类弹性蛋白多肽是一类对刺激响应的生物聚合物,其应用范围从重组蛋白纯化到药物递送。本方案描述了利用类弹性蛋白多肽及其肽段或蛋白融合物在大肠杆菌(Escherichia coli)中的低温临界溶解温度相变行为,作为色谱法的简单替代方法进行纯化与表征。
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类弹性蛋白多肽是一类对刺激响应的生物聚合物,其应用范围从重组蛋白纯化到药物递送。本方案描述了利用类弹性蛋白多肽及其肽段或蛋白融合物在大肠杆菌(Escherichia coli)中的低温临界溶解温度相变行为,作为色谱法的简单替代方法进行纯化与表征。
弹性蛋白样多肽是一类具有重复序列的生物聚合物,表现出低临界溶解温度相变行为:在特征相变温度以下以可溶性单体形式存在,而在相变温度以上则聚集形成微米级的共聚物相分离液滴。通过基因水平设计弹性蛋白样多肽,可精确调控其氨基酸序列与长度,从而决定其热学特性。弹性蛋白样多肽已被广泛应用于生物传感、组织工程和药物递送等领域,在这些应用中可通过调节ELP的相变温度和聚合物结构以满足特定需求。此外,弹性蛋白样多肽的低临界溶解温度相变行为使其可通过热响应性实现纯化,即利用其选择性的共聚物相分离与再溶解过程,在异源表达后有效去除可溶性及不可溶性杂质。 大肠杆菌该方法可用于弹性蛋白样多肽的纯化,也可作为肽或蛋白融合物的纯化工具,在该技术中,通过基因融合连接至弹性蛋白样多肽标签的重组肽或蛋白无需色谱法即可实现纯化。本方案描述了弹性蛋白样多肽及其肽或蛋白融合物的纯化步骤,并讨论了用于评估纯化后弹性蛋白样多肽产物热行为的基本表征技术。
弹性蛋白样多肽(ELPs)是由重复的五肽单元VPGXG组成的生物聚合物,其中X为除脯氨酸外的任意氨基酸,称为客体残基。ELPs表现出下临界溶液温度(LCST)相变行为,即当均匀的ELP溶液被加热至其LCST时,会分离成两相,这一温度在ELP文献中通常被称为逆相变温度(Tt)1。这两相分别为ELP含量极低的球状相和富含ELP的沉淀相。富含ELP的沉淀相是在ELP链迅速聚集形成微米级颗粒并进一步融合后短时间内形成的。该相变过程发生在数摄氏度的温度范围内,通常具有可逆性,当温度降至Tt以下时,溶液可恢复为均匀状态。
ELP 通常通过将人工基因连接到表达质粒中,在Escherichia coli(E. coli)内合成。随后将该质粒转化至适合蛋白表达的E. coli菌株中。我们一直采用 T7-lac pET 载体系统在E. coli中表达多种 ELP,尽管其他研究者也已使用酵母2-4、真菌5和植物6-8中的其他表达系统。目前存在多种构建重复序列 ELP 基因的分子生物学方法,包括递归定向连接(RDL)9、质粒重建介导的递归定向连接(PRe-RDL)10以及重叠延伸滚环扩增(OERCA)11。在基因层面设计 ELP 的能力,使得研究人员可利用重组 DNA 技术构建具有多种结构(例如, 单嵌段、双嵌段、三嵌段等)的 ELP,并可进一步融合功能性多肽或蛋白质。在基因水平上的精确控制还可确保每种 ELP 均以其质粒模板所规定的精确长度和组分进行表达,从而获得完全单分散的生物大分子产物。
每种ELP的热学性质取决于其内在的生物聚合物参数,如分子量(MW)和序列,以及外在因素,如其在溶液中的浓度和其他共溶质(如盐类)的存在。ELP的长度12 及其客体残基组成1,13,14 是ELP设计中两个正交参数,可用于调控Tt,其中疏水性客体残基和更长的链长度会导致更低的 Tts,而亲水性客体残基和较短的链长则导致更高的Tts. ELP 浓度与 T 呈负相关t,其中浓度较高的 ELP 溶液具有较低的 Tts12盐的种类和浓度也会影响ELP的Tt,其中盐的影响遵循霍夫梅斯特序列15. 促水化阴离子(Cl⁻)- 且在霍夫迈斯特序列中位置更高的) 会降低 ELP 的相变温度 Tt 增加盐浓度可增强这一效应。通过调节这些内在和外在参数,可获得特定应用所需的特定温度范围内的热响应行为,从而适用于特定用途的弹性蛋白样多肽(ELP)。
ELP 的刺激响应行为在多种应用中具有重要价值,包括生物传感16,17、组织工程18以及药物递送19,20。此外,当 ELP 在基因水平上与肽或蛋白质融合时,ELP 可作为简单的纯化标签,提供一种无需层析的低成本批量纯化方法,用于重组肽或蛋白质的分离21。通过优化纯化工艺,可确保与 ELP 融合的肽或蛋白质的活性得以保持。对于需要保留 ELP 标签的应用,可直接纯化肽或蛋白质-ELP 融合产物22,23;而若需要获得游离的肽或蛋白质,则可在肽或蛋白质与 ELP 之间插入一个蛋白酶识别位点。随后通过游离蛋白酶或蛋白酶-ELP 融合体进行消化,即可去除 ELP 标签;其中后者更具操作便利性,因为最终可通过一轮 ELP 纯化步骤,将 ELP 标签和蛋白酶-ELP 融合体与目标肽或蛋白质一次性分离24,25。以下方案描述了利用 ELP 及其肽或蛋白质融合体的热响应特性进行纯化的方法,并介绍了表征 ELP 产物热响应行为的基本技术。
1. ELP 表达
2. ELP 纯化:初步步骤与第一轮逆相变循环
3. ELP 纯化:反向相变循环的后续轮次
4. 纯化后处理(可选)
5. 表征:SDS-PAGE
6. 表征:基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱法(MALDI-TOF-MS)
7. 表征:程序控温浊度法与动态光散射
本文描述了ELP均聚物和ELP二嵌段共聚物纯化与表征的代表性结果。在大肠杆菌(E. coli)中表达24小时后,通过离心收集细胞,并采用超声处理进行裂解。通常在超声处理后可观察到颜色的细微变化,表明细胞已充分裂解(图1A)。加入PEI后,通过离心去除基因组组分和细胞碎片,从而将不溶性杂质形成的大沉淀与上清液中可溶性ELP分离(图1B)。ELP进一步通过反向相变循环(ITC)进行纯化,该方法利用ELP的低临界溶解温度(LCST)特性,将其与可溶性和不溶性杂质分离(图2)28。ELP的相变可通过加热和/或添加盐来触发。离心后,ELP与部分不溶性杂质在离心管底部形成沉淀(图1C)。此步骤称为“热离心”,弃去上清液中的可溶性杂质,保留ELP沉淀并将其重悬于冷缓冲液中。将重新溶解的ELP在4 °C下再次离心。此步骤称为“冷离心”,弃去不溶性杂质沉淀,保留含有可溶性ELP的上清液。重复交替进行热离心和冷离心循环可提高ELP纯度,但会略微降低产率,因为在每次ITC循环过程中,部分残留的ELP会损失于离心管和移液器吸头中。
ELP 及多肽或蛋白质-ELP 融合物的成功纯化可通过 SDS-PAGE 确认。在整个纯化过程中取样的少量样品可显示 ELP 从 E. coli 裂解液中逐步纯化的效果。ELP 在粗制 E. coli 裂解液中过量表达,随着反向温度循环(ITC)的多次进行,杂质逐渐减少(图 3)。纯化后的 ELP 在凝胶上呈现为一条接近其理论分子量(MW)的单一条带。
ELP 的相变温度 Tt 通过程序控温浊度法进行表征。ELP 均聚物的浊度曲线在 350 nm 处表现出单一且急剧的光密度(O.D.)上升(当 ELP 浓度为 25 μM 时,O.D. 值较基线升高约 2.0 个单位)(图 4A)。降温过程中的浊度扫描证实了 ELP 相变的可逆性,当温度降至 Tt 以下时,O.D. 值恢复至基线水平(图 4B)。与均聚物 ELP 相比,ELP 二嵌段共聚物表现出更为复杂的浊度曲线:O.D. 值通常首先上升至基线以上 0.1–0.5 个单位,随后急剧上升至基线以上 2.0 个单位(图 5A)。动态光散射(DLS)测量提供了水合半径 RH 随温度变化的信息,进一步验证了浊度曲线所得结果(图 5B)。

图 1. ELP 的初步纯化。 表达 24 小时后,通过离心收集 E. coli 细胞,并重悬于 PBS 中。A) 通过超声处理裂解细胞,此过程伴随颜色的轻微变化,裂解液在超声后颜色变深。B) 加入 PEI 以浓缩 DNA 污染物后,对裂解液进行离心,不溶性杂质形成大量沉淀,而可溶性 ELP 保留在上清液中。C) 通过加热和/或加盐诱导 ELP 相变,离心后形成半透明的 ELP 沉淀。请点击此处查看该图的放大版本。

图2. 逆相变循环。 利用ELP的低临界溶解温度(LCST)特性,将其与可溶性和不溶性杂质分离。从富含ELP的裂解液开始(1),通过加热和/或加盐诱导ELP发生相变,再经离心(热离心)分离ELP(2)。保留ELP沉淀(3a),弃去含有可溶性杂质的上清液(3b)。将ELP沉淀重悬于冷缓冲液中(4),并在4 °C下再次离心(冷离心)(5)。弃去含有不溶性杂质的沉淀(6a),保留含有可溶性ELP的上清液(6b)。重复进行热离心与冷离心交替循环,直至达到SDS-PAGE检测所确定的目标纯度。请点击此处查看该图的放大版本。

图3. ELP纯化产物的SDS-PAGE分析。通过SDS-PAGE可确认ELP的成功纯化。在超声处理后的粗制E. coli裂解液中可见过表达的ELP(2)。加入PEI并离心后,可溶性ELP主要保留在上清液中(3),尽管部分ELP随不溶性杂质沉淀被弃去(4)。第一次热离心后的上清液仍含有较高水平的可溶性杂质(5)。第一次冷离心后的上清液显示ELP与不溶性杂质实现了良好分离(6)。通过额外的热离心(7)和冷离心(8)循环,可分别去除残留的可溶性和不溶性杂质,直至最终热离心(9)和冷离心(10)的上清液中无额外杂质条带,表明ELP产物纯度达到满意水平。该ELP同聚物的序列为SKGPG-(VGVPG)80-Y,预期分子量为33.37 kDa。请点击此处查看此图的放大版本。

图 4. 通过程序控温浊度法表征ELP均聚物。 通过以1 °C/min的速率升高温度并监测350 nm处的光密度(O.D.),确定ELP的相变温度Tt。A) ELP均聚物在给定浓度下表现出单一且急剧的光密度上升,由此定义其Tt。B) 通过降低25 μM溶液的温度并监测其在350 nm处的光密度变化,验证ELP相变的可逆性;光密度恢复至基线水平表明相变具有可逆性。该ELP均聚物的序列为SKGPG-(VGVPG)80-Y。请点击此处查看该图的高清版本。

图 5. 通过温度程序化浊度法和动态光散射表征ELP二嵌段共聚物。 能够发生纳米级自组装的弹性蛋白样多肽(ELP),例如可自组装成球形胶束的ELP二嵌段共聚物,表现出更为复杂的浊度曲线。A) 光密度(O.D.)的适度增加表明从单体(unimer)向胶束的转变,随后光密度迅速上升,表明ELP已完全聚集为微米级聚集体。B) 动态光散射(DLS)测量通过提供流体动力学半径(RH)随温度变化的信息,验证了25 μM溶液中浊度曲线所推断的行为。此处,ELP单体的RH约为8 nm,胶束的RH约为25 nm。该ELP二嵌段共聚物的序列为GCGWPG-(VGVPG)60-(AGVPGGGVPG)30-PGGS。请点击此处查看该图的放大版本。
ELP 利用其对刺激响应的相变行为,提供了一种低成本且无需层析的纯化方法。该方法利用 ELP 及其与多肽或蛋白质融合后的低临界溶解温度(LCST)行为,在大肠杆菌(E. coli)中表达基因编码的 ELP 后,可有效去除可溶性和不溶性杂质。这种简便的纯化方式可用于制备适用于多种用途的 ELP,也可用于纯化重组多肽或蛋白质,其中 ELP 可作为纯化标签,并在纯化后通过后续处理将其切除。
ELP 纯化过程包括初步步骤:裂解 E. coli,并从粗制培养裂解液中去除基因组物质及不溶性细胞碎片(图1),随后通过逆向温度循环(ITC)去除残留的可溶性和不溶性杂质(图2)。通过加热或加盐诱导 ELP 发生相变后进行离心,使 ELP 与上清液中的可溶性杂质分离,该步骤称为热离心(hot spin)。将 ELP 重新溶解后,再在低于其相变温度(Tt)的条件下进行离心,以去除不溶性杂质沉淀,该步骤称为冷离心(cold spin)。交替进行热离心和冷离心可逐轮提高 ELP 溶液的纯度,但会略微降低回收率。ELP 的纯化得率因 ELP 的 Tt、长度以及融合的肽或蛋白而异。通常情况下,每升 E. coli 培养液可获得约 100 mg 的纯化 ELP,但在某些情况下得率可达 500 mg/L。最终 ELP 产物的纯度通过 SDS-PAGE 进行确认(图3)。纯化后 ELP 的分子量(MW)应与 ELP 基因编码的理论分子量接近。然而,某些 ELP 在 SDS-PAGE 中的表观分子量可能比预期分子量高出最多 20%9,27。更精确的 ELP 分子量分析可通过 MALDI-TOF-MS 实现,该方法结合高效液相色谱(HPLC)等正交分析技术,还可进一步提供 ELP 产物纯度的信息。
纯化完成后,通过程序升温浊度法测定ELP的相变温度(Tt)。该技术在升温过程中监测ELP溶液的光密度(O.D.)。由于Tt具有浓度依赖性,建议对与ELP预期应用相关的浓度系列进行表征。对于ELP均聚物,浊度曲线呈现单一 sharp 升高,对应ELP从单体向微米级聚集体的转变(图4A)。Tt定义为浊度曲线拐点所对应的温度,精确确定为光密度对温度的一阶导数的最大值。当温度降至Tt以下时,光密度恢复至基线水平,表明ELP相变具有可逆性(图4B)。由于ELP凝聚相的沉降以及ELP再溶解过程中的滞后效应差异,升温与降温过程中的浊度曲线在幅度和动力学上会有所不同。肽段或蛋白-ELP融合物也表现出类似的低临界溶解温度(LCST)行为,其中融合的肽段或蛋白会影响ELP的Tt。对于蛋白-ELP融合物,当温度低于蛋白的熔解温度时,相变是可逆的。尽管程序升温浊度法是ELP产物初步热学表征的优良方法,也可采用其他技术(如差示扫描量热法(DSC))测定ELP的Tt。
具有更复杂结构的 ELP 表现出更为复杂的热行为,这些行为也可通过程序控温浊度测定法进行表征。例如,ELP 二嵌段共聚物在达到临界胶束化温度时,会因温度触发而自组装形成球形胶束,并呈现出特征性的浊度曲线。对于此类 ELP 二嵌段共聚物,光密度(O.D.)通常首先较基线升高 0.1–0.5 个单位,表明从单分子链(unimer)向胶束的转变;随后在较高温度下,O.D. 出现急剧上升(较基线最高可达 2.0 个单位),表明形成了微米级聚集体(图 5A)。通过动态光散射(DLS)可进一步获取关于温度触发自组装 ELP 结构的信息,该技术用于测量溶液中 ELP 组装体的流体力学半径(RH)。RH 的变化与浊度法测得的 O.D. 变化高度一致(图 5B)。ELP 单分子链通常表现出 RH<10 nm,而纳米粒子组装体的 RH 约为 20–100 nm,聚集体的 RH>500 nm。关于自组装 ELP 纳米粒子的其他信息,如聚集数和形貌,可通过静态光散射或低温透射电子显微镜技术获得17,23,29。
由于ELP热学性质的可调性,可实现一系列Tts 通过不同的 ELP 设计获得。需要牢记的是,固有的 Tt 将影响每种ELP纯化方案的优化,其中极低或极高的Tts 需要对该标准方案进行最大程度的修改。具有极高相变温度的弹性蛋白样多肽(ELP)可能不适用于本方法进行纯化。如果新型 ELP 或肽段/蛋白-ELP 融合物的设计可能影响 ELP 的热响应特性,可考虑添加简单的组氨酸标签,以便通过固定化金属亲和层析进行替代纯化。此外,若 ELP 序列中的客体残基带有电荷,则可能需要对该方案进行相应调整。可通过调节缓冲液 pH 作为改变 ELP 整体电荷的方法,以期消除 与污染物的静电相互作用17此外,当采取适当措施以确保纯化过程不会影响融合肽或融合蛋白活性时,本方案也适用于ELP与肽段或蛋白质融合的特殊情况。方案中关于此类修改的注释旨在指导纯化过程中可能面临这些挑战的ELP的处理,以确保其功能完整性。t、电荷或融合问题。
利用 ELP 的低临界溶解温度(LCST)行为对其进行纯化,是一种简单且无需层析的纯化方法,适用于大多数在 E. coli 中表达的 ELP 及其肽段或蛋白质融合物。本文总结的方案可在一天内完成 ELP 的纯化,仅需使用大多数生物学实验室常见的设备。我们希望,ELP 及其融合物易于纯化的特点,将促进在材料科学、生物技术和医学领域中不断涌现出更多样化的 ELP 设计。
作者声明无竞争性财务利益。
本工作由美国国家科学基金会(NSF)研究三角材料研究中心(MRSEC)(项目编号:DMR-1121107)资助。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| pET-24a(+) pET-25b(+) | Novagen | 69749-3 69753-3 | 含卡那霉素抗性(pET-24)或氨苄青霉素抗性(pET-25)的 T7-lac 表达载体。 |
| Ultra BL21 (DE3) 感受态细胞 | Edge BioSystems | 45363 | 用于重组蛋白表达的 E. coli 感受态细胞。 |
| 优异肉汤(TB)干粉培养基 | MO BIO Laboratories | 12105 | 培养基用去离子 H2O 重悬后,经高压灭菌方可使用。 |
| 异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG) | Gold Biotechnology | I2481C | IPTG 用去离子 H2O 溶解,经无菌过滤后加入培养物中以诱导蛋白高效表达。 |
| 磷酸盐缓冲液(PBS)片剂 | Calbiochem | 524650 | 每片 PBS 片剂溶于 1 L 去离子 H2O 后,可形成 10 mM 磷酸盐缓冲液,含 140 mM NaCl 和 3 mM KCl,25 °C 时 pH 为 7.4。 |
| 聚乙烯亚胺(PEI)溶液(~50% w/v) | MP Biomedicals | 195444 | PEI 以去离子 H2O 配制成 10%(w/v)溶液。 |
| Nalgene Oak Ridge 高速离心管,50 ml | Thermo Scientific | 3138-0050 | 此类圆底离心管可耐受 30–50 ml 样品的高速离心。 |
| 三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl) | Thermo Scientific | 20491 | TCEP-HCl 储存液以去离子 H2O 配制为 100 mM,调节 pH 至 7.0。对于富含半胱氨酸的弹性蛋白样多肽(ELP),将该还原剂储存液加入 ELP 沉淀中,使其在 H2O 中终浓度达到 10 mM。 |
| Ready Gel Tris-HCl 凝胶,4–20% 线性梯度聚丙烯酰胺凝胶,10 孔,30 μl | Bio-Rad Laboratories | 161-1105 | 此类线性梯度凝胶适用于不同分子量 ELP 的良好可视化。 |
| 二水合氯化铜(CuCl2·2H2O) | Fisher Scientific | C454-500 | 制备过滤后的 0.5 M 溶液,用于 Tris-HCl 聚丙烯酰胺凝胶的负染色。 |
| Anotop 10 注射器滤器: 0.02 μm 0.1 μm 0.2 μm | Whatman | 6809-1002 6809-1012 6809-1022 | 此类直径为 10 mm 的注射器滤器可用于制备用于动态光散射(DLS)测量的小体积样品。 |
| Millex-HV 滤器: 0.45 μm | EMD Millipore | SLHVX13NK | 此类直径为 13 mm 的注射器滤器可用于制备含大尺寸纳米颗粒聚集体的溶液,以进行动态光散射(DLS)测量。 |
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