通过溶解动态核极化(DNP)实现的灵敏度提升,使得利用核磁共振(NMR)和磁共振成像(MRI)实时追踪代谢过程成为可能。本文讨论了一种专用于研究酶促反应的溶解DNP装置的特性与性能。
需要JoVE订阅才能观看此内容。 请登录或开始免费试用
通过溶解动态核极化(DNP)实现的灵敏度提升,使得利用核磁共振(NMR)和磁共振成像(MRI)实时追踪代谢过程成为可能。本文讨论了一种专用于研究酶促反应的溶解DNP装置的特性与性能。
基于核磁共振(NMR)研究的主要局限性在于灵敏度较低,这导致需要较长的采集时间,从而无法实现对代谢转化过程的实时NMR检测。通过溶解态动态核极化(dissolution DNP)实现的超极化技术,借助电子自旋向核自旋的极化转移所产生的显著非平衡态核磁化,部分克服了灵敏度问题。由此获得的高强度NMR信号可用于实时监测化学反应。然而,超极化NMR的缺点在于信号采集的时间窗口有限,通常仅为核自旋纵向弛豫时间常数的数量级。 T1,或者在有利情况下,接近耦合核单重态的弛豫时间常数的数量级 TLLS细胞对内源性分子的摄取及代谢速率可为肿瘤发生发展和药物反应提供重要信息。大量既往的超极化核磁共振研究已证实丙酮酸作为代谢底物在监测酶活性方面的相关性 体内本研究详细描述了利用超极化核磁共振(NMR)技术研究酶促反应(特别是乳酸脱氢酶(LDH)存在下丙酮酸向乳酸转化速率)所需的实验装置与方法。
动态核极化(DNP),1,2 一种旨在增强核自旋极化的技术 即“上”自旋与“下”自旋布居数之间的不平衡(P = [N↑ - N↓] / [N↑ + N↓]),于20世纪50年代首次被引入。核自旋如 13C 可被极化至高达 P = 10-1 在有利条件下,通常在约1 K的温度和3.357 T的磁场中。3,4 21世纪初,溶解性动态核极化(dissolution DNP)技术的问世为生物应用带来了突破。该技术通过将冷冻的极化样品溶解于过热水中,同时保持低温下获得的高核极化水平,从而实现极化信号的显著增强。5 液态核磁共振信号增强了10倍3-104 与常见的热极化常温核磁共振(RT NMR)条件相比,溶解态动态核极化(dissolution DNP)因此提供了一种非侵入性测量生化反应速率的方法 原位 实时进行,允许通过核磁共振以1秒或更短的时间分辨率监测动态变化。6-10 还能够检测极低浓度的分析物。11
在非侵入性分子成像技术中,超极化核磁共振(NMR)是唯一能够实时同时检测底物及其代谢产物的技术。溶解态动态核极化(dissolution DNP)自问世以来,在从体外(in vitro)核磁共振到临床磁共振成像(MRI)12等多个科研领域均受到广泛关注,其中最具前景的应用集中在对代谢过程的原位(in situ)监测13,14。溶解态DNP的主要局限在于,经过约五倍纵向弛豫时间常数 T1 的时间后,增强的极化信号便会消失。因此,必须选用具有相对较长 T1 的核自旋分子。为了延长极化增强的时间窗口,可利用弛豫缓慢的核自旋态,即所谓的长寿命态(long-lived states, LLS)15-17。LLS对分子内偶极-偶极相互作用不敏感,因此其特征弛豫时间常数 TLLS 可远长于 T118。由此可实现数十分钟甚至长达1小时的磁化寿命19,20,LLS已被提出用于磁共振波谱(MRS)和磁共振成像(MRI)中21。
通过超极化核磁共振(NMR)研究酶促反应速率时,需仔细优化的关键点包括:(i)最大化固态下的极化度;(ii)尽量减少超极化溶液从极化仪转移至核磁共振波谱仪过程中的极化损失。本文描述了一套定制的溶解型动态核极化(DNP)装置与注射系统的改造,用于酶促反应研究。将通过广泛使用的经典超极化底物[1-13C]丙酮酸。选择它的主要原因有两点:首先,其天然的长半衰期 13C纵向弛豫时间T1 >50秒,在高磁场和高于293 K的温度下)可实现对反应过程持续数分钟的监测,其次因其在癌症代谢中的核心作用。13,14 利用溶解态动态核极化核磁共振(DNP NMR)结合定制开发的注射系统,可在存在初始未标记乳酸池的条件下监测乳酸脱氢酶(LDH)催化的丙酮酸氧化反应9,22 或未添加未标记乳酸,如此处所示。已有研究表明,[1-13C]乳酸信号测量 体内 (包括细胞内)在注射超极化[1-13C]丙酮酸的主要原因在于丙酮酸与乳酸之间的快速标记交换,而非乳酸的生成。6
本文展示了将超极化[1-13C]丙酮酸注入含有乳酸脱氢酶(LDH)但初始不含乳酸的核磁共振管后,实时生成[1-13C]乳酸的过程。
系统描述
溶解性动态核极化(DNP)装置包含两个主要部分(图1):DNP极化器和核磁共振(NMR)波谱仪。DNP极化器的核心部件是低温恒温器,用于在抽气的液氦浴中将样品冷却至约1 K。该低温恒温器置于3.35 T的超导磁体中,其几何结构可确保极化样品位于磁体的等中心位置(图1)。在低温恒温器内部,样品(a)被核磁共振线圈(b)包围,用于测量极化建立过程,整个结构置于过模微波谐振腔(c)内。样品整体由抽气的液氦浴(d)维持在低温状态,并通过波导引入微波进行照射。整个系统由定制软件进行控制(图2D)。
实现动态核极化(DNP)及其后续溶解过程所需的硬件与低温设备目前仍是一项技术挑战。为此,研发并测试了一种新型DNP低温恒温器23,24,以评估其低温性能,并进一步优化其快速冷却能力、液氦保持时间以及运行过程中的整体最低液氦消耗量。
冷冻恒温器由两部分组成。第一部分是隔热杜瓦瓶(图2A),大致可分为上部(a)、样品空间(b)和保持高真空的外真空室(OVC)(c),外真空室内设有辐射屏蔽层。第二部分是主插件(图2B),插入隔热杜瓦瓶中,用于调控所有气流。来自外部储存杜瓦瓶并通过传输管线(a)输送的液氦,首先在分离器(b)中冷凝,该分离器是一个中间腔室,既用于保持冷冻恒温器上部低温,也用于去除传输过程中蒸发的氦气。通过缠绕在冷冻恒温器上部的一根毛细管(c)进行抽气,以降低分离器的压力;流经该毛细管的冷氦气用于冷却挡板(d)以及隔热杜瓦瓶(OVC)中的辐射屏蔽层。样品置于样品空间内并进行极化。样品空间通过另一根缠绕在主冷冻恒温器插件尾部的毛细管(e)与分离器相连。该毛细管可通过一个从外部手动操作的针阀打开或关闭。
为了实现动态核极化(DNP)过程中所需的低温,需要将液氦收集在低温恒温器的样品腔中,并将其压力降低至毫巴(mbar)范围。低温恒温器的操作通过一套较为复杂的抽气系统完成,该系统包含三组泵,由电子和机电仪器在不同位置进行监控和操作(图2C)。低温恒温器的开放式真空腔(OVC)需由第一级抽气系统抽至高真空。该系统由一台涡轮分子泵和一台作为前级泵的旋片泵(a)组成。液氦通过低温恒温器的进样管线从储存杜瓦瓶(b)转移至低温恒温器的分离器中。分离器的出口连接至第二级抽气装置,该装置由一台抽速为35 m3/hr的隔膜泵(c)组成。该管路可用于在液氦从杜瓦瓶转移以及分离器冷却过程中,排出沸腾产生的氦气。收集在分离器中的液氦随后可通过上述毛细管转移至样品腔。为了将液氦从分离器转移至样品腔,并进一步将样品腔压力降至毫巴范围,需通过一个手动蝶阀(e)将第三级抽气系统连接至低温恒温器,该系统由一台抽速为250 m3/hr的罗茨泵和一台抽速为65 m3/hr的旋片泵(d)组成。
所有真空系统的操作均由一个定制的电动气动装置(f)进行控制和调节。该装置控制着低温恒温器分离器(g)与样品腔出口(h)、第二/第三级抽气系统(c, d)、压缩氦气瓶(i)以及外部环境之间的真空管路连接。装置(f)与外部之间的连通需通过一个单向阀(j)。电动气动装置(f)、整个系统的各项参数以及溶解硬件均由一个定制的电子设备通过USB接口与普通PC连接进行控制和操作。最终,整个系统通过该电子设备由一套定制的独立软件(图2D)进行管理,相关操作通过软件界面上的按钮来启动。
为了处理样品并测量固态下的核磁共振(NMR)信号增长,需使用一系列插件(图3A)。为准备极化用的低温恒温器,将主样品插件(a)放入低温恒温器中。主样品插件内装有核磁共振线圈(b),该线圈置于一个过模的镀金微波谐振腔内。将待极化的基质溶液(极化溶液)在液氮温度下预先冷冻,并置于玻璃纤维样品支架(c)底部末端的合适样品容器中。将样品支架推入主样品插件中,使其到达磁体的等中心位置。将镀金波导管(d)插入样品支架中。该波导管可使来自外部微波源的微波以最小损耗传输至样品。
用于低温恒温器管理的定制软件可在点击相应界面按钮后自动执行多种操作,如降温(将低温恒温器温度降低至接近液氦温度)、充液(将液氦注入低温恒温器至预设液位)以及进一步的冷却步骤 T ≈ 1 K(通过抽气使液氦浴达到尽可能低的温度),加压(将低温恒温器压力略微加压至高于室压) P = 10–30 mbar,以允许在无空气污染风险的情况下打开冷冻恒温器)以及溶解(自动程序,用于溶解DNP样品并将所得的超极化溶液转移至测量位置, 即,核磁共振波谱仪)
通过在94 GHz的微波照射下(极化磁场 B0 = 3.35 T)对样品进行极化。当极化时间达到3个TDNP时,认为样品已完全极化,其中TDNP为极化建立时间。TDNP的数量级与给定磁场和温度下目标核在固态中的纵向弛豫时间相同。在本研究的所有实验中,样品的极化时间均超过5个TDNP。
极化时间结束后,样品必须溶解在室温溶液中,以便用于酶活性的测定。在溶解过程中,溶解插件锅炉(图3B)中产生的5 ml过热D2O在压缩氦气(P = 6–8 bar)推动下,流向DNP增强的样品并将其溶解。生成的超极化溶液在压缩氦气作用下,从溶解插件中经由溶解插件出口(图3C-b)和内径为2 mm的聚四氟乙烯(Teflon)转移管推出。溶解过程所需时间为300毫秒。23 样品从DNP极化器转移至核磁共振(NMR)波谱仪位置所需时间约为3秒。
溶解过程使用溶解插件(图3B)进行。该溶解插件由电子-气动组件(a)、含连接管路的碳纤维棒(b)组成,连接管路连通气动组件中的锅炉与样品容器锁(c),可实现与样品容器的密封耦合,并将流体导出至出口。电子-气动组件(图3C)用于产生并驱动过热的D2O通过碳纤维棒进入样品容器,随后将超极化溶液从低温恒温器中提取出来。电子-气动组件由气动阀(a)构成,用于控制压缩氦气(P = 6–8 bar)管线(b)、锅炉(c)(通过阀门(d)向其中注入D2O)以及通过碳纤维棒(f)通向出口(e)之间的连接。该系统还包括安装在锅炉(c)内的压力计G、温度计和加热电阻丝、触发器(h)以及连接盒(i),后者用于将系统与电子控制装置连接。
DNP 冷冻仪与核磁共振波谱仪通过传输管线相连, 即, 内径为2 mm的聚四氟乙烯管,超极化溶液由加压氦气推动通过其中(P = 6-8 bar)时启动溶解。
溶解过程包含以下操作步骤:在前300毫秒内,将过热的D2O推入样品容器,以熔化并溶解超极化冷冻溶液。随后,通过加压(P = 6–8 bar)的氦气将超极化溶液从低温恒温器中抽出,并经由内径为2 mm的PTFE管(图3C-e)输送至测量位置,然后采用第6.2.1步或第6.2.2步中所述的任一程序进行注射。
溶解DNP NMR装置的第二个组成部分是核磁共振波谱仪。在本文所述的装置中,核磁共振波谱仪的工作磁场为 B0 = 11.7 特斯拉。使用一个5 mm核磁共振探头在溶解后检测超极化信号。核磁共振波谱仪通过核磁共振控制台进行操作,该控制台可用于固态和液态核磁共振测量,并结合厂商提供的软件XWinNMR使用。典型的测量过程包括一个低翻转角的硬脉冲(针对液态测量进行过校准,或针对固态测量未校准),随后进行信号采集。
使用定制的13C线圈在DNP极化器位置(图3Ab)连接核磁共振波谱仪,进行固态热极化信号和DNP诱导信号建立的测量。在此特定情况下,核磁共振波谱仪不进行信号锁场。当进行固态测量时,为避免对极化产生显著干扰,两次采集之间的时间延迟应足够长,通常应大于0.5 TDNP。
固态增强度定义为
,其中
为超极化信号(在步骤 3.3 中获得),而
为固态信号(在步骤 3.2 中液氦泵送温度下的热平衡状态下获得)(图 4A)。该参数定义了在超极化溶液转移过程中不可避免的损失发生前,可用于核磁共振(NMR)实验的最大极化度。测量采用简单的脉冲-采集序列,使用未校准的小翻转角脉冲进行。对于固态测量,通常省略脉冲校准。
类似的方法可用于测定液态下的超极化信号增强。在这种情况下,注入前(步骤6.2)置于波谱仪管中的样品由500 µl的D2O组成。溶解并注入后,有两个重要参数需要监测。第一个是核磁共振波谱仪位置处的超极化增强,
(图4B),其中
为注入超极化溶液后立即测得的信号(在步骤7.1中获得),而
为热极化信号(在步骤7.2中获得)。第二个参数是纵向弛豫时间T1(图4B,插图),该参数与底物及每种代谢产物相关(通过步骤7.1中获得信号的指数拟合得到)。这两个参数决定了获得足够信噪比(SNR)所需的最低底物浓度以及进行代谢转化测量的可用时间窗口。固态极化度
与液态极化度
的比值可估算超极化溶液转移过程中因弛豫导致的极化损失。在无弛豫损失的情况下,应观察到比值
接近1。
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
注意:所有数据分析均使用商业软件完成。
1. 准备偏振溶液
2. 偏振
3. 固体核磁共振测量
4. 优化主磁体磁场的均匀性(“调场”)
5. 溶解
6. 注射
7. 液态核磁共振测量
8. 含酶样品的制备(丙酮酸转化为乳酸反应专用)
9. 完整的酶促反应速率测定步骤
10. 拟合
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
利用溶解DNP增强NMR信号
DNP效应是指在微波照射样品的条件下,将未配对电子自旋(通常来自稳定的自由基分子)的高极化度转移至NMR活性核的过程。最常用的自由基为TAM(OXO63)和TEMPOL4。使用TEMPOL进行极化时,可通过“交叉极化”方法优化极化过程25。
为了在固态下获得最大的核极化,优化稳定自由基的浓度对该技术的成功至关重要。在本研究的实验条件下,TEMPOL 的最佳浓度为 33 mM。该底物的极化程度足以实时监测其酶促转化过程。
巴黎笛卡尔大学安装的极化器的磁场为 B0 = 3.35 T,该系统的各组件如上文所述(图 1–图 3)。低温恒温器的设计确保最终...
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
溶解DNP NMR实验的关键因素包括:(i)底物所达到的极化水平,这决定了实验所需的最低产物浓度以及可进行的信号采集次数;(ii)磁化寿命,需与从极化位点到检测位点的转移时间以及底物转化速率相比较。本文所述的溶解DNP装置的注射系统可在短短3–4秒内完成样品转移。尽管该转移速度不及S. Bowen和C. Hilty提出的方法迅速26,但由于低磁场下纵向弛豫较为缓慢,丙酮酸盐的极化损失仍受到限制。[1-13C]丙酮酸盐因其羧基核具有较长的T1弛豫时间,可在低至10-3 U/ml的浓度下测量乳酸脱氢酶(LDH)的通量。
采用溶解态动态核极化(DNP)获得的高信噪比表明,即使对于更低浓度的[1-13C]丙酮酸以及更低的酶促转化速率,仍具有检测灵敏度。当前达到的极化水平使得在液态核磁共振波谱仪中使用小翻转角 α = 10° 时,可获得超过200次具有显著信噪比的实验信号。这为重复时间与翻转角的进一步优化提供了空间。在固态极化建立过程中,某些分子与...
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
作者声明不存在任何竞争性经济利益
作者感谢 J. J. van der Klink 博士在设备选型与组装方面提供的帮助,同时感谢 F. Kateb 博士和 G. Bertho 博士的有益讨论。A.C. 受瑞士国家科学基金会(项目编号 PPOOP2_157547)资助。我们感谢巴黎索邦城市大学(NMR@Com、DIM Analytics、巴黎市政府)、法国医学研究基金会(FRM ING20130526708)以及布兰库西—休伯特合作伙伴计划(Parteneriat Hubert Curien Brancusi 32662QK)提供的经费支持。我们的团队隶属于 Equipex 项目 Paris-en-Résonance 和 CACSICE。
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。
| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| DNP 极化仪 | Vanderklink s.a.r.l (瑞士) | /// | 用于样品极化的低温恒温器及电子设备 |
| 真空系统组件 | Edwards vacuum (法国) | 各种 | - 涡轮分子泵系统 - 隔膜泵系统 - 高容量罗茨泵系统 - 真空接头及组件 |
| DNP 3.35T 磁体 | Bruker (法国) | ||
| 500 MHz 核磁共振波谱仪 | Bruker (法国) | ||
| Origin 8.0 | OriginLab (美国) | 数据分析软件 | |
| 化学品 | |||
| 1-13C 标记丙酮酸钠,13C 原子丰度 99% | Sigma Aldrich (法国) | 490709 | |
| 氘代乙醇-D6,无水,氘原子丰度 99.5% | Sigma Aldrich (法国) | 186414 | |
| 4-羟基-TEMPO,纯度 97% | Sigma Aldrich (法国) | 176141 | |
| 重水 | Sigma Aldrich (法国) | 151882 | |
| 还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH) | Sigma Aldrich (法国) | ||
| 乙二胺四乙酸(EDTA) | Sigma Aldrich (法国) | ||
| 二硫苏糖醇(DTT) | Sigma Aldrich (法国) | ||
| 磷酸盐缓冲液,pH = 7.0 | Sigma Aldrich (法国) | ||
| 乳酸脱氢酶(LDH) | Sigma Aldrich (法国) | L-2500 | |
| 牛血清白蛋白(BSA) | Sigma Aldrich (法国) |
访问受限。请登录或开始试用以查看此内容。