مقالة منهجية

مستحلب T7 الحمض النووي الريبي البلمرة بوساطة مولتيجين نظام التعبير، بمغس

13.1K مشاهدات

DOI:

10.3791/55187

يونيو 27, 2017

* These authors contributed equally

في هذه المقالة

ملخص

وتصف هذه الدراسة طرق للتعبير المشترك بوساطة T7 من جينات متعددة من البلازميد واحد في القولونية الإشريكية باستخدام نظام البلازميد بمغس.

الملخص

ويعتبر التعبير المشترك عن بروتينات متعددة أمرا ضروريا بشكل متزايد للبيولوجيا التركيبية، ودراسة مجمعات البروتينات البروتينية، وتوصيف وتسخير المسارات الحيوية. في هذه المخطوطة، يتم وصف استخدام نظام فعال للغاية لبناء أوبيرونات الاصطناعية مولتيجين تحت سيطرة بوليميراز T7 الحمض النووي الريبي. هذا النظام يسمح العديد من الجينات ليتم التعبير عنها في وقت واحد من البلازميد واحد. هنا، مجموعة من أربعة ناقلات ذات الصلة، بمغس-A، بمغس-هيسا، بمغس-K، و بمغكس-هيسك، مع امبيسلين أو كاناميسين مقاومة اختيار علامة (A و K) وإما امتلاك أو تفتقر إلى N- محطة هيكساهستيدين علامة (له) يتم الكشف عنها. يتم توفير بروتوكولات مفصلة لبناء الأوبرونات الاصطناعية باستخدام هذا النظام المتجه جنبا إلى جنب مع البيانات المقابلة، تبين أن نظام القائم على بمغس تحتوي على خمسة جينات يمكن أن تكون شيدت بسهولة واستخدامها لإنتاج جميع البروتينات المشفرة الخمسة في الإشريكية القولونية . هذا الكيسإم والبروتوكول تمكن الباحثين من التعبير بشكل روتيني عن وحدات معقدة متعددة المكونات والمسارات في E. القولونية .

المقدمة

ويعتبر التعبير المشترك عن بروتينات متعددة أمرا ضروريا بشكل متزايد، لا سيما في تطبيقات البيولوجيا التخليقية، حيث يجب التعبير عن وحدات وظيفية متعددة 1 ؛ في دراسة البروتينات المجمعات البروتين، حيث التعبير وظيفة غالبا ما تتطلب تعبير مشترك 2 ، 3 ؛ وفي تحديد وتسخير المسارات الحيوية، حيث يجب التعبير عن كل جين في المسار 4 ، 5 ، 6 ، 7 ، 8 . وقد تم تطوير عدد من النظم للتعبير المشترك، وخاصة في ال....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

البروتوكول

1. الحصول على الجينات ذات الاهتمام

  1. تصميم الجينات الاصطناعية.
    1. تحسين تسلسل الجينات لتعبير E. القولونية .
    2. إزالة أي مواقع تقييد مشكلة من تسلسل (أفري، ندي، إكوري، و زباي).
    3. إدراج مواقع تقييد للاستنساخ؛ موقع 5-ندي و 3'-إكوري الموقع. ويمكن استخدام مواقع أخرى، إذا لزم الأمر؛ الرجوع إلى المنطقة مولتيكلونينغ من البلازميد المحدد (

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

النتائج

في هذه الدراسة، كان الهدف هو المشاركة في التعبير عن خمسة بروتينات من البلازميد واحد. وقد تم شراء الشظايا الاصطناعية المثلى المكونة من خمسة كودون والتي ترميز إما علامات هيكساهستيدين N- أو C- الطرفية تجاريا. تم تضخيم الجينات الاصطناعية عن طريق ير واستنساخها بشكل فردي في ناقلات ير حادة ومتسلسلة. لتوليد البلازميد بوليسيسترونيك، تم استنساخ الجينات الخمسة من الفائدة لأول مرة في البلازميد بمغس المناسب، بمغس-A. ويبين الشكل 2 P.......

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المناقشة

ويعتبر التعبير المشترك عن الجينات المتعددة أمرا ضروريا بشكل متزايد، خاصة في تحديد وإعادة تشكيل مسارات الأيض المعقدة المتعددة الأقطاب 3 و 4 و 5 . نظام بمغس يجعل مولتيجين شارك في التعبير في E. القولونية الروتينية 6 ، 7 ، 8 ويمكن الوصول إليها للباحثين متنوعة. في هذه الدراسة، أظهرت خمسة بروت.......

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

الكتاب ليس لديهم ما يكشف.

شكر وتقدير

وقد دعم هذا العمل من قبل مجلس العلوم الطبيعية والهندسة البحوث في كندا.

....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسمالشركةرقم فهرسيالتعليقات
<قوي >إنزيمات < / قوي >
الفوسفاتيز القلوي ، معوي العجل (CIP)نيو إنجلاند بيولابزM0290S
AvrIIنيو إنجلاند بيولابزR0174S
EcoRIنيو إنجلاند بيولابسR0101S
NdeIنيو إنجلاند بيولابزR0111S
XbaIجديد إنجلترا BiolabsR0145S
Herculase II Fusion DNA PolymeraseAgilent Technologies600677
T4 DNA LigaseNew England BiolabsM0202S
NameCompanyCatalog NumberComments
Recodes< / قوي >
1 كيلو بايت سلم الحمض النووينيو إنجلاند بيولابسN3232L
4-20٪ Mini-PROTEAN TGX جل بروتين خال من البقعBio-Rad456-8095
50x TAEFisher Thermo ScientificBP1332-4
AgarFisher Thermo ScientificBP1423-500
AgaroseFisher Thermo ScientificBP160-500
AmpicilinSigma-AlrichA9518-5G
BL21 (DE3) خلاياكيميائية خلية Comeptent محضرة في المنزل
B-PER كاشف استخراج البروتين البكتيريفيشر Thermo ScientificPI78243
dNTP مزيجAgilent Technologiesالمزود بمجموعة
استخراج هلام البوليميرازأوميغاD2500-02E.Z.N.A استخراج جل ، مقدمة من VWR Cat 3: CA101318-972
جلايسينفيشر ثيرمو سيانتيفيكBP381-1
جسمه المضاد العلامة [HRP] ، mAb ، MouseGenScriptA00612
Immobilon Western Chemiluminescent HRP SubstrateEMD MilliporeWBKLS0100
IPTGSigma-Alrich15502-10G
LBFisher Thermo ScientificBP1426-500
MethanolFisher Thermo ScientificA411-20
الحليب الخالي من الدسم المبسترالبقالةحليب البقالة الذي لا يحمل اسما كاف
غشاء النيتروسليلوزAmersham Protran (GE Healthcare Life Sciences)10600007غشاء PT 0.45 & micro ؛ م 200 مم × 4 م ، مقدمة من VWR Cat #: CA10061-086
طقم عزل الحمض النووي البلازميدأوميغاD6943-02E.Z.N.A Plasmid DNA MiniKit I ، المقدم من VWR Cat #: CA101318-898
pMGXBoddy Labطلب من Boddy Lab Contact cboddy@uottawa.ca
Primers InterintegratedDNA Technologies تصميمالاشعال حسب الحاجة للجينات المطلوبة
تقنيات الحياة الجينية الاصطناعيةتصميم وتحسين حسب الحاجة
ورقة ترشيح لطخة سميكةBio-Rad1703932
قاعدة تريسBioShopTRS001.1
Tween-20Sigma-AlrichP9416-50ML
XL1-Blue خلاياخلية Comeptent محضرة في المنزل
<قوي>الاسم< قوي><قوي> الشركة< / strong> رقم الكتالوج< / strong>تعليقات< / strong>
Equipment< / strong>
BioSpectrometerEppendorfRK-83600-07
Gel box - PAGEBio-Rad1658005Mini-PROTEIN Tetra Vertical Electrophorese
خلية جل تصويرAlpha InnotechAlphaImager EC
حاضنة فرنفيشر ثيرمو سيانتيفيك11-690-650Dحاضنة متساوية الدرجة
الأولى شاكرفيشر ثيرمو ساينتفيكSHKE6000-7ماكس كيو 6000 ماكس كيو 6000
بيرسونا شفراتفيشر ثيرمو ساینتفيكS04615
حزمة الطاقةبيو رادS65533QFB300
TransilluminatorVWR الدوليةM-10E ، 6W
ThermocylcerEppendorfZ316091Mastercycler Personal ، مقدمة من Sigma
UV Face-Shield18-999-4542
WaterbathFisher Thermo Scientific15-460-2SQ
النقل الغربيBio-Rad1703935Mini-Trans Blot Cell
كومبنت مسحوق الفوري متجر المحلي مختصة كيميائيا الحلاقة جهاز

المراجع

  1. Purnick, P. E. M., Weiss, R. The second wave of synthetic biology: from modules to systems. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 10 (6), 410-422 (2009).
  2. Bieniossek, C., et al. Automated unrestricted multigene recombineering for multiprotein complex production.<....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

إعادة الطباعة والأذونات

طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه

طلب إذن

الوسوم

E coli

مقالات ذات صلة