锌指结构域具有内在的细胞通透性,能够介导蛋白质递送至多种哺乳动物细胞类型。本文提供了一种利用锌指技术实现细胞内蛋白质递送的详细逐步操作方案。
需要JoVE订阅才能观看此内容。 请登录或开始免费试用
方法文章
* These authors contributed equally
锌指结构域具有内在的细胞通透性,能够介导蛋白质递送至多种哺乳动物细胞类型。本文提供了一种利用锌指技术实现细胞内蛋白质递送的详细逐步操作方案。
由于具有模块化特性,并可被重新编程以识别多种DNA序列,Cys2-His2 锌指DNA结合结构域已成为靶向基因组编辑的有用工具。与其他许多DNA结合蛋白类似,锌指也具有天然穿越细胞膜的能力。我们近期已证明,这种固有的细胞通透性可用于细胞内蛋白质递送。将锌指基序进行基因融合,可实现蛋白质和酶类货物向多种哺乳动物细胞类型的高效转运。与其他蛋白质转导技术不同,通过锌指结构域递送不会抑制酶活性,并可实现高水平的细胞质递送。本文提供了一套利用锌指技术向哺乳动物细胞递送蛋白质的详细分步操作方案,重点强调了实现高水平细胞内锌指介导递送的关键步骤,并讨论了优化该系统性能的策略。
高效且通用的蛋白质递送策略对于许多基础研究和治疗应用至关重要。将纯化的蛋白质直接递送入细胞是实现这一目标最安全、最简便的方法之一。1,2 与依赖核酸基因表达的策略3-5不同,蛋白质递送不存在插入突变的风险,不依赖细胞的转录/翻译机制,并可实现即时效应。然而,由于缺乏简单且可广泛适用的方法来赋予蛋白质穿膜活性,蛋白质直接进入细胞的过程常常受到阻碍。目前促进胞内蛋白质递送的方法主要包括使用天然存在的6-8或设计的穿膜肽9-12、超带电转导结构域13,14、纳米颗粒15和脂质体16、病毒样颗粒17,18以及聚合物微球材料19。遗憾的是,这些方法中的许多存在细胞摄取效率低20,21、稳定性差22、意外的细胞类型特异性23、内体逃逸能力弱24以及毒性25等问题。此外,许多蛋白质转导技术会降低递送蛋白的生物活性。14
本实验室先前已证明,锌指核酸酶(ZFN)蛋白——由可编程的 Cys2-His2 锌指 DNA 结合蛋白与 FokI 限制性内切核酸酶的切割结构域组成的嵌合限制性内切酶26-28 ——具有天然的细胞通透性。29 这种出人意料的穿膜活性被证实是人工设计的锌指结构域本身固有的一种特性;该 DNA 结合平台已被广泛用作靶向基因组编辑的有力工具30-32,其穿膜能力被认为源于蛋白表面六个带正电荷残基的特定排列。事实上,已有研究表明多种 DNA 结合蛋白(如 c-Jun 和 N-DEK)具有天然穿越细胞膜的能力。33 近期,本实验室进一步拓展了这些发现,证明锌指(ZiF)结构域的穿膜活性可用于细胞内蛋白递送。将单指或双指 ZiF 结构域与特定蛋白货物进行基因融合后,其摄取效率超过了多种传统的细胞穿膜肽递送系统。34 尤为重要的是,ZiF 介导的递送并未影响融合酶类货物的活性,并实现了高水平的胞质递送。综上所述,这些研究结果表明 ZiF 结构域在高效、便捷地将蛋白乃至其他更多样化的生物大分子递送入细胞方面具有巨大潜力。
本文介绍了一种利用ZiF技术在哺乳动物细胞中递送蛋白质的详细分步实验方案。我们此前构建了一系列包含一指、两指、三指、四指、五指和六指的ZiF结构域,这些结构域由于α-螺旋DNA结合残基被取代而丧失了DNA结合能力,但仍具备将蛋白质递送入细胞的功能34(图1)。本文以两指ZiF结构域介导Emerald GFP(EmGFP)在HeLa细胞中的表达与转导为例进行说明。该方案可广泛适用于几乎所有能在大肠杆菌(Escherichia coli)中可溶性表达的蛋白质以及多种哺乳动物细胞类型。文中还提供了预期实验结果,并讨论了优化该系统性能的策略。
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
1. 克隆
2. 表达与纯化
3. 蛋白质储存
4. 蛋白质转导
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
可表达双指ZiF-EmGFP融合蛋白 E. coli 与 >95% 纯度及高产量(>25 mg/ml) (图2)。通常情况下,单指和双指ZiF融合蛋白的表达量几乎与野生型未修饰蛋白相当。然而,在某些情况下,五指和六指ZiF融合蛋白的表达产量不足以满足后续应用的需求。
在37 °C条件下,将双指ZiF-EmGFP蛋白直接作用于HeLa细胞90分钟,可导致EmGFP荧光呈剂量依赖性增强(图3A)。关键的是,在缺乏ZiF结构域的情况下未观察到任何荧光信号。我们先前发现,仅用2 μM双指ZiF-EmGFP蛋白处理后,几乎所有细胞均呈现荧光;且当ZiF融合蛋白浓度低至0.25 μM时,HeLa细胞仍可检测到EmGFP荧光(图3B)。
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
本文介绍了一种利用可穿透细胞的锌指(ZiF)结构域进行蛋白质递送的分步实验方案。ZiF结构域不会降低融合酶类货物的活性34;能够以接近未修饰蛋白的产量实现蛋白质的表达与纯化;并且可将蛋白质和酶高效地导入多种细胞类型,其递送效率超过传统的细胞穿透肽或蛋白质转导结构域系统。综上所述,这些结果表明ZiF结构域在介导蛋白质直接递送入细胞方面具有广泛的应用潜力。
尽管由三个和四个锌指(ZiF)结构域组成的扩展阵列带有更高的正电荷,但此前实现最大蛋白递送效率时仅使用了双指ZiF结构域。这些结果表明,ZiF介导的细胞摄取可能受到除电荷以外其他因素的影响,包括蛋白质稳定性或构象刚性。研究还发现,ZiF结构域介导的蛋白递送具有能量依赖性,因此所有经蛋白处理的细胞均需在37 °C条件下孵育。通过使用针对不同内吞途径的小分子抑制剂,发现巨胞饮作用以及(程度较轻的)小窝蛋白依赖性内吞作用是ZiF介导细胞进入的主要途径34。值得注意的是,与其他蛋白转导系统不同,ZiF结构域能够高效地从内体中逃逸,从而介导融合的大分子货物在细胞质中的高水平递送,凸显了这些结构域在实...
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
作者无任何利益冲突需要披露。
本工作由美国国立卫生研究院(DP1CA174426,授予 Carlos F. Barbas)和中国上海科技大学(授予 J.L)资助。分子图形使用 PyMol 生成。
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| XmaI | 新英格兰生物实验室 | R0180L | |
| SacI | 新英格兰生物实验室 | R0156L | |
| Expand High Fidelity PCR 系统 | 罗氏 | 11759078001 | |
| dNTPs | 新英格兰生物实验室 | N0446S | |
| 4%-20% Tris-甘氨酸迷你蛋白凝胶,1.5 mm,10 孔 | Life Technologies | EC6028BOX | |
| 2x Laemmli 上样缓冲液 | BioRad | 161-0737 | |
| T4 DNA 连接酶 | Life Technologies | 15224-017 | |
| BL21 (DE3) 感受态 E. coli | 新英格兰生物实验室 | C2527I | |
| IPTG | Thermo Scientific | R0391 | |
| 氯化锌 | Sigma-Aldrich | 208086-5G | |
| 硫酸卡那霉素 | 费舍尔科技 | BP906-5 | |
| 葡萄糖 | Sigma-Aldrich | G8270-100G | |
| Tris 碱 | 费舍尔科技 | BP152-25 | |
| 氯化钠 | Sigma-Aldrich | S9888-25G | |
| DTT | 费舍尔科技 | PR-V3151 | |
| PMSF | Thermo Scientific | 36978 | |
| Ni-NTA 琼脂糖树脂 | QIAGEN | 30210 | |
| 甘油 | Sigma-Aldrich | G5516-500ML | |
| 咪唑 | Sigma-Aldrich | I5513-25G | |
| Amicon Ultra-15 离心滤过装置 | EMD Millipore | UFC900324 | |
| DMEM | Life Technologies | 11966-025 | |
| 胎牛血清 | Life Technologies | 10437-028 | |
| 抗生素-抗真菌剂 | Life Technologies | 15240-062 | |
| 24 孔平底培养板 | Sigma-Aldrich | CLS3527-100EA | |
| 多聚赖氨酸 | Sigma-Aldrich | P7280 | |
| 不含钙、镁的 DPBS | Life Technologies | 21600010 | |
| 硫酸乙酰肝素 | Sigma-Aldrich | H4777 | |
| 胰蛋白酶 | Life Technologies | 25300054 | |
| HeLa 细胞 | ATCC | CCL-2 | |
| Nano Drop ND-1000 分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | ||
| QIAquick PCR 纯化试剂盒 | QIAGEN | 28104 | |
| QIAquick 凝胶回收试剂盒 | QIAGEN | 28704 |
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。