我们描述了一种用于追踪由胞内细菌引发的内膜系统破裂的方法 志贺氏菌 福氏 和 结核分枝杆菌 在宿主细胞入侵过程中。我们的检测利用了CCF4,一种存在于活细胞或固定细胞宿主胞质中的FRET探针。该报告分子可被细菌表面存在的一种酶活性降解。
我们描述了一种用于追踪由胞内细菌引发的内膜系统破裂的方法 志贺氏菌 福氏 和 结核分枝杆菌 在宿主细胞入侵过程中。我们的检测利用了CCF4,一种存在于活细胞或固定细胞宿主胞质中的FRET探针。该报告分子可被细菌表面存在的一种酶活性降解。
Shigella flexneri 是一种致病性细菌,可侵入宿主细胞并进入内吞囊泡。随后,该膜包被的区室破裂,使细菌进入细胞质中自由移动、增殖,并进一步侵染邻近细胞。Mycobacterium tuberculosis 可被免疫细胞吞噬,并已被证实可在巨噬细胞中破坏吞噬体膜。我们开发了一种可靠的检测方法,用于追踪 Shigella flexneri 或 Mycobacterium tuberculosis 进入宿主细胞后吞噬体膜的破裂过程。该方法利用 CCF4 作为对β-内酰胺酶敏感的FRET报告分子,该探针可在宿主细胞的细胞质中均匀分布。当细菌病原体侵入宿主细胞时,只要细菌仍处于膜包被的区室内,探针便保持完整;一旦囊泡破裂,胞内病原体表面的β-内酰胺酶会立即切割 CCF4,导致FRET信号丧失并改变其发射光谱。这种可靠的比率型检测方法可准确提供侵入性细菌诱导囊泡破裂的时间信息,并可通过专用算法与自动化显微镜及图像处理技术联用,实现对FRET供体和受体发射信号的检测。此外,该方法可在单细胞水平上实时研究胞内细菌引发的囊泡破裂动态过程。最后,该方法非常适用于高通量分析,其时空分辨率优于以往方法。本文提供了以 Shigella flexneri 以及多种分枝杆菌菌株(如 Mycobacterium marinum、Mycobacterium bovis 和 Mycobacterium tuberculosis)为模型,在 HeLa 细胞和 THP-1 巨噬细胞中进行 CCF4 囊泡破裂检测的示例性实验方案,适用于时间序列或终点实验。
许多细菌病原体在感染过程中会被真核细胞以膜包被的区室形式内化。细胞入侵可通过专职宿主细胞的吞噬作用实现,例如巨噬细胞吞噬结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis);或者由病原体主动诱导进入通常不具备吞噬能力的细胞。在诱导内化的情况下,例如志贺氏痢疾杆菌(Shigella flexneri),病原体会向宿主细胞质中注入效应蛋白,这些蛋白会劫持包括内膜系统分选机制在内的多种细胞功能,导致细菌定位于内体样区室内1,2。随后,志贺氏菌(Shigella)破坏包被膜,引起液泡破裂,使病原体进入细胞质,干扰宿主的膜运输过程,并避免被运送至溶酶体。近年来还发现,吞噬溶酶体破裂也是结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)的一种感染策略,该病原体曾长期被认为仅存在于膜包被的区室内3,17。
为了研究侵入性病原体亚细胞膜运输的动力学,自20世纪80年代末基于透射电子显微镜(TEM)的研究以来,已取得显著进展4,5。例如,基于荧光显微镜的方法,如使用染料、针对细菌表面组分的抗体,或与亚细胞区室共定位的标记物,已逐渐成为主流6,7。然而,这些方法仍无法提供精确的时空分辨率,也难以对细菌病原体引起的液泡破裂进行定量测量。
这一难题已通过一种基于头孢菌素衍生的CCF4-AM FRET报告分子的检测方法得到解决,该方法最初用于研究基因表达8。随后,该方法被应用于感染生物学领域,以研究效应蛋白的分泌以及Neisseria进入宿主细胞的过程9,10,11。我们开发了一种利用该报告分子的研究方法,用于检测由Shigella flexneri12和Mycobacterium tuberculosis17诱导的液泡破裂。本方法的原理如图1所示,以Shigella flexneri为例进行说明。首先,将宿主细胞加载FRET CCF4-AM底物,该底物在细胞质中脱去AM酯基团后被滞留于胞内。随后,用Shigella flexneri感染细胞。当液泡破裂发生后,细菌表面的β-内酰胺酶即可立即切割CCF4底物。这导致FRET信号丧失,当探针在405 nm激发时,发射峰从535 nm转变为450 nm。通过测定450 nm与535 nm发射光强度的比值,可反映液泡的完整性:低比值表示细菌仍被膜包裹或位于细胞外,而高比值则表明细菌与宿主细胞质发生了接触。我们还报道了该方法的一种改进版本,用于研究Mycobacterium tuberculosis在THP-1巨噬细胞中诱导的吞噬体破裂。尽管实验原理相同,但操作顺序有所调整:CCF4-AM的加载仅在细菌感染之后进行。
因此,通过在单细胞水平上进行定量的比率荧光测量,可以实时追踪Shigella flexneri在不同类型细胞中的液泡破裂过程,并可在固定样品中进行检测12,13,14。此外,本方法还可适用于其他多种侵袭性病原体,本研究中已利用Mycobacterium bovis和Mycobacterium tuberculosis加以验证。最后,将本实验方案微型化至96孔板(或384孔板)格式,可实现对大量实验条件的高通量筛选。
该检测可在多种实验体系中进行,但我们建议缩小样本体积以节约试剂,尤其是 CCF4-AM。因此,以下方案分别描述了在 96 孔板中固定 HeLa 细胞或 THP-1 巨噬样细胞的检测流程,以及在 35 mm 玻底培养皿中活 HeLa 细胞的检测流程。该检测方法可适用于其他病原体。除志贺氏菌感染外,我们还描述了 THP-1 细胞吞噬不同分枝杆菌菌株的检测方案。
重要的是,在加载 CCF4-AM 后,所有试剂和缓冲液(包括洗涤缓冲液)均需含有 1 mM 的丙磺舒。丙磺舒是一种阴离子通道抑制剂,可在整个实验步骤中促进 CCF4 在细胞质中的滞留。固定后的样品应在实验结束后数小时内完成检测,因为 CCF4 信号在长时间内不稳定。
1. 使用Shigella flexneri对固定样本进行CCF4检测(96孔板)
2. 使用Shigella flexneri 对活体样本进行 CCF4 检测(35 mm 玻璃底培养皿,MatTek)
3. 使用固定样品进行CCF4检测 分枝杆菌(96孔板格式)
补充方案
为了检测细菌表面的β-内酰胺酶活性,需进行荧光测定。每种拟用于本实验方案的细菌菌株均应进行此项检测。具体操作如下:将洗涤后的细菌与100 nM CCF4-AM(Invitrogen)、50 μg/ml 猪肝酯酶提取物(sigma)在1 ml PBS中混合,于37 °C避光孵育1小时。可使用1 mg/ml的可溶性β-内酰胺酶(Invitrogen)作为阳性对照。随后,使用PTI Quantamaster荧光分光光度计和1 ml石英比色皿,在405 nm激发波长下进行发射光谱扫描。当细菌加入CCF4探针后,可在535 nm处观察到FRET信号减弱,同时在450 nm处出现明显的荧光峰。
CCF4-AM/β-内酰胺酶方法是一种稳健且灵敏的技术,可用于追踪如细胞内病原体的液泡破裂过程 福氏志贺菌 (图1)。该 志贺氏菌 本研究中使用的小鼠品系称为 M90T AfaI 和 BS176 AfaI。M90T AfaI 是一种 福氏志贺菌 表达黏附素AfaE的菌株,该黏附素能够高效结合上皮细胞表面的CD55 15因此,表达AfaE的菌株在上皮细胞中的侵袭能力远高于野生型M90T菌株。BS176 AfaI是一种表达AfaE的突变株。 志贺氏菌 福氏 缺失该基因的菌株 志贺氏菌 毒力质粒。该菌株无法侵入HeLa细胞。然而,该菌株能够进入THP-1细胞,因为该细胞系的摄取仅依赖于经典的吞噬作用,不需要功能性的III型分泌系统。两种菌株均表达β-内酰胺酶,并由于携带编码AfaE的质粒而在细胞表面表现出β-内酰胺酶活性。用非侵袭性BS176 AfaI菌株感染HeLa细胞1小时后,CCF4 FRET探针保持完整,如图所示 图2A 由绿色信号(535 nm)指示。相反,感染强毒性的M90T AfaI菌株1小时后,信号转向蓝色(450 nm),表明探针在细胞质中被切割。为了定量分析这一现象,我们开发了一个用于Metamorph和Acapella软件的脚本,可自动识别细胞并测量535 nm和450 nm通道的荧光强度,从而确定比率信号。如图所示 图2B,利用Draq5通道对细胞的细胞核和细胞质进行分割。随后,该算法能够识别450 nm和535 nm的阳性细胞群体,计算每个单个细胞在这两个波长下的荧光强度比值,并以直方图形式呈现 图2C突变株的比值较低,而毒力株的比值较高。尽管本例感染实验采用共聚焦显微镜获取结果,但落射荧光显微镜也适用于该检测。 图3 和 4 以两种不同的人类细胞类型为例:HeLa 上皮细胞和 THP-1 类似巨噬细胞。在感染毒力型 M90T AfaI 后 志贺氏菌 孵育1小时和90分钟时,与感染BS176 AfaI的细胞相比,HeLa和THP-1细胞中可观察到信号从绿色(535 nm)转变为蓝色(450 nm)图3A 和 4A)。我们开发的MetaMorph软件脚本可直接检测CCF4阳性细胞群体,并计算每个单个细胞在450 nm和535 nm通道中的荧光强度比值。随后,通过在Excel中开发的宏程序,根据该比值对细胞进行分类,从而生成显示细胞分布的直方图。与为Acapella开发的其他脚本类似,使用MetaMorph算法分析HeLa细胞和THP-1巨噬细胞时,BS176 AfaI感染的细胞表现为低比值,而M90T AfaI感染的细胞则表现为高比值。图3B 和 4B)。最后,展示了该方法在分枝杆菌研究中的适应性应用。 图5. Mycobacterium bovis 在整个实验过程中,BCG 始终存在于吞噬体中,这一点通过实验全程检测到的强烈 535 nm 信号得以反映。相比之下, 结核分枝杆菌 在感染3天后诱导THP-1巨噬细胞吞噬体膜破裂,感染7天时表现为450 nm信号(图 5A 和 5B)。采用相同的算法来研究液泡破裂 志贺氏菌,我们发现 结核分枝杆菌 感染细胞的450/535 nm比值高于 Mycobacterium bovis 感染7天后的BCG(图5C 和 5D).

图 1. CCF4-AM/β-内酰胺酶检测法用于追踪 Shigella flexneri 内体囊泡破裂的原理示意图。 CCF4-AM 可自由穿过质膜进入细胞质,在细胞质中其酯基被胞质酯酶水解,生成 CCF4 阴离子。该反应阻止 CCF4 进入任何膜包被的细胞器。在此阶段,CCF4 在 405 nm 激发下于 535 nm 处产生 FRET 信号。探针保持完整状态,直至表达 β-内酰胺酶的细菌破坏内吞囊泡。此时,CCF4 被 β-内酰胺酶切割,导致在 405 nm 激发下发射光由 535 nm 转变为 450 nm,FRET 信号随之消失。

图 2. 利用共聚焦显微镜追踪 Shigella flexneri 液泡破裂过程。 (A) HeLa 细胞经 CCF4-AM 负载 2 小时 30 分钟后,分别感染表达 β-内酰胺酶的 Shigella flexneri BS176 AfaI 突变株或 M90T AfaI 毒力株 1 小时,随后用 4% 多聚甲醛固定 10 分钟。接着使用 Draq5 对细胞核进行染色,并采用配备 10 倍物镜的共聚焦显微镜进行成像。所选代表性图像包含以下合并通道:完整的 CCF4 探针在 535 nm 处显示为绿色,裂解后的 CCF4 探针在 450 nm 处显示为蓝色。(B) 使用 Acapella 软件中自动化算法检测系统的示例图像。细胞(细胞核+细胞质)的分割基于 Draq5 通道获得;CCF4 阳性细胞则通过合并 450 nm 和 535 nm 通道信号识别。(C) 柱状图显示了利用 Acapella 软件对 Shigella flexneri BS176 AfaI 突变株和 M90T AfaI 毒力株进行自动化分析的结果。平均比值表示 450 nm 与 535 nm 通道信号强度的比值。点击此处查看高清大图。

图3. 利用落射荧光显微镜追踪Shigella flexneri在HeLa细胞中的液泡破裂过程。(A) HeLa细胞经CCF4-AM负载2小时30分钟后,分别感染表达β-内酰胺酶的Shigella flexneri BS176 AfaI突变株或M90T AfaI毒力株,感染1小时后用4%多聚甲醛固定10分钟。随后使用配备20倍物镜的落射荧光显微镜进行成像。代表性图像选自以下通道:CCF4完整探针535 nm(绿色)和CCF4裂解探针450 nm(蓝色)。(B) 直方图显示了在MetaMorph软件中进行自动化分析的结果。各个细胞根据其在450 nm与535 nm通道荧光强度比值进行分布。

图 4. 利用落射荧光显微镜追踪 THP-1 细胞中 Shigella flexneri 的液泡破裂过程。 (A) THP-1 细胞经 CCF4-AM 染色 2 小时 30 分钟后,分别感染表达 β-内酰胺酶的 Shigella flexneri BS176 AfaI 突变株或 M90T AfaI 毒力株,感染时间为 1 小时 30 分钟,随后用 4% 多聚甲醛固定 10 分钟。接着使用配备 20 倍物镜的落射荧光显微镜对细胞成像。所选代表性图像包含以下通道:CCF4 完整探针 535 nm(绿色)和 CCF4 裂解探针 450 nm(蓝色)。(B) 使用 MetaMorph 软件进行自动化分析所得结果的直方图。各个细胞根据其在 450 nm 与 535 nm 通道中的荧光强度比值进行分布。

图 5. 利用落射荧光显微镜追踪Mycobacterium bovis BCG 和Mycobacterium tuberculosis 在 THP-1 巨噬细胞中的吞噬体破裂情况。(A, B) THP-1 细胞经表达 β-内酰胺酶的Mycobacterium bovis BCG 或Mycobacterium tuberculosis 感染 2 小时后,培养 3 至 7 天。洗涤后,细胞负载 CCF-4-AM 2 小时,并用 4% 多聚甲醛固定 30 分钟,随后使用配备 40 倍物镜的落射荧光显微镜进行成像。代表性图像选自以下通道:完整的 CCF4 探针,535 nm(绿色);裂解的 CCF4 探针,450 nm(蓝色)。(C, D) 使用 MetaMorph 软件进行自动化分析结果的直方图。单个细胞根据其在 450 nm 与 535 nm 通道间的荧光强度比值分布。
CCF4-AM/β-内酰胺酶检测法是一种简单的方法,用于追踪细胞内Shigella flexneri和分枝杆菌在不同类型细胞中诱导的液泡破裂。该方法利用一种对β-内酰胺酶敏感的胞质FRET报告分子,该报告分子可被细菌表面具有活性的酶切割。
在加载CCF4-AM底物后,向所有溶液中添加丙磺舒可轻松避免底物的流失。如所示,该检测方法可适用于多种细胞类型(上皮细胞、吞噬细胞)和多种实验格式(96孔板、35 mm玻璃底培养皿、6/12/24孔板)。使用6/12/24孔板时,需在接种细胞前将无菌盖玻片置于各孔底部。实验结束后,将盖玻片转移至载玻片上,并用封片剂(如Prolong Gold抗荧光淬灭试剂(Invitrogen))封片。与固定后样本保存于PBS中的96孔板格式相比,该方法可在检测后更长时间内保持信号稳定。在确定样本体积前,应考虑CCF4-AM底物的高成本,因此建议缩小实验规模。6/12/24孔板格式的实验成本较高,但信号可持续数天;相反,96孔板格式的实验成本较低,但样本需在实验当天完成分析。值得注意的是,活细胞实验也可在96孔或384孔板格式中进行,从而可同时检测数十种条件(如突变细菌、感染复数MOI、质粒或siRNA转染、化学物质等),并在每孔内设置多个检测位点。尽管该方法适用于Shigella flexneri,但我们强调,由于分枝杆菌的感染周期过长,超出细胞质中可维持的CCF4可测浓度范围,因此无法实现真正的实时或延时成像实验。基于此原因,CCF4-AM底物仅在入侵完成之后才施加于细胞。
如果使用 MetaMorph 软件进行图像采集与分析,我们建议使用“高通量筛选采集”模块,该模块可对整块 96 孔或 384 孔板进行成像,并为每个孔设定指定数量的图像采集。此外,“筛选数据回顾”模块允许(i)在同一张大“海报”上同时可视化每个孔在任意通道下的拼接图像马赛克,以及(ii)循环运行专门的算法,用于测量 535 nm 和 450 nm 通道的荧光强度。尽管我们已能够通过延时显微镜观察单个细菌的液泡破裂现象,但我们提醒注意,单个细菌表面的酶活性存在差异,这使得细胞内细菌数量与液泡破裂效率之间的精确关联变得困难。
由于该检测方法具有良好的稳健性,适用于96孔或384孔板的高通量操作。我们还成功地将该方案改造用于FACS分析,以研究悬浮细胞的感染情况16。该检测方法也可用于研究其他在表面展示β-内酰胺酶的细菌或载体,因而具有广泛的应用前景。例如,该方法可用于研究由其他病原体(如表达β-内酰胺酶的Legionella pneumophila、Listeria monocytogenes或Salmonella typhimurium)诱导的液泡破裂12。由于Listeria monocytogenes的感染周期较短,与Shigella flexneri相似,因此可进行延时成像实验。相比之下,由于Legionella pneumophila和Salmonella typhimurium的感染周期较长,建议进行终点实验。
多种可能的应用使得 CCF4-AM/β-内酰胺酶检测成为一种有趣的荧光测定方法,可用于追踪固定样本或实时条件下由胞内病原体诱导的液泡破裂。
我们没有需要披露的内容。
本工作由法国国家研究局和欧洲研究理事会资助。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| LiveBlazer FRET-B/G 加载试剂盒(CCF4-AM) | Invitrogen | K1089 | 避光保存,分装后于 -80 °C 贮存 |
| Draq5 | Biostatus | DR50050 | |
| 聚-L-赖氨酸 | Sigma | P9155 | |
| μ CLEAR-黑板,96 孔 | Greiner Bio-One | 655090 | |
| 35 mm 玻璃底培养皿 | MatTek 公司 | P35G-1.5-10-C | |
| 丙磺舒 | Sigma | P8761 | |
| β-内酰胺酶 | Sigma | P0389 |