Name: Lazer Yakalama Mikrodiseksiyonu ile Oral Submukoz Fibrozis Örneklerinden Morfolojik ve Mekansal Bilgilerle Hücrelerin İzolasyonu (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2023-08-11T15:00:00.000+00:00
Duration: 5 min 42 s
Description: Öğrenin, lazer yakalama mikrodiseksiyonu ile oral submüöz fibrozis dokularından hücre izolasyonunu. Parafin gömülü örneklerde morfolojik ve mekansal bilgilerle çoklu omik analizler için hücre çıkarımı yapın.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu çalışma, Çin Ulusal Doğa Bilimleri Vakfı (81671006, 81300894), CAMS Tıp Bilimleri İnovasyon Fonu (2019-I2M-5-038), Ulusal klinik anahtar disiplin inşaat projesi (PKUSSNKP-202102), Pekin Üniversitesi Sağlık Bilimleri Merkezi (BMU2022BSS001) Üstün Doktora Adayları için İnovasyon Fonu.

Bu çalışma, Pekin Üniversitesi Okul ve Hastanesi kurumsal inceleme kurulu tarafından onaylanmıştır. Hastalardan bilgilendirilmiş onam alındı. Bu çalışmada kullanılan doku örnekleri tanımlandı. Çalışma şeması Şekil 1'de gösterilmiştir.
1. Numune hazırlama
<ol><li>Formalinle sabitlenmiş parafine gömülü oral submukoz fibroz dokularını bir mikrotom üzerinde 3 μm ve 10 μm kalınlığında sürekli bölümler halinde kesin.</li>
	<li>Bölümleri suda açın ve ardından kaydırakların üzerine balık tutun. 3 μM ve 10 μm'lik bölümleri sırasıyla yapışma mikroskobu slaytlarına (slayt A) ve PEN membran slaytlarına (slayt B) sabitleyin.</li>
	<li>Slaytları 2 saat boyunca 60 °C'de bir sıcak plaka üzerine yerleştirin.</li>
</ol>2. Hematoksilen-eozin boyama
<ol><li>A ve B slaytlarını 10 dakika boyunca ksilene (DİKKAT) yerleştirin ve bu adımı üç kez tekrarlayın.</li>
	<li>Hidrat, derecelendirilmiş etanol çözeltilerinde A ve B'yi her konsantrasyonda 1 dakika boyunca %100, %100, %90, %80 ve %70 sırasına göre kaydırır.</li>
	<li>A ve B slaytlarını 30 saniye boyunca ultra saf damıtılmış suya koyun</li>
	<li>A ve B slaytlarını 90 saniye boyunca Harris hematoksilen boya çözeltisine yerleştirin.</li>
	<li>A ve B slaytlarını 30 saniye boyunca ultra saf damıtılmış suya koyun ve bu adımı üç kez tekrarlayın.</li>
	<li>A ve B slaytlarını 2 saniye boyunca div-hematoksilen çözeltisine (DİKKAT) yerleştirin.</li>
	<li>A ve B slaytlarını 30 saniye boyunca ultra saf damıtılmış suya koyun ve bu adımı üç kez tekrarlayın.</li>
	<li>Slaytları A ve B'ye 2 saniye boyunca% 1 yeniden mavi çözelti içinde yerleştirin.</li>
	<li>A ve B slaytlarını 30 saniye boyunca ultra saf damıtılmış suya koyun ve bu adımı üç kez tekrarlayın.</li>
	<li>Slaytları 2 saniye boyunca eozin çözeltisine yerleştirin.</li>
	<li>A ve B slaytlarını 30 saniye boyunca ultra saf damıtılmış suya koyun ve bu adımı üç kez tekrarlayın.</li>
	<li>Slaytları dereceli etanol çözeltilerinde her konsantrasyonda 2 saniye boyunca %70, %80, %90, %100 ve %100 sırasına göre kurutun.</li>
	<li>Slayt A'yı 3 dakika boyunca ksilene yerleştirin ve bu adımı iki kez tekrarlayın.</li>
	<li>A'yı kaydırmak için bir damla montaj ortamı (DİKKAT) ekleyin ve bir kapak camı ile örtün.</li>
</ol>3. Histolojik morfolojinin gözlenmesi ve lazer yakalama mikrodiseksiyonu
<ol><li>Lazer mikrodiseksiyon sistemini ve yazılımını başlatın (Şekil 2).</li>
	<li>Slayt A'yı slayt tablasına yerleştirin ve lazer mikrodiseksiyonu için ilgilenilen alanı belirlemek için histolojik morfolojiyi gözlemleyin.</li>
	<li>A slaytını çıkarın ve B slaytını slayt sahnesine ters olarak yerleştirin.</li>
	<li>Toplama cihazını dışarı itmek için Kaldır düğmesine (Şekil 2) tıklayın. Toplama cihazına bir polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) tüpü yerleştirin ve tüpün sabit tutulduğundan emin olun. Tamam düğmesine tıklayın (Şekil 3).</li>
	<li>Toplayıcı Aygıt: Tüp Kapakları'nı işaretleyen ilgili kırmızı daireye tıklayarak bir kapak seçin. Seçilen daire yeşile dönecektir.</li>
	<li>Çiz düğmesini ve Çiz + Kes düğmesini tıklayın ve ilgilendiğiniz alanı çizmek için fareyi kullanın.</li>
	<li>Tıkla Kesimi Başlat İlgilenilen alanı yakalamak için düğmesine basın; yakalanan numune kapak tarafından toplanacaktır (Şekil 4).</li>
	<li>Yakalanan örneğin toplandığından emin olmak için Alt düğmeye tıklayın (Şekil 5).</li>
	<li>Bir sonraki örneği yakalamak için Numune düğmesine tıklayın.</li>
	<li>Tıkla Boşalt PCR tüpünü yakalanan sample ile boşaltmak için.</li>
</ol>

Mekansal-omik analiz için oral submukoz fibrozis doku örneklerinin alınması

<ol><li>Cai, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Oral+submucous+fibrosis%3A+A+clinicopathological+study+of+674+cases+in+China%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Oral+Pathology+%26+Medicine%22%5BJournal%5D)">Oral submucous fibrosis: A clinicopathological study of 674 cases in China.</a> Journal of Oral Pathology & Medicine. 48 (4), 321-325 (2019).</li>
<li>Cai, X., Huang, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clinicopathological+factors+associated+with+progression+of+oral+submucous+fibrosis%3A+A+population-based+retrospective+study%5BTitle%5D)+AND+%22Oral+Oncology%22%5BJournal%5D)">Clinicopathological factors associated with progression of oral submucous fibrosis: A population-based retrospective study.</a> Oral Oncology. 130, 105949(2022).</li>
<li>Ray, J. G., Chatterjee, R., Chaudhuri, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Oral+submucous+fibrosis%3A+A+global+challenge.+Rising+incidence%2C+risk+factors%2C+management%2C+and+research+priorities%5BTitle%5D)+AND+%22Periodontology+2000%22%5BJournal%5D)">Oral submucous fibrosis: A global challenge. Rising incidence, risk factors, management, and research priorities.</a> Periodontology 2000. 80 (1), 200-212 (2019).</li>
<li>Shih, Y. H., Wang, T. H., Shieh, T. M., Tseng, Y. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Oral+submucous+fibrosis%3A+A+Review+on+etiopathogenesis%2C+diagnosis%2C+and+therapy%5BTitle%5D)+AND+%22International+Journal+of+Molecular+Sciences%22%5BJournal%5D)">Oral submucous fibrosis: A Review on etiopathogenesis, diagnosis, and therapy.</a> International Journal of Molecular Sciences. 20 (12), 2940(2019).</li>
<li>Cai, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+preliminary+exploration+of+immune+microenvironment+in+oral+leukoplakia+concomitant+with+oral+submucosal+fibrosis%3A+A+comparative+immunohistochemical+study%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Oral+Pathology+%26+Medicine%22%5BJournal%5D)">The preliminary exploration of immune microenvironment in oral leukoplakia concomitant with oral submucosal fibrosis: A comparative immunohistochemical study.</a> Journal of Oral Pathology & Medicine. , (2023).</li>
<li>Warnakulasuriya, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Oral+potentially+malignant+disorders%3A+A+consensus+report+from+an+international+seminar+on+nomenclature+and+classification%2C+convened+by+the+WHO+Collaborating+Centre+for+Oral+Cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Oral+Diseases%22%5BJournal%5D)">Oral potentially malignant disorders: A consensus report from an international seminar on nomenclature and classification, convened by the WHO Collaborating Centre for Oral Cancer.</a> Oral Diseases. 27 (8), 1862-1880 (2021).</li>
<li>Cai, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+and+validation+of+a+nomogram+prediction+model+for+malignant+transformation+of+oral+potentially+malignant+disorders%5BTitle%5D)+AND+%22Oral+Oncology%22%5BJournal%5D)">Development and validation of a nomogram prediction model for malignant transformation of oral potentially malignant disorders.</a> Oral Oncology. 123, 105619(2021).</li>
<li>Murthy, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Malignant+transformation+rate+of+oral+submucous+fibrosis%3A+A+systematic+review+and+meta-analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Clinical+Medicine%22%5BJournal%5D)">Malignant transformation rate of oral submucous fibrosis: A systematic review and meta-analysis.</a> Journal of Clinical Medicine. 11 (7), 1793(2022).</li>
<li>Kujan, O., Mello, F. W., Warnakulasuriya, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Malignant+transformation+of+oral+submucous+fibrosis%3A+A+systematic+review+and+meta-analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Oral+Diseases%22%5BJournal%5D)">Malignant transformation of oral submucous fibrosis: A systematic review and meta-analysis.</a> Oral Diseases. 27 (8), 1936-1946 (2020).</li>
<li>Qin, X., Ning, Y., Zhou, L., Zhu, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Oral+submucous+fibrosis%3A+Etiological+mechanism%2C+malignant+transformation%2C+therapeutic+approaches+and+targets%5BTitle%5D)+AND+%22International+Journal+of+Molecular+Sciences%22%5BJournal%5D)">Oral submucous fibrosis: Etiological mechanism, malignant transformation, therapeutic approaches and targets.</a> International Journal of Molecular Sciences. 24 (5), 4992(2023).</li>
<li>Sun, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell+and+spatial+dissection+of+precancerous+lesions+underlying+the+initiation+process+of+oral+squamous+cell+carcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Discovery%22%5BJournal%5D)">Single-cell and spatial dissection of precancerous lesions underlying the initiation process of oral squamous cell carcinoma.</a> Cell Discovery. 9 (1), 28(2023).</li>
<li>Zhu, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Delineating+the+dynamic+evolution+from+preneoplasia+to+invasive+lung+adenocarcinoma+by+integrating+single-cell+RNA+sequencing+and+spatial+transcriptomics%5BTitle%5D)+AND+%22Experimental+%26+Molecular+Medicine%22%5BJournal%5D)">Delineating the dynamic evolution from preneoplasia to invasive lung adenocarcinoma by integrating single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics.</a> Experimental & Molecular Medicine. 54 (11), 2060-2076 (2022).</li>
<li>Ji, A. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multimodal+analysis+of+composition+and+spatial+architecture+in+human+squamous+cell+carcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Multimodal analysis of composition and spatial architecture in human squamous cell carcinoma.</a> Cell. 182 (2), 497-514 (2020).</li>
<li>Van den Bossche, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microenvironment-driven+intratumoral+heterogeneity+in+head+and+neck+cancers%3A+clinical+challenges+and+opportunities+for+precision+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Drug+Resistance+Updates%22%5BJournal%5D)">Microenvironment-driven intratumoral heterogeneity in head and neck cancers: clinical challenges and opportunities for precision medicine.</a> Drug Resistance Updates. 60, 100806(2022).</li>
<li>Li, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improvement+in+the+risk+assessment+of+oral+leukoplakia+through+morphology-related+copy+number+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Science+China.+Life+sciences%22%5BJournal%5D)">Improvement in the risk assessment of oral leukoplakia through morphology-related copy number analysis.</a> Science China. Life sciences. 64 (9), 1379-1391 (2021).</li>
<li>Watkins, T. B. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pervasive+chromosomal+instability+and+karyotype+order+in+tumour+evolution%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Pervasive chromosomal instability and karyotype order in tumour evolution.</a> Nature. 587 (7832), 126-132 (2020).</li>
<li>Odell, E. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Aneuploidy+and+loss+of+heterozygosity+as+risk+markers+for+malignant+transformation+in+oral+mucosa%5BTitle%5D)+AND+%22Oral+Diseases%22%5BJournal%5D)">Aneuploidy and loss of heterozygosity as risk markers for malignant transformation in oral mucosa.</a> Oral Diseases. 27 (8), 1993-2007 (2021).</li>
<li>Wood, H. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+genomic+road+to+invasion-examining+the+similarities+and+differences+in+the+genomes+of+associated+oral+pre-cancer+and+cancer+samples%5BTitle%5D)+AND+%22Genome+Medicine%22%5BJournal%5D)">The genomic road to invasion-examining the similarities and differences in the genomes of associated oral pre-cancer and cancer samples.</a> Genome Medicine. 9 (1), 53(2017).</li>
<li>Venugopal, D. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrated+proteomics+based+on+2D+gel+electrophoresis+and+mass+spectrometry+with+validations%3A+Identification+of+a+biomarker+compendium+for+oral+submucous+fibrosis-An+indian+study%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Personalized+Medicine%22%5BJournal%5D)">Integrated proteomics based on 2D gel electrophoresis and mass spectrometry with validations: Identification of a biomarker compendium for oral submucous fibrosis-An indian study.</a> Journal of Personalized Medicine. 12 (2), 208(2022).</li>
<li>Kundu, P., Pant, I., Jain, R., Rao, S. G., Kondaiah, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-wide+DNA+methylation+changes+in+oral+submucous+fibrosis%5BTitle%5D)+AND+%22Oral+Diseases%22%5BJournal%5D)">Genome-wide DNA methylation changes in oral submucous fibrosis.</a> Oral Diseases. 28 (4), 1094-1103 (2022).</li>
<li>Cai, X., Zhang, H., Li, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multi-target+pharmacological+mechanisms+of+Salvia+miltiorrhiza+against+oral+submucous+fibrosis%3A+A+network+pharmacology+approach%5BTitle%5D)+AND+%22Archives+of+Oral+Biology%22%5BJournal%5D)">Multi-target pharmacological mechanisms of Salvia miltiorrhiza against oral submucous fibrosis: A network pharmacology approach.</a> Archives of Oral Biology. 126, 105131(2021).</li>
<li>Xiao, X., Hu, Y., Li, C., Shi, L., Liu, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+content+abnormality+in+oral+submucous+fibrosis+concomitant+leukoplakia%3A+A+preliminary+evaluation+of+the+diagnostic+and+clinical+implications%5BTitle%5D)+AND+%22Diagnostic+Cytopathology%22%5BJournal%5D)">DNA content abnormality in oral submucous fibrosis concomitant leukoplakia: A preliminary evaluation of the diagnostic and clinical implications.</a> Diagnostic Cytopathology. 48 (11), 1111-1114 (2020).</li>
<li>Zhou, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Long+non-coding+RNA+expression+profile+associated+with+malignant+progression+of+oral+submucous+fibrosis%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Oncology%22%5BJournal%5D)">Long non-coding RNA expression profile associated with malignant progression of oral submucous fibrosis.</a> Journal of Oncology. 2019, 6835176(2019).</li>
<li>Lunde, M. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Profiling+of+chromosomal+changes+in+potentially+malignant+and+malignant+oral+mucosal+lesions+from+South+and+Southeast+Asia+using+array-comparative+genomic+hybridization%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Genomics+%26+Proteomics%22%5BJournal%5D)">Profiling of chromosomal changes in potentially malignant and malignant oral mucosal lesions from South and Southeast Asia using array-comparative genomic hybridization.</a> Cancer Genomics & Proteomics. 11 (3), 127-140 (2014).</li>
<li>Sun, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spatially+resolved+metabolomics+to+discover+tumor-associated+metabolic+alterations%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">Spatially resolved metabolomics to discover tumor-associated metabolic alterations.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 116 (1), 52-57 (2019).</li>
<li>Ma, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Copy+number+alteration+profiling+facilitates+differential+diagnosis+between+ossifying+fibroma+and+fibrous+dysplasia+of+the+jaws%5BTitle%5D)+AND+%22International+Journal+of+Oral+Science%22%5BJournal%5D)">Copy number alteration profiling facilitates differential diagnosis between ossifying fibroma and fibrous dysplasia of the jaws.</a> International Journal of Oral Science. 13 (1), 21(2021).</li>
</ol>

Yazarlar herhangi bir çıkar çatışması beyan etmezler.

Bu protokol, lazer mikrodiseksiyon yoluyla daha fazla mekansal-omik analiz için morfolojik ve mekansal bilgilerle OSF doku örneklerini yakalamak için bir boru hattı bildirdi. Temsili sonuçlardan, morfoloji ile ilgili çeşitli örnekler arasında farklı CNA kalıpları belirledik.
OPMD'nin bir türü olan OSF, oral skuamöz hücreli karsinomun yaygın bir prekanseröz durumudur6. Genomik instabilitenin OPMD17,18'in gelişimi...

Oral submükoz fibrozis (OSF), esas olarak bukkal mukozada gelişen ve ağız açıklığının kısıtlanması ile sonuçlanan kronik, sinsi bir hastalıktır1. OSF multifaktöriyel bir hastalık iken, areca fıstığı veya tembul fıstığı çiğneme OSF 2,3'ün ana nedenidir. Coğrafi olarak spesifik olan bu alışkanlık nedeniyle, OSF ağırlıklı olarak Güneydoğu ve Güney Asya'daki popülasyonlarda yoğunlaşmıştır3. OSF'nin yaygın histolojik özellikleri arasında oral mukozal epitelin altındaki bağ dokusunda anormal kollajen birikimi, vasküler stenoz ve oklüzyon1 yer alır. OSF epitel dokusu, oral lökoplaki ile birlikte olduğunda atrofi veya hiperplazi ve hatta displazi belirtileri ile ortaya çıkabilir 4,5.
OSF, Dünya Sağlık Örgütü tarafından %4-%6 malign dönüşüm oranı ile oral skuamöz hücreli karsinomlara ilerleme potansiyeli sergileyen yaygın bir oral potansiyel malign bozukluk (OPMD) olarak tanımlanmaktadır6,7,8,9. OSF'nin malign dönüşümünün altında yatan mekanizma kompleks10'dur. Hem displazi hem de atrofi dahil olmak üzere epitelin anormal büyümesi, karsinogenez potansiyelini arttırır ve stromadaki yaşlanan fibroblastlar, reaktif oksijen türleri (ROS) ve diğer moleküller yoluyla epitelyal-mezenkimal geçişi (EMT) indükleyerek OSF'nin malign ilerlemesinde rol oynayabilir10.
Mekansal-omik analizler için teknolojiler, kanser mekanizmaları hakkında içgörü sağlayan morfolojik ve mekansal bilgilerle multi-omik veriler üretti11,12,13. Burada, lazer mikrodiseksiyon ile formalinle sabitlenmiş parafine gömülü OSF dokusundan morfoloji ile ilişkili hücre popülasyonlarını yakalamak için bir protokol sunuyoruz. Bu örneklerin multi-omik analizleri, doku içi heterojenlik ile ilgili zorlukların üstesinden gelebilir ve OSF14'teki moleküler patolojinin ve malign transformasyon mekanizmalarının anlaşılmasını artırabilir.

<table><tbody><tr><td>Yapışma mikroskobu slaytları</td><td>CITOTEST</td><td>REF.188105</td><td></td></tr><tr><td>Div-hematoksilen</td><td>YiLi</td><td>20230326</td><td></td></tr><tr><td>Eozin çözeltisi</td><td>BASO</td><td>BA4098</td><td></td></tr><tr><td>Etanol</td><td>PEKING REAKTIF</td><td>No.32061</td><td></td></tr><tr><td>Harris hematoksilen boya çözeltisi</td><td>YiLi</td><td>20230326</td><td></td></tr><tr><td>Sıcak plaka</td><td>LEICA</td><td>HI1220</td><td></td></tr><tr><td>Lazer yakalama mikrodiseksiyon sistemi</td><td>LEICA</td><td>LMD7</td><td>Makinesi</td></tr><tr><td>Lazer mikrodiseksiyon mikrosistemi</td><td>LEICA</td><td>8.2.3.7603</td><td>Yazılım</td></tr><tr><td>Micromount montaj ortamı</td><td>LEICA</td><td>REF.3801731</td><td></td></tr><tr><td>Mikroskop kapak camı</td><td>CITOTEST</td><td>REF.10212450C</td><td></td></tr><tr><td>Mikrotom</td><td>LEICA</td><td>RM2235</td><td></td></tr><tr><td>PCR tüpleri</td><td>AXYGEN</td><td>16421959</td><td></td></tr><tr><td>PEN-membran slaytlar</td><td>LEICA</td><td>No.11505158</td><td></td></tr><tr><td>Yeniden mavi çözelti</td><td>YiLi</td><td>20230326</td><td></td></tr><tr><td>Ultra saf damıtılmış su</td><td>Invitrogen</td><td>REF.10977-015</td><td></td></tr><tr><td>Ksilen</td><td>PEKING REAKTIFI</td><td>No.33535</td><td></td></tr></tbody></table>

lazer yakalama mikrodiseksiyonu ile oral submukoz fibrozis Örneklerinden morfolojik ve mekansal bilgilerle hücrelerin İzolasyonu

Isolation of Cells with Morphological and Spatial Information from Oral Submucous Fibrosis Samples by Laser Capture Microdissection

Oral submukoz fibrozis (OSF), ağız boşluğunda yaygın olarak görülen potansiyel olarak malign bir bozukluk türüdür. Epitel atrofisi ve lamina propria ve submukoza fibrozisi sıklıkla histopatolojik slaytlarda bulunur. Epitelyal displazi, epitelyal atrofi ve yaşlanan fibroblastların OSF'nin malign transformasyonu ile ilişkili olduğu öne sürülmüştür. Bununla birlikte, potansiyel olarak malign oral bozuklukların ve oral skuamöz hücreli karsinomun heterojenliği nedeniyle, OSF'de malign transformasyonun spesifik moleküler mekanizmalarını tanımlamak zordur. Burada, formalinle sabitlenmiş parafine gömülü doku preparatları üzerinde lazer yakalama mikrodiseksiyonu ile morfolojik veri ve uzamsal bilgi taşıyan az sayıda epitelyal veya mezenkimal hücre elde etmek için bir yöntem sunuyoruz. Mikroskop kullanarak, mikro ölçekli (~ 500 hücre) displastik veya atrofik epitel dokusunu ve fibrotik subepitel dokusunu hassas bir şekilde yakalayabiliriz. Ekstrakte edilen hücreler, morfolojik ve mekansal bilgilerle genomik ve transkriptomik veriler elde etmek için genom veya transkriptom dizilimi ile değerlendirilebilir. Bu yaklaşım, toplu OSF doku diziliminin heterojenliğini ve lezyonsuz alanlardaki hücrelerin neden olduğu girişimi ortadan kaldırarak, OSF dokusunun hassas uzamsal-omik analizine izin verir.

OSF dokularının lazer mikrodiseksiyonu ile displastik epitel, displastik epitel altında stroma, atrofik epitel ve atrofik epitel dokusu altında stroma örnekleri elde edildi (Şekil 1). DNA'nın çıkarılması ve düşük derinlikli tüm genom dizilimi yoluyla, morfolojiyle ilgili kopya sayısı değişikliklerini (CNA) analiz edebildik15. CNA, OPMD15,16'da artmış malign transformasyon riski ile ilişkili yaygın bir genomik ...

Oral submukoz fibroz dokularının lazer yakalama mikrodiseksiyonu, morfolojik ve mekansal bilgilerle multi-omik verilerin analizi için ilgilenilen histolojik bölgelerden hücrelerin hassas bir şekilde çıkarılmasına izin verir.

Lazer Yakalama Mikrodiseksiyonu ile Oral Submukoz Fibrozis Örneklerinden Morfolojik ve Mekansal Bilgilerle Hücrelerin İzolasyonu

Oral submucous fibrosis (OSF) is a common type of potentially malignant disorder in the oral cavity. The atrophy of epithelium and fibrosis of the lamina ...

Başlıca araştırma alanlarımız, oral lökoplaki ve oral submukoz fibrozis gibi oral, potansiyel olarak malign bozuklukların prediktif modellerinin geliştirilmesi altında malign dönüşüm mekanizmalarıdır. Derin öğrenme yapay zeka modelleri altında genomik transkriptomik, proteomik ve diğer multi-omik dizileme analizleri, ağız, potansiyel olarak malign bozukluklardan ağız kanserine ilerlemeyi incelemek için kullanılır. Mevcut dizileme ve multi-omik analizler çoğunlukla donmuş örneklere dayanmaktadır, ancak oral, potansiyel olarak malign bozukluklar çoğunlukla biyopsi ile resmi olarak sabitlenmiş parafine gömülü dokudur ve parafin örneklerine dayalı deneysel teknikler geliştirme ihtiyacı vardır.Oral, potansiyel olarak malign bozukluklardan ve skuamöz hücreli karsinomdan alınan parafin doku örnekleri çok sayıda ve çeşitli kaynaklardan temin edilebilir, bu da onları çalışma için çok değerli bir kaynak haline getirir. Tüm protokoller, hastalık gelişimi ve malign dönüşüm mekanizmalarını daha iyi anlamak için bu kaynakları tam olarak kullanmaya yardımcı olabilir.

isolation-cells-with-morphological-spatial-information-from-oral

Research

JoVE Journal

Medicine

Tıp

Memeli Doku Lazer Yakalama Mikrodisseksiyon

Video, 3D organotipik ko-kültür modelinin mikron düzeyinde hassasiyetle lazer diseksiyonunu açıklamaktadır. 3D organotipik modellerde, fibroblastlar gibi stromal bileşenler, kanser epitel hücreleri ile 3 boyutlu olarak birlikte kültürlenir. 3D model, invazyon ve kanser-stroma etkileşimlerinin yakın fizyolojik koşullarda incelenmesini sağlayan deneysel bir araç olarak hizmet eder.

Lazer Mikrodiseksiyon: İstilacı Kolorektal Kanser hücrelerini 3D Organotipik Kültür Modelinden İzole Etme Tekniği

Sentetik, doku mühendisliği kolorektal kanser modelleri, lazer microdissected stroma hücreleri ve moleküler profil invaziv ön ve kanserle ilişkili stromal hücre tümör hücreleri arasındaki ara yüzeyde ayırt edici karakterize biyoloji ve incelemek için bir yeni ve manuel olarak kullanılabilen bir yaklaşımı temsil etmektedir.

Moleküler Kolorektal Kanser Hücrelerinin bir 3-Boyutlu Modeli İnvaziv tümör mikro Profili ve<em&gt; Ex vivo</em&gt; Fibroblastlar

Diseksiyon yaygın doku içindeki DNA, RNA ve protein incelenmesi için kullanılmıştır. Lazer yakalama mikroskobu (LCM) en sık kullanılan yöntem, ancak, yeni bir freze tekniği, mesodissection, son zamanlarda kullanılabilir. Biz mesodissected formalin sabit parafin Mycobacterium tuberculosis granülomlarının gömülü doku slaytlar RNA çıkarma göstermektedir.

Kurtarma Bir Roman Mikrodiseksiyon Yaklaşımı<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</emAkciğer granülomlara Gömülü Formalinle Sabit Parafin dan&gt; Özel Transkript

Bireysel dopamin nöronlarının izolasyon ya da doğrudan veya dolaylı olarak immunohistokimyasal ile ventral tegmental alan lazer yakalama mikrodiseksiyon kullanılarak gösterilmiştir. Kızılötesi lazer kullanarak cam slayt doku izolasyonu ve bir kızılötesi ve morötesi lazer kombinasyonu kullanılarak membran slaytlar arasındaki parametreler tartışılmıştır.

Lazer Yakalama Mikrodisseksiyon - Bireysel Dopamin Nöronlar İzolasyonu ve Tüm ventral tegmental Area bir Gösteri

Belirli bir doku hücrelerinin bir alt kümesi gen ifade analizi büyük bir sorun teşkil etmektedir. Bu makalede, lazer yakalama mikrodiseksiyon ile hızlı bir immün yöntemi birleştirerek belirli bir hücre popülasyonu yüksek kaliteli toplam RNA izole açıklamaktadır.

Hücre belirli alt gruplar RNA izolasyonu Hızlı immünoyaftalama ile birlikte Lazer yakalama mikrodiseksiyon kullanma

Burada, transkripsiyonel profilleme için belirli bitki hücre tiplerinin lazer destekli mikrodiseksiyonu için bir protokol sunuyoruz. Protokol farklı türler ve hücre tipleri için uygun olsa da, odak noktası, turpgil cinsi Boechera'da eşeyli ve apomiktik üreme için önemli olan dişi germ hattının son derece erişilemez hücreleridir.

Bireysel Hücre Tiplerinin transkripsiyonel Profiling için bir alet olarak lazer destekli mikrodiseksiyon (LAM)

Bu iletişim kuralı, enterik gangliyon lazer yakalama mikrodiseksiyon (LCM) kullanarak sabitlenmemiş, taze rezeke insan bağırsak dokusundan izole yüksek bütünlük RNA örnekleri almak için hedeftir. Bu protokol flaş donmuş örnekleri insan bağırsak dokusu, cryosectioning, ethanolic boyama ve dehidratasyon, LCM, hazırlanıyor içerir ve RNA çıkarma.

Lazer-yakalama mikrodiseksiyon optimizasyonu gelen insan dokusu taze donmuş enterik gangliyon yalıtım için

Lazer mikrodisesi ( LMD) glioma heterojenite ve invazyon aracılık yolları ortaya çıkarmak için kullanılabilecek hassas ve son derece tekrarlanabilir bir tekniktir. Burada lazer LMD kullanarak glioma dokusundan ayrık alanları izole etmek ve ardından transkripsiyonanalizi yapmak için optimize edilmiş bir protokol tanımlıyoruz.

İntratümöral Heterojenite, Oncostreams ve Invasion'ın Mekansal ve Moleküler Karakterizasyonu için Glioma Alt Bölgelerinin Lazer Yakalama Mikrodizması

Bu protokol, lazer mikrodiseksiyonu kullanarak histoloji ile çözülmüş hücre popülasyonlarının zenginleştirilmesi için lekeli, ince doku kesiti görüntülerinden patoloji onaylı ilgi alanlarının yapay zeka odaklı segmentasyonu için yüksek verimli bir iş akışını açıklamaktadır. Bu strateji, ilgilenilen hücre popülasyonlarını gösteren sınırların doğrudan lazer mikroskoplara aktarılmasını sağlayan yeni bir algoritma içerir.

Tümör Mikroçevresinin Mikro Ölçekli Proteomik Analizi için Endüstriyelleşmiş, Yapay Zeka Rehberliğinde Lazer Mikrodiseksiyonu

Öğrenin, lazer yakalama mikrodiseksiyonu ile oral submüöz fibrozis dokularından hücre izolasyonunu. Parafin gömülü örneklerde morfolojik ve mekansal bilgilerle çoklu omik analizler için hücre çıkarımı yapın.

Lazer Yakalama Mikrodiseksiyonu ile Oral Submukoz Fibrozis Örneklerinden Morfolojik ve Mekansal Bilgilerle Hücrelerin İzolasyonu (Video) | JoVE Journal

Lazer Yakalama Mikrodiseksiyonu ile Oral Submukoz Fibrozis Örneklerinden Morfolojik ve Mekansal Bilgilerle Hücrelerin İzolasyonu

Daha fazla video keşfet