السل المستخدمة في هذه الدراسة كان اسمه BT18 ، والتي نشأت من سلالة "JinQiao No.2" المزروعة من قبل مركز بحوث الحبوب الصغيرة المتنوعة من أكاديمية شانشي للعلوم الزراعية. يتم توضيح الخطوات الأساسية لهذا البروتوكول في الشكل 1.
ملاحظة: تشغيل التلاعب المتعلقة بالنباتات الخارجية بسرعة، وعندما يكون ذلك ممكنا، والحفاظ على أطباق بيتري مغلقة لتجنب الذبول والتلوث. ما لم ينص على خلاف ذلك، أجريت جميع الحاضنات explant تحت شرط ضوء 14-ح و10-ح فترة ضوئية داكنة في 25 درجة مئوية. ما لم ينص على خلاف ذلك، تم إجراء جميع العمليات المتعلقة بالنباتات السابقة أو البكتيريا في ظروف معقمة في غطاء تدفق لامينار. يتم توفير جميع المكونات الإعلامية لـ A. rhizogenes والثقافات النباتية في المختبر في الجدول 1. بعد ضبط درجة الحموضة ، تم ضبط جميع الوسائط في 120 درجة مئوية لمدة 20 دقيقة. تم إعداد الوسائط الصلبة عن طريق ملء 25 مل من المتوسط في طبق بيتري قطره 9 سم والسماح لها بترسيخ.
تنبيه: إيداع جميع البكتيريا والنباتات المعدلة وراثيا في حاوية النفايات المناسبة. تشغيل جميع المواد الكيميائية الخطرة في خزانة أبخرة وإيداعها في حاوية النفايات الخطرة.
1- إعداد القابلات المسببة للسل
- إعداد بذور السل
- حدد بذور السل الممتلئة وغير التالفة(الشكل 1A1)التي تم الحفاظ عليها عند درجة حرارة أقل من −20 درجة مئوية لمدة لا تزيد عن عامين.
- نقع البذور في الماء في 28 درجة مئوية لمدة 20 دقيقة تقريبا بحيث يمكن بسهولة تقشير معطف البذور قبالة(الشكل 1A2). إذا لزم الأمر، استخدم مقص لقطع فتحة على البذور لتسهيل تقشير.
- تعقيم بذور السل
- ضع 100-200 بذور مقشرة في قارورة مخروطية معقمة 100 مل.
- تطهير البذور باستخدام الإيثانول 75٪ لمدة 30 s.
- استبدال الإيثانول مع 5٪ هيبوكلوريت الصوديوم وتطهير لمدة 15 دقيقة.
ملاحظة: يمكن استخدام التطهير باستخدام ثنائي كلوريد الزئبق بتركيز 1 غرام/لتر لمدة 8 سنوات كمقمّقم بديل ليحل محل هيبوكلوريت الصوديوم في أي حالة من حالات التعقيم غير الكافي.
تنبيه: ثنائي كلوريد الزئبق خطير وليس مادة صديقة للبيئة. تشغيله في خزانة fuming وإيداعه في حاوية النفايات الخطرة، إذا تم استخدام ثنائي كلوريد الزئبق في أي حال.
- صب هيبوكلوريت الصوديوم.
- غسل البذور باستخدام الماء المعقم deionized 5 مرات.
- لطخة البذور الجافة مع ورقة ثنائية العقيمة.
- إعداد شتلات السل
- إعداد 50 مل موراشيج وSkoog (MS) المتوسطة القاعدية (1962) تستكمل مع 30 غرام / لتر السكروز و 7 ز / لتر مسحوق أجار (MSSA)(الجدول 1)في زجاجة زراعة الأنسجة النباتية 300 مل.
- ضبط درجة الحموضة إلى 5.8 قبل التعقيم.
- توزيع 10 بذور بالتساوي لكل زجاجة من متوسطة MSSA.
- تنبت البذور في غرفة الثقافة في 25 درجة مئوية ± 1 درجة مئوية تحت شرط الضوء لمدة 7-10 أيام.
- إعداد النباتات المعقمة
- حدد شتلات قوية من السل(الشكل 1C)،عندما تتكشف 2 قطعة من cotyledons.
- قطع الشتلات من الجذور(الشكل 1C أحمر اندفاعة رؤوس الأسهم)،وتجنب الاتصال مع المتوسطة.
- وضعها في طبق بيتري معقم.
- قطع يبوكوتل إلى شرائح 0.8-1 سم، وقص cotyledons إلى قطع 0.5 سم تقريبا.
- قبل زراعة هذه explants على MSSA المتوسطة تحت شرط الضوء لمدة 24 ساعة.
- نقلها إلى قارورة مخروطية 100 مل معقم، والتي هي الآن جاهزة للعدوى.
2. إعداد A. رهيزوجينات للتحول
ملاحظة: تم توفير سلالة A. rhizogenes ACCC10060 من قبل معهد تطوير النباتات الطبية والحفاظ عليها عند −80 درجة مئوية. A. تم تحويل رهيزوجينات مع ناقل ثنائي pK7GWIWG2D (II) التي تؤوي T-DNA تحمل الجين B4 المصاحبة GFP كجين مؤشر والجينات المقاومة كان كعلامة يمكن اختيارها. الجين b4 هو عضو في الأسرة bHLH عامل النسخ, التي لم تنشر بعد. لتقييم إمكانات جذور السل المشعرة، تم تحويل A. rhizogenes مع الناقل الثنائي pK7WG2D الذي يحتوي على جين MYB116 للتحقيق في تأثيره على إنتاج الأيض الثانوي مثل الفلافونويدات على مستوى التعبير الجيني والتحليلات الأيضية. تنشيط A. يجب أن تكون مستعدة جيدا في نفس الوقت مع explants.
- تفعيل A. رهيزوجينات
- ذوبان الريزوجينات A. على الجليد
- تراجع البكتيريا وخط لهم بالتساوي على الخميرة مانيتول المتوسطة (YEB) تستكمل مع 15 غ / لتر مسحوق أجار, 50 ملغ / لتر ريفامبيسين, و 50 ملغ / لتر spectinomycin (YEBARS, درجة الحموضة 7.0).
- احتضان البكتيريا في 28 درجة مئوية لمدة 12-16 ساعة.
- اختيار مستعمرة أحادية النسيلة والثقافة في طبق آخر بيتري في نفس الطريقة المذكورة أعلاه.
- حدد المستعمرات أحادية النسيلة والثقافة لهم في قارورة مخروطية معقمة 100 مل تحتوي على 20 مل من متوسطة YEB تكملها مع 50 ملغ / لتر ريفامبيسين و 50 ملغ / لتر spectinomycin (YEBRS، درجة الحموضة 7.0) في 28 درجة مئوية و 200 دورة في الدقيقة لمدة 16-18 ساعة حتى قيمة OD600 تصل إلى 2.0.
- احتضان 2٪ -4٪ من الثقافة المذكورة أعلاه في قارورة مخروطية أخرى 100 مل تحتوي على 20 مل من وسط YEBRS عند 28 درجة مئوية و 200 دورة في الدقيقة لمدة 4-5 ساعة حتى تصل قيمة OD600 إلى حوالي 0.5(الشكل 1D).
3- العدوى بالنباتات المسببة للسل وفحصها
ملاحظة: الهدف من هذا البروتوكول هو الحصول على جذور مشعرة متحولة وراثيا. تم استخدام الجذور البرية كتحكم سلبي لتقييم التعبير المعدل وراثيا. في هذا البروتوكول، تم تحويل A. rhizogenes مع ناقلات ثنائية إما pK7WG2D تحمل جين FtMYB116 أو pK7GWIWG2D (II) تحمل جين B4 مقدما.
- إعادة تعليق A. رهيزوجينات
- نقل الثقافة التي تم الحصول عليها في الخطوة 2.1.6 إلى أنبوب طارد ة بالسيارة معقم 50 مل.
- تدور في 4000 × ز لمدة 10 دقيقة في 20 درجة مئوية.
- إزالة supernatant وإعادة تعليق بيليه البكتيرية مع MS المتوسطة تستكمل مع 30 غرام / لتر السكروز و 300 ميكرومتر acetosyringone (AS) (MSSAS، درجة الحموضة 5.8) إلى OD600 × 0.2.
- عدوى النباتات الخارجية
- غرس التعليق البكتيري الذي تم الحصول عليه في الخطوة 3.1.3 في قارورة مخروطية تحتوي على النباتات الجاهزة المعدة في الخطوة 1.4.6 لمدة 10 دقيقة(الشكل 1E).
- إخراج explants، ولطخة لهم الجافة باستخدام ورقة bibulous معقمة.
4. الزراعة المشتركة للنباتات مع A. rhizogenes
- ضع ورق فلتر معقم قطره 9 سم على متوسط MS ، والذي يتم ترسيخه باستخدام مسحوق أجار 7 جرام / لتر مُكمل بـ 30 جرام / لتر من السكروز و 100 ميكرومتر AS (MSSAAS متوسط ، درجة الحموضة 5.2).
- تراكب explants على ورقة تصفية في 25 درجة مئوية لمدة 3 أيام في الظلام(الشكل 1F).
5- الثقافة التعريفية والانتقائية
- ضع ما يقرب من 20 من النباتات المصابة على متوسطة MSSA المكملة بـ 500 ملغم/لتر من التشيفوتتاكسي و50 ملغم/لتر كاناميسين (كان) (MSSACK، درجة الحموضة 5.8)(الشكل 1G).
- احتضانها عموديا تحت حالة الضوء عند 25 درجة مئوية ± 1 درجة مئوية. تحدث الجذور المشعرة بعد أسبوع واحد تقريبًا من الحضانة(تشيررؤوس الأسهم السوداء ذات الاندفاعة السوداء الشكل 1H إلى حدوث جذور شعرية).
ملاحظة: استبدال MSSACK المتوسطة كل 15 يوما إذا لزم الأمر.
6. subculturing جذور السل شعر
ملاحظة: يهدف هذا الإجراء إلى حصاد جذور شعر قوية. مراقبة نمو الجذور المشعرة بانتظام أثناء الانتشار ، وإزالة تلك الملوثة والمنشطة في الوقت المناسب. إذا لزم الأمر، كرر الخطوات التالية لنشر المزيد من الجذور المشعرة. يستغرق ما يقرب من 10-14 يوما من subculturing إلى الحصاد.
- حدد الجذور شعر تظهر مظهر الأبيض والنمو السريع.
- قطع لهم إلى قطع من 2-3 سم.
- من الواضح أن رقم لهم على مقاعد البدلاء نظيفة.
- الثقافة الفرعية لهم في قارورة مخروطية 100 مل معقم تحتوي على 5 مل من متوسطة MS تكملها مع 30 غرام / لتر السكروز و 50 ملغ / لتر كان (MSSK، درجة الحموضة 5.8) بسرعة دوارة من 80 دورة في الدقيقة في 25 درجة مئوية في الظلام حتى أنها مبالغفيها إلى الجزء السفلي من القارورة(الشكل 1I).
7- تحديد الجذور المشعرة المتحولة والحفاظ عليها
ملاحظة: يمكن تحديد الجذور المشعرة المتحولة استنادًا إلى جوانب المورفولوجيا ومستوى الجينات. ويمكن أيضا أن يتم تحديد وفقا لالجينوم الجذر شعر والمقاومة، والتي لا تغطيها في هذا البروتوكول. يركز هذا الإجراء في المقام الأول على الجينات المراسلة وتحديد الجينات المستهدفة.
- إزالة التوني والجذور المشعرة الملوثة واختيار تلك مع مظهر أبيض.
- تقييم ما إذا كان هناك الفلورة الخضراء تحت الأزرق / الضوء المزدوج فوق البنفسجي ة transilluminator.
- حدد الجذور المشعرة التي تظهر إشارة فلورية قوية في الأنابيب مرقمة أو ملفوفة باستخدام tinfoil ملحوظ بعد تجفيفها بورقة ماصة.
- Lyophilize لهم في النيتروجين السائل، تليها تخزين كل الحصاد في −80 درجة مئوية لمزيد من التحقيق.
- التعرف الجيني
- ثلاثية 0.1 غرام من الجذور المشعرة إلى مسحوق ناعم في النيتروجين السائل.
- إعداد الحمض النووي الجينومي للخطوط المعدلة وراثيا مستقلة من السل باستخدام تعديل cetyltrimethylammonium بروميد الأسلوب25 وفقا لتعليمات الشركة المصنعة للمصنع الجينوم ية DNA عدة.
- تنفيذ تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) باستخدام 100 نانوغرام من قالب الحمض النووي الجينومي والتمهيديات المدرجة في الجدول 2.
- أداء دورة التضخيم على النحو التالي: predenaturation في 94 درجة مئوية لمدة 5 دقيقة، التطهر في 94 درجة مئوية لمدة 30 ث، التمهيدي الصلب في 55 درجة مئوية لمدة 30 ث، وتمديد التمهيدي في 72 درجة مئوية لمدة 30 ث. بعد 36 دورة وخطوة تمديد النهائي في 72 درجة مئوية لمدة 10 دقيقة، وتحليل منتجات التضخيم على 1٪ المواد الهلامية أغاروز.
- الطخ المواد الهلامية بتلطيخ الحمض النووي وتصورها تحت ضوء الأشعة فوق البنفسجية.