本文描述了Vastus lateralis的活检方法、线粒体的纯化制备以及呼吸测定分析。由于所需肌肉样本量小,该技术适用于临床研究应用。
本文描述了Vastus lateralis的活检方法、线粒体的纯化制备以及呼吸测定分析。由于所需肌肉样本量小,该技术适用于临床研究应用。
分离线粒体的呼吸测定分析常用于研究电子传递链功能。本文介绍一种获取人类Vastus lateralis(股外侧肌)样本、从少量骨骼肌组织中分离线粒体,并利用细胞外通量(XF)分析仪进行基于微孔板的呼吸测定分析的方法。通过比较使用1.0、2.5和5.0 μg线粒体所获得的呼吸测定谱图,结果表明1.0 μg线粒体已足以检测呼吸活性,而5.0 μg线粒体在标准误比较基础上可提供最一致的结果。对分离线粒体进行蛋白印迹(Western blot)分析,检测线粒体标志物COX IV和非线粒体组织标志物GAPDH,结果显示该实验方案的非线粒体污染有限。仅需20 mg肌肉组织即可开展线粒体呼吸测定研究,使研究者能够在临床研究项目中利用单个活检样本实现多个研究终点的分析。
线粒体是细胞内主要的能量生成场所,在衰老以及多种与年龄相关的疾病(如心血管疾病、阿尔茨海默病、糖尿病、癌症和肥胖)中发挥重要作用。对分离线粒体进行呼吸测定分析可直接评估电子传递链(ETC)功能,显著推动了我们对线粒体生物学及其在健康与疾病中作用的理解。分离的线粒体可用于研究生物能量学的多个方面,例如底物转运、ATP合酶活性、质子漏逸 等等。 本文所述方法已优化,可用于对从人体骨骼肌组织活检样本中分离的线粒体进行呼吸测定分析。本论文所描述的活检方案已被本机构工作人员应用了过去12年。我们的团队已在不同年龄(最高至90岁)且伴有各种慢性疾病的成人受试者中完成了超过700例操作,未发生任何不良安全事件。该方案的一个关键特点是专为利用极少的组织量而设计,从而便于其在临床研究中的应用。
已开发出多种用于分离线粒体的实验方案。Fernandez-Vizarra 等1,2 描述了一种从多种大鼠组织及培养细胞中分离线粒体的方法。Garcia-Cazarin 等3 已有研究报道了一种从大鼠和小鼠骨骼肌中分离线粒体的方法。Iglesias-Gonzales 也报道了一种从大鼠脑组织中分离线粒体的方法。 等4 格罗斯, 等5 报道了一种使用巴氏循环仪和/或PCT破碎仪分离线粒体的方法。最近,Franko 等6 报道了一种使用抗TOM22磁珠分离高度富集线粒体的方法。
尽管这些方案能够获得良好的结果,但与本文所述方法相比,其对组织样本量的需求较大。例如,Gross 等5 使用了1.5–1.8 g的腓肠肌组织以及约2 g的肾组织。同样,Franco 等6 使用了500 mg的小鼠肝组织。根据我们的经验,经皮穿刺针吸活检获取的骨骼肌(股外侧肌)组织通常仅有100–200 mg。本方案能够在20–50 mg的肌肉组织中评估线粒体功能,使研究者可在单次活检样本中进行多项检测,并将剩余样本储存用于后续的其他分子生物学实验。这一特性在临床研究及其他需要高效利用样本的研究中至关重要。需要注意的是,由于线粒体外膜受损以及细胞色素C活性丧失,此前冷冻保存的线粒体不适合用于偶联呼吸的研究。本方法是在Chappell和Perry7发表的方法基础上进行改进和优化而建立的。
根据本文所述方法,我们近期报道了从人体Vastus lateralis分离的线粒体呼吸测定谱与身体功能能力(以步速衡量)呈直接相关性8。
注意:所描述的方案已获得维克森林医学院机构审查委员会的批准。已获得参与者的书面知情同意。所有参与者均为健康的老年人(65-79岁),性别不限,体重指数(BMI)范围为23-35。
1. 骨骼肌活检
2. 线粒体分离
3. 线粒体的洗涤
4. 使用 BCA 蛋白质检测试剂盒通过测定蛋白浓度估算线粒体含量
注意:使用此浓度计算用于呼吸测定实验中24孔微孔板加样的线粒体量,或用于蛋白质印迹实验的线粒体量。计算蛋白质浓度时需考虑稀释倍数(10倍)。
5. 按照 Rogers, GW, et al.12 所述方法进行 XF 检测
注意:在数据输出中以 pMoles O2/min 为单位观察 O2 消耗速率(OCR),或观察 O2 和 pH 的绝对水平。
6. 蛋白质印迹
注意:通过 Western 印迹法检测线粒体标志物 COX IV 和全组织 GAPDH,以确认最终样品中线粒体的富集情况
图1展示了整个实验方案的详细流程图。
COX IV/GAPDH 的 Western 印迹图谱(图 2)显示了线粒体蛋白 COX IV 和非线粒体标志物 GAPDH 的表达情况。在整体肌肉裂解液中,COX IV 和 GAPDH 的表达均清晰可见。采用本方案所述方法分离线粒体后,在相同曝光条件下,COX IV 条带仍然明显,而 GAPDH 则无表达;延长曝光时间可能显示出微弱的 GAPDH 条带。这些印迹结果表明,所分离的线粒体中非线粒体污染极少。此外,不同样本间分离得到的线粒体中 COX IV 的表达具有一致性。
图3展示了使用1.0 μg、2.5 μg和5.0 μg线粒体时,由复合体II(琥珀酸和鱼藤酮)驱动的典型呼吸测定曲线。如预期所示,随着线粒体用量的增加,整体耗氧速率(OCR)也随之升高。本实验测得的呼吸控制比(RCR)为7.95,表明所制备的线粒体质量较高。此外,解偶联态3(state 3u)的OCR略高于态3(state 3),进一步证实了线粒体的良好质量。
为了比较在分析不同数量线粒体时结果的一致性,我们使用每孔分别加入1.0 µg、2.5 µg和5.0 µg线粒体的实验条件进行了方差分析(ANOVA),并计算了平方和(SS)作为实际方差值(图4)。SS值展示了状态2、状态3、状态3u、抗霉素A以及RCR的结果。在状态2和状态3的测量中,单因素方差分析具有统计学显著性(p<0.01 和 p<0.05,分别)。类似地,抗霉素A和RCR的单因素方差分析也具有统计学显著性(p<0.01 和 p<0.0001,分别)。各组之间在状态3u上未观察到显著差异。这些结果表明,每孔5.0 μg的线粒体所产生的SS值最低,相较于其他浓度,是本研究人群在XF 24系统中使用的最佳数量。
图5 用作指南,以指示根据初始肌肉样本量可预期获得的线粒体蛋白量。如预期所示,所处理的肌肉量(mg)与最终样本的总线粒体蛋白含量(mg)之间存在显著相关性。
| Chappel-Perry 缓冲液 I (CPI) | |
| 化学物质 | 浓度 |
| KCl | 100 mM |
| MOPS | 50 mM |
| EDTA | 1 mM |
| MgSO4 | 5 mM |
| ATP | 1 mM |
| pH | 7.4 |
| Chappel-Perry 缓冲液 II (CPII) | |
| 化学物质 | 浓度 |
| KCl | 100 mM |
| MOPS | 50 mM |
| EDTA | 1 mM |
| MgSO4 | 5 mM |
| ATP | 0.2 mM |
| 无脂肪酸 BSA | 0.50% |
| pH | 7.4 |
| 线粒体测定溶液 (MAS) (2X) | |
| 化学物质 | 浓度 |
| 蔗糖 | 35 mM |
| 甘露醇 | 110 mM |
| KH2PO4 | 2.5 mM |
| MgCl2 | 2.5 mM |
| HEPES | 1.0 mM |
| EGTA | 0.5 mM |
| 无脂肪酸 BSA | 0.10% |
| pH | 7.4 |
| 含复合体 II 初始条件的线粒体测定溶液 (MAS) | |
| 化学物质 | 浓度 |
| 1X MAS | |
| 琥珀酸 | 10 mM |
| 鱼藤酮 | 2 μM |
| pH | 7.4 |
| 含复合体 I 初始条件的线粒体测定溶液 (MAS) | |
| 化学物质 | 浓度 |
| 1X MAS | |
| 丙酮酸 | 5 mM |
| 苹果酸 | 5 mM |
| pH | 7.4 |
| *所有缓冲液均需使用去离子水配制 | |
表1. 溶液与缓冲液配方。
| 实验步骤 | ||
| 开始实验流程 | ||
| 操作指令 | 时间(分钟) | 通道 |
| 校准 | 0.00 | |
| 等待 | 10.00 | |
| 混匀 | 1.00 | |
| 等待 | 3.00 | |
| 混匀 | 1.00 | |
| 等待 | 3.00 | |
| 混匀 | 0.50 | |
| 测量 | 3.00 | |
| 混匀 | 1.00 | |
| 测量 | 3.00 | |
| 混匀 | 0.50 | |
| 注入 | A | |
| 混匀 | 1.00 | |
| 测量 | 6.00 | |
| 混匀 | 1.00 | |
| 注入 | B | |
| 混匀 | 1.00 | |
| 测量 | 3.00 | |
| 混匀 | 1.00 | |
| 注入 | C | |
| 混匀 | 1.00 | |
| 测量 | 3.00 | |
| 混匀 | 1.00 | |
| 注入 | D | |
| 混匀 | 1.00 | |
| 测量 | 3.00 | |
| 结束实验流程 | ||
表2. 呼吸计的混合、测量和混合循环设置。

图 1. 完整实验方案的流程图。 请点击此处查看此图的放大版本。

图 2. 全骨骼肌组织及分离线粒体的代表性蛋白质印迹图。 全组织提取物和分离的线粒体分别用 COX IV 抗体作为线粒体标记物,以及 GAPDH 抗体作为非线粒体对照进行免疫印迹。在分离的线粒体中未观察到 GAPDH 条带,表明几乎没有或完全没有来自非线粒体来源的污染。请点击此处查看该图的放大版本。

图3. 人源线粒体分离后的代表性呼吸测定曲线 股外侧肌. 三种浓度的分离线粒体, 5.0 μg, 2.5 μg,以及 1.0 μg 本实验中使用了以下化合物。加样后各化合物的终浓度为:2 mM ADP(A孔); 2 μM 寡霉素(B通道); 6 μM FCCP(C孔);以及 2 μM 抗霉素A(D孔)。本实验计算的RCR为7.95。 请点击此处以查看此图的放大版本。

图4. 平方和。 使用5.0 μg、2.5 μg和1.0 μg线粒体时,不同线粒体呼吸状态及呼吸控制比(RCR)的平方和。请点击此处查看该图的放大版本。

图5. 本图可用于根据初始肌肉样本重量估算预期获得的线粒体蛋白量。 肌肉量(mg)与总线粒体蛋白产量(mg)的回归分析。如预期所示,肌肉量与获得的总线粒体蛋白量之间存在直接的正相关关系。
分离的线粒体常用于研究电子传递链(ETC)功能以及其他线粒体活动,包括底物转运和三羧酸(TCA)循环功能。利用分离的细胞器进行呼吸测定实验,可直接检测氧化磷酸化的基础过程以及ETC的内在特性。与完整细胞或透化肌纤维相比,对分离线粒体进行呼吸测定分析具有数据解释相对简便、且不受非线粒体过程或线粒体质量/生物合成变化“干扰”的优势。数据归一化基于线粒体蛋白含量,从而便于不同样本间线粒体的直接比较。当研究目的是确定潜在机制并鉴定特定靶点(如ETC组分/复合物或线粒体转运机制)时,对分离线粒体进行呼吸测定分析是首选方法。
本文描述了一种从少量组织样本中进行肌肉活检并分离功能性线粒体的实验方案。由于采用了自动匀浆器而非手动Dounce匀浆器,该方法在不同操作者之间具有良好的可重复性。仅需20 mg肌肉组织即可完成线粒体的分离。由此样本量所获得的线粒体数量足以进行Seahorse基于微孔板的呼吸测定,同时还能剩余足够的线粒体用于其他实验及后续分子分析的储存。值得注意的是,该方法也可应用于XF 96系统,在该系统中可使用更少量的线粒体(每孔1–2 μg)。
多种线粒体分离方案依赖Dounce匀浆器进行初始组织破碎。该方法的一个缺点是初始组织匀浆过程需要人工操作。不同操作者在使用匀浆器时,研杵施加的力度和速度可能存在显著差异6。这可能导致实验间以及实验室间的变异,使得不同实验之间的数据比较变得困难。在人体干预研究中这一问题尤为突出,因为受试者的数据通常在不同时间点(如治疗前后)采集,且可能在多个地点进行。我们采用自动化匀浆仪,以实现更一致的操作,获得可重复性更高的结果,并显著减少个体间差异。该方法的制备速度也使其适用于同时处理多个样本。通常情况下,单日内可完成多达三项实验。
本研究所述技术的潜在局限性源于分离细胞器的使用以及基于微孔板的实验形式。例如,Picard 等 已证明,分离的线粒体在功能特性上与透化肌纤维中完整的线粒体存在根本性差异。他们提出,线粒体分离技术会导致生物能量功能发生改变,例如与透化肌纤维相比,其呼吸控制比(RCR)显著升高,并伴随活性氧(ROS)产生增多13。与透化肌纤维相比,线粒体的分离需要更长的制备时间。此外,细胞内容物的丢失降低了其生理相关性,而完整细胞甚至透化纤维则能保留这种相关性。本方法中采用基于微孔板的呼吸测定技术,可对每个样本进行重复检测。然而,线粒体必须贴附于每个孔的底部,这种构型不同于其正常所处的环境,可能影响其功能特性。另外需要注意的是,采用本方案进行线粒体分离时,线粒体制备物中仍可能存在内质网(ER)的污染。内质网污染程度的差异可能影响线粒体得率的测定,并对实验结果产生影响。
综上所述,本研究提供的数据证实,采用该方法从组织中分离的线粒体具有功能活性,可用于需要从少量骨骼肌样本中获取高质量分离线粒体的研究或应用。该方法的优势在于:i)能够从极少量的骨骼肌组织中分离线粒体;ii)操作过程快速;iii)借助基于微孔板的技术,可同时处理多个样本;iv)在完成生物能量学检测后,仍有足够的剩余组织和分离线粒体可用于样本保存及其他分子生物学研究。
作者 George Rogers 就职于 Seahorse Bioscience,该公司生产本文所用仪器。开放获取费用由 Seahorse Biosciences 资助。
我们感谢波士顿大学医学院的Marc Liesa博士在本方案开发过程中提供的有益讨论;感谢来自维克森林医学院的Karin Murphy女士、Heather Gregory女士和John Stone先生在技术方面提供的宝贵协助。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 仪器 | |||
| 均质器 Bio-Gen PRO200 | BioExpress | ||
| Eppendorf 离心机 5804 R | Fisher Scientific | ||
| 深孔板转子 | Fisher Scientific | ||
| 6 mm 伦敦大学学院医院针头 | Cadence | ||
| 60 cc 注射器 | Fisher Scientific | ||
| 96孔板读板仪 | Tecan (Genios-basic) | ||
| Seahorse XF 24-3 分析仪 | Seahorse Biosciences, Inc. | ||
| 蛋白凝胶系统 | Life Technologies (Invitrogen) | ||
| Kodak Gel Logic 112 | Carestream Health, Inc | ||
| Kodak 相机组件 | Carestream Health, Inc | ||
| 耗材 | |||
| XF24 V7 细胞培养微孔板和 XF24 传感器 cartridge | Seahorse Bioscience | 100850-001 | |
| 100867-100 | |||
| 氢氧化钾 (KOH) | Sigma-Aldrich Co | 221473 | |
| 盐酸 (HCl) | Acros | 12421-0010 | |
| Dulbecco's 磷酸盐缓冲液 | Lonza | 17-512F | |
| 氯化钾 (KCl) | Fisher Scientific | P333 | |
| MOPS | Fisher Scientific | BP308 | |
| EDTA | Fisher Scientific | BP118 | |
| 硫酸镁 (MgSO4) | Sigma-Aldrich Co | M7506 | |
| ATP | Sigma-Aldrich Co | A9187 | |
| 无脂肪酸 BSA | Calbiochem | 126575 | |
| 蔗糖 | Sigma-Aldrich Co | S0389 | |
| 细菌蛋白酶 | Sigma-Aldrich Co | P-8038 | |
| D-甘露醇 | Sigma-Aldrich Co | M9546 | |
| KH2PO4 | Fisher Scientific | P284 | |
| 氯化镁 (MgCl2) | Sigma-Aldrich Co | M9272 | |
| HEPES | Sigma-Aldrich Co | H3784 | |
| EGTA | Sigma-Aldrich Co | E3889 | |
| BCA 蛋白检测试剂盒 | Sigma-Aldrich Co | PI23227 | |
| 琥珀酸* | Sigma-Aldrich Co | S3674 | |
| 丙酮酸* | Sigma-Aldrich Co | P5280 | |
| 苹果酸* | Sigma-Aldrich Co | 2288 | |
| ADP(K+ 盐)* | Sigma-Aldrich Co | A5285 | |
| XF 细胞线粒体应激检测试剂盒 | Seahorse Biosciences | 101706 | |
| Tween-20 | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | SC-29113 | |
| NuPAGE 12% Bis-Tris 凝胶 | Life Technologies (Invitrogen) | NP0343BOX | |
| Immobilin 转印膜 (0.45 μm) | Millipore | IPVH20200 | |
| MOPS SDS 电泳缓冲液 (20X)-500 ml | Life Technologies (Invitrogen) | NP0001 | |
| NuPAGE 转印缓冲液 (20X)-1 升 | Life Technologies (Invitrogen) | NP0006-1 | |
| 一抗 (抗 VDAC1/Porin 单克隆抗体) | Abcam | ab14734 | |
| 一抗 (抗 GAPDH 单克隆抗体) | Abcam | ab9484 | |
| 抗小鼠 IgG (山羊),HRP 标记 | PerkinElmer | NEF822E001EA | |
| 抗兔 IgG (山羊),HRP 标记 | PerkinElmer | NEF812E001EA | |
| *ADP、琥珀酸、丙酮酸和苹果酸必须仅用 KOH 调节至 pH 7.4 |