विधानसभा, लोड हो रहा है, और एक विश्लेषणात्मक ultracentrifuge नमूना सेल के संरेखण

Published 11/05/2009
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Biology
 

Summary

विश्लेषणात्मक ultracentrifuge (नीलामी) नमूना सेल नमूना और संदर्भ बफर प्रयोगों के दौरान रखती है और उच्च वैक्यूम और 60,000 rpm के लिए रोटर गति को उजागर. इस वीडियो को विधानसभा लोड हो रहा है और एक नीलामी प्रयोग के इस बहुत ही महत्वपूर्ण घटक के संरेखण के लिए आवश्यक विस्तार करने के लिए कठोर ध्यान प्रदर्शन करेंगे.

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Balbo, A., Zhao, H., Brown, P. H., Schuck, P. Assembly, Loading, and Alignment of an Analytical Ultracentrifuge Sample Cell. J. Vis. Exp. (33), e1530, doi:10.3791/1530 (2009).

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Abstract

Protocol

नमूना सेल विधानसभा और टोक़

  1. हम एक साथ 2 विंडो विधानसभाओं रखकर नमूना सेल निर्माण शुरू करते हैं.
    खिड़की में एक खिड़की धारक गैसकेट रखें. स्थिति विंडो धारक के अंदर खिड़की लाइनर (या यह कभी कभी एक खिड़की कुशन कहा जाता है) इतना है कि जहाज के उद्घाटन धारक के keyway विपरीत है. एक मामूली कोण पर, धारक विंडो में जगह खिड़की पर खिड़की धारक के प्रमुख तरीके के साथ मुंशी निशान aligning. नीचे प्रेस धीरे खिड़की के दोनों पक्षों पर बहुत किनारों पर.
  2. उचित सील और नमूना सेल की सटीक टोक़ सुनिश्चित करने के लिए, हम हल्के से कोट आवास गैसकेट और Spinkote स्नेहक के साथ पेंच अंगूठी. अपने अंगूठे और तर्जनी के बीच एक Spinkote की बहुत छोटी राशि बिखरा हुआ है. Spinkote की एक पतली, अदृश्य फिल्म के साथ पेंच अंगूठी धागे कोट. इसी तरह, आवास गैसकेट कोट. किसी भी दृश्य स्नेहक पोछो.
  3. एक खिड़की विधानसभा फिसलने से शुरू नमूना सेल विधानसभा, आप की ओर का सामना करना पड़ खिड़की के साथ, सेल आवास में आवास कुंजी के साथ keyway aligning से. आवास कुंजी के साथ centerpiece keyway संरेखित करें और इसे धीरे सेल के अंदर खिड़की विधानसभा के शीर्ष पर गिर.
  4. कभी उपकरण के किसी भी प्रकार का उपयोग करने के लिए सेल आवास में centerpiece धक्का. यह प्रयोगों के दौरान रिसाव में जिसके परिणामस्वरूप सी.पी. को स्थायी नुकसान का कारण बन सकता है. दूसरी खिड़की विधानसभा मुड़ें ताकि विंडो centerpiece की ओर का सामना करना पड़ रहा है, आप से दूर, आवास कुंजी के साथ keyway संरेखित करें और यह centerpiece के शीर्ष पर नीचे स्लाइड. शीर्ष पर आवास गैसकेट प्लेस, तो, तो एक पेंच की अंगूठी शब्द "आउट" दिखाई देता है. अपनी उंगलियों और एक संरेखण उपकरण का उपयोग करना, हाथ पेंच अंगूठी कस.
    यदि सी.पी. आसानी से आवास बैरल में स्लाइड नहीं करता है, पहले यह संरेखित करें, तो यह की चोटी पर दूसरी खिड़की विधानसभा जगह. खिड़की विधानसभा पर कोमल नीचे दबाव लागू करके, सेल आवास में एक ही समय में दोनों स्लाइड. इस तरह, हम सी.पी. पर सीधे दबाने से बचें.
    अब धूल एक प्रकार का वृक्ष, और उंगलियों के निशान के लिए सेल के अंदर देखने के लिए एक अच्छा समय है. तुम भी न्यूटन रिंगों से संकेत मिलता है कि वहाँ अभी भी सी.पी. और खिड़कियों के बीच हवा है नोटिस जाएगा. ये टोक़ लागू करने के बाद गायब हो जाएगा.
  5. पेंच अंगूठी और "बाहर" दिखाई शब्द के साथ, नमूना सेल सेल टोक़ कोलिट टोक़ स्टैंड के अंदर नीचे सभी तरह जगह है. जगह में टोक़ खड़े संभाल पर लगातार दबाव लागू करने के द्वारा सेल पकड़ो. एक सतत गति में 120-140 के बीच एलबीएस में पेंच अंगूठी कस लें. एक समायोज्य सुक्ष्ममापी टोक़ रिंच का उपयोग कर यदि यह / एलबीएस में 120-140 के बीच में सेट और पेंच अंगूठी कस रिंच "क्लिक" सेट टोक़ का संकेत तक पहुँच गया है. टोक़ खड़े संभाल रिलीज और ध्यान खिड़कियों को छू के बिना नमूना सेल निकालने के.

लोड हो रहा है और नमूना सेल सील

  1. अवसादन वेग प्रयोगों के लिए, हम नियमित रूप से 12mm 200ul विंदुक का उपयोग centerpiece के प्रत्येक क्षेत्र में 400ul की मात्रा लोड. ऊपर और पेंच दिखाई अंगूठी पर शब्द "बाहर" पर लोड हो रहा है छेद के साथ एक नमूना सेल स्थिति. विंदुक टिप आधे रास्ते स्लाइड नीचे बायाँ centerpiece के क्षेत्र में छेद के माध्यम से लोड हो रहा है और धीरे धीरे संदर्भ समाधान के 200ul बांटना. एक बार दोहराएँ 400ul कुल. वही विंदुक टिप और उसी तकनीक का उपयोग करना, ध्यान से और धीरे धीरे नमूना समाधान के 400ul के साथ सही centerpiece के क्षेत्र को भरने.
    उल 150-180 के खंड अवसादन संतुलन प्रयोगों के लिए उपयोग किया जाता है, लेकिन एक ही देखभाल और तकनीक का पालन किया जाना चाहिए.

    यह करने के लिए संदर्भ और नमूना समाधान के संस्करणों मैच निकटता के रूप में के रूप में संभव जरूरी है. विंदुक पर मजबूती विंदुक टिप फिटिंग, धीरे धीरे लोड हो रहा है और वितरण समाधान, लोडिंग बुलबुले से बचने और दोनों के रूप में संभव के रूप में बराबर मात्रा को ध्यान में रखते हुए सभी सहायता समाधान के लिए एक ही विंदुक टिप का उपयोग कर.
  2. प्रत्येक लोड हो रहा है यकीन है कि वे केंद्र टुकड़ा और एल्यूमीनियम आवास के बीच तैनात हैं बनाने के छेद में snugly 2 नए लाल आवास प्लग gaskets रखकर सेल सील. प्रत्येक आवास प्लग के साथ कवर. एक छोटे से फ्लैट सिर पेचकश के साथ हाथ कस.

रोटर में नमूना सेल संरेखण

  1. रोटर लोड हो रहा से पहले, सुनिश्चित करें कि counterbalance मामला है कि नमूना सेल लीक में विपरीत स्थिति में 0.5 से अधिक नहीं जी नमूना सेल की तुलना में हल्का है. शून्य पर संतुलन के साथ बाहर शुरू करो. पहले नमूना सेल है कि सीबी विपरीत स्थिति में हो जाएगा वजन. धड़ा संतुलन नमूना सेल वजन घटाना है, तो, सीबी तौलना. Counterbalance की कुर्की छेद से वजन जोड़ना या घटाना. यकीन है कि वजन ऊपर से नहीं बहर. यह सुनिश्चित करें कि counterbalance अंतिम वजन 0.5 ग्राम के भीतर विपरीत नमूना सेल की तुलना में हल्का Reweigh.
  2. एक रोटर 4 जगह का प्रयोग, 4 की स्थिति में counterbalance इतनी जगह है कि सफेद तीर दिखाई देता है और टी में इशारावह केन्द्रापसारक बल की दिशा. यकीन है कि यह सभी तरह रोटर अंदर नीचे है. धीरे सेट पेंच, counterbalance के शीर्ष पर सिर्फ सफेद तीर से भर पाया, जकड़ना जब तक counterbalance दृढ़ता जगह में है, लेकिन अभी भी गठबंधन किया जा करने में सक्षम है. आवास के साथ संतुलित नमूना सेल स्थिति रोटर के केंद्र और पेंच दिखाई अंगूठी पर शब्द "बाहर" का सामना करना पड़ प्लग है.
  3. रोटर नीचे खोज, संरेखण उपकरण का उपयोग counterbalance पर शास्त्राी निशान साथ अंदर शास्त्राी निशान निशान रोटर के केंद्र को निकटतम पंक्ति. सेट पेंच कस जगह में गठबंधन counterbalance ताला. उसी तरह, रोटर पर 2 स्थिति में अंदर मुंशी निशान के साथ नमूना सेल मुंशी चिह्न संरेखित करें.

अधिक जानकारी के लिए देख https://sedfitsedphat.nibib.nih.gov/default.aspx

Discussion

उचित सेल विधानसभा, नमूना प्रविष्टि, रोटर में और कक्ष संरेखण उच्च गुणवत्ता नीलामी प्रयोगों के लिए महत्वपूर्ण है. यह सच है, विशेष रूप से प्रयोगों है कि macromolecular अवसादन प्रोफाइल पर प्राप्त डेटा के एक बहुत विस्तृत विश्लेषण की आवश्यकता के लिए, उदाहरण के लिए, जब प्रोटीन बातचीत का अध्ययन और ट्रेस कुल मात्रा का निर्धारण. अक्सर प्रयोगात्मक स्थापना की गुणवत्ता और नीलामी अध्ययन से परिणाम की सटीकता और परिशुद्धता के लिए सीमित है. 3 - व्यावहारिक डिजाइन और नीलामी प्रयोगों के आगे निष्पादन पर जानकारी के लिए, एक संदर्भ देखें. व्यावहारिक स्थापना, सिद्धांत, और नीलामी प्रयोगों के डेटा विश्लेषण को कवर कार्यशालाओं हमारी प्रयोगशाला में एक वर्ष में दो बार स्वास्थ्य के राष्ट्रीय संस्थान में आयोजित किया जा रहा है है. [4]

Acknowledgements

हम NIBIB, NIH के अंदर का रिसर्च प्रोग्राम द्वारा अनुसंधान सहायता स्वीकार करते हैं.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
4-place Ti analytical rotor Beckman Coulter Inc. 361964
Torque stand assembly Beckman Coulter Inc. 361318
Cell alignment tool Beckman Coulter Inc. 362340
Spinkote Lubricant Beckman Coulter Inc. 306812
Counterbalance Beckman Coulter Inc. 360219
Cell Housing kit Beckman Coulter Inc. 334602
Window gasket Beckman Coulter Inc. 327021
Window liner Beckman Coulter Inc. 362329
Window, sapphire Beckman Coulter Inc. 307177
Window, quartz Beckman Coulter Inc. 301730
Window holder Beckman Coulter Inc. 305037
12mm double sector Epon centerpiece Beckman Coulter Inc. 306493
Cell plug gaskets Beckman Coulter Inc. 327022
Cell housing plug Beckman Coulter Inc. 362327

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Brown, P. H., Balbo, A., Schuck, P. Characterizing protein-protein interactions by sedimentation velocity analytical ultracentrifugation. Curr Protoc Immunol. Chapter 18, Unit 18.15-Unit 18.15 (2008).
  2. Balbo, A., Brown, P. H., Braswell, E. H., Schuck, P. Measuring protein-protein interactions by equilibrium sedimentation. Curr Protoc Immunol. Chapter 18, Unit 18.8-Unit 18.8 (2007).
  3. analytical ultracentrifugation direct boundary modeling with sedfit [Internet]. Peter Schuck. Available from: http://www.analyticalultracentrifugation.com/default.htm Forthcoming.
  4. Home - Workshops [Internet]. National Institutes of Health. Available from: https://sedfitsedphat.nibib.nih.gov/workshop/default.aspx Forthcoming.

Comments

1 Comment

  1. Very clear. Thanks

    Reply
    Posted by: Anonymous
    June 5, 2011 - 3:55 PM

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