahi sınırların değerlendirilmesi için çok önemlidir. Ayrıca, Gleason skoru, öncü lezyonlar (yüksek dereceli prostat intraepitelyal neoplazi - PIN) ve inflamatuar lezyonlar (prostatit) gibi patolojik kriterlerle tanımlanan histolojik tümör alanlarına odaklanarak taze prostat dokusu örneklerinin tanımlanmasını ve mikro-makro diseksiyonunu sağlar. Bu örnekler daha sonra sonraki araştırma analizleri için bir Biyobankada saklanır.

Sonuçlar, bu tekniğin incelenen olguların a'inde (41 olgunun 25'i) tümör materyali elde etmeyi mümkün kıldığını ortaya koymaktadır (Tablo 1).
Tablo 1: Çalışma örneklerinin histopatolojik verileri. Çalışmada kullanılan örnekler için histopatolojik verilerin özeti. Tanısal silindir, tanı amaçlı elde edilen prostat biyopsi örneğini ifade ederken, işlenmiş silindir, araştırma amaçlı prostatektomi örneğinden elde edilen silindire karşılık gelir. ND: veri yok; LL: s...

Bu protokol, radikal prostatektomi örneklerinden örneklerin toplanmasını kolaylaştırmak için bir yöntemi tanımlar. Amaç, örneklerden alınan doku örneklerini bir Biyobankada saklamadan önce anatomopatolojik kriterlere dayalı olarak haritalamak, karakterize etmek ve mikro-makro diseksiyon yapmaktır.

Geliştirilmiş Örnekleme Tekniği ve Histolojik Karakterizasyon ile Prostat Tümörü Biyobankacılık Güvenilirliğinin Artırılması

Acquiring fresh and well-characterized tumor tissue samples is critical for conducting high-quality &#34;omics&#34; studies. However, it can be ...

Araştırmamız, yüksek kaliteli prostat kanseri doku örnekleri elde etmek için metodolojiyi geliştirmeye odaklanmaktadır. Prostat kanseri araştırmalarında genetik intratümöral heterojenite, çok odaklılık ve tümör odaklarının kesin moleküler karakterizasyonu gibi zorlukları ele alır. Biyobankacılık, biyolojik örnekleri sistematik olarak toplayan, işleyen ve depolayan bir teknoloji yönlendirme uygulamasıdır.Bu teknolojilerin entegre edilmesi, iyi karakterize edilmiş prostat kanseri örneklerinden kapsamlı veri setlerinin oluşturulmasını sağlar, işbirliğini teşvik eder, araştırmayı, güvenilirliği geliştirir ve prostat kanseri hastaları için kişiselleştirilmiş tıp ve stratejilerin geliştirilmesine yardımcı olur. Patoloji, intratümöral heterojenite, histopatolojik standardizasyon, moleküler veri entegrasyonu, laboratuvar yoğun süreçler, otomatik e-görüntü analizi için altında iklim kantitatif analizi dahil olmak üzere çeşitli deneysel değişikliklerle karşı karşıyadır. Bu sorunların ele alınması, devam eden teknolojik gelişmeleri, standardizasyon girişimlerini, disiplinler arası işbirliklerini ve gelişmiş deneysel ve hesaplama yöntemlerini gerektirir.Protokol, tümör örneklemesini verimli ve doğru bir şekilde ele alır. Hassas lokalizasyon için görüntüleme ve biyopsi verilerini entegre eder. Gerçek zamanlı histopatolojik içgörüler sunar, maliyetleri ve zamanı azaltır, numune kalitesini artırır ve tüm iskemi süresini en aza indirir.Bu, prostat kanseri histopatolojik araştırmalarındaki kritik zorlukları ele almaktadır. Protokolümüz, tümörün hem histopatolojik verilerin anlaşılmasını iyileştirerek, biyobankacılığı geliştirerek, işbirliğini teşvik ederek ve kişiselleştirilmiş tıbbı mümkün kılarak prostat kanseri araştırmalarını dönüştürebilir. Boylamsal biyobanka, zamansal değişiklikleri ortaya çıkarır, hastalık ilerlemesini ve tedavi yanıtlarını netleştirir, çoklu verileri etkileşime sokar, moleküler sinirleri ve prostat kanseri için yeni biyobelirteçleri ortaya çıkarır.

enhancing-prostate-tumor-biobanking-reliability-with-improved

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Kanser Araştırmaları

Bu videoda, örnekleme için prostat dokusundaki belirli tümör içeren bölgeleri hedeflemek için MRI verisine dayalı bir teknik gösterilmektedir. Toplanan biyopsi örnekleri ya biyobankacılık amaçları için saklanabilir ya da sonraki aşağı akış analizi için kullanılabilir.

Biyobankacılık için Prostat Kanseri Dokusu Örneklemesi: Taze Tümör Dokusundan Biyopsi Zımbalarını Çıkarmak için MRI Kılavuzluğunda Hedefli Bir Teknik

İnsan genomunun% 8'ini işgal insan endojen retrovirüsleri (herv), kıt kodlama kapasitelerini ama yüz bin uzun terminal tekrarları (LSY) korur. Özel bir Affymetrix mikroarray bireysel herv odağı ifade belirlemek için tasarlanmıştır ve gelecekteki klinik çalışmalar için kavramının bir kanıtı olarak prostat kanseri dokularda kullanıldı.

Prostat Kanserinde Biyomarker Discovery Uygulama: Bireysel herv Lokusları İfade Mikroarray tabanlı Kimlik

Kutanöz tümörler genellikle Mohs mikrografik ameliyattan sonra atılır. Klinik destek personelinin klinik operasyonlara müdahale etmeden, aşağısındaki laboratuvar uygulamaları için kutanöz tümörün ( örn., Skuamöz hücreli karsinoma, bazal hücreli karsinoma ve melanom) örneklerini etkili bir şekilde işleyip saklayabilmesini sağlayan bir protokol açıklanmaktadır.

Kliniğe Dayalı Biyorepositoryum Kurulması

Bu yöntem, radikal prostatektomi sonrası biyobankacılık dokusunda örnekleme prosedürlerini yönlendirmek amacıyla prostat kanseri hastaları için klinik tanı salk›r›m verilerinin kullan›m›n› kapsamaktadır. Bu, daha geniş bir akış aşağı uygulama yelpazesi için taze dokunun verimliliği ve kullanılabilirliği etrafında daha önce yayınlanmış yöntemlerle ilgili sorunların üstesinden gelir.

Prostat Kanseri Biyobankacılık Için Örnekleme Prosedürleri Kılavuzu manyetik rezonans görüntüleme ve biyopsi verilerinin kullanımı

Aşağıdaki çalışmada, kolorektal ve pankreas kanserinden oluşan büyük bir biyobankanın kurulması için gerekli ardışık adımları açıklıyoruz.

Yaşayan Bir Biyobankanın Oluşturulması ve Bakımı - Nasıl Yaparız

Biyobankalar biyomedikal araştırmalar için çok önemli kaynaklardır ve Avrupa Onkoloji Enstitüsü'ndeki Translasyonel ve Dijital Tıp Birimi için Biyobanka bu alanda bir modeldir. Burada, biyobankaların farklı insan biyolojik numunelerinin yönetimi için standart çalışma prosedürlerinin ayrıntılı bir açıklamasını sunuyoruz.

Translasyonel Tıp için Biyobanka: Optimal Numune Yönetimi için Standart Çalışma Prosedürleri

Bu makale, biyobankacılık, kişiselleştirilmiş tıp ve diğer araştırma uygulamaları için faydalarını optimize etmek üzere tasarlanmış meme kanseri örneklerinin toplanması için ayrıntılı bir protokol sunmaktadır. Meme biyopsisi ve mastektomi prosedürleri de dahil olmak üzere numune toplama iş akışı, doku hasarını en aza indirmeye ve numune kalitesini en üst düzeye çıkarmaya odaklanarak ayrıntılı olarak açıklanmaktadır.

Meme Biyopsisi ve Mastektomi Örnek Toplama İşlemlerinin Biyobankacılık, Kişiselleştirilmiş Tıp ve Araştırma Uygulamaları için Optimizasyonu

Bu çalışma, koni şeklinde çift delikli yöntem ve çift düzlem prob kılavuzluğu kullanılarak geliştirilmiş bir transperineal prostat biyopsi tekniği sunmaktadır. Bu modifikasyonlar travmayı azaltır, hastanın iyileşmesini artırır ve biyopsi doğruluğunu iyileştirir, bu da prosedürü prostat kanseri teşhisi için güvenilir ve minimal invaziv bir yaklaşım haline getirir.

Transperineal Prostat Biyopsisi Çift Düzlem Prob Kılavuzluğunda Koni Şeklinde Çift Delikli Yöntem Kullanılarak

Burada, kanser-doku oranını iyileştirmek için örnek hazırlama, görüntüleme ve yapay zekaya odaklanan, geleneksel histopatolojiye göre avantajları nedeniyle biyopsi örneklerinde uyarılmış Raman histolojisi (SRH) kullanarak prostat kanserini tespit etmek için standart bir protokol sunuyoruz. Ek olarak, transkriptomik, organoid veya ksenogreft modelleri için biyobankacılığı ve intraoperatif cerrahi sınırların belirlenmesini destekler.

Uyarılmış Raman Histolojisi ve Yapay Zeka Kullanılarak Prostat Biyopsilerinde Kanserin Tespiti ve İzolasyonu

Prostat kanseri heterojenliği ve tedavi direnci zorluklar olmaya devam etmektedir. Temel ebeveyn tümör özelliklerini koruyan hasta kaynaklı organoidler (PDO'lar) üretmek için bir protokol açıklıyoruz. Bu standartlaştırılmış model, ilaç taramasını ve hassas tıptaki gelişmeleri destekler.

Hasta Kaynaklı Prostat Kanseri Organoidlerinin Oluşturulması ve Sürdürülmesi: Ayrıntılı Bir Deneysel Protokol

Keşfedin, prostat kanseri dokularının geliştirilmiş örnekleme ve histolojik karakterizasyon yöntemleriyle nasıl toplandığını. İntratümöral heterojenite ve moleküler analiz zorluklarını aşarak kişiselleştirilmiş tıp stratejilerine katkı sağlar.

Geliştirilmiş Örnekleme Tekniği ve Histolojik Karakterizasyon ile Prostat Tümörü Biyobankacılık Güvenilirliğinin Artırılması

Daha fazla video keşfet