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Articles by Carlos A. Lopez in JoVE
JoVE Bioengineering
生物分子检测的干涉反射成像传感器（IRIS）
1Department of Electrical and Computer Engineering, Boston University, 2Department of Biomedical Engineering, Boston University, 3Center for Advanced Genomics Technology, Boston University, 4Department of Medicine, Section of Infectious Diseases, Boston University School of Medicine, 5Department of Microbiology, Boston University School of Medicine, 6CNR (National Research Council), Istituto di Chimica del Riconoscimento Molecolare
免费的生物分子检测定量，高通量，实时，标签（DNA，蛋白质等）上的二氧化硅
Other articles by Carlos A. Lopez on PubMed
病毒基因治疗顺铂的转录调控。
电离辐射 (IR) 和氧自由基中间体 （回报） 激活启动早期生长反应 1 (Egr1) 子通过特定的顺式序列称为 CArG 元素。Ad.Egr.TNF.11D，复制缺陷型腺病毒载体包含 CArG 元素克隆的 cDNA 重组人肿瘤坏死因子-α 用于治疗食管腺癌和大鼠结肠腺癌细胞文化中和作为裸小鼠移植瘤上游。顺铂，常用化疗药物生产 DNA 损伤和产生回报会导致肿瘤细胞死亡。目前的研究表明诱导肿瘤细胞和异种移植的 Ad.Egr.TNF.11D 与顺铂结合治疗肿瘤坏死因子-α 生产。结果显示 Egr1 启动子诱导顺铂和这种感应部分介导，通过 CArG 元素。这些研究还证明不增加的情况下增强抗肿瘤反应后 Ad.Egr.TNF.11D 与顺铂，相比仅任一代理治疗的毒性。化疗诱导肿瘤基因治疗因此提供了一种手段来控制转基因表达同时增强常用化疗药物的效力。
基因治疗由 MDR1 及 EGR1 启动子序列转录靶向化疗 （审查） 的控件。
很有希望的肿瘤基因治疗好处已有限，因无法提供均匀整个肿瘤治疗作用的基因大规模和调控基因表达在肿瘤细胞内。针对转录，DNA 规管的启动子序列进行本地化转基因表达的使用曾受雇为解决方案来绕过这些限制。肿瘤坏死因子-α 细胞因子，展品强效抗癌性质，但之后系统性管理及其实用程序受限于毒性。我们检讨策略即给化疗诱导 EGR1 或 MDR1 创办人段结扎肿瘤坏死因子-α 激活肿瘤坏死因子-α 基因的表达和增强了基因治疗和化疗的有效性。
Chemoinducible 基因治疗： 一项战略，增强阿霉素抗肿瘤活性。
复制缺陷型腺病毒载体，Ad.Egr-TNF.11D，被策划的结扎 CArG (Egr-1 基因启动子上游向人类肿瘤坏死因子-α 基因 cDNA CC(A/T)6GG) 元素。我们在这里报告 Ad.Egr TNF.11D 激活的临床上重要的抗肿瘤药物顺铂、 环磷酰胺、 阿霉素、 5-氟尿嘧啶、 吉西他滨和紫杉醇。N-乙酰半胱氨酸、 清除自由基，阻止诱导肿瘤坏死因子-α 的抗癌剂，活性氧中间体激活 CArG 序列的支持作用。重要的是，PC 3 人类前列腺癌和探讨大鼠结肠癌肿瘤与阿霉素体内的电阻是逆转阿霉素结合 Ad.Egr-肿瘤坏死因子，导致显著的抗肿瘤作用。Ad.Egr TNF.11D 治疗已经与抑制肿瘤血管生成相关联。在这方面，肿瘤微血管密度显著跌幅指出以下任一代理仅比与阿霉素和 Ad.Egr TNF.11D 联合治疗。这些数据显示 Ad.Egr TNF.11D 激活由不同的抗癌药物。
Forphenicinol 增强了模型的鳞状细胞癌中环磷酰胺抗肿瘤作用。
我们研究了 forphenicinol (第四方) 和环磷酰胺 （CPA） 或电离辐射 (IR) 对生长的小鼠鳞状细胞癌肿瘤 SCCVII 之间的相互作用。C3H 小鼠建立了原发性肿瘤，右后肢皮下注射 SCCVII 肿瘤细胞。第四方 （100 毫克/千克 8 天） 和/或注册会计师 （两次 25 毫克/千克） 是由腹腔注射管理。肿瘤是 40 Gy (八 5 Gy 分数） 总剂量辐照。SCCVII 肿瘤生长被抑制的第四方 (P = 近年），红外 (P = 0.003) 和注册会计师 （P < 0.001） 与控制相比。第四方和 CPA 的组合抑制肿瘤生长可以相比哪种独自在这两个小和大体积肿瘤的治疗。第四方并不显著增强抗肿瘤作用的红外，但是，当注册会计师 + 第四方结合红外，重要肿瘤生长的抑制作用指出相比第四方独自 (P < 0.001），注册会计师独自 (P = 0.002) 和红外单 (P = 0.002)。由于其低毒性的配置文件，可结合第四方注册会计师、 红外和其他细胞毒疗法可能会提高治疗的比率。
对硅纳米多孔膜和基于 ECM 的神经分泌细胞微环境评价。
理解超微型合成接口和细胞表达神经元表型之间的交互，对于推进神经记录和刺激等与人类大脑的神经 microdevice 交互的神经工程领域中的研究至关重要。在这里我们探索的神经假体的治疗应用这两个组件的集成。超微型硅纳米多孔膜为生存、 扩散和知名的 PC12 无性系分化及其影响进行了调查。具体而言，细胞形态，通过荧光染色，审查了在许多方面对硅膜和广泛用于聚苯乙烯文化表面可比。附件和分化的 PC12 细胞胶原和层粘连蛋白改性膜及标准组织培养表面上是相似的。最后，分化反应和酪氨酸羟化酶活性的 PC12 细胞嵌入在类型中我同时实验膜衬底上的胶原基质暴露于神经生长因子是重大和组织培养 (TC-PS) 聚苯乙烯表面没有区别。从这项研究结果表明超微型硅纳米多孔膜可能有用，neuroprosthetic 的应用程序和该胶原的生物相容性优先透醇结构可能会有用的固定矩阵的 PC12 细胞植入 macroencapsulation 设备用于治疗神经退行性疾病中加载。
肝大肠癌 Oligometastases 自体模型的建立。
旨在改善成果结直肠癌肝转移患者的区域和系统性疗法会见了不太大但有形的成功。目前，肝叶切除术仍然是只治疗，但只有少数患者手术的候选人。动物模型是研究新的治疗转移性结直肠癌患者的理想方法。我们建议自体结直肠癌肝转移的动物模型模仿 oligometastases，这是一种临床状态被认为适合区域的治疗策略。
表皮生长因子受体抑制剂类与并发放化疗体内的头部和颈部癌症治疗的效果。
为了以最佳方式融入头部和颈部癌症的临床治疗表皮生长因子受体 (EGFR) 抑制剂，必须回答两个重要问题： (a) 不会抑制表皮生长因子将添加到的放化疗，影响和 (b) 如果是的话，哪种方法抑制表皮生长因子的优越 （而不是一种小分子酪氨酸激酶抑制表皮生长因子抗体)？我们设计了体内的研究，以解决这些问题。
苯基丁酸的增敏作用人类胶质母细胞瘤细胞缺乏对电离辐射的野生型 P53 功能。
组蛋白去乙酰酶 (HDAC) 抑制剂诱导增长逮捕、 分化和肿瘤细胞凋亡。苯基丁酸 (PB) 是临床上用于治疗尿素循环障碍 HDAC 抑制剂。由于其低毒性、 脑脊液渗透和口服生物利用度高，我们作为人类胶质母细胞瘤细胞系中潜在辐射增敏剂调查 PB。
DNA 和蛋白质吸附的光相移的量化。
荧光测量相比，无标签的检测方法的主要优势是其定量检测能力，因为绝对度量的吸附材料促进生物分子相互作用的动力学特征。表面上看，生物分子层密度干涉测量技术与光学的阶段但换算系数以前尚未准确地确定。我们目前阶段转变测量标定方法，并将它应用于表面绑定牛血清白蛋白、 免疫球蛋白 G 和单链 DNA。无盐的水中溶解的已知浓度与生物分子出没与阵列表面上和剩下很容易计算出的大量的水蒸发后的精确卷。使用我们无标签的方法，计算的质量的膜层进行比较测量厚度，和我们观察到超过 4 个数量级的线性相关性。我们确定的被广泛接受的 1 转换厚度 nm 对应约 1 ng/mm(2) 表面密度较好地对这些物质举行，通过我们的实验现在可进一步指定为不同类型的生物分子。通过对表面密度的厚度依赖的精确标定方法，我们建立了允许单链 DNA 和两个不同的蛋白质分子的绝对人数的精确确定关系。
无标签的芯片成像的直接检测 DNA 杂交和单核苷酸不匹配。
一种新方法是直接检测芯片上 DNA 分子杂交的提议。光学干涉测量法用于无标签的生物分子积累对玻璃表面，使相互作用的动态检测的传感。提交方法的功能体现在高吞吐量遥感的固相杂交的寡核苷酸。通过比较拍摄之前和之后杂交的无标签的芯片图像检测到的寡核苷酸碱基对长期目标 20 表面固定化探针杂交。通过动态数据采集期间变性的洗涤与低离子浓度缓冲区样本，熔化的单核苷酸错配的双工有别于完美匹配与高置信区间双工 (> 97%）。本文介绍的技术简单、 可靠且准确，并省去了使用标签或辅助试剂监视寡核苷酸杂交。
手术成功 HAART 患者血浆中艾滋病毒 1 RNA 形式的表征。
测定来描述等离子体人类免疫缺陷病毒 （艾滋病毒-1） 1 序列为低病毒负荷量检测患者由相结合的抗 CD44 微球与嵌套的 RT-PCR 针对 env C2V4 区域选择性绑定。序列取自 10 20 HIV 阳性病人都有病毒负荷量低于 48 拷贝/毫升血浆从派生的序列与那些来自 CD14 + CD16 + 单核细胞和 CD4 + T 细胞进行了对比。等离子序列与那些从单核细胞，暗示期间成功抗逆转录病毒治疗，占主导地位的血浆病毒源自髓系细胞扩增了最密切相关。通过描述艾滋病毒 1 RNA 序列从 8 毫升的血浆，同时避免多个步骤，这可能会导致污染和恶化，这种方法可以帮助澄清患者产生耐药性抑制艾滋病毒 1 病毒性的形式。理解的残病毒血症源制定办法消灭病毒至关重要。
无标签的多路复用反射光谱成像的病毒检测。
我们一个新的标签免费平台基于反射光谱成像显示整个病毒和病毒蛋白的检测。干涉反射成像传感器 （IRIS） 已被证明能敏感蛋白质和 DNA 检测的实时和高吞吐量格式。水疱性口炎病毒 （无声） 被用作目标检测是人们熟知的蛋白质组成，可以从其他危险、 高致病性的代理，其余生物安全 2 级代理代理检测到快递病毒外壳蛋白修改。我们表现出完整无声 virions 取得与充当捕获探测器表面固定化的抗体特异性检测证实这一点使用荧光成像。检测限确认到 3.5 × 10 (5) 菌斑形成单位/毫升 (PFUs/mL)。若要增加特异性在临床方案中的的糖蛋白外部和内部的病毒蛋白质同时发现与同一抗体阵列与洗涤剂中断纯净的无声和被感染的细胞裂解解决方案。我们的研究结果显示敏感和特定病毒检测与简单的表面化学和最小的样品制备定量的无标签的干涉测量平台上。
