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用于外周血和脐带血T细胞基因修饰的Sleeping Beauty及人工抗原呈递细胞的临床应用

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DOI:

10.3791/50070

2013年2月1日

本文内容

摘要

在我们首次进行的人体基因治疗临床试验中,将表达靶向CD19的嵌合抗原受体(CAR)的T细胞作为B细胞恶性肿瘤的试验性治疗手段。本文描述了利用Sleeping Beauty(SB)系统对T细胞进行遗传修饰,以导入靶向CD19的CAR,并在设计的CD19阳性人工抗原呈递细胞上实现选择性扩增。

摘要

通过将基因治疗与免疫治疗相结合,可改进临床级T细胞的效能,从而构建出一种具有更优生物学特性的生物制品,其潜力体现在:(i) 对肿瘤相关抗原(TAAs)的识别能力增强,(ii) 输注后在体内持久存续,(iii) 向肿瘤部位迁移的潜力提升,以及 (iv) 在肿瘤微环境中重复发挥效应功能的能力。目前大多数用于人类临床应用的T细胞基因改造方法,均采用逆转录病毒和慢病毒载体以实现嵌合抗原受体(CAR)的稳定表达。1-3此方法虽然符合现行药品生产质量管理规范(GMP),但由于依赖少数生产设施来制备和放行临床级重组病毒,成本较高。非病毒质粒的电转导作为一种替代转导的方案具有吸引力,因为DNA可在临床级生产中的成本约为前者的十分之一th 重组GMP级病毒的成本。为了提高整合效率,我们进行了改进 睡美人 用于人类应用的 (SB) 转座子与转座酶4-8我们的SB系统使用两种DNA质粒,其中一种转座子编码目的基因(例如 2nd 第二代CD19特异性CAR转基因(指定为CD19RCD28)和一种转座酶例如 SB11)可将外源基因插入TA双核苷酸重复序列中9-11为了获得满足临床需求数量的基因修饰T细胞,我们使用经改造以表达肿瘤相关抗原(TAA)的K562细胞系衍生的人工抗原呈递细胞(aAPC)(克隆#4)。例如 CD19,以及T细胞共刺激分子CD86、CD137L、膜结合型白细胞介素(IL)-15(与修饰的IgG4 Fc区融合的肽段)和CD64(Fc-γ受体1),用于负载单克隆抗体(mAb)12在本报告中,我们展示了在符合cGMP条件下生成靶向CD19的CAR的可执行操作步骤+ 适用于人体应用的T细胞。通过同步电转染两个DNA质粒——SB转座子(CD19RCD28)和SB转座酶(SB11),随后在可溶性重组人IL-2和IL-21存在条件下,每隔7天添加γ射线照射的aAPC(克隆#4)以刺激细胞,从而筛选获得稳定整合子13通常需要进行4个周期(连续培养28天),以获得具有临床应用前景数量的稳定表达CAR的T细胞。该制备临床级CD19特异性T细胞的方法可应用于外周血(PB)或脐带血(UCB)来源的T细胞。此外,通过将导入的CAR特异性与aAPC上由CAR识别的TAA表达相匹配,该策略还可用于生成针对多种肿瘤类型的T细胞。

方案

第0天或之前

1. 从外周血和脐带血中分离单个核细胞(MNC)

  1. 用等体积的PBS-EDTA稀释PB,用四倍体积的PBS-EDTA稀释UCB。
  2. 将稀释后的血液(25 ml)缓慢铺加到50 ml离心管中的Ficoll(12 ml)上,以400 × g离心30–40分钟(不使用刹车)。
  3. 使用移液管收集并转移单个核细胞层(界面层)至新的50 ml离心管中。
  4. 用PBS-EDTA补总体积至50 ml,以450 × g离心10分钟。
  5. 吸除上清液,轻轻将细胞沉淀重悬于50 ml完全培养基(CCM)中,再以400 × g离心10分钟。
  6. 轻轻重悬细胞沉淀,并合并至CCM中,使用台盼蓝排斥法进行细胞计数(Cellometer,PBMC程序)。
  7. 此时单个核细胞可用于电穿孔(Nucleofection)或冻存以备后续使用。

第0天用于电穿孔的T细胞制备

  1. 若使用冻存的单个核细胞(MNC),请在37 °C水浴中快速解冻足够用于全规模电穿孔的细胞量(2 × 108,额外增加约20%以补偿离心和2小时孵育过程中的细胞损失)。若使用新鲜分离的MNC,则直接进行步骤2.3。
  2. 轻柔重悬细胞,并转移至适当大小的离心管中,加入预热的无酚完全RPMI培养基(PF-RPMI),在200 × g条件下离心10分钟(不启用刹车),吸除上清液。
  3. 用PF-RPMI重悬MNC,进行细胞计数(Cellometer),并将细胞以106 个细胞/mL的浓度转移至适当大小的细胞培养容器中。
  4. 在37 °C、5% CO2的加湿培养箱中孵育2小时±30分钟。
  5. 将MNC转移至无菌离心管中,在200 × g条件下离心5分钟(不启用刹车),吸除上清液,轻柔重悬并合并细胞沉淀于PF-RPMI中。
  6. 进行细胞计数(Cellometer),计算所需细胞悬液的体积(2 × 108 MNC)。
  7. 将计算好的体积转移至无菌50 mL离心管中,在200 × g条件下离心10分钟(不启用刹车)。
  8. 吸除上清液,确保无残留培养基,通过轻敲管壁的方式轻柔重悬细胞。

3. 第0天对单个核细胞(MNC)进行电穿孔(核转染)(使用10个比色皿的完整流程)

  1. 在湿润的 37 °C/5% CO2 培养箱中,预先将无菌的 12 孔板(含 10 个孔,每孔加入 4 ml 温热的 PF-RPMI)进行预孵育。
  2. 在生物安全柜(BSC)中,将 Lonza Nucleofector 人 T 细胞试剂盒溶液(按制造商说明重悬,www.lonza.com)恢复至室温。
  3. 制备 Nucleofector 溶液/DNA 主混合液:每个反应/电转杯中加入 100 μl 添加物的 Nucleofector 溶液、15 μg 转座子(指定为 CD19RCD28/pSBSO 的超螺旋 DNA 质粒)和 5 μg 转座酶(指定为 pCMV-SB11 的超螺旋 DNA 质粒)。
  4. 轻轻敲击离心管侧壁使细胞沉淀(来自步骤 2.8)充分分散,并重悬于 Nucleofection 溶液/DNA 主混合液中(最终细胞浓度:2 × 107 个细胞/100 μl)。
  5. 小心将 100 μl 细胞悬液(来自步骤 3.4)转移至十个(10)Lonza Nucleofection 电转杯中,注意避免产生气泡。
  6. 轻敲电转杯一次,使用程序 U-014(适用于未刺激的 T 细胞)进行电穿孔。
  7. 将电转杯和 12 孔板(步骤 3.1)转移至生物安全柜(BSC)中。
  8. 使用 Amaxa 细尖转移移液器,从每个电转杯中收集电穿孔后的细胞:加入约 500 μl 来自对应孔(步骤 3.1 准备的 12 孔板)的预温培养基,然后将 12 孔板放回湿润的 37 °C/5% CO2 培养箱中孵育 2 小时 ± 30 分钟。
  9. 孵育 2 小时后,收集并转移所有孔中的细胞至无菌离心管中。
  10. 在室温下以 140 × g 离心 8 分钟(不启用刹车),洗涤细胞,吸除并弃去上清液,确保细胞沉淀上无残留培养基。
  11. 轻轻敲击离心管侧壁使细胞沉淀分散,并轻柔重悬于 CCM 中,以获得单细胞悬液。
  12. 进行细胞计数,并用 CCM 调整细胞浓度至 106 个细胞/ml。
  13. 将细胞悬液转移至细胞培养瓶中,并置于培养箱中过夜培养。
  14. 对对照组(EGFP 转染细胞)重复执行步骤 2.1 至 3.8:每电转杯使用 5 × 106 个细胞和 5 μg Amaxa 对照 EGFP 超螺旋质粒(pmaxGFP)。

第1天(共1天)st 及后续刺激周期

第1天通过流式细胞术分析CAR表达

  1. 收集电穿孔后的细胞,使用台盼蓝排斥法(血细胞计数板)进行细胞计数。
  2. 用针对 CD3、CD4、CD8 和人 IgG Fcγ 的特异性抗体对细胞(1 至 2 × 106)进行染色(用于检测 CAR 表达水平)。
  3. 在 FACS Calibur 仪器上获取细胞,并使用 FCS Express 软件分析数据以计算 CAR 表达量。
    1. 通过以下公式计算培养物中 CAR+ 细胞数量:
      (总活细胞数)×(CAR+ 细胞百分比)= CAR+ 细胞数

第1天aAPC(克隆#4)的制备。aAPC(克隆#4)由K562细胞(亲本细胞系购自美国模式培养物集存库)衍生而来,用于共表达所需T细胞共刺激分子

  1. 在37 °C水浴中解冻一份冷冻的100 Gy辐照aAPC等分试样。
  2. 将细胞在CCM中以400 × g离心10分钟,洗涤两次,并使用Cellometer(台盼蓝排斥法)进行计数。
  3. 计算刺激所需的活aAPC数量:
    (CAR+细胞数)× 2 = 所需辐照aAPC数

6. aAPC介导的CAR刺激+ 第1天开始时的T细胞st 及后续刺激周期

  1. 在无菌容器中,将电穿孔后的细胞(表达CAR)与γ射线照射的aAPC(克隆#4)按1:2的比例(CAR+细胞:活aAPC)在CCM中混合。
    1. 注意 aAPC的比例需根据电穿孔后第二天流式细胞术检测的CAR表达水平进行调整。
  2. 向细胞悬液中加入IL-21(30 ng/ml)。
  3. 以106个细胞/ml的浓度分装至T-75 cm2培养瓶和/或Vue Life Culture袋中,并放回培养箱。

第3天、第5天

7. CAR+ T 细胞的持续培养

  1. 进行半量换液,补充IL-21,并将T细胞维持在106 个细胞/ml的浓度。

第7天

8. 第一轮人工抗原呈递细胞介导的刺激周期结束

  1. 收集细胞,计数并进行 CD3、CD4、CD8 和 Fcγ(CAR)染色,然后进行步骤 10.1。

9. 耗竭 CD56+ 细胞(通常在电穿孔后 7 至 14 天之间)

  1. 如果 CD56+CD3neg 淋巴细胞 ≥ 10%,则使用磁性微珠进行 CD56 耗竭。

刺激周期 #2、#3 和 #4 分别对应第 8 天 → 14 天、第 15 天 → 21 天以及第 22 天 → 28 天

10. 通过递归添加aAPC扩增T细胞至临床所需数量

  1. 按照步骤 4.3-8.1 中所述,重复刺激过程(4 次)。
  2. 从第 7、14 和 21 天开始,在每次更换培养基时(每周三次,按周一-周三-周五的时间表)向培养物中添加 IL-2(50 U/ml)。
  3. 根据需要冷冻保存(存档)多余的 T 细胞。
    1. 使用程序降温仪冷冻 T 细胞。

第28天

11. 最后一轮aAPC介导的刺激周期结束:收获T细胞

  1. 对T细胞进行冷冻保存,用于放行检测和输注。

结果

我们报道,通过电转染DNA质粒并将T细胞在γ射线照射的aAPC上扩增,可生成适用于临床的人源外周血(PB)和脐带血(UCB)来源T细胞的数量。这些经基因修饰的T细胞表达导入的CAR,可识别与主要组织相容性复合体无关的肿瘤相关抗原CD19。用于表达(i)转座子的SB来源DNA质粒,一种2nd 第二代CAR(CD19RCD28),通过CD28和CD3-ε传递信号14,以及(ii)转座酶SB1115,此前已有描述13,16,17本研究中使用的质粒由Waisman临床生物制造中心(Madison, WI)商业生产。aAPC(克隆#4)源自K562细胞(亲本细胞系购自美国模式培养物集存库),共同表达所需T细胞共刺激分子(每种引入的分子均在 390%(如前所述,在aAPC细胞表面)12在此,我们展示了可通过SB转座技术将CAR导入来自外周血(PB)或脐带血(UCB)的单个核细胞(MNC),再添加人工抗原呈递细胞(aAPC),以CAR依赖的方式扩增CD19特异性T细胞图1、图4)13,18. 十个比色皿(2x107 每位受体使用 MNC/比色皿进行电穿孔处理 15 μg 编码转座子(CAR)的DNA质粒(CD19RCD28/pSBSO) 5 μg 编码转座酶(SB11)的DNA质粒(pCMV-SB11)。若单个核细胞(MNC)数量有限,或为适应实验室工作规模,可减少电穿孔所用比色皿的数量。电穿孔当天定义为刺激周期#1的“第0天”。作为流式细胞术和培养条件的对照,自体T细胞进行模拟电穿孔处理(不加DNA质粒),并在预先负载OKT3抗体以交联CD3、从而维持T细胞增殖的γ射线照射过的aAPC(克隆#4)上进行数量扩增。我们通常在电穿孔后的第二天评估电转效率及T细胞的存活率。图2B)。对照DNA质粒(命名为pmaxGFP)和CAR在该初始时间点的EGFP表达反映了整合型和游离型质粒的蛋白表达。通常,电穿孔后第二天,EGFP表达率约为60%,CAR表达率约为40%(图2A) T细胞存活率为40-50%。在存在可溶性重组人IL-2和IL-21的条件下,反复添加γ射线照射的aAPC,可获得稳定表达CAR(CD19RCD28)的T细胞。CD3阴性CD56+ 若培养物中NK细胞比例≥10%,尤其是T细胞上CAR表达比例较低时,应使用特异性针对CD56的顺磁性微珠去除NK细胞。该步骤可防止NK细胞快速过度生长,从而避免其干扰aAPC维持CAR T细胞增殖的能力。+ T细胞。偶尔,从CAR中耗竭NK细胞+ 在最后两个刺激周期中进行T细胞操作,但由于部分CAR细胞共表达CD56,会导致目标细胞的损失+ T细胞。在共培养的第14天之后,T细胞在功能封闭系统中使用Vue Life培养袋进行培养。通常在共培养的第14天或第21天(即第二轮或第三轮刺激周期结束时),将一部分经基因修饰并扩增的T细胞冷冻保存,作为未来分析的存档材料,并在后续生产工艺中出现意外问题时用于复苏。T细胞通常在培养第28天左右收获。图3)中常规表达 >90% CAR 且为 >80% 存活率(图2C,D). 我们先前已证明,在aAPC上共培养四周后,CD3+ T细胞的平均扩增倍数为19,800±11,313(携带CAR)+ 表达率为 90%±7.5 13这些T细胞经过冷冻保存,并接受生产过程中的检测和放行检测,以评估所制备产品的安全性和治疗潜力。放行检测依照临床实验室改进修正案(CLIA)的要求进行,以在临床试验受试者回输前出具分析证书。

CAR T细胞制备流程图;CD3/CD28转座子激活,细胞因子添加。
图1. 从外周血(PB)和脐带血(UCB)中电穿孔并扩增CAR+ T细胞的步骤示意图。 点击此处查看高清大图

流式细胞术分析图;GFP、FSC-H 图谱;CAR 表达数据图,CD3、CD4、CD8 结果。
图 2. 外周血来源基因修饰 T 细胞的表征。(A) 首次刺激周期第 0 天 EGFP 的表达,用于评估基因转导效率。(B) 电穿孔后约 24 小时及 (C) 在 aAPC 上共培养 28 天后,通过流式细胞术检测 CD3+、CD8+ 和 CD4+ T 细胞中 CD19 特异性 CAR(CD19RCD28)的表达。在脐带血来源的 T 细胞中也观察到类似的 CAR 表达。(D) CAR 表达的动力学变化。 点击此处查看高清大图

细胞生长曲线;推断的细胞数量与共培养天数的关系;CD3、CAR刺激分析。
图3. 外周血来源的CAR+ T细胞的扩增。 外周血来源的CD3+ 和CAR+ T细胞在γ射线照射的aAPC存在下,联合重组人源可溶性IL-2和IL-21反复共培养后的数量扩增速率。向上的箭头表示添加γ射线照射的aAPC,标志着每一轮刺激周期的开始。脐带血来源的CAR+ T细胞表现出类似的扩增速率。

CAR T细胞制备示意图:电穿孔、K562共培养、冷冻保存、输注过程。
图4. 使用SB系统和aAPC系统对来自外周血(PB)和脐带血(UCB)的CAR+ T细胞进行基因修饰与扩增的制备流程示意图。 通过电转将SB来源的超螺旋DNA质粒导入T细胞,并在重组人可溶性IL-2和IL-21存在条件下,与K562来源的aAPC(克隆#4)进行后续共培养,从而生成靶向CD19的CAR+ T细胞。 点击此处查看高清大图

T细胞来源转座子*转座酶T细胞输注IRB #NIH-OBA #IND #
自体(患者来源)**CD19RCD28SB11自体造血干细胞移植后2007-06350804-92214193
同种异体(供者来源)CD19RCD28SB11同种异体造血干细胞移植后2009-05250910-100314577
同种异体(供者来源)CD19RCD28SB11同种异体脐带血移植后2010-08351001-102214739

表1. 在美国食品药品监督管理局(FDA)的监管下,于MDACC开展的临床试验中输注在aAPC上扩增的CD19特异性CAR+ T细胞。 *T细胞通过强制表达编码靶向CD19的SB转座子而获得特异性nd 第二代CAR,命名为CD19RCD28,通过CD28和CD3-ζ传导信号。**试验详见参考文献#7

讨论

转座子与转座酶系统,例如 piggyBac12,19 和 SB18,20-22,是基因治疗的非病毒方法,可作为临床级CAR的病毒介导转导的替代方案+ T细胞。选择睡美人(SB)作为基因转移系统,是基于其在人类基因治疗中的潜在应用价值。1,6,23我们开发了SB转座(用于导入CAR)与递归添加γ射线照射的aAPC(用于回收稳定表达CAR的基因修饰T细胞)两项双重技术,作为符合cGMP标准的I/II期临床试验中制备肿瘤相关抗原特异性T细胞的平台技术。图4。经过28天(四个7天刺激周期)在γ射线照射的aAPC上共培养后,我们通常能够获得至少约1010 适用于人类应用的基因修饰T细胞。根据需要,可进行额外的刺激循环,以产生更大量的基因修饰T细胞。此外,如果CAR较少+ T细胞是必需的,可通过减少电穿孔所用比色皿数量,并在每轮刺激周期开始时仅将扩增后T细胞中的一部分继续在活化人工抗原呈递细胞(aAPC)上进行后续增殖,从而缩小电穿孔与扩增的操作规模。收获用于输注的大多数经电穿孔和扩增的T细胞可稳定表达CAR。CD4的扩增+ 和 CD8+ 表达我们2的T细胞nd 生成的CAR包括具有记忆/初始表型的细胞,并表现出重定向特异性的三个特征。首先,经基因修饰的T细胞可特异性裂解CD19+ 靶点,其次,在响应CD19时产生IFN-γ+ 刺激细胞,第三,响应 CD19 发生增殖+ 饲养细胞,均以CAR依赖性方式13,18通过SB系统以非病毒质粒DNA电转的方式将CAR转基因整合,可在来自外周血和脐带血的静息态原代T细胞中实现。我们及其他研究者已对K562细胞进行遗传改造,使其作为人工抗原呈递细胞(aAPC),以高效扩增出满足临床输注需求数量的T细胞。24,25. 人工抗原呈递细胞及组织培养环境(例如 IL-21的添加)已进行修改,以生成患者和供体来源的CD19特异性T细胞,用于造血干细胞移植后的输注表1)13,18我们可以通过静脉穿刺获取的外周血(PB)直接制备CAR+ T细胞,从而避免了通过单采分离术获取外周血单个核细胞(MNC)所带来的成本、不适和不便。该方法能够大量制备CAR+ 来自少量单个核细胞的T细胞特别适用于异基因脐带血移植后输注T细胞。由于新生儿供者体积小且信息匿名,无法在后续时间点再次获取该个体的样本,且可用于T细胞制备的收获单个核细胞数量有限,以避免干扰造血功能。目前正在进行生产工艺的进一步优化,包括引入高通量电穿孔装置,并结合完全封闭式的WAVE生物反应器,以最大限度减少人工操作。总体而言,SB系统与人工抗原呈递细胞(aAPC)是生成靶向CD19的嵌合抗原受体(CAR)T细胞的有吸引力的技术平台+ 能够适应并大规模生成经基因修饰的T细胞,以识别其他细胞表面肿瘤相关抗原,且符合cGMP规范。

披露

未声明任何利益冲突。

致谢

作者感谢宾夕法尼亚大学的 Carl June 博士在生成和提供 aAPC 克隆 #4 方面提供的帮助,以及明尼苏达大学的 Perry Hackett 博士在 SB 系统方面提供的帮助。

基金支持:癌症中心核心资助(CA16672);RO1(CA120956,CA124782,CA141303);R33(CA116127);P01(CA148600);SPORE(CA136411);Albert J Ward基金会;Burroughs Wellcome基金;Gillson Longenbaugh基金会;德克萨斯州癌症预防与研究所;CLL全球研究基金会;美国国防部;Noelan L. Bibler遗产;Harry T. Mangurian, Jr. 白血病免疫治疗基金;个性化癌症治疗研究所;白血病与淋巴瘤学会;淋巴瘤研究基金会;MDACC姊妹机构网络基金;Miller基金会;Herb Simons先生;Joe H. Scales先生及夫人;Thomas Scott先生;国家癌症研究基金会;儿科癌症研究基金会;细胞治疗生产援助项目(PACT);William Lawrence与Blanche Hughes儿童基金会。

材料

本文使用的材料清单
姓名公司目录编号评论
试剂
表达GFP的DNA质粒(pmaxGFP)LonzaVPA-1002(试剂盒)
PBSSigmaD8537
CliniMACS PBS-EDTAMiltenyi Biotec70026
HyQ RPMI-1640赛默飞世尔科技SH30096.01
无酚红 RPMI-1640赛默飞世尔科技SH30605.01
Hyclone 胎牛血清赛默飞世尔科技SH3007003HI
GlutaMAX(100倍浓缩液)Gibco3505-061
Ficoll-PaqueGE Healthcare Biosciences17-1440-02
重组人IL-21PeproTechAF-200-21
重组人白细胞介素-2(Proleukin)诺华NDC 65483-116-07
人T细胞试剂盒(核转染溶液)LonzaVPA-1002
CliniMACS CD56 试剂Miltenyi70206
FITC标记的鼠源mAb,特异性识别人CD3BD Biosciences349201
与特异性识别人 CD4 的小鼠单克隆抗体偶联的 APCBD Biosciences340443
PerCPCy5.5 标记的鼠源抗人 CD8 单克隆抗体BD Biosciences341051
PE 偶联的 F(ab')2 山羊抗人 Fc 抗体片段γInvitrogenH10104
叠氮化钠SigmaS2002
一次性用品
12孔板康宁3513
T-75 cm²2 烧瓶康宁430641
培养袋Vue Life290°C;750°C
50 ml 离心管BD Biosciences352098
设备
Amaxa Nucleofector IILonzaAAB-1001
细胞计数仪Nexcelom BioscienceCellometer Vision
Sorvall Legend RT 离心机Sorvall75004377
BD FACS CaliburBD Biosciences342975
程序降温仪平面仪Kryo 750
辐照仪CIS bio InternationalIBL-437 C#09433
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分子(内源性和外源性)的表达
细胞系通用名称细胞类型表达的分子
CJKT64.86.41BBL.GFP-IL15.CD19克隆4K562CD86、CD64、CD137L、CD19、GFP 与膜结合型 IL-15 共表达

完全培养基(CCM) (4℃保存) °C,最长可达30天)
HyQ RPMI-1640/无酚红RPMI-1640
10% FBS
1% GlutaMAX

流式细胞术缓冲液 (4℃保存) °C,最长可达30天)
PBS
2% FBS
0.1% 叠氮化钠

参考文献

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