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方法文章

高通量 原位 用于表征小鼠胎儿下泌尿生殖道中mRNA表达模式的杂交方法

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DOI:

10.3791/2912

2011年8月19日

本文内容

摘要

在此,我们描述一种高效的高通量方法 原位 原位杂交(ISH)方法用于可视化小鼠胎儿前列腺组织切片中mRNA表达的模式。该方法可轻松适用于可视化其他小鼠组织或其他物种组织中mRNA的表达模式。

摘要

下泌尿生殖道(LUT)的发育是一个复杂的过程。在雄性胎儿尿道形成前列腺的过程中,这种复杂性尤为明显,该过程依赖于雄激素信号以及上皮-间质间的相互作用1,2。了解调控前列腺发育的分子机制,可能揭示在生命后期被异常重新激活的生长机制,从而导致良性前列腺增生和前列腺癌等前列腺疾病的发生。

发育中的泌尿生殖窦(LUT)具有复杂的解剖结构。当前列腺芽体在受孕后16.5天(dpc)开始形成时,已存在多种细胞类型。血管、神经和平滑肌位于间质性间充质中3。该间质包裹着多层上皮,并通过雄激素受体依赖的旁分泌信号诱导胎儿前列腺的形成4。目前尚不完全清楚在前列腺发育过程中,间质中哪些雄激素受体响应基因是必需的,以及前列腺导管上皮如何响应这些基因而形成。精确识别细胞类型并定位其中特定因子的表达,对于进一步理解前列腺发育至关重要。原位杂交(ISH)技术可实现mRNA在组织内的定位。因此,该方法可用于确定信号分子及其受体的表达模式与时间,从而揭示潜在的前列腺发育调控因子。

本文介绍了一种高通量原位杂交(ISH)技术,用于鉴定胎鼠下泌尿生殖道(LUT)中mRNA的表达模式,所用组织切片由振动切片机切割而成。该方法相较于其他ISH方案具有多项优势。在载玻片上进行薄切片ISH在技术上较为困难;冷冻切片常存在组织结构质量差的问题,而冷冻切片和石蜡切片均常导致信号分辨率较弱。对整体组织进行ISH则可能导致探针滞留。相比之下,我们的高通量技术采用厚切片,可清晰显示组织精细结构。经改良的微量离心管便于在ISH过程中对切片进行操作。单个17.5天胎龄(dpc)LUT样本最多可同时筛查4种mRNA转录本,单次实验最多可检测24种mRNA转录本,从而降低成本并提高效率。该方法允许将多个处理组以完全相同的方式作为单一整体进行处理,避免数据分析中的偏差。对于前列腺研究者而言尤为关键的是,该方法可提供胎鼠尿道中低丰度和高丰度mRNA转录本在空间和时间上的精确定位,而尿道正是前列腺导管网络的发育起源。

方案

1. 从PCR生成的模板合成地高辛-11-UTP标记的核糖探针

  1. 为了合成基因特异性核糖探针,使用 Entrez Gene(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez)获取该基因的 cDNA 参考序列(RefSeq)。利用 Primer3 程序(http://frodo.wi.mit.edu/primer3/)5 针对 cDNA 序列的 3’ 区域设计基因特异性 PCR 引物。有关 PCR 引物选择的推荐参数,可参见其他文献(http://www.gudmap.org/Research/Protocols/Vezina/Riboprobe_Syn.html)。
  2. 使用 MegaBLAST 程序(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/seq/BlastGen/BlastGen.cgi?taxid=10090)6 评估所选 DNA 序列的特异性。当使用 0.01 的 EXPECT 阈值时,若该 DNA 序列在 RefSeq 数据库中不与其他序列比对,则认为其具有特异性。
  3. 通过 PCR 扩增核糖探针模板。PCR 反应组分和热循环条件应针对每对引物进行优化。一个典型的 50 μl 反应体系包含:1X 缓冲液、2 mM MgCl2、0.2 mM dNTPs、1X Q 溶液、1 μg cDNA、2.5 U Taq DNA 聚合酶、0.25 μM 引物以及无核酸酶水(nuclease-free H2O)。典型的热循环程序包括:94°C 初始变性 2 分钟,随后进行 40 个循环(94°C 变性 30 秒、57°C 退火 30 秒、72°C 延伸 1 分钟),最后在 72°C 延伸 10 分钟。PCR 反应中使用的 cDNA 是从小鼠泌尿生殖系统 mRNA 反转录合成的。
  4. 通过琼脂糖凝胶电泳分离 PCR 产物,使用凝胶回收试剂盒(Gel Extraction Kit)进行纯化,并通过分光光度法测定纯化产物的浓度。预期产量为 1.2 – 3.6 μg。
  5. 将 PCR 产物转录为标记的核糖探针。转录反应体系(40 μl)包含:400 ng 纯化的 PCR 产物、1X 核苷酸标记混合物(含地高辛标记的 11-UTP)、1X 转录缓冲液、5 U RNase 抑制剂、80 U T7 RNA 聚合酶以及无核酸酶水(nuclease-free H2O)。在 37°C 下孵育 3–4 小时,每 30 分钟轻轻振荡样品一次。
  6. 使用 Qiagen RNeasy Mini 试剂盒,按照柱上 DNase 消化进行 RNA 纯化的说明纯化核糖探针。通过分光光度法定量核糖探针。预期产量为 4–20 μg。通过将部分样品在 1.5% 非变性琼脂糖凝胶上电泳分离,评估探针质量。高质量的探针应呈现清晰条带,无明显拖尾。
  7. 为确保核糖探针能特异性识别其靶标,在首次原位杂交(ISH)实验中应包含阳性对照组织。该阳性对照组织中,核糖探针所针对的 mRNA 表达模式应已知且明确。

2. 振动切片机刀片的制备(基于先前描述的方案)7

  1. 在磷酸盐缓冲液(PBS)中配制4%的低熔点琼脂糖溶液。将溶液微波加热至琼脂糖完全溶解,并维持溶液温度在62°C。
  2. 通过从直径12 mm的Millicell培养板小室插入物上移除膜,制备一个聚苯乙烯环形模具,并保留聚苯乙烯环作为琼脂糖模具使用。每次使用前,将环状模具在RNase抑制剂溶液中浸泡过夜。
  3. 为确保切片表面光滑,使用以下纯溶剂依次冲洗Wilkinson刀片表面,以去除防锈剂及其他添加剂:石油醚、二甲苯、氯仿、甲醇和MilliQ水。将双刃刀片沿长度方向分离为两个单刃刀片。
  4. 使用Loctite胶水将Wilkinson刀片粘附于切片机刀片上。该切片机刀片不用于切割,仅用于增强Wilkinson刀片的刚性。应使用金属剪刀将切片机刀片裁剪至与Wilkinson刀片等长,粘合后使其边缘较Wilkinson刀片的切割刃错开3–4 mm。

3. 泌尿生殖组织的解剖、保存与切片制备

  1. 制备 PBSTw 溶液(含 0.1% Tween™ 20 和 0.2 mM 叠氮化钠的 PBS 溶液,经 0.22 μm Stericup® 滤器过滤)。该溶液可预先配制,并在 25°C 下保存。
  2. 将新鲜解剖的小鼠下泌尿道组织(膀胱、盆腔尿道以及相关的沃尔夫管和缪勒管来源结构)在含 4% 多聚甲醛固定液的 PBS 中,于 4°C 下孵育过夜。
  3. 通过在梯度浓度甲醇/PBSTw(1:3、1:1、3:1 v/v)溶液中于 25°C 洗涤 10 分钟进行组织脱水。将样品在 100% 甲醇中于 –20°C 至少保存过夜。存档组织可在 –20°C 保存至少 2 年。
  4. 通过梯度浓度甲醇/PBSTw(3:1、1:1、1:3 v/v)溶液在 25°C 下洗涤 10 分钟,对存档组织进行再水化,以备切片。
  5. 解剖并弃去约三分之二的膀胱组织,保留大部分三角区与尿道相连。

4. 在琼脂糖中包埋泌尿生殖组织

  1. 将聚苯乙烯环形模具平的一面朝下放置在 25°C 的普通玻璃显微镜载玻片上。
  2. 用 62°C 的琼脂糖溶液填充环形模具,并冷却约 2 分钟。
  3. 从 PBSTw 中取出 LUT 组织,并用吸水纸轻轻吸干。
  4. 将组织转移至琼脂糖溶液中。
  5. 使用镊子调整 LUT 组织在琼脂糖中的方向,使其悬浮于环形模具顶部与底部之间的中间位置,并在 4°C 下孵育,直至琼脂糖完全凝固。
  6. 若在琼脂糖凝固过程中组织完全下沉,可将其从琼脂糖中切出并重新包埋;在重新包埋过程中,可根据需要调整琼脂糖的冷却时间。

5. 使用振动切片机对泌尿生殖组织进行切片(基于先前描述的方案)7

  1. 将加强型Wilkinson刀片安装到振动切片机上,并将刀片角度设置为 35°将PBS加入豪华型标本浴槽中,并在浴槽周围放置湿冰。
  2. 从环形模具中取出凝固的琼脂糖凝胶块,并用吸水纸擦拭其底面。确认组织方向正确。若需调整组织方向,可用剃刀刀片对琼脂糖凝胶块的平直边缘进行斜切以校正方向。
  3. 将琼脂糖凝胶块用Loctite胶水粘附到振动切片机样品安装盘上,如图所示 图 1A.
  4. 将样本固定盘插入振动切片机中。
  5. 调节切片机切片厚度至 50μm,将速度调至2,刀片振幅调至4,开始切片。
  6. 使用钝头镊子转移每一片组织切片(图 1B) 加入含有 0.5 mL 冰冷 PBSTw 的 24 孔细胞培养板孔中。
  7. 为准备样品 原位 杂交后,切去每个组织切片周围的大部分琼脂糖(剩余的琼脂糖将在原位杂交过程中融化),并清除所有相关碎片。切片可在48小时内储存 4°C 在 PBSTw 中。

6. 样品篮制备 原位 杂交

  1. 在微量离心管的100μL刻度处剪去管底。
  2. 将剪切后的管边缘置于火焰中加热,直至塑料软化,然后将微量离心管牢固地压在一块直径0.5英寸的聚酯网片中心。
  3. 修剪多余的网片,并使用加热的18号针头在每个管盖上穿刺两个孔,以完成篮式装置的制备(图1C)。
  4. 取下24孔板的盖子,并在每孔正上方中心位置钻一个直径12mm的孔。在原位杂交(ISH)实验流程的洗涤步骤之间,使用该盖子转移样品篮(图1D)。

7. 胚胎粉末制备 原位 杂交(基于先前描述的方案)8

  1. 采集与待检测组织切片相同发育阶段的小鼠胚胎组织,于 –80°C 保存。将冷冻组织放入陶瓷研钵中,浸入液氮,用研杵研磨成细粉。
  2. 将胚胎粉末与 4 倍体积的丙酮混合,使用玻璃匀浆器(Dounce 匀浆器)反复匀浆数次。
  3. 将匀浆液转移至 15 mL 玻璃螺口瓶中,于 4°C 过夜提取。
  4. 在 4°C 下以 5000 rpm 离心 10 分钟,沉淀胚胎粉末。移除并弃去含脂质的上清液。将组织沉淀用 4 倍体积的新鲜丙酮重悬,并于 4°C 提取 2 小时。
  5. 在 4°C 下以 5000 rpm 离心 10 分钟,再次沉淀胚胎粉末。移除并弃去上清液。
  6. 将沉淀物置于 #2 Whatman 滤纸上空气干燥。研碎沉淀物以获得细粉,置于密封良好的玻璃瓶中,4°C 保存。每克胚胎湿重可获得约 50 mg 粉末。

8. 原位 杂交第一天

  1. 将预杂交液(50% 甲酰胺、5x SSC、1% 封闭试剂、10μg/mL 酵母 tRNA、10μg/mL 肝素,储存于 -20°C)预热至 60.5°C。该溶液可预先配制并储存于 -20°C。
  2. 通过在小型塑料储存容器中加入约 0.5 英寸的自来水,制备加湿的杂交室。盖上容器并预热至 60.5°C。
  3. 向 24 孔培养板的孔中加入 2mL PBSTw。将样品篮置于 24 孔板盖的孔洞中,并将组织切片转移至篮中(每个篮中最多可放置 10 片切片)。
  4. 在含 6% H2O2 的溶液中,25°C 下孵育组织切片 30 分钟。此步骤及后续所有孵育步骤均应在旋转摇床上轻柔振荡进行,除非另有说明。所有孵育和洗涤均在 24 孔板中进行,每孔使用总体积为 2mL 的溶液。
  5. 用 PBSTw 在 25°C 下洗涤组织切片,每次 5 分钟,共洗涤 4 次。
  6. 在含 5μg/mL 蛋白酶 K 的 PBSTw 中,25°C 下孵育组织切片 12 分钟。
  7. 用 PBSTw 在 25°C 下洗涤组织切片 1 次,每次 5 分钟。
  8. 在含 4% 多聚甲醛和 0.2% 戊二醛的 PBS 中,25°C 下对组织切片进行后固定 20 分钟。
  9. 用 PBSTw 在 25°C 下洗涤组织切片 2 次,每次 5 分钟。
  10. 每孔加入 2mL 预热的预杂交缓冲液,并将组织切片置于加湿的杂交室中,在 60.5°C 下孵育至少 1 小时。
  11. 在每孔的预杂交缓冲液中加入 0.65μg 标记的核糖探针,并将组织切片在加湿的杂交室中于 60.5°C 下过夜孵育。

9. 原位 杂交第2天

  1. 准备以下用于杂交后洗涤步骤的溶液:溶液 1(50% 甲酰胺,5× SSC,1% SDS)、溶液 2(10 mM Tris-HCl pH 7.5,0.5 M NaCl,0.1% Tween™ 20,0.2 mM 叠氮化钠,0.22 μm 滤过)和溶液 3(2× SSC,50% 甲酰胺)。这些溶液可预先配制。溶液 1 和溶液 3 储存于 -20°C,溶液 2 储存于 25°C。溶液储存寿命至少为 3 个月。
  2. 用预热的溶液 1 在 60.5°C 下对组织切片进行 3 次,每次 30 分钟的洗涤。洗涤过程中使用加湿孵育盒。
  3. 用预热的溶液 1 与溶液 2 按体积比 1:1 混合的溶液在 60.5°C 下对组织切片进行 1 次 10 分钟的洗涤。洗涤过程中使用加湿孵育盒。
  4. 用溶液 2 在 25°C 下对组织切片进行 4 次,每次 10 分钟的洗涤。
  5. 在含 0.25 μg/mL RNase 的溶液 2 中,于 37°C 孵育组织切片 15 分钟。
  6. 用不含 RNase 的溶液 2 在 25°C 下对组织切片进行 1 次 10 分钟的洗涤。
  7. 用溶液 3 在 25°C 下对组织切片进行 1 次 10 分钟的洗涤,随后在 60.5°C 下用溶液 3 进行 2 次,每次 1 小时的洗涤。60.5°C 洗涤过程中使用加湿孵育盒。
  8. 准备以下用于 DIG 标记的核糖探针免疫组织化学检测的溶液:组织封闭缓冲液(TB,1× TBS,10% 羊血清,1% 封闭试剂,1% BSA,0.1% Tween™ 20,0.22 μm 滤过)、抗体稀释缓冲液(AD,1× TBS,5% 羊血清,1% 封闭试剂,1% BSA,0.1% Tween™ 20,0.2 mM 叠氮化钠,0.22 μm 滤过)、抗体吸附缓冲液(AA,1× TBS,5% 羊血清,1% 封闭试剂,1% BSA,6 mg/mL 胚胎粉)和 TBSTw(1× TBS,0.1% Tween™ 20,0.2 mM 叠氮化钠,0.22 μm 滤过)。这些溶液可预先配制。TBSTw 储存于 25°C,其余所有溶液均储存于 -20°C。
  9. 用 TBSTw 在 25°C 下洗涤 3 次,每次 10 分钟。
  10. 将组织切片在 TB 缓冲液中于 25°C 孵育至少 2 小时。
  11. 在组织切片于 TB 缓冲液中孵育的同时,每 200 μL AA 缓冲液中加入 1.1 μL 抗 DIG 抗体。将 AA 缓冲液加抗体混合物于 4°C 孵育至少 2 小时,然后以 10,000 rpm 离心 1 分钟。弃去上清液,将上清液转移至 2 mL AD 缓冲液中。
  12. 将组织切片从 TB 缓冲液中取出,置于含抗体的 AD 缓冲液中,在加湿孵育盒中于 4°C 过夜孵育。

10. 原位 杂交第3天

  1. 配制显色液 NTMT(100 mM Tris-HCl pH 9.5,100 mM NaCl,50 mM MgCl2,0.2 mM 叠氮化钠,0.22 μm 滤膜过滤)。该溶液可预先配制,并在 25°C 下保存。使用前立即加入 2 mM 左旋咪唑和 0.1% Tween™ 20。
  2. 从孔中移除抗体溶液(AD 缓冲液 + 抗体),并将溶液储存于 4°C。该溶液最多可重复使用两次。
  3. 在含 2 mM 左旋咪唑的 TBSTw 中,于 25°C 下洗涤组织 8 次,每次 10 分钟。
  4. 小心将组织从篮子中转移至含有 TBSTw 的培养皿中。用镊子去除可见杂质,再将组织转移至洁净的微量离心管中。
  5. 用 1 mL NTMT 在 25°C 下洗涤组织一次,持续 10 分钟。
  6. 吸除 NTMT,每管加入 1 mL 含 50% NTMT(含 2 mM 左旋咪唑)和 50% BM Purple 的混合液,将离心管置于避光盒中,于 25°C 孵育。显色时间从数小时至数天不等。若显色缓慢,可使用 100% BM Purple。
  7. 监测显色进程,若溶液中出现沉淀晶体或颜色由黄色变为紫色,则更换 NTMT/BM Purple 溶液。完全显色后(4–250 小时),用每管 1 mL 含 2 mM 左旋咪唑的 NTMT 在 25°C 下洗涤组织 2 次,每次 5 分钟。
  8. 在含 4% 多聚甲醛后固定液的 PBS 中,每管加入 1 mL,于 4°C 过夜孵育组织。
  9. 为漂白组织,将组织在含 3% H2O2 的 PBSTw 中,每管加入 1 mL,于 25°C 孵育 30 分钟。然后在含 1 mL PBSTw 的离心管中,于 25°C 洗涤组织一次,持续 10 分钟,并将组织储存在含 4% 多聚甲醛后固定液的 PBS 中,每管 1 mL,于 4°C 保存。
  10. 将组织切片封片于载玻片上,加盖盖玻片,使用复式显微镜成像。

11. 代表性结果:

LUT 组织在琼脂糖中的空间方向决定了组织切片的切面。对于矢状切面,需切除至少三分之二的膀胱,将剩余的 LUT 组织包埋于琼脂糖中,使尿道中线与琼脂糖块的平坦表面平行(图 1A)。可通过倾斜琼脂糖块的平坦边缘对组织切面进行微调。图 1B 展示了按此方向定位的 17.5 天胚胎期(17.5dpc)雄性 LUT 组织的一个代表性矢状切面。

在为期多天的原位杂交(ISH)实验过程中,样本篮可保护精细的组织切片,避免样本丢失以及灰尘和颗粒物的沉积。图1C 所示,通过将聚酯网膜熔接到1.5 mL 微离心管的切口端制备样本篮。每个样本篮的管盖上均穿刺一个小孔,以促进溶液流入和流出样本篮。将样本篮置于经改造的24孔板盖上所钻的12 mm 孔中,使其悬浮于ISH溶液中(图1D)。在更换溶液并转移样本篮至不同24孔板时,经改造的板盖可提供支撑。

在检测低丰度 mRNA 所需的长时间孵育过程中,限制非特异性背景染色具有挑战性。在样本缓冲液中添加 0.2 mM 叠氮化钠,并随后通过 0.22 μm 滤器过滤,似乎能够降低背景染色(图 2)。采用本文所述方法,在显色发育溶液中长时间孵育样本时,背景染色未出现明显可见的差异(图 3)

静态平衡;含培养皿、移液器吸头和试管架的装置;实验示意图。
图 1. 小鼠下泌尿生殖道(LUT)组织切片及用于原位杂交(ISH)的微量离心管篮的制备。包含部分膀胱、盆腔尿道以及来源于沃尔夫管和缪勒管结构的LUT组织被包埋于圆柱形的4%低熔点琼脂糖凝胶中。(A)将凝胶块粘附于样品固定盘上,并(B)使用振动切片机切成50 μm厚的切片。(C)将LUT组织切片转移至微量离心管篮中,该管篮通过在管盖上打孔,并将聚酯网膜固定于管底切割端制备而成。(D)将微量离心管插入24孔板盖上钻出的12 mm孔中,以便在ISH实验过程中使组织切片悬浮于缓冲液中。箭头指示琼脂糖凝胶块中的LUT组织位置。

组织切片的组织学比较;A:过滤的 NaAz 缓冲液,B:未过滤的,箭头指示变化。
图2. 加入0.2 mM叠氮化钠 0.22μm 过滤后的溶液可提高组织质量并减少背景染色。17.5天孕龄(dpc)雄性小鼠下泌尿生殖道(LUTs)沿矢状面切片,厚度为 50μm组织切片采用针对 twist 同源物 1 的探针通过原位杂交(ISH)进行染色。ISH 实验中使用的缓冲液为 (A) 0.22μm 过滤并添加0.2 mM叠氮化钠(NaAz),或(B)未过滤且未添加NaAz。箭头指示背景染色。图像以相同放大倍数拍摄。结果为代表性的染色模式 n = 3 只与胎次无关的小鼠

原位杂交结果;Esrrg、Baz2a、Wnt10a 基因表达;示意图;胚胎发育
图3. 背景染色强度似乎不会随着显色时间的延长而增强。17.5天孕龄雄性小鼠的下泌尿生殖道(LUTs)被切成矢状面切片,厚度为 50μm. 采用原位杂交(ISH)对切片进行染色,使用识别高丰度转录本雌激素相关受体γ(estrogen-related receptor gamma)的探针,在(A)9.5小时的显色染色液孵育条件下进行染色Esrrg使用可识别中等丰度转录本溴结构域邻近锌指结构域 2A 的探针Baz2a),或使用识别低丰度转录本wingless-type MMTV整合位点家族成员10a(Wnt10a)的探针处理236小时(C)Wnt10a)。图像在相同的放大倍数下采集。结果为代表性的染色模式 n = 3 只与胎次无关的小鼠

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讨论

采用此处描述的方法,可以在胎鼠泌尿生殖道(LUT)的所有主要细胞类型和组织区室中检测mRNA,包括间充质垫、尿路上皮、平滑肌、前列腺芽、射精管以及阴道。本方案使用的50μm切片具有以下优势:厚度足以分辨组织结构(如血管),同时又足够薄以避免探针滞留,而探针滞留是整体原位杂交(whole-mount ISH)中常见的方法学问题。每种新合成的核糖探针都会在阳性对照组织上进行评估,这些组织的染色结果已在先前发表的研究中得到验证。我们确保在这些组织中观察到的染色模式具有特异性。本方法的另一优势在于,可对同一LUT组织的相邻切片进行多种mRNA表达模式的分析。此外,该方法可与免疫组织化学技术联用,以可视化特定细胞的蛋白标志物,并识别原位杂交(ISH)染色所标记的细胞类型。该方法不适用于传统的复染方法,例如使用Fast Red或苏木精进行细胞核复染。然而,我们已成功使用荧光细胞核染料对样本进行复染,包括4',6-二脒基-2-苯基吲哚(DAPI)和碘化丙啶(propidium iodide)。

本文所述方法相较于先前描述的方法7有多项改进。当前文稿中几乎所有缓冲液和试剂储备...

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披露

未声明任何利益冲突。

致谢

作者谨此感谢新泽西癌症研究所的 Lan Yi 博士在制备组织篮过程中提供的技术支持。本研究由美国国立卫生研究院基金 DK083425 和 DK070219 资助。

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材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
抗地高辛抗体,Fab 片段罗氏集团11214667001
封闭剂罗氏集团11096176001
BM 紫色 AP 底物,沉淀型罗氏集团11442074001
牛血清白蛋白Fisher ScientificBP1600-100
24孔细胞培养板Corning3524
地高辛-11-UTP罗氏集团1277073910
dNTPs罗氏集团11969064001
双面剃须刀片Wilkinson Sword经典模型
Eliminase RNase 去除剂Decon Laboratories1102
甲酰胺Sigma-AldrichF5786-1L
凝胶回收试剂盒Qiagen28704
戊二醛,25% 水溶液2OSigma-AldrichG6257-100ML
肝素钠盐Sigma-AldrichH3393
过氧化氢,30% 水溶液2OFisher ScientificBP2633-500
左旋咪唑Sigma-AldrichL9756
Loctite 404 快干瞬干胶Henkel Corp46551
氯化镁Fisher ScientificM33-500
马来酸Sigma-AldrichM0375-500G
1.5 mL 微量离心管Biologix 研究公司BP337-100
Millicell 培养板插件EMD MilliporePICM01250
分子研磨树脂G-Biosciences786-138PR
4% 多聚甲醛磷酸盐缓冲液溶液Affymetrix19943
磷酸盐缓冲液,不含 Ca && MgMP BiomedicalsICN1760420
聚酯网,33 微米,12" × 24"Small Parts, Inc.CMY-0033-D
蛋白酶K溶液,20 mg/mlAmrescoE195-5ML
QIAshredder 离心柱Qiagen79654
Q溶液Qiagen提供Taq DNA聚合酶
RNaseSigma-AldrichR6513
RNase 抑制剂罗氏集团03335399001
RNeasy mini试剂盒Qiagen74104
RNEASY mini试剂盒Qiagen74104
RQ1 无RN酶的DNasePromega Corp.M6101
SeaPlaque 低熔点琼脂糖Lonza Inc.50101
羊血清Sigma-AldrichS2263-500mL
Stericup 滤器,0.22μ米,聚醚砜,500毫升EMD MilliporeSCGPU05RE
叠氮化钠,颗粒状Fisher ScientificS227I-100
氯化钠Fisher ScientificBP358-212
十二烷基硫酸钠Fisher ScientificS529-500
SSC,20倍浓度溶液Research Products International Corp.S24022-4000.0
SuperScript III 第一链合成系统Invitrogen18080-051
T7 RNA聚合酶罗氏集团10881767001
Taq DNA聚合酶Qiagen201203
Tris-HClFisher ScientificBP153-1
Tween 20Fisher ScientificBP337-100
配备豪华型标本槽的振动切片机徕卡显微系统VT1000A
酵母tRNA罗氏集团109495

参考文献

  1. Cunha, G. R. The possible influence of temporal factors in androgenic responsiveness of urogenital tissue recombinants from wild-type and androgen-insensitive (Tfm) mice. Journal of Experimental Zoology. 205, 181-181 (1978).
  2. Cunha, G. R. Hormonal, cellular, and molecular regulation of normal and neoplastic prostatic development. Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology. 92, 221-221 (2004).
  3. Price, D. Comparative aspects of development and structure in the prostate. National Cancer Institute Monographs. 12, 1-1 (1963).
  4. Cunha, G. R. Stromal-epithelial interactions--I. Induction of prostatic phenotype in urothelium of testicular feminized (Tfm/y) mice. Journal of Steroid Biochemistry. 14, 1317-1317 (1981).
  5. Rozen, S. Primer3 on the WWW for general users and for biologist programmers. Methods in Molecular Biology. 132, 365-365 (2000).
  6. Zhang, Z. A greedy algorithm for aligning DNA sequences. Journal of Computational Biology. 7, 203-203 (2000).
  7. Vezina, C. M. Dioxin causes ventral prostate agenesis by disrupting dorsoventral patterning in developing mouse prostate. Toxicological Sciences. 106, 488-488 (2008).
  8. Wilkinson, D. G. Detection of messenger RNA by in situ hybridization to tissue sections and whole mounts. Methods in Enzymology. 225, 361-361 (1993).

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