Denne artikkelen presenterer en detaljert protokoll for T4 ligatur og denaturing siden rensing av små sirkulære DNA molekyler, annealing og Opprinnelig side analyse av sirkulære fliser, montering og AFM avbilding av 1D- og 2D DNA nanostrukturer, samt agarose gel gelelektroforese og sentrifugering rensing av begrenset DNA nanostrukturer.