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方法文章

海水采样与收集

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DOI:

10.3791/1159

2009年6月17日

本文内容

摘要

本视频记录了采集近海海水样品并对其进行处理的方法,以用于多种后续应用,包括生物量浓缩、核酸纯化、细胞丰度、营养盐和痕量气体分析。

摘要

本视频记录了采集近海海水样品并进行后续多种分析处理的方法,包括生物量浓缩、核酸纯化、细胞丰度测定、营养盐及痕量气体分析等。本次演示的样品采自位于萨尼奇湾运行的 HMS John Strickland 号甲板。采样使用配备多功能绞车和缆线系统的 A 型架吊机,结合 Niskin 或 Go-Flo 水样采集瓶进行。同时利用电导率、温度和深度(CTD)传感器对底层水体进行监测。为尽量减少气体逸出,优先采集痕量气体样品,随后测定营养盐、水体化学参数和细胞数量。最后采集用于生物量过滤的水样。单次采样作业的设备架设与采集时间约为 1.5 小时,最大采样深度为 215 米。因此,完成本视频所述系列采样通常需要总计约 6 小时。

方案

第1部分:水样采集

  1. 为每次采样投掷分配相应的深度。
  2. 确定当前投掷需要采样的深度以及需采集的总水量。
  3. 确保 Go-Flo 瓶和 Niskin 瓶处于打开状态,且其阀门和出水口处于关闭状态。
  4. 将 CTD 安装在绳索底部并下放至水中。
  5. 在 CTD 之后,将用于最深采样深度的瓶子安装到绳索上;确保绳索正确安装在支架内,并拧紧螺丝。
  6. 在下放前,为每个瓶子(最深的那个除外)安装触发器(messenger)。
  7. 将绳索下放到第一个深度与下一个深度之间的距离,然后安装另一个瓶子。需要注意的是,对于需要收集 20 L 水样用于过滤的深度,应连续安装两个 12 L 的瓶子,间隔约 0.75 m。
  8. 当所有瓶子都安装到绳索上后,将绳索下放到目标深度,并等待 2 分钟。
  9. 释放一个触发器(messenger),并等待几分钟,以确保所有瓶子均已关闭。
  10. 收回绳索,并在瓶子升至甲板架时依次卸下。
  11. 对于需要 20 L 水样用于 DNA 和 RNA 分析的深度,采集两个 Niskin 瓶。其中一个瓶子用于采集化学参数样品(见下文),另一个则排入大容量容器(carboy)中。立即从第二个 Niskin 瓶中采集 RNA 样品。第一个瓶子的剩余水样也排入该容器中,以获得约 20 L 的最终体积。对于低分辨率样品,仅需预留 1 L 水样,用无菌 Nalgene 瓶进行过滤。

第二部分:气体样品采集

  1. 如果需要采集氧气样品,则应首先进行采集。
  2. 将一段细管连接到Niskin/Go-Flo采水器的旋塞上,细管的另一端插入玻璃血清瓶中。
  3. 用待测水样冲洗血清瓶3次,然后将瓶子完全充满,确保无气泡存在。
  4. 加入50μl氯化汞(HgCl2),加样方式应避免向样品中引入气泡。
  5. 用橡胶塞密封瓶子后,再用铝盖压紧封口,随后将样品瓶置于装有冰的冷藏箱中保存。

第3部分:营养样品采集

  1. 60毫升注射器用样品水冲洗,再加入(0.2 μm) 将acrodisc串联连接,并推动部分水通过该装置。
  2. 用约10 ml过滤水将聚乙烯瓶冲洗3次(冲洗时振荡瓶子)。
  3. 过滤后的样品水被加入到瓶子中,约 ¾ 完整。
  4. 样品在冷藏箱中置于冰上保存。

第4部分:氨气样品采集

  1. 用样品水冲洗样品管。
  2. 用样品水将样品管完全充满。
  3. 使用10ml移液器取出5ml样品水;弃去管中剩余的水,将移液器吸头中的5ml样品水重新注入样品管中。
  4. 当所有深度的样品采集完毕后,向每支试管中加入7.5ml铵工作试剂。

第5部分:细胞计数的样品采集

  1. 将一个预先标记的50 ml Falcon离心管(内含5.4 ml 37%甲醛)加液至管顶,使终浓度为4%。操作时注意避免溢出。

第6部分:用于硫化氢测量的样品采集

  1. 将预标记的 50 ml Falcon 管中装满 20% 的乙酸锌(Zn(O2CCH3)2),注意不要洒出。

第7部分:小体积收集用于生物量浓度测定

  1. 将1升的瓶子装满至瓶口。

第8部分:用于生物量浓缩的大体积收集

  1. 装满20升大瓶。

第9部分:代表性结果

海水采样的最终结果包括约12个溶解氧样品、32至48个气体样品、16个营养盐样品、32个铵根样品、16个硫化氢样品、16个用于细胞计数的样品、6个20升大瓶、16个1升瓶,以及4个含有用RNA later保存的微生物生物量的Sterivex 0.22μm滤器。

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讨论

总体而言,此类采样需要大量的准备工作和规划,因此请在出发前预留两天时间整理物品,返回后预留一天时间进行清理。一般情况下,切勿让盐水接触蠕动泵或用于运输野外设备的铝制Zarges箱。妥善使用设备,它们将在未来长时间内保持良好性能。

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披露

作者无任何利益冲突需要披露。

致谢

我们感谢加拿大创新基金会、不列颠哥伦比亚知识发展基金以及加拿大自然科学与工程研究理事会(NSERC)对近海和开阔大洋低氧区域持续研究工作的支持。此外,D.A.W. 获得了来自 NSERC、Killam 以及由 TULA 基金会资助的微生物多样性与进化研究中心提供的博士后奖学金支持。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
20 L 塑料大瓶Fisher Scientific02-960-15
3/8" Tygon 管Cole-Parmer06429-36
Sterivex 滤器Fisher ScientificSVG010RS
预过滤器外壳装置AMD501200
Luer 接头Cole-Parmer31507-27
1/4" Tygon 软管Cole-Parmer06429-24
1/4" Tygon 软管Cole-Parmer06429-24
1/4" Tygon 软管Cole-Parmer06429-24
50 ml 塑料离心管
玻璃血清瓶玻璃样品采集
玻璃血清瓶用隔垫和铝盖
手动压盖器
20–200 µl 移液器及吸头
玻璃试管铵样品采集
30 ml 塑料瓶营养盐样品采集
Acrodisc 滤器EMD Millipore
5 ml 离心管亚硝酸盐样品采集
37% 甲醛试剂用于细胞计数样品
20% 乙酸锌试剂用于硫化物样品
氯化汞试剂用于气体样品
milliQ 水试剂
铵工作试剂试剂硼酸缓冲液、亚硫酸钠、邻苯二甲醛
磺胺酸试剂5 g 溶于 450 ml 水和 50 ml 盐酸
N-(1-萘基)-乙二胺二盐酸盐溶液试剂0.5 g 溶于 500 ml 水

参考文献

  1. Cline, J. D. Spectrophotometric determination of hydrogen sulfide in natural waters. Limnology & Oceanography. 14, 454-458 (1969).
  2. Holmes, R. M., Aminot, A., Kerouel, R., Hooker, B. A., Peterson, B. J. A simple and precise method for measuring ammonium in marine and freshwater ecosystems. Canadian Journal of fisheries and Aquatic Science. 56, 1801-1808 (1999).

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水样采集CTD传感器Niskin采水器Go-Flo采水器痕量气体采样营养盐分析细胞计数生物量过滤RNA纯化