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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
染色体可以从活细胞如淋巴细胞或皮肤成纤维细胞中分离出来,并从生物体包括人或小鼠。这些染色体制剂可进一步用于常规G显带和分子细胞遗传学方法,如荧光原位杂交(FISH),比较基因组杂交(CGH)和光谱核型分析(SKY)。
染色体(遗传学)分析被广泛用于染色体不稳定性的检测。当随后G显带和如荧光原位杂交(FISH)分子生物学技术,此法必须分析单个细胞对于涉及基因组重排,并涉及一个或多个染色体部分的收益或亏损畸变强大的能力。在人类中,染色体异常发生率约为每1 160个活产1,2,所有流产的60-80%3,4,死胎10%2,5,患有先天性心脏疾病6,3-6%个人13%不孕不育病例2,并在许多患者的发育迟缓和出生缺陷7。恶性肿瘤的细胞遗传学分析是经常使用的研究人员和临床医生,作为克隆性染色体异常的观测已经显示出具有诊断和预后意义8,9。60,染色体分离是非常宝贵的基因治疗和干生物,包括非人灵长类动物和啮齿动物10-13细胞研究。
染色体可以从活组织,包括外周血淋巴细胞,皮肤成纤维细胞,羊膜细胞,胎盘,骨髓和肿瘤样品的细胞中分离出来。染色体在有丝分裂的中期阶段进行分析,当它们被大部分冷凝并因此更加清晰可见。染色体分离技术的第一步涉及主轴纤维的破坏由孵化与秋水仙胺,以防止细胞从进到随后的后期阶段。然后将细胞用低渗溶液,并在其膨胀状态与卡诺固定液保存。的细胞,然后下降到幻灯片,然后可以用于各种各样的程序。 G显带包括胰蛋白酶处理,然后进行染色用姬姆萨打造特色光和暗带。同样的公关ocedure分离的染色体,可用于制备细胞对诸如荧光原位杂交(FISH),比较基因组杂交(CGH),和光谱核型分析(SKY)14,15程序。
染色体核型分析是利用世界性诊断染色体不稳定和重排,导致遗传性疾病和恶性肿瘤1,2,8,9的常规技术。此外,对于宪法和癌症获得的遗传异常的诊断和研究更高的分辨率可与经典遗传学方法和分子细胞遗传学方法,如荧光原位杂交(FISH)的组合,比较基因组杂交(CGH)来实现和光谱核型分析(SKY)14,15。最近,这些技术已被用于与干细胞研究相关的染色体不稳定性的评价。核型异常如长期培养的胚胎干细胞(ES)和各种生物体的成体干细胞的非整倍体已经报道由多个实验室。最近的证据支持某些细胞系在本质上更倾向于染色体instabiLITY不管文化条件为此,建立和/或维持人,小鼠,或恒河猴干细胞系时,染色体分析,建议作为质量控制过程的一部分。许多报告描述了使用常规和分子细胞遗传学监测干细胞和恶性细胞或有机体的各种文化10-13的染色体的稳定性越来越大的兴趣。这些协议正越 来越多地使用非遗传实验室的培养细胞13染色体的快速评估。我们提出我们的基本程序,用于从不同的细胞类型,这可以应用于从多种生物衍生的临床和研究的目的和细胞染色体制备。
1。贴壁细胞的染色体收获
2。玻片制备和染色固
一位代表幻灯片的快速评估将继续进一步的程序,如G显带,FISH,CGH,或Sky之前提供关于收获的质量信息。一些实验室倾向于固体染色的细胞进行快速采集和染色体评估。可替代地,在相差显微镜可用于这种分析。幻灯片最好准备当湿度约为50%,而环境温度(20-25℃)。
3。 G显带用胰蛋白酶和姬姆萨(GTG)
<P>胰蛋白酶是在变性DNA区域常染色质组蛋白具有较高的转录活性产生的蛋白水解酶。下面的姬姆萨染色,这些地区将出现光带。高度浓缩的染色质,很少或没有转录活性(异)将其从组蛋白的胰蛋白酶保护的很大一部分,因此,会弄脏黑暗以下Giemsa染色。至关重要的是最初G带一张幻灯片监控条件并在必要时调整胰岛素的时间为随后的幻灯片。高品质的中期息差的染色体分析是必不可少的。一个成功的试验产生的染色体这是很好的传播合适的染色体形态和。正确的G-带染色体包含的特征光与暗的条纹图案。

图1:一个成功的染色体蔓延,其中染色体平均长度,以及传播,很容易从一个另一个可辨,和光与暗带之间有足够的对比度,良好的染色体形态允许个体染色体和评估的鉴定表明任何重排染色体不稳定。
染色体可以从活细胞如淋巴细胞或皮肤成纤维细胞中分离出来,并从生物体包括人或小鼠。这些染色体制剂可进一步用于常规G显带和分子细胞遗传学方法,如荧光原位杂交(FISH),比较基因组杂交(CGH)和光谱核型分析(SKY)。
在这个手稿中描述的工作成为可能,从帕特里克F.泰勒基金会的资助。
| KaryoMAX 秋水 | 仙粒Gibco | 15212-012 | |
| HBSS 缓冲液 | Gibco | 24020-117 | |
| 0.5% 胰蛋白酶 EDTA 10x | Gibco | 15400-054 | |
| Permount | Fisher Scientific | SP15-100 | |
| 缓冲片剂 "GURR" | Gibco | 10580-013 | |
| Geimsa 染色 | 剂Ricca 化学公司 | 3250-16 | |
| 离心机 5810 | Eppendorf | ||
| 甲醇 | Caledon 实验室化学品 | 6700130 | |
| 冰醋酸 | Krackeler Scientific Inc. | 编号:11-9508-05 |