Name: Mycobacterium Türlerinin DNA Mikroarray Çip Yöntemi ile Tanımlanması (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-06-24T14:30:00.000+00:00
Duration: 6 min 27 s
Description: Öğrenin, DNA mikroarray çip yöntemiyle Mycobacterium türlerini hızlı ve hassas bir şekilde tanımlamayı. Bu yöntem, klinik mikrobiyolojide erken teşhisi kolaylaştırarak hasta tedavi sonuçlarını iyileştirir.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

<ol><li>Primm, T. P., Lucero, C. A., Falkinham, J. O. III <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Health+impacts+of+environmental+mycobacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Genet%22%5BJournal%5D)">Health impacts of environmental mycobacteria.</a> Trends Genet. 38 (8), 821-830 (2004).</li>
<li>Sawyer, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mycobacterium+bovis+and+its+impact+on+human+and+animal+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Genet%22%5BJournal%5D)">Mycobacterium bovis and its impact on human and animal tuberculosis.</a> Trends Genet. 39 (8), 587-592 (2023).</li>
<li>Zhao, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+impact+of+DNA+microarray+chip+technology+on+the+diagnosis+and+management+of+non-tuberculous+mycobacterial+infections+in+immunocompromised+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Antimicrob+Agents+Chemother%22%5BJournal%5D)">The impact of DNA microarray chip technology on the diagnosis and management of non-tuberculous mycobacterial infections in immunocompromised patients.</a> Antimicrob Agents Chemother. 65 (12), e01500-e01500 (2021).</li>
<li>Liu, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray-based+detection+of+drug-resistant+Mycobacterium+strains%3A+a+single-center+experience%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Microbiol+Infect%22%5BJournal%5D)">DNA microarray-based detection of drug-resistant Mycobacterium strains: a single-center experience.</a> Clin Microbiol Infect. 26 (10), 1400-1407 (2020).</li>
<li>Li, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+evaluation+of+DNA+microarray+and+next-generation+sequencing+for+Mycobacterium+identification%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Infect+Dis%22%5BJournal%5D)">Comparative evaluation of DNA microarray and next-generation sequencing for Mycobacterium identification.</a> Int J Infect Dis. 118, 250-258 (2022).</li>
<li>Chen, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimizing+probe+design+for+DNA+microarray-based+Mycobacterium+identification%3A+a+computational+biology+approach%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Optimizing probe design for DNA microarray-based Mycobacterium identification: a computational biology approach.</a> BMC Microbiol. 19 (2), 120-129 (2019).</li>
<li>Michelet, L., Boschiroli, M. L. Mycobacterium uberis. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMichelet%2C+L+%22Microorganisms%22">Microorganisms</a>. 8 (11), 1701(2020).</li>
<li>Imran, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray+technology+for+the+detection+and+identification+of+Mycobacterium+species%3A+a+review%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microbiol+Biotechnol+Res%22%5BJournal%5D)">DNA microarray technology for the detection and identification of Mycobacterium species: a review.</a> J Microbiol Biotechnol Res. 6 (2), 275-285 (2020).</li>
<li>Garcia-Sanchez, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+DNA+microarray+technology+for+Mycobacterium+detection+and+characterization%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Advances in DNA microarray technology for Mycobacterium detection and characterization.</a> J Mol Diagn. 24 (5), 650-662 (2022).</li>
<li>Wang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Machine+learning+analysis+of+SERS+fingerprinting+for+the+rapid+determination+of+Mycobacterium+tuberculosis+infection+and+drug+resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Comput+Struct+Biotechnol+J%22%5BJournal%5D)">Machine learning analysis of SERS fingerprinting for the rapid determination of Mycobacterium tuberculosis infection and drug resistance.</a> Comput Struct Biotechnol J. 26 (20), 5364-5377 (2022).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integration+of+DNA+microarray+data+with+clinical+outcomes+in+tuberculosis+patients%3A+implications+for+personalized+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Integration of DNA microarray data with clinical outcomes in tuberculosis patients: implications for personalized medicine.</a> Mol Diagn. 16 (3), 150-160 (2024).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+identification+of+Mycobacterium+tuberculosis+complex+and+common+non-tuberculous+Mycobacteria+by+DNA+microarray+chip%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid identification of Mycobacterium tuberculosis complex and common non-tuberculous Mycobacteria by DNA microarray chip.</a> BMC Microbiol. 21 (1), 242(2021).</li>
<li>Smith, J. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray+insights+into+Mycobacterium+epidemiology+and+control+strategies%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">DNA microarray insights into Mycobacterium epidemiology and control strategies.</a> J Clin Microbiol. 60, e02033-e02121 (2022).</li>
<li>Garcia, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tracking+Mycobacterial+spread+via+DNA+microarray%3A+a+community-based+study%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Tracking Mycobacterial spread via DNA microarray: a community-based study.</a> PLoS One. 18 (3), e0282123(2023).</li>
<li>Li, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Economic+evaluation+of+DNA+microarray+chip+technology+in+Mycobacterium+diagnosis%5BTitle%5D)+AND+%22Diagnostics%22%5BJournal%5D)">Economic evaluation of DNA microarray chip technology in Mycobacterium diagnosis.</a> Diagnostics. 11 (12), 2235(2021).</li>
<li>Wang, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cost-benefit+analysis+of+implementing+DNA+microarray+chip+for+Mycobacterium+detection+in+clinical+settings%5BTitle%5D)+AND+%22J+Med+Econ%22%5BJournal%5D)">Cost-benefit analysis of implementing DNA microarray chip for Mycobacterium detection in clinical settings.</a> J Med Econ. 25 (1), 113-122 (2022).</li>
<li>Liu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((False+positives+and+false+negatives+in+DNA+microarray+chip+detection+of+Mycobacteria%3A+a+comprehensive+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Microb+Pathog%22%5BJournal%5D)">False positives and false negatives in DNA microarray chip detection of Mycobacteria: a comprehensive analysis.</a> Microb Pathog. 149, 104671(2020).</li>
<li>Chen, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Validation+and+improvement+of+DNA+microarray+chip+for+Mycobacterium+identification%3A+coping+with+genetic+variants%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Cell+Infect+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Validation and improvement of DNA microarray chip for Mycobacterium identification: coping with genetic variants.</a> Front Cell Infect Microbiol. 11, 627923(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>%0,9 Sodyum Klorür Enjeksiyonu (NaCl)</td><td>FuZhou HAIWANGFUYAO</td><td>H35020289</td><td></td></tr><tr><td>Uygulamalı Biyosistem amplifikasyon aparatı</td><td>Thermo Fisher Bilimsel</td><td>Veriti 96 Kuyulu Termal Döngüleyici</td><td></td></tr><tr><td>CapitalBio Lüks Tarama10K/B</td><td>Başkent Biyo</td><td>LuxScan10K/B</td><td></td></tr><tr><td>CapitalBio SlideWasher 24&nbsp;</td><td>Başkent Biyo</td><td>SlideWasher 24&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>&nbsp; Santrifüj&nbsp;</td><td>Eppendorf Belediyesi</td><td>5424R Serisi</td><td>MaX.speed 15000 dak-1</td></tr><tr><td>Hibridizasyon tamponu</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>HybSet gen mikrodizi çipi ve kapağı</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Mycobacterium tür tanımlama kiti</td><td>Başkent Biyo</td><td>301030</td><td></td></tr><tr><td>Negatif kontroller, pozitif kontroller</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Nükleik asit çıkarıcı</td><td>TIANLONG</td><td>GeneRotex 96</td><td></td></tr><tr><td>PCR amplifikasyon reaktifi</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>pH 6.8 fosfat tamponu</td><td>Şanghay yuanye Biyoteknoloji</td><td>R20029-10</td><td></td></tr><tr><td>Pipetleyiciler ve Uçlar</td><td>Termo Bilimsel</td><td>0.1 - 10 &mu; L, 2 - 20 &mu; L, ve 20 - 200 &mu; L, 100-1000 &mu; L</td><td></td></tr><tr><td>qEx-DNA/RNA Nükleik asit ekstraksiyon veya saflaştırma kiti</td><td>TIANLONG</td><td>qEx-DNA/RNA</td><td></td></tr><tr><td>SDS</td><td>Başkent Biyo</td><td>441060</td><td></td></tr><tr><td>Sodyum hidroksit(NaOH)</td><td>XILONGS&nbsp; Bilimsel</td><td>XK13-011-00027</td><td></td></tr><tr><td>SSC</td><td>Başkent Biyo</td><td>441050</td><td></td></tr><tr><td>Termostatik Su Banyosu</td><td>SURUI</td><td>HH-W600 Serisi</td><td></td></tr></tbody></table>

mycobacterium türlerinin dna mikroarray Çip yöntemi ile tanımlanması

Identification of Mycobacterium Species by DNA Microarray Chip Method

Olumlu sonuçlar Mycobacterium cinsi (iç kontrol, IC) ve Mycobacterium tuberculosis probları için pozitif sonuç değerleri Alıcı İşletim Karakteristiği (ROC) yöntemi ile belirlenir. Diğer 16 NTM'yi tespit etmek için kullanılan problar için pozitif sonuç değerleri yüzdelik yöntem ile belirlenir.
Deneysel kalite kontrol Pozitif kontrol ürününün tespit sonucu "Mycobacteriumtuberculosis kompleksi" olmalıdır ( Şek...

Mycobacterium Türlerinin DNA Mikroarray Çip Yöntemi ile Tanımlanması

This study presents a DNA microarray chip method designed for the accurate identification of Mycobacterium species. By leveraging asymmetric PCR ...

identification-of-mycobacterium-species-by-dna-microarray-chip-method

Research

JoVE Journal

Medicine

Tıp

Bu video, bir antikor mikrodizi çipi kullanarak çevresel bir numunedeki Siyanobakteri suşlarını tespit etmek için bir yöntemi gösterir. Çeşitli bakterileri taşıyan numuneler, basılı antikorlarla etkileşime girer ve florofor etiketli anti-siyanobakteriyel-suş antikorları ile immün boyama, farklı noktalarda floresan yoluyla spesifik siyanobakteriyel suşların varlığını ortaya çıkarır.

Bir Antikor Mikroarray Çipi Kullanarak Siyanobakteriyel Suşları Tespit Etmek İçin Bir Teknik

Bir amplifikasyon mikrodizi önemli ölçüde son kullanıcı için mikro-dizi iş akışını tek bir oda içine asimetrik PCR amplifikasyonu ve mikrodizi hibridizasyon birleştirir. Mikrodizi iş akışı basitleştirilmesi rutin alt-kaynak ortamlarda kullanılabilir mikroarray tabanlı tanı oluşturmak için gerekli bir ilk adımdır.

Çok ilaca dirençli Demonstrating<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</em&gt; Amplifikasyon Microarray

Diseksiyon yaygın doku içindeki DNA, RNA ve protein incelenmesi için kullanılmıştır. Lazer yakalama mikroskobu (LCM) en sık kullanılan yöntem, ancak, yeni bir freze tekniği, mesodissection, son zamanlarda kullanılabilir. Biz mesodissected formalin sabit parafin Mycobacterium tuberculosis granülomlarının gömülü doku slaytlar RNA çıkarma göstermektedir.

Kurtarma Bir Roman Mikrodiseksiyon Yaklaşımı<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</emAkciğer granülomlara Gömülü Formalinle Sabit Parafin dan&gt; Özel Transkript

Bu video makalede, iki bileşenli bir sistem yanıt düzenleyici gen hedef ve birleştirme bölgelerini belirlemek için bir in vitro mikro-dizi göre bir yöntem açıklanır.

Bakteriyel için iki bileşenli Düzenleme Sistemleri Gen Hedefler belirlemek için DNA afinite-saflaştırılmış Chip (DAP-chip) Yöntem

Matris destekli lazer desorpsiyon/iyonizasyon uçuş süresi kütle spektrometresi (MALDI-TOF MS) ve moleküler teknikler (16S rRNA gen dizilimi), rutin teşhiste nadir görülen bakteriyel patojenlerin tanımlanmasına izin verir. Bu protokolün amacı, daha doğru ve güvenilir verilere yol açan her iki tekniğin kombinasyonunda yatmaktadır.

16S rRNA gen Sıralama ve MALDI-TOF MS tarafından Nadir Bakteriyel patojenlerin tanımlanması

İnsan tüketimine yönelik tatlı su rezervuarlarında siyanobakteriyel toksinlerin varlığı, su yönetimi yetkilileri için büyük bir endişe kaynağıdır. Su kontaminasyonu riskini değerlendirmek için bu makale, bir antikor mikrodizi çipi kullanılarak sıvı ve katı numunelerdeki siyanobakteri suşlarının sahada tespiti için bir protokol açıklamaktadır.

Saptamak için deneysel protokol Siyanobakteri Bir Antikor Mikroarray Chip ile Sıvı ve Katı Örneklerinde

Burada, hücre -Mycobacterium abscessus etkileşimleri çalışmaya iki protokol mevcut: transposon mutant kitaplığa bakteriyel hücre içi eksikliği ve bakteriyel hücre içi transcriptome RNA üzerinden belirlenmesi için tarama sıralama. Her iki yaklaşımın genomik avantajları ve hücre içi bakteri fitness artırılması transcriptomic uyarlama içgörü sağlamak.

Mycobacterium abscessus virülans işaretleri tanımlaması fagositler hücre içi çoğaltma için

EUCAST, otomatik kan kültürleri için doğrudan bir antimikrobiyal duyarlılık testi (AST) protokolü geliştirmiştir. Bununla birlikte, kütle spektrometresi tabanlı mikrobiyal tanımlamaya bağımlılığı, otomatik bir mikrobiyal tanımlama sisteminde doğrudan bir aşı hazırlama protokolü kullanılarak ortadan kaldırılabilir. Bu yaklaşım, numune alındıktan sonraki 24 saat içinde AST raporları sağlayabilir.

Kütle Spektrometresi Olmadan EUCAST RAST Yöntemini Kolaylaştırmak için Otomatik Bir Mikrobiyal Tanımlama Sistemi Kullanarak Doğrudan Mikrobiyal Tanımlama

iChip tekniği, topraktan yeni mikroorganizma keşfi oranlarını artıran ucuz ve basit bir yerinde izolasyon cihazı kullanır. Yeni mikroorganizmalar, diğer uygulamaların yanı sıra toprak mikrobiyomu veya doğal ürün keşfi ile ilgili daha fazla çalışma için kullanılabilir.

iChip Teknolojisi Kullanılarak Toprak Mikroorganizmalarının İzolasyonu

Bu protokol, mikobakterilerden yüksek kaliteli DNA çıkarmak için CTAB yöntemini tanımlar; bu yöntem, onların dayanıklı, mikolik asit açısından zengin hücre duvarlarının getirdiği zorlukları aşmaktadır. Bu süreç, enzimatik sindirim, CTAB ile hücre lizisi ve organik ekstraksiyon ile etanol çökeltilemesiyle DNA arındırmasını içerir. Bu yöntem, moleküler çalışmalar için uygun DNA üretir ve mikobakteriyel araştırmalar için güvenilirdir.

Mycobacterium Türlerinden Setiltrimetilamonium Bromid Tekniği ile Tam Genom Deoksiribonüklein Asit Ekstraksiyonu

Öğrenin, DNA mikroarray çip yöntemiyle Mycobacterium türlerini hızlı ve hassas bir şekilde tanımlamayı. Bu yöntem, klinik mikrobiyolojide erken teşhisi kolaylaştırarak hasta tedavi sonuçlarını iyileştirir.

Mycobacterium Türlerinin DNA Mikroarray Çip Yöntemi ile Tanımlanması

Daha fazla video keşfet