RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
zh_CN
Menu
Menu
Menu
Menu
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
为评估细胞死亡的一种准确的方法是描述。该协议改进传统的膜联蛋白V /碘化丙碘化物(PI)的协议,这显示多达40%的假阳性的细胞株和原代细胞的动物模型的广泛事件。
细胞凋亡的研究有了显着的影响以来,流式细胞仪为基础的方法的引进。碘化丙啶(PI)是广泛用于与Annexin V的结合来确定,如果细胞通过质膜的完整性和通透性1,2差异可行的,凋亡,或坏死。膜联蛋白V / PI协议是一个常用的方法,为研究细胞凋亡3。 PI是,往往比其他核污渍,因为它是经济,稳定和细胞活力的一个良好指标,根据其能力,以排除在活细胞4,5染料。 PI的进入细胞的能力是依赖于细胞膜的通透性; PI不染色居住或早期由于存在一个完整的质膜 1,2,6的细胞凋亡。晚期凋亡和坏死细胞,血浆和核膜的完整性下降 7,8,使PI传递透过膜,插成核酸,并显示红色荧光 1,2,9 。不幸的是,我们发现,传统的膜联蛋白V / PI双协议导致大量的误报事件(高达40%),这是与PI染色的RNA 在细胞质车厢10。原代细胞和细胞株在动物模型的广泛影响,大细胞:显示最高的发生10(核细胞质比率<0.5 )。在这里,我们展示了修改后的膜联蛋白V / PI方法,提供了一个评估与常规方法相比,细胞死亡的显着改善。该协议需要在修复细胞,促进一成以下的染色细胞的RNase进入细胞通透性的变化。的时间和浓度的RNase一个已经优化去除细胞质RNA。结果是比传统的膜联蛋白V / PI协议(<5%,与细胞质PI染色的事件)的显着改善。
执行此过程可在500μL的硅化管或6毫升聚苯乙烯圆底流式细胞仪管。后者通常是与其他程序一起进行可行性分析时使用。所有卷6毫升聚苯乙烯圆底流式细胞仪管。 500μL的硅化管,减少了1 / 5的所有卷。
流式细胞仪分析的最佳浓度为2-4 × 10 6细胞,每200μL体积。细胞的损失可能会导致此过程,因此,我们建议每个样本程序开始在4 × 10 6个细胞组成。
1。细胞制备
2。应用膜联蛋白V / PI染色
3。代表性的成果:
如图1所示,有不同程度的假阳性PI染色的细胞类型和细胞系的例子。要考虑为假阳性事件,细胞固定,然后用RNase A的看待这个结果在假阳性事件的数量显着减少,细胞相比,没有经过核糖核酸治疗(图2B)。图2C显示行核糖核酸治疗的细胞,细胞没有核糖核酸治疗相比,代表图像。图3显示了如何与固定和RNase处理步骤修改后的膜联蛋白V / PI双协议,通过限制假阳性染色事件的数量,提高常规协议。

图1。传统的碘化丙啶染色协议导致大量的误报事件 。,我们曾评估跨越广泛的动物模型,以及在多种细胞系10假跨原代细胞的阳性染色程度。代表的图像显示在三个独特的细胞群(一个常用的细胞株 - RAW巨噬细胞和两个主要的细胞 - 小鼠骨髓巨噬细胞(BMM)的金鱼原发性肾脏巨噬细胞(PKM))的假阳性染色程度。真阳性事件显示核车厢内的预期之间的PI和DRAQ5的合作本地化(黄色区域描绘PI和DRAQ5之间的共定位)。 DRAQ5是高度membraNE渗透性染料,准确污渍核舱在活的和死的细胞 10,11,12 。为了方便视觉决心共定位DRAQ5染色绿色pseudocolour。

图2。提高PI核染色的准确性。 (一)我们评估的PI基于一个良好的特点核污渍的数量(BrdU,7 - AAD和DAPI)的相似性DRAQ5程度的核染色的准确性。 BrdU是一种人工合成的核苷纳入增殖细胞的DNA,因此只会弄脏核车厢内。 7 - AAD有一个高亲和力的DNA,类似为PI,不能跨越一个完整的质膜。的DAPI也有很强的亲和力的DNA,是最常用的核染色荧光显微镜。 BrdU,7 - AAD,DAPI染色和DRAQ5之间的相似程度> 99%,突出自己的能力,准确地在RAW 264.7巨噬细胞的细胞核染色。相比之下,基于传统协议的细胞质PI染色%的染色相对DRAQ5相似的一个显着减少。 (二)观察到类似的结果在两个主要测试细胞:小鼠骨髓巨噬细胞(BMM)的金鱼原发性肾脏巨噬细胞(PKM)。 50微克/毫升核糖核酸酶在染色过程中特定阶段的一个团,消除非核PI染色,显着增加的相似程度相对DRAQ5染色。 (三)原发性肾脏巨噬细胞的具有代表性的图像显示为核糖核酸酶治疗和无细胞的相似程度。为了方便治疗之间的视觉差异的决心,DRAQ5绿色。黄色区域描绘BrdU和DRAQ5,有价证券和DRAQ5之间的共定位。

图3。改性膜联蛋白V / PI显着降低虚假凋亡/坏死事件。小金鱼肾巨噬细胞(PKM)染色与传统的和修改过的膜联蛋白V / PI协议。散点图描述膜联蛋白V / PI双染色金鱼的PKM。左边的散点图显示传统PKM的细胞的膜联蛋白V / PI染色(无核糖核酸)。在右边的散点图显示与修改后的膜联蛋白V / PI双协议(核糖核酸)染色PKM细胞。此外核糖核酸酶中的一个显着减少因假阳性污渍的去除PI染色的结果。 PKM的细胞,然后进行分析的基础上文化早期祖细胞内的不同人群(EP),单核细胞(单声道)和成熟的巨噬细胞(垫MAC)。积极PI事件的数量减少,由于去除误报事件是在大的成熟的巨噬细胞更明显比在较小的早期祖细胞。在传统的协议为基础的结论有误提出一个较为成熟的巨噬细胞亚群的细胞死亡中的积极的关系。
为评估细胞死亡的一种准确的方法是描述。该协议改进传统的膜联蛋白V /碘化丙碘化物(PI)的协议,这显示多达40%的假阳性的细胞株和原代细胞的动物模型的广泛事件。
这项研究是由一个自然科学和工程加拿大(NSERC)的研究资助局和阿尔伯塔省农业资金联盟授予DRB支持。 AMR是通过一个NSERC凡尼尔加拿大研究生奖学金,阿尔伯塔大学的助教和一个英国女王伊丽莎白二世研究生奖学金的支持。
| 1 x PBS - / - | |||
| 1 x 膜联蛋白V结合缓冲液 | BD Biosciences | 556454 | |
| 膜联蛋白V-Alexa Fluor 488 | 分子探针,Life Technologies | A13201 | |
| 化丙啶(PI) | Sigma-Aldrich | P4864 | 1 mg / mL,溶于H2O |
| 2%甲醛 | 中,Sigma-Aldrich | F1268 | |
| 来自牛胰腺的 RNase A | Sigma-Aldrich | R4642 | |
| DRAQ5 | 生物状态 | DR50050 | 在1 x PBS-/- 中以 1:60 稀释 |