病原菌生长的定量分析是表征多种Arabidopsis thaliana(以下简称:拟南芥)免疫反应的有力工具。本文所述方法提供了一种优化的注射浸润实验,用于定量测定丁香假单胞菌致病变种(Pseudomonas syringae pv. maculicola)ES4326 在成年拟南芥叶片中的增殖情况。
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病原菌生长的定量分析是表征多种Arabidopsis thaliana(以下简称:拟南芥)免疫反应的有力工具。本文所述方法提供了一种优化的注射浸润实验,用于定量测定丁香假单胞菌致病变种(Pseudomonas syringae pv. maculicola)ES4326 在成年拟南芥叶片中的增殖情况。
在缺乏特化移动免疫细胞的情况下,植物通过局部程序性细胞死亡和系统性获得抗性来抵御病原体侵袭。通过检测感染组织内病原菌的生长情况,可对特定拟南芥基因在整体植物免疫反应中的作用进行特异且定量的评估。三十多年来,半活体营养型细菌 Pseudomonas syringae pv. maculicola ES4326 (Psm ES4326)已被广泛用作研究拟南芥免疫反应分子机制的模式病原菌。为了将病原菌导入叶片组织,已建立了多种接种方法, 例如, 注射浸润、浸渍接种、喷雾、真空浸润和淹水接种。以下方案描述了一种优化的注射浸润方法,用于递送毒力菌株 Psm 将ES4326接种至成年土壤培养的拟南芥植株叶片中,并准确筛选对该病原菌增强的感病性(EDS)。此外,本实验方案可结合多种预处理方法,以进一步解析植物防御不同层次中特定的免疫缺陷,包括水杨酸(SA)诱导的免疫(STI)和微生物相关分子模式诱导的免疫(MTI)。
由于植物的固着生长特性,它们 constantly 面临着大量具有不同生活方式和营养策略的病原体威胁1。从初步分类来看,活体营养型病原体通过维持寄主存活来获取营养,而死体营养型病原体则主动分泌毒素和酶以杀死寄主组织,并以死亡细胞为食1。另一类被称为半活体营养型的病原体,在侵染初期表现为活体营养阶段,当病原体积累达到一定阈值后,便转变为死体营养阶段2。为了有效抵御这些微生物,植物进化出复杂的先天免疫系统,该系统配备多种监控机制,可识别病原体侵袭并触发局部程序性细胞死亡3以及系统性获得抗性(SAR)4。目前的研究重点在于解析植物免疫系统中关键的信号组分及其相互之间的信号串扰5。
根据“之字形”模型5,植物先天免疫反应的第一层需要质膜定位的模式识别受体(PRRs)来识别微生物的入侵。PRRs能够识别微生物相关分子模式(MAMPs),并建立MAMP触发的免疫反应(MTI)6。除了诱导编码抗菌PR蛋白的基因发生转录上调7外,MTI还会引发多种抑制病原体生长的事件,包括活性氧(ROS)和活性氮(RNS)的产生、胼胝质在细胞壁上的沉积,以及多个激酶信号通路的激活8。
迄今为止,已在拟南芥中鉴定出多种可触发MTI的MAMPs,包括细菌flg229(来源于鞭毛蛋白的22个氨基酸片段)、elf1810(来自细菌翻译延伸因子Tu的18个氨基酸片段)以及细胞壁结构组分肽聚糖11。为了建立成功的侵染,一些专性病原菌已进化出将毒性效应蛋白分泌至细胞内或细胞间空间的能力,从而抑制MTI并引发效应子触发的感病性(ETS)12,13。例如,毒性效应子可通过失活MTI中的丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)磷酸化级联反应,促进感染组织中的病害发展14-16。在寄主与病原菌的动态共进化过程中,植物也发展出反制策略,能够识别效应蛋白并削弱病原菌的毒性分子17。这种对效应子的直接或间接识别由抗病(R)蛋白介导18。其中大多数属于NB-LRR(核苷酸结合和富含亮氨酸重复序列)蛋白家族19。当R蛋白识别到无毒效应子时,会激发一种更强且更广泛的免疫反应,称为效应子触发的免疫(ETI)20。除了诱导防御相关基因的表达21和防御代谢物的产生22外,ETI通常还会引发快速的局部程序性细胞死亡,即超敏反应(HR),以限制病原菌向邻近组织扩散3。
除了局部的程序性细胞死亡23,植物还能启动一种长期且全株范围的免疫反应,称为系统获得性抗性(Systemic Acquired Resistance, SAR)4。当受到活体营养型病原菌侵染时,植物细胞会在局部和远端组织中触发内源性植物激素水杨酸(salicylic acid, SA)的生物合成及其积累,并诱导PR蛋白的表达24。通过这一过程,未受感染的叶片进入一种高度戒备状态,从而在后续遭遇多种病原菌侵染时能够更快地启动防御反应24。水杨酸及其合成类似物,如苯并-(1,2,3)-噻二唑-7-硫代羧酸S-甲酯(BTH)和2,6-二氯异烟酸(INA),在外部施用时能够化学诱导水杨酸(SA)触发的免疫反应(Salicylic Acid-Triggered Immunity, STI)24。非病程相关基因表达因子1(Nonexpressor of Pathogenesis-Related genes 1, NPR1)被认为是SA的受体之一,并在SA介导的局部和系统性组织防御反应中发挥主要转录调控作用21,25,26。已有确凿证据表明,NPR1是建立SAR所必需的,缺失NPR1会导致植物对Pseudomonas syringae表现出显著的感病性25。
为了全面表征植物组分在植物-病原体互作中的分子贡献,已开发出多种生物测定方法,用于检测特定的防御事件,包括活性氧爆发27、胼胝质沉积28、防御基因的表达及其蛋白产物的积累21。尽管这些单项检测能够揭示植物免疫反应的某一特定形式,但它们均无法代表整个植株水平上的完整防御反应。相反,感染后对病原体生长的定量分析可提供在个体水平上免疫反应的整体评估。因此,建立并优化一种精确且高度标准化的病原体接种检测方法,对于推动拟南芥免疫反应相关研究与发现至关重要。
Pseudomonas syringae一种革兰氏阴性细菌被鉴定为植物病原菌,能够引起包括拟南芥在内的多种植物宿主发病29作为模式植物-病原体系统,拟南芥 - P. syringae 互作已被广泛应用于解析植物防御反应的分子机制29截至目前,已有超过50个 P. syringae 根据其感染不同植物物种的能力,已鉴定出多种致病变种30 . P. syringae pv. 番茄 DC3000Pst DC300031和 P. syringae pv. maculicola ES4326 (Psm ES432632 是两种应用最广泛且研究最为深入的致病菌株。除了能被植物识别并触发MTI反应外, Pst DC3000 和 Psm ES4326 能够分泌毒性效应蛋白,以抑制 MTI 并触发 ETS,从而有利于病原菌的生长31,33.
为了功能解析拟南芥与之间的相互作用 P. syringae 多个 基于病原体递送方式,已开发出多种病原体感染方法。对于土壤栽培的植物,可通过注射渗入法、真空渗入法、浸渍接种法和喷雾接种法递送病原体。29,34最近,已开发出幼苗淹水接种法,用于对培养在组织培养板上的拟南芥幼苗进行大规模筛选。35注射渗透法作为一种最常用的方法,通过称为气孔的天然叶片开口,将病原体手动递送至质外体。29通过该方法,等量的 P. syringae 可渗透至受感染的叶片中,且植物免疫反应的强度与病原体生长水平呈负相关。因此,定量检测病原体生长情况是评估整株植物免疫功能的最佳方法。此外,注射渗透法可区分局部与系统性组织,适用于系统性获得抗性(SAR)相关分子机制的研究。36.
在以下实验方案中,我们描述了一种优化的注射式渗入法,使用Psm ES4326侵染拟南芥突变体以筛选增强型疾病敏感性(EDS)表型。本方案将采用两种拟南芥基因型:野生型生态型Columbia-0(Col-0)植株(对照)和npr1-1功能缺失 突变体 (高敏感性) ,并用毒性细菌菌株Psm ES4326进行侵染37。npr1-1突变体在NPR1蛋白的锚蛋白重复共识序列内携带一个点突变,导致高度保守的组氨酸变为酪氨酸,从而使该蛋白失去功能25。此外,本文还介绍了若干对注射式渗入法的改进,可用于定量分析免疫应答特定层次中的缺陷,包括MTI和STI。
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以下文本描述了在拟南芥中进行优化的Psm ES4326 注射式渗入实验的逐步操作方案。该实验的主要步骤以简化的流程图表示(图1)。
1. 植物生长条件
2. 培养基与培养板的制备
3. 增强的疾病易感性(EDS)
4. 水杨酸触发的免疫(STI)
5. MAMP 触发的免疫(MTI)
注意:本实验中使用拟南芥野生型Col-0以及fls2和efr突变体植株。FLS2和EFR是定位于质膜的模式识别受体(PRRs),分别能够识别flg22和elf189,10。每个PRR的缺失会导致植株对特定类型的MAMP不敏感,表现为在外部施加MAMP预处理并用Psm ES4326进行注射接种后,突变体中病原菌生长情况无明显变化。
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我们在此描述的方案代表了一种优化的 P. syringae 通过注射浸润法定量评估拟南芥植株的免疫反应。如图所示 图1,注射器浸润法 Psm ES4326 之后进行病原体提取与定量 通过 系列稀释与菌落计数
如方案文本中第3步所述,可通过接种OD值为0.0002的菌液来评估对Psm ES4326的增强疾病敏感性(EDS)。如图3所示,高度敏感的npr1-1突变体中的病原菌生长量比野生型Col-0植株高出约2.5 log(即300倍)。根据实验条件的不同,npr1-1植株中的细菌生长量可能比Col-0高出最多达3.0 log,通常结果范围在1.5–2.5 log之间。因此,该EDS检测方法提供了较宽的差异窗口,研究人员可借此对拟南芥突变体和转基因植株进行比较,以鉴定可能参与植物免疫反应的候选基因。
除了确定EDS外,Psm ES4326 ...
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随着可用耕地减少和人口增长,全球研究人员面临着作物改良的紧迫需求。作物产量会受到多种生物和非生物胁迫的显著影响。其中,病原体感染是导致作物减产的主要原因之一,仅在美国就造成了约12%的产量损失45。为解决这一问题,科研人员已在模式植物拟南芥—P. syringae 病害系统中开展了大量研究,以全面表征植物免疫反应的组分及其调控机制。本文介绍了一种优化的P. syringae ES4326 注射式侵染实验方法,可用于在整株植物水平上定量评估植物免疫反应中的细微差异。
尽管已有多种病原体感染实验用于表征植物免疫反应29,35,但注射器渗入法提供了一个高度可控的系统,可将等量的病原体接种至感染组织中。在其他感染实验中,包括浸染接种和喷雾接种,病原体会被施加到整个地上部分组织,包括子叶和真叶34。已有报道指出,在浸染接种实验中,生态型Landsberg erecta(Ler)的子叶对病原体更为敏感,这可能导致数据偏差,从而对整体抗病性得出错误结...
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作者无任何利益冲突需要披露。
感谢Shahid Mukhtar博士对文稿的批评指正,以及Xinnian Dong博士提供的样本数据分析文件。本工作由美国国家科学基金会职业奖(NSF-CAREER,项目号IOS-1350244)和阿拉巴马大学伯明翰分校生物系资助。
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