التغيرات في عزلات البكتيريا في الجهاز التنفسي السفلي لدى مرضى العناية المركزة قبل وبعد جائحة كوفيد-19

Mahmut Ulger; Serif Kurtulus; Remziye Can; Salim Yakut; Mehmet Celik; Hatice Kalaycioglu; Fadile Yildiz Zeyrek

doi:10.3791/70651

مقالة بحثية

التغيرات في عزلات البكتيريا في الجهاز التنفسي السفلي لدى مرضى العناية المركزة قبل وبعد جائحة كوفيد-19

DOI:

10.3791/70651

⸱

يونيو 9, 2026

Mahmut Ulger¹ , Serif Kurtulus² , Remziye Can³ , Salim Yakut⁴ , Mehmet Celik⁵ , Hatice Kalaycioglu¹ , Fadile Yildiz Zeyrek⁴

¹Department of Chest Diseases, University of Harran Faculty of Medicine, ²Clinic of Chest Diseases, University of Health Sciences, Mehmet Akif Inan Training and Research Hospital, ³Mustafa Kemal Atatürk vocational and Technical High School, ⁴Department of Medical Microbiology, University of Harran Faculty of Medicine, ⁵Department of İnfectious Diseases and Clinical Microbiology, University of Harran Faculty of Medicine

في هذه المقالة

ملخص

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

هنا، يقدم بروتوكول ميكروبيولوجي استعادي لتحليل عينات الجهاز التنفسي السفلي لدى مرضى وحدة العناية المركزة، بما في ذلك معالجة الزراعة، وتحديد التصلب المتقطع في مالدي-توف، ومقارنة توزيع مسببات الأمراض البكتيرية لدى المرضى السلبيين لكوفيد-19 قبل وبعد جائحة كوفيد-19.

الملخص

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

لمقارنة توزيع مسببات الأمراض البكتيرية المعزولة من عينات الجهاز التنفسي السفلي لدى مرضى وحدة العناية المركزة السلبية من كوفيد-19 قبل وبعد جائحة كوفيد-19، تم تحليل نتائج الزراعة من المرضى المقبولين في وحدة العناية المركزة لأمراض الصدر في مستشفى جامعي بأثر رجعي. تم تضمين المرضى الذين لم يكن لديهم شك سريري أو إشعاعي في كوفيد-19 ونتائج PCR سلبية وتصنيفهم كمرضى قبل كوفيد-19 أو ما بعد كوفيد-19 بناء على مارس 2020. تم تربية العينات على أجار دم الأغنام بنسبة 5٪، وأجار أزرق إيوسين ميثيلين، وأجار الشوكولاتة، وتم تقييمها بعد حضانة استمرت 24–48 ساعة عند درجة حرارة 37 درجة مئوية. فقط الكائنات الدقيقة السائدة التي تظهر نموا في القطاع الثاني للخطوط كانت تعتبر ذات أهمية سريرية. تم تضمين ما مجموعه 1,665 مريضا، حيث تم اكتشاف نمو ميكروبي في 48.9٪ من العينات، وكان معظمها من فترة ما قبل كوفيد-19. كان Acinetobacter baumannii هو الكائن الأكثر عزلة في كلتا الفترتين. أظهر تحليل الانحدار اللوجستي انخفاضا في معدلات الكشف عن كلبسييلا الرئوية، وPseudomonas aeruginosa، والمكورات العنقودية الذهبية (نسبة الاحتمالات ≈0.3)، والإشريكية القولونية (نسبة الأرجحية ≈0.4) في فترة ما بعد كوفيد-19. كما كانت معدلات الوفيات أقل في فترة ما بعد كوفيد-19، رغم عدم ملاحظة فرق كبير في نوع الخروج. ظل تنوع مسببات الأمراض بشكل عام متشابها عبر الفترات؛ ومع ذلك، لوحظت انخفاضات في اكتشافات البكتيريا المختارة بعد بداية الجائحة. قد تعكس هذه النتائج تغيرات في ممارسات مكافحة العدوى خلال فترة الجائحة، رغم أنه لا يمكن إثبات السببية بسبب تصميم الدراسة بأثر رجعي وغياب القياسات المباشرة للعوامل المساهمة.

المقدمة

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

تشمل التهابات الجهاز التنفسي السفلي (LRTIs) الحالات الالتهابية في المجاري الهوائية، بما في ذلك التهاب الشعب الهوائية، وقصر الشعب الهوائية، والتهاب القصيبات الهوائية، والخراج الرئوي، والانصباب الجنيبي، والالتهاب الرئوي¹. تمثل هذه العدوى سببا رئيسيا للمراضة والوفيات لدى المرضى المنومين وتشكل خطرا كبيرا في البيئات عالية الحدة مثل وحدات العناية ^{المركزة (}ICUs). تشكل حالات LRTI حوالي 10٪–25٪ من العدوى المكتسبة في المستشفيات، مع معدلات وفيات تبلغ بين 22٪ إلى 71٪ بين مرضى العناية المركزة ^3,4. قد تنشأ من مسببات الأمراض البكتيرية أو الفيروسية أو الفطرية، مع عوامل بكتيرية شائعة تشمل كليبسييلا الرئوة، وPseudomonas aeruginosa، وAcinetobacter baumannii، والمكورات الرئوية العقدية، والمكورات العنقودية الذهبية⁵. العصيات سالبة الجرام مثل الإشريكية القولونية، وK. pneumoniae، وSerratia marcescens، وP. aeruginosa، وAcinetobacter spp.، وأنواع Enterobacter غالبا ما ترتبط بأنواع LRTI المكتسبة في المستشفيات المتأخرة، وغالبا ما ترتبط بفترات طويلة في المستشفى وزيادة استعمار البلعوم الفموي⁶.

أصبح إدارة الالتهاب الرئوي المكتسب من المستشفيات أكثر تحديا بسبب ظهور مسببات الأمراض المقاومة للأدوية المتعددة. تتأثر النتائج السريرية ليس فقط بالعوامل المرتبطة بالمرضى، بل أيضا بالكائن المسبب وملف قابليته المضادة للميكروبات ^7,8. وبالتالي، يبقى مراقبة توزيع مسببات الأمراض في وحدات العناية المركزة أمرا أساسيا لتوجيه العلاج التجريبي وتحسين نتائج المرضى⁹.

لقد غيرت جائحة فيروس كورونا 2019 (COVID-19) بشكل كبير أنظمة الرعاية الصحية حول العالم، مما أدى إلى تغييرات كبيرة في ممارسات مكافحة العدوى، واستراتيجيات إدارة المرضى، واستخدام مضادات الميكروبات¹⁰^–¹². قد يكون تطبيق تدابير الوقاية من العدوى والاستخدام الواسع للمضادات الحيوية واسعة الطيف خلال هذه الفترة قد أثر على وبائيات مسببات الأمراض التنفسية في وحدات العناية المركزة.

هدفت هذه الدراسة إلى تحديد الكائنات الدقيقة المسؤولة عن عدوى الجهاز التنفسي السفلي لدى مرضى العناية المركزة السلبية لكوفيد-19، ومقارنة توزيع مسببات الأمراض قبل وبعد جائحة كوفيد-19 باستخدام طرق ميكروبيولوجية موحدة.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

البروتوكول

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

تمت الموافقة على بروتوكول الدراسة من قبل لجنة أخلاقيات كلية الطب بجامعة هاران (القرار رقم HRU/23.12.23; 10 يوليو 2023). وبسبب التصميم الاستعادي، تم التنازل عن الموافقة المستنيرة. تم إجراء جميع الإجراءات وفقا لمعايير المختبرات المؤسسية. الأدوات البحثية المستخدمة في هذا البروتوكول مدرجة في جدول المواد.

1. تصميم الدراسة واختيار المرضى

تمت مراجعة نتائج زراعة الجهاز التنفسي السفلي للمرضى الذين تم قبولهم في وحدة العناية المركزة لأمراض الصدر في مستشفى جامعي بين مارس 2017 ومارس 2023 بأثر رجعي. تم تضمين المرضى إذا لم يكن كوفيد-19 مشتبها به سريريا أو إشعاعيا، وكانت نتائج اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل لفيروس SARS-CoV-2 سلبية. تم استبعاد المرضى دون سن 18 عاما والذين كانت نتائجهم إيجابية لاختبار PCR.

تم تصنيف المرضى إلى مجموعات ما قبل كوفيد-19 (قبل مارس 2020) وما بعد كوفيد-19 (مارس 2020 وما بعده) بناء على تاريخ أول حالة مؤكدة لكوفيد-19 في تركيا.

2. مجموعة العينات

شملت عينات الجهاز التنفسي السفلي عينات بلغم، وسحب القصبة الهوائية العميقة (DTA)، وغسيل الشعب الهوائية (BAL) التي جمعت تحت ظروف معقمة وفقا للممارسات السريرية القياسية في وحدة العناية المركزة.

تم الحصول على عينات بلغم وDTA من المرضى الذين تم تنبيبهم وغير المثقلين باستخدام تقنيات الشفط المعقم. تم جمع عينات BAL أثناء تنظير الشعب الليفي البصري باستخدام غرس محلول ملحي معقم تليها الشفط.

3. تقييم أولي للعينة

تم تقييم عينات البلغم وDTA في البداية عن طريق التلوين بالجرام. اعتبرت العينات مناسبة للزراعة إذا احتوت على ما لا يقل عن 25 كريات بيضاء متعددة الأشكال ونوى وأقل من 10 خلايا ظهارية حرشفية في حقل منخفض القدرة بتكبير 100 مرة. تم استبعاد العينات التي لم تستوفي هذه المعايير.

4. معالجة الزراعة

تمت معالجة عينات البلغم باستخدام طريقة زراعة نوعية. تم تطعيم العينات على أغار دم الأغنام بنسبة 5٪، وأجار الإيوسين والميثيلين الأزرق، وأجار الشوكولاتة، ثم حضنتها هوائية عند درجة حرارة 37 درجة مئوية وتم تقييمها بعد 24 و48 ساعة. فقط الكائنات الدقيقة السائدة التي تظهر نموا يمتد إلى القطاع الثاني المخطط كانت تعتبر ذات أهمية سريرية.

تمت معالجة عينات DTA وBAL باستخدام طرق الزراعة الكمية. تم تطعيم الأليكوات على نفس الوسائط وحضانته تحت ظروف متطابقة. تم اعتبار عتبات النمو التي لا تقل عن 100000 وحدة تكوين مستعمرة (CFU) لكل مل ل DTA و10000 وحدة CFU لكل مل لعينات BAL ذات دلالة.

5. تحديد الكائنات الدقيقة

تم تحديد جميع العزلات التي تستوفي المعايير المحددة مسبقا باستخدام مطيافية الكتلة بمساعدة المصفوفة بإزالة الامتصاص بالليزر بتأين وقت الطيران (MALDI-TOF MS) وفقا لإجراءات المختبر القياسية.

6. تسجيل البيانات وتحليلها

تم تسجيل الخصائص الديموغرافية، وأنواع العينات، ونتائج الزرعات، والكائنات الدقيقة المحددة، ونتائج التفريغ بشكل منهجي. تمت مقارنة توزيع الكائنات الدقيقة بين فترات ما قبل وبعد كوفيد-19.

7. التحليل الإحصائي

تم إجراء تحليلات إحصائية باستخدام SPSS (الإصدار 15.0) وبرنامج Minitab. تم تقييم طبيعية المتغيرات المستمرة باستخدام اختبار شابيرو-ويلك. تمت مقارنة المتغيرات التصنيفية باستخدام اختبار كاي تربيع. تم إجراء تحليل الانحدار اللوجستي لتقييم الروابط بين توزيع الكائنات الدقيقة والوفيات. تم اعتبار قيمة p أقل من 0.05 ذات دلالة إحصائية.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

النتائج

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

تراوح عمر سكان الدراسة بين 18 و103 سنوات، بمتوسط عمر 68.95 زائد أو ناقص 15.00. شكلت النساء 34.4٪ (n = 572) والرجال 65.6٪ (n = 1093) من المشاركين. بشكل عام، تم إخراج 42.3٪ (n = 704) من المرضى، بينما حدثت الوفيات في 57.7٪. تم اكتشاف نمو ميكروبي في 48.9٪ (n = 815) من الزرعات، في حين لم يلاحظ نمو في 51.1٪ (n = 850).

شملت أنواع العينات البلغم (45.6٪، n = 759)، DTA (41.9٪، n = 698)، وBAL (12.5٪، n = 208). أكثر الكائنات الدقيقة معزولة كان Acinetobacter baumannii (21.5٪، n = 358). تم جمع ما م...

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المناقشة

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

ترتبط العدوى التي تتطور في وحدات العناية المركزة بارتفاع معدلات المراضة والوفيات، ويظل تحديد العوامل الميكروبيولوجية المسببة أمرا أساسيا لاستراتيجيات الوقاية والعلاج الفعالة ^1,7. قامت هذه الدراسة بتقييم مسببات الأمراض في الجهاز التنفسي السفلي المعزولة في وحدة العناية المركزة لأمراض الصدر على مدى ست سنوات، وقارنت فترات ما قبل وبعد كوفيد-19. تماشيا مع التقارير السابقة، كان A. baumannii أكثر مسببات الأمراض معزولة في كلا الف...

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

يعلن المؤلفون أنهم لا يملكون تضارب مصالح.

شكر وتقدير

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

يقر المؤلفون بالدعم المؤسسي الذي قدمته إدارة المستشفى خلال فترة الدراسة.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسم	الشركة	رقم فهرسي	التعليقات
مجموعة مجموعة غسل القصبات الهوائية	غير مطبق	غير مطبق	يستخدم لجمع عينة غسل القصبات الهوائية
أجار الشوكولاتة	RTA	غير مطبق	وسط زراعة للعينات التنفسية
قسطرة تنفس عميق	غير مطبق	غير مطبق	يستخدم لجمع عينة التنفس العميق
أجار يوزين ميثيلن أزرق	RTA	غير مطبق	وسط انتقائي للبكتيريا سالبة الجرام
كواشف التلطيخ بغرام	غير مطبق	غير مطبق	يستخدم لتقييم مجهريّ أولي
حاضنة (37 درجة مئوية)	غير مطبق	غير مطبق	يستخدم لتحضين المزروعات
نظام MALDI-TOF MS (VITEK MS)	bioMérieux	غير مطبق	يستخدم لتحديد البكتيريا
محلول المصفوفة لـ MALDI-TOF MS	bioMérieux	غير مطبق	يُستخدم حسب تعليمات الشركة المصنعة
أجار دم الخراف (5%)	RTA	غير مطبق	وسط زراعة أساسي

إعادة الطباعة والأذونات

طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه

طلب إذن

التغيرات في عزلات البكتيريا في الجهاز التنفسي السفلي لدى مرضى العناية المركزة قبل وبعد جائحة كوفيد-19

في هذه المقالة

ملخص

الملخص

المقدمة

البروتوكول

النتائج

المناقشة

الإفصاحات

شكر وتقدير

المواد

إعادة الطباعة والأذونات

الوسوم

مقالات ذات صلة