Name: Polikarbonat Ultrasantrifüj Tüpünün Hücre Dışı Veziküllerin Proteomik Analizlerinde Yeniden Kullanımı (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2024-03-08T13:40:00.000+00:00
Duration: 2 min 36 s
Description: Keşfedin polikarbonat ultrasantrifüj tüplerinin hücre dışı vezikül izolasyonunda yeniden kullanımını. Bu yöntem, kardiyovasküler dokularda kalsifikasyon çalışmaları için proteomik analizlerde maliyet ve atık azaltır.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu çalışma, Ulusal Sağlık Enstitüleri hibeleri (NIH) R01HL147095, R01HL141917 ve R01HL136431, Kowa Company, Ltd. ve Avrupa Birliği'nin Horizon 2020 Araştırma ve İnovasyon Programı'ndan Marie Skłodowska-Curie Hibe Sözleşmesi No. 101023041 (R. Cahalane) tarafından bir araştırma hibesi ile desteklenmiştir. Şekil 1 , Biorender.com ile oluşturulmuştur. Mevcut temizleme protokolü, Uluslararası Hücre Dışı Veziküller Derneği 2023 Eğitim Günü'nde (https://www.youtube.com/watch?v=DOebcOes6iI) sunulan önerilen bir tüp temizleme protokolü değiştirilerek geliştirilmiştir. Orijinal karotis dokusu EV örnekleri için Üniversite Sağlık Ağı'ndan (Toronto Üniversitesi, Kanada) Dr. Kathryn Howe ve Dr. Sneha Raju'ya çok teşekkürler.

1. Tüp temizleme
NOT: EV izolasyon prosedürü, hem kapaklı hem de kapaksız polikarbonat UC tüpleri kullanır (aşağıda ayrıntılı olarak açıklanmıştır). Hem kapaklı hem de kapaksız tüpler için aynı prosedür izlendi. Kapaklı tüpler söz konusu olduğunda, kapak parçaları ayrı ayrı temizlendi ve kurutma ve ön depolamadan sonra yeniden birleştirildi.
<ol><li>Polikarbonat tüplerin ilk kullanımından ve numunenin çıkarılmasından sonra, numunenin tüpün yan tarafına kurumasını önlemek için UC tüplerini hemen musluk suyuna batırın.</li>
	<li>Tüpleri %0,1 sodyum dodesil sülfat (SDS) içinde 10 dakika musluk suyuna aktarın ve daldırın.</li>
	<li>Her seferinde bir tüp, SDS çözeltisinin hepsini olmasa da çoğunu tüpten boşaltın ve EV peletinin bulunduğu tüp alanını iyice silmek için bir pamuklu çubuk kullanın. NOT: Kıllı hiçbir şey kullanmayın. Bu protokolde normal pamuklu çubuklar kullanılırdı; Bununla birlikte, tüpleri temizlemek için özel, az tüy bırakan pamuklu çubuklar kullanılabilir.</li>
	<li>En az 3 kez sıcak musluk suyuyla (~50 °C) durulayın. Tüpü tamamen doldurduğunuzdan ve boşalttığınızdan emin olun.</li>
	<li>1x'i bir sprey şişesi veya dar ağızlı bir yıkama şişesi kullanarak demineralize su ile durulayın.</li>
	<li>Bir sprey şişesi kullanarak 1x'i %70 etanol ile durulayın.</li>
	<li>Tüpü kuruması için baş aşağı bırakın. NOT: Floresanla aktive edilmiş hücre sınıflandırması için tüp rafları, UC tüplerini kurutmak için iyi çalışır.</li>
	<li>Tamamen kurumuş tüpleri temiz bir kavanoza koyun; Yeniden kullanıma hazırdırlar. NOT: Şu anda, protokol 2x'e kadar yeniden kullanım için doğrulanmıştır.</li>
</ol>2. EV zenginleştirme
NOT: Aşağıdaki EV izolasyonu ve proteomik protokolü, hem orijinal doku EV izolasyonu hem de boş (hiç kullanılmamış) ve temizlenmiş tüp örneklerini elde etmek için kullanılan "sahte örnekler" için kullanılmıştır. Orijinal örnekler, karotis endartektomi uygulanan hastaların karotis plaklarından doku tuzağına düşürülmüş EV'ler olarak yeniden süspanse edildi. Cerrahi örnekler Üniversite Sağlık Ağı'ndan (Toronto, Kanada) toplandı ve kurumsal etik kurul tarafından onaylandı. Tüm hastalar, Helsinki Bildirgesi'ne uygun olarak numune toplama ve veri analizi için bilgilendirilmiş onam verdiler. Sahte numuneler, boş ve temizlenmiş tüplerin EV izolasyon numuneleri ile aynı çözeltiler ve işleme adımlarıyla işlenmesinden elde edilen sahte peletlerdi.
<ol><li>EV numunelerinin buzunu çözün veya PBS'de buz üzerinde sahte numuneler yapın.</li>
	<li>NTE tamponu (10 mM Tris-HCl, 1 mM EDTA, 0.137 M NaCl pH 7.4) ve steril filtre yapın.</li>
	<li>Numuneleri 10.000 × g'da 4 °C'de 10 dakika döndürün.</li>
	<li>Süpernatanı 1 mL'lik üstü açık polikarbonat tüpe taşıyın.</li>
	<li>Süpernatanı 4 ° C'de 1 saat boyunca 100.000× g'da santrifüjleyin.</li>
	<li>Pelet, proteaz inhibitörü ile 150 μL steril filtreli NTE tamponunda yeniden süspanse edin.</li>
	<li>1.5 mL'lik bir mikrosantrifüj tüpüne aktarın ve toplam 1.5 mL'lik bir numune hacmine ulaşmak için NTE tamponu ekleyin.</li>
	<li>Numuneleri buz üzerinde tutun.</li>
</ol>3. Yoğunluk gradyanlarının hazırlanması ve yoğunluk gradyan ayrımı
NOT: Bu EV izolasyon protokolü daha önce Blaser ve ark.9 tarafından tanımlanmıştır Kısaca:
<ol><li>Seyreltici olarak NTE tamponu ile beş İodiksanol Yoğunluk Gradyan Ortamı (% 10,% 15,% 20,% 25 ve% 30) çözeltisi hazırlayın.</li>
	<li>Beş yoğunluk çözeltisini, %30'u altta ve %10'u üstte olacak şekilde kapaklı ultrasantrifüj tüp(ler)ine sırayla katmanlayın.</li>
	<li>Kapakları tüp(ler)in üzerine sabitleyin ve oda sıcaklığında 1 saat boyunca yavaşça sabit bir yatay konuma hareket ettirin.</li>
	<li>1 saat sonra, gradyanı soğutmak için tüp(ler)i 30 dakika boyunca buz üzerinde yavaşça dikey konuma getirin.</li>
	<li>Hazırlanan yoğunluk gradyan tüp(ler)inin üstüne 1.5 mL numune veya sahte numune (NTE tamponu) ekleyin.</li>
	<li>4 ° C'de 40 dakika boyunca 250.000 × g'da ultrasantrifüj tüp(ler)i.</li>
	<li>Yoğunluk gradyanının (2.4 mL) üst fraksiyonlarını kapaksız ultrasantrifüj tüp(ler)ine çıkarın. Steril filtrelenmiş NTE tamponu ile 9 mL'ye kadar doldurun.</li>
	<li>EV'leri 4 °C'de 1 saat boyunca 100.000 × g'da ultrasantrifüj ederek peletleyin. NOT: Görünür EV peletinin konumunu veya beklenen konumu bir işaretleyici ile daire içine alın. Bu, pelet alanını doğrudan çubukla temizlemenizi sağlar.</li>
	<li>Tüpü 3 dakika boyunca baş aşağı konuma getirirken süpernatanı aspire edin. Tüpü sağ tarafı yukarı çevirmeden önce kalan damlacıkları pamuklu çubukla çıkarın.</li>
	<li>EV peletini referans alınan kitte 12 μL liz tamponu içinde yeniden süspanse edin.</li>
</ol>4. Proteomik için peptit hazırlama
NOT: Proteomik numune hazırlama, düşük bolluktaki protein numuneleri için kurum içi modifikasyonlarla kit protokolüne göre gerçekleştirilmiştir. Değiştirilen protokol aşağıdaki gibidir:
<ol><li>Numuneleri lizse tamponunda 95 °C'de 10 dakika ısıtarak parçalayın, denatüre edin, indirgeyin ve alkilleyin.</li>
	<li>Numuneden 10 μL liz çözeltisi ve 10 μL sindirim çözeltisi kullanarak 37 ° C'de 2 saat boyunca Lys-C / tripsin sindirim solüsyonunu kullanarak numuneleri sindirin.</li>
	<li>Hidrofilik ve hidrofobik kirleticileri yıkayarak ve kit çözeltileri kullanarak saflaştırılmış peptitleri dışarı atarak peptitleri bir kartuştan saflaştırın.</li>
	<li>Saflaştırılmış peptitleri 45 ° C'de 45 dakika veya kuruyana kadar hızlı bir vakumda kurutun. NOT: Peptitlerin aşırı kurumasını önleyin.</li>
	<li>Numuneleri kütle spektrometresi dizileme zamanına kadar -80 °C'de saklayın.</li>
	<li>Kurutulmuş peptitlere 17 μL LC yük çözeltisi ekleyin.</li>
	<li>Numuneleri 1 saat buz üzerinde bırakın.</li>
	<li>Örnekleri kısaca vorteksleyin ve ardından 5 dakika boyunca ultrasonik bir su banyosunda sonikasyon yapın.</li>
	<li>LC yük numunelerini 1 dakika boyunca 16.000 × g'da santrifüjleyin, üstten 15 μL aspire edin ve yeni bir tüpe ayırın.</li>
</ol>5. Sıvı kromatografisi ve tandem kütle spektrometresi dizilimi
<ol><li>Bir kütle spektrometresi üzerine 2 μL LC yüklü peptit çözeltisi enjekte edin.</li>
	<li>Çift sütunlu bir kurulum kullanarak peptitleri fraksiyonlayın.</li>
	<li>Kolonu 45 °C'lik sabit bir sıcaklıkta ısıtın.</li>
	<li>Analitik gradyanı 300 nL/dk'da %5 ila %21 Solvent B'den (asetonitril /%0.1 formik asit) 60 dakika çalıştırın, ardından 10 dakika %21 ila %30 Solvent B ve 10 dakika daha %95-%5 dekupaj testere yıkama.</li>
	<li>MS1'i 120 K çözünürlüğe (maksimum enjeksiyon süresi, 25 ms) ayarlayın, üst öncü iyonları (3,0 sn döngü süresi içinde) HCD izolasyon genişliği 1,2 m/z'ye, dinamik dışlama etkin (60 sn) duruma getirin ve MS2 çözünürlüğünü 60 K (maksimum enjeksiyon süresi, otomatik; normalleştirilmiş çarpışma enerjisi, %24, %26 ve %28) olarak ayarlayın.</li>
	<li>MS1 ve MS2 alım aralığını sırasıyla 400 m/z-1.200 m/z ve 120 m/z-1.200 m/z olarak ayarlayın.</li>
</ol>6. Peptit / protein tanımlaması
<ol><li>Elde edilen peptit spektrumlarını, bir insan uniProt veritabanına karşı ticari bir arama algoritması kullanarak bir proteomik arama yazılımı ile arayın.</li>
	<li>Sindirim enzimini tripsine ayarlayın ve iki adede kadar kaçırılan bölünmeye izin verin.</li>
	<li>Öncü toleransı 10 ppm'ye ve parça tolerans penceresini 0,02 Da'ya ayarlayın.</li>
	<li>Metiyonin oksidasyonunu ve N-terminal asetilasyonunu değişken modifikasyonlar olarak ve sistein karbamidometilasyonunu sabit modifikasyon olarak ayarlayın.</li>
	<li>Peptitleri, Percolator algoritması tarafından hesaplanan %1.0'lık bir yanlış keşif oranı (FDR) eşiğine göre filtreleyin.</li>
	<li>Yalnızca belirli bir protein grubuna atanan ve başka herhangi bir protein grubunda tespit edilmeyen peptitleri benzersiz olarak kabul edin ve bunları daha fazla analiz için kullanın.</li>
	<li>Analizlerde her protein için yalnızca en az iki benzersiz peptit ekleyin.</li>
	<li>Öncü iyon algılama ile kimlikleri en üst düzeye çıkarın.</li>
	<li>Maksimum 10 dakikalık tutma süresi kayması, 10 ppm kütle toleransı ve minimum 5 sinyal-gürültü ile kromatografik hizalama gerçekleştirin.</li>
	<li>Peptit bolluğunu toplam peptit miktarına göre normalleştirin.</li>
</ol>

Proteomik için Polikarbonat Ultrasantrifüj Tüplerinin Verimli Geri Dönüşümü

<ol><li>van Niel, G., D'Angelo, G., Raposo, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Shedding+light+on+the+cell+biology+of+extracellular+vesicles%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Reviews+Molecular+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Shedding light on the cell biology of extracellular vesicles.</a> Nature Reviews Molecular Cell Biology. 19 (4), 213-228 (2018).</li>
<li>Théry, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Minimal+information+for+studies+of+extracellular+vesicles+2018+%28MISEV2018%29%3A+a+position+statement+of+the+International+Society+for+Extracellular+Vesicles+and+update+of+the+MISEV2014+guidelines%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Extracellular+Vesicles%22%5BJournal%5D)">Minimal information for studies of extracellular vesicles 2018 (MISEV2018): a position statement of the International Society for Extracellular Vesicles and update of the MISEV2014 guidelines.</a> Journal of Extracellular Vesicles. 7 (1), 1535750(2018).</li>
<li>Witwer, K. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Standardization+of+sample+collection%2C+isolation+and+analysis+methods+in+extracellular+vesicle+research%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Extracellular+Vesicles%22%5BJournal%5D)">Standardization of sample collection, isolation and analysis methods in extracellular vesicle research.</a> Journal of Extracellular Vesicles. 2 (1), 20360(2013).</li>
<li>Konoshenko, M. Y., Lekchnov, E. A., Vlassov, A. V., Laktionov, P. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+of+extracellular+vesicles%3A+general+methodologies+and+latest+trends%5BTitle%5D)+AND+%22BioMed+Research+International%22%5BJournal%5D)">Isolation of extracellular vesicles: general methodologies and latest trends.</a> BioMed Research International. 2018, e854347(2018).</li>
<li>Kowal, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Proteomic+comparison+defines+novel+markers+to+characterize+heterogeneous+populations+of+extracellular+vesicle+subtypes%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences%22%5BJournal%5D)">Proteomic comparison defines novel markers to characterize heterogeneous populations of extracellular vesicle subtypes.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 113 (8), E968-E977 (2016).</li>
<li>Karimi, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detailed+analysis+of+the+plasma+extracellular+vesicle+proteome+after+separation+from+lipoproteins%5BTitle%5D)+AND+%22Cellular+and+Molecular+Life+Sciences%22%5BJournal%5D)">Detailed analysis of the plasma extracellular vesicle proteome after separation from lipoproteins.</a> Cellular and Molecular Life Sciences. 75 (15), 2873-2886 (2018).</li>
<li>Lischnig, A., Bergqvist, M., Ochiya, T., Lässer, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+proteomics+identifies+proteins+enriched+in+large+and+small+extracellular+vesicles%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+%26+Cellular+Proteomics%22%5BJournal%5D)">Quantitative proteomics identifies proteins enriched in large and small extracellular vesicles.</a> Molecular & Cellular Proteomics. 21 (9), 100273(2022).</li>
<li>van Herwijnen, M. J. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comprehensive+proteomic+analysis+of+human+milk-derived+extracellular+vesicles+unveils+a+novel+functional+proteome+distinct+from+other+milk+components%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+%26+Cellular+Proteomics%22%5BJournal%5D)">Comprehensive proteomic analysis of human milk-derived extracellular vesicles unveils a novel functional proteome distinct from other milk components.</a> Molecular & Cellular Proteomics. 15 (11), 3412-3423 (2016).</li>
<li>Blaser, M. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiomics+of+tissue+extracellular+vesicles+identifies+unique+modulators+of+atherosclerosis+and+calcific+aortic+valve+stenosis%5BTitle%5D)+AND+%22Circulation%22%5BJournal%5D)">Multiomics of tissue extracellular vesicles identifies unique modulators of atherosclerosis and calcific aortic valve stenosis.</a> Circulation. 148 (8), 661-678 (2023).</li>
<li>Kristensen, K., Henriksen, J. R., Andresen, T. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Adsorption+of+cationic+peptides+to+solid+surfaces+of+glass+and+plastic%5BTitle%5D)+AND+%22PLOS+ONE%22%5BJournal%5D)">Adsorption of cationic peptides to solid surfaces of glass and plastic.</a> PLOS ONE. 10 (5), e0122419(2015).</li>
<li>Use and care of centrifuge tubes and bottles. Beckman Coulter. , Available from: 
 <a target="_blank" href="https://www.beckman.com/supplies/tubes-and-bottles">https://www.beckman.com/supplies/tubes-and-bottles</a> (2014).</li>
<li>R&D & Technology Department chemical resistance of polycarbonate products. PALRAM. , Available from: 
 <a target="_blank" href="http://ilgbcatalog.org/wp-content/uploads/2015/02/PC-chemical-resistance.pdf">http://ilgbcatalog.org/wp-content/uploads/2015/02/PC-chemical-resistance.pdf</a> (2015).</li>
<li>Wang, L., Zhang, J., Hou, S., Sun, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+method+for+quantifying+polycarbonate+and+polyethylene+terephthalate+microplastics+in+environmental+samples+by+liquid+chromatography-tandem+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Environmental+Science+%26+Technology+Letters%22%5BJournal%5D)">A simple method for quantifying polycarbonate and polyethylene terephthalate microplastics in environmental samples by liquid chromatography-tandem mass spectrometry.</a> Environmental Science & Technology Letters. 4 (12), 530-534 (2017).</li>
<li>Schittek, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dermcidin%3A+a+novel+human+antibiotic+peptide+secreted+by+sweat+glands%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Immunology%22%5BJournal%5D)">Dermcidin: a novel human antibiotic peptide secreted by sweat glands.</a> Nature Immunology. 2 (12), 1133-1137 (2001).</li>
<li>Blaydon, D. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mutations+in+CSTA%2C+encoding+Cystatin+A%2C+underlie+exfoliative+ichthyosis+and+reveal+a+role+for+this+protease+inhibitor+in+cell-cell+adhesion%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Human+Genetics%22%5BJournal%5D)">Mutations in CSTA, encoding Cystatin A, underlie exfoliative ichthyosis and reveal a role for this protease inhibitor in cell-cell adhesion.</a> American Journal of Human Genetics. 89 (4), 564-571 (2011).</li>
<li>Henry, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hornerin+is+a+component+of+the+epidermal+cornified+cell+envelopes%5BTitle%5D)+AND+%22FASEB+Journal%22%5BJournal%5D)">Hornerin is a component of the epidermal cornified cell envelopes.</a> FASEB Journal. 25 (5), 1567-1576 (2011).</li>
<li>Bolling, M. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Generalized+ichthyotic+peeling+skin+syndrome+due+to+FLG2+mutations%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Investigative+Dermatology%22%5BJournal%5D)">Generalized ichthyotic peeling skin syndrome due to FLG2 mutations.</a> The Journal of Investigative Dermatology. 138 (8), 1881-1884 (2018).</li>
<li>Jin, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DAMP+molecules+S100A9+and+S100A8+activated+by+IL-17A+and+house-dust+mites+are+increased+in+atopic+dermatitis%5BTitle%5D)+AND+%22Experimental+Dermatology%22%5BJournal%5D)">DAMP molecules S100A9 and S100A8 activated by IL-17A and house-dust mites are increased in atopic dermatitis.</a> Experimental Dermatology. 23 (12), 938-941 (2014).</li>
<li>Gläser, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+antimicrobial+protein+psoriasin+%28S100A7%29+is+upregulated+in+atopic+dermatitis+and+after+experimental+skin+barrier+disruption%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Investigative+Dermatology%22%5BJournal%5D)">The antimicrobial protein psoriasin (S100A7) is upregulated in atopic dermatitis and after experimental skin barrier disruption.</a> Journal of Investigative Dermatology. 129 (3), 641-649 (2009).</li>
<li>Molhave, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((House+dust+in+seven+Danish+offices%5BTitle%5D)+AND+%22Atmospheric+Environment%22%5BJournal%5D)">House dust in seven Danish offices.</a> Atmospheric Environment. 34, 4767-4779 (1999).</li>
<li>Buschow, S. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MHC+class+II-associated+proteins+in+B-cell+exosomes+and+potential+functional+implications+for+exosome+biogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Immunology+and+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">MHC class II-associated proteins in B-cell exosomes and potential functional implications for exosome biogenesis.</a> Immunology and Cell Biology. 88 (8), 851-856 (2010).</li>
</ol>

Yazarların açıklanacak herhangi bir çıkar çatışması yoktur.

Burada, EV zenginleştirme ve proteomik uygulamalar için polikarbonat UC tüplerinin temizlenmesi için bir protokolü açıklıyor ve doğruluyoruz. Bu kütle spektrometresi edinim protokolünün tespit sınırının altında temizlenmiş bir psödo-pelet analizi ile karşılaştırıldığında, önceki UC tüp numunesinden kalıntı proteinin başarılı bir şekilde uzaklaştırıldığını gösterdik ve temizlenmiş UC tüpü psödo-peletlerine kıyasla hiç kullanılmamış boş UC tüpünün proteomik benzerliğini gösterdik.
İlk olarak, proteinin yanlışlıkla iç polikarbonat duvara adsorpsiyonunu önlemek için, UC tüpleri hemen H2O10'a daldırıldı. Polikarbonat UC tüplerinin elde yıkanması üreticiler tarafından tavsiye edilmektedir11. Lipsol gibi diğer deterjanlar dikkatli kullanılmalıdır. Nötr olmayan bir pH'a sahip deterjan, yüzey aktif madde ve şelatlama maddelerinin bir karışımından oluşan tescilli bir laboratuvar deterjanıdır. Bu nedenle, bu adım için, kütle spektrometresi ile uyumlu bir deterjan,% 0.1 SDS kullanıldı ve 10 dakikadan fazla yıkama yapılmadı11. Deneyimlerimize göre, kıl temizleme araçlarının kullanılması, dikkatli olunmadığı takdirde tüpün çizilmesine neden olabilir. Artık protein için bir rezervuar sağlayabilecek potansiyel çizikleri azaltmak için, EV pelet oluşumu alanına odaklanarak polikarbonat tüpün içini silmek için bir pamuklu çubuk kullanıldı. Tekrarlanan otoklavlama, polikarbonat tüp ömrünüazaltabilir 11; Bunun yerine, üç kısa sıcak su durulaması yapıldı. Ayrıca, üreticilerin termal olmayan sterilizasyon yöntemleri önermesine rağmen, kaçınılması gereken belirli bir sıcaklığın açıklanmadığına da dikkat edilmelidir. Tüpler, üreticilerin tavsiyelerine göre yeniden kullanımdan önce her zaman deformasyon veya çatlama belirtileri açısından incelenmelidir. Yanıcı maddelerin çalışan santrifüjlerin yakınında kullanılması tavsiye edilmez; Bu nedenle, son% 70 etanol durulama adımından sonra tüpleri gece boyunca kuruturuz.
Kromatogramların manuel olarak değerlendirilmesiyle önemli bir polimer kontaminasyonu gözlenmedi. SDS'nin polikarbonatı bozması beklenmez ve sıcak suya (<60 °C) kısa süreli maruz kalmanın hiçbir etkisi olmazken, daha uzun süreli maruziyetlerin12. Ayrıca, önceki çalışmalar, polikarbonat türlerinin, asetonitril gradyan13'e dayalı olarak toplanmadan önce bir tutma süresinde elüte olduğunu göstermiştir. Polimerlerin mevcut olmadığından emin olamasak da, elde etme yöntemlerimizle, proteomun önemli ölçüde etkilenmediğinden eminiz.
Etiketsiz proteomik deneyler için laboratuvar gereçlerini yeniden kullanırken, önceki kullanımdan kalan artık protein kirleticileri özellikle dikkate alınmalıdır. Ayrıca, EV proteomikleri genellikle çok düşük verimli numunelerle gerçekleştirilir ve bazen <100 ng aralığında protein miktarları verir. Bu miktarlardaki başlangıç proteini kütle spektrometresi için uygundur, ancak küçük miktarlarda kalıntı proteinin bile genel proteom üzerindeki etkisini önemli ölçüde artırır. İlerleyen kütle spektrometresi diziliminin hassasiyeti göz önüne alındığında, insan taşıma ve üretiminden kaynaklanan kirleticiler tanımlanacaktır. Bu protokolde, temizlik sonrasında tanımlanan proteinlerin sayısında %98 oranında önemli bir azalma olduğunu gösteriyoruz. Kalan proteinler neredeyse sadece hiç kullanılmayan boş tüpler ve temiz tüpler arasında paylaşıldı. Bu sonuçlar, tanımlanan proteinlerin, proteomik preparatın kendisinden kaynaklanan kirleticiler veya önceki kullanımdan taşınmayan, tüp üretiminden kalan kalıntı elementler olduğunu göstermektedir. Şimdiye kadar, boş ve temizlenmiş tüplerde büyüklük sırasına göre en bol miktarda tanımlanmış üç protein, saç ve deride bulunan ve genellikle bu tür preparatlarda insan kullanımından kaynaklanan kirleticiler olarak tanınan insan keratini tip I (KRT1, KRT10, KRT9) idi (https://www.thegpm.org/crap/). Paylaşılan 18 proteinden dokuzu diğer keratinlerdi. Ayrıca tanınmış bir insan kirleticisi olarak insan terinde bulunan bir protein olan dermcidin (DCD) bulunur14. Tanımlanan diğer proteinler ayrıca epidermiste (CSTA15, HRNR16, FLG217) bulunur veya daha önce toz akarlarında (S100A7, S100A8, S100A9) bulunur18,19. "Toz" un önemli bir bileşeninin insan derisiolduğu unutulmamalıdır 20. Temizlenmiş tüplerde tanımlanan iki benzersiz proteinin her ikisi de EV'lerde rol oynamıştır, ancak tanımlanan diğer EV proteinlerine kıyasla çok küçüktür 1,21. Numunelerde tanımlanan proteinler preparat ile tutarlıdır ve boş ve temizlenmiş tüpler arasında çok net bir örtüşme olduğunu gösterir ve yeniden kullanımı destekler.
EV'ler, hücre-hücre iletişimi ve biyolojik mineralizasyonun oluşumu dahil ancak bunlarla sınırlı olmamak üzere biyolojik süreçlerde önemli bir role sahiptir. EV'ler insan vücudunda her yerde bulunur ve biyobelirteçler, terapötikler ve (pato)fizyoloji ile ilgili bilgi kaynakları olarak potansiyelleri nedeniyle hızla büyüyen bir temel bilim alanıdır. Diferansiyel UC kullanarak deney yapmak için bu parçacıkları zenginleştirmek, özel polikarbonat tüpleri içerir. Bu termoplastiklerin tek kullanımlık ve bertarafı, daha yüksek deneysel sarf malzemesi maliyetlerine ve küresel plastik kirliliği yüküne katkıda bulunur. Burada, proteomik deneylere uygun EV izolasyonu gerçekleştirmek için polikarbonat UC tüplerinin temizlenmesi ve yeniden kullanılması için bir protokol sunduk ve doğruladık. Sonuç olarak, bu, EV laboratuvarları tarafından üretilen atıkları azaltacak ve bu tür deneylerle ilişkili maliyeti düşürecektir.

Hücre dışı veziküller (EV'ler), protein gibi biyolojik olarak aktif kargo taşıyan hücrelerden salınan ve hücre-hücre iletişimi ve biyolojik mineralizasyonun oluşumu dahil olmak üzere çeşitli biyolojik süreçlere katılan lipid-çift tabaka ile sınırlandırılmış parçacıklardır1. Bu parçacıklar tüm vücut sıvılarında ve dokularında bulunur ve biyolojik aktiviteleri ve kullanımları hızla gelişen bir bilimsel araştırma alanıdır. Bu nanopartiküllerin izolasyonu ve doğrulanması, küçük boyutları ve lipozomlar ve protein agregatları gibi diğer partiküllere biyo-benzerlikleri nedeniyle çeşitli zorluklar ortaya çıkarmaktadır. En son Uluslararası Hücre Dışı Veziküller Derneği kılavuzları, Hücre dışı vezikül çalışmaları için minimum bilgi 2018 (MISEV2018), EV bilimsel araştırmaları için tanınan standarttır2.
EV izolasyonu için yukarı akış kaynağına ve aşağı akış uygulamalarına bağlı olarak, genellikle birlikte çeşitli yöntemler kullanılmalıdır. 2015 itibariyle, EV'ler için en yaygın birincil izolasyon yöntemi diferansiyel ultrasantrifüjleme (UC)2 idi. Prensip olarak, ilk düşük hızlı santrifüjleme, hücreler ve hücre kalıntıları gibi daha büyük veya daha yoğun istenmeyen bileşenleri ayırır ve EV'leri süpernatantta bırakır. Daha sonra, UC, EV'leri daha küçük veya daha az yoğun olan ancak aynı zamanda yoğun EV olmayan parçacıklar da içerebilen diğer parçacıklardan ayırmak ve saflaştırmak için çok yüksek merkezkaç kuvveti kullanır. Çoğu protokol, EV'leri bir sıvıdan izole etmek için genellikle bir adımda veya başka bir adımda UC kullanır3. Ayrıca UC, EV'leri kaldırma kuvvetine göre ayırmak için OptiprepTM iyodiksanol ve merkezkaç kuvveti gibi ortamları kullanan yoğunluk gradyanlı ultrasantrifüjleme (DGUC) gibi diğer EV izolasyon yöntemlerindekullanılır 4. EV izolasyonu için başka yöntemler de mevcuttur3.
EV'ler tarafından dikte edilen biyolojik süreçlerin hızla gelişen anlayışı ve bunların biyobelirteç ve patofizyoloji ile ilgili bilgi olarak potansiyelleri göz önüne alındığında, proteomik gibi keşfe dayalı analizler ilgi görmüştür 5,6,7,8. EV'ler küçüktür ve kaynağa bağlı olarak, tüm doku veya hücre lizatı ile karşılaştırıldığında düşük bir protein verimine (<1 μg) sahiptir. Proteomik analiz için EV'lerin izolasyonu, EV olmayan protein kirleticilerinin yukarı akış sıvısından veya dokudan uzaklaştırılması, izolasyon işlemi sırasında EV protein bozunmasının dikkate alınması ve peptit hazırlama ve kütle spektrometresi analizleri ile kimyasal olarak uyumlu protein çözeltileri oluşturan yöntemlerin kullanılması gibi özel hususlar gerektirir.
Araştırma laboratuvarı sarf malzemeleri genellikle plastiktir ve doğası gereği tek kullanımlıktır. Bu tek kullanımlık malzemeler, küresel plastik kirliliği krizine ve sarf malzemesi maliyetlerine katkıda bulunur. Özel polikarbonat ve polistiren UC tüpleri, laboratuvar uygulamalarında EV'leri peletlemek için gereken yüksek merkezkaç kuvvetlerine dayanacak şekilde tasarlanmıştır. UC tüplerini yeniden kullanım için sterilize etmek ve dezenfekte etmek mümkün olsa da, proteomik analizler, özellikle EV'ler gibi düşük protein verimine sahip olanlar özel dikkat gerektirir. Önceki kullanımdan kalan kalıntı proteinin yeterli miktarda uzaklaştırılması çok önemli olmakla kalmaz, aynı zamanda kütle spektroskopisi ve plastik türevli polimer kontaminasyonu ile kimyasal uyumluluk da dikkate alınmalıdır.
Burada, kütle spektrometresi için uygun deterjanlar kullanan polikarbonat tüplerin bir temizleme protokolünü sunuyoruz ve kalıntı proteinin tespit sınırlarının altında başarılı bir şekilde uzaklaştırılmasını ve tespit edilebilir polimer kirleticilerin eksikliğini doğrulamak için deneyler yapıyoruz. Hem UC hem de DGUC amaçlarını kullanarak EV proteomik uygulamaları için temizleme protokolünü doğrulamak için, kombine bir UC ve DGUC protokolü ile insan damar dokusu EV'lerinin izolasyonlarından tüpler elde ettik. Tüpler, tarif edilen protokol kullanılarak temizlendi ve deneysel işlem, hiç kullanılmayan boş bir UC tüpü ile temizlenmiş bir UC tüpü karşılaştırılan numuneler olmadan tekrarlandı. Sonuç olarak, EV'lerin zenginleştirilmesi için uygun bir UC tüp temizleme protokolünün doğrulanması, EV laboratuvarları tarafından üretilen atıkları azaltacak ve bu tür deneylerle ilişkili maliyeti düşürecektir.

<table><tbody><tr><td>10 mL Üstü Açık Kalın Duvar Polikarbonat</td><td>Tüp Beckman Coulter Yaşam Bilimleri</td><td>355630</td><td>kapaksız ultrasantrifüj tüp(ler)&nbsp;</td></tr><tr><td>10.4 mL Kapaklı Polikarbonat Şişe Tertibatı</td><td>Beckman Coulter Yaşam Bilimleri</td><td>355603</td><td>kapaklı ultrasantrifüj tüp(ler)i&nbsp;</td></tr><tr><td>bir Beğeni PepMap 100 C18 HPLC Sütunları, 75 & m x 70 mm; ve bir EASY-Spray HPLC Sütunu, 75 & m x 250 mm</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>164946 ve ES902</td><td>Çift sütunlu kurulum</td></tr><tr><td>Kritik Çubuklu Çubuk, Pamuklu Başlı</td><td>VWR</td><td>89031-270</td><td>pamuklu çubuk</td></tr><tr><td>Exploris 480, EASY-Spray Source ile önlü, Easy-nLC1200 HPLC pompasına bağlı.</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>BRE725533</td><td>Kütle spektrometresi</td></tr><tr><td>İnsan UniProt veritabanı (101043 giriş, Ocak 2022'de güncellendi)</td><td>NA</td><td>NA</td><td>İnsan veritabanı</td></tr><tr><td>MilliQ su</td><td></td><td></td><td>su</td></tr><tr><td>PreOmics iST kiti ></td><td>PreOmics</td><td>P.O.00027</td><td>ticari protein numune hazırlama kiti&nbsp;</td></tr><tr><td>Proteom Kaşifi &nbsp; paket (PD, Sürüm 2.5)</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>NA</td><td>Proteomik arama yazılımı</td></tr><tr><td>SEQUEST-HT arama algoritması&nbsp;</td><td>NA</td><td>NA</td><td>Arama algoritması</td></tr><tr><td>Sodyum Dodesil Sülfat (%20)</td><td>Boston BioProducts</td><td>BM-230</td><td>deterjan</td></tr></tbody></table>

polikarbonat ultrasantrifüj tüpünün hücre dışı veziküllerin proteomik analizlerinde yeniden kullanımı

Polycarbonate Ultracentrifuge Tube Re-Use in Proteomic Analyses of Extracellular Vesicles

Tek kullanımlık laboratuvar plastikleri kirlilik krizini daha da kötüleştiriyor ve sarf malzemesi maliyetlerine katkıda bulunuyor. Hücre dışı vezikül (EV) izolasyonunda, ilişkili yüksek merkezkaç kuvvetlerine dayanmak için polikarbonat ultrasantrifüj (UC) tüpleri kullanılır. EV proteomiği gelişmekte olan bir alandır ve bu tüpler için doğrulanmış yeniden kullanım protokolleri eksiktir. Düşük verimli protein izolasyon protokolleri ve aşağı akış proteomikleri için sarf malzemelerinin yeniden kullanılması, santrifüj tüpünden türetilmiş sentetik polimer kontaminasyonunun olmaması ve artık proteinlerin yeterli miktarda uzaklaştırılması gibi kütle spektroskopisi edinimleriyle reaktif uyumluluğu gerektirir.
Bu protokol, EV proteomik deneylerinde yeniden kullanım için polikarbonat UC tüplerinin temizlenmesi için bir yöntemi tanımlar ve doğrular. Temizleme işlemi, protein kurumasını önlemek için UC tüplerinin H2O'ya hemen daldırılmasını, %0,1 sodyum dodesil sülfat (SDS) deterjanla yıkanmasını, sıcak musluk suyunda, demineralize suda ve %70 etanolde durulamasını içerir. Aşağı akış EV proteomiği için UC tüpü yeniden kullanım protokolünü doğrulamak için, diferansiyel UC ve yoğunluk gradyan ayrımı kullanılarak EV'leri kardiyovasküler dokudan izole eden bir deneyin ardından kullanılmış tüpler elde edildi. Tüpler temizlendi ve deneysel işlem, hiç kullanılmayan boş UC tüplerini temizlenmiş UC tüpleriyle karşılaştıran EV örnekleri olmadan tekrarlandı. İzolasyon prosedürlerinden elde edilen yalancı EV peletleri, düşük bollukta protein örnekleri için modifikasyonlara sahip ticari bir protein örneği hazırlama kiti kullanılarak sıvı kromatografi-tandem kütle spektrometresi için parçalandı ve hazırlandı.
Temizlemeyi takiben, tanımlanan proteinlerin sayısı, aynı tüpten alınan önceki EV izolasyon örneğine kıyasla yalancı pelette% 98 oranında azaltıldı. Temizlenmiş bir tüp ile boş bir tüp karşılaştırıldığında, her iki numune de %86 benzerliğe sahip çok az sayıda protein (≤20) içeriyordu. Temizlenen tüplerin kromatogramlarında polimer piklerinin olmadığı doğrulandı. Sonuç olarak, EV'lerin zenginleştirilmesi için uygun bir UC tüp temizleme protokolünün doğrulanması, EV laboratuvarları tarafından üretilen atıkları azaltacak ve deney maliyetlerini düşürecektir.

Temizleme protokolünü doğrulamak için (Şekil 1) iki deney yapıldı. İlk olarak, temizlenmiş tüpten alınan "sahte numunenin" proteomu, tanımlanan proteinlerin taşınmasını belirlemek için tüpün ilk kullanımından elde edilen doku EV numunesinin proteomu ile karşılaştırıldı. Temsili kromatogramlar, tüplerin temizlenmesini takiben tepe heterojenliğinde bir azalma gösterir (Şekil 2<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/66126/66126fig01.jpg"> <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/66126/66126fig01large.jpg" target="_blank"></a><img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/66126/66126fig02.jpg"> <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/66126/66126fig02large.jpg" target="_blank"></a><img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/66126/66126fig03v2.jpg"> <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/66126/66126fig03largev2.jpg" target="_blank"></a><img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/66126/66126fig04.jpg"> <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/66126/66126fig04large.jpg" target="_blank"></a><a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/66126/Table%201.zip" target="_blank"></a>

Proteomik deneyler için uygun hücre dışı vezikül izolasyonu gerçekleştirmek için polikarbonat ultrasantrifüj tüplerinin temizlenmesi ve yeniden kullanılması için ayrıntılı bir protokol sağlanmıştır.

Polikarbonat Ultrasantrifüj Tüpünün Hücre Dışı Veziküllerin Proteomik Analizlerinde Yeniden Kullanımı

Single-use laboratory plastics exacerbate the pollution crisis and contribute to consumable costs. In extracellular vesicle (EV) isolation, polycarbonate ...

Kardiyovasküler hastalıkları, özellikle kapakçıklar ve kan damarları gibi kardiyovasküler dokuların patolojik kalsifikasyonunda hücre dışı veziküllerin rolünü inceliyoruz. Grubumuzdaki araştırmacılar son zamanlarda proteomik profillerini belirlemek için fibro kalsifik kardiyovasküler dokudan doku ve sıkışmış hücre dışı vezikülleri çıkarmak için yöntemler tanımladılar. Grubumuz, bu hücre dışı veziküllerin hastalık dokularında kalsifikasyonu başlatmak için önemli protein yükü içerdiğini göstermiştir.Hücre dışı vezikül izolasyonunun ultrasantrifüj adımında kullanılan özel tüpler, yeniden kullanım için temizlenebilir ve sterilize edilebilir. Bununla birlikte, proteomik analiz, herhangi bir kontaminasyonun aşağı akış sonuçlarını büyük ölçüde etkileyebileceğinden özel dikkat gerektirir. Burada, aşağı akış düşük girdili proteomik uygulamalar için uygun olan hücre dışı vezikül izolasyonu için sarf malzemelerinin, özellikle polikarbonat ultrasantrifüj tüplerinin yeniden kullanılması için bir protokolü doğruluyoruz.Protokolümüz basit ve etkilidir ve araştırmacıların hem sarf malzemesi maliyetlerini hem de tipik olarak bu izolasyon protokolleriyle ilişkili atıkları azaltmasına olanak tanır.

polycarbonate-ultracentrifuge-tube-re-use-proteomic-analyses

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Bu makale, ökaryotik hücrelerde ribozom tercüme çıkarılması için bir protokol tanımlamaktadır. Bir kez çıkarılan, ribozom, farklı ribozomal popülasyonlar analiz izin vermek için sukroz gradient fraksiyonlandırmasıyla monosomes ve polyribosomes içine ayrılır. Gibi, bu yöntem çeviri düzenleme incelenmesi için altın standarttır.

Ökaryotik Polyribosome Profil Analizi

Bu videoda, taze veya donmuş dokulardan hücre dışı veziküllerin çıkarılması tekniği açıklanmaktadır. İzole edilen hücre dışı veziküller, hastalık patogenezindeki önemli rollerini ortaya çıkarmak için daha ileri analizler için kullanılabilir.

Hücre Dışı Vezikül Ekstraksiyonu: Diferansiyel Santrifüjleme Kullanarak Tüm Doku Örneklerinden Hücre Dışı Vezikülleri İzole Etme Tekniği

Bu video, karakterizasyon çalışmaları için uygun hücre dışı veziküllerin alt popülasyonlarını izole etmek için yoğunluk gradyanlı ultrasantrifüjleme tabanlı saflaştırma yöntemini göstermektedir.

Hücre Dışı Veziküllerin Alt Popülasyonlarının Saflaştırılması: Yoğunluk Gradyanlı Ultrasantrifüjleme Kullanarak Hücre Dışı Veziküllerin Alt Popülasyonlarını Saflaştırma Tekniği

Bu video, Mycobacterium tuberculosis'in (Mtb) kültür süzüntüsünden bakteriyel hücre dışı vezikülleri (EV'ler) saflaştırmak için boyut dışlama kromatografisi (SEC) tekniğini göstermektedir. Teknik, EV'lerin saflaştırılmış fraksiyonlarını elde etmek için gözenekli reçine dolgulu bir kolon kullanır. Gözenekli parçacıklar seçici olarak daha küçük proteinlerin gözeneklere girmesine izin vererek daha yavaş elüsyona neden olur. Aynı zamanda, EV'lerin daha büyük boyutları nedeniyle gözeneklere girmesi...

Mikobakteriyel hücre dışı vezikülleri saflaştırmak için bir boyut dışlama kromatografisi tekniği

Burada, exosomes plazma ve serum exosomal kan proteinleri azaltılmış ortak arıtma ile arındırmak için bir protokol mevcut. En iyi duruma getirilmiş iletişim kuralı Ultrafiltrasyon, proteaz tedavi ve boyutu dışlama Kromatografi içerir. Exosomes yararları aşağı akım analizleri veziküller ve proteomik karakterizasyonu daha doğru miktar dahil olmak üzere, geliştirilmiş arıtma.

Protein sindirimi, Ultrafiltrasyon ve boyutu dışlama Kromatografi insan kan plazması ve Serum Exosomes yalıtım en iyi duruma getirmek için

Protokol hücre kültür supernatants ile kullanılmak üzere tasarlanmış küçük hücre dışı veziküller (EV) üzerinde yüzey epitopları algılamak için tekrarlanabilir yöntemi açıklanır. Yüzey antijeni CD9, tanıyan antikorlar ile CD63 ve CD81 birleştiğinde boncuk kullanarak belirli EV immunoprecipitation kullanır. Yöntem aşağı akım akış sitometresi analizi için optimize edilmiştir.

Hücre şartına ortamdan hücre dışı veziküller sitometrik analizinde akışı

Burada, küçük hücre dışı veziküller (EVs) tüm dokular, beyin ve tümör örnekleri de dahil olmak üzere gelen yalıtmak için detaylı bir protokol sağlar. Bu yöntem daha da aşağı akım analizleri için sağlam doku EVs ayıklamak için tekrarlanabilir bir teknik sunar.

Hücre dışı veziküller çekme--dan tüm doku

Burada, hücre tarafından üretilen doğal Nano opartiküllerden oluşan bir grup olan ekstrüllüler veziküller için depolama kararlılığını değerlendirmek üzere kolayca uygulanabilir bir protokol sunuyoruz. Veziküller bir model enzim olarak glukuronidaz ile yüklenir ve farklı koşullarda saklanır. Depodan sonra, fizikokimyasal parametreleri ve kapsüllenmiş enzimin aktivitesi değerlendirilir.

Ekstrasellüler veziküllerin depolama Istikrarı değerlendirilmesi

Bu protokol, ev çökeltme, yoğunluk gradyan ultracentrifugation ve parçacık yakalama birleştirerek yüksek verimlilik ve verim ile virions uzak hücre dışı veziküller (EVs) izole aerodinamik bir iş akışı ve başlangıç bir azalma sağlamak için tüm EV araştırmalarında kullanılmak üzere tekrarlanabilir preparatlar ile sonuçlanan hacim gereksinimleri.

Yüksek Verim Ekstrasellüler Vezikül Preparatlarının Virüsten Uzaklaştırılması

Mevcut protokol, siyanobakteriyel kültürlerden hücre dışı veziküllerin izolasyonu, konsantrasyonu ve karakterizasyonu için ayrıntılı açıklamalar sunmaktadır. Vezikülleri farklı ölçeklerdeki kültürlerden arındırmaya yönelik yaklaşımlar, metodolojiler arasındaki ödünleşimler ve saha örnekleriyle çalışmak için dikkat edilmesi gerekenler de tartışılmaktadır.

Siyanobakteriyel hücre dışı veziküllerin izolasyonu ve karakterizasyonu

Keşfedin polikarbonat ultrasantrifüj tüplerinin hücre dışı vezikül izolasyonunda yeniden kullanımını. Bu yöntem, kardiyovasküler dokularda kalsifikasyon çalışmaları için proteomik analizlerde maliyet ve atık azaltır.

Polikarbonat Ultrasantrifüj Tüpünün Hücre Dışı Veziküllerin Proteomik Analizlerinde Yeniden Kullanımı

Daha fazla video keşfet