Name: İnfluenza Virüslerinin Kriyo-elektron Tomografisinden Hemaglutininin Nanometre Altı Çözünürlükte Yapısal Tayini (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-11-07T12:50:00.000+00:00
Duration: 8 min 19 s
Description: Öğrenin, kriyo-elektron tomografi ile influenza hemaglutininin reseptör bağlanmasında konformasyon değişikliklerini nanometre altı çözünürlükte inceleyin. Bu yöntem, viral glikoproteinlerin yapısal analizi için uygulanabilir.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Young, L. N., Villa, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bringing+structure+to+cell+biology+with+cryo-electron+tomography%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Biophys%22%5BJournal%5D)">Bringing structure to cell biology with cryo-electron tomography.</a> Annu Rev Biophys. 52, 573-595 (2023).</li>
<li>Navarro, P. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+cryo-electron+tomography%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Mol+Biosci%22%5BJournal%5D)">Quantitative cryo-electron tomography.</a> Front Mol Biosci. 9, 934465(2022).</li>
<li>Hong, Y., Song, Y., Zhang, Z., Li, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cryo-electron+tomography%3A+the+resolution+revolution+and+a+surge+of+in+situ+virological+discoveries%5BTitle%5D)+AND+%22Annu+Rev+Biophys%22%5BJournal%5D)">Cryo-electron tomography: the resolution revolution and a surge of in situ virological discoveries.</a> Annu Rev Biophys. 52, 339-360 (2023).</li>
<li>Turk, M., Baumeister, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+promise+and+the+challenges+of+cryo-electron+tomography%5BTitle%5D)+AND+%22FEBS+Lett%22%5BJournal%5D)">The promise and the challenges of cryo-electron tomography.</a> FEBS Lett. 594 (20), 3243-3261 (2020).</li>
<li>Huang, Q. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+structural+analysis+of+influenza+virus+by+cryo-electron+tomography+and+convolutional+neural+networks%5BTitle%5D)+AND+%22Structure%22%5BJournal%5D)">Quantitative structural analysis of influenza virus by cryo-electron tomography and convolutional neural networks.</a> Structure. 30 (5), 777-786.e3 (2022).</li>
<li>Ke, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structures+and+distributions+of+SARS-CoV-2+spike+proteins+on+intact+virions%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Structures and distributions of SARS-CoV-2 spike proteins on intact virions.</a> Nature. 588 (7838), 498-502 (2020).</li>
<li>Mangala Prasad, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cryo-ET+of+Env+on+intact+HIV+virions+reveals+structural+variation+and+positioning+on+the+Gag+lattice%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Cryo-ET of Env on intact HIV virions reveals structural variation and positioning on the Gag lattice.</a> Cell. 185 (4), 641-653.e17 (2022).</li>
<li>Förster, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Subtomogram+analysis%3A+the+sum+of+a+tomogram%27s+particles+reveals+molecular+structure+in+situ%5BTitle%5D)+AND+%22J+Struct+Biol+X%22%5BJournal%5D)">Subtomogram analysis: the sum of a tomogram's particles reveals molecular structure in situ.</a> J Struct Biol X. 6, 100063(2022).</li>
<li>Tegunov, D., Xue, L., Dienemann, C., Cramer, P., Mahamid, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multi-particle+cryo-EM+refinement+with+M+visualizes+ribosome-antibiotic+complex+at+3.5+%C3%85+in+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Multi-particle cryo-EM refinement with M visualizes ribosome-antibiotic complex at 3.5 Å in cells.</a> Nat Methods. 18 (2), 186-193 (2021).</li>
<li>Xue, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualizing+translation+dynamics+at+atomic+detail+inside+a+bacterial+cell%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Visualizing translation dynamics at atomic detail inside a bacterial cell.</a> Nature. 610 (7930), 205-211 (2022).</li>
<li>Kühlbrandt, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+resolution+revolution%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">The resolution revolution.</a> Science. 343 (6178), 1443-1444 (2014).</li>
<li>Chen, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cryo-electron+tomography+reveals+the+microtubule-bound+form+of+inactive+LRRK2%5BTitle%5D)+AND+%22Elife%22%5BJournal%5D)">Cryo-electron tomography reveals the microtubule-bound form of inactive LRRK2.</a> Elife. 13, e97222(2024).</li>
<li>Chen, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((De+novo+protein+identification+in+mammalian+sperm+using+in+situ+cryoelectron+tomography+and+AlphaFold2+docking%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">De novo protein identification in mammalian sperm using in situ cryoelectron tomography and AlphaFold2 docking.</a> Cell. 186 (23), 5041-5053.e19 (2023).</li>
<li>Kelley, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Towards+community-driven+visual+proteomics+with+large-scale+cryo-electron+tomography+of+Chlamydomonas+reinhardtii%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Towards community-driven visual proteomics with large-scale cryo-electron tomography of Chlamydomonas reinhardtii.</a> bioRxiv. , (2024).</li>
<li>Klumpe, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In-cell+structure+and+snapshots+of+copia+retrotransposons+in+intact+tissue+by+cryo-ET%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">In-cell structure and snapshots of copia retrotransposons in intact tissue by cryo-ET.</a> Cell. 188 (8), 2094-2110.e18 (2025).</li>
<li>Li, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+structure+of+basal+body+inner+junctions+from+Tetrahymena+revealed+by+electron+cryo-tomography%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">The structure of basal body inner junctions from Tetrahymena revealed by electron cryo-tomography.</a> EMBO J. 44 (7), e1975-e2001 (2025).</li>
<li>Song, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+mechanism+underlying+fascin-mediated+bundling+of+actin+filaments+unveiled+by+cryo-electron+tomography%5BTitle%5D)+AND+%22J+Struct+Biol%22%5BJournal%5D)">The mechanism underlying fascin-mediated bundling of actin filaments unveiled by cryo-electron tomography.</a> J Struct Biol. 217 (2), 108212(2025).</li>
<li>Waltz, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In-cell+architecture+of+the+mitochondrial+respiratory+chain%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">In-cell architecture of the mitochondrial respiratory chain.</a> Science. 387 (6740), 1296-1301 (2025).</li>
<li>Huang, Q. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Virion-associated+influenza+hemagglutinin+clusters+upon+sialic+acid+binding+visualized+by+cryo-electron+tomography%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Virion-associated influenza hemagglutinin clusters upon sialic acid binding visualized by cryo-electron tomography.</a> bioRxiv. , (2024).</li>
<li>Turoňová, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+situ+structural+analysis+of+SARS-CoV-2+spike+reveals+flexibility+mediated+by+three+hinges%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">In situ structural analysis of SARS-CoV-2 spike reveals flexibility mediated by three hinges.</a> Science. 370 (6513), 203-208 (2020).</li>
<li>Ke, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structures+and+distributions+of+SARS-CoV-2+spike+proteins+on+intact+virions%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Structures and distributions of SARS-CoV-2 spike proteins on intact virions.</a> Nature. 588 (7838), 498-502 (2020).</li>
<li>Calcraft, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integrated+cryoEM+structure+of+a+spumaretrovirus+reveals+cross-kingdom+evolutionary+relationships+and+the+molecular+basis+for+assembly+and+virus+entry%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Integrated cryoEM structure of a spumaretrovirus reveals cross-kingdom evolutionary relationships and the molecular basis for assembly and virus entry.</a> Cell. 187 (16), 4213-4230.e19 (2024).</li>
<li>Tegunov, D., Cramer, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Real-time+cryo-electron+microscopy+data+preprocessing+with+Warp%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Real-time cryo-electron microscopy data preprocessing with Warp.</a> Nat Methods. 16 (11), 1146-1152 (2019).</li>
<li>Mastronarde, D. N., Held, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Automated+tilt+series+alignment+and+tomographic+reconstruction+in+IMOD%5BTitle%5D)+AND+%22J+Struct+Biol%22%5BJournal%5D)">Automated tilt series alignment and tomographic reconstruction in IMOD.</a> J Struct Biol. 197 (2), 102-113 (2017).</li>
<li>Zheng, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((AreTomo%3A+an+integrated+software+package+for+automated+marker-free%2C+motion-corrected+cryo-electron+tomographic+alignment+and+reconstruction%5BTitle%5D)+AND+%22J+Struct+Biol+X%22%5BJournal%5D)">AreTomo: an integrated software package for automated marker-free, motion-corrected cryo-electron tomographic alignment and reconstruction.</a> J Struct Biol X. 6, 100068(2022).</li>
<li>Liu, Y. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isotropic+reconstruction+for+electron+tomography+with+deep+learning%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Isotropic reconstruction for electron tomography with deep learning.</a> Nat Commun. 13 (1), 6482(2022).</li>
<li>Chen, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+complete+data+processing+workflow+for+cryo-ET+and+subtomogram+averaging%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">A complete data processing workflow for cryo-ET and subtomogram averaging.</a> Nat Methods. 16 (11), 1161-1168 (2019).</li>
<li>Zhou, Q. Y., Park, J., Koltun, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Open3D%3A+a+modern+library+for+3D+data+processing%5BTitle%5D)+AND+%22arXiv%22%5BJournal%5D)">Open3D: a modern library for 3D data processing.</a> arXiv. , (2018).</li>
<li>Zivanov, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Bayesian+approach+to+single-particle+electron+cryo-tomography+in+RELION-4.0%5BTitle%5D)+AND+%22Elife%22%5BJournal%5D)">A Bayesian approach to single-particle electron cryo-tomography in RELION-4.0.</a> Elife. 11, e83724(2022).</li>
<li>Pettersen, E. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((UCSF+ChimeraX%3A+structure+visualization+for+researchers%2C+educators%2C+and+developers%5BTitle%5D)+AND+%22Protein+Sci%22%5BJournal%5D)">UCSF ChimeraX: structure visualization for researchers, educators, and developers.</a> Protein Sci. 30 (1), 70-82 (2021).</li>
<li>Adams, P. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((PHENIX%3A+a+comprehensive+Python-based+system+for+macromolecular+structure+solution%5BTitle%5D)+AND+%22Acta+Crystallogr+D+Biol+Crystallogr%22%5BJournal%5D)">PHENIX: a comprehensive Python-based system for macromolecular structure solution.</a> Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 66 (Pt 2), 213-221 (2010).</li>
<li>Burt, A., Gaifas, L., Dendooven, T., Gutsche, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+flexible+framework+for+multi-particle+refinement+in+cryo-electron+tomography%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biol%22%5BJournal%5D)">A flexible framework for multi-particle refinement in cryo-electron tomography.</a> PLoS Biol. 19 (8), e3001319(2021).</li>
<li>Watanabe, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Intracellular+Ebola+virus+nucleocapsid+assembly+revealed+by+in+situ+cryo-electron+tomography%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Intracellular Ebola virus nucleocapsid assembly revealed by in situ cryo-electron tomography.</a> Cell. 187 (20), 5587-5603.e19 (2024).</li>
<li>Woldeyes, R. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structure+of+the+thin+filament+in+human+iPSC-derived+cardiomyocytes+and+its+response+to+heart+disease%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Structure of the thin filament in human iPSC-derived cardiomyocytes and its response to heart disease.</a> bioRxiv. , (2025).</li>
<li>Li, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((HIV-1+Env+trimers+asymmetrically+engage+CD4+receptors+in+membranes%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">HIV-1 Env trimers asymmetrically engage CD4 receptors in membranes.</a> Nature. 623 (7989), 1026-1033 (2023).</li>
<li>Scaramuzza, S., Castaño-Díez, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Step-by-step+guide+to+efficient+subtomogram+averaging+of+virus-like+particles+with+Dynamo%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biol%22%5BJournal%5D)">Step-by-step guide to efficient subtomogram averaging of virus-like particles with Dynamo.</a> PLoS Biol. 19 (8), e3001318(2021).</li>
<li>Castaño-Díez, D., Kudryashev, M., Arheit, M., Stahlberg, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dynamo%3A+a+flexible%2C+user-friendly+development+tool+for+subtomogram+averaging+of+cryo-EM+data+in+high-performance+computing+environments%5BTitle%5D)+AND+%22J+Struct+Biol%22%5BJournal%5D)">Dynamo: a flexible, user-friendly development tool for subtomogram averaging of cryo-EM data in high-performance computing environments.</a> J Struct Biol. 178 (2), 139-151 (2012).</li>
<li>Tran, E. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cryo-electron+microscopy+structures+of+chimeric+hemagglutinin+displayed+on+a+universal+influenza+vaccine+candidate%5BTitle%5D)+AND+%22mBio%22%5BJournal%5D)">Cryo-electron microscopy structures of chimeric hemagglutinin displayed on a universal influenza vaccine candidate.</a> mBio. 7 (2), e00257-e00316 (2016).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>AMD Ryzen Threadripper PRO 5965WX</td><td>AMD</td><td>https://www.amd.com/en/support/downloads/drivers.html/processors/ryzen-threadripper-pro/ryzen-threadripper-pro-5000wx-series/amd-ryzen-threadripper-pro-5965wx.html</td><td></td></tr><tr><td>AreTomo 1.3.4</td><td>UC San Francisco</td><td>https://drive.google.com/drive/folders/1Z7pKVEdgMoNaUmd_cOFhlt-QCcfcwF3_</td><td></td></tr><tr><td>EMAN2 2.99.52</td><td>Baylor Tıp Fakültesi</td><td>https://blake.bcm.edu/emanwiki/EMAN2</td><td></td></tr><tr><td>IMOD 4.12.27</td><td>Colorado Üniversitesi Boulder</td><td>https://bio3d.colorado.edu/imod/</td><td></td></tr><tr><td>Grip analiz scriptleri</td><td>UMass Chan Tıp Fakültesi</td><td>https://github.com/jqyhuang/influenza-analysis</td><td></td></tr><tr><td>IsoNet 0.3</td><td>UCLA</td><td>https://github.com/IsoNet-cryoET/IsoNet</td><td></td></tr><tr><td>M 2.0.0</td><td>Genentech</td><td>https://warpem.github.io/warp/home/m/</td><td></td></tr><tr><td>NVIDIA A4000</td><td>NVIDIA&nbsp;</td><td>https://www.nvidia.com/en-us/products/workstations/rtx-a4000/</td><td></td></tr><tr><td>Open3D&nbsp;</td><td>Intel Labs</td><td>https://www.open3d.org/</td><td></td></tr><tr><td>PHENIX 1.21-5207</td><td>Lawrence Berkeley Ulusal Laboratuvarı</td><td>phenix-online.org</td><td></td></tr><tr><td>RELION 4.0</td><td>MRC Moleküler Biyoloji Laboratuvarı</td><td>https://relion.readthedocs.io/en/release-4.0/</td><td></td></tr><tr><td>Ubuntu 20.04</td><td>Ubuntu</td><td>https://releases.ubuntu.com/focal/</td><td></td></tr><tr><td>UCSF ChimeraX 1.6.1</td><td>UC San Francisco</td><td>https://www.cgl.ucsf.edu/chimerax/</td><td></td></tr><tr><td>Warp 2.0.0</td><td>Genentech</td><td>http://warpem.github.io/warp/</td><td></td></tr></tbody></table>

İnfluenza virüslerinin kriyo-elektron tomografisinden hemaglutinin'in nanometre altı Çözünürlükte yapısal tayini

Subnanometer-Resolution Structural Determination of Hemagglutinin from Cryo-Electron Tomography of Influenza Viruses

İnfluenza Virüslerinin Kriyo-elektron Tomografisinden Hemaglutinin'in Nanometre Altı Çözünürlükte Yapısal Tayini

Cryo-electron tomography is a powerful tool to visualize heterogeneous samples, with one major application being structural characterization of ...

subnanometer-resolution-structural-determination-hemagglutinin-from

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Biyokimya

Protokol zarı proteinleri kullanarak kriyo-elektron tomografisi ve 3D görüntü işleme yapıları belirlemek için yüksek verimli bir yaklaşımı açıklar. Numune hazırlama, veri toplama, veri işleme ve yorumlama kapsar ve yaklaşım, HIV-1 zarf glikoprotein bir temsilcisi hedef üretim ile son bulur. Bu hesaplama prosedürleri, araştırmacılar ve öğrenciler uzaktan çalışma ve veri işleme ve yapısal analiz için katkıda bulunmayı sağlayan bir şekilde dizayn edilmiştir.

Cryo-Elektron Tomografi ve Otomatik Sub-tomogram Ortalaması kullanarak HIV Zarf Glikoproteinler Moleküler Yapılarının Belirlenmesi

Biz yüksek hızlı 3D canlı hücre floresan ışık mikroskobu ve yüksek çözünürlüklü kriyo-elektron tomografi birleştiren bir karşılıklı mikroskopi yöntemi açıklanmaktadır. Biz burada görüntüleme, dinamik ana HeLa hücreleri ile etkileşime küçük bir HIV-1 parçacıkların bağıntılı yöntemin özelliği göstermektedir.

Dinamik Etkileşimler 3D Yapısal Analiz için karşılıklı Mikroskopi

Biz toplamak ve tüm mitokondri süreç elektron cryo-tomografi nasıl bir protokol mevcut. Teknik, doğal biyolojik membranların büyük membran protein komplekslerinin yapısı, işlevi, ve organizasyon hakkında detaylı bilgiler sağlar.

Elektron Cryo-tomografi ile Mitokondri ATP Sintazı dimerlerini Görselleştirme

Virionların yüzeye bağlanması, Süper çözünürlüklü floresan görüntüleme veya atomik kuvvet mikroskopisi (AFM) ile tek virion görüntüleme için bir gerekliliktir. Burada, VIRIONların AFM ve süper çözünürlüklü floresan görüntülemede kullanıma uygun cam yüzeylere kontrollü yapışıklık için örnek bir hazırlama yöntemi gösteriyoruz.

Tek Virion Atomik Kuvvet Mikroskopisi ve Süper Çözünürlüklü Floresan Görüntüleme için Numune Hazırlama

Jsubtomo hesaplama paketi ile elektron kriyo-tomografisi ve alt tomogram ortalamasının bir kombinasyonu kullanılarak viral membran glikoprotein komplekslerinin yapılarını belirlemek için bir yaklaşım sunulmuştur.

Jsubtomo kullanılarak Elektron Cryotomography Rekonstrüksiyonunda ikinci viral zarf glikoproteini Spikes ortalamasını

Bu makale SPHIRE yazılım paketini kullanarak cryo-EM görüntüleri işlemek için bir protokol sunmaktadır. Mevcut protokol, neredeyse atomik çözünürlüğü hedefleyen hemen hemen tüm tek parçacılı EM projeleri için uygulanabilir.

SPHIRE Kullanılarak Elektron Kriyo-mikroskopi Görüntülerinden Yüksek Çözünürlüklü Tek Parçacık Analizi

Kriyo-elektron tomografisi ile in situ makromoleküllerin yüksek çözünürlüklü yapısal çalışmaları için kriyo odaklı iyon ışını mikromakine ile dalma donmuş biyolojik örneklerin lamel hazırlanması için bir protokol sunuyoruz. Sunulan protokol, Saccharomyces cerevisiaeiçindeki makromoleküllerin yapısal karakterizasyonu için yüksek tekrarlanabilirlik ile yüksek kaliteli lamel hazırlanması için yönergeler sağlar.

Kriyo-Elektron Tomografisi için Saccharomyces cerevisiae'nin Hazırlanması ve Kriyo-FIB mikromakinesi

Burada, transmisyon elektron mikroskobu kullanılarak nano ölçekte sıvı-EM ve kriyo-EM analizi için uygun virüs düzenekleri hazırlamak için protokoller açıklanmaktadır.

Sıvı ve Buzdaki Virüs Düzeneklerinin Yüksek Çözünürlüklü Görüntülenmesinin İlerlemesi

Mevcut protokol, Tomo5 kullanılarak yüksek çözünürlüklü kriyo-elektron tomografisi uzaktan veri toplama ve emClarity kullanılarak sonraki veri işleme ve subtomogram ortalamasını açıklamaktadır. Apoferritin, 2.86 şçözünürlükte bir kriyo-ET yapısı elde etmek için ayrıntılı adım adım süreçleri göstermek için bir örnek olarak kullanılır.

Kriyo-elektron Tomografisi Uzaktan Veri Toplama ve Subtomogram Ortalaması

Bu video protokolü, virolojik örneklerin taramalı transmisyon elektron mikroskobu tomografisinin nasıl gerçekleştirileceğini göstermektedir. Optimum sonuçlar için numuneler, yüksek basınçlı dondurma ve ardından dondurma ikamesi ile hazırlanır.

Virolojide Taramalı Transmisyon Elektron Mikroskobu Tomografisi: Yüksek Basınçlı Dondurulmuş, Dondurularak İkame Edilmiş Örneklerin 3 Boyutlu Görüntülenmesi

Öğrenin, kriyo-elektron tomografi ile influenza hemaglutininin reseptör bağlanmasında konformasyon değişikliklerini nanometre altı çözünürlükte inceleyin. Bu yöntem, viral glikoproteinlerin yapısal analizi için uygulanabilir.

İnfluenza Virüslerinin Kriyo-elektron Tomografisinden Hemaglutinin'in Nanometre Altı Çözünürlükte Yapısal Tayini

Daha fazla video keşfet