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Articles by Mathias Munschauer in JoVE
JoVE General
PAR - 클립 - RNA 단백질의 바인딩 Transcriptome 전체 바인딩 사이트를 식별하는 방법
1Howard Hughes Medical Institute, Laboratory of RNA Molecular Biology, Rockefeller University, 2Berlin Institute for Medical Systems Biology, Max-Delbrück-Center for Molecular Medicine, 3Biozentrum der Universität Basel and Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), 4Biozentrum der Universität Basel and Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), 5Genomics Resource Center, Rockefeller University
RNA의 성적표는 횡단 행동 RNA 결합 단백질 (RBPs)의 다수에 의해 중재됩니다 광범위한 posttranscriptional 규정이 적용됩니다. 여기 우리는 정확하고 transcriptome 전체 규모 RBPs의 RNA 결합 사이트를 식별할 수있는 generalizable 방법을 제시.
Other articles by Mathias Munschauer on PubMed
Transcriptome 수준 식별 파 클립에 의해 RNA 바인딩 단백질과 MicroRNA 대상 사이트의
RNA 사본을 RNA 의무적인 단백질 (RBPs)와 microRNA 포함 된 수백 관련 된 posttranscriptional 유전자 조절 될 수 있습니다 ribonucleoprotein 복합물 (miRNPs) 셀 타입 종속 패션에 표현 된. 우리 셀룰러 RBPs 및 Mirnps의 바인딩 사이트 높은 해상도 transcriptome 수준에서 결정 가교 셀 기반 접근 방식을 개발. Crosslinked 사이트 티 미 딘 immunopurified 4 thiouridine 치료 세포의 Rnps에서에서 준비 된 Cdnas에 cytidine 전환에 의해 공개 됩니다. 우리는 심각 하 게 공부와 miRNPs, PUM2, QKI, IGF2BP1 3, 전/EIF2C1-4와 TNRC6A C를 포함 하 여 여러 RBPs 바인딩 사이트 및 규제 결과 결정 우리의 연구 결과 밝혀 이러한 요소 순서 대로 모티프를 포함 하는 사이트의 수천 바인딩하고, intronic 또는 코딩 대 대 exonic untranslated에 대 한 명백한 특혜가 있다 대 본 영역. Transcriptome 걸쳐 사이트 바인딩 정확한 매핑 개인과이 변이 복잡 한 유전자 질환에 기여 하는 방법 사이의 유전 변이에 급속 하 게 신흥 데이터의 해석에 중요 한 것입니다.
