Using Cleavage Under Targets and Tagmentation (CUT&#38;Tag) Assay in Mouse Myoblast Research

Yuefeng Li; Xiaofen Wu; Ping Hu

doi:10.3791/66066

Fare Miyoblast Araştırmalarında Hedefler Altında Bölünme ve Etiketleme (CUT & Tag) Testinin K...

JoVE Journal
Developmental Biology
Author Produced

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Developmental Biology

Using Cleavage Under Targets and Tagmentation (CUT&Tag) Assay in Mouse Myoblast Research

Fare Miyoblast Araştırmalarında Hedefler Altında Bölünme ve Etiketleme (CUT & Tag) Testinin Kullanılması

Full Text

1,335 Views

07:09 min

March 1, 2024

DOI: 10.3791/66066-v

Yuefeng Li^1,2, Xiaofen Wu^1,2, Ping Hu^1,2

¹Guangzhou Laboratory, ²The Key Laboratory of Biological Targeting Diagnosis, Therapy and Rehabilitation of Guangdong Higher Education Institutes,The Fifth Affiliated Hospital of Guangzhou Medical University

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Epigenetik alanda yeni olan araştırmacılar, CUT & Tag'i ChIP tahlillerine göre önemli ölçüde daha kolay bir alternatif bulacaklar. CUT & Tag, nadir ve birincil hücre popülasyonları üzerindeki epigenetik çalışmalardan büyük ölçüde yararlandı ve çok az hücreden yüksek kaliteli veriler üretti. Bu protokol, fare arka bacak kaslarından izole edilen fare miyoblastları üzerinde H3K4me1 CUT & Tag testlerinin gerçekleştirilmesini açıklar.

Grubumuzun araştırması, yetişkin iskelet kası kök hücrelerinde genom yapısının ve transkripsiyonun, özellikle kök hücre bağlılığı, farklılaşması ve tinasisis gibi sülfat değişiklikleri sırasında nasıl düzenlendiğine ve sürdürüldüğüne odaklanmaktadır. Kas dokusundaki tek çekirdekli hücrelerin sadece %1'ini içeren yetişkin iskelet kası kök hücreleri, kas sindiriminden elde edilen tek hücreli süspansiyonlardaki kıtlıkları nedeniyle High-C, ChIP'ler ve ATAC dizilimi kullanan kromatin özellik çalışmaları için bir zorluk teşkil etmektedir. Kromatin immüno-çökeltme, ChIP, genom özelliklerinin profilini çıkarmak için önemli bir araç olmuştur.

Dr.Steven Henikoff tarafından geliştirilen daha basit, daha verimli bir kesme ve etiketleme tekniği, özellikle nadir hücre popülasyonlarında epigenetik çalışmalarında, genellikle ChIP'yi aşar. Kullanım kolaylığı, epigenetik olmayan uzmanlar da dahil olmak üzere araştırmacılar için erişilebilirliği genişletir.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos